王靜怡,佐長賡,牛新湘,楊紅梅,楚 敏,王 寧,林 青,王有武,婁 愷,史應武,
(1.新疆大學生命科學與技術學院,烏魯木齊 830052; 2.新疆農(nóng)業(yè)科學院微生物應用研究所,烏魯木齊 830091;3.新疆特殊環(huán)境微生物實驗室,烏魯木齊 830091; 4 新疆農(nóng)業(yè)科學院土壤肥料與農(nóng)業(yè)節(jié)水研究所,烏魯木齊 830091; 5 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部西北綠洲農(nóng)業(yè)環(huán)境重點實驗室,烏魯木齊 830091)
【研究意義】棉花黃萎病已成為新疆棉花種植和生產(chǎn)的主要障礙[1,2]。棉花黃萎病是一種土傳病害,由大麗輪枝菌通過侵染根部定殖于維管束引起,生物防治在近幾年取得了很好的效果,不易使病原菌產(chǎn)生抗病性的特征使生物防治成為了近幾年防治方法[3-5]。生防菌能否很好的發(fā)揮防病效果受多種因素影響,主要有其施加后在植株或土壤中的適應能力、定殖能力、拮抗物質(zhì)的產(chǎn)生能力及拮抗基因的表達水平[6],而生防菌的定殖能力是決定其發(fā)揮生防效果的前提[7-10]。棉花黃萎病是一種土傳病害,由大麗輪枝菌通過侵染根部定殖于維管束引起。生物防治作為最有前景的防治方法,內(nèi)生和根際細菌被認為是生防細菌中最有潛力的微生物菌群。研究生防菌在棉田土壤中的定殖數(shù)量及其與防病作用相關性,對生防菌在棉花黃萎病的防效具有重要意義。【前人研究進展】WANG等[11]在草莓采收后將拮抗菌接種到草莓果實上,檢測到拮抗菌菌群短時間內(nèi)在草莓果實表面大量富集,病原菌數(shù)量明顯下降,可能是果實表面有限的空間被拮抗菌生長繁殖所占據(jù),伴隨著抑菌功能,病原菌在果實傷口處和表面的生長繁殖被抑制,最終抑制果實的發(fā)病 。棉田條件復雜且多變,棉花黃萎病生防菌在實驗室條件下對大麗輪枝菌有很好的抑制作用,而在大田中不一定能發(fā)揮相同的效果。生防菌劑應用于大田能否起作用主要取決于所施生防菌劑能否在植株根際定殖并增殖[12-13]。其中杜鵑等[14]報道了施加生防菌后根際土壤的細菌數(shù)量顯著增加,真菌數(shù)量顯著減少,棉花根際土壤微生物群落結構向有利于作物生長的細菌型轉(zhuǎn)變。婁善偉等[15]也得出相似結論,微生物菌劑滴施后對棉花黃萎病產(chǎn)生了較為明顯的抑制作用,發(fā)病指數(shù)降低,棉花產(chǎn)量隨施加藥量的增加而增加?!颈狙芯壳腥朦c】目前大部分研究放在生防菌與病原菌之間的相互作用使其提高防效上,對生防菌實際應用在土壤中時的定殖與防病相關的研究報道還很少。對于生防菌施入后,棉花黃萎病發(fā)病情況與生防菌定殖量的相關性分析還很少見報道,大多都是生防菌和土壤微生物群落的研究。需研究生防菌施入棉田土壤后生防菌的數(shù)量變化和棉花黃萎病的發(fā)病情況。【擬解決的關鍵問題】選擇4株棉花內(nèi)生和根際拮抗菌進行盆栽實驗,使用平板計數(shù)和實時熒光定量分析細菌和病原菌,分析生防菌的定殖與防病的相互關系,為生物防治保障農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量與安全生產(chǎn)提供技術支撐。
1.1.1 土 樣
土樣取自烏魯木齊安寧渠試驗場灰漠土,土壤理化性質(zhì)由中國科學院新疆生態(tài)與地理研究所胡明芳測定。其中有機質(zhì)15.2 g/kg,全氮0.868 g/kg,全磷0.667 g/kg,全鉀19.8 g/kg,堿解氮0.055 g/kg,速效鉀0.288 g/kg,速效磷0.003 g/kg,pH 8.1。
1.1.2 供試病原菌
大麗輪枝菌[16](Verticilliumdahliae),由新疆農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所饋贈。
1.1.3 供試拮抗菌
4個菌株:分離自博樂和石河子花期棉株體內(nèi)的BacillusvelezensisBHZ-29、BacillusatrophaeusSHZ-24;分離自石河子花期和苗期棉株根際的BacillussubtilisSHT-15和BacillusvanilleaSMT-24。
1.1.4 棉花品種
新陸早36號由新疆石河子農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所饋贈。
1.1.5 供試培養(yǎng)基
NB培養(yǎng)基:蛋白胨10 g,牛肉浸出粉3 g,氯化鈉5 g,蒸餾水1 000 mL,pH (7.2±0.2)。
NA培養(yǎng)基:蛋白胨10 g,牛肉粉3 g,氯化鈉5 g,瓊脂15 g,蒸餾水1 000 mL,pH (7.3±0.1)。
孟加拉紅培養(yǎng)基:蛋白胨5 g,葡萄糖10 g,磷酸二氫鉀1 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,瓊脂20 g,孟加拉紅0.033 3 g,氯霉素0.1 g。
Czapek’s培養(yǎng)基:NaNO33 g,K2HPO31 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,KCl 0.5 g,F(xiàn)eSO4·4H2O 0.01 g,蔗糖30 g,蒸餾水1 000 mL,pH6.5。
1.1.6 主要試劑
DNeasy PowerSoil Kit(QIAGEN公司);SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒(生物工程股份有限公司);SanPrep柱式質(zhì)粒DNA小量抽提試劑盒(生物工程股份有限公司)。
1.2.1 棉苗盆栽種植
將長8 cm,寬6 cm紙片做成紙筒,將經(jīng)過滅菌處理的土樣裝至紙筒2/3處,在每個紙筒中種植一粒顆粒飽滿的棉種,覆土壓實后放置智能培養(yǎng)箱中培養(yǎng),常溫室溫培養(yǎng),晝/夜光照與溫度分別:13 h/11 h,26℃/24℃,相對濕度:80%,光照強度60 klx。待接種病原菌后將棉苗移植于大花盆中,每盆移植8株棉苗。
1.2.2 拮抗細菌接種和大麗輪枝菌接種
播種后 18 d左右棉苗一片真葉初現(xiàn)時將SMT-24,BHZ-29,SHT-15,SHZ-24菌株發(fā)酵液以10 mL/株(108CFU/mL)均勻灌溉棉苗,對照CK(僅接種大麗輪枝菌)接種同體積滅菌NB培養(yǎng)基,接種后放回智能培養(yǎng)箱培養(yǎng)。第1次接種接抗菌7 d后接種大麗輪枝菌,接種量為10 mL/株(107個孢子/mL)。接種大麗輪枝菌5 d后,第2次接種拮抗細菌發(fā)酵液10 mL/株。5 d后第3次接種拮抗細菌發(fā)酵液10 mL/株。
1.2.3 拮抗細菌在土壤中定殖數(shù)量檢測
棉苗土壤第3次接種拮抗細菌10 d后,每10天每種拮抗菌取3份棉苗根部土,混勻后稱量5 g的土壤放入裝有45 mL滅菌生理鹽水的250 mL三角瓶中,25℃,180 r/min震蕩2 h,10-4和10-5稀釋梯度涂布于NA固體培養(yǎng)基上,30℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)1 d。計數(shù)統(tǒng)計細菌菌落數(shù)在30~300 CFU的平板,每次處理設置3組平行,每組平行計數(shù)5次。
1.2.4 qPCR定量大麗輪枝菌
1.2.4.1 大麗輪枝菌DNA的提取
大麗輪枝菌DNA的提取利用真菌基因組DNA提取試劑盒對其發(fā)酵液進行提取。提取后的樣品保存在-20℃冰箱中待測。
1.2.4.2 qPCR反應體系的優(yōu)化
參考黨文芳等[17]的方法,應用大麗輪枝菌引物Vd-F929-947(5`-CGTTTCCCGTTACTCTTC-3`)和Vd-R1076-1094(5`-GGATTTCGGCCCAGAAACT-3`)對土壤基因組總DNA進行擴增。
1.2.4.3 大麗輪枝菌重組質(zhì)粒的制備與鑒定
參考黨文芳等[17]的方法。
1.2.4.4 標準曲線的建立
參考黨文芳和張濤等的方法[17,18]。
1.2.4.5 樣品的qPCR檢測
用qPCR對擴增后的大麗輪枝菌定量檢測,將得到的每個樣品對應的Ct值帶入上述重組質(zhì)粒DNA構建的標準曲線方程中,計算棉花根際土壤中大麗輪枝菌的含量(copies/g FRW)。
1.2.5 病情調(diào)查
調(diào)查第3次拮抗菌接種2 d后發(fā)病情況,以棵為單位,統(tǒng)計發(fā)病葉片數(shù)與每株總?cè)~片數(shù),分級標準如下:0級:外表無癥狀;1級:病葉占總?cè)~片數(shù)25%以下;2級:病葉占總?cè)~片數(shù)25%~50%;3級:病葉占總?cè)~片數(shù)50%~75%;4級:病葉占總?cè)~片數(shù) 75%以上。
病情指數(shù)=∑(級值×株數(shù) /(最高級值×總株數(shù))×100。
防治效果=(大麗輪枝菌對照組病情指數(shù)-拮抗菌處理后的病情指數(shù))/大麗輪枝菌對照組病情指數(shù)×100%。
1.2.6 生防菌定殖數(shù)量與防病效果相關性
利用皮爾遜相關系數(shù)(PCC)分析生防菌定殖數(shù)量與防病效果之間的相關性,PCC分析在SPSS 26軟件中進行。
繪圖和分析利用Origin 2018和SPSS 26軟件進行。
研究表明,菌株SHZ-24和BHZ-29在土壤中適應性良好,呈現(xiàn)先減小后增大的趨勢;菌株SMT-24和SHT-15在土壤中呈現(xiàn)先增大后減小的趨勢。在50 d時,4株菌的定殖數(shù)量從高到低的順序依次為SHZ-24, BHZ-29,SMT-24,SHT-15,在土壤中的數(shù)量分別為5.13×107、3.63×107、3.97×107和2.53×107copies/g,且4株菌的數(shù)量都大于10 d時的數(shù)量。圖1
經(jīng)拮抗細菌處理的土壤中大麗輪枝菌數(shù)量均小于CK對照組。在CK組中,土壤中大麗輪枝菌呈現(xiàn)先減小后增大的趨勢。4組拮抗細菌處理的土壤中,大麗輪枝菌數(shù)量由高到低分別是:BHZ-29,SMT-24,SHT-15,SHZ-24。圖2
注:滅菌土壤
研究表明,土壤中4株拮抗細菌處理組的病情指數(shù)變化均小于CK對照組,且4株菌處理組在整個生長時期內(nèi)病情指數(shù)呈現(xiàn)緩慢增長趨勢,增長速度小于CK對照組。50 d時,CK對照、SHZ-24、SMT-24、SHT-15和BHZ-29菌各處理的病情指數(shù)分別為22.44,11.7,11.36,12.06和11.39。 圖3
注:滅菌土壤A:ck; B:SHZ-24; C:SMT-24; D:SHT-15; E:BHZ-29
研究表明,經(jīng)4株拮抗細菌處理后,SHZ-24、SHT-15、SMT-24和BHZ-29菌株的定殖數(shù)量與大麗輪枝菌數(shù)量的PCC分別為-0.945、-0.982、-0.963和-0.961(P<0.01),4株拮抗細菌定殖數(shù)量與大麗輪枝菌數(shù)量呈負相關且為高度相關。4株拮抗細菌定殖數(shù)量與防病效果的PCC值分別為0.938、0.983、0.801和0.851(P<0.01),4株拮抗細菌定殖數(shù)量與防病效果呈正相關且為高度相關。表1
注:滅菌土壤
土壤中的微生物數(shù)量繁多、種類豐富,其中微生物的多樣性對土壤的成分組成、土壤中的養(yǎng)分利用情況和植物的生長發(fā)育起著重要作用[19-21]。林巧玲等[22]采用灌根和涂葉的方法對盆栽大豆中海洋細菌解淀粉芽孢桿菌的定殖動態(tài)進行了研究,指出灌根方法可使該菌株在大豆體內(nèi)穩(wěn)定定殖一段時期。祁超等[23]利用GFP標記法測定生防菌在黃瓜體內(nèi)的定殖情況,得出生防菌可在黃瓜體內(nèi)穩(wěn)定定殖且維持在一定數(shù)量。王濤等[24-25]通過盆栽試驗分析了棉花黃萎病拮抗細菌在土壤、棉花根際和根內(nèi)的定殖情況,指出拮抗細菌在滅菌土中的定殖數(shù)量高于自然土中。
研究中當拮抗細菌施入棉株根部土壤中時,拮抗細菌可在土壤中定殖并增殖。4株菌中SHZ-24菌株在土壤中定殖能力最好,且在生長后期防病效果在4株菌中較好,定殖能力是發(fā)揮其防病效果的前提,與前人研究結論相符。經(jīng)拮抗細菌處理的土壤中大麗輪枝菌數(shù)量均小于CK對照組。拮抗細菌施入土壤中后通過競爭和拮抗物質(zhì)的產(chǎn)生等抑制了大麗輪枝菌的生長。土壤中大麗輪枝菌呈現(xiàn)先減小后增大的趨勢。拮抗細菌定殖數(shù)量與防病效果相關性分析,發(fā)現(xiàn)4株拮抗細菌定殖數(shù)量與防病效果呈顯著正相關,拮抗細菌的施加量顯著影響其在土壤中防病效果的發(fā)揮。而生防細菌能否大田應用涉及生防菌的施用方式、施用量、對土壤環(huán)境的適應能力、在土壤中抑菌物質(zhì)的產(chǎn)生能力及與土壤環(huán)境中各生物之間的互作能力等。生防菌的大田應用涉及范圍廣,在土壤中的存活能力只是影響其能否大田應用的其中一個因素,讓生防菌應用于大田,還須進行影響其應用全部因素的研究。
構建了實時熒光定量拮抗菌和大麗輪枝菌的標準曲線,對棉花根際拮抗菌和大麗輪枝菌進行了實時熒光定量。4株菌在滅菌土壤中存活數(shù)量變化趨勢相同,50 d時的存活數(shù)量從高到低分別為SHZ-24、BHZ-29、SMT-24和SHT-15,拮抗細菌處理的土壤中大麗輪枝菌數(shù)量均小于CK對照組。4株拮抗細菌均降低棉苗的病情指數(shù),其中BHZ-29的防病效果最好。SHZ-24、SHT-15、SMT-24和BHZ-29菌株在土壤中的數(shù)量與大麗輪枝菌數(shù)量呈負相關,PCC值分別為-0.945、-0.982、-0.963和-0.961。與防病效果的PCC值分別為0.938、0.983、0.801和0.851,4株拮抗細菌在土壤中的定殖數(shù)量與防病效果呈顯著正相關。