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        miR-483-5p 靶向Timp2 調(diào)控破骨細(xì)胞的生成

        2023-08-12 09:29:58牛田琦劉彩霞鄧慧鳴曾祥周
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        牛田琦,劉彩霞,熊 軍,賈 浩,王 華,李 霜,鄧慧鳴,曾祥周

        (海南醫(yī)學(xué)院,海南 ???571199)

        破骨細(xì)胞(osteoclasts,OCs)是來自單核-巨噬細(xì)胞譜系的多核骨吸收細(xì)胞[1],破骨細(xì)胞作為人體內(nèi)唯一負(fù)責(zé)骨吸收的細(xì)胞類型,對(duì)正常骨骼發(fā)育和體內(nèi)骨平衡至關(guān)重要,過度激活會(huì)導(dǎo)致骨內(nèi)環(huán)境平衡失調(diào)[2],進(jìn)而導(dǎo)致多種溶骨性骨疾病,如骨質(zhì)疏松癥、骨佩吉特病和侵蝕性關(guān)節(jié)炎[3]。因此,破骨細(xì)胞已成為預(yù)防和治療骨溶解疾病的重要靶點(diǎn)。microRNA 是一類高度保守的單鏈小分子非編碼RNA,在真核生物中可調(diào)節(jié)超過30% 的基因[4]。miRNA 可特異性結(jié)合靶標(biāo)的3'-非翻譯區(qū)(3'-UTR),通過干擾mRNA 的穩(wěn)定性和/或阻斷蛋白翻譯抑制mRNA 的表達(dá)[5]。大量研究表明,miRNA通過調(diào)控上述多種因子和激素影響各信號(hào)通路,導(dǎo)致OCs 分化和功能改變[6-8]。miR-483 是Landgraf等[9]于2007 年報(bào)道的在人胎肝中發(fā)現(xiàn)的一種miRNA,經(jīng)酶切后形成miR-483-5p 和miR-483-3p。關(guān)于miR-483-5p 的大多數(shù)文獻(xiàn)與腫瘤有關(guān)。但是,目前關(guān)于miR-483-5p 通過Timp2調(diào)控OCs 生成及其機(jī)制未見報(bào)道。前期研究通過生物信息軟件發(fā)現(xiàn)了miR-483-5p 的靶基因Timp2,并對(duì)比了二者部分基因序列,發(fā)現(xiàn)有互補(bǔ)序列,進(jìn)而通過體外熒光素酶分析驗(yàn)證靶點(diǎn),并利用RANKL 誘導(dǎo)RAW264.7細(xì)胞向OCs 分化體系進(jìn)行靶向驗(yàn)證,明確miR-483-5p 靶向于Timp2影響OCs 分化及活性的機(jī)制。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        RAW264.7 小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞和人胚腎293T 細(xì)胞均購自中國科學(xué)院細(xì)胞庫。

        主要試劑和儀器:GP-transfect-Mate 轉(zhuǎn)染試劑來自蘇州吉瑪基因有限公司;熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒來自安諾倫北京生物科技有限公司;Lipo 2000 轉(zhuǎn)染試劑來自美國賽默飛公司;白細(xì)胞酸性磷酸酶(TRAP)試劑盒來自美國Sigma 公司;蛋白提取試劑盒、SDS-PAGE 凝膠配制試劑盒均來自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒Prime Script TM RT Master Mix (Perfect Real Time)、熒光定量檢測(cè)試劑盒TB Green?Premix Ex TaqTMⅡ(Tli RNaseH Plus)均來自日本TaKaRa 公司;TRIzol 試劑來自美國Invitrogen 公司;胎牛血清(FBS)、DMEM 培養(yǎng)基、青霉素和鏈霉素均來自美國Gibco 公司;多功能酶標(biāo)儀(型號(hào):Synergy HTX)來自美國Biotek 公司;實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀(型號(hào):Roche LightCycler480Ⅱ)來自德國羅氏診斷公司。

        1.2 方法

        1.2.1 生物信息軟件預(yù)測(cè) 用TargetScan8.0 數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站https://www.targetscan.org/vert_80/預(yù)測(cè)可能與miR-483-5p 靶向的靶基因,對(duì)所預(yù)測(cè)靶基因和miR-483-5p 的基因序列進(jìn)行對(duì)比,尋找是否有互補(bǔ)序列。

        1.2.2 雙熒光素酶活性檢測(cè) 構(gòu)建Timp2野生型和突變型3'-UTR 質(zhì)粒來自于蘇州吉瑪基因股份有限公司。轉(zhuǎn)染:293T 細(xì)胞按5×105細(xì)胞/孔的濃度接種12 孔板,各組分別設(shè)置3 個(gè)復(fù)孔,用含10%FBS、100 U/mL 青霉素G 和100 μg/mL 鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)基于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)24 h,使細(xì)胞完全貼壁。轉(zhuǎn)染分組為:mimic NC +Timp2野生、miR483 mimic+Timp2野生、mimic NC+Timp2-miR483-突變、miR483 mimic+Timp2-miR483 突變。參照GP-transfect-Mate 說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染,在培養(yǎng)箱中溫育5 h 后棄掉舊轉(zhuǎn)染液,加入500 μL 含10% FBS 的DMEM 培養(yǎng)液。37 ℃ 5%CO2繼續(xù)培養(yǎng)48 h。雙熒光素酶系統(tǒng)檢測(cè):棄掉12 孔板中的培養(yǎng)液,用500 μL PBS 洗滌細(xì)胞兩次,將1×PLB 300 μL 加入到培養(yǎng)孔中,在室溫輕緩晃動(dòng)培養(yǎng)板15 min,把裂解液轉(zhuǎn)移到檢測(cè)試板中,每孔100 μL。用Synergy HTX 酶標(biāo)儀雙熒光素酶檢測(cè)系統(tǒng)分別檢測(cè)螢火蟲熒光素酶活性和海腎熒光素酶活性,選擇1~2 s 延遲,5~10 讀數(shù)。

        1.2.3 細(xì)胞轉(zhuǎn)染 將miR-483-5p mimic、miR-483-5p inhibitor 和Timp2siRNA 分別轉(zhuǎn)染入RAW264.7細(xì)胞中用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。轉(zhuǎn)染方法:取RAW264.7 細(xì)胞按5×104/孔密度鋪板于24 孔板,用含10% FBS、100 U/mL 青霉素G 和100 μg/mL 鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)基500 μL/孔培養(yǎng)24 h,使細(xì)胞完全貼壁。參照Lipo 2000 說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染。37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)5 h 后,棄掉板中的舊轉(zhuǎn)染液,加入含10% FBS 的DMEM 培養(yǎng)基500 μL/孔,除Blank組外,其余各組加入終濃度為100 ng/mL 的RANKL,繼續(xù)培養(yǎng)。

        1.2.4 共轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn) 首先將來自于蘇州吉瑪基因公司構(gòu)建的慢病毒Timp2-LV 根據(jù)說明書感染入RAW264.7 細(xì)胞,待細(xì)胞在6 孔板中培養(yǎng)至90%以上,消化后重新以5×104/孔密度鋪板于24 孔板,進(jìn)行后續(xù)轉(zhuǎn)染miR-483-5p mimic 實(shí)驗(yàn)。

        1.2.5 Western blot 檢測(cè) RAW264.7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)2 d 后用含PMSF 的RIPA 緩沖液從培養(yǎng)的細(xì)胞中提取全細(xì)胞蛋白。全細(xì)胞蛋白濃度用BCA 蛋白測(cè)定試劑盒測(cè)定。等量的全細(xì)胞提取物通過10% SDS-PAGE 和電泳分離,轉(zhuǎn)移到聚偏氟乙烯膜上。用5%脫脂牛奶在TBST 中阻斷1 h 后,用Timp2和β-actin 一抗在4 ℃下孵育過夜,然后用HRP 耦聯(lián)二抗孵育1 h,最后用蛋白顯影儀用ECL試劑檢測(cè)條帶。用ImageJ 軟件對(duì)western blotting得到的信號(hào)進(jìn)行量化。用β-actin 進(jìn)行歸一化。

        1.2.6 TRAP 染色 RAW264.7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)4 d 后行TRAP 染色,具體實(shí)驗(yàn)步驟按照試劑盒說明書進(jìn)行。在倒置顯微鏡下觀察拍照,視野中觀察到的紫紅色部分為OCs 的胞漿,胞漿中藍(lán)染部分為OCs 的胞核,并按TRAP 染色陽性且細(xì)胞核數(shù)大于3 個(gè)的為破骨細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。

        1.2.7 RT-PCR 檢測(cè) RAW264.7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)2 d 后用TRIzol 試劑從培養(yǎng)的RAW264.7 細(xì)胞中分離總RNA。利用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒Prime Script TM RT Master Mix(Perfect Real Time)將500 ng 總RNA 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。實(shí)時(shí)PCR 根據(jù)TB Green?Premix Ex TaqTM Ⅱ(Tli RNaseH Plus)試劑盒說明書配制反應(yīng)體系,用Roche LightCycler480實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增參數(shù)如下:95 ℃30 s,95 ℃5 s,60 ℃20 s,共40 個(gè)循環(huán)。實(shí)驗(yàn)小鼠引物序列如下:TRAP 上游引物:5'-GTGGAAGCCTCTGGAAAATC-3',下游引物:5'-CTCCTCCCTCACACCCGTTA - 3';NFATc1 上游引物:5'-CCGTTGCTTCCAGAAAATAACA-3',下游引物:5'-TGTGGGATGTGAAACTCG GAA - 3';Cathepsin K 上游引物:5' - CTTCCAATACGTGCAGCAGA-3',下 游 引 物 :5'-TCTTCAGG GCTTTCTCGTTC-3';MMP-9上游引物:5'-CAAAGACCTGAAAACCTCCAA-3';下游引物:5'-GGTACAAGTATGCCTCTGCCA-3';β-actin 上游引物:5'-CTGTCCCTGTATGCCTCTG-3';下游引物:5'-TGATGTCACGCACGATTT-3'。采用2-ΔΔCT法評(píng)估相關(guān)基因表達(dá),所有值用β-actin 歸一化。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        采用SPSS26.0 軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。計(jì)量資料間的分析采用單因素方差分析和LSD 事后檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)意義分析。P<0.05 判斷差異為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 靶基因預(yù)測(cè)

        通過Target Scan 8.0 軟件預(yù)測(cè)mmu-miR-483-5p 的靶基因,并通過接下來的熒光素酶報(bào)告基因發(fā)現(xiàn)Timp2可能是miR-483-5p 影響OCs 分化的靶點(diǎn),并對(duì)Timp2進(jìn)行接下來的驗(yàn)證。

        2.2 熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)驗(yàn)證Timp2 是否為mmu-miR-483-5p 靶點(diǎn)

        通過對(duì)Timp2的3'-UTR 與mmu-miR-483-5p的互補(bǔ)區(qū)對(duì)比發(fā)現(xiàn)完全互補(bǔ),見圖1(A)。為了驗(yàn)證Timp2與mmu-miR-483-5p 的靶向關(guān)系,成功克隆了Timp23'-UTR,構(gòu)建了用于miRNA 靶標(biāo)檢測(cè)的野生型Timp2WT 以及突變型Timp2MUT 重組載體。雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染HEK 293T 細(xì)胞2 d 后,共轉(zhuǎn)染野生型重組載體Timp2WT 時(shí),與 mimics NC 組比較,mmu-miR-483-5p mimics 組的熒光活性顯著下調(diào)(F=19.401,P<0.05),見圖1(B);而共轉(zhuǎn)染突變型重組載體Timp2MUT 時(shí),mimics NC 組與mmu-miR-483-5p mimics組的熒光素酶活性差異不顯著(F=0.05,P>0.05),見圖1(C)。說明mmu-miR-483-5p 可以與預(yù)測(cè)的Timp2基因的3'-UTR 位點(diǎn)互補(bǔ),兩者之間存在靶向調(diào)控關(guān)系。上述結(jié)果初步提示Timp2基因可能是mmu-miR-483-5p 調(diào)控破骨細(xì)胞生成的靶基因。

        圖1 雙熒光素酶報(bào)告分析Fig 1 Luciferase reporter assays

        2.3 轉(zhuǎn)染miR-483-5p 在RAW264.7 細(xì)胞中的含量對(duì)Timp2 的影響

        將miR-483-5p mimic 和miR-483-5p inhibitor 分別轉(zhuǎn)染入RAW264.7 細(xì)胞后發(fā)現(xiàn),增加細(xì)胞中miR-483-5p 的表達(dá)后相較于NC 組,Timp2的蛋白含量顯著降低(F=13.218,P<0.05),相反,抑制miR-483-5p 的表達(dá)后相較于inNC 組,Timp2的蛋白含量有所提高(F=25.693,P<0.01),見圖2,這說明在體外miR-483-5p 至少與Timp2蛋白有靶向關(guān)聯(lián),且呈負(fù)相關(guān)。

        圖2 Western blot 檢測(cè)Fig 2 Western blot analysis

        2.4 沉默RAW264.7 細(xì)胞中Timp2 對(duì)OCs 分化的影響

        為明確Timp2與OCs 之間的關(guān)系,本研究用Timp2的siRNA 沉默RAW264.7 細(xì)胞中的Timp2,誘導(dǎo)OCs 后TRAP 染色顯示,相較于RANKL 誘導(dǎo)的陽性對(duì)照組,沉默細(xì)胞中Timp2會(huì)導(dǎo)致更多OCs生成(F=118.021,P<0.05),見圖3(A)。而RTPCR 結(jié)果與之對(duì)應(yīng),各特異性基因TRAP(F=7 358.715,P<0.05)、NFATc1(F=1 741.066,P<0.05)、Cathepsin K(F=239.981,P<0.05)和MMP-9(F=4 456.654,P<0.05)的表達(dá)相應(yīng)增高,見圖3(B),這提示在RAW264.7 細(xì)胞中Timp2作為miR-483-5p 的靶點(diǎn)可影響OCs 分化及活性。

        圖3 TRAP 染色和RT-PCR 檢測(cè)Fig 3 TRAP staining and RT-PCR analysis

        2.5 miR-483-5p 和Timp2 共處理RAW264.7 細(xì)胞后對(duì)OCs 分化的影響

        Timp2- LV 和miR - 483 - 5p mimic 共處理RAW264.7 細(xì)胞后TRAP 染色結(jié)果顯示,與RANKL 組相比,僅轉(zhuǎn)染miR-483-5p mimic 可促進(jìn)OCs 分化,并且分化出的OCs 體積增大,但在轉(zhuǎn)染miR-483-5p mimic 的前提下,過表達(dá)Timp2可顯著逆轉(zhuǎn)miR-483-5p mimic 引起的過度OCs 活化(F=108.721,P<0.05),見圖4(A)。RT-PCR 檢測(cè)特異性基因得到了和TRAP 染色一致的結(jié)果(TRAP:F=323.829,P<0.05;NFATc1:F=197.148,P<0.05;Cathepsin K:F=431.888,P<0.05;MMP-9:F=448.821,P<0.05),見圖4(B)。因此miR-483-5p和Timp2在體外呈靶向且相互拮抗的作用,miR-483-5p 可通過降低Timp2的表達(dá)導(dǎo)致OCs 過度分化。

        圖4 共轉(zhuǎn)染后TRAP 染色和RT-PCR 檢測(cè)Fig 4 TRAP staining and RT-PCR analysis after co-transfection

        3 討論

        越來越多的研究證明OCs 在病理?xiàng)l件下的形成和激活異常對(duì)多種疾病中的骨破壞的影響非常關(guān)鍵[10]。OCs 分化過程受到多種因子和激素的影響,包括RANKL、M-CSF、性激素等,這些因素作為信號(hào)分子導(dǎo)致下游多條信號(hào)通路被激活,如NFATc1(主要)、MAPK、MITF、PI3K/AKT 和NF-κB 等,從而調(diào)節(jié)OCs 的分化和活性[11,12]。除了這些促破骨因子外,還有一些發(fā)揮抑制作用的調(diào)節(jié)因子,如骨保護(hù)素(OPG)與RANKL 的可溶結(jié)合,導(dǎo)致RANK/RANKL 信號(hào)通路的激活被沉默。而雌激素可通過刺激OPG 的產(chǎn)生間接地抑制骨吸收[13]。此外,一些促炎細(xì)胞因子也可促進(jìn)OCs 的形成[14]。

        許多研究認(rèn)為在OCs 形成過程中,干預(yù)調(diào)控破骨相關(guān)的miRNA 具有重要意義。自1993 年發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)名為“l(fā)in4”的miRNA 以來,越來越多的研究在多種有機(jī)體中發(fā)現(xiàn)了許多miRNA 可以通過負(fù)向調(diào)控多個(gè)基因的表達(dá)來控制多種生物過程,包括器官發(fā)生、發(fā)育、造血功能、細(xì)胞凋亡、增殖和腫瘤發(fā)生等,是控制細(xì)胞增殖、遷移和細(xì)胞分化等過程的關(guān)鍵調(diào)控分子[15],miRNA 來自RNA 聚合酶Ⅱ,該轉(zhuǎn)錄序列來自于非編碼DNA 序列、內(nèi)含子或非翻譯區(qū)(UTR)內(nèi)的編碼序列[16],其調(diào)控基因的功能作用于轉(zhuǎn)錄后水平[17],許多miRNA 已被確定為淋巴細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子(如miR146a 或miR155)[18]。

        在針對(duì)miR-483-5p 的研究中,Wang 等[19]報(bào)道了miR-483-5p 可通過調(diào)節(jié)軟骨細(xì)胞肥大參與骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)生、發(fā)展;De-Ugarte 等[20]通過miRNA 芯片分析發(fā)現(xiàn)骨質(zhì)疏松病人來源的松質(zhì)骨樣本中miR-483-5p 的表達(dá)水平較對(duì)照組明顯上調(diào)。

        有研究表明miR-483-5p 有助于單核細(xì)胞分化為OCs[21],而在本研究中,首先利用生物信息軟件預(yù)測(cè)miR-483-5p 可能與Timp2有靶向關(guān)系,進(jìn)而構(gòu)建Timp23'-UTR 的野生型(WT)和突變型(MUT)雙熒光素酶報(bào)告基因載體,通過RT-PCR 檢測(cè)和基因測(cè)序確定Timp2是miR-483-5p 的靶點(diǎn)。隨后,利用miR-483-5p mimic 和miR-483-5p inhibitor 人為的上調(diào)或下調(diào)RAW264.7 細(xì)胞中miR-483-5p 的含量后對(duì)靶蛋白進(jìn)行檢測(cè),體現(xiàn)出miR-483-5p 可影響RAW264.7 細(xì)胞中Timp2的蛋白表達(dá)量。并研究了Timp2在OCs 分化過程中的作用,結(jié)合兩部分?jǐn)?shù)據(jù),筆者認(rèn)為miR-483-5p 可通過靶向Timp2調(diào)控OCs 的分化過程及其破骨活性。對(duì)RAW264.7 細(xì)胞的共處理驗(yàn)證了該猜想,在RAW264.7 細(xì)胞分化為OCs 過程中,Timp2可顯著逆轉(zhuǎn)miR-483-5p 帶來的OCs 過度活化。因此,通過以上體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了miR-483-5p 通過調(diào)控Timp2影響OCs 分化和活性。這一發(fā)現(xiàn)對(duì)干預(yù)調(diào)控破骨相關(guān)的miRNA 影響OCs形成具有重要意義,為治療OCs 過度分化導(dǎo)致的骨破壞疾病提供了新的潛在思路和策略。

        作者貢獻(xiàn)度說明:

        曾祥周:項(xiàng)目主持人,負(fù)責(zé)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)及論文修改指正;牛田琦:負(fù)責(zé)實(shí)驗(yàn)實(shí)施、數(shù)據(jù)處理及論文撰寫;劉彩霞:負(fù)責(zé)部分?jǐn)?shù)據(jù)處理;熊軍、李霜、鄧慧鳴:負(fù)責(zé)樣本收集整理;王華、賈浩:負(fù)責(zé)針對(duì)靶基因預(yù)測(cè)提供技術(shù)指導(dǎo)。

        所有作者聲明不存在利益沖突關(guān)系。

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