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        科洛火山小椅山火山灰細(xì)菌多樣性及其與環(huán)境因子的關(guān)系

        2023-06-04 07:05:54賀雙俊楊健劉濤張爽王偉東晏磊
        關(guān)鍵詞:火山灰菌門火山

        賀雙俊,楊健,劉濤,張爽,王偉東,晏磊

        (黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院/黑龍江省寒區(qū)環(huán)境微生物與農(nóng)業(yè)廢棄物資源化利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,大慶 163319)

        火山活動(dòng)被定義為行星或衛(wèi)星周圍伴隨固體、液體或氣體釋放而產(chǎn)生的內(nèi)部熱運(yùn)動(dòng)。隨著火山地質(zhì)運(yùn)動(dòng)過(guò)程,形成了許多豐富多樣的極端山體地貌微環(huán)境,從酸性溫泉到深海以及內(nèi)陸玄武巖棲息地。由于火山環(huán)境在地球上廣泛分布,了解火山環(huán)境中微生物生命的多樣性和特征具有重要的地質(zhì)學(xué)意義?;鹕江h(huán)境可以作為模型系統(tǒng)來(lái)理解原核生物多樣性和分布特征的典型模式。這些研究提高了我們對(duì)火山巖石與板塊俯沖和碰撞相關(guān)的地質(zhì)活動(dòng)演替對(duì)地殼的生長(zhǎng)的決定作用[1-2],為深入認(rèn)識(shí)地球化學(xué)環(huán)境對(duì)地球表面和地下微生物多樣性主要影響。因此,探索火山環(huán)境的微生物多樣性有助于揭示地球上存在的早期微生物生命的潛力。近年來(lái),許多研究表明,火山噴發(fā)活動(dòng)不僅影響局部乃至全球的生態(tài)系統(tǒng)和氣候,而且由于火山灰對(duì)環(huán)境生態(tài)系統(tǒng)的影響,對(duì)環(huán)境生態(tài)系統(tǒng)能夠產(chǎn)生重要的生態(tài)環(huán)境效應(yīng)。這也有助于深入挖掘地質(zhì)歷史時(shí)期火山噴發(fā)的火山灰層中的新細(xì)菌資源[3],為了解火山環(huán)境的微生物多樣性和碳氮元素的全球循環(huán)提供重要的核心思路[4-5]。在伴隨著火山地質(zhì)活動(dòng)演替形成的山體地貌可能會(huì)因?yàn)樯锘顒?dòng)而發(fā)生不同程度顯著的變化,最近研究表明夏威夷基拉韋厄火山(KVD)沉積環(huán)境中具有豐富的細(xì)菌多樣性,而且大部分微生物多樣性多基于與環(huán)境樣品未培養(yǎng)的微生物或特定的16S rRNA基因序列特征相異的新菌群落研究密切相關(guān)。據(jù)已報(bào)道研究在與火山灰沉積物中微生物的生物礦化及參與地質(zhì)元素化學(xué)循環(huán)中原核生物群落分布的種群代謝多樣性[6-8]。另外,目前對(duì)于不同環(huán)境火山灰分離培養(yǎng)及參與風(fēng)化的細(xì)菌多樣性與環(huán)境因子的相關(guān)性關(guān)系研究發(fā)現(xiàn):日本櫻島火山火山灰中分離培養(yǎng)獲得的細(xì)菌菌群豐度與平均溫度、pH 值、環(huán)境變量呈顯著相關(guān),而只與碳吸收保持統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而且溫度越低,細(xì)菌豐度和土壤碳氮積累增加較慢[9]。

        科洛火山群坐落于黑龍江省黑河市嫩江縣小興安嶺西側(cè),作為地質(zhì)生物演化、棲息繁衍的重點(diǎn)典型區(qū)域之一。小椅山火山屬火山錐山體噴發(fā)于更新世晚期,火山錐周邊遍及各種火山灰、火山浮渣、火山石、火山彈及熔巖臺(tái)地等熔巖裸露,植被稀少,具備發(fā)育良好的微型火山地貌。小椅山火山環(huán)境生態(tài)條件惡劣,且保藏豐富的微生物資源,同時(shí)對(duì)地球物理化學(xué)循環(huán)推動(dòng)作為貢獻(xiàn)成員,對(duì)極地生態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)建和維持起到關(guān)鍵作用。因此,截至目前,國(guó)內(nèi)對(duì)小椅山火山生境微生物棲息環(huán)境變化規(guī)律和地球化學(xué)循環(huán)作用機(jī)理尚不清楚,尤其對(duì)于適應(yīng)于小椅山火山地質(zhì)環(huán)境自然生態(tài)微生物多樣性與火山環(huán)境內(nèi)部有機(jī)質(zhì)、碳、氮、磷及鐵、硫等環(huán)境元素共同組成的相互關(guān)系尚無(wú)定論。研究為全面深入科洛火山群—小椅山火山灰中對(duì)地球化學(xué)循環(huán)、生物礦化、巖石風(fēng)化等作用的地質(zhì)微生物資源庫(kù)提供科學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 主要試劑儀器

        主要試劑:總鐵測(cè)定試劑盒(廣東環(huán)凱微生物科技有限公司,中國(guó));細(xì)菌引物338F 和806R(上海英駿生物技術(shù)有限公司,中國(guó));dNTP Mix(10 mM),Phusion HF MM(M0541L),Phusion(BioLabs,美國(guó));VAHTSTMDNA Clean Beads(南京諾唯贊生物科技有限公司,中國(guó));MinElute PCR Purification Kit(QIAGEN,德國(guó));瓊脂糖(BIOWEST,西班牙);去離子水(天根生化科技北京有限公司,中國(guó));無(wú)水乙醇(500 mL)(北京化工廠,中國(guó))。

        主要儀器:pH 計(jì)(PHB-4 型,上海儀電科學(xué)儀器股份有限公司,中國(guó)),總有機(jī)碳(TOC)用HT1300 干法測(cè)定;總有機(jī)碳碳氮元素分析儀(multi N/C 2100型,耶拿,德國(guó));分光光度計(jì)(A003 型,上海菁華科技儀器有限公司,中國(guó));Nanodrop(2000 型,賽默飛世爾科技有限公司,中國(guó));PCR 儀(2720 型,Applied Biosystems,美國(guó));微型離心機(jī)(1795 型,天根生化科技有限公司,中國(guó));高通量測(cè)序儀(HiSeq2500,Illumina,美國(guó))。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 樣品采集

        小椅山位于中國(guó)黑龍江省黑河市嫩江科洛斷陷盆地中心區(qū)域(125°99′E,49°31′N),研究于2018 年10 月(秋季)對(duì)科洛火山群小椅山火山灰進(jìn)行采樣。在火山口頂部、中部、底部3 個(gè)位點(diǎn)分別采集0~5 cm深度范圍內(nèi)的火山灰,按照1∶1∶1 比例混合,得到小椅山火山灰混合樣品,記為XYS1,XYS2,XYS3 三個(gè)樣品重復(fù),并迅速裝入滅菌袋,低溫運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室,分別4 ℃和-20 ℃低溫保存?zhèn)溆?,一部分為后續(xù)理化分析,另一部分為高通量測(cè)序分析做準(zhǔn)備。如圖1 所示即小椅山火山灰采樣區(qū)域概況圖。

        圖1 小椅山火山灰采樣區(qū)域概況圖Fig.1 Overview of volcanic ash sampling area in Xiaoyishan

        1.2.2 環(huán)境因子測(cè)定

        實(shí)驗(yàn)以2.5∶1 水樣比作為操作標(biāo)準(zhǔn)收集濾液上清液,火山灰樣品pH 采用PHB-4 型帶玻璃電極的數(shù)字pH 計(jì)測(cè)定?;鹕交覙悠房傆袡C(jī)碳(TOC)采用碳氮元素分析儀測(cè)定(multi N/C 2100 型,耶拿,德國(guó)),硝態(tài)氮(NO3-N)利用過(guò)硫酸鉀消解—紫外分光光度法測(cè)定,總鐵(TI)通過(guò)總鐵試劑盒測(cè)定。

        1.2.3 細(xì)菌多樣性分析

        采用MOBIO Power SoilRDNA 提取試劑盒(MOBIO Lab,CA,USA),提取小椅山火山灰樣品總DNA,以一對(duì)通用的細(xì)菌引物338F(5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3′) 和806R (5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)用來(lái)擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA基因的V3+V4 可變區(qū)域;采用20 μL 反應(yīng)體系:ddH2O 13.25 μL,10xPCR Ex Taq Buffer 2.0 μL,DNA template(100 ng·mL-1)0.5 μL,primel(10 mmol·L-1)10 μL,prime2(10 mmol·L-1)1.0 μL,dNTP Mix(10 mmol·L-1)2.0 μL,Ex Taq DNA polymerase(5 U·mL-1)0.25 μL。PCR 擴(kuò)增的條件為:95 ℃預(yù)變性5 min,然后95 ℃變性30 s、58 ℃退火20 s、72 ℃延伸6 s,共30 個(gè)循環(huán),最后再72 ℃退火7 min,擴(kuò)增產(chǎn)物保持在4 ℃條件下。合格的基因組樣品在北京百邁客生物科技有限公司進(jìn)行高通量測(cè)序。

        建庫(kù)測(cè)序:提取樣品總DNA 后,根據(jù)保守區(qū)設(shè)計(jì)得到引物,在引物末端加上測(cè)序接頭,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增并對(duì)其產(chǎn)物進(jìn)行純化、定量和均一化形成測(cè)序文庫(kù),建好的文庫(kù)先進(jìn)行文庫(kù)質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的文庫(kù)基于Illumina Novaseq 6000 測(cè)序平臺(tái)得到的原始圖像數(shù)據(jù)文件,經(jīng)堿基識(shí)別(Base Calling)分析轉(zhuǎn)化為原始測(cè)序序列(Sequenced Reads),結(jié)果以FASTQ(簡(jiǎn)稱為fq)文件格式存儲(chǔ),其中包含測(cè)序序列(Reads)的序列信息以及其對(duì)應(yīng)的測(cè)序質(zhì)量信息。采用Trimmomatic v0.33 軟件對(duì)原始測(cè)序序列進(jìn)行質(zhì)控,對(duì)低質(zhì)量Raw reads 過(guò)濾,然后對(duì)小椅山火山灰三個(gè)重復(fù)樣品測(cè)序共獲得229 877 對(duì)Raw Reads 進(jìn)行過(guò)濾質(zhì)控;使用cutadapt(v1.9.1)軟件進(jìn)行引物序列的識(shí)別與去除,采用FLASH(v1.2.7)軟件和overlap 進(jìn)行高質(zhì)量Reads 拼接,均產(chǎn)生58643 條Clean Reads 拼接序列;使用UCHIME v4.2 軟件去除嵌合體,鑒定得到高質(zhì)量序列(Effective Reads);最后進(jìn)行聚類/去噪,劃分OTUs/ASVs(后面統(tǒng)一稱之為Feature),并根據(jù)Feature 的序列組成得到其物種分類。基于特征(Feature)分析結(jié)果,進(jìn)一步對(duì)樣品在各個(gè)分類水平上進(jìn)行α 多樣性分析(Alpha Diversity),β 多樣性分析(Beta Diversity),顯著物種差異分析,相關(guān)性分析,功能預(yù)測(cè)分析等等,可以挖掘樣品之間的差異。

        1.2.4 細(xì)菌多樣性同環(huán)境因子的關(guān)系

        運(yùn)用CANOCO 5.0 軟件(http://canoco5.com/)對(duì)環(huán)境因子,微生物豐度變化和環(huán)境因子之間進(jìn)行冗余分析(redundancy analysis,RDA),運(yùn)用Pastv2.16軟件(http://folk.uio.no/ohammner/pastD)對(duì)群落與環(huán)境因子間的相關(guān)系數(shù)進(jìn)行分析。RDA 模型的選擇原則:先用species-sample 數(shù)據(jù)(97%相似性的樣品OTU表)做PCA 分析,看分析結(jié)果中Lengths of gradient的第一軸的大小,如果在3.0~4.0 之間,選RDA 和CCA 均可,如果小于3.0,RDA 的結(jié)果要好于CCA。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 小椅山火山灰環(huán)境因子

        小椅山火山灰的pH,TOC,TI,NO3-N 環(huán)境因子的測(cè)定結(jié)果:pH 為7.31,呈中性,其TOC 含量為7.32%,NO3-N 含量為21.356 μg·g-1,TI 含量為1.875 mg·g-1。利用Canoco5.0 對(duì)species-sample 數(shù)據(jù)(97%相似性的樣品OTU 表)做DCA 分析,得到的第一軸的大小為2,故選擇RDA 模型。再利用Canoco5.0 對(duì)不同的環(huán)境因子進(jìn)行RDA 分析(圖2),篩選主要對(duì)小椅山火山灰有影響的環(huán)境因子,研究小椅山火山灰的不同環(huán)境因子之間的相關(guān)性。RDA 前兩軸的累積貢獻(xiàn)率為100%,其中第一主軸為96.84%(表1),已超過(guò)50%,包含大部分信息,故將其作為主分量軸,且主要是由第一主軸決定。從環(huán)境因子箭頭與排序軸的夾角可以看出:火山灰中TOC、TI 和NO3-N 構(gòu)成了RDA 的第一排序軸,TOC、TI 和NO3-N 與排序軸呈正相關(guān);pH 構(gòu)成了第二排序軸。從環(huán)境因子之間的相關(guān)性來(lái)看,TI、NO3-N、TOC 相互之間均呈現(xiàn)正相關(guān);pH 與TI、NO3-N、TOC 呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)。

        表1 環(huán)境因子與小椅山火山灰細(xì)菌群落組成的相關(guān)系數(shù)分析Table 1 Correlation coefficient analysis between environmental factors and composition of bacterial communities in tephra of Xiaoyishan

        表2 小椅山火山灰中細(xì)菌Alpha 多樣性Table 2 The alpha diversity of bacteria in Xiaoyishan volcano tephra in the koluo-volcano region

        圖2 火山灰中不同環(huán)境因子之間的RDA 分析Fig.2 RDA analysis of different environmental factors in tephra

        2.2 小椅山火山灰細(xì)菌多樣性分析

        2.2.1 Alpha 多樣性指數(shù)

        通過(guò)Alpha 多樣性分析可以反映樣品內(nèi)的微生物群落的豐富度和多樣性。常用的度量指數(shù)主要包括Chao1 指數(shù)體現(xiàn)群落豐富度,以及Shannon 指數(shù)和Simpson 指數(shù)均體現(xiàn)群落均勻度情況。小椅山火山灰細(xì)菌多樣性測(cè)序共獲得61 338 條序列,這些序列根據(jù)97%的相似性標(biāo)準(zhǔn)可劃分為2 182 個(gè)操作分類單位(OTU),小椅山火山灰細(xì)菌的Shannon 指數(shù)為9.202 9,Simpson 指數(shù)為0.989 4,Chao l 指數(shù)為2 182。其中Shannon 指數(shù)越高,表明群落多樣性越高;Chao 1 指數(shù)越大,表明群落的豐富度越高。圖3 為小椅山火山灰細(xì)菌16S rRNA 基因高通量測(cè)序稀釋曲線圖,從圖3 可看出,曲線逐漸趨于平緩,其測(cè)序程度已經(jīng)覆蓋到小椅山火山灰樣品的所有物種,可以基本反映樣品測(cè)序的真實(shí)情況。

        圖3 小椅山火山灰細(xì)菌的16S rRNA 基因高通量測(cè)序稀釋曲線Fig.3 The dilution curve of 16s rRNA gene of bacteria form Xiaoyishan volcanic ash based on high throughput sequencing

        2.2.2 小椅山火山灰細(xì)菌組成

        小椅山火山灰中細(xì)菌的群落組成和優(yōu)勢(shì)群落如圖4 反映了門水平和屬水平上的系統(tǒng)發(fā)育分類學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。結(jié)果表明,小椅山火山灰細(xì)菌共獲得53 003 條序列,999 個(gè)OTU 分布,其中在門水平上,涵蓋了Proteobacteria(25.151%),Actinobacteria(22.042%),F(xiàn)irmicutes(17.088%),Bacteroidetes(8.369%),Acidobacteria(7.054%),Gemmatimmonadetes(5.173%),Others(5.065%),Chloroflesi(3.509%),Verrucomicrobia(3.383%),Patescibacteria(1.998%)等32 個(gè)菌門。在屬水平上,Lactobacillus(8.394%)屬于厚壁菌門,Gemmatimonas(2.287%)屬于芽單胞菌門,其他細(xì)菌類群Others(72.112%),Uncultured bacterium 未鑒定的細(xì)菌(17.207%)可能是新的細(xì)菌類群,它們的分類 地位未能確定,待繼續(xù)進(jìn)一步研究。

        圖4 小椅山火山灰中細(xì)菌在門和屬水平上的群落組成(a:門水平;b:屬水平)Fig.4 The community composition of bacteria in the tephra of Xiaoyishan(a:phylum level,b:genus level)

        2.3 小椅山火山灰細(xì)菌多樣性同環(huán)境因子的關(guān)系

        小椅山火山灰細(xì)菌多樣性同環(huán)境因子的關(guān)系經(jīng)由RDA 分析結(jié)果如圖5 所示。由圖可知,從射線長(zhǎng)度方面,4 個(gè)影響因子的射線長(zhǎng)度相差較小。從射線與射線的夾角大小方面:Actinobacteria 與TOC、NO3-N 和TI 的夾角最小,即TOC、NO3-N 和TI 對(duì)Actinobacteria 的影響顯著;Acidobacteria、Proteobacteria及Gemmatimmonadetes 與TOC、NO3-N 和TI 的夾角相對(duì)較小,即TOC、NO3-N 和TI 對(duì)Acidobacteria、Proteobacteria 及Gemmatimmonadetes 的影響顯著。Bacteroidetes 與pH 的夾角相對(duì)偏小,即pH 對(duì)Bacteroidetes 的影響顯著。綜上,小椅山火山灰中不同菌屬對(duì)環(huán)境因子的響應(yīng)存在著較大差異。

        圖5 火山灰細(xì)菌多樣性同環(huán)境因子的RDA 分析Fig.5 RDA analysis of bacterial diversity in tephra with environmental factors

        3 討論

        科洛火山位于大興安嶺山地與松嫩平原的過(guò)渡地帶,五大連池火山群以北,屬小興安嶺西段余脈,火山面積約350 平方公里。其中小椅山火山地理位置特殊,作為科洛火山群中保存完整火山錐并有火山口?;鹕藉F附近有火山灰、火山浮石、火山彈和熔巖臺(tái)地,其東南60 公里為五大連池火山群,地處東北寒區(qū)地帶,這導(dǎo)致火山環(huán)境極端特殊,通過(guò)對(duì)理化因子的測(cè)定結(jié)果發(fā)現(xiàn)該火山灰中大部分環(huán)境因子參數(shù)TOC、NO3-N、TI 作為優(yōu)勢(shì)菌門,Proteobacteria 變形菌門(25.151%),Actinobacteria 放線菌門(22.042%),F(xiàn)irmicutes 厚壁菌門(17.088%),Acidobacteria 酸桿菌門(7.054%)的生長(zhǎng)提供充足的能量來(lái)源,這與實(shí)驗(yàn)室前期對(duì)科洛火山小孤山細(xì)菌與TOC、NO3-N 環(huán)境因子相關(guān)性結(jié)果相類似[7]。小椅山火山屬溢流式噴發(fā)自中—晚更新世以來(lái),區(qū)內(nèi)火山活動(dòng)逐漸活躍,該時(shí)期的火山活動(dòng)仍受NE 向基底斷裂控制,而且火山均由堿玄質(zhì)火山渣錐和熔巖流組成,山體結(jié)構(gòu)完整,小椅山火山錐的主體是由紅色火山渣與黑色火山渣構(gòu)成,其黑紅色火山渣主體界線顏色差異反映出火山環(huán)境鐵離子的不同氧化價(jià)態(tài),以此說(shuō)明此火山TI 環(huán)境因子影響顯著[8]??偺?、銨態(tài)氮環(huán)境因子相關(guān)性影響顯著以及pH 中性,不過(guò),也受一些人為因素影響如旅游、人工種植、人為取石開(kāi)采等的影響;自然界中鐵循環(huán)與碳氮循環(huán)有著緊密聯(lián)系,部分碳氮鐵循環(huán)過(guò)程中還存在著偶合反應(yīng),這與在RDA 分析中,NO3-N、TOC 與TI 互為正相關(guān)的結(jié)果相對(duì)應(yīng)[6]。

        目前研究對(duì)科洛火山環(huán)境樣品是通過(guò)結(jié)合高通量測(cè)序的方法進(jìn)行研究,可知火山灰細(xì)菌主要分布在變形菌門Proteobacteria、放線菌門Actinobacteria、厚壁菌門Firmicutes、擬桿菌門Bacteroidetes、酸桿菌門Acidobacteria、芽單胞菌門Gemmatimonadetes、疣微菌門Verrucomicrobia、綠彎菌門Chloroflexi 等?;趯偎椒治?,Lactobacillus是小椅山火山灰細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌群,通常存在含鹽堿地根際土壤生境中生存。小椅山火山灰細(xì)菌還包括Gemmatimonas,它們屬于芽單胞菌門,芽孢桿菌科,被認(rèn)為主要是好氧或兼性厭氧的異養(yǎng)菌,對(duì)可利用的TOC 有較快的應(yīng)激。另外,火山灰環(huán)境中的微生物在氮素循環(huán)不同環(huán)節(jié)中的作用能夠利用銨態(tài)氮經(jīng)微生物活動(dòng)如:硝化細(xì)菌的硝化作用將其生物氧化轉(zhuǎn)變成為硝態(tài)氮供給自身營(yíng)養(yǎng)補(bǔ)充;而且許多來(lái)源于變形桿菌門的生絲微菌科多為低碳和化學(xué)異養(yǎng)菌,這些生物能夠利用硝態(tài)氮作為氮源與低能度碳源情況下才能正常生長(zhǎng),其不能在營(yíng)養(yǎng)豐富的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。其中,在門水平上火山灰優(yōu)勢(shì)細(xì)菌群落與土壤化學(xué)性質(zhì)的RDA 相關(guān)性結(jié)果(圖5):絕大多數(shù)優(yōu)勢(shì)菌門都與土壤化學(xué)因子有特定的相關(guān)性關(guān)系。Gemmatimonadetes(芽單胞菌門)與土壤pH 呈顯著正相關(guān)關(guān)系,Proteobacteria(變形菌門)與土壤全氮呈顯著正相關(guān)關(guān)系。故此結(jié)果與研究學(xué)者[10-16]對(duì)土壤細(xì)菌群落的環(huán)境因子相關(guān)性影響結(jié)果類似。因此Proteobacteria 與TOC 呈顯著正相關(guān)關(guān)系;Bacteroidetes 與土壤全氮呈顯著正相關(guān)關(guān)系,以此說(shuō)明土壤全氮可能是影響Proteobacteria 和Bactemidetes 豐度的重要影響因子,這與貴州黃壤中細(xì)菌群落組成與環(huán)境因子的顯著性關(guān)系結(jié)果相類似[17]。火山灰噴發(fā)時(shí)代年齡差異不僅是微生物群落組成的主要因素也與其他因素,如空間異質(zhì)性、有機(jī)碳含量、外源降雨和風(fēng)等氣候外界因素共同影響微生物多樣性和群落分布動(dòng)態(tài)。

        小椅山火山灰樣品微生物多樣性與外部環(huán)境因子RDA 分析(圖5),分析結(jié)果表明火山灰中不同菌屬對(duì)環(huán)境因子的響應(yīng)也存在著較大差異,其中TOC、NO3-N、TI 與大多數(shù)菌屬均呈正相關(guān),為研究小椅山火山灰細(xì)菌群落多樣性重要環(huán)境因素影響,這可以解釋為硝態(tài)氮在環(huán)境因子里是具有代表性的元素之一,為優(yōu)勢(shì)菌門生長(zhǎng)提供能量來(lái)源,所以是影響火山灰細(xì)菌多樣性的重要環(huán)境因素。另外除去環(huán)境的外部因素,還有其他微生物之間的相互作用的內(nèi)部因素[17-20],同樣也是影響微生物群落結(jié)構(gòu)的重要因素。比如,好氧微生物[21]的生命活動(dòng)對(duì)氧氣的消耗造成局部的厭氧環(huán)境,有利于環(huán)境中銨態(tài)氮的轉(zhuǎn)化至硝態(tài)氮營(yíng)養(yǎng)積累供給微生物所需;微生物對(duì)有機(jī)物的硝化作用等十分重要。

        4 結(jié)論

        通過(guò)高通量測(cè)序分析小椅山火山灰微生物多樣性,以及結(jié)合小椅山火山灰環(huán)境因子測(cè)定結(jié)果,最終得出:小椅山火山灰樣品的pH 為7.31,呈中性;TI 含量為1.875 mg·g-1,TOC 含量為7.32%,TN 含量為4.75 μg·g-1,硝態(tài)氮(NO3-N)含量為21.356 μg·g-1;火山灰環(huán)境共獲得2 182 個(gè)OTU 分布,在門水平上,主要優(yōu)勢(shì)菌門變形菌門(Proteobacteria,25.151%),放線菌門(Actinobacteria,22.042%),厚壁菌門(Firmicutes,17.088%),擬桿菌門(Bacteroidetes,8.369%),酸桿菌門(Acidobacteria,7.054%),芽單胞菌門(Gemmatimmonadetes,5.173%)等32 個(gè)細(xì)菌門類。在屬水平上,其主要優(yōu)勢(shì)菌群為L(zhǎng)actobacillus(8.394%)和Gemmatimonas(2.287%),這些優(yōu)勢(shì)菌群主要由厚壁菌門和芽單胞菌門組成;通過(guò)小椅山火山灰微生物多樣性同環(huán)境因子的關(guān)系的RDA 圖可知,TOC、NO3-N、TI 與小椅山火山灰大多數(shù)功能優(yōu)勢(shì)菌屬呈正相關(guān),故推測(cè)TOC、NO3-N、TI 是影響小椅山火山灰微生物多樣性的重要環(huán)境因素。因此,研究火山生境火山灰環(huán)境微生物多樣性及地質(zhì)化學(xué)循環(huán),對(duì)于參與地球生命活動(dòng)的地質(zhì)微生物群落多樣性同與環(huán)境因子相關(guān)性研究具有重要的指示意義。

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