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        m6A修飾在乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移和化療耐藥中的研究進(jìn)展

        2023-08-24 15:59:52劉思涵余和芬
        中國醫(yī)藥科學(xué) 2023年10期
        關(guān)鍵詞:耐藥乳腺癌

        劉思涵 余和芬

        1.首都醫(yī)科大學(xué)第八臨床醫(yī)學(xué)院,北京 100038;2.首都醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)系,北京 100069

        乳腺癌是世界范圍內(nèi)女性最常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率以每年0.5%的速度增長[1]。在女性群體中,乳腺癌已取代肺癌,成為發(fā)病率最高的腫瘤[2]。由于早期診斷的普及和治療手段的進(jìn)步,乳腺癌的五年生存率已從20 世紀(jì)60 年代的63%上升為現(xiàn)在的90%。然而,對(duì)于確診時(shí)即為進(jìn)展期或已經(jīng)發(fā)生轉(zhuǎn)移的乳腺癌患者來說,五年生存率僅為26%。乳腺癌仍是危害女性健康的嚴(yán)重疾病。表觀遺傳學(xué)一直是生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),m6A 修飾作為真核細(xì)胞內(nèi)最普遍的RNA 修飾形式,通過影響RNA 的多種生物學(xué)過程,參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展和耐藥等多個(gè)方面。本文就m6A 修飾與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移和化療耐藥的有關(guān)研究做一綜述,旨在從m6A 修飾表觀遺傳角度為延緩乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移,逆轉(zhuǎn)乳腺癌化療耐藥提供參考依據(jù)。

        1 m6A修飾概述

        1.1 m6A修飾的基本概念

        m6A 修飾是發(fā)生在真核細(xì)胞RNA 中一種最主要的表觀遺傳修飾,其具體含義是指腺嘌呤(A)第6 位氮原子形成的一種甲基化修飾。m6A 修飾具有序列偏好性,主要定位于保守的RRACH 序列(R=G或A;H=A、C 或U)中,且此序列富集于mRNA 的3’非翻譯區(qū)(3’-UTR)和終止密碼子區(qū)[3]。

        1.2 m6A修飾的動(dòng)態(tài)調(diào)控

        m6A 修飾是一種動(dòng)態(tài)可逆的變化過程,主要由三種類型的蛋白調(diào)控,分別是m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶(writers)、m6A 去甲基酶(erasers)以及m6A 識(shí)別蛋白(readers)。

        1.2.1 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶的主要功能是以S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)作為甲基供體,在mRNA 的分子的特定位點(diǎn)加入m6A 修飾。目前明確的m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶主要包括甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白3(methyltransferase-like 3,METTL3)、甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白14(methyltransferaselike 14,METTL14)和腎母細(xì)胞瘤1- 相關(guān)蛋白(Wilm’s tumor 1-associated protein,WTAP)。METTL3 具有催化活性,將甲基轉(zhuǎn)移至受體腺嘌呤6 號(hào)氮原子。METTL14 本身不具備催化活性,但是可以穩(wěn)定RNA 底物并促進(jìn)METTL3 的催化活性。WTAP 通過與METTL3 和METTL14 相互作用 將其招募至相應(yīng)的mRNA 靶點(diǎn)。其他m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶還有RNA 結(jié)合基序蛋白15(RNA binding motif protein 15,RBM15)、鋅指CCCH 域蛋白13(zinc finger CCCH domain containing protein13,ZC3H13)、METTL16(methyltransferase-like16,METTL16)等。

        1.2.2 m6A 去甲基酶 目前明確的m6A 去甲基酶主要有肥胖相關(guān)蛋白(fat-mass and obesityassociated protein,F(xiàn)TO) 和Alk B 同源物5(Alk B homolog 5,ALKBH5)。盡管FTO 和ALKBH5 都可以去除甲基,但是它們二者對(duì)底物的選擇性具有差異,F(xiàn)TO 可以去除m6A 修飾和m6Am 修飾中的甲基,而ALKBH5 只能去除m6A 修飾上的甲基。除此之外,F(xiàn)TO 和ALKBH5 在去甲基序列的偏好性和去甲基的具體過程也不完全相同。

        1.2.3 m6A 識(shí)別蛋白 如果說甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基酶共同調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)mRNA 的m6A 水平,那么m6A識(shí)別蛋白則通過選擇性結(jié)合m6A 甲基化修飾在下游發(fā)揮調(diào)控作用。m6A 識(shí)別蛋白主要包括YTH結(jié)構(gòu)域蛋白1-2(YTHDC1-2)、YTH 結(jié)構(gòu)域家族1-3(YTHDF1-3)、異質(zhì)核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,HNRNPs), 包 括HNRNPC、HNRNPG、HNRNPA2B1、真核起始因子3(eukaryotic initiation factor 3,eIF3)等。結(jié)合蛋白通過直接或間接與m6A 修飾位點(diǎn)結(jié)合,發(fā)揮調(diào)節(jié)mRNA 的功能。

        2 m6A修飾與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移

        2.1 m6A甲基轉(zhuǎn)移酶與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移

        多種m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶參與調(diào)控乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移。METTL3 作為最重要的m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶,其在乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮的作用還存在爭議。Hu等[4]發(fā)現(xiàn)METTL3 在乳腺癌中高表達(dá)并提示預(yù)后不良,通過在蛋白質(zhì)水平調(diào)控Zeste 基因增強(qiáng)子同源物2(enhancer of Zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit,EZH2),進(jìn)而下調(diào)E-鈣黏蛋白(E-cadherin),促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞發(fā)生上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。然而,Shi 等[5]發(fā)現(xiàn),METTL3 在三陰性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中低表達(dá),并且與短距離無轉(zhuǎn)移生存密切相關(guān)。在此基礎(chǔ)上,Ruan 等[6]揭示了TNBC 中METTL3 的上游調(diào)控因子,提出miR-34c-3p 通過降低METTL3 mRNA 和蛋白質(zhì)水平,促進(jìn)TNBC 的增殖,轉(zhuǎn)移和侵襲。但是過表達(dá)circMETTL3 則可以通過分子海綿作用,阻止miR-34c-3p 和METTL3 mRNA 相互作用,逆轉(zhuǎn)miR-34c-3p 在TNBC 中的發(fā)揮的促癌作用。因此,circMETTL3 可能作為TNBC 治療的新方法。METTL3 在乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移中的作用機(jī)制十分復(fù)雜,目前還沒有達(dá)成共識(shí),有待進(jìn)一步的研究。

        METTL14 作為m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物之一,也參與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移的調(diào)控。Yi 等[7]發(fā)現(xiàn),METTL14 在乳腺癌組織中高表達(dá),通過調(diào)節(jié)m6A 修飾和hsa-miR-146a-5p 表達(dá),進(jìn)一步促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲。而Gong 等[8]卻發(fā)現(xiàn),METTL14在乳腺癌細(xì)胞中表達(dá)下調(diào),導(dǎo)致結(jié)腸腺瘤樣息肉(adenomatous polyposis coli,APC)基因的mRNA 穩(wěn)定性降低。APC 作為Wnt 信號(hào)通路的拮抗劑,其水平降低可以導(dǎo)致Wnt 通路的異常激活,從而在腫瘤細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移方面起到促進(jìn)作用。研究表明[9-10],METTL14 可以與多種長鏈非編碼RNA(lncRNAs) 相互作用,在腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮促進(jìn)作用。異常的METTL4 和m6A 水平與乳腺癌病情和預(yù)后密切相關(guān),有研究提出[11],激素受體陰性的乳腺癌患者是否可能受益于外源性METTL14 的過度表達(dá),為乳腺癌的臨床治療提供了新的分子靶點(diǎn)。

        Wang 等[12]發(fā)現(xiàn),WTAP 表達(dá)與乳腺癌腫瘤大小和分級(jí)呈正相關(guān),與腋窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況呈負(fù)相關(guān),有關(guān)WTAP 抑制乳腺癌腋窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的潛在機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。Ou 等[13]首次提出WTAP可能作為C5aR1+中性粒細(xì)胞促癌通路中的重要中間因子,促進(jìn)乳腺癌的進(jìn)展。C5aR1+中性粒細(xì)胞通過分泌白細(xì)胞介素(interleukin,IL)-1β 和腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)-α,協(xié)同激活細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶1/2(extracellular signalregulated kinase1/2,ERK1/2),促進(jìn)WTAP 磷酸化,增加其穩(wěn)定性。增加的WTAP 通過促進(jìn)烯醇化酶1(enolase 1,ENO1)m6A 修飾,誘導(dǎo)乳腺癌糖酵解,促進(jìn)乳腺癌的惡性進(jìn)展,創(chuàng)新性地提出了C5aR1+中性粒細(xì)胞和WTAP-ENO1 網(wǎng)絡(luò)作為乳腺癌治療靶點(diǎn)的潛力。

        2.2 m6A去甲基酶與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移

        FTO 失調(diào)在乳腺癌中的作用機(jī)制尚不明確。Jeschke 等 發(fā)現(xiàn)FTO 在乳腺癌中低表達(dá),通過提高m6A 水平,調(diào)控Wnt 信號(hào)通路,促進(jìn)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化。除此之外,Jeschke 等[14]還提出了FTO 低表達(dá)的腫瘤細(xì)胞對(duì)Wnt 通路抑制劑具有更高的敏感性,F(xiàn)TO 低表達(dá)的乳腺癌患者更有可能從Wnt 抑制劑中獲益。然而,Xu 等[15]發(fā)現(xiàn)FTO 在人表皮生長因子受體-2(HER-2)陽性的乳腺癌中高表達(dá),通過FTO/miR-181b-3p/ARL5B 軸,加速腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲。作為除FTO 以外的另一種m6A 去甲基酶,ALKBH5 在乳腺癌中侵襲轉(zhuǎn)移中作用也逐漸被更多的學(xué)者關(guān)注。Zhang 等[16-17]發(fā)現(xiàn),ALKBH5可能作為缺氧誘導(dǎo)因子(hypoxia inducible factor,HIF)的下游靶基因,和鋅指蛋白217(zinc finger protein 217,ZNF217)協(xié)同,降低NANOG 同源盒蛋白(NANOG homeobox,NANOG)和Kruppel 樣因子(Kruppel like factor,KLF)4 mRNA的m6A修飾水平,提高NANOG 和KLF4 的mRNA 穩(wěn)定性,進(jìn)而增加乳腺癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移所需的干細(xì)胞的百分比,在乳腺癌中起到致癌作用。以上研究為臨床提供了研發(fā)ALKBH5 抑制劑阻止乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移的新思路。

        2.3 m6A識(shí)別蛋白與乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移

        YTHDF1 是用途最廣、功能最強(qiáng)的識(shí)別蛋白。研究表明[18-20],YTHDF1 與包括消化系統(tǒng),呼吸系統(tǒng),泌尿系統(tǒng)在內(nèi)的多種腫瘤的進(jìn)展密切相關(guān)。YTHDF1 在乳腺癌組織和細(xì)胞中高表達(dá),與腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化等惡性進(jìn)展呈正相關(guān),而與生存期和免疫細(xì)胞腫瘤浸潤呈負(fù)相關(guān)。關(guān)于YTHDF1 促癌作用的潛在機(jī)制,Sun 等[21]認(rèn)為YTHDF1 可以通過METLL14 依賴的方式調(diào)控E2F 轉(zhuǎn)錄因子8(E2F transcription factor 8,E2F8)mRNA 的穩(wěn)定性和DNA 損傷修復(fù),發(fā)揮致癌作用。Chen 等[22]則認(rèn)為乳腺癌中高表達(dá)的YTHDF1 可以通過識(shí)別并結(jié)合到叉頭盒蛋白M1(forkhead box M1,F(xiàn)OXM1)mRNA 的m6A 修飾位點(diǎn),促進(jìn)FOXM1的翻譯,發(fā)揮致癌作用。Yao 等[23]發(fā)現(xiàn),腫瘤內(nèi)缺氧可以誘導(dǎo)HIF-1α,抑制miR-16-5p 表達(dá),進(jìn)而促進(jìn)YTHDF1 的表達(dá),最后通過上調(diào)丙酮酸激酶M2(pyruvate kinase M2,PKM2)增強(qiáng)腫瘤糖酵解,發(fā)揮促癌作用。除YTHDF1 以外,Lin 等[24]還發(fā)現(xiàn),在TNBC 細(xì)胞中,YTHDF3 可以通過m6A 修飾依賴的方式增強(qiáng)E 盒結(jié)合鋅指蛋白(zinc finger E-box binding homeobox 1,ZEB1)mRNA 的穩(wěn)定性,發(fā)揮促癌作用。通過以上研究,YTHDF1 和YTHDF3 有望成為乳腺癌患者預(yù)后評(píng)價(jià)指標(biāo)和潛在的治療靶點(diǎn)。

        Lv 等[25]將HNRNPC 與在多種腫瘤中表達(dá)異常的circRNA 聯(lián)系起來,推測乳腺癌中上調(diào)的circBACH2 在細(xì)胞質(zhì)中作為has-miR-944 的分子海綿,促進(jìn)HNRNPC 的表達(dá)和活性,進(jìn)而影響MAPK 信號(hào)通路,從而加速BC 細(xì)胞的增殖。Shi 等[26]提出IGF2BP1 與長鏈非編碼RNA MIR210HG 相互作用,通過MYCN/IGF2BP1/MIR210HG/miR-210 軸,在乳腺癌進(jìn)展中發(fā)揮促癌作用。

        3 m6A修飾與乳腺癌化療耐藥

        阿霉素是多種表型乳腺癌化學(xué)治療的首選方案。Li 等[27]發(fā)現(xiàn)METTL3 在阿霉素耐藥的乳腺癌細(xì)胞中高表達(dá),通過調(diào)控人肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis associated in lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)的表達(dá),招募E2F1 并激活下游前梯度蛋白2(anterior gradient 2,AGR)的表達(dá),從而促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞對(duì)阿霉素的耐藥。Huang 等[28]發(fā)現(xiàn),WTAP 可以與lncRNA DLGAP1-AS1 形成正反饋環(huán),促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞化療耐藥。Wang 等[29]發(fā)現(xiàn)在對(duì)阿霉素耐藥的乳腺癌細(xì)胞中FTO 高表達(dá),并且其發(fā)揮作用與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白和轉(zhuǎn)錄激活子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)相關(guān)。STAT3 是促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞產(chǎn)生化療耐藥的重要因子,STAT3 和FTO 通過形成雙向促進(jìn)的環(huán)路,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞對(duì)阿霉素的化療耐藥。雖然文獻(xiàn)數(shù)量較少,但FTO 在化療耐藥乳腺癌細(xì)胞中的高表達(dá)水平這一觀點(diǎn)基本一致。在未來,是否可以利用FTO 抑制劑來逆轉(zhuǎn)乳腺癌化療耐藥有待進(jìn)一步研究。Wu 等[30]發(fā)現(xiàn)蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶5(protein arginine methyltransferase 5,PRMT5)通過增強(qiáng)ALKBH5 的核轉(zhuǎn)位,從而上調(diào)ALKBH5,去除BRCA1 的m6A 修飾以穩(wěn)定mRNA,進(jìn)一步增強(qiáng)DNA 修復(fù)能力,從而降低阿霉素對(duì)乳腺癌細(xì)胞的療效。

        4 總結(jié)與展望

        m6A RNA 修飾除了在腫瘤的發(fā)生進(jìn)展中起到重要調(diào)控作用,還與神經(jīng)系統(tǒng)、生殖系統(tǒng)等多種疾病密切相關(guān)。參與m6A 修飾的有關(guān)蛋白通過與miRNA,lncRNA,circRNA 等多種分子和免疫細(xì)胞相互作用,在乳腺癌侵襲進(jìn)展和化療耐藥中發(fā)揮作用。正是由于參與m6A 修飾的有關(guān)蛋白種類繁多且功能各異,所以為抗癌藥物的研發(fā)提供了數(shù)目眾多的潛力靶點(diǎn),也為逆轉(zhuǎn)化療耐藥提供了新思路。未來的研究中,臨床需要就各種關(guān)鍵的修飾蛋白在不同表型乳腺癌細(xì)胞中表達(dá)水平的高低得出統(tǒng)一結(jié)論,為乳腺癌靶向藥物的開發(fā)奠定理論基礎(chǔ),以期通過藥物的高度靶向作用降低副作用。

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