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        基于深度學(xué)習(xí)的CT-MR 圖像聯(lián)合配準(zhǔn)分割方法

        2023-09-18 04:36:00錢旭升申明磊胡冀蘇戴亞康周志勇
        計(jì)算機(jī)工程 2023年9期
        關(guān)鍵詞:一致性模態(tài)監(jiān)督

        洪 犇,錢旭升,申明磊,胡冀蘇,耿 辰,戴亞康,周志勇

        (1.南京理工大學(xué) 電子工程與光電技術(shù)學(xué)院,南京 210094;2.中國科學(xué)院 蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所,江蘇 蘇州 215163)

        0 概述

        人工智能技術(shù)已經(jīng)成功應(yīng)用到許多醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中,如手術(shù)計(jì)劃導(dǎo)航、輔助診斷、圖像引導(dǎo)的消融等。作為醫(yī)學(xué)圖像分析中最基本的兩項(xiàng)任務(wù),圖像配準(zhǔn)和圖像分割對(duì)于輔助解決醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的各種問題具有重要意義[1-2]。

        圖像配準(zhǔn)的目的是得到兩幅圖像之間的逐像素轉(zhuǎn)換參數(shù),利用這組轉(zhuǎn)換參數(shù)使兩幅圖像在解剖結(jié)構(gòu)上保持一致[3]。不同于單模態(tài)配準(zhǔn),多模態(tài)配準(zhǔn)在不同模態(tài)圖像的灰度和紋理上差異較大[4],以往基于灰度的測(cè)度方式無法有效匹配多模態(tài)圖像之間的特征[5]?;谏蓪?duì)抗網(wǎng)絡(luò)(Generative Adversarial Network,GAN)的方法將圖像從一種模態(tài)轉(zhuǎn)換到另一種模態(tài),從而將多模態(tài)配準(zhǔn)轉(zhuǎn)換成更為簡(jiǎn)單的單模態(tài)配準(zhǔn)[6]。文獻(xiàn)[7]進(jìn)一步擴(kuò)展了該工作,同時(shí)實(shí)現(xiàn)單模態(tài)和多模態(tài)的配準(zhǔn)。生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的方法往往難以訓(xùn)練,且不可避免地帶來一些人工特征的干擾[8]。通過構(gòu)造特征描述符,文獻(xiàn)[9]基于鄰域描述子(Modality Independence Neighborhood Descriptor,MIND)設(shè)計(jì)損失函數(shù),以人工構(gòu)造特征對(duì)配準(zhǔn)進(jìn)行監(jiān)督。然而,無監(jiān)督學(xué)習(xí)的方法缺少解剖學(xué)的語義信息,難以達(dá)到更加準(zhǔn)確的配準(zhǔn)效果[10-11]。弱監(jiān)督學(xué)習(xí)的配準(zhǔn)方法使用組織分割標(biāo)簽描述不同模態(tài)圖像之間相同的器官邊界或病灶區(qū)域,引導(dǎo)配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)從分割標(biāo)簽推斷解剖結(jié)構(gòu)對(duì)應(yīng)關(guān)系,從而實(shí)現(xiàn)多模態(tài)配準(zhǔn)。例如,文獻(xiàn)[12]利用分割標(biāo)簽作為弱監(jiān)督信息,在MR-TRUS 圖像對(duì)上實(shí)現(xiàn)了多模態(tài)配準(zhǔn)。為了解決分割標(biāo)簽覆蓋面積不足的問題。文獻(xiàn)[13]在配準(zhǔn)的同時(shí)對(duì)圖像和分割標(biāo)簽進(jìn)行形變操作,形成全局和局部相結(jié)合的配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)。

        醫(yī)學(xué)圖像分割的目的是得到感興趣區(qū)域的分割標(biāo)簽[14],并提取出邊界信息進(jìn)一步執(zhí)行圖像分析與計(jì)算機(jī)輔助診斷等任務(wù)。2015 年,文獻(xiàn)[15]提出了U-Net 分割網(wǎng)絡(luò),利用U 型結(jié)構(gòu)和跳躍連接融合了不同層次的信息,在圖像分割領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。通過設(shè)計(jì)不同深度的嵌套子網(wǎng)絡(luò),UNet++[16]的提出解決了U-Net 網(wǎng)絡(luò)深度設(shè)計(jì)的問題,并通過深監(jiān)督機(jī)制大幅縮減了參數(shù)量,使得網(wǎng)絡(luò)分割精度進(jìn)一步提升。文獻(xiàn)[17]將U-Net 中傳統(tǒng)卷積替換為內(nèi)卷操作,進(jìn)一步提升了局部特征學(xué)習(xí)能力。然而,上述方法都依賴于真實(shí)標(biāo)注的組織分割標(biāo)簽,并且容易受到不同標(biāo)注者的主觀影響。針對(duì)這一問題,文獻(xiàn)[18]利用兩個(gè)協(xié)同模型組成協(xié)同訓(xùn)練框架,分別預(yù)測(cè)未標(biāo)記數(shù)據(jù)的偽標(biāo)簽來互相指導(dǎo),通過互補(bǔ)性避免了單個(gè)模型無法保證偽標(biāo)簽質(zhì)量的問題。

        配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò)在各自的領(lǐng)域已經(jīng)達(dá)到了一定的效果,然而它們卻被視為相互獨(dú)立的任務(wù)。但是,分割和配準(zhǔn)任務(wù)存在一定的關(guān)聯(lián)性,即配準(zhǔn)和分割都可以通過分割標(biāo)簽的輔助解剖信息來提高任務(wù)的精度[19]。具體地說,分割可以通過將帶有分割標(biāo)簽的圖像配準(zhǔn)到待分割圖像上以得到對(duì)應(yīng)的分割標(biāo)簽[20],配準(zhǔn)可以通過將輔助分割標(biāo)簽信息加入損失函數(shù)[21]實(shí)現(xiàn)多模態(tài)配準(zhǔn)。因此,通過分割和配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)的聯(lián)合優(yōu)化,可以進(jìn)一步提升兩者的精度[22-24]。文獻(xiàn)[25]利用硬參數(shù)共享的方式提出聯(lián)合配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)U-ReSNet,通過最小化均方誤差和局部互相關(guān)來同時(shí)約束配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò)。文獻(xiàn)[26]利用軟參數(shù)共享的方法,提出一種“十字繡”網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),同時(shí)在編碼和解碼階段共享配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò)參數(shù),實(shí)現(xiàn)更好的泛化性能。以上多任務(wù)學(xué)習(xí)的方法雖然很好地將配準(zhǔn)與分割相結(jié)合,但是需要對(duì)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行大量修改,難以適應(yīng)最新的配準(zhǔn)和分割算法。為此,一些無須改動(dòng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的聯(lián)合配準(zhǔn)分割框架被提出。文獻(xiàn)[27]提出一種聯(lián)合配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)框架DeepAtlas,為缺少標(biāo)簽時(shí)分割和配準(zhǔn)的聯(lián)合訓(xùn)練提供了一個(gè)通用的解決方案,該方案將已知的概率圖譜通過逆形變場(chǎng)進(jìn)行形變,并將得到先驗(yàn)的已形變概率圖譜作為分割的真實(shí)標(biāo)簽。文獻(xiàn)[28]實(shí)現(xiàn)了無監(jiān)督聯(lián)合配準(zhǔn)分割模型U-RSNet。文獻(xiàn)[29]提出了聯(lián)合學(xué)習(xí)框架RsegNet,通過正逆形變場(chǎng)的雙一致性監(jiān)督實(shí)現(xiàn)解剖一致性,并在4 個(gè)公共數(shù)據(jù)集上進(jìn)行驗(yàn)證,效果均優(yōu)于單獨(dú)訓(xùn)練的網(wǎng)絡(luò)。然而,目前的各種聯(lián)合配準(zhǔn)分割方法大都局限于單模態(tài)數(shù)據(jù)。由于分割網(wǎng)絡(luò)難以適應(yīng)不同模態(tài)的圖像,因此無法同時(shí)得到不同模態(tài)的圖像分割標(biāo)簽,導(dǎo)致聯(lián)合配準(zhǔn)分割方法難以應(yīng)用到多模態(tài)數(shù)據(jù)中。此外,聯(lián)合配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)大都需要大量的分割標(biāo)簽來保證訓(xùn)練的進(jìn)行,如果缺少標(biāo)簽則難以完成聯(lián)合過程[27]。

        本文提出一種基于深度學(xué)習(xí)的聯(lián)合配準(zhǔn)分割算法,并構(gòu)建基于多尺度鄰域描述符和一致性監(jiān)督的聯(lián)合配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)(Multi-scale neighborhood descriptor and Consistency supervision based joint Registration and Segmentation Network,MC-RSNet)框架,該框架包含兩個(gè)分割網(wǎng)絡(luò)和一個(gè)多模態(tài)配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò),通過配準(zhǔn)-分割迭代優(yōu)化的方式同時(shí)實(shí)現(xiàn)兩項(xiàng)任務(wù),利用模態(tài)一致性監(jiān)督通過配準(zhǔn)產(chǎn)生的形變場(chǎng)使兩個(gè)獨(dú)立的分割網(wǎng)絡(luò)互為監(jiān)督,進(jìn)而提升多模態(tài)圖像分割的精度,并在此基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)一種多尺度模態(tài)獨(dú)立鄰域描述符,通過構(gòu)建多個(gè)尺度的鄰域范圍擴(kuò)充描述符的上下文信息,為多模態(tài)圖像配準(zhǔn)提供更準(zhǔn)確的不同模態(tài)之間的特征對(duì)應(yīng)關(guān)系,以提高配準(zhǔn)精度。

        有些學(xué)生為了達(dá)到美化的目的,在繪圖手段上花費(fèi)的時(shí)間過多;也有的為了“可視化”而“可視化”,置換了一些更好的教學(xué)方法,得不償失。所以,教師要注意,教無定法,在中考復(fù)習(xí)中“思維可視化”只是一種策略、一種手段,不是替代當(dāng)前的教學(xué)方法,而是與之相適應(yīng)、相配合。只有讓“思維可視化”與“中考復(fù)習(xí)”和諧地融為一體,促進(jìn)學(xué)生對(duì)科學(xué)本質(zhì)的理解,才能使凝固的課堂重新煥發(fā)出生命的活力,才能在這場(chǎng)沒有硝煙的中考復(fù)習(xí)戰(zhàn)中獲勝。

        1 聯(lián)合配準(zhǔn)分割方法

        定義Im和If分別表示浮動(dòng)圖像(MR)和固定圖像(CT),Lm,seg和Lf,seg分別表示MR 圖像的分割標(biāo)簽和CT 圖像的分割標(biāo)簽,在所有M對(duì)CT-MR 圖像對(duì)中提供了N(N

        多模態(tài)配準(zhǔn)的目的是找到一組最優(yōu)的空間變換參數(shù)?(形變場(chǎng)),使得不同模態(tài)的圖像在解剖結(jié)構(gòu)上對(duì)齊;分割的目的是在圖像中分離出器官等感興趣區(qū)域。對(duì)于上述兩項(xiàng)任務(wù),通過最小化相似性度量來訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò),以學(xué)習(xí)最優(yōu)網(wǎng)絡(luò)參數(shù),從而得到最優(yōu)網(wǎng)絡(luò)模型。根據(jù)本文中損失函數(shù)的具體設(shè)計(jì),將圖像配準(zhǔn)和分割的過程表示如下:

        其中:EmsMIND是基于多尺度模態(tài)獨(dú)立鄰域描述符構(gòu)造的圖像相似性測(cè)度,用于計(jì)算圖像結(jié)構(gòu)相似度;Econsistency用于約束分割標(biāo)簽圖像中的圖像輪廓對(duì)齊程度;Esmooth表示對(duì)形變場(chǎng)不平滑的懲罰;°表示由配準(zhǔn)形變場(chǎng)?對(duì)浮動(dòng)圖像Im進(jìn)行空間變換。

        出口邊界:割草機(jī)出口設(shè)置為pressure-outlet,壓力邊界值p=1.3×105 Pa,即表壓設(shè)為0 Pa,湍流強(qiáng)度為5%,水力直徑為500 mm。

        1.1 配準(zhǔn)-分割聯(lián)合優(yōu)化的深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)

        為了能夠得到最佳的配準(zhǔn)效果,構(gòu)建基于多尺度配準(zhǔn)算法Ms-RNet[4]的配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò),如圖3 所示。在編碼階段,配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò)利用卷積來提取原始輸入圖像的特征。每個(gè)卷積中的核大小和步長(zhǎng)分別被設(shè)置為3×3×3 和1×1×1,隨后使用LReLU 激活函數(shù)增加非線性特征。卷積核的初始數(shù)量被設(shè)置為16,隨著每次最大池化不斷倍增最終達(dá)到64 個(gè)。在解碼器階段,通過上采樣恢復(fù)原始圖像的大小,同時(shí)通過跳躍連接與空間注意力結(jié)構(gòu)恢復(fù)編解碼過程中特征圖丟失的細(xì)節(jié)。

        聯(lián)合配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)框架如圖1 所示,該框架包括分割子網(wǎng)絡(luò)和配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò)兩個(gè)分支。在整體上,以M對(duì)浮動(dòng)圖像Im和固定圖像If及N對(duì)真實(shí)分割標(biāo)簽Lm,gt和Lf,gt作為輸入(N

        1.3.4 對(duì)照品溶液制備 精密稱取橙皮苷3.75 mg,置25 mL量瓶中,加甲醇溶解并稀釋至刻度,即得橙皮苷對(duì)照品儲(chǔ)備液,濃度為 0.15 mg/mL。

        圖1 基于配準(zhǔn)與分割的聯(lián)合優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)框架Fig.1 Joint optimization network framework based on registration and segmentation

        具體而言,在進(jìn)行聯(lián)合訓(xùn)練之前,首先利用配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò)在無監(jiān)督情況下[4]進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,然后利用分割子網(wǎng)絡(luò)在含有N對(duì)分割標(biāo)簽的M對(duì)數(shù)據(jù)上進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,得到預(yù)訓(xùn)練模型之后進(jìn)入聯(lián)合訓(xùn)練階段。在聯(lián)合訓(xùn)練過程中先后執(zhí)行配準(zhǔn)、分割,交替訓(xùn)練兩種網(wǎng)絡(luò)中的一種,同時(shí)保持另一種固定,形成完整的訓(xùn)練過程。在該過程中,分割為配準(zhǔn)提供標(biāo)簽輔助配準(zhǔn),配準(zhǔn)為分割提供形變場(chǎng)實(shí)現(xiàn)模態(tài)間一致性約束。利用兩者互補(bǔ)的特性,在循環(huán)交替的過程中傳遞互補(bǔ)的約束,實(shí)現(xiàn)互相提高,交替過程如圖2 所示。需要注意的是,只在第一輪訓(xùn)練時(shí)使用了預(yù)訓(xùn)練模型,此后交替訓(xùn)練使用的網(wǎng)絡(luò)均為上一步訓(xùn)練優(yōu)化的結(jié)果。具體訓(xùn)練步驟如下:

        圖2 配準(zhǔn)與分割的交替訓(xùn)練過程Fig.2 Alternating training process of registration and segmentation

        步驟1利用配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò)單獨(dú)對(duì)所有M對(duì)CTMR 圖像進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練;利用分割子網(wǎng)絡(luò)對(duì)N對(duì)含有分割標(biāo)簽的CT-MR 圖像進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練。將預(yù)訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò)作為聯(lián)合框架中的初始網(wǎng)絡(luò)。

        其中:P表示預(yù)測(cè)標(biāo)簽;G表示真實(shí)標(biāo)簽(groundtruth)。

        福建省在國家防辦制定的實(shí)施方案編制大綱基礎(chǔ)上,制定了福建省建設(shè)實(shí)施方案編制大綱,監(jiān)測(cè)預(yù)警系統(tǒng)建設(shè)技術(shù)要求,防御宣傳手冊(cè)、宣傳欄、警示牌樣式和防御預(yù)案編制要求和范本等。這些技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)明確了“構(gòu)建監(jiān)測(cè)預(yù)警網(wǎng)絡(luò)和群測(cè)群防的防御體系,完善‘預(yù)警到鄉(xiāng)、預(yù)案到村、責(zé)任到人’工作機(jī)制,實(shí)現(xiàn)有效防御山洪災(zāi)害,保障人民群眾生命安全,最大限度減輕山洪災(zāi)害損失”的建設(shè)目標(biāo);規(guī)范了建設(shè)任務(wù)、建設(shè)內(nèi)容和概算編制要求等;體現(xiàn)了具有福建特色的項(xiàng)目總體要求和技術(shù)方案,為各地編制實(shí)施方案奠定了良好基礎(chǔ)。

        步驟3將所有M對(duì)CT-MR 圖像輸入到聯(lián)合框架的分割部分,在有無真實(shí)標(biāo)簽的兩種情況下分別使用Edice和Econsistency約束分割標(biāo)簽。

        步驟4交替運(yùn)行步驟2 和步驟3,直到網(wǎng)絡(luò)趨于穩(wěn)定得到最終的配準(zhǔn)和分割模型。

        由于配準(zhǔn)與分割子網(wǎng)絡(luò)在未經(jīng)訓(xùn)練時(shí)網(wǎng)絡(luò)參數(shù)隨機(jī)初始化,得到的配準(zhǔn)和分割結(jié)果可能效果并不理想。直接使用配準(zhǔn)和分割子網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聯(lián)合優(yōu)化,可能并不會(huì)朝著正確的方向進(jìn)行優(yōu)化[29],由于互相的約束作用反而會(huì)使結(jié)果逐漸惡化,因此選擇預(yù)訓(xùn)練配準(zhǔn)與分割子網(wǎng)絡(luò)為兩者提供較好的初始參數(shù),保證聯(lián)合訓(xùn)練時(shí)不會(huì)出現(xiàn)惡化的情況,使聯(lián)合訓(xùn)練過程只需要在預(yù)訓(xùn)練的基礎(chǔ)上進(jìn)一步微調(diào)優(yōu)化即可[29]。此外,在全部M對(duì)CT-MR 圖像中僅有N對(duì)圖像包含真實(shí)標(biāo)簽(N

        值得注意的是,本文方法采用了聯(lián)合訓(xùn)練的方式而非多任務(wù)學(xué)習(xí),這是因?yàn)槎嗳蝿?wù)學(xué)習(xí)需要更改配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),對(duì)于任意新的配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò)來說都需要重新設(shè)計(jì)網(wǎng)絡(luò)。采用聯(lián)合訓(xùn)練的方式同時(shí)實(shí)現(xiàn)配準(zhǔn)和分割,無須對(duì)子網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行改動(dòng),對(duì)于任意新的深度學(xué)習(xí)配準(zhǔn)分割網(wǎng)絡(luò)可以直接組合。在聯(lián)合訓(xùn)練框架中,對(duì)于配準(zhǔn)和分割的要求是輸入兩種模態(tài)的圖像,分別輸出兩種模態(tài)圖像之間的形變場(chǎng)和兩種模態(tài)圖像的分割標(biāo)簽。配準(zhǔn)與分割的聯(lián)合交替優(yōu)化主要通過形變場(chǎng)和分割標(biāo)簽來完成,如圖2 所示。本文提出的框架是一種即插即用[30]的網(wǎng)絡(luò)框架,對(duì)于任意多模態(tài)配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)和分割網(wǎng)絡(luò),在滿足輸出形變場(chǎng)和分割標(biāo)簽的情況下均可進(jìn)行組合應(yīng)用到聯(lián)合框架中。通過即插即用的方式組合現(xiàn)有的配準(zhǔn)和分割網(wǎng)絡(luò),可以直接在現(xiàn)有模型的基礎(chǔ)上專注于特定任務(wù)進(jìn)行優(yōu)化,在決策級(jí)別進(jìn)行聯(lián)合避免了特征級(jí)別聯(lián)合需要更改網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的操作,保證配準(zhǔn)和分割互相作用,在提升效果的同時(shí)大幅減輕了工作量。

        為了解決目前聯(lián)合配準(zhǔn)分割算法難以應(yīng)用于多模態(tài)數(shù)據(jù)的問題,本文提出一種基于多尺度鄰域描述符和模態(tài)一致性監(jiān)督的聯(lián)合配準(zhǔn)分割框架(MCRSNet),通過模態(tài)一致性監(jiān)督將兩個(gè)分割網(wǎng)絡(luò)和一個(gè)多模態(tài)配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)聯(lián)合起來,兩個(gè)分割網(wǎng)絡(luò)串行運(yùn)行,分割和配準(zhǔn)并行運(yùn)行,實(shí)現(xiàn)配準(zhǔn)和分割的同時(shí)提升。

        以掘進(jìn)機(jī)截割臂升降角度為例,驗(yàn)證建立的基于油缸行程傳感器的截割頭姿態(tài)角檢測(cè)模型。試驗(yàn)中,截割臂從0°到最大角度23°,將掘進(jìn)機(jī)平臺(tái)參數(shù)L0=388 mm,L1=202 mm,L2=470 mm,θ=54.18°和油缸行程傳感器相對(duì)截割臂為0°時(shí)伸長(zhǎng)量代入式(2),得出的截割臂升降角度為測(cè)試值,以安裝在截割臂上的精度為0.01°的兩軸傾角傳感器SCA120T檢測(cè)的截割臂角度為理論參考值,結(jié)果見表2。

        圖3 配準(zhǔn)子網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.3 Structure of registration subnetwork

        1.2.2 基于多尺度鄰域描述符的損失函數(shù)

        圖4 分割子網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.4 Structure of segmentation subnetwork

        1.2 基于模態(tài)一致性監(jiān)督和多尺度鄰域描述符的損失函數(shù)

        本文提出一種應(yīng)用于聯(lián)合配準(zhǔn)分割框架MCRSNet 的損失函數(shù),其中,CT-MR 有標(biāo)簽和CT-MR無標(biāo)簽情況下的損失函數(shù)如式(3)和式(4)所示:

        其中:Ereg表示配準(zhǔn)損失部分;Eseg表示分割損失部分;EmsMIND用于約束配準(zhǔn)的局部結(jié)構(gòu);Edice用于在有標(biāo)簽的情況下約束配準(zhǔn)和分割的全局輪廓邊界;Esmooth用于使配準(zhǔn)形變場(chǎng)平滑;Econsistency用于在無標(biāo)簽的情況下提供監(jiān)督信息同時(shí)約束兩種模態(tài)分割標(biāo)簽之間的模態(tài)間一致性;If和Im分別表示固定圖像和浮動(dòng)圖像;Lf,segandLm,seg分別表示固定圖像和浮動(dòng)圖像的分割結(jié)果;Lm,gt和Lf,gt分別表示固定圖像和浮動(dòng)圖像的ground-truth;?表示形變場(chǎng);°表示非線性變換。經(jīng)過多次實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,最終α、β、λ分別為20、2.0、0.5。

        1.2.1 模態(tài)一致性監(jiān)督損失函數(shù)

        為了進(jìn)一步提升配準(zhǔn)效果,本文設(shè)計(jì)一種多尺度模態(tài)獨(dú)立鄰域描述符(multi-scale Modality Independence Neighborhood Descriptor,msMIND),并基于msMIND 設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)損失函數(shù),提升配準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)準(zhǔn)確性。

        在真實(shí)標(biāo)簽存在的情況下,配準(zhǔn)和分割所需標(biāo)簽由已標(biāo)注的真實(shí)標(biāo)簽提供。當(dāng)標(biāo)簽不存在時(shí),通過模態(tài)一致性監(jiān)督損失來為配準(zhǔn)和分割繼續(xù)提供監(jiān)督信息。本文利用配準(zhǔn)產(chǎn)生的形變場(chǎng)對(duì)MR 圖像的分割標(biāo)簽進(jìn)行形變并將形變后的標(biāo)簽與CT 圖像的分割標(biāo)簽進(jìn)行結(jié)構(gòu)匹配,從而在無標(biāo)簽時(shí)也能夠提供監(jiān)督信息。模態(tài)一致性監(jiān)督損失Econsistency定義如下:

        其中:Sm(y)和Sf(y)表示體素y處的浮動(dòng)和固定的分割標(biāo)簽;?代表形變場(chǎng);°代表非線性變換。

        配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)產(chǎn)生的形變場(chǎng)?提供了從浮動(dòng)圖像到固定圖像的逐體素位移分量。對(duì)于配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)來說,浮動(dòng)圖像的分割標(biāo)簽經(jīng)過形變場(chǎng)形變后應(yīng)該具有與固定圖像分割標(biāo)簽相同的解剖結(jié)構(gòu),即Lm,seg°?≈Lf,seg。此時(shí),分割網(wǎng)絡(luò)固定,利用分割標(biāo)簽對(duì)配準(zhǔn)進(jìn)行監(jiān)督進(jìn)一步提高了配準(zhǔn)在標(biāo)簽覆蓋區(qū)域的精度。對(duì)于分割網(wǎng)絡(luò)來說,它產(chǎn)生的分割結(jié)果Lf,seg和Lm,seg提供了圖像上感興趣區(qū)域的體素分布,同樣也會(huì)存在Lm,seg??≈Lf,seg,此時(shí)配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)固定,兩個(gè)模態(tài)的分割網(wǎng)絡(luò)互為監(jiān)督,使得兩個(gè)分割網(wǎng)絡(luò)的分割標(biāo)簽具有模態(tài)間一致性。本文通過優(yōu)化一致性損失Econsistency在缺少標(biāo)簽的情況下實(shí)現(xiàn)對(duì)配準(zhǔn)和分割的約束。也就是說,這種約束可以幫助配準(zhǔn)算法找到準(zhǔn)確的標(biāo)簽對(duì)應(yīng)關(guān)系,幫助分割算法補(bǔ)充缺失的監(jiān)督信息,使分割結(jié)果具有模態(tài)間一致性。

        本文利用模態(tài)一致性監(jiān)督Econsistency建立了不同模態(tài)分割與配準(zhǔn)之間的聯(lián)系,并為聯(lián)合訓(xùn)練過程中的兩個(gè)任務(wù)參數(shù)的更新提供了指導(dǎo),將模態(tài)一致性監(jiān)督集成到損失函數(shù)中,從而形成了基于模態(tài)一致性監(jiān)督的損失函數(shù)。

        為了盡可能保證精度,構(gòu)建基于空間通道雙注意力模 塊scSE-block[31]的分割網(wǎng)絡(luò)nnU-Net[32]作 為本文的分割子網(wǎng)絡(luò),稱為scSE-nnU-Net,如圖4 所示。在下采樣過程中使用跨步卷積與最大池化來進(jìn)行特征提取,并使用轉(zhuǎn)置卷積與scSE-block 執(zhí)行上采樣操作,通過在空間和通道兩方面抑制不重要信息,進(jìn)行有效特征的提取。輸入圖像尺寸為128×128×96像素,批大小為2。共執(zhí)行5 次最大池化操作,得到底部特征圖大小為4×4×6 像素。每個(gè)編碼器由兩個(gè)卷積塊組成,激活函數(shù)為L(zhǎng)ReLU 函數(shù),卷積核大小為3×3×3。初始卷積核數(shù)目設(shè)置為32 個(gè),隨著每次最大池化數(shù)目倍增,直到底部數(shù)量最大為320 個(gè),然后使用上采樣將特征圖恢復(fù)至原始大小,并使用Softmax 得到輸出結(jié)果。

        為了評(píng)估配準(zhǔn)與分割性能,本文選擇了一些表現(xiàn)良好的方法與MC-RSNet 進(jìn)行對(duì)比。配準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)有Elastix[37]、Voxelmorph[38]、Ms-RNet[4],分割網(wǎng)絡(luò)有U-Net[39]、nnU-Net[32]、scSE-nnU-Net。其中,Ms-RNet[4]和scSE-nnU-Net 分別是本文的配準(zhǔn)與分割子網(wǎng)絡(luò)。

        將表面活性劑和助表面活性劑按質(zhì)量比(Km)混勻,得到混合表面活性劑(Smix);將油相(Oil)和Smix混勻,得到混合油相;在混合油相中緩慢滴加水相,不斷攪拌,直至形成透明的體系,記下體系發(fā)生透明或渾濁變化時(shí)的各組分用量,用origin8.5繪制偽三元相圖。根據(jù)納米乳區(qū)大小,篩選合適的納米乳體系。

        由于解剖結(jié)構(gòu)在局部鄰域內(nèi)的相對(duì)灰度分布基本不受模態(tài)變化影響[33],因此通過設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)描述符來排除模態(tài)的影響進(jìn)而實(shí)現(xiàn)多模態(tài)配準(zhǔn)的測(cè)度。本文基于自相似理論[34],描述每個(gè)體素周圍鄰域的灰度分布來表示該體素的局部結(jié)構(gòu)。如圖5 所示,選取圖像中任一圖像塊的周圍6 鄰域圖像塊,并計(jì)算每?jī)蓚€(gè)圖像塊之間灰度上誤差的平方作為自相似性,中心圖像塊周圍的12 對(duì)圖像塊的自相似性共同組成了中心圖像塊的上下文信息,用來表示該中心圖像塊處的局部結(jié)構(gòu)。如圖6 所示,為了更進(jìn)一步解決6 鄰域范圍的限制,在原有6 鄰域的基礎(chǔ)上擴(kuò)展到了12 鄰域,分為內(nèi)外兩層,并給內(nèi)外兩層賦予不同的權(quán)重。相比于現(xiàn)有的MIND[9]描述符和MINDSSC[35]描述符,本文的改進(jìn)在于:將原有6 鄰域多尺度化,擴(kuò)充了局部結(jié)構(gòu)所包含的信息量,在著重于中心點(diǎn)附近重要信息的同時(shí),保證遠(yuǎn)離中心點(diǎn)的信息也能夠被接收到,實(shí)現(xiàn)對(duì)局部結(jié)構(gòu)更加準(zhǔn)確的表達(dá)。為了簡(jiǎn)便起見,在圖5 中僅畫出了單一尺度的表現(xiàn)形式,多尺度的形式只需以相同的半徑將鄰域擴(kuò)充兩倍,如圖6 中的二維展示。

        圖5 msMIND 三維展示Fig.5 Presentation of msMIND in 3D

        圖6 msMIND 二維展示Fig.6 Presentation of msMIND in 2D

        msMIND 的計(jì)算公式為:

        現(xiàn)代立體漆藝以三維立體的形式,豐富多變的漆繪語言,表達(dá)藝術(shù)家的造物能力和審美理想。胎骨,作為塑型的基礎(chǔ),是研究現(xiàn)代立體漆藝無法繞開的核心話題。不論是傳承既有的材料處理方式來表現(xiàn)現(xiàn)代人的審美理想,還是在材料的創(chuàng)新上下功夫,其豐富多變的形式都是無法在一篇文章中盡述的。但這“承”與“變”的劃分不是最關(guān)鍵的。我們將持續(xù)關(guān)注的是現(xiàn)代藝術(shù)家們欲要表達(dá)的心境和理想,以及他們借助現(xiàn)代立體漆藝表現(xiàn)心境和理想的技術(shù)能力。

        其中:msMIND 表示雙重尺度6 鄰域范圍內(nèi)的局部結(jié)構(gòu),與中心圖像塊x距離為r代表內(nèi)層6 鄰域,距離為2r代表外 層6鄰域;α和β分別代 表不同權(quán)重;Dp表示以x為中心的6 鄰域內(nèi)任意兩個(gè)距離向量ri和rj上的圖像塊zi、zj之間的灰度相似距離;每個(gè)圖像塊大小為p×p×p;P定義為兩個(gè)圖像塊之間一系列的位移量;t代表任意分位移量。因此,Dp計(jì)算兩個(gè)圖像塊內(nèi)所有點(diǎn)的均方差,如式(7)所示:

        V(I,x)是圖像局部方差的估計(jì),定義為所有6 鄰域圖像塊之間的Dp的期望:

        由于msMIND 特征是Dp的高斯函數(shù),因此在不相似時(shí)表現(xiàn)為低響應(yīng),在相似時(shí)表現(xiàn)為高響應(yīng),可以很好地表征局部特征[4]。一旦提取了兩個(gè)圖像的msMIND 描述子,相似性度量就可以定義為兩者描述子之間的絕對(duì)差的平均值。因此,基于msMIND的相似性度量定義如下:

        其中:I和J分別是兩幅待比較的圖像;R是6 鄰域向量的集合。

        2 實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析

        2.1 數(shù)據(jù)集與評(píng)價(jià)指標(biāo)

        實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集來自麗水市中心醫(yī)院,包括118 對(duì)CT-MR 圖像及其對(duì)應(yīng)的肝臟標(biāo)簽。CT 圖像為平掃未增強(qiáng),原始尺寸為512×512 像素×L(其中L為CT數(shù)據(jù)中切片的數(shù)量,范圍為32~104);MR 圖像為T1未增強(qiáng),原始尺寸為512×512 像素×K(其中K為MR數(shù)據(jù)中切片的數(shù)量,范圍為52~80)。肝臟標(biāo)記由兩名放射科醫(yī)生手動(dòng)標(biāo)記,以評(píng)估配準(zhǔn)性能和輔助配準(zhǔn)。需要注意的是,在訓(xùn)練過程中只使用了30%的肝臟標(biāo)簽,極大地減少了圖像標(biāo)注任務(wù)的時(shí)間。為了進(jìn)一步評(píng)估圖像結(jié)構(gòu)配準(zhǔn)好壞[36],在每對(duì)CT-MR圖像上標(biāo)記了3 個(gè)標(biāo)記點(diǎn),如腫瘤、囊腫和肝裂隙,標(biāo)記圖像示例如圖7 所示。

        圖7 CT-MR 圖像展示Fig.7 Presentation of CT-MR images

        對(duì)于所有圖像數(shù)據(jù),CT-MR 圖像對(duì)使用仿射對(duì)齊[37]來減少位置偏差。然后將所有圖像重采樣到各向同性體素(1 mm×1 mm×1 mm),并進(jìn)行歸一化和剪裁得到分辨率為304×304×228 像素的清晰圖像。其中,90 對(duì)CT-MR 圖像作為訓(xùn)練集,28 對(duì)作為測(cè)試集,并在訓(xùn)練過程中使用隨機(jī)仿射變換對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)一步擴(kuò)展,同時(shí)進(jìn)行五折交叉驗(yàn)證以減少實(shí)驗(yàn)誤差。

        對(duì)于配準(zhǔn)任務(wù),采用3 項(xiàng)指標(biāo)來評(píng)價(jià)配準(zhǔn)結(jié)果,其中,Dice 相似系 數(shù)(Dice Similarity Coefficient,DSC)用于評(píng)估配準(zhǔn)前后肝臟的重疊程度,Hd95(95% Hausdorff distance)用于評(píng)估標(biāo)簽邊界的距離,數(shù)值越低表示兩者越接近,目標(biāo)配準(zhǔn)誤差(Target Registration Error,TRE)用于評(píng)估配準(zhǔn)前后標(biāo)記點(diǎn)的距離誤差,定義為距離的均方根。具體公式如下:

        步驟2將所有M對(duì)CT-MR 圖像輸入到聯(lián)合框架的配準(zhǔn)部分中,使用EmsMIND約束結(jié)構(gòu)對(duì)齊,分別通過Edice和Econsistency在有無真實(shí)標(biāo)簽的兩種情況下約束分割標(biāo)簽對(duì)齊。

        不,準(zhǔn)確來說,也不能算是完全的骸骨,應(yīng)該是有些皮肉的,只是那皮肉太過干枯,皺巴巴地貼在了骨架上,以至于他的關(guān)

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