靳建剛, 田再芳, 鄭敏娜, 康佳惠
(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生態(tài)農(nóng)牧研究所,山西 朔州 037200; 2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)高寒區(qū)作物研究所,山西 大同 037008)
21 世紀(jì)以來,牧區(qū)家畜飼養(yǎng)量逐步減少,牛羊肉和奶類生產(chǎn)的重心逐漸向農(nóng)區(qū)和農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū)轉(zhuǎn)移,畜牧業(yè)的這一發(fā)展趨勢(shì)極大地促進(jìn)了農(nóng)區(qū)-農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū)人工草地的快速發(fā)展,人工草地的建設(shè)已成為草業(yè)發(fā)展中特別重要的組成部分[1]。近年來,隨著國家草產(chǎn)業(yè)政策的積極推進(jìn),飼用燕麥(Avena sativaL.)作為一種優(yōu)質(zhì)禾本科牧草,其建立的人工草地在黃土高原農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū)得到了較快發(fā)展,種植范圍逐步擴(kuò)大,產(chǎn)業(yè)效應(yīng)已初步顯現(xiàn)。飼用燕麥起源于地中海紅燕麥及其祖先野紅燕麥[2],是牧區(qū)和農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū)廣泛種植的一年生草料兼用作物,具有適應(yīng)性強(qiáng)、營養(yǎng)價(jià)值高、耐鹽堿等優(yōu)良特性[3],主要以燕麥青(干)草、青貯燕麥和燕麥籽實(shí)等方式被家畜利用[4],在農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū)的畜牧業(yè)生產(chǎn)和生態(tài)經(jīng)濟(jì)建設(shè)中發(fā)揮著重要作用。相對(duì)于其他禾本科牧草,飼用燕麥具有更高的產(chǎn)量和應(yīng)用前景,相應(yīng)地也需要更加合理的營養(yǎng)水平來保障其營養(yǎng)品質(zhì)和產(chǎn)量。
在現(xiàn)階段飼用燕麥人工草地的生產(chǎn)中,施肥是草地建植和田間管理中重要的管理措施之一。當(dāng)肥料(包括無機(jī)肥和有機(jī)肥)等外源物質(zhì)輸入到土壤后,會(huì)對(duì)土壤的營養(yǎng)狀態(tài)和微生物群落產(chǎn)生顯著的影響。合理施肥不僅可以改善土壤結(jié)構(gòu)[5-7],還可以豐富微生物群落和微生物活性[8],提高肥料利用率[9]。然而,在生產(chǎn)中為了追求高產(chǎn),農(nóng)戶經(jīng)常過量施用化肥,不僅嚴(yán)重污染土壤資源,影響土壤養(yǎng)分庫和微生物多樣性的可持續(xù)發(fā)展,還會(huì)威脅食品安全、影響全民健康[8]。因此,在飼草燕麥草地生產(chǎn)中,對(duì)無機(jī)肥、有機(jī)肥的施用必須找到一個(gè)平衡點(diǎn),以實(shí)現(xiàn)干旱半干旱區(qū)飼用燕麥人工草地土壤生態(tài)系統(tǒng)的可持續(xù)發(fā)展。
目前,國內(nèi)燕麥主產(chǎn)區(qū)關(guān)于無機(jī)-有機(jī)肥配施對(duì)土壤理化性狀影響的研究較多,但對(duì)燕麥根際土壤微生物群落的研究較少。因此,為研究晉北生態(tài)區(qū)不同施肥措施對(duì)燕麥根際微生物多樣性的影響,以不同施肥處理下飼用燕麥的根際土壤微生物為研究對(duì)象,采用高通量測(cè)序技術(shù),探討不同施肥處理下燕麥根際土壤細(xì)菌群落的多樣性及其結(jié)構(gòu)組成,并結(jié)合土壤養(yǎng)分狀況和飼用燕麥植株的生物產(chǎn)量,擬優(yōu)選出最佳施肥模式,為晉北地區(qū)燕麥飼草的種植和提質(zhì)增效提供參考。
試驗(yàn)于2021年在山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生態(tài)農(nóng)牧研究所的野外試驗(yàn)基地(39°33′—41°14′N、113°14′—114°44′E)進(jìn)行。試驗(yàn)地是典型的北方農(nóng)牧交錯(cuò)區(qū),海拔1 350 m,屬大陸性季風(fēng)氣候,農(nóng)業(yè)區(qū)劃為中溫帶干旱區(qū)。試驗(yàn)地耕層土壤(0—20 cm)容重1.48~1.53 g·cm-3,pH 8.46,土壤有機(jī)質(zhì)含量14.61 g·kg-1。
選用飼用燕麥品種‘甜燕麥’為試驗(yàn)材料,由國家燕麥產(chǎn)業(yè)體系大同試驗(yàn)站提供。試驗(yàn)所用肥料包括常規(guī)商用化肥和自制有機(jī)肥,其中,商用化肥分別為尿素(CO(NH2)2, 含N≥46%)、過磷酸鈣(含P2O512.0%)和氯化鉀(含K2O 60.0%);自制有機(jī)肥以牛糞為主要原料(有機(jī)質(zhì)含量16.5%),添加1%的腐熟劑處理后制成,其N、P2O5、K2O含量分別為0.046 3、 0.021 0、 0.060 1 g·kg-1。
試驗(yàn)以不施肥處理為對(duì)照(CK),分別設(shè)置僅施用商用化肥(T2)及商用化肥與有機(jī)肥分別按照 9∶1(T3)、8∶2(T4)、7∶3(T5)、6∶4(T6)和 5∶5(T7)的比例配施,共計(jì)7個(gè)處理,每處理3次重復(fù),總計(jì)21個(gè)小區(qū)。其中,T2處理氮、磷、鉀的施用量分別為180、90和90 kg·hm-2;T3、T4、T5、T6、T7處理氮的總用量與T2處理一致,其有機(jī)肥施用量按照配施比例計(jì)算,磷和鉀的不足部分用相應(yīng)化肥補(bǔ)足,具體施用量見表1。試驗(yàn)處理按照完全隨機(jī)的方式排列,小區(qū)面積4 m×5 m,小區(qū)間間隔1 m。
表1 試驗(yàn)各處理的肥料施用量Table 1 Specific information processed by the experiment
飼用燕麥于2021年5月25日條播,播種量150 kg·hm-2,行距25 cm,播種深度4~5 cm。各肥料均采用撒施的方式施入,其中氮肥分別于播種前和拔節(jié)期按6∶4的比例分2次施入;磷肥、鉀肥和有機(jī)肥均于播種前一次性施入。試驗(yàn)期間各小區(qū)其他管理措施基本一致,播前灌水1次,生育期內(nèi)人工除草,于乳熟期采集土壤樣品和植株樣品。
1.4.1 株高和干草產(chǎn)量測(cè)定 于2021年8月20日(乳熟期)進(jìn)行取樣、測(cè)產(chǎn)。每個(gè)小區(qū)去除小區(qū)兩側(cè)邊行,隨機(jī)選擇10株植株,從植株主莖的地表至穗頂部(不含芒)測(cè)量株高(plant height,HP);并隨機(jī)選擇3個(gè)2 m樣段齊地面刈割,稱其鮮重,然后于105 ℃烘箱中殺青30 min,65 ℃下烘干至恒重,測(cè)定干草產(chǎn)量(yield,Y),以kg·m-2為單位計(jì)算。
1.4.2 土壤樣品采集和測(cè)定 于2021年8月18日采集土壤樣品。各小區(qū)按對(duì)角線采樣法,每個(gè)小區(qū)選取6點(diǎn)用土鉆取0—20 cm土層樣品及植物根際0~10 mm的土樣,各樣品混勻后采用四分法取0.5 kg土樣,3次重復(fù)。取樣后,將其分為2份,1份裝入離心管液氮封存用于土壤微生物分析;另1份風(fēng)干后用于土壤pH、有機(jī)質(zhì)(soil organic matter,SOM)、全氮(total nitrogen,TN)、全磷(total phosphorus,TP)、全鉀(total potassium,TK)速效氮(available nitrogen,AN)、速 效 磷(available phosphorus,AP)、速 效 鉀(available potassium,AK)、有機(jī)碳(soil organic carbon,SOC)和可溶解性鹽(soluble salt,SS)含量等土壤理化性質(zhì)的測(cè)定,各指標(biāo)參照鮑士旦[10]的方法進(jìn)行測(cè)定。
1.4.3 土壤總DNA提取及基因擴(kuò)增 使用MN NucleoSpin 96 Soil(MN,germany)試劑盒進(jìn)行土壤細(xì)菌DNA的提取,每個(gè)樣品重復(fù)3次,采用PacBio測(cè)序平臺(tái)的通用引物(正向27F和反向1492R)以細(xì)菌16S rRNA基因全長序列(V3~V4)為目的片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增體系參照鄭敏娜等[8]的方法。擴(kuò)增合格樣品送北京百邁克生物有限公司進(jìn)行PacBio平臺(tái)測(cè)序分析。
對(duì)原始下機(jī)subreads進(jìn)行校正得到CCS(circular consensus sequencing)序列(SMRT link,version8.0),使用lima(v1.7.0)軟件得到符合要求的高質(zhì)量CCS序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。利用QIIME軟件對(duì)優(yōu)質(zhì)序列在相似性≥97%的水平上進(jìn)行 OUT(operation taxonomic unit)聚類,基于OTU分析結(jié)果,對(duì)樣品在各個(gè)分類水平上進(jìn)行分類學(xué)分析;利用Mothur v.1.30軟件和R語言工具進(jìn)行α多樣性分析[9];利用軟件QIIME進(jìn)行β多樣性分析[9]等;通過R語言分析作圖。使用SPSS 22.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
不同施肥處理下飼用燕麥根際土壤理化特性和生物產(chǎn)量測(cè)定結(jié)果如表2所示。不同施肥處理對(duì)土壤全氮、速效氮和有機(jī)碳含量無顯著影響,各處理間差異不顯著;對(duì)土壤速效鉀和速效磷含量有顯著影響。各處理的速效鉀含量在189.36~298.99 mg·kg-1,其中T7處理最高,顯著高于其他處理;T4處理次之。各處理的速效磷含量在8.49~11.09 mg·kg-1,其中T4 處理最高,顯著高于其他處理;T5處理次之,但與其他處理間差異不顯著。不同施肥處理對(duì)土壤可溶解性鹽含量影響顯著,隨著有機(jī)肥施入量的增加,土壤中可溶解性鹽含量逐漸降低,其中CK顯著高于施肥處理;T4、T5、T6、T7處理間差異不顯著,但顯著低于其他處理。此外,T4處理飼用燕麥的株高為107.32 cm,顯著高于除T5處理外的其他處理;干草產(chǎn)量為9 245.52 kg·hm-2,顯著高于除T5和T6處理外的其他處理。
表2 不同處理下土壤理化性質(zhì)和干草生物量Table 2 Physical and chemical properties of soil and biomass of oats under different treatments
利用PacBio平臺(tái)測(cè)序結(jié)果顯示,所有土壤樣品共獲得1 605 355個(gè)序列讀數(shù),基于97%的相似性共獲得5 902個(gè)OTU,樣本文庫的覆蓋度達(dá)99.0%以上。分類學(xué)分析將細(xì)菌群落劃分為28個(gè)門,73個(gè)綱,187個(gè)目,347個(gè)科,533個(gè)屬。
從表3可知,T2和T4處理樣品中檢測(cè)到的OTU數(shù)量較CK顯著增加14.02%和9.59%。不同施肥處理下飼草燕麥根際土壤細(xì)菌群落的Ace指數(shù)和Chao 1指數(shù)分別表現(xiàn)為:T4>T6>T5>T2、T3、CK和T6、T4>T5>T2、T3、CK;T6處理細(xì)菌群落的Shannon指數(shù)顯著高于除T7處理外的其他處理。
表3 不同改良措施處理下土壤細(xì)菌測(cè)序及群落α 多樣性指數(shù)Table 3 Bacterial sequencing and community α diversity index of soil treated with different improvement measures
在門水平上,7個(gè)處理的土壤細(xì)菌群落共檢測(cè)到28個(gè)類群,其中變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidota)、放線菌門(Actinobacteriota)、綠彎菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteriota)、藍(lán)藻細(xì)菌門(Cyanobacteria)的相對(duì)豐度較高,累計(jì)相對(duì)豐度在84.81%以上,為優(yōu)勢(shì)菌門(圖1A)。對(duì)不同施肥處理進(jìn)行比較,變形菌門在T2處理中的相對(duì)豐度最高,為40.10%,在T7處理中最低,為20.08%;厚壁菌門在T7處理中的相對(duì)豐度最高,為26.08%,顯著高于除T6處理外的其他處理;擬桿菌門在 T7、T6和T5處理的相對(duì)豐度較CK處理分別提高10.32%、9.78%和9.73%;放線菌門在T4處理中的相對(duì)豐度最高,為17.68%,顯著高于其他處理;綠彎菌門在T5、T6、T7處理中的相對(duì)豐度顯著低于CK處理;酸桿菌門在T2處理中的相對(duì)豐度最高,為11.14%;藍(lán)藻細(xì)菌門在T4處理中的相對(duì)豐度最高,為12.06%。
在屬水平上,7個(gè)處理的飼草燕麥根際土壤細(xì)菌群被劃分為533個(gè)類群,其中相對(duì)豐度大于1%的細(xì)菌類群包括鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)、uncultured_bacterium_c_Subgroup_6、uncultured_bacterium、乳 酸 桿 菌(Lactobacillus)、uncultured_bacterium_f_A4b(圖1B)。鞘脂單胞菌屬為第1優(yōu)勢(shì)菌屬,在CK處理中的相對(duì)豐度最高,為 5.39%;uncultured_bacterium_c_Subgroup_6在CK、T2、T3處理中的相對(duì)豐度較高,均超過5.50%;uncultured_bacterium、乳酸桿菌、uncultured_bacterium_f_A4b在T7和T6處理中的相對(duì)豐度較高,顯著高于其他處理。
圖1 不同施肥處理下細(xì)菌的結(jié)構(gòu)組成Fig. 1 Composition and structure of bacterial under different fertilization treatments
主 坐 標(biāo) 分 析(principal coordinat analysis,PCA)結(jié)果(圖2)顯示,不同施肥處理形成了不同的細(xì)菌群落。第1坐標(biāo)(PC1)物種累積百分比方差占33.36%,第2坐標(biāo)(PC2)物種累積百分比方差占18.97%,累計(jì)52.33%,物種差異可用這2個(gè)軸來解釋。由圖2可知,T4、T5、T6、T7處理與CK、T2、T3處理間差異較大。
為了進(jìn)一步確定與不同施肥處理相關(guān)的特定細(xì)菌類群,根據(jù)分類學(xué)組成,使用線性判別分析效應(yīng)大?。╨inear discriminant analysis effect size,LEfSe)比較了7個(gè)處理的細(xì)菌群落組成。結(jié)果(圖3)顯示,根據(jù)設(shè)定的篩選標(biāo)準(zhǔn)(LDA>4)共發(fā)現(xiàn)58個(gè)類群在統(tǒng)計(jì)學(xué)上有顯著差異(P<0.05),其中,T4處理中檢測(cè)到24個(gè),主要包括放線菌門(微球菌科Microscillaceae)、綠藻門(束鞘藻目、Coleofasciculaceae和念珠藻目Nostocales)和芽單胞菌門(芽孢菌目Bacillales);T5處理檢測(cè)到21個(gè),包括微菌桿科(Microbacteriaceae)、類芽孢菌科(Paenibacillaceae)等; CK則富集了較多擬桿菌目(Bacteroidales)的細(xì)菌菌群。
圖3 不同改良措施下土壤細(xì)菌群落系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 3 Cladogram of soil bacterial community under different treatments
在屬水平,采用冗余分析(redundancy analysis,RDA)進(jìn)一步分析了差異物種與主要環(huán)境因子之間的關(guān)系,結(jié)果(圖4)表明,第1個(gè)成分(RDA 1)解釋了細(xì)菌菌群總變異的21.63%,第2個(gè)成分(RDA 2)解釋了細(xì)菌菌群總變異的12.71%,累積解釋率34.34%。此外,RDA 表明不同環(huán)境因子對(duì)細(xì)菌群落的影響不同。相關(guān)分析結(jié)果(表4)表明,TN、AN、SOC和AP含量與戴沃斯氏菌屬(Devosia)、交替赤菌屬(Alterythrobacter)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、鞘氨醇單胞菌屬(Bacilllus Sphingomonas)的相對(duì)豐富度呈極顯著正相關(guān)(P<0.01),與紅球菌屬(Rhodococcus)、藤黃單胞菌屬(Luteimonas)、短波單胞菌屬(Brevundimonas)呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05);AK含量與短波單胞菌屬(Brevundimonas)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)的相對(duì)豐度呈顯著正相關(guān)(P<0.05),與紅球菌屬(Rhodococcus)、藤黃單胞菌屬(Luteimonas)呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05)。
表4 基于屬水平的細(xì)菌群落和環(huán)境因子之間相關(guān)分析Table 4 Correlation analysis between bacterial communities and environmental factors at the genus level
圖4 屬水平上不同施肥處理下土壤細(xì)菌的相對(duì)豐度和土壤環(huán)境因子間的RDA分析Fig. 4 RDA analysis of soil bacteria relative abundance and among soil environmental factors under different fertilization
人工草地是我國重要的畜牧業(yè)生產(chǎn)基地。目前,在人工草地的建植與管理中,化肥施用量偏高,有機(jī)肥投入不足,從而造成耕地土壤退化,耕性變差,草產(chǎn)品品質(zhì)下降等問題。因此,在飼用燕麥的生產(chǎn)過程中探索合理高效的有機(jī)-無機(jī)配施比例有助于土壤和草地的可持續(xù)發(fā)展。研究發(fā)現(xiàn),在草地農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中增施有機(jī)肥可提高土壤中有效鉀和有效磷含量[9,11-12];但對(duì)土壤全氮、有效氮和有機(jī)碳含量影響較小[13-14],這與本研究結(jié)果一致。本研究表明,隨著有機(jī)肥施用量的增加、無機(jī)肥施用量的減少,土壤中可溶解性鹽含量逐漸降低,表明增施有機(jī)肥可有效改善土壤結(jié)構(gòu),降低土壤中鹽分含量;而研究中土壤有機(jī)質(zhì)含量未發(fā)生顯著變化,可能是有機(jī)肥施用時(shí)間較短,商麗榮等[9]也得出類似的結(jié)論。此外,本研究T4處理下的飼用燕麥株高和生物產(chǎn)量最高,一方面可能是由于施用有機(jī)肥改善了土壤生態(tài);另一面該處理下施用的有機(jī)、無機(jī)肥用量保障了飼用燕麥的正常生長發(fā)育,且氮素利用率達(dá)到最大化。
農(nóng)業(yè)管理措施(例如施肥)作為對(duì)土壤擾動(dòng)的一種重要方式,也會(huì)給微生物群落的生物多樣性和豐富度帶來顯著影響[15-18]。本研究表明,不同比例的無機(jī)-有機(jī)肥配施對(duì)細(xì)菌群落的多樣性指數(shù)和豐富度指數(shù)均有明顯影響,這可能是因?yàn)殡S著有機(jī)肥施用量的增加,改善了土壤結(jié)構(gòu),促進(jìn)了有機(jī)物的分解,從而影響了微生物種群結(jié)構(gòu)。對(duì)微生物群落結(jié)構(gòu)和組成的分析結(jié)果表明,變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidota)、放線菌門(Actinobacteriota)、綠彎菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteriota)、藍(lán)藻細(xì)菌門(Cyanobacteria)為優(yōu)勢(shì)菌門,但其在不同處理中的相對(duì)豐度又存在差異,與前人研究結(jié)果一致[8,19-24]。綠彎菌門(Chloroflexi)含有綠色色素,能夠通過光合作用產(chǎn)生能量[9],Lino等[25]研究表明,其菌群數(shù)量與植物地上生物量呈顯著正相關(guān)。酸桿菌門 (Acidobacteriota) 是近年來新分離的細(xì)菌類群[8],其作用還有待進(jìn)一步研究。
土壤微生物群落會(huì)在不同程度的擾動(dòng)下表現(xiàn)出不同的響應(yīng)策略[8]。本研究也表明,不同處理下土壤細(xì)菌的群落組成存在差異,其中Microscillaceae、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、第 三 節(jié) 類 芽 胞 桿 菌(Paenibacillaceae)在T4和T5處理中的相對(duì)豐度較高,較CK處理的增幅均在5.42%以上;乳酸桿菌(Lactobacillales)是有機(jī)物降解的重要參與者,其在T2處理中的相對(duì)豐度較高;而Chitinophagales可代謝碳水化合物,是碳代謝的重要參與者[26],其在CK處理中的相對(duì)豐度較高。此外,不同無機(jī)-有機(jī)肥配施處理引起的環(huán)境因素變化對(duì)不同微生物群的影響不同,土壤TN、AP、SOC和AK含量對(duì)細(xì)菌群落有著更為顯著的影響。
綜上所述,無機(jī)肥與有機(jī)肥按照8∶2的比例配施不僅能夠有效降低土壤中可溶解性鹽含量,還能提高土壤中有效鉀和有效磷含量,且增加土壤細(xì)菌群落的多樣性指數(shù),使其優(yōu)勢(shì)菌群更有利于土壤正向演替,增加植物地上部生物產(chǎn)量。未來,對(duì)于不同比例無機(jī)-有機(jī)肥配施對(duì)土壤菌群及微環(huán)境的影響機(jī)理還有待進(jìn)一步深入研究。