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        基于CiteSpace的關(guān)于乳腺癌PI3K信號通路的計量分析

        2023-10-14 14:52:10徐思怡彭火平徐佳偉虞程棟余騰驊孫正魁
        中國醫(yī)藥科學 2023年18期
        關(guān)鍵詞:發(fā)文聚類通路

        徐思怡 彭火平 徐佳偉 虞程棟 余騰驊 陳 雯 孫正魁

        1.南昌大學研究生院醫(yī)學部,江西南昌 330006;

        2.南昌大學附屬腫瘤醫(yī)院 江西省腫瘤醫(yī)院乳腺腫瘤外科,江西南昌 330029

        乳腺癌已超過肺癌成為最常見的惡性腫瘤之一,是女性癌癥死亡的首要原因。乳腺癌可以分為四種亞型,分別為Lumina A 型、Lumina B 型、人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER-2)過表達型以及三陰性乳腺癌,超過70% 的乳腺癌是激素受體(hormone receptor,HR)陽性[1-3],內(nèi)分泌治療已成為治療激素敏感型乳腺癌的主要且有效方式,但大部分患者最終會因內(nèi)分泌治療耐藥而導致疾病進展。臨床前研究發(fā)現(xiàn)磷脂酰肌醇3- 激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/ 蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)/哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信號通路(PAM 信號通路)在正常細胞中具有促進增殖、分化、血管生成、代謝等作用[4],而在乳腺癌中與腫瘤內(nèi)分泌繼發(fā)性耐藥及乳腺癌發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[5]。因此,靶向PI3K 通路的抑制劑受到研究者的廣泛關(guān)注,旨在為進展期乳腺癌患者找到一個更有效且安全的聯(lián)合用藥策略[6-8]。

        文獻計量分析作為一種分析模型,通過對相關(guān)文獻的分析,可以快速揭示某一特定研究領(lǐng)域的知識網(wǎng)絡(luò)、研究熱點的演變和新興趨勢[9]。然而,到目前為止,還沒有關(guān)于PI3K 信號通路在乳腺癌領(lǐng)域的文獻計量學研究。本研究從Web of Science(WOS)網(wǎng)站上檢索有關(guān)PI3K 信號通路在乳腺癌領(lǐng)域的研究文獻,并進行文獻計量學分析,旨在分析PI3K 信號通路與乳腺癌相關(guān)的研究文獻,探討該領(lǐng)域的研究趨勢、研究熱點及其他有用信息。

        1 數(shù)據(jù)與方法

        1.1 數(shù)據(jù)收集

        在WOS 核心數(shù)據(jù)庫中以“Breast cancer”和“PI3K”為主題詞檢索相關(guān)文獻,僅摘錄2022 年12 月31 日之前發(fā)布的相關(guān)英文文獻,結(jié)果共得到8094 篇WOS 核心文獻。將檢索出的8094 篇WOS核心合集文獻以“全記錄與引用的參考文獻”導出,并以純文本文件形式保存,以供后續(xù)分析。

        1.2 數(shù)據(jù)處理與分析

        本研究中用到的分析軟件包括Office 2021 和CiteSpace 6.1.R3 Advanced 軟件。將下載的文獻導入CiteSpace 軟件,利用其“Remove Duplication”功能刪除重復(fù)記錄,同時篩選保留論著、綜述及會議論文,最后共得到7590 篇文獻。CiteSpace 參數(shù)設(shè)置如下:時間跨度從1994—2022 年,時間切片為1 年,共選擇四種節(jié)點類型進行合作網(wǎng)絡(luò)分析:國家、機構(gòu)、關(guān)鍵詞和引文,同時選擇關(guān)鍵詞進行共現(xiàn)和突現(xiàn)分析,圖譜修剪方式選擇“Pathfinder”“Pruning sliced networks”“Pruning the merged network”,其他參數(shù)設(shè)置為默認值。

        2 結(jié)果

        2.1 年發(fā)文量分析

        將本研究納入的7590 篇WOS 核心合集文獻按發(fā)表時間進行統(tǒng)計,結(jié)果顯示最早關(guān)于PI3K文獻發(fā)布于1994 年,1994—2000 年發(fā)文較少,除2019 年略有下降外,2000 年后發(fā)文量呈逐年上升趨勢,2021 年發(fā)文量最多,達691 篇,截至目前發(fā)文量仍在不斷上漲,由此可見PI3K 通路在乳腺癌研究領(lǐng)域越來越受到重視,成為近年來的研究熱點,具有十分重要的研究價值和研究潛力。見圖1。

        圖1 1994—2022 年關(guān)于乳腺癌中PI3K 信號通路的年發(fā)文情況

        2.2 發(fā)文國家/地區(qū)、機構(gòu)分析

        2.2.1 國家/地區(qū)分析 用CiteSpace 軟件對世界各國家/地區(qū)發(fā)文情況及其合作關(guān)系進行可視化分析,并生成共現(xiàn)圖譜,圖譜密度0.0323,有93 個節(jié)點,138 條連線,時間切片為1 年。每個節(jié)點代表一個國家,較大的節(jié)點表示發(fā)布文章數(shù)更多。節(jié)點之間的連線代表國家之間的合作,連線粗細代表合作的密切程度。自1994 年以來,美國發(fā)文最多(2539 篇),其次是中國(2489 篇),兩國發(fā)文量占總發(fā)文量的67.62%,表明這兩個國家在此研究領(lǐng)域作出了巨大貢獻。中心性用于評估一個節(jié)點的重要性,盡管美國發(fā)表文章最多,但其中心性低于發(fā)文量不多的俄羅斯,提示俄羅斯在此領(lǐng)域的影響力高于美國。圖譜連線較稀疏,各國/地區(qū)間缺乏深層次的合作,且除美國和中國外,其他國家/地區(qū)發(fā)文量依然較少,表明該領(lǐng)域仍有許多值得探索的空間。見圖2。

        2.2.2 機構(gòu)分析 對各機構(gòu)發(fā)文及合作情況進行可視化分析,共有774 個機構(gòu)發(fā)表文章,發(fā)表數(shù)排名前三的機構(gòu)分別是德克薩斯大學安德森癌癥研究中心(245 篇)、中國醫(yī)科大學(145 篇)、哈佛大學(140 篇),其中哈佛大學中心性最高(0.26),提示哈佛大學是本領(lǐng)域高產(chǎn)且最具影響力的機構(gòu)。值得注意的是,發(fā)文量排名前十的機構(gòu)中有5 個來自美國,5 個來自中國,由此可見研究力量仍集中于這兩個國家,在未來的研究中還應(yīng)加強與其他國家機構(gòu)的合作共享。見圖3。

        2.3 關(guān)鍵詞可視化分析

        2.3.1 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析 關(guān)鍵詞是對研究內(nèi)容的高度凝練,對關(guān)鍵詞進行分析可以幫助我們快速掌握文章的主題,從而把握該領(lǐng)域的研究熱點及研究前沿。通過CiteSpace 軟件共提取出943 個關(guān)鍵詞,出現(xiàn)次數(shù)較多的關(guān)鍵詞包括乳腺癌、表達、激活、通路、生長、凋亡、蛋白質(zhì)、信號通路、磷酸化、抗腫瘤活性、雌激素受體,其中激活、磷酸化、蛋白質(zhì)、抗腫瘤活性的中心性>0.1,提示這些關(guān)鍵詞是乳腺癌PI3K 通路領(lǐng)域的研究熱點。見圖4。

        2.3.2 關(guān)鍵詞突現(xiàn) 突現(xiàn)詞是指一個詞或一篇文章在一段時間內(nèi)突然興起,是推斷特征研究領(lǐng)域研究前沿的重要指標[10]。在此提取了出現(xiàn)次數(shù)最多的30 個關(guān)鍵詞。突現(xiàn)強度和持續(xù)時間是評估突現(xiàn)詞的兩個指標,時間線用藍線表示,而突現(xiàn)則顯示為一段紅色條帶,表示突現(xiàn)的開始年份、結(jié)束年份和持續(xù)時間?!癙I3K”突現(xiàn)強度最強(38.93),其次是“雙盲”(30.18);“PI3K”“乳腺上皮細胞”“腫瘤細胞”“因子受體”突現(xiàn)持續(xù)時間最長,均為16 年;截至2022 年仍處于爆發(fā)階段的是“促進”“三陰性乳腺癌”“雙盲”,表明這些關(guān)鍵詞是該領(lǐng)域的研究前沿,其中“雙盲”是2019 年出現(xiàn)的最新突現(xiàn)詞,突現(xiàn)強度為30.18。由此可見,PI3K 通路在乳腺癌中的研究已進入藥物臨床研究階段,PI3K 信號通路抑制劑聯(lián)合化療藥物、分子靶向藥物和放療將成為新的研究策略[11]。見圖5。

        圖5 乳腺癌中PI3K 信號通路的關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析

        2.4 文獻共被引分析

        2.4.1 文獻共被引可視化分析 文獻共被引是指在被引文獻的參考文獻列表中,兩篇文章被共同引用的頻率[12]。利用CiteSpace 軟件構(gòu)建共被引參考文獻的引文網(wǎng)絡(luò)圖及聚類圖,聚類圖譜網(wǎng)絡(luò)模塊化Q值為0.8133,平均輪廓系數(shù)為0.9056,表明該網(wǎng)絡(luò)有較好的聚類性能及高度可靠性,且最大的22個聚類平均輪廓系數(shù)均>0.8,進一步證實了該聚類的可靠性。聚類大小表示每個群集中包含的引用數(shù),#0 進展期腫瘤是最大的聚類,包含229 篇引文。內(nèi)分泌治療聯(lián)合或不聯(lián)合CDK4/6 抑制劑是HR 陽性進展期乳腺癌患者的標準治療方案。然而,獲得性耐藥對內(nèi)分泌治療仍然是一個挑戰(zhàn)[13-15]。見圖6 ~7。

        圖6 乳腺癌中PI3K 信號通路的研究文章共被引分析圖譜

        圖7 乳腺癌中PI3K 信號通路的研究文章共被引聚類分析

        2.4.2 引文突現(xiàn) 引文突現(xiàn)是確定當下最活躍研究主題的指標。共列出了突現(xiàn)強度最強的前25篇文章,Bray 等[16]于2018 年發(fā)表的“Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries”突現(xiàn)強度最強(106.17),且一直持續(xù)至今。文章參考國際癌癥研究機構(gòu)編制的“GLOBOCAN 2018”癌癥發(fā)病率和死亡率,提供了全球癌癥負擔的現(xiàn)狀報告,重點關(guān)注世界20 個地區(qū)的地理變異性。見圖8。

        圖8 乳腺癌中PI3K 信號通路的研究文章引文突現(xiàn)分析

        3 討論

        本研究對WOS 核心合集中與乳腺癌PI3K 通路有關(guān)的7590 篇文章進行文獻計量學分析。利用Office 和CiteSpace 軟件對收集的數(shù)據(jù)進行聚類和可視化分析,以了解該領(lǐng)域的研究成果、研究熱點和研究前沿,從而為研究人員和臨床工作者提供新的思路。研究結(jié)果顯示,自1994 年開始,年發(fā)文量總體呈逐年上升趨勢,2016 年后年發(fā)文量均保持在500 篇以上,提示PI3K 信號通路仍是乳腺癌領(lǐng)域的研究熱點,因此本研究認為在未來幾年相關(guān)研究還將持續(xù)增加。除美國和中國外,其他國家在本領(lǐng)域相關(guān)研究較少,文章產(chǎn)出較少,且合作網(wǎng)絡(luò)稀疏,需要加強國際合作共享。研究還發(fā)現(xiàn),在乳腺癌PI3K信號通路領(lǐng)域中出現(xiàn)的高頻關(guān)鍵詞包括乳腺癌、表達、激活、雌激素受體等,最新研究趨勢突現(xiàn)詞包括“促進”“三陰性乳腺癌”“雙盲”。

        基于目前PIK3CA 抑制劑聯(lián)合氟維司群在晚期HR 陽性乳腺癌患者中具有較好的臨床效果以及相關(guān)的臨床/臨床前試驗數(shù)據(jù),PI3K 信號通路抑制劑將有良好的應(yīng)用前景。但PIK3CA 抑制劑僅適用于內(nèi)分泌治療后進展的晚期PIK3CA 突變患者,這大大限制了該藥的日常應(yīng)用,新的聯(lián)合用藥方案亟待進一步研究。同時大量基礎(chǔ)實驗結(jié)果顯示,PAM 信號通路與腫瘤免疫微環(huán)境存在交互效應(yīng),PI3K 信號通路在免疫治療方面的作用也可以作為研究人員新的研究思路[16]。

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