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        北疆地區(qū)馬鏈球菌分離鑒定及耐藥性和毒力基因分析

        2023-09-08 10:44:00孫丹嵐買占海佟盼盼陳見興布阿依夏木吾斯曼
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        孫丹嵐,買占海,佟盼盼,陳見興,羅 潔,張 磊,布阿依夏木·吾斯曼,況 玲

        (新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052)

        鏈球菌種類繁多,有的屬于動物正常菌群,而有的是致病菌,如化膿性鏈球菌、肺炎鏈球菌、豬鏈球菌、無乳鏈球菌、停乳鏈球菌等,可引起動物的肺炎、敗血癥、腦膜炎、乳腺炎等,給畜牧養(yǎng)殖業(yè)和公共衛(wèi)生造成嚴(yán)重威脅。肺炎鏈球菌(Streptococcuspneumoniae,SP)發(fā)現(xiàn)于1881年,是各種感染如社區(qū)獲得性肺炎、中耳炎、腦膜炎、膿腫、敗血癥等的主要致病菌之一,尤其對于嬰幼兒和老年人,其中肺炎、敗血癥和腦膜炎致死率較高[1]。SP有超過90種血清型,且目前的疫苗不能完全覆蓋[2-3]。SP攜帶多種毒力基因,其導(dǎo)致各種感染疾病的具體機(jī)制有待明確,毒力基因在此過程中可能具有重要作用,這種作用可能體現(xiàn)在毒力基因的有無和表達(dá)水平兩個方面[4-6]。

        馬鏈球菌(Streptococcusequi,S.equi)屬于蘭氏分群的C群β溶血鏈球菌,包括獸疫亞種(Streptococcusequisubspecieszooepidemicus,SEZ)、馬亞種(Streptococcusequisubspeciesequi,SEE)和類馬亞種(Streptococcusequisubspecies ruminatorum,SER)三個不同的亞種[7]。馬腺疫(Strangles)是一種散發(fā)性或地方流行性的馬屬動物接觸性傳染病,該病以發(fā)熱、上呼吸道黏膜炎癥、頜下淋巴結(jié)腫脹化膿為典型特征[8]。帶菌馬已被認(rèn)為是維持病原體長期存在和暴發(fā)感染的重要因素[9]。其發(fā)病率可達(dá)100%,死亡率達(dá)10%[10]。病菌隨病馬噴鼻、咳嗽及膿腫破潰排出體外,經(jīng)消化道、上呼吸道黏膜、扁桃體或受損皮膚感染健康馬匹[11]。患病幼駒也可因吮乳,將細(xì)菌傳染給母馬,引起馬乳房炎,甚至引發(fā)敗血癥[12]。

        馬鏈球菌的致病性和耐藥性研究在國內(nèi)研究較少,常見的毒力基因有fneB[13],臨床常用青霉素、四環(huán)素和磺胺類藥物等進(jìn)行治療[14],同時,耐藥鏈球菌的出現(xiàn)也導(dǎo)致基層馬場遭受很大經(jīng)濟(jì)損失,臨床用藥亟需新的思路。本實(shí)驗(yàn)通過對馬場采集樣品進(jìn)行細(xì)菌分離培養(yǎng),利用藥敏實(shí)驗(yàn)和PCR檢測,測定并分析馬鏈球菌及其他鏈球菌的耐藥性和毒力基因,從而為基層馬場臨床用藥提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 菌種來源 24株鏈球菌分離自2019年9月至2020年4月昌吉及伊犁馬場的132份健康及患病馬匹馬鼻拭子樣本。

        1.2 主要試劑 THB培養(yǎng)基購自青島高科技工業(yè)醫(yī)海博生物技術(shù)有限公司;革蘭氏染色試劑盒購自珠海貝索生物技術(shù)有限公司;藥敏紙片:青霉素、氨芐西林、頭孢氨芐、頭孢他啶、頭孢噻肟、四環(huán)素、氯霉素、紅霉素、慶大霉素、強(qiáng)力霉素、恩諾沙星、磺胺甲基異惡唑購自杭州濱和生物公司。

        1.3 細(xì)菌分離培養(yǎng)與純化 無菌狀態(tài)下吸取采集的馬鼻拭子樣品1 mL加入到3 mL THB液體培養(yǎng)基中,在37℃、160 rpm的搖床中震蕩培養(yǎng)12~24 h,進(jìn)行增菌培養(yǎng)。用接種環(huán)沾取菌液在THB固體培養(yǎng)基上進(jìn)行平板劃線接種,倒置于37℃的恒溫培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng),觀察菌落形態(tài),挑取針尖大小的菌落繼續(xù)培養(yǎng)。一般需要提純3次或3次以上,直到培養(yǎng)基菌落單一、穩(wěn)定為止。

        1.4 菌株的形態(tài)觀察 顯微鏡觀察挑取純化的單菌落進(jìn)行革蘭氏染色,在油鏡(100×)下觀察其形態(tài)特征。

        1.5 菌株的PCR鑒定及測序 以提取的分離菌株基因組DNA為模板,用16S RNA通用引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系(50 μL)為:上、下游引物各2 μL,DNA模板2 μL,2×TaqPCR Green Mix 25 μL,ddH2O補(bǔ)至50 μL。用凝膠成像分析系統(tǒng)觀察結(jié)果。擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,49℃退火30 s,72℃延伸30 s,共35個循環(huán)。目標(biāo)條帶大小為197 bp。將鑒定有目標(biāo)條帶的PCR產(chǎn)物測序。

        1.6 藥敏實(shí)驗(yàn) 采用標(biāo)準(zhǔn)K-B紙片擴(kuò)散法,檢測分離菌株對青霉素、氨芐西林、頭孢氨芐、頭孢他啶、頭孢噻肟、四環(huán)素、氯霉素、紅霉素、慶大霉素、強(qiáng)力霉素、恩諾沙星、磺胺甲基異惡唑12種抗生素的敏感性。

        1.7 菌株耐藥基因及毒力基因的檢測 通過PCR和瓊脂糖凝膠電泳分析從鏈球菌中提取的DNA,確定是否存在耐藥基因或毒力基因。根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道和現(xiàn)有研究,選取流行率較高的基因[15-17]。耐藥基因分別為:耐β-內(nèi)酰胺類(blaTEM、blaCTX-M)、耐四環(huán)素類(tetA)、耐磺胺類(SulI)、耐喹諾酮類(qnrA、aac(6'))。以上6個耐藥基因PCR擴(kuò)增引物序列和反應(yīng)運(yùn)行參數(shù)見表2。毒力基因分別為:ply、pspA、nanA、psaA、lytA、seM、fneB。以上7個毒力基因PCR擴(kuò)增引物序列和反應(yīng)運(yùn)行參數(shù)見表2。引物合成由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR反應(yīng)體系(20 μL)為:2×TaqPCR Green Mix 10 μL,上、下游引物1 μL,DNA模板1 μL,ddH2O補(bǔ)至20 μL。用凝膠成像分析系統(tǒng)觀察結(jié)果,膠回收產(chǎn)物于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        表1 PCR所用引物序列Table 1 Primer sequences for PCR

        表2 鏈球菌對常見菌藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table 2 Results of drug sensitivity test of Streptococcus to common bacteria

        2 結(jié)果

        2.1 培養(yǎng)結(jié)果 鏈球菌在THB固體培養(yǎng)基平板上培養(yǎng),直徑0.1~1.0 mm,灰白色,表面光滑,邊緣整齊的小菌落。馬鏈球菌在綿羊血平板上長出針尖大小白色菌落,有溶血環(huán)(圖1)。

        圖1 馬鏈球菌馬亞種在綿羊血培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)Fig.1 Colony morphology of Equi on sheep blood

        2.2 鏡檢結(jié)果 菌體呈藍(lán)紫色,為革蘭氏陽性菌,直徑0.6~1.0 μm。菌體似矛頭狀排列單個或多個排列成鏈狀,無芽孢、無菌毛(圖2)。

        圖2 鏈球菌革蘭氏染色鏡檢結(jié)果(100×)Fig.2 Microscopic examination of Streptococcus by Gram staining (100×)

        2.3 PCR結(jié)果 根據(jù)目的條帶顯示,對采集樣品進(jìn)行PCR鑒定,共得到24株鏈球菌。圖3為其中兩株菌的結(jié)果。

        圖3 鏈球菌16S PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.3 Amplification results of Streptococcus 16S PCR

        2.4 測序結(jié)果 對在197 bp目的條帶下的11株菌進(jìn)行測序,通過測序確定9株馬鏈球菌馬亞種(Y1、Y2、Y3、D1、D2、D3、L1、L2、L3),兩株肺炎鏈球菌(0-1,35-61)。

        2.5 藥敏結(jié)果 24株鏈球菌對12種抗菌藥物的耐藥情況由表2和表3可見,本實(shí)驗(yàn)所分離的肺炎鏈球菌對強(qiáng)力霉素、青霉素的耐藥率很高,對四環(huán)素、頭孢他啶的耐藥率也較高,對磺胺甲基異惡唑、恩諾沙星、氨芐西林、氯霉素都較為敏感。所分離的馬鏈球菌對磺胺甲基異惡唑耐藥性較高,對氨芐西林、頭孢噻肟、四環(huán)素的耐藥性也超過半數(shù),對氯霉素、頭孢氨芐、頭孢他啶、慶大霉素、強(qiáng)力霉素的耐藥性較低,對紅霉素、恩諾沙星敏感。

        表3 馬鏈球菌對常見菌藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table 3 Drug sensitivity test results of Streptococcus equi to common bacteria

        2.6 耐藥基因檢測結(jié)果 對鑒定出的24株鏈球菌分離株進(jìn)行6種耐藥基因檢測,檢測結(jié)果如表4所示,除blaCTX-M、tetA、SulI和aac(6')基因外,其余2種耐藥基因均有檢測到。其中blaTEM基因在17個菌株中均被檢出,對各菌株耐藥基因組合分布進(jìn)行統(tǒng)計(jì),含有2個以上耐藥基因的菌株有2株(8.3%),其余7株菌未檢測出任何耐藥基因(表4)。部分陽性結(jié)果見圖4、圖5。

        圖5 qnrA基因檢測結(jié)果Fig.5 qnrA gene detection results

        表4 不同菌株的耐藥基因檢測情況Table 4 Detection of drug resistance genes

        2.7 毒力基因檢測結(jié)果 對鑒定出的24株鏈球菌分離株進(jìn)行7種毒力基因檢測,檢測結(jié)果可知,除pspA、nanA、psaA和seM基因外,其余3種毒力基因均有檢測到。其中l(wèi)ytA和fneB基因分別在8個和9個菌株中均被檢出,對各菌株毒力基因組合分布進(jìn)行統(tǒng)計(jì),含有3個以上毒力基因的菌株有3株(12.5%),其余10株菌未攜帶毒力基因(表5)。部分陽性結(jié)果見圖6~8。

        圖6 ply基因檢測結(jié)果Fig.6 ply gene detection results

        圖7 lytA基因檢測結(jié)果Fig.7 lytA gene detection results

        圖8 fneB基因檢測結(jié)果Fig.8 fneB gene detection results

        表5 不同菌株的毒力基因檢測情況Table 5 Detection of virulence genes

        3 討論

        馬亞種馬鏈球菌是馬腺疫的主要病原,在馬和驢的膿腫淋巴結(jié)中也曾分離出,馬鏈球菌的致病性耐藥性研究在國內(nèi)研究較少,本研究分離出的鏈球菌中,有9株馬鏈球菌,其中D1、D2、D3、L1、L2、L3 6株馬鏈球菌來自昌吉某馬場,Y1、Y2、Y3 3株菌來自伊犁某馬場,Neamat-Allah等[17]認(rèn)為馬腺疫全年發(fā)病,但在春季發(fā)病率較高,Radostits等[18]研究得出馬腺疫多發(fā)生于寒冷季節(jié)的結(jié)論,本研究的樣品為秋季和春季末采集。

        本實(shí)驗(yàn)分離出的肺炎鏈球菌和馬鏈球菌馬亞種,樣品均采樣自昌吉某馬場。分離出的馬鏈球菌馬亞種中有1株對慶大霉素、氯霉素耐藥;有5株對四環(huán)素耐藥;有5株對頭孢噻肟耐藥;有1株對頭孢他啶耐藥;有4株對氨芐西林耐藥。

        根據(jù)耐藥基因的結(jié)果,24株菌株中,有17株攜帶β-內(nèi)酰胺類耐藥基因blaTEM,說明在鏈球菌中blaTEM基因有較高攜帶幾率,其中1株鏈球菌(HW5-1-2)和1株馬鏈球菌(Y1)同時攜帶了喹諾酮類耐藥基因qnrA,為多重耐藥菌株。經(jīng)過耐藥表型和耐藥基因數(shù)據(jù)的對照可知,耐藥表型與耐藥基因并不完全相符,如馬鏈球菌和其他鏈球菌對四環(huán)素類藥物的耐藥率均較高,馬鏈球菌5株,其他鏈球菌10株,但因?yàn)橹粰z測了一種四環(huán)素類耐藥基因(tetA),并沒有檢測出相關(guān)耐藥基因的存在,可能是菌株DNA中還有沒發(fā)現(xiàn)的其他耐藥基因存在,本次實(shí)驗(yàn)沒有檢測到。根據(jù)毒力基因的結(jié)果來看,有5株鏈球菌攜帶lytA基因,9株馬鏈球菌均攜帶fneB基因,值得關(guān)注的是,有3株馬鏈球菌同時攜帶3個毒力基因,分別為ply基因,lytA基因及FneB基因。根據(jù)耐藥性結(jié)果和毒力基因結(jié)果綜合分析,馬鏈球菌(Y1),同時攜帶兩種耐藥基因(blaTEM基因和qnrA基因)及一種毒力基因(fneB基因)。在臨床用藥中應(yīng)盡量避免在對馬鏈球菌引起的疾病中用β-內(nèi)酰胺類藥物進(jìn)行治療。

        通過本次實(shí)驗(yàn)可知,北疆地區(qū)馬源鏈球菌對常見藥物有較高的耐藥率,提示該地區(qū)耐藥情況比較嚴(yán)重;應(yīng)重視由耐藥菌株引起的鏈球菌病在馬場中傳播的嚴(yán)峻形勢。綜上所述,應(yīng)做到抗生素輪換使用并謹(jǐn)慎選擇,避免因?yàn)E用抗生素出現(xiàn)大量耐藥菌。

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