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        下調(diào)lncRNA ZEB1-AS1靶向促進miR-133a-3p表達抑制口腔鱗癌細(xì)胞SCC15侵襲和遷移的分子機制

        2023-02-28 10:03:54王海琴閆冰李成
        中國老年學(xué)雜志 2023年4期
        關(guān)鍵詞:水平檢測

        王海琴 閆冰 李成

        (西寧市口腔醫(yī)院口腔外科,青海 西寧 810000)

        口腔鱗癌是常見的口腔頜面惡性腫瘤,其發(fā)病率在口腔頜面全部惡性腫瘤中占80%,口腔鱗癌的發(fā)病率不斷攀升〔1〕。近些年來,基因在口腔鱗癌中的作用得到了人們的廣泛重視,口腔鱗癌中異常表達的基因參與影響腫瘤細(xì)胞的惡性生長和轉(zhuǎn)移,分子靶向基因治療口腔鱗癌成為近些年研究的熱點〔2〕。長鏈非編碼RNA(lncRNA)的轉(zhuǎn)錄本大于200 nt,沒有開放閱讀框、起始密碼子、終止密碼子,因此也沒有編碼蛋白質(zhì)的功能,lncRNA蘊含信息豐富,其在人體組織中的表達具有數(shù)量多、作用模式多、種類多等特點,lncRNA在細(xì)胞內(nèi)的各種活動如細(xì)胞分化、細(xì)胞生長、染色質(zhì)修飾等過程中發(fā)揮作用〔3〕。lncRNA鋅指E-盒結(jié)合同源異形盒1-反義鏈(ZEB1-AS)1又稱為ZEB1的反義RNA1,其長度為2 232 bp,其首次發(fā)現(xiàn)于肝癌中,后續(xù)在膀胱癌、肺癌等腫瘤中也發(fā)現(xiàn)ZEB1-AS1表達上調(diào),ZEB1-AS1具有促進腫瘤惡性生長的作用〔4~6〕。目前尚不明確ZEB1-AS1在口腔鱗癌細(xì)胞生長和侵襲中的作用。前期的預(yù)實驗發(fā)現(xiàn),ZEB1-AS1和miR-133a-3p存在互補結(jié)合位點,二者可能互為靶向關(guān)系。miR-133a-3p是一個具有抑制口腔鱗癌細(xì)胞惡性生長和轉(zhuǎn)移作用的小分子RNA,其在口腔鱗癌中表達下調(diào)〔7〕。本研究旨在探討下調(diào)ZEB1-AS1對口腔鱗癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的作用及作用機制。

        1 材料與方法

        1.1材料 口腔鱗癌細(xì)胞系CAL27購自上海晶萊生物技術(shù)有限公司;E-鈣黏蛋白(cadherin)抗體購自美國Abbkine;口腔鱗癌細(xì)胞系HN-6購自上海賓穗生物科技有限公司;口腔鱗癌細(xì)胞系SCC15購自美國ATCC;基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)-2抗體購自北京天根;ZEB1-AS1 shRNA、shRNA control由上海吉瑪構(gòu)建;N-cadherin抗體購自以色列Alomone;inhibitor control、miR-133a-3p inhibitor購自上海晨曄生物;正??谇簧掀ぜ?xì)胞系HOK購自上海榕柏生物技術(shù)有限公司;MMP-9抗體購自美國GeneTex;miR-133a-3p mimics、mimics control由北京吉田生物科技有限公司構(gòu)建。

        1.2實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(Rt-PCR)檢測口腔鱗癌細(xì)胞中ZEB1-AS1表達變化 用Trizol試劑提取口腔鱗癌細(xì)胞CAL27、HN-6、SCC15及正??谇簧掀ぜ?xì)胞HOK內(nèi)的RNA,RNA放在-80℃保存。制備逆轉(zhuǎn)錄體系,包括:2 μl的PrimeSLipt mix、2 μl的RNA,最后添加焦碳酸二乙酯(DEPC)水至8 μl,逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的條件為:37℃孵育15 min,85℃孵育5 s,4℃保存。PCR體系如下:2 μl的cDNA、0.4 μl的上游引物、5 μl的SYBR Ⅱ、0.4 μl的下游引物,加入適量的DEPC水至10 μl。PCR條件如下:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性10 s,60℃孵育1 min,72℃孵育1 min。根據(jù)樣本反應(yīng)得到的Ct值,以GAPDH作為內(nèi)參,按照2-△△Ct法計算ZEB1-AS1的表達水平。引物為:GAPDH上游:5′-GTCAACGATTTGGTCTGTATT-3′,下游:5′-AGTCTTCTGGGTGGCAGTGAT-3′,ZEB1-AS1上游:5′-TTCAAACCCATAGTGGTTGCT-3′,下游:5′-TGGGAGATACCAAACCAAC-TG-3′。

        1.3細(xì)胞轉(zhuǎn)染和分組 口腔鱗癌細(xì)胞SCC15種植到6孔板中,分別把ZEB1-AS1 shRNA及shRNA control至細(xì)胞內(nèi),依照轉(zhuǎn)染試劑(Lipofectamine 2000)說明進行轉(zhuǎn)染。將轉(zhuǎn)染了ZEB1-AS1 shRNA、shRNA control以后的口腔鱗癌細(xì)胞SCC15分別命名為sh-ZEB1-AS1組、sh-NC組,設(shè)置沒有進行細(xì)胞轉(zhuǎn)染操作的口腔鱗癌細(xì)胞SCC15為Control組。各組細(xì)胞在轉(zhuǎn)染后繼續(xù)培養(yǎng)24 h,根據(jù)1.2中Realtime PCR方法檢測細(xì)胞中ZEB1-AS1表達水平。

        1.4CCK-8方法檢測細(xì)胞增殖 以96孔板,按照每孔接種105個將細(xì)胞分成Control組、sh-NC組、sh-ZEB1-AS1組,細(xì)胞放在37℃,5% CO2培養(yǎng)箱內(nèi)常規(guī)方法培養(yǎng)24 h。分別在每個孔內(nèi)小心的加CCK-8溶液(10 μl),反應(yīng)4 h(37℃)。然后放在酶標(biāo)儀上測定波長為450 nm的OD值。計算各組細(xì)胞的存活率變化。

        1.5利用Transwell小室方法分析檢測細(xì)胞的遷移以及侵襲水平 把Control組、sh-NC組、sh-ZEB1-AS1組細(xì)胞用不添加胎牛血清的細(xì)胞培養(yǎng)液懸浮,細(xì)胞密度為每毫升含有105個細(xì)胞。將凍存在-80℃冰箱中的基質(zhì)膠取出,放在4℃過夜。取300 μl的不含血清的細(xì)胞培養(yǎng)液,添加60 μl的基質(zhì)膠,混合后,添加到上室中,置于37℃孵育4 h。于上室緩緩加100 μl的細(xì)胞溶液,吸取500 μl細(xì)胞培養(yǎng)液至下室,置于37℃條件下孵育24 h。將Transwell小室取出,磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌2次,用棉簽把沒有穿過膜的細(xì)胞擦掉,然后置于中性的甲醛溶液中孵育15 min。添加結(jié)晶紫染色30 min,PBS洗滌,風(fēng)干以后,將小室放在顯微鏡下進行觀察,計數(shù)細(xì)胞穿膜的數(shù)目作為細(xì)胞侵襲數(shù)目。在細(xì)胞遷移實驗檢測以前需要將基質(zhì)膠包被的步驟省去。

        1.6利用Western印跡分析并檢測N-cadherin、MMP-2、MMP-9、E-cadherin蛋白表達 按照100∶1的比例將放射免疫沉淀(RIPA)裂解液和苯甲基磺酰氟(PMSF)混合,放在冰上備用。將Control組、sh-NC組、sh-ZEB1-AS1組培養(yǎng)24 h,然后棄掉培養(yǎng)液上清,將配制好的蛋白抽提試劑添加到細(xì)胞內(nèi),放在冰上裂解20 min,期間每隔3 min吹打1次。12 000 r/min,4℃高速離心10 min,將上清溶液吸取并保存在-80℃。利用二喹啉甲酸(BCA)方法檢測蛋白的濃度。將蛋白溶液和5×上樣緩沖液按照4∶1的比例混合,然后放在100℃加熱5 min,置于-80℃保存。制備12%的分離膠及5%的濃縮膠。每個上樣孔中加入40 μg的蛋白樣品,初始電壓設(shè)置為70 V,電泳30 min以后,調(diào)整電壓至90 V,電泳到凝膠的底部以后,停止電泳。依照預(yù)染蛋白分子量的大小,將對應(yīng)的膠塊切下,裁剪聚偏氟乙烯(PVDF)膜,把轉(zhuǎn)膜裝置放在4℃進行,設(shè)置300 mA恒流進行常規(guī)轉(zhuǎn)膜。小心把PVDF膜浸泡于5%牛血清白蛋白配制的封閉液內(nèi),然后將裝置置于室溫內(nèi)、搖床孵育2 h。將一抗按照1∶1 000的比例稀釋,繼續(xù)放置PVDF膜于一抗內(nèi),4℃過夜。PVDF膜于1∶5 000稀釋后二抗結(jié)合后。電化學(xué)發(fā)光(ECL)顯色。利用ImageJ對各個條帶進行灰度值檢測,內(nèi)參是GAPDH。

        1.7ZEB1-AS1靶基因的預(yù)測及鑒定 本次實驗利用軟件starbase預(yù)測ZEB1-AS1靶基因,將ZEB1-AS1-WT、ZEB1-AS1-MUT分別和mimics control、miR-133a-3p mimics小心的共轉(zhuǎn)染至口腔鱗癌細(xì)胞SCC15內(nèi),轉(zhuǎn)染24 h后,以熒光素酶活性檢測試劑盒對各組細(xì)胞的熒光素酶活性進行分析。ZEB1-AS1-WT、ZEB1-AS1-MUT分別為含有ZEB1-AS1結(jié)合位點、含有突變以后的ZEB1-AS1結(jié)合位點的熒光素酶報告載體。將Control組、sh-NC組、sh-ZEB1-AS1組培養(yǎng)24 h,用Realtime PCR方法檢測細(xì)胞中miR-133a-3p表達水平,步驟完全按照1.2中進行,內(nèi)參為U6。引物為:U6上游:5′-GTCAACGATTTGGTCTGTATT-3′,下游:5′-CTCGCTTTCGGCAGCACA-3′;miR-133a-3p上游:5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游:5′-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGA-CAGCTGG-3′。

        1.8miR-133a-3p inhibitor對下調(diào)ZEB1-AS1 shRNA口腔鱗癌細(xì)胞的作用檢測 在口腔鱗癌細(xì)胞SCC15中分別將miR-133a-3p inhibitor、ZEB1-AS1 shRNA和inhibitor control、ZEB1-AS1 shRNA共轉(zhuǎn)染,命名為sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-133a-3p組、sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-NC組,細(xì)胞培養(yǎng)24 h以后,利用Realtime PCR方法測定miR-133a-3p表達水平(步驟參照1.2),CCK-8方法分析檢測各細(xì)胞的增殖水平(步驟按照1.4中進行),利用Transwell小室方法分析并檢測各組細(xì)胞遷移及侵襲水平(步驟參按照1.5中進行),利用Western印跡檢測細(xì)胞內(nèi)MMP-2、N-cadherin、MMP-9、E-cadherin蛋白的水平(步驟參按照1.6中進行)。

        1.9統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS21.0軟件進行t檢驗、方差分析。

        2 結(jié) 果

        2.1ZEB1-AS1在口腔鱗癌細(xì)胞中的表達變化 口腔鱗癌細(xì)胞CAL27、HN-6、SCC15中ZEB1-AS1水平(1.58±0.13、2.15±0.16、2.78±0.22)均明顯高于正??谇簧掀ぜ?xì)胞HOK中ZEBI-ASI水平(1.00±0.12,P<0.05)。ZEB1-AS1在口腔鱗癌細(xì)胞中表達上調(diào)??谇击[癌細(xì)胞CAL27、HN-6中ZEB1-AS1水平明顯低于口腔鱗癌細(xì)胞SCC15(P<0.05)。選擇表達水平最高的口腔鱗癌細(xì)胞SCC15用于后續(xù)實驗。

        2.2下調(diào)ZEB1-AS1對口腔鱗癌細(xì)胞增殖、侵襲和遷移影響 與Control組、sh-NC組比較,sh-ZEB1-AS1組口腔鱗癌細(xì)胞SCC15中ZEB1-AS1水平明顯減少,細(xì)胞存活率明顯下降,遷移及侵襲數(shù)目明顯降低,蛋白MMP-9、N-cadherin、MMP-2表達水平明顯降低,E-cadherin蛋白表達水平明顯增強(P<0.05)。見圖1、表1。

        1~3:Control組,sh-NC組,sh-ZEB1-AS1組圖1 Western印跡檢測各組MMP-2、MMP-9、 N-cadherin、E-cadherin蛋白表達

        表1 各組細(xì)胞存活率和遷移、侵襲數(shù)目以及MMP-2、N-cadherin、MMP-9、E-cadherin蛋白表達量

        2.3ZEB1-AS1和miR-133a-3p互為靶向關(guān)系 生物信息學(xué)軟件發(fā)現(xiàn)ZEB1-AS1和miR-133a-3p存在互補結(jié)合位點。見圖2。miR-133a-3p mimics和WT共轉(zhuǎn)染以后的熒光素酶活性降低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001)。見表2。ZEBI-AS1 shRNA轉(zhuǎn)染后,sh-ZEB1-AS1組口腔鱗癌細(xì)胞SCC15中miR-133a-3p水平(1.89±0.16)高于Control組、sh-NC組(1.00±0.10、0.98±0.12),差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P<0.05)。

        圖2 ZEB1-AS1和miR-133a-3p靶向結(jié)合位點

        表2 熒光素酶活性

        2.4miR-133a-3p inhibitor對下調(diào)ZEB1-AS1影響口腔鱗癌細(xì)胞SCC15增殖、遷移和侵襲的影響 與sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-NC組比較,sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-133a-3p組口腔鱗癌細(xì)胞SCC15中miR-133a-3p表達明顯減少,而細(xì)胞存活率明顯變大,細(xì)胞遷移及侵襲數(shù)目明顯增加,細(xì)胞內(nèi)MMP-9、N-cadherin、MMP-2蛋白量明顯變大,E-cadherin蛋白表達明顯減少(均P<0.001)。見表3、圖3。

        表3 各組細(xì)胞存活率和遷移、侵襲數(shù)目及N-cadherin、MMP-9、E-cadherin、MMP-2蛋白表達比較

        1~2:sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-NC組,sh-ZEB1-AS1+Anti-miR-133A-3p組圖3 Western印跡檢測兩組MMP-2、MMP-9、 N-cadherin、E-cadherin蛋白表達

        3 討 論

        腫瘤的惡性生長是一個極為復(fù)雜的過程,受到很多基因的表達調(diào)控作用。伴隨著基因測序技術(shù)的不斷進步和發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)非編碼RNA占人類基因組的98%,而且這些非編碼RNA在細(xì)胞發(fā)育、組織穩(wěn)態(tài)、細(xì)胞生長等過程中發(fā)揮作用〔8〕。lncRNA是一種大于200 nt的核苷酸轉(zhuǎn)錄本,絕大多數(shù)的lncRNA在組織中的表達具有組織特異性,lncRNA通過調(diào)控表觀遺傳學(xué)、細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運、印跡缺失等發(fā)揮生物學(xué)功能〔9〕。最初人們發(fā)現(xiàn),ZEB1-AS1參與肝癌細(xì)胞生長和惡性表型轉(zhuǎn)化〔6〕。后續(xù)在膠質(zhì)瘤、胃癌等腫瘤中證明ZEB1-AS1高表達促進腫瘤惡性生長,而下調(diào)ZEB1-AS1具有抑制腫瘤進展的功能〔10,11〕。本實驗表明,口腔鱗癌細(xì)胞中ZEB1-AS1表達上調(diào),并且下調(diào)ZEB1-AS1能夠在體外抑制口腔鱗癌細(xì)胞的增殖能力,提示ZEB1-AS1是口腔鱗癌中的促進因子。

        腫瘤細(xì)胞從原病發(fā)灶脫落,通過降解細(xì)胞外基質(zhì)進入微循環(huán)系統(tǒng),隨著微循環(huán)系統(tǒng)達到新的組織和器官,形成新的病灶〔12〕。腫瘤轉(zhuǎn)移的基礎(chǔ)條件之一是細(xì)胞外基質(zhì)降解,MMPs是常見的細(xì)胞外基質(zhì)降解酶,其含有很多蛋白成員,分別能夠?qū)⒉煌募?xì)胞外基質(zhì)成分降解〔13〕。MMP-2和MMP-9是與腫瘤轉(zhuǎn)移關(guān)系最為密切的MMPs成員,其表達水平升高促進腫瘤轉(zhuǎn)移〔14〕。還有研究報道顯示,EMT是腫瘤轉(zhuǎn)移的早期標(biāo)志,發(fā)生EMT的腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力也大大增加〔15〕。N-cadherin是間質(zhì)細(xì)胞標(biāo)志蛋白,其在EMT過程中表達水平上調(diào)〔16〕。E-cadherin是上皮細(xì)胞標(biāo)志蛋白,其在EMT過程中表達下調(diào)〔17〕。本實驗結(jié)果說明,下調(diào)ZEB1-AS1降低口腔鱗癌細(xì)胞侵襲、遷移和EMT水平。

        lncRNA的作用機制復(fù)雜,目前研究最多的是其可以通過與miRNA結(jié)合發(fā)揮作用,而且在不同的生理以及病理過程中,lncRNA調(diào)控的miRNA不同,且lncRNA可以同時影響多個miRNA的表達,一個miRNA也可以同時受到多個lncRNA的調(diào)控作用〔18~20〕。本實驗發(fā)現(xiàn),ZEB1-AS1和miR-133a-3p存在互補結(jié)合位點,而且下調(diào)ZEB1-AS1靶向促進miR-133a-3p表達,ZEB1-AS1作用機制可能與miR-133a-3p有關(guān)。miR-133a-3p是一個長度在20nt左右的非編碼RNA,具有很多生理功能,在人體組織中廣泛表達〔21〕。以前的研究發(fā)現(xiàn),miR-133a-3p在腫瘤中扮演抑制因子的角色,其能夠抑制卵巢癌、膀胱癌、口腔鱗癌、結(jié)腸癌等多種腫瘤細(xì)胞的生長〔7,22~24〕。本研究結(jié)果提示,下調(diào)ZEB1-AS1靶向促進miR-133a-3p表達降低口腔鱗癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移能力。

        綜上,ZEB1-AS1可能是一個口腔鱗癌促進因子,下調(diào)其表達通過靶向促進miR-133a-3p抑制口腔鱗癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,ZEB1-AS可能是未來口腔鱗癌治療的靶點?,F(xiàn)階段對于ZEB1-AS1靶向miR-133a-3p的下游具有機制還不清楚,在以后的實驗中會進行探討。

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