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        基于生物信息學(xué)對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌新輔助放化療敏感性生物標(biāo)志物的發(fā)掘*

        2023-09-11 04:28:22杜芝霖伍健徐鵬郎錦義
        腫瘤預(yù)防與治療 2023年8期
        關(guān)鍵詞:分析

        杜芝霖,伍健,徐鵬,郎錦義

        646000 四川 瀘州,西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院 腫瘤科(杜芝霖、伍健、郎錦義);610041 成都,四川省腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心,四川省腫瘤醫(yī)院·研究所,四川省癌癥防治中心,電子科技大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院放療中心/放射腫瘤學(xué)四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(徐鵬、郎錦義)

        根據(jù)全球癌癥統(tǒng)計(jì),2020 年有超過604 000 例食管癌新發(fā)病例和544 000 例死亡病例,全球發(fā)病率第七,死亡率第六[1]。中國是食管癌的高發(fā)地區(qū),2015 年中國癌癥統(tǒng)計(jì),食管癌的發(fā)病率排名第三,死亡率排名第四[2]。其中,食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)是食管癌中最常見的組織學(xué)類型。

        ESCC 的早期癥狀并不明顯,許多患者直到癌癥晚期才被明確診斷。盡管近幾十年出現(xiàn)了新的治療策略和方案,但食管癌的預(yù)后仍然很差,5 年生存率約為20%[3-4]。而如今,新輔助放化療(neoadjuvant chemoradiotherapy,NCRT)聯(lián)合根治性食管切除術(shù)已逐漸成為食管癌的主要治療方法[5]。然而,不同患者接受NCRT 的結(jié)果不一樣。獲得病理完全緩解(pathologic complete response,PCR)的患者比未獲得PCR 的患者有更好的生存率[6-7]。但一些臨床參數(shù)例如TNM 分期、腫瘤位置和腫瘤大小等并不能預(yù)測食管鱗癌患者對(duì)NCRT 是否敏感[8]。如何有效地預(yù)測食管鱗癌患者對(duì)NCRT 治療的敏感性是本研究的目的。

        隨著高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)的發(fā)展,對(duì)腫瘤發(fā)生機(jī)制的認(rèn)識(shí)有了很大的提升[9]。有相關(guān)研究提出,一些基因水平的變化可以預(yù)測NCRT 敏感性,這有助于ESCC 患者的個(gè)體化治療[10-11]。如SOX17基因在食管鱗癌患者中的過表達(dá)對(duì)NCRT更為敏感[12]。研究人員也通過建立35 個(gè)基因突變譜的預(yù)測模型,來預(yù)測食管癌患者接受NCRT 治療的敏感性[13]。還有研究發(fā)現(xiàn)了能預(yù)測食管癌患者NCRT 治療敏感性的5 個(gè)基因[14]。因此基因的異常表達(dá)或突變會(huì)影響到患者接受NCRT 的敏感性。在本研究中,通過使用生物信息學(xué)方法,篩選出與食管鱗癌NCRT 治療敏感性相關(guān)的具有預(yù)測價(jià)值的生物標(biāo)志物,并采用免疫組化方法進(jìn)行初步驗(yàn)證,以期獲得新的治療靶點(diǎn),為食管癌患者的個(gè)體化治療帶來希望。

        1 材料和方法

        1.1 數(shù)據(jù)源和數(shù)據(jù)處理

        從GEO 數(shù)據(jù)庫中篩選與食管鱗癌NCRT 敏感性相關(guān)的數(shù)據(jù)集,納入標(biāo)準(zhǔn):①提供食管癌患者RNA-Seq 的數(shù)據(jù)集;②包含食管癌NCRT 后不敏感患者的組織與敏感患者的組織。最終篩選出數(shù)據(jù)集GSE45670[15]。

        回顧性收集了四川省腫瘤醫(yī)院2017~2021 年食管鱗癌患者的相關(guān)信息。納入標(biāo)準(zhǔn):① 患者在疾病確診前未進(jìn)行過任何抗腫瘤治療;② 患者年齡18~75 歲,KPS 評(píng)分 > 80;③ 我院初治的中晚期胸段食管鱗癌并且無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者 (cT1b-cT2N+或cT3-cT4任何N),并于我院行NCRT 及手術(shù)治療;④ 所有患者治療前均需完善相關(guān)基線檢查,明確病灶情況。所有患者新輔助同步放化療治療后第28天復(fù)查增強(qiáng)CT 進(jìn)行初次篩選NCRT 敏感性。影像學(xué)提示腫瘤病灶沒有消退,稱之為疾病穩(wěn)定(stable disease,SD)或是腫瘤病灶較前增大,稱之為疾病進(jìn)展(progression disease,PD)的患者歸類于放化療不敏感;影像學(xué)提示腫瘤病灶完全消失,稱之為完全緩解(complete response,CR)或者腫瘤病灶較治療前緩解 > 50%的患者歸類于放化療敏感。放化療后約6 周,患者接受食管鱗癌根治性手術(shù)切除原發(fā)腫瘤以及區(qū)域淋巴結(jié)。術(shù)后病理是否獲得PCR 作為最終劃分食管鱗癌患者接受NCRT 敏感性的標(biāo)準(zhǔn)。

        1.2 差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs)的獲得及蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析

        使用R 軟件的“l(fā)imma”包對(duì)GSE45670 數(shù)據(jù)集的NCRT 敏感組和NCRT 不敏感組的 DEGs 進(jìn)行篩選,閾值設(shè)置為P< 0.05 和LogFC > 1,并使用“ggplot2”包進(jìn)行了熱圖和火山圖的繪制[16-17]。

        將篩選出的DEGs 導(dǎo)入String 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org)進(jìn)行PPI 網(wǎng)絡(luò)分析。通過設(shè)置PPI 最低互作得分(0.4),去除該網(wǎng)絡(luò)中不相關(guān)的節(jié)點(diǎn),得到初次篩選的PPI 網(wǎng)絡(luò)[18]。將其導(dǎo)入Cytoscape 軟件中將PPI 網(wǎng)絡(luò)可視化。通過Cytoscape 軟件的MCODE 插件進(jìn)一步過濾,設(shè)置MCODE 分?jǐn)?shù) > 4,節(jié)點(diǎn)數(shù) > 5[19]。使用該軟件中Cytohubba 和CytoNCA 兩個(gè)插件,運(yùn)用Degree 算法,篩選出核心差異基因[20-21]。

        1.3 構(gòu)建加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)

        利用WGCNA 分析方法對(duì)數(shù)據(jù)集GSE45670構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)[22]。首先,篩選出方差前25%的5 837 個(gè)基因。其次,計(jì)算每對(duì)基因之間的皮爾遜相關(guān)性,得到一個(gè)相似性矩陣。第三,使用“pick Soft Threshold”函數(shù)來選擇理想的軟閾值(β = 5)。第四,利用冪函數(shù)將相似度矩陣轉(zhuǎn)換為鄰接矩陣。然后,將鄰接矩陣轉(zhuǎn)換為拓?fù)渲丿B矩陣(topoligical overlap matrix,TOM)。最后,建立了基于TOM 的不相似度(1-TOM)的層次聚類。每個(gè)模塊樹狀圖至少包含50 個(gè)基因,將相似表達(dá)模塊聚類為相同模塊的閾值設(shè)為0.25,最終得到模塊。

        1.4 篩選候選基因進(jìn)行基因富集分析

        使用R 軟件的“VennDiagram”包,將DEGs 和WGCNA 中相關(guān)度最高的模塊內(nèi)的基因進(jìn)行交叉重疊后,結(jié)合PPI 網(wǎng)絡(luò)中獲得核心基因和候選基因。

        對(duì)候選基因進(jìn)行基因通路富集分析,使用R 包“clusterProfiler”和“enrichplot”包對(duì)其進(jìn)行注釋,對(duì)可能參與的生物過程和信號(hào)通路進(jìn)行相應(yīng)的分析[23-24]。

        1.5 對(duì)候選基因進(jìn)行生存分析

        從TCGA 數(shù)據(jù)庫中篩選食管鱗癌患者行Kaplan-Meier 生存分析,獲得食管鱗癌患者基因表達(dá)水平與生存時(shí)間之間的關(guān)系。在Log-rank 檢驗(yàn)中,P< 0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        1.6 基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)9 和醛固酮還原酶(aldo-keto reductase,AKR)1C3 的免疫組化分析

        對(duì)已明確診斷為ESCC 患者的活檢樣本進(jìn)行免疫組化分析。采用抗體MMP9(1∶100)和抗體AKR1C3(1∶200)進(jìn)行蘇木精染色。目標(biāo)蛋白的表達(dá)量通過使用Image-Pro Plus 圖像軟件進(jìn)行分析。MMP9 陽性蛋白主要在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜中表達(dá)為褐色。AKR1C3 陽性蛋白表現(xiàn)出中度到較強(qiáng)的細(xì)胞質(zhì)反應(yīng),顏色為褐色。通過測量出每張圖片的累積光密度值 (integrated option density, IOD)以及區(qū)域面積值(area),再計(jì)算出平均光密度值(mean density),即 mean density = IOD/area,此值反映了目標(biāo)蛋白的單位面積濃度。最后取每個(gè)樣本的 3 個(gè)隨機(jī)區(qū)域mean density 的平均值即為此樣本的值。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        利用R 軟件(4.2.1)、Cytoscape 軟件(3.8.0)、ImageProPlus 軟件、String 在線網(wǎng)站(https: //string-db.org/)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。采用Kaplan-Meier 法進(jìn)行生存分析,并采用Log-rank 檢驗(yàn)。利用TCGA 數(shù)據(jù)集,來獲取相關(guān)候選基因的表達(dá)水平的高低與食管鱗癌患者總生存期之間的關(guān)系。并且對(duì)其進(jìn)行了相應(yīng)曲線的繪制。免疫組化的結(jié)果采用GraphPad Prism 7.0 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)或雙尾非配對(duì)檢驗(yàn)來確定顯著性水平。本研究中使用的所有數(shù)據(jù)均滿足統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的假設(shè)。所有定量數(shù)據(jù)均以均值±標(biāo)準(zhǔn)差呈現(xiàn)。P< 0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 數(shù)據(jù)收集

        從GEO 數(shù)據(jù)庫中篩選得到的數(shù)據(jù)集GSE45670,包含了28 個(gè)食管鱗癌患者的樣本,其中有17 個(gè)食管鱗癌NCRT 治療不敏感的患者和11 個(gè)食管鱗癌NCRT 治療敏感的患者。而臨床樣本共收集了26 例活檢組織標(biāo)本,包括11 例NCRT 治療敏感者,也是影像學(xué)上提示腫瘤病灶CR 的患者,和15 例NCRT治療不敏感者,其中11 例患者影像學(xué)提示腫瘤病灶SD,4 例患者影像學(xué)提示腫瘤病灶PD。

        2.2 DEGs 的篩選及PPI 網(wǎng)絡(luò)分析

        以LogFC > 1,P< 0.05 為閾值,共篩選得到350個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因166 個(gè),下調(diào)基因184 個(gè)(圖1)。

        圖1 差異基因篩選結(jié)果Figure 1. Volcano Plot of DEGs

        運(yùn)用String 在線數(shù)據(jù)庫構(gòu)建了350 個(gè)DEGs 的PPI 網(wǎng)絡(luò),再導(dǎo)入Cytoscape 軟件中,運(yùn)用MCODE 插件進(jìn)行篩選,再使用Degree 算法,運(yùn)用該軟件中的CytoHubba 和CytoNCA 插件最終確定MMP9是該網(wǎng)絡(luò)的核心基因(圖2)。

        圖2 由差異基因構(gòu)成的PPI 網(wǎng)絡(luò)Figure 2. Protein-Protein Interaction Networks Composed of Differentially Expressed Genes

        2.3 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

        WGCNA 是近年來廣泛使用的一種技術(shù),旨在避免僅僅分析DGEs 而造成忽視核心基因的可能性[25-26]。通過選取相關(guān)系數(shù)為0.85 時(shí)對(duì)應(yīng)的軟閾值為 5(圖3A)構(gòu)建無尺度網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行 WGCNA,再通過動(dòng)態(tài)雜化剪切合并相似的模塊,獲得13 個(gè)模塊(圖3B)。其中沒有被分配到任何集群中的灰色模塊,在本研究中沒有進(jìn)行進(jìn)一步的分析。結(jié)果顯示,紫色模塊與食管鱗癌患者接受NCRT 敏感性的相關(guān)性最高,共159個(gè)基因,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P= 0.03;圖3C)。

        圖3 構(gòu)建WGCNA 模塊Figure 3. Construction of WGCNA Modules

        2.4 獲得候選基因

        將紫色模塊中的159 個(gè)基因與350 個(gè)DEGs 進(jìn)行交集,提取到5 個(gè)重疊基因(圖4)。將這5 個(gè)重疊基因與PPI 網(wǎng)絡(luò)中的核心基因結(jié)合,得到6 個(gè)候選基因,包括AKR1C3、GPX2、RRBP1、GSTM3、AKR1C1和MMP9。

        圖4 DEGs 和紫色模塊基因的韋恩圖Figure 4.Screening of Candidate Genes: Venn Diagram of Intersections between DEGs and the Purple Module

        2.5 候選基因的功能富集分析

        這些候選基因共得到335 個(gè)相關(guān)的GO 條目。選出其中10 個(gè)GO 條目(圖5A)。同時(shí),分別從生物過程、細(xì)胞組分和分子功能這三個(gè)方面選取了相關(guān)的條目(圖5B)?;蚝突蚪M的KEGG 信號(hào)通路分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些基因主要富集于“氧化應(yīng)激反應(yīng)”中,也可能與“細(xì)胞解毒”“細(xì)胞間橋”等途徑有關(guān)(圖5C)。

        圖5 候選基因的功能富集分析Figure 5. Functional Enrichment Analysis of the Candidate Genes

        2.6 候選基因的生存分析

        從TCGA 的食管癌數(shù)據(jù)庫中篩選出81 個(gè)食管鱗癌患者的臨床數(shù)據(jù)來對(duì)這6 個(gè)候選基因進(jìn)行生存分析,通過生成最佳截止點(diǎn),形成基因高表達(dá)和低表達(dá)兩組。從圖6 可知,AKR1C3和AKR1C1基因高表達(dá)組患者與低表達(dá)組患者相比,總生存率(overall survival,OS)明顯較差,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P= 0.011,P= 0.035),而食管鱗癌患者的OS 并不受其它4 個(gè)基因的表達(dá)影響,差異不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P> 0.05)。

        圖6 TCGA 數(shù)據(jù)庫中ESCC 中候選基因的Kaplan-Meier 生存曲線Figure 6. Kaplan-Meier Survival Curves of Candidate Genes in ESCC from TCGA Database

        2.7 通過免疫組化檢測食管鱗癌標(biāo)本中AKR1C3和MMP9 的表達(dá)

        對(duì)GSE45670 數(shù)據(jù)集中6 個(gè)基因的表達(dá)進(jìn)一步分析,P< 0.01 被認(rèn)為是基因表達(dá)的顯著性差異,發(fā)現(xiàn)AKR1C3、AKR1C1、MMP9和RRBP1在NCRT 不敏感的組織和NCRT 敏感組織中的表達(dá)差異更為顯著(圖7)。通過對(duì)本研究收集的活檢標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析,與NCRT 敏感的組織相比,NCRT 不敏感組織中AKR1C3 蛋白表達(dá)上調(diào)(圖8);MMP9 蛋白則在NCRT 敏感組織中表達(dá)上調(diào)(圖9)。

        圖7 GSE45670 數(shù)據(jù)集中6 個(gè)候選基因的接受NCRT 食管鱗癌不敏感組織和接受NCRT 食管鱗癌敏感組織之間的基因表達(dá)差異Figure 7.Expressions of 6 Candidate Genes in Non-responder and Responder to NCRT in GSE45670 Dataset

        圖8 AKR1C3 在NCRT 敏感組織和 NCRT 不敏感組織表達(dá)水平的比較(DAB 法,×20)Figure 8.Expression Levels of AKR1C3 in Responder and Non-responder to NCRT (DAB, ×20)***P < 0.001.

        圖9 MMP9 在 NCRT 敏感組織和 NCRT 不敏感組織表達(dá)水平的比較(DAB 法,×20)Figure 9.Expression Levels of MMP9 in Responder and Non-responder to NCRT(DAB,×20)

        3 討 論

        本研究利用生物信息學(xué)對(duì)基因集GSE45670 進(jìn)行分析。首先通過DEGs 分析篩選出 350 個(gè)差異基因。其次,基于WGCNA 生物信息學(xué)方法,得出與食管鱗癌放化療治療中異質(zhì)性顯著相關(guān)的159 個(gè)基因,與350 個(gè)DEGs 進(jìn)行交叉,獲得了5 個(gè)重疊基因(AKR1C1、AKR1C3、GPX2、GSTM3、RRBP1)。 同時(shí),基于350 個(gè)DEGs,生成了相應(yīng)的PPIs 網(wǎng)絡(luò)。利用MCODE、CytoHubba 和CytoNCA 這三個(gè)插件,將其導(dǎo)入Cytoscape 軟件進(jìn)行可視化,得到了1 個(gè)核心基因(MMP9)。最后,得到了6 個(gè)候選基因,包括AKR1C1、AKR1C3、GPX2、GSTM3、RRBP1和MMP9。通過進(jìn)一步對(duì)這6 個(gè)候選基因進(jìn)行功能富集分析發(fā)現(xiàn),“氧化應(yīng)激反應(yīng)”途徑在其中起著非常重要的作用。放射治療通過多種方式誘發(fā)腫瘤細(xì)胞的死亡,例如產(chǎn)生活性氧(reactive oxygen species,ROS)、DNA損傷和亞細(xì)胞細(xì)胞器中的應(yīng)激反應(yīng)。ROS 是由電離輻射所誘發(fā)的,不僅與蛋白質(zhì)、DNA 損傷、細(xì)胞膜表面酶和基因組不穩(wěn)定相關(guān),還引發(fā)損傷修復(fù),可以破壞氧化還原穩(wěn)態(tài),從而導(dǎo)致氧化應(yīng)激反應(yīng),最終導(dǎo)致細(xì)胞死亡[27-29]。并且化療會(huì)誘導(dǎo)產(chǎn)生大量的ROS,從而導(dǎo)致癌細(xì)胞死亡。該通路對(duì)于癌癥的發(fā)展、治療的耐藥性和基因組的不穩(wěn)定性等方面都有著不可忽視的作用。

        同時(shí),通過設(shè)置P< 0.01 為閾值,得出AKR1C3/1、MMP9和RRBP1在GSE45670 數(shù)據(jù)集中NCRT 敏感組和NCRT 不敏感組的表達(dá)差異更為顯著。

        RRBP1 是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白,在核糖體結(jié)合、新生蛋白易位以及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激和未折疊蛋白反應(yīng)中起重要作用。對(duì)于新生蛋白核糖體的結(jié)合和轉(zhuǎn)運(yùn),RRBP1 是必不可少[30]。許多研究證實(shí),RRBP1 在許多惡性腫瘤中過表達(dá),例如宮頸癌、肺癌、膀胱癌和結(jié)直腸癌,并且影響患者的預(yù)后[31-34]。同時(shí),也有研究證實(shí),RRBP1 可能通過調(diào)節(jié)YAP1 的表達(dá)而成為順鉑耐藥的主要驅(qū)動(dòng)因素[35]。這些證據(jù)都說明,RRBP1基因水平的變化與癌癥的發(fā)生發(fā)展具有一定的相關(guān)性。

        MMP9 是一種參與多種生物活性的基質(zhì)蛋白酶,是金屬蛋白酶類中分子量最大的一種。MMP9在作用于細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)的構(gòu)成和膜蛋白裂解中扮演著重要的角色,它可以切割多種ECM 蛋白來使得ECM 重構(gòu)。MMP9 對(duì)基底膜的降解過程也起著非常重要的作用,基底膜中含有膠原,包括IV 型膠原,而這些膠原可被MMP9 降解,而基底膜破裂通常是腫瘤形成過程中腫瘤發(fā)生侵襲和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵階段[36-37]。目前,有部分研究已經(jīng)證實(shí),MMP9 在一些惡性腫瘤中過表達(dá),例如非小細(xì)胞肺癌、宮頸癌和胰腺癌[38-40]。同時(shí),一些研究提出,MMP9 與放射治療有關(guān),部分原因是ROS 的形成可以破壞鋅離子和Cys99 之間的相互作用,從而激活MMP9,增加MMP9 的表達(dá),影響放射治療效果[41-42]。血漿MMP9 水平在肺癌、乳腺癌和肝癌放療期間會(huì)升高[43-44]。在晚期非小細(xì)胞肺癌患者中,血清MMP9 水平在放射治療后顯著降低,但在SD和PD 的患者中,放射治療后的血清MMP9 水平?jīng)]有變化[45]。ESCC 患者NCRT 后,健康食管組織近端甚至遠(yuǎn)端MMP9 水平升高[46]。在最近的一項(xiàng)研究中,研究發(fā)現(xiàn)MMP9 的表達(dá)與小細(xì)胞肺癌患者的順鉑耐藥有關(guān)[47]。因此,MMP9 與癌癥病理廣泛相關(guān),不僅在腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移和血管生成中發(fā)揮作用,同時(shí)還介導(dǎo)了腫瘤的微環(huán)境。

        AKR1C3 是細(xì)胞內(nèi)的一種多功能酶,是AKRs的一員。AKR1C1/3基因具有較高的序列同源性。AKR1C3 主要在內(nèi)分泌器官中表達(dá),參與腎上腺和腫瘤中類固醇的新生物合成,通過調(diào)節(jié)各種激素的合成以及其與相應(yīng)受體結(jié)合的量,影響了腫瘤的發(fā)生發(fā)展[48]。AKR1C3 表達(dá)也會(huì)影響到與上 皮 間 充 質(zhì)轉(zhuǎn) 化 (epithelial-mesenchymal transitions, EMT)相關(guān)的許多轉(zhuǎn)錄因子,而EMT 也是促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移、腫瘤侵襲的主要作用機(jī)制之一[49]。有相關(guān)研究提出,基因AKR1C3 在乳腺癌和前列腺癌中表達(dá)上調(diào),是其預(yù)后不良的標(biāo)志[50-51]。在惡性腫瘤細(xì)胞中,AKR1C3基因表達(dá)上調(diào)可消除ROS,積累PGF2,進(jìn)一步刺激MAPK 信號(hào),防止G2/M 期阻滯或減少凋亡,促進(jìn)癌細(xì)胞增殖,而導(dǎo)致其抗輻射[52-53]。AKR1C3 在非小細(xì)胞肺癌中表達(dá)較高,而在小細(xì)胞肺癌中表達(dá)則相反。而小細(xì)胞肺癌在臨床中通常對(duì)放射治療非常敏感[54]。同時(shí),AKR1C3 表達(dá)上調(diào)可維持腫瘤細(xì)胞內(nèi)的還原環(huán)境,不僅導(dǎo)致ROS 濃度降低,還可能與多西他賽耐藥和蒽環(huán)類藥物耐藥有關(guān)[55-56]。因此,AKR1C3 不僅與多種惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān),并且與多種抗腫瘤治療也有一定的聯(lián)系。

        同時(shí),本研究通過在食管鱗癌組織標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析,發(fā)現(xiàn)MMP9 和AKR1C3 蛋白表達(dá)水平差異與ESCC 患者對(duì)NCRT 敏感性具有一定的相關(guān)性。AKR1C3 陽性蛋白在食管鱗癌接受NCRT治療不敏感的組織中有著中度到較強(qiáng)的細(xì)胞質(zhì)反應(yīng),如圖8 所示。MMP9 陽性蛋白在食管鱗癌接受NCRT 敏感的組織中的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜中有著更高的表達(dá),如圖9 所示。生存分析顯示,AKR1C1 和AKR1C3 高表達(dá)的食管癌患者的OS 低于AKR1C1和AKR1C3 低表達(dá)的食管癌患者。但是,我們的研究也有相應(yīng)的缺陷。首先,與ESCC 患者NCRT 敏感性相關(guān)的樣本數(shù)量是有限的,需要在更大的隊(duì)列中評(píng)估這些基因的疾病預(yù)測效用。其次,本研究提出的生物標(biāo)志物應(yīng)進(jìn)行進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,以明確其確切的生物學(xué)行為。

        綜上所述,本研究結(jié)果表明,基因MMP9和AKR1C3的異常表達(dá)與ESCC 患者接受NCRT 敏感性的生物學(xué)特性有著密切的關(guān)系,這為實(shí)現(xiàn)食管癌患者個(gè)體化治療提供了線索。

        作者聲明:本文全部作者對(duì)于研究和撰寫的論文出現(xiàn)的不端行為承擔(dān)相應(yīng)責(zé)任;并承諾論文中涉及的原始圖片、數(shù)據(jù)資料等已按照有關(guān)規(guī)定保存,可接受核查。

        學(xué)術(shù)不端:本文在初審、返修及出版前均通過中國知網(wǎng)(CNKI)科技期刊學(xué)術(shù)不端文獻(xiàn)檢測系統(tǒng)的學(xué)術(shù)不端檢測。

        同行評(píng)議:經(jīng)同行專家雙盲外審,達(dá)到刊發(fā)要求。

        利益沖突:所有作者均聲明不存在利益沖突。

        文章版權(quán):本文出版前已與全體作者簽署了論文授權(quán)書等協(xié)議。

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