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        miR-216b-5p 通過靶向NCOA3 促進膠質(zhì)母細胞瘤細胞鐵死亡

        2023-09-23 13:35:34高必波孫會英冷登輝冉小平
        昆明醫(yī)科大學學報 2023年8期
        關(guān)鍵詞:檢測

        王 東 ,高必波 ,孫會英 ,冷登輝 ,冉小平 ,林 文

        (1)資陽市人民醫(yī)院神經(jīng)疾病科,四川 資陽 641300;2)昆明醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院神經(jīng)外科,云南 昆明 650032)

        膠質(zhì)母細胞瘤(Glioblastoma)是成年人中樞神經(jīng)系統(tǒng)中惡性程度最高且最常見的腫瘤[1],目前的標準治療方法為最大程度切除腫瘤后口服替莫唑胺聯(lián)合全腦放射[2]。但是因其增殖快,侵襲性強,血管生成迅速豐富的特點,腫瘤的復發(fā)率接近100%,5 a 總生存率為5%[3]。因此,深入研究膠質(zhì)瘤的發(fā)病機制以及潛在治療靶向迫在眉睫。鐵死亡(Ferroptosis)是一種非典型性程序性細胞死亡的方式,由脂質(zhì)過氧化損傷引起[3-4]。由于癌細胞獨特的代謝特征,鐵死亡對腫瘤細胞的惡性生物學特征以及腫瘤的發(fā)展的影響逐漸引起人們的重視[5-6]。微小核糖核酸(microRNAs,miRNA)是大小約為 22 個核苷酸的轉(zhuǎn)錄本,在細胞核和細胞質(zhì)中通過多步過程產(chǎn)生,且被證實參與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展過程[7]。本文主要探討miR-216b-5p 通過靶向NCOA3 對膠質(zhì)瘤細胞鐵死亡的影響,以期為膠質(zhì)母細胞瘤的臨床治療提供新的靶點。

        1 材料與方法

        1.1 細胞培養(yǎng)

        人腦正常膠質(zhì)細胞HEB,人腦膠質(zhì)母細胞瘤細胞株LN299 和U251 均購自ATCC(American type culture collection)公司。細胞均培養(yǎng)在加入10% 胎牛血清和100 U/mL 青霉素-鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)基(購于武漢普諾賽)中,在37℃,5% CO2 的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。U251 使用DMSO 溶液充分溶解的Erastin 溶液(50 mg Erastin 粉末中加入 1.83 mL DMSO 溶液充分溶解成 50 mM 儲存液,工作濃度為5.47 μg/g)或等體積DMSO 溶液刺激,miR-216b-5p mimics,miR-216b-5p inhibitor,pcDNA-NCOA3 以及對應的陰性對照質(zhì)粒均設計并構(gòu)建自上海吉滿生物科技,通過Lipofectamine TM 2000 agent(Invitrogen,美國)進行。U251 細胞分為DMSO 處理組(等量DMSO 刺激24 h),Erastin 處理組(Erastin 刺 激24 h),Erastin +mimic NC 組(轉(zhuǎn)染mimic NC 后Erastin 刺激24 h),Erastin+miR-216b-5p mimic 組(轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimic 后Erastin 刺激24 h),Erastin+pcDNA 3.1 組(轉(zhuǎn)染pcDNA 3.1 后Erastin 刺激24 h),Erastin+pcDNA-NCOA3 組(轉(zhuǎn)染pcDNA-NCOA3后 Erastin 刺激 24 h),pcDNA+miR-216b-5p mimic+pcDNA-NCOA3 組(共同轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimic 和pcDNA-NCOA3 后Erastin 刺激24 h)。

        1.2 RNA 以及蛋白表達檢測

        各組細胞接種到6 孔板后,加入TRIZOL 裂解液提取總RNA 后通過分光光度計檢測RNA 的濃度和純度。使用Reverse Transcription Kits(TaKaRa,TRR820A)或Bulge-Loop miRNA qRTPCR Starter Kit(銳博,C10211-1)進行逆轉(zhuǎn)錄,SYBR? premix Ex TaqTM 實時定量PCR 試劑盒(大連寶生物公司)進行PCR 擴增并進行qPCR 分析。mRNA 水平檢測采用GAPDH 作為內(nèi)參基因,miRNAs 水平檢測采用U6 作為內(nèi)參基因。采用2-ΔΔCT方法分析mRNA 的相對表達水平,重復3次實驗。熒光定量PCR 擴增引物序列見表1。所有引物均由廣州銳博生物有限公司設計并合成。

        表1 熒光定量PCR 擴增引物列表Tab.1 Nucleotide sequences of the primers used for real-time quantitative PCR

        使用RIPA 法對細胞進行裂解,即將RIPA 裂解液(含0.01% PMSF、150 nmol/L Tris(pH=8)、0.1% SDS、0.2% EDTA、1% Triton X-100、1%脫氧膽酸鈉)置于冰上30 min 充分裂解細胞,通過BCA 蛋白質(zhì)測定法(購于江蘇凱基生物技術(shù)公司)對蛋白量進行測定,將等量蛋白(30~50 μg)和2×SDS 上樣混合液混合并煮沸5 min,10% SDSPAGE 分離蛋白并轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(Millipore,美國)。將膜在室溫下用5% 脫脂奶粉封閉后,與按比例稀釋后的一抗(表2)4℃下孵育過夜,清洗后與二抗室溫下孵育2 h,通過增強化學發(fā)光法(Millipore,美國)使條帶顯色,GAPDH被用于內(nèi)參基因。

        表2 Western blot 中所用一抗Tab.2 Primary antibodies used in western blot

        1.3 細胞增殖凋亡檢測

        將細胞以3 000 個細胞每孔的密度接種于96孔板,每組6 個復孔,每孔加入100 μL 含有CCK-8 工作液(Abcam,批號 ab228554,工作液:培養(yǎng)基=1∶10)的DMEM 培養(yǎng)基,37℃避光孵育,酶標儀檢測450 nm 處吸光度值。凋亡檢測試劑盒購于東仁化學,用預冷的70%酒精固定細胞,并用PBS 清洗。然后將細胞與5 mL Annexin VFITC 和10 μL PI 孵育15 min,使用激發(fā)波長為488 納米的流式細胞儀觀察和分析凋亡細胞的比例。

        1.4 生化指標檢測

        取各組細胞,使用丙二醛(MDA)測定試劑盒(TBA 法)(南京建成 A003-1-2),鐵檢測試劑盒(abcam,ab83366),谷氨酸(Glu)含量測試盒(酶聯(lián)生物,ml076520),谷氨酰胺檢測試劑盒(abcam,ab197011),α-酮戊二酸檢測試劑盒(abcam,ab83431)按說明書制備樣本,通過酶標儀分析MDA 水平,亞鐵(Fe2+)水平,谷氨酰胺水平,谷氨酸水平,α-酮戊二酸水平。

        1.5 靶向預測及驗證

        通過miRDB(https://mirdb.org/)預測miR-216b-5p 的下游靶向基因,通過FeffDb 數(shù)據(jù)庫(http://www.zhounan.org/ferrdb/current/)獲取鐵死亡相關(guān)基因,通過GeneCards(https://www.genecards.org/)獲取膠質(zhì)母細胞瘤相關(guān)基因,并使用Venn 圖(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)獲取共有基因,用clusterProfiler 包進行GO 富集。通過miRDB 預測miR-216b-5p 與NCOA3 的結(jié)合靶點,將含有miR-216b-5p 的野生或突變型NCOA 3 質(zhì)粒構(gòu)建到pRL-CMV 載體中,通過lipofectamine 2000 將WT-NCOA 3,Mut-NCOA 3,miR-216b-5p mimics,mimic NC 轉(zhuǎn)染入U251 細胞,并按照Dual-Luciferase Reprter Assay System 試劑盒說明書(Promega,美國)測量Renilla 和Firefly的熒光素酶活性并計算相對熒光強度。

        1.6 統(tǒng)計學處理

        通過Graph-Pad Prism 8.0 軟件(GraphPad Software,San Diego,CA)進行 Kolmogorov-Smirnov 檢驗數(shù)據(jù)的正態(tài)性。正態(tài)分布的連續(xù)性變量均以平均數(shù)±標準差()表示,并通過Graph-Pad Prism 8.3 軟件進行統(tǒng)計分析。組間比較采用單因素方差分析,如有差異進一步用Tukey’s 檢測兩兩比較,P< 0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 miR-216-5p 的上調(diào)緩解膠質(zhì)母細胞瘤細胞在Erastin 介導的凋亡

        首先驗證miR-216a-5p 在膠質(zhì)母細胞瘤中的表達。與人腦膠質(zhì)細胞HEB 相比,miR-216b-5p在人膠質(zhì)母細胞瘤細胞株LN229 和U251 中均高表達(圖1A)。為了驗證miR-216b-5p 對膠質(zhì)母細胞瘤細胞株中鐵死亡的影響,通過鐵死亡誘導劑Erastin 調(diào)控U251 中鐵死亡的發(fā)生,并轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimics 調(diào) 控miR-216b-5p 在U251中的表達。qPCR 的結(jié)果顯示,與加入等劑量的DMSO 的 U251 細胞相比,miR-216b-5p 在Erastin 的刺激下下調(diào),而轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimics 會使U251 細胞中的miR-216b-5p 上調(diào),說明質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染成功(圖1B)。通過CCK-8 和流式細胞術(shù)分別檢測細胞的增殖和凋亡,發(fā)現(xiàn)相較于DMSO 處理的細胞相比,Erastin 刺激下的U251 的細胞活力下降,且凋亡比率上升,而轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimics 后,細胞活力回升且細胞凋亡率下降(圖1C~1D)。說明miR-216b-5p 參與Erastin 介導的細胞凋亡。

        圖1 miR-216b-5p 參與Erastin 介導的細胞凋亡Fig.1 miR-216b-5p was involved in Erastin-mediated apoptosis

        2.2 miR-216-5p 的上調(diào)緩解膠質(zhì)母細胞瘤細胞在Erastin 介導的脂質(zhì)過氧化和鐵離子累積

        為了進一步研究miR-216-5p 對U251 中鐵死亡的影響,分別檢測了U251 中MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,α-酮戊二酸的含量。結(jié)果顯示,在Erastin 的刺激下,U251 中的MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,α-酮戊二酸均有明顯的上調(diào),而轉(zhuǎn)染miR-216b-5p mimics 后,U251 中的MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,α-酮戊二酸均有明顯下降(圖2A~E)。同時,western blot 的結(jié)果顯示,鐵死亡相關(guān)蛋白PTGS2,NOX1,ACSL4 的蛋白表達量在Erastin 的刺激下明顯上升,而GPX4,F(xiàn)TH1 的蛋白量明顯下降;miR-216b-5p 的轉(zhuǎn)染可逆轉(zhuǎn)以上結(jié)果(圖2F~2K)。以上結(jié)果說明miR-216-5p 可通過調(diào)節(jié)脂質(zhì)過氧化和鐵離子累積抑制細胞的鐵死亡。

        圖2 miR-216-5p 的上調(diào)緩解膠質(zhì)母細胞瘤細胞在Erastin 介導的脂質(zhì)過氧化和鐵離子累積Fig.2 Upregulation of miR-216-5p alleviates Erastin-mediated lipid peroxidation and iron accumulation in glioblastoma cells

        2.3 miR-216b-5p 直接靶向并負向調(diào)控NCOA3

        為了進一步研究miR-216b-5p 對U251 中鐵死亡的調(diào)節(jié)機制,通過miRDB 預測miR-216b-5p 的靶向基因共489 個,通過Gencards 獲取膠質(zhì)母細胞瘤相關(guān)基因8 289 個,通過FeffDb 數(shù)據(jù)庫(http://www.zhounan.org/ferrdb/current/)獲取鐵死亡相關(guān)基因 934 個。通過Venn 圖取交集,獲得9個在膠質(zhì)母細胞瘤中與鐵死亡相關(guān),且與miR-261b-5p 有直接靶向關(guān)系的基因,即FOXO4,NCOA3,PARP8,PARP11,LIG3,MAPK9,TLR4,RB1,PTEN(圖3A)。對以上9 個基因進行GO/KEGG 富集分析,以上基因主要富集在調(diào)節(jié)DNA 結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子的活性,有絲分裂細胞周期相變的負向調(diào)節(jié),有絲分裂細胞周期的負向調(diào)節(jié),細胞周期相變的負向調(diào)控,細胞周期過程的負向調(diào)節(jié)等功能上(圖3B)。根據(jù)miRDB 的Target score 大小排序,選擇NCOA3 進行后續(xù)研究。通過雙熒光素酶對miR-216b-5p 和NCOA3的靶向關(guān)系進行驗證,結(jié)果顯示,當細胞共同轉(zhuǎn)染了MUT-NCOA3 質(zhì)粒和miR-NC 或miR-216b-5p mimics 后,相對熒光素酶活性沒有明顯區(qū)別,而與NC 模擬物相比,miR-216b-5p mimics 與WT-NCOA3 共同轉(zhuǎn)染后相對熒光素酶活性下降(P< 0.000 1,圖3C~D)。因此證明了NCOA3 與miR-216b-5p 之間的靶標關(guān)系。qPCR 以 及Western blot 實驗結(jié)果顯示,當miR-216b-5p 過表達,NCOA3 的mRNA 以及蛋白表達下降,而當miR-216b-5p 被敲降,NCOA3 的mRNA 以及蛋白表達上升(圖3E~G)。因此證明miR-216b-5p 可負向調(diào)節(jié)NCOA3 的表達。

        圖3 miR-216b-5p 直接靶向并負向調(diào)控NCOA3Fig.3 miR-216b-5p directly targets and negatively regulates NCOA3

        2.4 miR-216b-5p 通過NCOA3 調(diào)控膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡

        為了明確NCOA3 在膠質(zhì)母細胞瘤細胞中對鐵死亡的調(diào)控作用,將U251 分別轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-NCOA3 和miR-216b-5p mimic,并使用DMSO或Erastin 進行處理。結(jié)果顯示,U251 細胞在Erastin 處理后,細胞活力明顯下降,MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,a-酮戊二酸均有明顯的上調(diào),鐵死亡相關(guān)蛋白PTGS2,NOX1,ACSL4 的蛋白表達量明顯上升,而GPX4,F(xiàn)TH1 的蛋白量明顯下降;而轉(zhuǎn)染NCOA3 使細胞活力進一步下降,MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,a-酮戊二酸再次上升,鐵死亡相關(guān)蛋白PTGS2,NOX1,ACSL4 的蛋白表達量再次上升,而GPX4,F(xiàn)TH1 的蛋白量明顯下降;但miR-216b-5p mimic 的轉(zhuǎn)染可逆轉(zhuǎn)以上結(jié)果(圖4)。以上結(jié)果說明,miR-216b-5p 通過NCOA3 調(diào)控膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡。

        圖4 miR-216b-5p 通過NCOA3 調(diào)控膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡Fig.4 miR-216b-5p regulates iron death in glioblastoma cells via NCOA3

        3 結(jié)論

        膠質(zhì)母細胞瘤屬于成人彌漫性膠質(zhì)瘤,IDH1/2 野生型,WHO4 級;在原發(fā)性惡性腦腫瘤中占約45.6%,且在膠質(zhì)瘤中惡性程度最高,五年生存率不足5%,平均生存時間僅14 個月[5,8-9]。目前針對膠質(zhì)母細胞瘤主要通過最大限度切除病灶,輔以放療和烷基化劑化療為主[10-11],但由于膠質(zhì)母細胞瘤的高侵襲性以及對化療藥物的耐藥性使膠質(zhì)母細胞瘤治療效果差,且極易復發(fā)[12]。因此,對膠質(zhì)母細胞瘤發(fā)病機制研究以及對治療靶點的探索,以期發(fā)現(xiàn)新的治療方式對膠質(zhì)母細胞瘤的臨床診斷具有重要意義。

        鐵死亡是一種鐵依賴性的細胞程序性死亡形式,主要表現(xiàn)為細胞內(nèi)線粒體收縮,雙層膜的密度增加,線粒體嵴減少或減少,線粒體外膜破裂等[13-14]。鐵死亡的誘導途徑主要分為脂質(zhì)代謝途徑以及鐵代謝途徑。在脂質(zhì)代謝途徑中,主要通過胱氨酸谷氨酸反轉(zhuǎn)運系統(tǒng)Xc-(cystine/glutamate antiporter,system Xc-)降低細胞中谷胱甘肽和半胱氨酸的水平,或通過降低谷胱甘肽過氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)的表達水平來誘導鐵死亡的產(chǎn)生;在鐵代謝途徑中,通過誘導細胞中亞鐵離子水平的增加來誘導鐵死亡的產(chǎn)生。鐵死亡在膠質(zhì)母細胞瘤中發(fā)揮的作用逐漸受到重視[15-16]。Li 等[8]發(fā)現(xiàn)NF-κB 通路在GPX4 抑制劑RAS 選擇性致死性小分子3(RAS-selective lethal 3,RSL3)對應膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡的激活中發(fā)揮重要的作用。Yee 等[17]發(fā)現(xiàn)在膠質(zhì)母細胞瘤早期中性粒細胞誘導的鐵死亡促進腫瘤的發(fā)展。Erastin 是一種小分子化合物,其激活細胞鐵死亡主要通過抑制抑制Xc-系統(tǒng)上SLC7A11的表達,減少胱氨酸的攝取,導致GPX4 合成減少和脂質(zhì)過氧化水平的升高[18]。Chen 等發(fā)現(xiàn)[19]Erastin 抑制了半胱氨酸轉(zhuǎn)運體的吸收,并降低膠質(zhì)母細胞瘤對特莫唑胺的耐藥性。類似地,本實驗發(fā)現(xiàn)Erastin 的刺激使細胞活力下降,細胞凋亡率上升,同時U251 中的MDA,亞鐵(Fe2+),谷氨酰胺,谷氨酸,a-酮戊二酸均有明顯的上調(diào),鐵死亡相關(guān)蛋白PTGS2,NOX1,ACSL4 的蛋白表達量明顯上升,而GPX4,F(xiàn)TH1的蛋白量明顯下降,預示著Erastin 可以通過誘導膠質(zhì)瘤母細胞瘤細胞中的鐵死亡的產(chǎn)生抑制腫瘤細胞的生長。

        miR-216b-5p 被發(fā)現(xiàn)在多種腫瘤中起到腫瘤抑制基因的作用。作為一種微小RNA,miR-216b-5p 參與調(diào)控乳腺癌[20],結(jié)腸癌[21-22],前列腺癌[23],漿液性上皮性卵巢癌[24]等腫瘤細胞的增殖,侵襲,化療耐藥性等惡性生物學特征。本研究同樣發(fā)現(xiàn),miR-216b-5p 在膠質(zhì)母細胞瘤中高表達,Erastin 的刺激使U251 細胞中的miR-216b-5p 表達下降,而miR-216b-5p 參與U251 細胞鐵死亡引起的細胞凋亡,脂質(zhì)過氧化和鐵離子累積。核受體輔助因子(nuclear receptor coactivator,NCOA3)是類固醇受體輔助因子(steroid receptor coactivator,SRC)家族的成員,通過與轉(zhuǎn)錄因子的相互作用調(diào)節(jié)基因的表達。NCOA3 在多種腫瘤中被報道具有促進腫瘤發(fā)生與發(fā)展的作用[25-27]。有研究發(fā)現(xiàn),NCOA3 通過與NR5A2 的協(xié)作抑制BET 抑制劑在乳腺癌中對鐵死亡的誘導,從而減壓腫瘤細胞的藥物抵抗性[28]。本實驗發(fā)現(xiàn),miR-216b-5p 直接靶向并負向調(diào)控NCOA3 的表達,且通過NCOA3 調(diào)控膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)miR-216b-5p 直接靶向NCOA3,且通過NCOA3 調(diào)控膠質(zhì)母細胞瘤細胞的鐵死亡,以此促進腫瘤的凋亡。本研究對膠質(zhì)母細胞瘤的新的治療靶點以及后續(xù)研究提出了新的可能性,以期為膠質(zhì)母細胞瘤的治療提供新思路。

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