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        胸水細(xì)胞蠟塊在肺腺癌診斷及EGFR/ALK/ROS1基因突變檢測(cè)中的應(yīng)用

        2023-03-06 10:09:06林日旭李易達(dá)林義王芳蔣磊李劍敏
        關(guān)鍵詞:肺癌融合檢測(cè)

        林日旭,李易達(dá),林義,王芳,蔣磊,李劍敏

        1.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 病理科,浙江 溫州 325015;2.溫州醫(yī)科大學(xué) 第二臨床醫(yī)學(xué)院,浙江溫州 325035;3.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬溫嶺醫(yī)院 病理科,浙江 臺(tái)州 317500;4.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 中心實(shí)驗(yàn)室,浙江 溫州 325015

        肺癌是一種多步驟、多因素的疾病,具有多種組織學(xué)亞型,是全球新發(fā)癌癥病例和死亡的主要原因。中國(guó)肺癌負(fù)擔(dān)最重,占全球病例的36.98%和死亡人數(shù)的39.21%[1]。其中,非小細(xì)胞肺癌(nonsmall-cell lung cancer,NSCLC)占肺癌的85%,其中肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)占據(jù)比例最高。近年來(lái),肺癌的總體病死率已經(jīng)下降,這種下降主要是驅(qū)動(dòng)基因的靶向治療顯著提高攜帶相應(yīng)驅(qū)動(dòng)突變的患者的生存率。表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)、間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)、ROS1癌基因受體酪氨酸激酶(ROS protooncogene 1 receptor tyrosine kinase,ROS1)是主要驅(qū)動(dòng)突變因子,其突變狀態(tài)與靶向藥物的預(yù)后緊密相關(guān),為晚期NSCLC指導(dǎo)治療和判斷預(yù)后提供重要指標(biāo)[2-4]。然而,多數(shù)肺癌患者往往在晚期被確診,但是獲取足夠的腫瘤組織用于分子診斷是相當(dāng)困難的,因此尋求有效的替代樣本用于分子診斷。惡性胸腔積液(malignant pleural effusion,MPE)被定義為在癌癥中排列在肺外部和胸腔壁的薄薄組織層(胸膜)之間的液體,常見(jiàn)于多種惡性腫瘤,包括肺癌、乳腺癌和淋巴瘤,但最常見(jiàn)于肺癌。對(duì)于許多NSCLC患者,MPE可以安全且重復(fù)地獲得,并可作為分子分析的替代標(biāo)本,特別是晚期和不可切除的NSCLC患者[5-6]。因此,本研究將采用LUAD患者的MPE中分別制成細(xì)胞涂片和細(xì)胞蠟塊,進(jìn)行病理診斷及基因突變檢測(cè),為實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展及靶向治療提供分子病理學(xué)依據(jù)。

        1 資料和方法

        1.1 樣本來(lái)源 收集2017年1月至2021年12月在溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院經(jīng)蘇木精-伊紅染色法(hematoxylin-eosin staining,HE)染色及免疫組化明確診斷為L(zhǎng)UAD的胸水標(biāo)本41例,男23例,女18例,年齡37~93(66.7±13.0)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):①無(wú)法手術(shù)或獲取組織蠟塊的LUAD患者;②具有充足的胸腔積液用于細(xì)胞蠟塊和細(xì)胞HE涂片制作;③可通過(guò)醫(yī)院診療系統(tǒng)統(tǒng)計(jì)年齡、性別、臨床分期、吸煙史等完善臨床信息。排除標(biāo)準(zhǔn):①具有高血壓等心血管疾病和其他合并癥、腦轉(zhuǎn)移患者;②無(wú)配對(duì)的MPE細(xì)胞蠟塊或細(xì)胞學(xué)HE涂片。所有研究對(duì)象的臨床病理特征見(jiàn)表1。本研究經(jīng)溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院臨床研究倫理委員會(huì)審批(批件號(hào):2022第R071號(hào))。

        表1 LUAD患者臨床病理特征[n=41,例(%)]

        1.2 胸水涂片及細(xì)胞蠟塊制備 收集LUAD患者胸水,進(jìn)行常規(guī)細(xì)胞涂片后HE染色。另將涂片剩余的胸水進(jìn)行離心(12 000 r/min,5 min),棄上清液后獲取胸水細(xì)胞沉淀;加入4%中性甲醛溶液靜置、固定30 min;棄上清液,細(xì)胞倒入擦鏡紙并加入不同濃度乙醇進(jìn)行脫水;將包好細(xì)胞的擦鏡紙塊放入4%中性甲醛溶液固定,制成細(xì)胞蠟塊,進(jìn)行切片及HE染色。

        1.3 細(xì)胞蠟塊DNA獲取及突變檢測(cè)方法 準(zhǔn)備收集好的胸水細(xì)胞涂片樣本及細(xì)胞蠟塊樣本,采用核酸DNA/RNA提取試劑盒(廈門(mén)艾德生物技術(shù)有限公司,ADx-FF03,注冊(cè)號(hào):閩廈械備20150082號(hào))提取細(xì)胞中DNA/RNA,DNA/RNA純度A60/A280比值在1.8~2.0之間。

        胸水細(xì)胞涂片經(jīng)刮片后,提取DNA/RNA后,采用EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突變檢測(cè)試劑盒(可逆末端終止測(cè)序法,南京世和醫(yī)療器械有限公司)及基因測(cè)序儀(型號(hào):MiSeqDx,美國(guó)Illumina公司)進(jìn)行下一代測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)檢測(cè)EGFR/ALK/ROS1基因突變。反應(yīng)程序:采用DNA探針捕獲技術(shù),首先對(duì)提取的核酸(DNA)進(jìn)行片段化、加接頭、PCR擴(kuò)增等步驟制備文庫(kù);其后采用具有特定序列的DNA探針與文庫(kù)進(jìn)行雜交,從而特異性捕獲來(lái)自人類基因組6種基因中的部分外顯子與內(nèi)含子區(qū)域,之后通過(guò)磁珠法富集被探針捕獲的目標(biāo)區(qū)域DNA片段。在對(duì)捕獲富集后的文庫(kù)進(jìn)行定量與質(zhì)控后,采用基因測(cè)序儀(型號(hào):MiSeqDx,美國(guó)Illumina公司)進(jìn)行高通量測(cè)序。對(duì)于測(cè)序數(shù)據(jù),采用生物信息學(xué)軟件判讀6種靶基因中是否存在來(lái)自腫瘤的變異。

        胸水細(xì)胞蠟塊經(jīng)脫蠟后,提取DNA/RNA后,采用人類EGFR/ALK/ROS1基因突變聯(lián)合檢測(cè)試劑盒[突變擴(kuò)增阻滯法(amplification refractory mutation system,ARMS),廈門(mén)艾德生物醫(yī)藥有限公司]及Mx3000P實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(美國(guó)Stratagene公司)進(jìn)行基因突變檢測(cè)。反應(yīng)程序?yàn)榈谝浑A段:95 ℃5 min,1 個(gè)循環(huán);第二階段:95 ℃ 25 s,64 ℃20 s,72 ℃ 20 s,15 個(gè)循環(huán);第三階段:93 ℃25 s,60 ℃ 35 s,72 ℃ 20 s,31 個(gè)循環(huán),收集FAM及VIC信號(hào),對(duì)樣本再進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,根據(jù)說(shuō)明書(shū)判讀是否存在基因變異。

        1.4 預(yù)后分析及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS23.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)數(shù)資料以例和率表示,通過(guò)醫(yī)院電子診療系統(tǒng)收集相關(guān)臨床病理特征信息,通過(guò)電話隨訪得到對(duì)應(yīng)患者的總體生存期(OS)及無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)。隨訪起始時(shí)間為2017年1月,終點(diǎn)時(shí)間為2021年12月。使用R語(yǔ)言中的“rms”包做預(yù)后分析,采用Log-Rank檢驗(yàn)比較同一檢測(cè)方法中突變和未突變兩組生存率,使用survminer包畫(huà)出K-M曲線。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 HE染色結(jié)果 胸水細(xì)胞HE涂片見(jiàn)大量核大深染異型細(xì)胞(見(jiàn)圖1A),細(xì)胞胸水蠟塊顯示見(jiàn)數(shù)團(tuán)異型細(xì)胞(見(jiàn)圖1B);胸水細(xì)胞HE涂片結(jié)果顯示,37個(gè)陽(yáng)性,4個(gè)陰性,癌細(xì)胞鑒定敏感性為90.2%,假陰性率為9.8%;胸水細(xì)胞蠟塊結(jié)果顯示,41個(gè)陽(yáng)性,0個(gè)陰性,癌細(xì)胞鑒定敏感性為100%,假陰性率為0,4個(gè)不一致。見(jiàn)表2。

        圖1 胸水細(xì)胞涂片及胸水細(xì)胞蠟塊癌細(xì)胞HE染色結(jié)果

        表2 MPE細(xì)胞蠟塊和細(xì)胞涂片癌細(xì)胞比較(n=41,例)

        2.2 突變檢測(cè)比較及ARMS檢測(cè)結(jié)果 MPE細(xì)胞涂片EGFR突變、ALK及ROS1融合檢測(cè)結(jié)果顯示,陽(yáng)性患者29例,陰性患者12例,突變率為70.7%;MPE細(xì)胞蠟塊EGFR、ALK及ROS1基因突變檢測(cè)結(jié)果顯示,陽(yáng)性30例,陰性11例,陽(yáng)性率為73.2%。其中,MPE細(xì)胞蠟塊樣本中有28例EGFR突變,突變率為68.3%(28/41);1例ALK融合,融合基因檢出率為2.4%(1/41);2例ROS1融合,融合基因檢出率為4.9%(2/41)。MPE細(xì)胞涂片樣本中有25例EGFR突變,突變率為61.0%(25/41);3例ALK融合,融合基因檢出率為7.3%(3/41);6例ROS1融合,融合基因檢出率為14.6%(6/41),見(jiàn)表3。

        表3 MPE細(xì)胞蠟塊和涂片中EGFR突變、ALK及ROS1融合狀態(tài)比較(n=41,例)

        2.3 預(yù)后比較 41例LUAD患者預(yù)后結(jié)果顯示,相比EGFR/ALK/ROS1未突變陰性患者,胸水細(xì)胞涂片及胸水細(xì)胞蠟塊的EGFR/ALK/ROS1突變陽(yáng)性患者的總生存率顯著增加(HR=0.35,P=0.020;HR=0.11,P<0.001;見(jiàn)圖2A、圖2B),無(wú)進(jìn)展生存率也顯著增加(HR=0.25,P=0.005;HR=0.19,P=0.002;見(jiàn)圖2C、圖2D)。

        圖2 胸水細(xì)胞涂片及胸水細(xì)胞蠟塊中EGFR/ALK/ROS1 突變患者預(yù)后比較分析

        2.4 治療效果比較 MPE細(xì)胞涂片EGFR/ALK/ROS1突變陽(yáng)性的29 例患者中,治療后疾病進(jìn)展(progressive disease,PD)的患者有15例,部分緩解(partial response,PR)或病變穩(wěn)定(stable disease,SD)的患者有13例,其余1例未復(fù)查CT導(dǎo)致無(wú)法評(píng)估治療效果,因此,疾病控制率(disease control rate,DCR)為46.43%(13/28);12例EGFR/ALK/ROS1未突變陰性患者中,PD的患者有5例,PR或SD的患者有4 例,3 例患者無(wú)法評(píng)估治療效果,DCR為44.44%(4/9),見(jiàn)表4。

        表4 MPE細(xì)胞涂片突變狀態(tài)(n=41,例)

        MPE細(xì)胞蠟塊EGFR/ALK/ROS1突變陽(yáng)性的30例患者中,治療后PD的患者有15例,PR或SD的患者有13 例,其余2 例未復(fù)查CT導(dǎo)致無(wú)法評(píng)估治療效果,因此,DCR為46.43%(13/28);11例EGFR/ALK/ROS1未突變陰性患者中,PD的患者有5例,PR或SD的患者有4例,2例患者無(wú)法評(píng)估治療效果,DCR為44.44%(4/9),見(jiàn)表5。

        表5 MPE細(xì)胞蠟塊突變狀態(tài)(n=41,例)

        3 討論

        NSCLC靶向治療的快速發(fā)展使得優(yōu)化和實(shí)施用于分子檢測(cè)的細(xì)胞學(xué)標(biāo)本成為當(dāng)務(wù)之急。多達(dá)70%的NSCLC患者被診斷為晚期,通常無(wú)法進(jìn)行組織活檢[7]。盡管細(xì)胞學(xué)樣本為分子檢測(cè)提供了高質(zhì)量的材料,但分子細(xì)胞病理學(xué)尚未廣為人知或廣泛使用。MPE是腫瘤診斷的主要手段,具有更少的侵入性和重復(fù)性,部分可在原位灶前被發(fā)現(xiàn),是臨床檢查中一個(gè)潛在的候選者,對(duì)于肺癌患者精準(zhǔn)診斷、分子檢測(cè)、預(yù)后分析、個(gè)性化治療有非常重要的意義。研究表明,細(xì)胞涂片的在常規(guī)分子檢測(cè)方面優(yōu)于組織活檢[7]:①細(xì)胞涂片可以風(fēng)干或在乙醇中固定;②簡(jiǎn)單、快速現(xiàn)場(chǎng)評(píng)估;③DNA易于提取,即使長(zhǎng)時(shí)間存檔也能提供高質(zhì)量的DNA。然而,細(xì)胞涂片不均勻、細(xì)胞量較少及背景顏色深容易造成誤診,并且無(wú)法進(jìn)行免疫組化進(jìn)行復(fù)診。與胸水細(xì)胞涂片相比,胸水細(xì)胞蠟塊切片不僅能提供較多樣本且容易保存,可以進(jìn)行HE染色及免疫組化,對(duì)于腫瘤診斷更為準(zhǔn)確。本研究結(jié)果顯示MPE腫瘤細(xì)胞蠟塊診斷提高了細(xì)胞涂片診斷陽(yáng)性率,應(yīng)用價(jià)值更高,這與之前研究[8]結(jié)果類似。因此,如果有足夠的MPE可用,腫瘤學(xué)家可以嘗試細(xì)胞蠟塊分析。

        同時(shí),精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的一個(gè)重要目標(biāo)是應(yīng)用分子分型來(lái)為癌癥患者提供準(zhǔn)確的診斷和個(gè)性化的治療策略。本研究也發(fā)現(xiàn),MPE細(xì)胞蠟塊EGFR突變率(68.3%)高于涂片EGFR突變率(61.0%),優(yōu)于之前文獻(xiàn)報(bào)道的54.5%與55%[8-9];MPE細(xì)胞蠟塊ALK融合基因檢出率(2.4%)和ROS1融合基因檢出率(4.9%)分別低于細(xì)胞涂片ALK融合基因檢出率(7.3%)及ROS1融合基因檢出率(14.6%),但是與其他研究相比,ALK融合基因檢出率低于之前文獻(xiàn)報(bào)道的9.1%與11.9%,而ROS1融合基因檢出率高于其他文獻(xiàn)報(bào)道的4.5%與2.6%[9-11],這可能是由于樣本量低,腫瘤異質(zhì)性、檢測(cè)試劑盒不一樣導(dǎo)致的。最后,本研究結(jié)果表明,與EGFR/ALK/ROS1未突變LUAD患者相比,MPE細(xì)胞涂片與MPE細(xì)胞蠟塊中EGFR突變、ALK融合與ROS1融合的LUAD患者的總生存率、無(wú)進(jìn)展生存率顯著增加,這可能是由于突變患者可以通過(guò)靶向治療獲益,這與之前的研究類似:發(fā)生融合突變患者比未發(fā)生融合的患者具有更好的治療反應(yīng)[12]。同時(shí),41例LUAD患者接受治療后,發(fā)現(xiàn)EGFR/ALK/ROS1突變的LUAD患者的DCR較高于未突變的野生型患者,這也是EGFR/ALK/ROS1突變LUAD患者預(yù)后更好的原因,與之前研究報(bào)道的類似:HER2突變LUAD患者化療后的DCR均高于HER2野生型患者[13]。因此,本研究也進(jìn)一步說(shuō)明化療或靶向治療對(duì)于EGFR/ALK/ROS1突變LUAD患者具有更大的臨床獲益。

        綜上所述,雖然MPE胸水細(xì)胞也會(huì)存在局限性,但是腫瘤細(xì)胞蠟塊作為侵入性較小且可重復(fù)的替代標(biāo)本可用于病理診斷及分子檢測(cè)。

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