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        丁酸梭菌的分離鑒定及生物學(xué)特性研究

        2023-07-13 03:26:34
        飼料研究 2023年8期

        劉 瑾 趙 華

        (天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院 天津市微生物代謝與發(fā)酵過程控制技術(shù)工程中心 天津市工業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300457)

        丁酸梭菌屬于梭菌屬,是革蘭氏陽性菌中特有的腸道益生菌,具有較高的耐受性,菌體呈直桿狀或稍彎曲,被鞭毛包圍,是一種在惡劣環(huán)境中可通過形成芽孢增強(qiáng)自身對(duì)外界環(huán)境適應(yīng)能力的菌株[1]。丁酸梭菌的芽孢抗逆性強(qiáng),能夠經(jīng)受制備過程中高溫、干燥、酸堿性的侵蝕,還具有穩(wěn)定性強(qiáng)的特性[2]。芽孢在適當(dāng)?shù)臈l件下可重新萌芽并形成細(xì)菌。在腸道中,梭菌屬與乳酸菌屬等益生菌之間互利共生,可促進(jìn)乳酸菌屬等益生菌的生長(zhǎng),達(dá)到調(diào)節(jié)動(dòng)物腸道微生態(tài)平衡的作用[3]。

        丁酸梭菌具有獨(dú)立的消化酶系統(tǒng),可分泌多種代謝產(chǎn)物,其中丁酸是其最主要的代謝產(chǎn)物之一,可作為宿主胃腸道的能量來源[4],促進(jìn)胃腸上皮組織發(fā)育并鞏固其屏障功能[5],達(dá)到促生長(zhǎng)目的[6]。丁酸梭菌能夠產(chǎn)生較高濃度和純度的丁酸,具有較好的生長(zhǎng)穩(wěn)定性以及較低的營(yíng)養(yǎng)需求等優(yōu)點(diǎn),極具開發(fā)潛力及商業(yè)價(jià)值[7]。近年來,丁酸梭菌作為益生菌被廣泛用于胃腸道疾病的臨床治療,如腸道菌群失調(diào)、藥物相關(guān)性腸炎、急性和慢性腹瀉、腸道應(yīng)激綜合征和便秘等,具有極強(qiáng)的腸道整理作用,對(duì)維持腸道正常生態(tài)有益;與其他益生菌制劑相比,丁酸梭菌的生長(zhǎng)速度快、抗應(yīng)激能力強(qiáng)、可以在腸道內(nèi)持續(xù)定植,能夠產(chǎn)生有機(jī)酸和丁酸梭菌肽[8-11]。丁酸梭菌發(fā)酵產(chǎn)生的分泌物可調(diào)節(jié)體內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)和組成,改善動(dòng)物機(jī)體內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài),促進(jìn)家畜生長(zhǎng)[12]。丁酸梭菌及其代謝產(chǎn)物具有提高動(dòng)物抗氧化能力、緩解炎癥、調(diào)節(jié)腸道免疫和屏障功能等作用[13-14]。這些特性使丁酸梭菌在食品、發(fā)酵工業(yè)、飼料、醫(yī)學(xué)醫(yī)藥等多個(gè)重要領(lǐng)域中具有得天獨(dú)厚的優(yōu)勢(shì)[15-17]。

        本研究從濃香型白酒窖泥中篩選丁酸梭菌,并對(duì)其進(jìn)行生理生化試驗(yàn)鑒定,采用氣相色譜法對(duì)其產(chǎn)酸量進(jìn)行檢測(cè),為丁酸梭菌在畜禽生產(chǎn)中的應(yīng)用提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        窖泥樣品采自中國(guó)安徽文王酒業(yè)有限公司。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 窖泥懸浮液的制備

        稱取窖泥樣品3.0 g,加入盛有80 mL RCM培養(yǎng)基和20 個(gè)無菌玻璃珠(φ=3 mm) 的螺口瓶中,37 ℃、220 r/min 振蕩30 min,得窖泥懸浮液。將獲得的窖泥懸浮液置于80 ℃下加熱10 min,殺死營(yíng)養(yǎng)體細(xì)胞,獲得僅含孢子的滅活窖泥懸浮液。

        1.2.2 丁酸梭菌的篩選

        將10%滅活窖泥懸浮液接種于300 mL RCM 培養(yǎng)基中,平行3 組。搖勻后,封口膜隔絕氧氣,置于37 ℃厭氧培養(yǎng)箱中培養(yǎng)10 d,觀察螺口瓶?jī)?nèi)產(chǎn)氣情況,選用產(chǎn)氣多的螺口瓶吸取5.0 mL加入裝有RCM培養(yǎng)基的螺口瓶?jī)?nèi),重復(fù)上述步驟,富集培養(yǎng)4~5 次。吸取富集培養(yǎng)菌液100 μL涂布,封口膜隔絕氧氣,放入?yún)捬醮校?5 ℃恒溫培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)3 d。挑取單菌落三區(qū)劃線重復(fù)此步驟2~3 次,得到純化單菌落。顯微鏡下觀察菌體,將篩選出的細(xì)菌在4 ℃下保存。

        1.2.3 篩選菌株的鑒定

        1.2.3.1 菌落形態(tài)學(xué)觀察

        點(diǎn)接單菌落于RCM 固體培養(yǎng)基上,37 ℃倒置培養(yǎng)3 d,觀察記錄初篩菌的菌落形態(tài)、顏色、透明程度、光澤、大小等,分離純化后的菌株進(jìn)行革蘭氏染色。

        1.2.3.2 生理生化鑒定

        參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》和《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》中的方法對(duì)疑似菌株進(jìn)行相關(guān)生理生化鑒定。

        1.2.3.3 16S rDNA序列分析

        (1)脫氧核糖核酸(DNA)提取。

        將獲得的單菌接入RCM 液體培養(yǎng)基內(nèi)進(jìn)行厭氧培養(yǎng),培養(yǎng)3 d得到新鮮培養(yǎng)液,8 000 r/min離心10 min收集菌體,使用1 mL RCM培養(yǎng)基重懸。

        (2)PCR擴(kuò)增。

        利用PCR 擴(kuò)增得到目的16S rDNA,將得到驗(yàn)證的PCR 產(chǎn)物送至金唯智生物科技有限公司測(cè)序,選定目的菌株。引物為細(xì)菌通用引物,序列為27F(5'-AGAGTTT GATCCTGGCTCAG-3')、1492R(5'-ACGGTTACCTTG TTACGACTT-3')。

        PCR 擴(kuò)增體系:2×Es Taq MasterMix 12.5 μL、27F 1 μL、1492R 1 μL、菌株培養(yǎng)液1 μL,加入ddH2O補(bǔ)至總體系25 μL。

        PCR 反應(yīng)參數(shù):94 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1.5 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸2 min。

        取擴(kuò)增好的PCR產(chǎn)物3 μL,用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,剩余PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物于4 ℃冰箱內(nèi)保存。若電泳驗(yàn)證獲得較好的PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,則將剩余PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物送至蘇州金維智生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序分析,并通過NCBI 中的BLAST 數(shù)據(jù)庫對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì),選擇相似性較高的模式菌株序列。

        1.2.4 測(cè)定篩選菌株生物學(xué)性能

        1.2.4.1 菌株產(chǎn)酸量的測(cè)定

        (1)酸類物質(zhì)的定性檢測(cè)。

        分別吸取乙酸、丁酸、己酸標(biāo)準(zhǔn)品1 mL于氣相色譜瓶?jī)?nèi)進(jìn)行檢測(cè),氣相色譜分析條件見表1,獲得單獨(dú)短鏈脂肪酸(SCFAs)出峰保留時(shí)間。氣相色譜儀的配備為氫離子火焰檢測(cè)器(FID)、DB-FFAP(30 m×320 μm×0.5 μm)色譜柱。

        表1 氣相色譜分析條件

        (2)酸類物質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)曲線建立。

        SCFAs 標(biāo)準(zhǔn)溶液質(zhì)量濃度見表2,根據(jù)表2 配制SCFAs 的混合標(biāo)準(zhǔn)液,分別吸取酸類混合標(biāo)準(zhǔn)溶液1 mL,使用0.22 μm的有機(jī)相濾膜機(jī)型過濾,將溶液過濾至氣相色譜瓶?jī)?nèi),按照表1方法進(jìn)行檢測(cè),獲得3種酸的氣相分析結(jié)果,以峰面積Y為縱坐標(biāo),質(zhì)量濃度(g/L)X為橫坐標(biāo)進(jìn)行線性回歸,得到混合酸的各標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        表2 SCFAs標(biāo)準(zhǔn)溶液質(zhì)量濃度 單位:g/L

        (3)分析方法的精密度分析。

        取表2內(nèi)濃度等級(jí)1的混合標(biāo)準(zhǔn)溶液,按照表1的氣相分析條件連續(xù)進(jìn)樣6 次,每次進(jìn)樣結(jié)束后為樣品換上未使用的氣相色譜瓶的螺口蓋,最終結(jié)果選擇以丁酸的峰面積作為酸的代表計(jì)算相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)用于表示分析測(cè)試結(jié)果的精密度。

        式中:X為單次進(jìn)樣峰面積,μ為6次進(jìn)樣峰面積平均值,n為6次試驗(yàn)。

        (4)培養(yǎng)液的前處理。

        將篩選獲得的2 株單菌接種于RCM 固體培養(yǎng)基上,厭氧袋內(nèi)37 ℃培養(yǎng)3 d。使用接種環(huán)挑取少許菌落接種于300 mL RCM液體培養(yǎng)基內(nèi),培養(yǎng)6 d。

        取菌體培養(yǎng)液1 mL,加入2%稀硫酸溶液,混勻,調(diào)節(jié)pH值為2,充分混勻完全酸化。用1 mL色譜純二氯甲烷1∶1 進(jìn)行萃取,萃取液用0.22 μm 濾膜過濾作為待測(cè)樣品。

        (5)氣相色譜分析培養(yǎng)液的酸類物質(zhì)。

        將單菌的培養(yǎng)液樣品前處理后,按照表1 進(jìn)行氣相色譜分析,利用混合酸類物質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)曲線定量得到2 株單菌的產(chǎn)酸種類以及產(chǎn)量。

        1.2.4.2 篩選菌株活菌數(shù)的測(cè)定

        篩選菌株培養(yǎng)6 d 后測(cè)定其發(fā)酵液生物量OD600nm值判斷發(fā)酵液中菌株活菌數(shù),3個(gè)平行,重復(fù)3次。

        1.2.4.3 篩選菌株芽孢率的測(cè)定

        將培養(yǎng)6 d的培養(yǎng)液80 ℃水浴10 min稀釋涂布于LB培養(yǎng)基,重復(fù)3次,計(jì)算芽孢率。

        1.2.4.4 篩選菌株淀粉酶活性的測(cè)定

        各取相同OD600nm值的1 mL發(fā)酵液滴加到淀粉瓊脂平板指定位置,厭氧培養(yǎng)72 h,在表面覆蓋一層碘液,觀察并測(cè)定透明圈的直徑。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 窖泥菌的篩選

        利用RCM培養(yǎng)基從窖泥中共分離出15株菌落形態(tài)存在差異的單菌落,通過繼續(xù)培養(yǎng)篩選出2 株菌,其生長(zhǎng)發(fā)育較為穩(wěn)定,不易變性,命名為菌株J-1和菌株J-2。

        2.2 篩選菌株的鑒定

        2.2.1 菌落形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果

        將分離得到的菌株J-1、菌株J-2在RCM培養(yǎng)基厭氧培養(yǎng)5~7 d觀察其菌落形態(tài),對(duì)單菌落進(jìn)行革蘭氏染色并使用油鏡觀察,結(jié)果見圖1。

        圖1 菌落形態(tài)及革蘭氏染色結(jié)果(100×油鏡)

        由圖1(a)、圖1(c)可知,菌株J-1分離后的菌落形態(tài)在RCM 平板培養(yǎng)基上皆呈現(xiàn)菌落大,白色不透明,中間深四周淺,菌落中心微微凸起,表面粗糙、扁平、不規(guī)則。

        由圖1(b)、圖1(d)可知,菌株J-2為革蘭氏陽性菌,菌體呈現(xiàn)長(zhǎng)棒狀。

        2.2.2 生理生化鑒定結(jié)果

        對(duì)分離株進(jìn)行單糖分解試驗(yàn)、H2S試驗(yàn)、明膠液化試驗(yàn)、吲哚試驗(yàn)、MR試驗(yàn)、V-P試驗(yàn)、硝酸鹽還原試驗(yàn)等生理生化試驗(yàn),結(jié)果見表3。根據(jù)《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌手冊(cè)》可初步判斷菌株J-1、菌株J-2均為丁酸梭菌。

        表3 菌株生理生化鑒定結(jié)果

        2.2.3 分子生物學(xué)鑒定結(jié)果

        將分離得到的菌株J-1、菌株J-2 在35 ℃的RCM 液體培養(yǎng)基內(nèi)培養(yǎng)2 d,得到新鮮菌體培養(yǎng)液,提取16S rDNA 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,將擴(kuò)增結(jié)果在0.8%的瓊脂糖凝膠電泳中進(jìn)行DNA驗(yàn)證,使用凝膠電泳成像系統(tǒng)得到的結(jié)果見圖2。

        圖2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        由圖2 可知,篩選獲得的2 株單菌PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物在1 500~2 000 bp之間均出現(xiàn)了清晰且無彌散的條帶,表明得到了較高質(zhì)量的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

        將擴(kuò)增所得的產(chǎn)物送樣進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序完成后將菌株16S rDNA全序列基因組在NCBI中的BLAST數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)。根據(jù)對(duì)比結(jié)果可知,菌株J-1 與酪丁酸梭菌(Clostridiumtyrobutyricum)序列同源性為98.41%,菌株J-2 與酪丁酸梭菌序列同源性為98.32%,均與酪丁酸梭菌具有較高的親緣性。采用MEGA-X軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,結(jié)果見圖3。

        由圖3 可知,根據(jù)NCBI 的比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育樹可知,菌株J-1、J-2 與酪丁酸梭菌有較高的親緣性,為梭狀芽孢桿菌屬(Clostridium)。

        2.3 篩選菌株生物學(xué)特性測(cè)定結(jié)果

        2.3.1 菌株產(chǎn)酸量的測(cè)定結(jié)果

        2.3.1.1 酸類物質(zhì)的定性檢測(cè)

        根據(jù)步驟可得單獨(dú)酸類物質(zhì)的氣相定性分析結(jié)果,可知乙酸、丁酸、己酸的出峰保留時(shí)間分別為5.868、7.458、9.770 min。

        混合酸的氣相分析結(jié)果見圖4。由圖4可知,氣相分析圖清晰明了,峰形對(duì)稱性高,色譜圖峰形尖銳,且無雜質(zhì)峰干擾,物質(zhì)分離單一,可準(zhǔn)確定性,氣相分析方法分離快速、操作實(shí)用以及分析周期短。

        圖4 混合酸的氣相分析結(jié)果

        混合酸的標(biāo)準(zhǔn)曲線見表4。由表4 可知,乙酸、丁酸、己酸的標(biāo)準(zhǔn)曲線在線性范圍內(nèi)具有良好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù)均大于0.999,表明該氣相分析方法具有可靠性。

        表4 混合酸的標(biāo)準(zhǔn)曲線

        根據(jù)連續(xù)進(jìn)樣濃度等級(jí)1的混合標(biāo)準(zhǔn)溶液6次得到丁酸的色譜峰面積計(jì)算RSD,見表5。

        根據(jù)RSD 計(jì)算公式可得,6 次連續(xù)進(jìn)樣,以丁酸為代表獲得RSD為0.185%。結(jié)果表明該氣相色譜分析方法精密度優(yōu)良。

        2.3.1.2 菌株培養(yǎng)液中的酸種類及含量對(duì)比

        將培養(yǎng)6 d的培養(yǎng)液通過前處理,并使用氣相進(jìn)行定性及定量分析,菌株產(chǎn)酸種類及產(chǎn)量見表6。

        2.3.2 菌株生物學(xué)性能比較(見表7)

        表7 菌株生物學(xué)性能比較

        由表7可知,兩株菌的生物量無明顯差異,菌株J-1的生孢率比菌株J-2高17.16%,菌株J-1產(chǎn)生的淀粉酶活性高于菌株J-2。益生菌在腸道內(nèi)產(chǎn)生的淀粉酶可將碳水化合物降解為低聚糖,促進(jìn)益生菌對(duì)碳源的利用。研究表明,菌株J-1生物學(xué)性能最優(yōu)。

        3 討論

        3.1 丁酸梭菌的分離、鑒定分析

        丁酸可降低環(huán)境的pH值,改變菌群的生長(zhǎng)環(huán)境,影響其他菌群的生長(zhǎng)繁殖,維持腸道菌群的平衡,改善腸道消化吸收功能。目前,大部分丁酸梭菌分離自人的腸道和土壤,來自白酒窖泥中的丁酸梭菌較少。白酒釀造過程中丁酸梭菌的含量以及發(fā)酵分泌物可在一定程度上影響白酒風(fēng)味,將其應(yīng)用于飼料中不僅具備良好的整腸作用,還能夠起到一定的風(fēng)味調(diào)整作用,增強(qiáng)飼料的益生價(jià)值[18-20]。本研究從濃香型白酒窖泥中篩選出15 株形態(tài)各異的菌株,最終選擇兩株菌株,通過生理生化鑒定和16S rRNA測(cè)序比對(duì),確定其為丁酸梭菌。系統(tǒng)發(fā)育樹分析發(fā)現(xiàn),兩株分離株與酪丁酸梭菌種屬關(guān)系最近。

        3.2 丁酸梭菌產(chǎn)酸量分析

        丁酸梭菌代謝產(chǎn)物中含有大量丁酸、乳酸等物質(zhì),這些物質(zhì)可促進(jìn)雙歧桿菌和乳酸菌等益生菌生長(zhǎng),抑制金黃色葡萄球菌、傷寒沙門桿菌、霍亂沙門桿菌等致病微生物的生長(zhǎng),在動(dòng)物腸道中發(fā)揮巨大作用[21-22]。丁酸梭菌代謝產(chǎn)生的丁酸、蛋白酶、維生素、抗菌肽物質(zhì)等物質(zhì)可提高機(jī)體的消化功能,增強(qiáng)免疫系統(tǒng),清理腸道中的有毒物質(zhì),提高腸道抗病能力[23]。本研究篩選得到的菌株J-1丁酸產(chǎn)量可達(dá)411.7 mg/L,為后續(xù)優(yōu)化發(fā)酵培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件以提高丁酸產(chǎn)量提供試驗(yàn)基礎(chǔ)。

        3.3 丁酸梭菌制劑的腸道益生性分析

        目前,丁酸梭菌制劑被廣泛應(yīng)用于畜牧業(yè)中[24]。丁酸梭菌作為飼料添加劑,具有促進(jìn)機(jī)體腸道有益菌群增殖,抑制有害菌群生長(zhǎng)繁殖的保健功能,食用添加丁酸的飼料可使畜禽獲得更高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值并提高免疫力,為腸道上皮組織細(xì)胞的再生和修復(fù)提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),改善腸道形態(tài)和結(jié)構(gòu),抑制機(jī)體炎癥反應(yīng),增強(qiáng)動(dòng)物機(jī)體免疫力以及抗氧化等生物學(xué)功能[25-26]。丁酸梭菌在生長(zhǎng)過程可形成芽孢,在最終商品化的菌劑中,活菌大多以芽孢的形式存在,而非芽孢形態(tài)的菌制劑不具備耐藥性[27]。因此,提高丁酸梭菌在發(fā)酵過程中的菌體數(shù)量以及菌體形成芽孢的條件與配方進(jìn)行一系列研究對(duì)其在飼料中應(yīng)用具有重要意義。本研究中,菌株J-1 的生孢率為77.64%,可為后續(xù)提高生孢率提供參考

        4 結(jié)論

        本研究從窖泥中篩選獲得菌株J-1、菌株J-2,經(jīng)形態(tài)學(xué)觀察、生理生化試驗(yàn)、分子生物學(xué)鑒定,確定菌株為丁酸梭菌。對(duì)兩株丁酸梭菌進(jìn)行生物學(xué)性能對(duì)比,菌株J-1在產(chǎn)酸種類及含量、活菌數(shù)、芽孢率、淀粉酶活性等方面均明顯優(yōu)于菌株J-2,可作為菌制劑儲(chǔ)備菌株。

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