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        小麥IQM基因家族鑒定及非生物脅迫下表達(dá)分析

        2023-05-17 06:46:54梁婷左靜紅陸青楊東唐益苗郭春曼汪德州王偉偉

        梁婷, 左靜紅, 陸青, 楊東, 唐益苗, 郭春曼*,汪德州*, 王偉偉*

        (1.長(zhǎng)江大學(xué)農(nóng)學(xué)院,湖北 荊州 434025; 2.北京市農(nóng)林科學(xué)院雜交小麥研究所,北京 100097)

        鈣離子(Ca2+)是細(xì)胞內(nèi)重要的第二信使之一,在植物生長(zhǎng)發(fā)育、逆境脅迫等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮重要作用[1]。植物主要通過(guò)鈣離子傳感器監(jiān)測(cè)細(xì)胞質(zhì)中Ca2+水平變化,進(jìn)而調(diào)控一系列下游反應(yīng)[2-3]。鈣離子傳感器分為4類:鈣調(diào)素 (calmodulin,CaM)、鈣調(diào)素類似蛋白 (calmodulin like protein,CML)、鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶B 樣蛋白 (calmodulin B-like,CBL)和鈣依賴型蛋白激酶 (calcium dependent protein kinase,CDPK)[4-5]。其中,鈣調(diào)素是一種高度保守的小型酸性蛋白,自身沒(méi)有酶活性,在結(jié)合Ca2+后產(chǎn)生構(gòu)象變化,激活其下游靶蛋白-鈣調(diào)素結(jié)合蛋白(calmodulin binding protein,CaMBP)行使其功能。CaM 與CaMBP 結(jié)合類型分為2 類,需要Ca2+參與的為Ca2+依賴型,不需要Ca2+參與的為Ca2+不依賴型[6]。Ca2+不依賴型中存在含有IQ 基序(IQxxxRGxxxR)的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白,根據(jù)結(jié)構(gòu)域和所含IQ 基序數(shù)量的不同,將此種鈣調(diào)素結(jié)合蛋白分為5類,分別是IQM (IQ motif containing protein)、CAMTA(calmodulin-binding transcription activator)、IQD (IQ67-domain containing protein)、CNGC(cyclic nucleotide-gated channel)和myosin。其中,IQM 只含有1 個(gè)能與鈣調(diào)素結(jié)合的IQ 基序,且該基序位于氨基酸序列N端[7]。IQM 廣泛存在于植物的根、莖、葉、花和果實(shí)等器官中,是鈣調(diào)素結(jié)合蛋白家族基因中非常重要的一類,與其他鈣調(diào)素結(jié)合蛋白家族相比,植物特異性IQM基因僅在擬南芥、水稻中進(jìn)行了全面分析,其他物種中甚少報(bào)道。報(bào)道顯示,IQM基因在各種不同組織及不同脅迫條件下的表達(dá)量有顯著變化,其可能參與植物生長(zhǎng)發(fā)育、逆境脅迫等多種生理調(diào)控過(guò)程[8]。

        擬南芥中已鑒定出6 個(gè)IQM基因家族成員(IQM1~I(xiàn)QM6),其 蛋 白 質(zhì)N 端均含有1 個(gè)IQ 基序[2]。AtIQM1與AtCaM5能在酵母和植物細(xì)胞中結(jié)合,并以Ca2+依賴型方式通過(guò)影響活性氧(reactive oxygen species,ROS)的含量來(lái)調(diào)節(jié)氣孔運(yùn)動(dòng)[9],AtIQM1的突變體氣孔開(kāi)度顯著減小,且不受外因(光照、黑暗等)誘導(dǎo),過(guò)表達(dá)AtIQM1植株在光誘導(dǎo)氣孔開(kāi)放處理后氣孔開(kāi)放度明顯增大[10]。此外,AtIQM1在調(diào)控根系生長(zhǎng)、茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)生物合成及防御灰霉病過(guò)程中也發(fā)揮重要作用[2,11];AtIQM2參與擬南芥根的生長(zhǎng)發(fā)育及開(kāi)花調(diào)控,AtIQM2突變體成花時(shí)間推遲[12];AtIQM3通過(guò)調(diào)控?cái)M南芥光周期途徑進(jìn)而影響開(kāi)花時(shí)間[13];AtIQM4對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育起正調(diào)控作用,在種子休眠和萌發(fā)期發(fā)揮重要作用[14];AtIQM5通過(guò)參與調(diào)控年齡途徑影響擬南芥開(kāi)花時(shí)間[15];AtIQM6基因突變致使遠(yuǎn)軸面表皮毛的發(fā)生晚于野生型[16]。水稻中已報(bào)道7 個(gè)IQM基因家族成員,研究顯示OsIQMs通過(guò)與OsCaMs相互作用參與多種通路調(diào)控,并且OsIQMs中的IQ 基序是OsIQMs與OsCaMs結(jié)合所必需的,幾乎所有的OsIQMs基因都是ABA 和MeJA 響應(yīng)基因,OsIQM1通過(guò)與OsWRKY24共同作用參與植物病害反應(yīng)[7]。

        小麥?zhǔn)亲钪匾募Z食作物之一,提高小麥抗逆性、增加小麥產(chǎn)量,是解決糧食安全問(wèn)題的關(guān)鍵因素。植物特異性IQM基因參與逆境脅迫調(diào)控,但小麥中IQM基因家族成員及功能尚未進(jìn)行系統(tǒng)報(bào)道。本研究在小麥全基因組水平下共鑒定出23 個(gè)TaIQM基因家族成員,對(duì)其染色體位置、基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、蛋白保守結(jié)構(gòu)域、非生物脅迫下的基因表達(dá)模式等進(jìn)行了系統(tǒng)分析,篩選得到了一些可能參與小麥逆境脅迫相關(guān)的候選基因,為深入研究小麥IQM基因的重要生物學(xué)功能提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        本研究選取小麥標(biāo)準(zhǔn)栽培品種中國(guó)春(Chinese spring, CS)為試驗(yàn)材料,將種子置于25 ℃的光照培養(yǎng)間水培,待長(zhǎng)到2 葉1 心期,對(duì)小麥幼苗分別進(jìn)行PEG-6000 溶液、低溫(4 ℃)、高溫(42 ℃)、NaCl (0.2 mol·L-1)和ABA(0.15 mol·L-1)脅迫處理,設(shè)3 次生物學(xué)重復(fù),以0 h 未處理的地上部和地下部組織作為對(duì)照(CK),在處理1、3、6、12、24 h 后取地上部和地下部組織,液氮冷凍后,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 小麥IQM基因家族鑒定 從Ensembl Plants (http://plants.ensembl.org/index.html)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取擬南芥、水稻IQM 家族蛋白序列及小麥全基因組CDS 和蛋白序列,利用HMMER 軟件構(gòu)建隱馬爾可夫模型,使用SMART(http://smart.emblheidelberg)、Pfma(https://pfam.xfam.org/)確 認(rèn)是否含有完整的IQ 結(jié)構(gòu)域[17]。使用ExPASy(http://web.expasy.org/protparam/)在線網(wǎng)站獲取小麥IQM 家族成員蛋白質(zhì)氨基酸數(shù)、分子量等理化性質(zhì)數(shù)據(jù)。使用Euk-mPLoc 2.0 server (http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/)網(wǎng)站在線進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析。

        1.2.2 小麥IQM基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建 運(yùn)用MEGA X 中的Align by Clustal W 對(duì)小麥、水稻、擬南芥IQM 基因家族蛋白序列進(jìn)行多序列比對(duì),參數(shù)設(shè)置為默認(rèn)值,Bootstrap 值設(shè)置為1 000,采用Neighbor-Joining 法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),構(gòu)建所得進(jìn)化樹(shù)使用 Evolview(https://evolgenius. info//evolview-v2/#login)在線工具進(jìn)行處理。

        1.2.3 小麥IQM基因結(jié)構(gòu)和蛋白保守基序分析使用GSDS 軟件(http://gsds.gao-lab.org/)分析小麥IQM 基因家族成員基因結(jié)構(gòu),使用MEME(http://meme-suite.org/tools/meme)進(jìn)行保守基序測(cè)定,最大Motif 數(shù)量設(shè)置為10,其他參數(shù)為默認(rèn)值,利用TBtools 軟件中的Gene Structure View 程序進(jìn)行可視化。

        1.2.4 小麥IQM基因啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)從Ensembl Plants數(shù)據(jù)庫(kù)中提取小麥IQM基因起始密碼子上游2 000 bp 序列,使用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)預(yù)測(cè)啟動(dòng)子順式作用元件[18],利用TBtools 軟件中Gene Structure View程序進(jìn)行可視化。

        1.2.5 小麥IQM基因組織表達(dá)模式分析 利用WheatOmics 1.0(http://202.194.139.32/)查找并下載中國(guó)春不同組織不同時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),分析小麥IQM基因的組織表達(dá)特異性,使用TBtools軟件中的HeatMap程序繪制表達(dá)模式熱圖。

        1.2.6 小麥IQM基因成員非生物脅迫表達(dá)模式分析 依據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的小麥IQM基因CDS序列,避開(kāi)保守結(jié)構(gòu)域設(shè)計(jì)qRT-PCR 引物(表1)。采用Trizol 法提取脅迫處理小麥材料總RNA 后,用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),同時(shí)測(cè)定OD260/280值。使用HiScript?Ⅲ 1stStrand cDNA Synthesis Kit (諾唯贊生物科技股份有限公司)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,以反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA 為模板進(jìn)行qRT-PCR 分析。反應(yīng)體系為20 μL,包括Taq Pro Universal SYBR Qpcr Master Mix(諾唯贊生物科技股份有限公司) 10 μL、上下游引物(10 μmol·L-1)各1 μL、cDNA 模板2 μL(100 ng),ddH2O 6 μL。qRT-PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃變性5 s,60 ℃退火30 s,40 個(gè)循環(huán)后增加熔解曲線環(huán)節(jié),95 ℃變性5 s,60 ℃退火30 s,95 ℃變性15 s,擴(kuò)增曲線和熔解曲線鑒定引物特異性。3 次生物學(xué)重復(fù),采用2-△△CT法[19]計(jì)算相對(duì)表達(dá)量。

        表1 qRT-PCR引物Table 1 qRT-PCR primers 續(xù)表Continued

        表1 qRT-PCR引物Table 1 qRT-PCR primers

        2 結(jié)果與分析

        2.1 TaIQM基因家族鑒定及序列分析

        利用生物信息學(xué)方法獲得23 個(gè)TaIQM基因家族成員。Pfam 分析表明,TaIQM 蛋白均含有IQ結(jié)構(gòu)域。按照其在小麥染色體上的位置依次命名為T(mén)aIQM1~TaIQM23(表2)。染色體定位顯示TaIQM基因不均勻的分布在18條染色體上,其中,5A、5B、5D、6B 和6D 染色體上均含有2 個(gè)IQM基因,其他染色體上均只含有1個(gè)IQM基因。對(duì)23個(gè)TaIQM 蛋白的氨基酸數(shù)目、相對(duì)分子量、等電點(diǎn)等蛋白質(zhì)理化性質(zhì)的分析結(jié)果顯示,TaIQM基因家族成員編碼的氨基酸數(shù)目在424~669 個(gè)之間,相對(duì)分子量在47 667.67~74 779.20 Da之間,等電點(diǎn)在6.14~9.67 之間,TaIQM 蛋白間氨基酸數(shù)目存在較大差異,相應(yīng)的蛋白相對(duì)分子量、等電點(diǎn)也存在較大差異。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示TaIQM家族基因主要存在于細(xì)胞核中。

        表2 小麥IQM基因家族蛋白理化性質(zhì)及亞細(xì)胞定位Table 2 Characteristics and subcellular localization prediction of TaIQM genes 續(xù)表Continued

        表2 小麥IQM基因家族蛋白理化性質(zhì)及亞細(xì)胞定位Table 2 Characteristics and subcellular localization prediction of TaIQM genes

        2.2 TaIQM基因家族蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析

        為研究小麥IQM基因與水稻、擬南芥的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,將23 個(gè)小麥 (Triticum aestivumL.)、8 個(gè)水稻(Oryza sativa)和6 個(gè)擬南芥(Arabidopsis thaliana)的IQM蛋白序列進(jìn)行多序列比對(duì)后構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖1)。結(jié)果顯示,IQM基因家族成員可分為3個(gè)亞家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),Ⅰ中共有15個(gè)IQM基因家族成員,其中小麥IQM基因9個(gè),TaIQM4、TaIQM5、TaIQM6與OsIQM5在一個(gè)分支上,表明他們之間進(jìn) 化 關(guān) 系 相 近;TaIQM10、TaIQM11、TaIQM12與OsIQM2、TaIQM6在 一 個(gè) 分 支 上;TaIQM14、TaIQM16、TaIQM18與OsIQM3在一個(gè)分支上,他們都與AtIQM2和AtIQM6屬于同一亞家族。Ⅱ中含有11個(gè)IQM基因家族成員,其中小麥IQM基因6 個(gè),TaIQM1、TaIQM2、TaIQM3與OsIQM4在同一分支上;TaIQM7、TaIQM8、TaIQM9與OsIQM1在同一分支上,他們都與AtIQM1、AtIQM4和AtIQM5屬于同一亞家族。Ⅲ中含有11 個(gè)IQM基因家族成員,其中小麥IQM基因8個(gè),TaIQM13、TaIQM15、TaIQM17、TaIQM19、TaIQM20、TaIQM21、TaIQM22、TaIQM23與OsIQM7、OsIQM8、AtIQM3屬于同一亞家族。所有亞家族中小麥與水稻IQM家族成員進(jìn)化關(guān)系較近,同源性較高,與擬南芥親緣關(guān)系較遠(yuǎn),表明IQM家族基因在單子葉植物和雙子葉植物進(jìn)化過(guò)程中發(fā)生了分離。

        圖1 IQM蛋白進(jìn)化樹(shù)分析Fig. 1 Phylogeny analysis of IQM proteins

        2.3 TaIQM基因家族成員結(jié)構(gòu)特性

        TaIQM基因結(jié)構(gòu)分析顯示,所有TaIQM基因均含有內(nèi)含子、外顯子,家族成員間基因結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)多樣性(圖2A)。TaIQM基因含有外顯子數(shù)量在5~10 個(gè)之間,其中,TaIQM3只含有5 個(gè)外顯子;TaIQM4、TaIQM5等5 個(gè) 基 因 含 有7 個(gè) 外 顯 子;TaIQM9、TaIQM11等5 個(gè)基因含有8 個(gè)外顯子;TaIQM1、TaIQM10等11 個(gè)基因含有9 個(gè)外顯子;TaIQM2含有11個(gè)外顯子。除TaIQM2、TaIQM8和TaIQM20外,其他都含有3'UTR。蛋白基序分析顯示(圖2B),TaIQM基因家族中有16個(gè)基因均含有10 個(gè)相同基序;TaIQM1、TaIQM2、TaIQM7等5 個(gè)基因只含有9 個(gè)Motif,不含有Motif10;TaIQM3僅含有6個(gè)Motif;所有TaIQM基因都含有Motif6(IQM基因家族保守結(jié)構(gòu)域)(圖2C)。以上說(shuō)明相似度較高的TaIQM基因間可能有相同進(jìn)化方向。

        圖2 TaIQM家族成員結(jié)構(gòu)特征和保守基序分析Fig. 2 Structure and conservative motif analysis of the TaIQM

        2.4 TaIQM基因順式作用元件

        TaIQM基因包含多種脅迫響應(yīng)順式作用元件(圖3),如干旱誘導(dǎo)(MBS)、厭氧(ARE)、低溫(LTR)、防御與應(yīng)激(TC-rich repeats)響應(yīng)元件,還包含多種激素響應(yīng)順式作用元件,如脫落酸(ABRE)、生長(zhǎng) 素(TGA-element)、赤 霉 素(GARE-motif、P-box、TATC-box)和水楊酸(TCA-element)響應(yīng)元件,推測(cè)TaIQM可能參與脅迫響應(yīng)和激素響應(yīng)過(guò)程。此外,TaIQM基因還包含一些保守的順式作用元件(如CAAT-box、TATA-box 等)和一些光響應(yīng)(ACE、G-box)、分生組織表達(dá)調(diào)控(CAT-box)、晝夜節(jié)律調(diào)控(circadian)和胚乳表達(dá)調(diào)控(GCN4-motif)等元件,預(yù)示著TaIQM家族可能還參與其他多種生物學(xué)過(guò)程。

        圖3 TaIQM啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)Fig. 3 Cis-acting elements analysis of TaIQM genes

        2.5 TaIQM基因組織表達(dá)特性

        根據(jù)網(wǎng)站中已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),繪制23 個(gè)TaIQM基因的組織表達(dá)量熱圖(圖4)。結(jié)果顯示,不同TaIQM基因間表達(dá)量差別明顯,同一TaIQM基因在不同組織的不同時(shí)期間表達(dá)量也存在差別。其中,TaIQM2在不同組織中都有較高的表達(dá)量;TaIQM10、TaIQM11和TaIQM12在不同組織中表達(dá)量極低;TaIQM4和TaIQM5在拔節(jié)早期的莖中表達(dá)量較高;TaIQM7、TaIQM8和TaIQM9在分蘗早期和開(kāi)花后2 d 的葉中表達(dá)量較高;TaIQM13在1 葉期的根中表達(dá)較高;TaIQM6、TaIQM15和TaIQM17在拔節(jié)早期的穗中表達(dá)量較高;TaIQM18在根的不同時(shí)期中表達(dá)較高;TaIQM19、TaIQM21和TaIQM23在開(kāi)花后2 d 的籽粒中表達(dá)量較高?;虻谋磉_(dá)量變化表明在不同的發(fā)育時(shí)期各個(gè)TaIQM基因功能各不相同。

        圖4 TaIQM基因在不同組織中的表達(dá)量熱圖Fig. 4 Heat map of relative expression level of TaIQM genes in different tissues

        2.6 非生物脅迫下TaIQM基因qRT-PCR分析

        TaIQM基因家族成員對(duì)非生物脅迫存在不同程度的響應(yīng),相對(duì)表達(dá)量存在明顯差異(圖5)。低溫處理下,7 個(gè)TaIQM基因在地上部呈現(xiàn)下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM10、TaIQM11和TaIQM12;3個(gè)TaIQM基因在地下部呈現(xiàn)下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM1、TaIQM2、TaIQM3。高 溫 處 理 下,2 個(gè)TaIQM基因在地上部呈現(xiàn)下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM7和TaIQM9;全部TaIQM基因在地下部均呈現(xiàn)不同程度的上調(diào)表達(dá)趨勢(shì)。NaCl 處理下,11個(gè)基因在地上部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM4、TaIQM5和TaIQM6;9 個(gè)基因在地下部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá)趨勢(shì)。ABA 處理下,2 個(gè)基因在地上部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM11和TaIQM12;6 個(gè)基因在地下部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM10、TaIQM13(圖5A)。干旱處理下,17個(gè)TaIQM基因在地上部均呈現(xiàn)不同程度的上調(diào)表達(dá)趨勢(shì),如TaIQM10、TaIQM11和TaIQM12,其余6 個(gè)TaIQM基因在地上部呈下調(diào)表達(dá)趨勢(shì);所有TaIQM基因在地下部均呈現(xiàn)明顯上調(diào)表達(dá)趨勢(shì)(圖5B)。推測(cè)在小麥苗期地下部,干旱脅迫對(duì)所有TaIQM基因的表達(dá)存在促進(jìn)作用。

        3 討論

        IQM基因廣泛存在于植物中,參與調(diào)控眾多生理生化過(guò)程,在擬南芥、水稻中已有系統(tǒng)研究,而在小麥中還未見(jiàn)報(bào)道。本研究在小麥全基因組中鑒定出23個(gè)IQM 基因家族成員,對(duì)獲得的TaIQM基因染色體位置、蛋白理化性質(zhì)、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域、表達(dá)模式等進(jìn)行全面分析。

        根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,IQM基因家族被劃分為3 個(gè)亞族。系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系揭示了IQM 蛋白之間的進(jìn)化關(guān)系,同一亞科中最近緣的成員在保守蛋白序列和基序結(jié)構(gòu)上相似,每個(gè)亞家族的IQM 蛋白可能具有相似的功能[20]。保守蛋白序列分析顯示,小麥IQM基因均存在6 個(gè)相同的Motif,其中Motif 6是位于蛋白序列N端且包含IQ基序的IQM基因家族保守結(jié)構(gòu)域[7]。IQ 結(jié)構(gòu)域與鈣調(diào)蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域密切相關(guān),報(bào)道顯示,IQD 蛋白與玉米、毛竹和擬南芥中的CaMs 相互作用[21],擬南芥中,IQM 蛋白與CaMs 相互作用[2]。基因結(jié)構(gòu)分析顯示,多數(shù)基因的3'端和5'端都含有UTR,且都存在7~10個(gè)外顯子。在Motif相同情況下,內(nèi)含子/外顯子結(jié)構(gòu)差異是推動(dòng)多基因家族演變的關(guān)鍵因素之一。順式作用元件分析發(fā)現(xiàn)TaIQM基因存在大量與生長(zhǎng)發(fā)育、脅迫應(yīng)答、激素調(diào)節(jié)相關(guān)的順式作用元件,推測(cè)TaIQM基因可能通過(guò)與干旱誘導(dǎo)、脫落酸、赤霉素等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)相互作用調(diào)控干旱應(yīng)答,但還需相關(guān)試驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。鈣調(diào)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑是調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育、逆境脅迫的重要信號(hào)組成部分,主要由鈣離子、鈣調(diào)素及鈣調(diào)素結(jié)合蛋白組成[5]。目前,已報(bào)道的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白多達(dá)90 種以上,如MYB、NAC、WRKY、CBP60、CAMTA/SR 等轉(zhuǎn)錄因子[3],它們通過(guò)協(xié)同作用調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫反應(yīng),如OsWRKY24通過(guò)與OsIQM1協(xié)同作用應(yīng)對(duì)植物病害反應(yīng)。23個(gè)TaIQM基因在不同發(fā)育階段和不同組織中表達(dá)差異顯著,這些基因可能通過(guò)與其他轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同作用參與調(diào)控小麥生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程。

        植物中的IQM基因在干旱、低溫等非生物脅迫應(yīng)答中起重要作用[22],且在不同時(shí)空條件下參與調(diào)節(jié)不同的脅迫反應(yīng)[21]。報(bào)道顯示,AtIQM1介導(dǎo)CaM、光和部分非生物脅迫信號(hào)的轉(zhuǎn)導(dǎo)[2],AtIQM4在擬南芥中與AtIQM1協(xié)同參與光和ABA對(duì)氣孔運(yùn)動(dòng)的調(diào)控[23],鹽和滲透脅迫均可降低擬南芥苗期AtIQM1和AtIQM4的表達(dá)水平,脫水、低溫處理均能提高AtIQM4的表達(dá)水平,AtIQM4在植物非生物脅迫響應(yīng)中起重要作用[14]。水稻中7 個(gè)IQM基因在重金屬鹽CdCl2和Pd(NO3)2處理下的擬南芥幼苗中全部顯示上調(diào)表達(dá)。OsIQM3和OsIQM5在PEG 脅迫反應(yīng)中顯示較高的轉(zhuǎn)錄水 平[7]。TaIQM7、TaIQM8和TaIQM9與AtIQM1、AtIQM4進(jìn)化關(guān)系相近,干旱脅迫下TaIQM7、TaIQM8和TaIQM9在地下部顯著上調(diào)表達(dá),與AtIQM4的表達(dá)模式相似,基因表達(dá)模式為研究基因功能提供重要依據(jù),這些基因在小麥干旱脅迫應(yīng)答反應(yīng)地下部中均呈現(xiàn)正向調(diào)控,結(jié)合組織表達(dá)數(shù)據(jù)中TaIQM7、TaIQM8和TaIQM9在根和葉組織中偏好表達(dá),表明TaIQM7、TaIQM8和TaIQM9可能參與調(diào)控小麥苗期地下部抗旱反應(yīng)。這些基因可作為抗旱候選基因進(jìn)一步深入研究。

        本研究在小麥全基因組水平上系統(tǒng)鑒定和分析了23 個(gè)小麥IQM基因,對(duì)其生物信息學(xué)及非生物脅迫下表達(dá)模式進(jìn)行了系統(tǒng)分析。進(jìn)化樹(shù)分析表明小麥IQM基因分為3 個(gè)亞家族(I~I(xiàn)II),基因結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)序列分析表明這些基因在每個(gè)亞家族中都相對(duì)保守。非生物脅迫下的表達(dá)模式分析表明絕大多數(shù)IQM基因?qū)EG、NaCl、冷和 ABA 處理有反應(yīng),說(shuō)明它們參與植物響應(yīng)非生物脅迫調(diào)控過(guò)程。本研究結(jié)果為深入探究小麥IQM家族各成員的生物學(xué)功能及非生物脅迫作用機(jī)制和小麥抗逆分子育種提供一定參考。

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