董國慶 黃秒 陸喜燕
南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳婦幼保健院兒童內(nèi)分泌科(廣東深圳 518028)
糖尿病是兒童時(shí)期第三常見的慢性疾病,是因環(huán)境及遺傳等多種因素導(dǎo)致的一種代謝紊亂,主要有1 型糖尿病(type 1 diabetes mellitus,T1DM)、2 型糖尿?。╰ype 2 diabetes mellitus,T2DM)和其它類型糖尿病[1]。單基因型糖尿病作為其它類型糖尿病中的重要組成部分,包括新生兒糖尿?。╪eonatal diabetes mellitus,NDM)、青少年成人型糖尿?。╩aturity-onset diabetes of the young,MODY)、線粒體糖尿?。╩itochondria diabetes mellitus,MDM)和綜合征相關(guān)糖尿病等,約占兒童糖尿病的1% ~6%[2-3]。然而,由于臨床表型異質(zhì)性和缺乏糖尿病家族史,有一部分單基因糖尿病被誤診。近年來,隨著二代測序技術(shù)(next-generation sequencing,NGS)及全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)的開展,糖尿病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)越來越清楚。本文對兒童糖尿病基因檢測相關(guān)內(nèi)容做如下綜述。
1.1 T1DMT1DM 有關(guān)的遺傳變異不斷被發(fā)現(xiàn),但其機(jī)制如何,待進(jìn)一步研究[4]。GWAS 已經(jīng)確定了50 多個(gè)導(dǎo)致T1DM 發(fā)病機(jī)制的遺傳風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域,超過60% 的變異影響胰島β 細(xì)胞表達(dá),表明這些基因可能在T1DM 發(fā)病機(jī)制中起關(guān)鍵作用[5]。最近研究表明,T1DM 遺傳風(fēng)險(xiǎn)評分(the type 1 diabetes genetic risk score,T1D-GRS)可篩查T1DM 遺傳風(fēng)險(xiǎn),適用于新生兒[6-7]、成人糖尿病的分類和胰島自身免疫性疾?。?]。
1.2 T2DM2 型糖尿病是一種復(fù)雜的疾病,是遺傳、表觀遺傳和環(huán)境因素之間相互作用的結(jié)果[9]。自2007年開始進(jìn)行T2DM-GWAS 研究后已發(fā)現(xiàn)約250 個(gè)基因組區(qū)域與T2DM 易感性相關(guān)[10],其中幾個(gè)區(qū)域出現(xiàn)了基因突變和疾病的因果證據(jù)[11]。例如:KCNJ11、WFS1、HNF1A、HNF1B、ABCC8、GLIS3。長鏈非編碼RNA 在T2DM 患者中與胰島功能相關(guān),并可促進(jìn)胰島β 細(xì)胞的凋亡[12]。有關(guān)多基因結(jié)構(gòu)與T2DM 研究取得了快速進(jìn)展,但在疾病預(yù)測或預(yù)防的臨床應(yīng)用很少[10]。
1.3 單基因糖尿病
1.3.1 MODY是指青少年發(fā)病的成年型糖尿病,代表了一組臨床異質(zhì)性常染色體顯性遺傳疾病,由參與β 細(xì)胞發(fā)育和胰島素分泌的基因突變引起,是最常見的單基因糖尿病形式[1,13]。目前明確導(dǎo)致MODY 致病基因有14 個(gè),其中GCK、HNF1A及HNF4A 突變在MODY 最常見[14]。MODY 在兒童人群中發(fā)病率因國家和地區(qū)而異,但以上基因致病突變約占所有MODY 病例的85% ~90%[15]。GCK 基因突變在中國MODY 患者中最為常見,其次是PAX4、FOXM1[16-18]。注意的是,具有MODY樣表型的患者中未發(fā)現(xiàn)在已知的MODY 基因突變,需考慮是否有其他基因致病突變導(dǎo)致。最近的研究將RFX6 確定為一種新的MODY 基因[19],WFS1、PPARG 和GLIS3 可作為這些罕見MODY 形式的潛在候選基因[20]。
1.3.2 NDM是指出生后6 個(gè)月內(nèi)發(fā)病的糖尿病,非常罕見疾病,發(fā)病率為1/10 萬~1/40 萬,目前發(fā)現(xiàn)至少有26 個(gè)致病基因[21],其中編碼鉀ATP 通道亞單位的基因(KCNJ11、ABCC8),INS 基因與暫時(shí)性和永久性NDM 有關(guān),而GCK 基因中的突變主要表現(xiàn)為永久性NDM。
1.3.3 MDM是指線粒體基因突變型和核基因突變型導(dǎo)致的特殊類型糖尿病,占糖尿病總數(shù)的3%。到目前為止,總共發(fā)現(xiàn)了54 個(gè)與不同類型糖尿病相關(guān)的mtDNA 突變[22],其中m.3243A>G 突變是MDM 中最常見的突變位點(diǎn),約占所有MDM 的85%,m.3243A>G 突變攜帶率高達(dá)1∶400。MDM 在兒童期發(fā)病較少,主要在成年發(fā)現(xiàn)。若兒童期先出現(xiàn)耳聾和發(fā)育遲緩(包括智力殘疾、自閉癥、矮小),后有糖尿病,要注意MDM。特別是在家系內(nèi)發(fā)現(xiàn)糖尿病的傳遞符合母系遺傳,是高度需注意除外MDM[23]。
2.1 臨床基因檢測方法選擇NGS 技術(shù)正迅速成為臨床實(shí)驗(yàn)室對疑似遺傳疾病患者的常規(guī)臨床診斷工具。首選全外顯子測序(whole exome sequencing,WES),現(xiàn)在市面上提供的臨床外顯子測序大部分可檢測點(diǎn)突變外,還檢測染色體微缺失、編碼區(qū)的大片段缺失、部分線粒體基因。注意的是,臨床醫(yī)師在選擇基因檢測前,需結(jié)合臨床表型篩選感興趣的基因,并與檢測實(shí)驗(yàn)室確認(rèn)感興趣基因已充分覆蓋。經(jīng)濟(jì)條件允許,可以做家系全外,可以提高致病基因新發(fā)突變的幾率。還有一些用全外測序不能檢出,例如6q24 暫時(shí)性新生兒糖尿?。═NDM)是一類罕見的單基因糖尿病,與染色體6q24 區(qū)基因印跡異常有關(guān),需用甲基化特異性多重連接依賴性探針擴(kuò)增法(methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification,MSMLPA)[24]。對于MDM 臨床疑診患者時(shí),首先篩查m.3243 位點(diǎn),國內(nèi)部分基因檢測公司開展m.3243位點(diǎn)口腔唾液篩查,必要時(shí)首取選皮膚組織(皮膚成纖維細(xì)胞),其次為血液(淋巴細(xì)胞)進(jìn)行線粒體基因包檢測。目前用于mtDNA 突變分析的方法包括WES、線粒體基因包和全基因組測序(wholegenome sequencing,WGS)[25]。WGS 主要用于識(shí)別核突變的情況下很有用,但它的檢測效率和準(zhǔn)確性需要提高[26]。
在進(jìn)行基因檢測前,臨床醫(yī)師需收集完整的臨床信息,如人類表型本體(human phenotype ontology,HPO)規(guī)范表達(dá),完整的家族史[27]。進(jìn)行任何基因檢測前均需向受檢者簽署知情同意書,告知詳細(xì)閱讀理解。檢測都不能保證100%找到致病原因,基于現(xiàn)有的研究及認(rèn)識(shí)、受送檢樣本的真實(shí)性、檢測局限性等因素限制。檢測只是輔助臨床診斷,不能替代臨床診斷。高精度的檢測方法仍然面臨可能發(fā)現(xiàn)一些臨床意義未明的結(jié)果,做好思想準(zhǔn)備。
2.2 臨床應(yīng)用指征對于以下幾類糖尿病患兒,建議進(jìn)行分子遺傳學(xué)檢測[1,13,28]:(1)6 個(gè)月齡前發(fā)?。唬?)6 ~12 個(gè)月齡起病,自身抗體陰性;(3)合并胰腺外病變;(4)家族多代(三代以上)高血糖或糖尿病史;(5)診斷T1DM 5年后,胰島素需要量低,血清及尿C 肽在正常范圍或稍偏低;(6)穩(wěn)定、輕度的空腹血糖升高(5.5 ~8.5 mmol/ L),糖化血紅蛋白穩(wěn)定在5.6% ~7.6%之間,特別是非肥胖患者;(7)新生兒期高胰島素性低血糖癥;(8)與肥胖程度不符合的顯著黑棘皮病表現(xiàn),可伴有高甘油三酯等脂代謝異常表現(xiàn);(9)中心型肥胖。(10)有明確的糖尿病家族史。多項(xiàng)研究顯示[2,29-30]自身抗體陰性是MODY 的最強(qiáng)預(yù)測因子,另外兩個(gè)關(guān)鍵因素是診斷時(shí)糖化血紅蛋白<7.5%和父母有糖尿病史。
1 歲至青春期前的兒童糖尿病主要是T1DM,在青春期前后,更多考慮T2DM 和單基因糖尿病,但T1DM 仍是一個(gè)考慮因素。診斷單基因糖尿病和T2DM 時(shí),陽性家族史是重要的參考因素。因此必須要詢問每個(gè)兒童糖尿病的家庭成員的具體細(xì)節(jié),包括糖尿病診斷時(shí)的年齡、診斷時(shí)的身體狀況和治療,以獲得有價(jià)值的家族史。
筆者給1 名生后有持續(xù)高血糖新生兒,予NGS測序基發(fā)現(xiàn)KCNJ11 c.679G/A p.(Glu227Lys)變異,家系驗(yàn)證提示父母均未見此突變。先證者為孕39+4周,女孩,出生體質(zhì)量2.12 Kg,生后因“足月小于胎齡兒,孕母妊娠期糖尿病兒”在新生兒科住院期間持續(xù)高血糖,血糖波動(dòng)在8.8 ~17.4 mmol/L,基因確診后給予口服格列本脲[0.05 ~01 mg/(kg·d),Tid 或Biol]治療1 周后血糖逐漸恢復(fù)正常,在1 歲時(shí)??诜幬?,現(xiàn)3 歲10月血糖定期監(jiān)測正常。此患兒表現(xiàn)為暫時(shí)性新生兒糖尿病,借助分子診斷技術(shù)實(shí)現(xiàn)了精準(zhǔn)治療。
兒童糖尿病第二代測序發(fā)現(xiàn)的、或者臨床未證實(shí)的可疑致病突變均可依照美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)會(huì)以及美國分子病理學(xué)會(huì)遺傳變異標(biāo)準(zhǔn)分類與指南進(jìn)行判別[31]。具體的遺傳變異分析流程(圖1)可參照美國國立衛(wèi)生研究院臨床基因組資源基因注解工作組制定的標(biāo)準(zhǔn)操作流程(https://clinicalgenome.org/,ClinGen),用于基因功能判斷的各種數(shù)據(jù)可從臨床相關(guān)變異數(shù)據(jù)庫(https//www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/,ClinVar)、人類基因突變數(shù)據(jù)庫(HGMD?)中獲取。對于功能數(shù)據(jù)缺乏的遺傳變異,可用生物信息學(xué)預(yù)測法對其進(jìn)行評估。
圖1 基因測序致病性的判斷流程圖Fig.1 Flow chart for determining the pathogenicity of gene sequencing
基因報(bào)告中經(jīng)常出現(xiàn)的意義未明突變(VUS)使得情況更加復(fù)雜,確定VUS 是否與患者的臨床表現(xiàn)有關(guān)是糖尿病基因診斷中最具挑戰(zhàn)性的方面之一[32]。目前,國內(nèi)大部分醫(yī)療機(jī)構(gòu)無專門的遺傳咨詢師為遺傳病提供遺傳咨詢,因此,在建立臨床診斷后,臨床醫(yī)師需承擔(dān)為患者及家屬提供遺傳咨詢。臨床醫(yī)師收到基因報(bào)告后,可以參照中國2020年發(fā)表的《遺傳病二代測序臨床檢測全流程規(guī)范化共識(shí)探討》[33]中有關(guān)檢測報(bào)告解讀和遺傳咨詢部分進(jìn)行臨床解讀??赡軙?huì)出現(xiàn)以下幾種情況:(1)檢出與先證者表型相關(guān)且符合遺傳規(guī)律的致病/疑似致病變異:臨床醫(yī)師應(yīng)該查閱相關(guān)文獻(xiàn),結(jié)合臨床表現(xiàn)與基因檢測結(jié)果謹(jǐn)慎的對先證者確診。通常遺傳報(bào)告不提供臨床指導(dǎo),在建立了基因診斷后也需查閱相關(guān)文獻(xiàn),對臨床管理進(jìn)行適當(dāng)?shù)母淖?。例如:GCK 基因突變致MODY 無需降糖治療,HNF1A 基因突變致MODY可能對磺脲類藥物治療更敏感。筆者用定制糖尿病基因包檢測一位反復(fù)空腹高血糖10 歲8月女孩,發(fā)現(xiàn)HNF1A 基因c.599G>A(p.R200Q)雜合突變,診斷MODY3,家系驗(yàn)證變異來源于母親,母親也存在空腹血糖異常,予飲食控制可正常,同胞弟弟也存在同一位點(diǎn)的突變,但未進(jìn)行血糖檢測。但本例先證者進(jìn)行飲食控制后血糖控制理想,因此我們還應(yīng)該注意到并非推薦MODY 最佳的治療方案適合所有患者,注意個(gè)體化治療。特別注意的是糖尿病線粒體DNA 突變分析,因MDM 常見致病m.3243A>G 人群攜帶率高,有較低的臨床外顯率,且有明顯的臨床異質(zhì)性,需謹(jǐn)慎對待。識(shí)別MDM 具有挑戰(zhàn)性,線粒體突變相關(guān)的致病表型取決于攜帶突變的mtDNA 拷貝的比例,并有組織特異性。另外T1DM 和T2DM 也存在線粒體功能障礙,線粒體糖尿病的表型也可能具有與T1DM 和T2DM 共同臨床表現(xiàn)。因此,臨床上注意區(qū)分由原發(fā)性線粒體疾病導(dǎo)致癥狀性糖尿病與原發(fā)性糖尿病對線粒體的繼發(fā)性影響非常重要。(2)檢出與先證者表型相關(guān)但不符合遺傳規(guī)律的致病/疑似致病變異:這種情況常見于染色體隱性遺傳性糖尿病檢測出一個(gè)致病雜合突變。若先證者臨床表型高度符合該基因相關(guān)疾病臨床表現(xiàn),建議聯(lián)系基因報(bào)告實(shí)驗(yàn)室做進(jìn)一步評估、分析。(3)檢出VUS:若VUS 與先證者表型高度相關(guān)且遺傳模式符合,此類變異有可能構(gòu)成糖尿病病因,建議結(jié)合先證者表型和家系驗(yàn)證情況進(jìn)一步分析,必要時(shí)組織遺傳糖尿病專家、基因報(bào)告實(shí)驗(yàn)室、遺傳學(xué)等進(jìn)行多學(xué)科討論,必要時(shí)做功能驗(yàn)證。若檢出與先證者表型相關(guān)但不符合遺傳規(guī)律VUS,先證者臨床表型高度符合該基因相關(guān)疾病臨床表現(xiàn),可考慮選擇其它檢測方法或者擴(kuò)大檢測范圍,尋找該基因的另一個(gè)致病變異。
對于新發(fā)致病突變或者有臨床意義的VUS,有條件的可進(jìn)行變異功能驗(yàn)證。首先需建立合適的糖尿病疾病模型。近年來,利用人類干細(xì)胞建立疾病模型成為研究熱點(diǎn)。人類胚胎干細(xì)胞(human embryonic stem cell lines,hESCs)及患者特異性誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(induced pluripotent stem cells,iPSC)的整體分化模型為研究遺傳疾病對人類胰腺中β 細(xì)胞發(fā)育以及人類胰腺本身的胚胎發(fā)育的影響提供了有用的工具[34]。許多研究已成功地使用CRISPR/Cas9 工具通過單個(gè)遺傳變異對β 細(xì)胞分化和功能的影響[35]。因T1DM 和T2DM 患者受自身免疫、環(huán)境以及多遺傳因素影響,利用人類干細(xì)胞分化模型對T1DM 和T2DM 建立疾病模型具有挑戰(zhàn)性[36],但是對于MODY 或PNDM 糖尿病表型糖尿病是一個(gè)理想的選擇[37]。
在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代,基因檢測已被證明是鑒定糖尿病遺傳原因重要工具。被診斷的遺傳性糖尿病,受益于精準(zhǔn)的臨床管理、遺傳咨詢、新的治療藥物。不斷報(bào)道的已知基因的新突變和新基因,有助于糖尿病發(fā)病機(jī)制的了解。在這樣的背景下,應(yīng)該重視遺傳因素在兒童糖尿病的致病作用,積極查閱相關(guān)文獻(xiàn),做好與基因檢測方、患者溝通,對基因檢測的選擇與基因報(bào)告的臨床解釋需謹(jǐn)慎。
【Author contribution】DONG Guoqing and HUANG Miao designed,wrote and revised the article. DONG Guoqing,HUANG Miao and LU Xiyan Reviewed the literatures. All authors read and approved the final manuscript as sub-mitted.