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        85525例無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)常染色體三體結(jié)果分析

        2023-07-31 07:44:58張苗苗方玉琴李景然王朝紅孫玉秀朱健生
        實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志 2023年12期
        關(guān)鍵詞:高風(fēng)險(xiǎn)三體染色體

        張苗苗 方玉琴 李景然 王朝紅 孫玉秀 朱健生

        安徽醫(yī)科大學(xué)附屬婦幼保健院(合肥 230000)

        無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)(noninvasive prenatal testing,NIPT)自問(wèn)世以來(lái),以分析孕婦外周血中的胎兒游離DNA(cell-free foetal DNA,cffDNA)為基礎(chǔ),在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域迅速推廣[1]。由于NIPT 方法的全基因組性質(zhì),已經(jīng)擴(kuò)大了篩查范圍,不可避免地會(huì)發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)常染色體三體(rare autosomal trisomies,RATs),定義為21、18 或13 號(hào)染色體以外的常染色體三體,但是對(duì)于RATs 的研究較少,其應(yīng)用價(jià)值尚存爭(zhēng)議,還需要更多的驗(yàn)證證據(jù)[2-3]。其次,RATs 并不罕見(jiàn),在產(chǎn)科人群中檢測(cè)到RATs 的頻率為0.18%左右,NIPT 對(duì)RATs 的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值(positive predictive value,PPV)較低(4%~6%)[4],假陽(yáng)性高的主要原因?yàn)橄拗菩蕴ケP(pán)嵌合(confined placental mosaicism,CPM)的存在,導(dǎo)致RATs 高風(fēng)險(xiǎn)通常與胎兒-胎盤(pán)疾病風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)[5],但是,關(guān)于RATs 的發(fā)病率和妊娠結(jié)局的報(bào)道仍然有限,出于這個(gè)原因,這種意外的發(fā)現(xiàn)通常會(huì)使遺傳咨詢變得困難,了解RATs 臨床意義的必要性已經(jīng)變得迫切。因此,本研究納入了目前國(guó)內(nèi)最大的樣本量,旨在探討NIPT 在篩查RATs 的準(zhǔn)確性以及RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的孕婦是否會(huì)發(fā)生不良妊娠結(jié)局,首次對(duì)RATs 進(jìn)行各條染色體的詳細(xì)分析,評(píng)估不同染色體之間存在的差異,以期幫助改善妊娠管理。

        1 資料與方法

        1.1 研究對(duì)象收集2018年1月1日至2022年6月1 日在安徽省婦幼保健院接受NIPT 的85 525 例孕婦(年齡:18~35 歲),納入標(biāo)準(zhǔn)如下:(1)孕周12+0~26+5;(2)單胎妊娠;(3)孕婦血清學(xué)篩查臨界風(fēng)險(xiǎn)值(1/1 000 ≤T21<1/270,1/1 000 ≤T18<1/350),孕婦血清學(xué)篩查高危值(T21 ≥1/270,T18 ≥1/350);(4)B 超提示胎兒?jiǎn)雾?xiàng)軟指標(biāo)異常。排除標(biāo)準(zhǔn)如下:(1)胎齡<12 周;(2)雙胎或者多胎妊娠;(3)B 超顯示胎兒結(jié)構(gòu)畸形;(4)配偶其中一方明確染色體異常;(5)1年以內(nèi)接受過(guò)異體輸血、干細(xì)胞治療、移植手術(shù)或免疫治療的孕婦;(6)患有惡性腫瘤的孕婦;(7)因嚴(yán)重溶血、凝血、游離DNA 含量低等原因復(fù)檢不合格的樣本。本研究得到了安徽醫(yī)科大學(xué)倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)。所有患者在檢測(cè)前進(jìn)行臨床遺傳學(xué)家的咨詢,并在采血前簽署知情同意書(shū)。

        1.2 檢測(cè)方法

        1.2.1 NIPT 檢測(cè)NIPT 使用無(wú)菌EDTA 抗凝管采集每位孕婦外周血5 mL,在安徽省婦幼保健院遺傳實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行兩步離心法,分離血漿,使用QIAAMP 循環(huán)核酸試劑盒(QIAGEN)磁珠吸附提取法提取DNA,隨后用末端修復(fù)酶進(jìn)行末端修復(fù),標(biāo)記接頭并用連接酶連接接頭,最后通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)將DNA 擴(kuò)增到所需的濃度完成文庫(kù)構(gòu)建;利用NextSeqCN500 測(cè)序儀進(jìn)行高通量測(cè)序和生物信息學(xué)分析,并與人類(lèi)基因組參考序列圖進(jìn)行比較,NIPT 結(jié)果以Z 值風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分表示:評(píng)分≥3或≤-3 被認(rèn)為是高風(fēng)險(xiǎn),評(píng)分-3~3 被認(rèn)為是低風(fēng)險(xiǎn)。

        1.2.2 侵入性產(chǎn)前診斷

        1.2.2.1 染色體核型分析在超聲引導(dǎo)下進(jìn)行羊水穿刺術(shù),抽取20~30 mL 羊水,進(jìn)行接種、培養(yǎng)、G 顯帶,使用GSL-120 型自動(dòng)核型掃描儀進(jìn)行核型掃描。根據(jù)《國(guó)際人類(lèi)細(xì)胞遺傳學(xué)命名系統(tǒng),ISCN2020》指南進(jìn)行核型描述。

        1.2.2.2 染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)同上采集羊水細(xì)胞后,進(jìn)行離心沉淀,提取DNA,根據(jù)AffymetrixCytoScan 750K 芯片操作規(guī)程,進(jìn)行SNP 芯片檢測(cè),收集數(shù)據(jù),參考公共數(shù)據(jù)庫(kù)(Clingen、Decpher、ClinVar、OMIM、DGV、ISCA、NCBI、UCSC)中的文獻(xiàn)進(jìn)行綜合分析。

        1.2.3 隨訪所有孕婦均通過(guò)電話或電子病歷系統(tǒng)進(jìn)行隨訪,隨訪內(nèi)容包括分娩記錄、實(shí)驗(yàn)室篩查、胎兒超聲檢查、細(xì)胞遺傳學(xué)測(cè)試和新生兒體檢報(bào)告。結(jié)果衡量標(biāo)準(zhǔn):根據(jù)出生孕周,新生兒分為足月兒(≥37 周)、早產(chǎn)兒(preterm birth,PTB)(32~37 周)和極早產(chǎn)兒(<32 周);胎兒生長(zhǎng)受限(fetal growth restriction,F(xiàn)GR)的標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)新生兒出生體重低于同孕齡正常體重的第10 百分位數(shù)[5-6]。

        2 結(jié)果

        2.1 RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的NIPT 結(jié)果85 525 例孕婦中篩查出182 例RATs 高風(fēng)險(xiǎn),頻率為0.21%(182/85 525),按降序排列,T7(7 號(hào)染色體三體)、T8、T16和T20 較常見(jiàn)(≥15 例);T10、T9、T3、T2、T11、T15、和T22 中等頻率(5~15 例);T14、T17、T1、T5、T6和T12 相對(duì)少見(jiàn)(<5 例);未檢測(cè)出T4 和T19。見(jiàn)圖1。

        圖1 NIPT 檢出RATs 在不同染色體上的分布Fig.1 The distribution of RATs on different chromosomes by NIPT

        2.2 RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)前診斷結(jié)果182 例孕婦經(jīng)過(guò)詳細(xì)的遺傳咨詢,46 例拒絕侵入性產(chǎn)前診斷,其余136 例進(jìn)行羊膜腔穿刺術(shù),行羊水核型分析或CMA 檢測(cè),檢測(cè)出7 例真陽(yáng)性(PPV:5.15%),分別為兩例T2、1 例T9、1 例T7、1 例T15 和2 例T16。PPV 分別為50.0%(2/4)、3.13%(1/32)、12.5%(1/8)、33.3%(1/3)和12.5%(2/16),其他染色體的PPV 均為0.00%,總PPV 為5.15%。見(jiàn)表1。

        表1 孕婦行NIPT 及侵入性產(chǎn)前診斷的結(jié)果Tab.1 Results of NIPT and invasive prenatal diagnosis in pregnant women 例

        行CMA 檢測(cè)的孕婦中發(fā)現(xiàn)了5 例雜合性缺失(loss of heterozygosity,LOH),1 例LOH(6),CMA 結(jié)果為6p25.3p22.3 區(qū)域15.57 Mb 及6q24.3q27 區(qū)域22.15 Mb 雜合性缺失,進(jìn)一步家系驗(yàn)證為母源性單親二倍體(uniparentaldisomy,UPD);1 例LOH(10),CMA 結(jié)果為10 號(hào)染色體雜合性缺失;2 例LOH(16),CMA 結(jié)果分別為16q21q24.3 區(qū)域24.45 Mb和16p13.3 區(qū)域5.91 Mb 雜合性缺失;1 例LOH(20),芯片結(jié)果為20P12.3P11.1 區(qū)域20.91 Mb 及20q11.21q13.33 區(qū)域29.06 Mb 雜合性缺失,進(jìn)一步家系驗(yàn)證,結(jié)果為父源性UPD。

        2.3 RATs 高風(fēng)險(xiǎn)孕婦的妊娠結(jié)局在182 例RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的孕婦中獲得121 例詳細(xì)隨訪信息,在不考慮單個(gè)染色體的情況下,121 例孕婦中有46 例(38.02%)發(fā)生不良妊娠,主要表現(xiàn)在FGR 和PTB,發(fā)生率分別為25.62%(31/121)和20.66%(25/121),明顯高于以往報(bào)道(6.39%和7.1%)[6-7]。值得關(guān)注的是,我們發(fā)現(xiàn)不良妊娠的發(fā)生率在不同染色體之間存在差異,例如在1、2、3、6、15、16、22 號(hào)染色體上較高(≥50%),而5、14、17 號(hào)染色體沒(méi)有發(fā)生。其次,16 號(hào)染色體的病例數(shù)較多且不良妊娠特征較為明顯,發(fā)生率高達(dá)89.5%(17/19),19例孕婦中9 例(47.4%)出現(xiàn)早產(chǎn),12 例(63.2%)出現(xiàn)FGR,見(jiàn)表2、3。

        表2 121 例RATs 高風(fēng)險(xiǎn)孕婦的妊娠結(jié)局Tab.2 Pregnancy outcomes of 121 pregnant women at high risk of RATs 例

        表3 孕婦的妊娠結(jié)局在不同染色體上的分布Tab.3 Distribution of pregnant women's pregnancy outcomes on different chromosomes 例

        3 討論

        與傳統(tǒng)的血清學(xué)篩查相比,NIPT 以其無(wú)創(chuàng)性、高準(zhǔn)確性和妊娠范圍廣等優(yōu)勢(shì)快速成為一種常見(jiàn)的產(chǎn)前篩查方式[8],對(duì)21、18 和13 號(hào)染色體非整倍體的篩查具有較高的敏感性和特異性[9-10],然而針對(duì)RATs 的數(shù)據(jù)量很少,臨床處理需要更多的數(shù)據(jù)支持。VAN 等[11]發(fā)現(xiàn)RATs 作為一個(gè)群體比T13 更常見(jiàn),幾乎和T18 一樣常見(jiàn),但是NIPT 檢測(cè)RATs 的準(zhǔn)確性以及RATs 高風(fēng)險(xiǎn)與不良妊娠結(jié)局的相關(guān)性具有不明確性[12],孕婦需要在侵入性產(chǎn)前診斷的已知風(fēng)險(xiǎn)和妊娠結(jié)局的未知影響之間進(jìn)行權(quán)衡,導(dǎo)致遺傳咨詢充滿挑戰(zhàn)。因此,我們對(duì)此類(lèi)數(shù)據(jù)進(jìn)行研究,有助于改善妊娠管理。

        本研究發(fā)現(xiàn),NIPT 樣本中RATs 的頻率為0.21%,最常見(jiàn)是T7、T8、T16 和T20,這與BENNP等[13]的觀察相似,PPV 分別為3.13%、0.00%、12.5%和0.00%,總PPV 僅為5.15%。PPV 較低的原因:(1)染色體異常僅發(fā)生在胎盤(pán)而不發(fā)生在胎兒,稱(chēng)為CPM[14]。在細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中,由于有絲分裂或者減數(shù)分裂發(fā)生錯(cuò)誤導(dǎo)致合子形成染色體三體,這在懷孕早期是致命的,只有合子發(fā)生“三體挽救”形成CPM,大部分胎兒才能繼續(xù)存活[15-16]。QI 等[17-18]發(fā)現(xiàn),T7、T8 病例伴隨正常的羊膜腔穿刺術(shù)幾乎可以肯定地解釋為CPM。(2)合子發(fā)生三體挽救時(shí),3 條染色體中的每一條都有同樣的丟失機(jī)會(huì),如果剩下的兩條染色體來(lái)自同一個(gè)親本,就會(huì)產(chǎn)生UPD,UPD 不涉及染色體劑量的增加,NIPT 很難檢測(cè)到,但是6、7、11、14、15 或20 號(hào)染色體上的印記基因會(huì)產(chǎn)生不良臨床后果[19-20]。在我們的研究中發(fā)現(xiàn)了2 例UPD,1 例母源性UPD(6),尚無(wú)明確印跡疾病,孕婦選擇繼續(xù)妊娠;1 例父源性UPD(20),與假性甲狀旁腺功能減退癥相關(guān)[21],孕婦選擇引產(chǎn)。UPD 的檢出率分別為50%(1/2)和9.09%(1/11),見(jiàn)表4。由此可見(jiàn),NIPT 檢測(cè)到的RATs 很可能是假陽(yáng)性的,但是RATs 高風(fēng)險(xiǎn)導(dǎo)致患UPD 的風(fēng)險(xiǎn)增加,盡管沒(méi)有超聲異常,印跡基因的不利影響仍存在。因此,NIPT 提示6、7、11、14、15 或20 號(hào)染色體三體時(shí),建議孕婦進(jìn)行侵入性檢測(cè),另一方面,如果不涉及印跡基因,應(yīng)該謹(jǐn)慎使用侵入性手術(shù),但考慮到TFM 的存在需要增強(qiáng)超聲隨訪。

        表4 羊水細(xì)胞中UPD 的檢出率及臨床表現(xiàn)Tab.4 Detection rate of UPD in amniotic fluid cells and clinical manifestation 例

        其次,NIPT 檢測(cè)的cffDNA 來(lái)源于絨毛滋養(yǎng)層細(xì)胞,在產(chǎn)前階段,“胎兒游離DNA”被稱(chēng)為“胎盤(pán)游離DNA”或許更加準(zhǔn)確[22],cffDNA 作為一種新的生物標(biāo)志物,可以預(yù)測(cè)胎盤(pán)的健康與疾病,RATs 高風(fēng)險(xiǎn)可能與胎兒宮內(nèi)死亡、FGR 和胎兒畸形等妊娠結(jié)局相關(guān)[13,23]。在本研究中,121 例RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的孕婦中有46 例(38.02%)發(fā)生不良妊娠,但是,大部分孕婦獲得了活產(chǎn)(95.87%),不良妊娠主要體現(xiàn)在FGR(25.62%)和PTB(20.66%)。此外,在后續(xù)的妊娠管理中對(duì)于不同的染色體很可能不同,1、2、3、6、15、16 和22 號(hào)染色體的不良妊娠發(fā)生率較高(>50%),尤其是16 號(hào)染色體FGR 和PTB 顯著高于總體組。出現(xiàn)這種現(xiàn)象的主要原因是:NIPT 篩查發(fā)現(xiàn)的RATs 通常局限于胎盤(pán),根據(jù)受累組織的分布,CPM 分為CPM 1、2、3 型。由于cffDNA 來(lái)源于滋養(yǎng)層細(xì)胞,因此,只有CPM 1和3 型可以被NIPT 識(shí)別。CPM 1 型主要導(dǎo)致自然流產(chǎn)或?qū)m內(nèi)死亡,CPM 3 型容易引起FGR、PTB 等不良結(jié)局。15 和16 號(hào)染色體主要在CPM 3 型中檢測(cè)到,因此出現(xiàn)了圍產(chǎn)期高比例的不良妊娠結(jié)局,對(duì)于與RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的孕婦妊娠期間的管理應(yīng)基于具體染色體[4,15,24-25]。由此可見(jiàn),對(duì)于NIPT 篩查RATs 高風(fēng)險(xiǎn)的孕婦,盡管大部分獲得了活產(chǎn),核型和CMA 結(jié)果也可能正常,但是患FGR 和PTB 的風(fēng)險(xiǎn)增加,需要進(jìn)行連續(xù)地超聲檢查以監(jiān)測(cè)胎兒的生長(zhǎng)發(fā)育。

        我們將85 525 例數(shù)據(jù)匯集在一起,以確定在RATs 中哪些染色體最常見(jiàn),并回顧了妊娠結(jié)局,評(píng)估了受累染色體、真陽(yáng)性和UPD 的存在。本研究的優(yōu)勢(shì):(1)數(shù)據(jù)量較大,分析了RATs 在各條染色體上的差異。我們發(fā)現(xiàn)不同染色體對(duì)妊娠管理的好處是不同的,比如16 號(hào)染色體和涉及印記基因的染色體。(2)獲得了較完整的產(chǎn)婦信息包括新生兒的發(fā)育情況,以便分析RATs 與妊娠結(jié)局的相關(guān)性,目前國(guó)內(nèi)的文章因缺乏后續(xù)的隨訪或者樣本量較少而沒(méi)有這方面的研究,導(dǎo)致過(guò)度診斷,眾所周知,羊水穿刺術(shù)是存在流產(chǎn)和感染的風(fēng)險(xiǎn),我們探討了是否需要進(jìn)行這項(xiàng)檢查,幫助緩解孕婦的焦慮。本研究的局限:(1)無(wú)法獲得胎盤(pán)的遺傳學(xué)檢測(cè)。(2)個(gè)別染色體的病例數(shù)仍然較少,可能無(wú)法得出關(guān)于異常風(fēng)險(xiǎn)的結(jié)論,但是通過(guò)數(shù)據(jù)的不斷積累有助于之后的研究。

        綜上所述,NIPT 篩查RATs 的PPV 較低,應(yīng)謹(jǐn)慎使用侵入性檢測(cè),但是如果涉及印跡基因,則建議進(jìn)行侵入性手術(shù)。另一方面,RATs 高風(fēng)險(xiǎn)具有重要的臨床意義,它提示孕婦患FGR 和PTB 的風(fēng)險(xiǎn)增加,尤其是16 號(hào)染色體,需要增強(qiáng)超聲檢查以監(jiān)測(cè)胎兒的生長(zhǎng)發(fā)育。

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