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        炭疽桿菌雙毒力因子熒光PCR 檢測方法的建立及應(yīng)用

        2023-02-15 13:37:36熊煒孫思揚韓偉李深偉薛蓓蕾田楨干
        中國動物檢疫 2023年2期
        關(guān)鍵詞:靈敏性炭疽雙重

        熊煒,孫思揚,韓偉,李深偉,薛蓓蕾,田楨干

        (1.上海海關(guān)動植物與食品檢驗檢疫技術(shù)中心,上海 200135;2.南昌海關(guān)技術(shù)中心,江西南昌 330038;3.上海國際旅行衛(wèi)生保健中心,上海 200335)

        由炭疽桿菌(Bacillus anthracis)引起的炭疽(anthrax)是嚴(yán)重危害人類和家畜健康的一種古老疫病,以急性、熱性、敗血性感染為主要特征。炭疽在世界各國均有發(fā)生,呈地方性流行或散發(fā),各種家畜、野生動物和人類都有不同程度的易感性[1]。炭疽芽胞有很強的抵抗力,在干燥的土壤中可存活數(shù)十年之久。依據(jù)侵染途徑不同,炭疽可分為3 種類型:皮膚性炭疽、吸入性炭疽和胃腸道炭疽[2]。近年來,我國不時有炭疽感染的報道。2017—2019年,我國共報道951 例炭疽病例,其中938 例是皮膚炭疽,占98.63%[3];2010—2019年,云南省共報告94 例人間炭疽病例[4];寧夏是我國炭疽的高發(fā)地區(qū),2019—2022年分離的毒株均為強毒株[5];2021年山東出現(xiàn)人間炭疽病例[6];2022年陜西省延長縣發(fā)生22 頭豬感染炭疽桿菌死亡事件[7]。

        炭疽致死的主要原因是炭疽桿菌在血液中大量增殖并產(chǎn)生毒素。炭疽毒素由3 種毒力因子組成,分別為保護性抗原(protective antigen,PA)、致死因子(lethal factor,LF)和水腫因子(edema factor,EF),均由pOX1 質(zhì)粒所編碼。這些毒力因子相互協(xié)同入侵機體,引起嚴(yán)重的病理性損害[8-9]。pOX2 質(zhì)粒負(fù)責(zé)編碼莢膜蛋白,可抵御炭疽桿菌繁殖體被機體吞噬。pOX1 和pOX2 質(zhì)粒任缺其一,都將大大降低炭疽桿菌的致病力[10]。

        炭疽桿菌常用的檢測方法有細菌培養(yǎng)、Ascoli沉淀試驗、莢膜免疫熒光檢測、抗體ELISA 檢測、PCR、熒光量子點免疫標(biāo)記法、RPA 等溫擴增、上轉(zhuǎn)磷光免疫層析技術(shù)等[11-15]。其中,熒光PCR 方法具有特異性強、靈敏度高、準(zhǔn)確性好等優(yōu)點。為了提高我國出入境口岸對不明粉未快件樣品的查驗效率,防范郵遞樣品的炭疽攻擊,本研究使用TaqMan 探針技術(shù),建立了針對炭疽桿菌兩種毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的雙重?zé)晒釶CR 檢測方法,并對該方法的特異性、靈敏性和穩(wěn)定性進行了試驗,以期為炭疽的精準(zhǔn)防控提供技術(shù)支撐。

        1 材料和方法

        1.1 主要試劑和儀器

        細菌DNA 提取試劑盒(HiPure Bacterial DNA kit),購自廣州美基生物科技有限公司;熒光PCR 通用試劑(Premix ExTaq),購自寶生物工程(大連)有限公司。熒光PCR 儀(QuantStudio 7 Flex),購自美國ABI 公司。

        1.2 質(zhì)粒和細菌

        含炭疽桿菌pOX1 和pOX2 保守序列的質(zhì)粒,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、嗜肺巴斯德桿菌、銅綠假單胞菌、螺桿菌、沙門氏菌、志賀氏菌、大腸桿菌、化膿棒狀桿菌、肺炎克雷伯菌、支氣管鮑特桿菌、無乳鏈球菌、蠟樣芽孢桿菌、副溶血弧菌、單增李斯特菌,由上海海關(guān)動植物與食品檢驗檢疫技術(shù)中心微生物室保存;產(chǎn)氣莢膜梭菌、布魯氏菌、豬丹毒桿菌、副豬噬血桿菌,由南昌海關(guān)技術(shù)中心提供。

        1.3 細菌核酸提取

        取500 μL 細菌培養(yǎng)液,按照細菌DNA 提取試劑盒要求進行核酸抽提,最后將DNA 用50 μL水溶解作為模板,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 引物和探針

        使用Vector NTI Suite 軟件分析GenBank 上公布的炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的基因序列,選擇保守區(qū)域,使用Primer Express 軟件設(shè)計引物和TaqMan 探針(表1)。

        表1 引物和探針序列

        1.5 檢測體系和反應(yīng)條件

        雙重?zé)晒釶CR 檢測體系:2×Premix ExTaq緩沖液10.0 μL、pOX1 和pOX2 質(zhì)粒正反向引物(30 μmol/L)各0.4 μL、pOX1 和pOX2 質(zhì)粒探針(30 μmol/L)各0.3 μL、待檢核酸模板3.0 μL,加水補足總體積至20.0 μL。單重?zé)晒釶CR 檢測體系:2×Premix ExTaq緩沖液10.0 μL、pOX1 或pOX2 質(zhì)粒正反向引物(15 μmol/L)各0.8 μL、pOX1 或pOX2 質(zhì)粒探針(15 μmol/L)0.6 μL、待檢核酸模板3.0 μL,加水補足總體積至20.0 μL。雙重和單重?zé)晒釶CR 反應(yīng)條件均為95℃ 3 min;95℃ 10 s、60℃ 30 s(收集熒光信號),共45 個循環(huán)。

        1.6 特異性試驗

        采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法分別檢測炭疽桿菌pOX1 和pOX2 質(zhì)粒以及金黃色葡萄球菌等19 種對照病原菌,驗證該方法的特異性。

        1.7 靈敏性試驗

        將炭疽桿菌pOX1 和pOX2 質(zhì)粒依次10倍比稀釋至拷貝數(shù)濃度為1×104、1×103、1×102、1×101、1×100copies/μL,采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法和單重?zé)晒釶CR 方法同時進行檢測,以水為陰性對照,驗證該方法的靈敏性。

        1.8 穩(wěn)定性試驗

        配制雙重?zé)晒釶CR 反應(yīng)體系,均分為4 份后凍存。每間隔2 個月取出1 份,用于pOX1 和pOX2 質(zhì)粒及48 份陰性組織樣本檢測,驗證該方法的穩(wěn)定性。

        1.9 臨床樣品檢測

        采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法分別對口岸入境的200 份豬肉樣本、200 份牛肉樣本和200 份羊肉樣本進行炭疽桿菌核酸檢測。

        2 結(jié)果

        2.1 特異性試驗

        采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法,同時用于炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 和其他對照病原菌的檢測。結(jié)果(圖1)顯示,僅pOX1 和pOX2 質(zhì)粒出現(xiàn)陽性擴增曲線,其余對照菌均未出現(xiàn)擴增曲線。

        圖1 特異性試驗結(jié)果

        2.2 靈敏性試驗

        將炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 分別進行10 倍比稀釋,同時用建立的雙重?zé)晒釶CR和單重?zé)晒釶CR 方法進行檢測。結(jié)果(圖2)顯示,雙重?zé)晒釶CR 和單重?zé)晒釶CR 方法對pOX1 和pOX2 質(zhì)粒的最低檢測限均為1×101copies/μL。

        圖2 靈敏性試驗結(jié)果

        2.3 穩(wěn)定性試驗

        結(jié)果顯示,4 個保存反應(yīng)體系擴增陽性質(zhì)粒的Ct 值和峰值幾乎一致,而所有陰性樣品均未出現(xiàn)擴增曲線。

        2.4 臨床樣品檢測

        結(jié)果顯示,僅陽性對照出現(xiàn)典型“S”形擴增曲線,600 份豬牛羊肉組織樣本中均未檢出炭疽桿菌陽性核酸。

        3 討論

        炭疽桿菌可以形成抵抗力強且長期存活的芽孢,因而被芽孢污染的溪谷、灘地、凹地和草場等環(huán)境可能會成為炭疽的自然疫源地。炭疽的流行有明顯的季節(jié)性,常流行于夏季,特別是在大降雨之后,雨水容易將環(huán)境中的炭疽芽孢沖刷出來,使得放牧牲畜接觸炭疽芽胞的概率增加,從而造成炭疽暴發(fā)或流行。炭疽桿菌是嚴(yán)重威脅公眾健康的致病菌之一,因此建立一種快速準(zhǔn)確的檢測方法,是迅速發(fā)現(xiàn)并控制病原擴散的有效手段。針對我國出入境郵件包裹中不明來源的粉未開展炭疽桿菌快速檢測,既保證了正常郵件快速通關(guān),又可防范通過郵件引發(fā)的惡意恐怖事件。

        基于此,本研究建立了針對炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的雙重?zé)晒釶CR 檢測方法。同時檢測2 種炭疽桿菌靶基因,既保證了檢測結(jié)果的可靠性,又能對炭疽桿菌的毒力進行預(yù)判,為后繼的處置提供更多參考。雙重?zé)晒釶CR 方法可能存在2 套檢測體系在同一反應(yīng)管內(nèi)相互干擾的情況,本研究分別比較了雙重和單重體系檢測同一份樣品的靈敏性,發(fā)現(xiàn)雙重檢測體系與單重檢測體系的最低檢測限一致。另外,如果檢測過程中出現(xiàn)單一通道陽性的情況,那么首先應(yīng)當(dāng)考慮復(fù)檢。復(fù)檢時應(yīng)重新提取核酸,并盡可能增加樣本提取量及模板添加量(減少水的補充),以確認(rèn)疑似樣品是否為單一質(zhì)粒陽性。如果確認(rèn)為單一質(zhì)粒陽性,可以初步判定為低致病性炭疽桿菌[10]。為了保證檢測結(jié)果的可靠性,本研究還驗證了該方法的特異性和穩(wěn)定性。結(jié)果顯示:19 種對照病原菌均未出現(xiàn)擴增曲線,說明特異性較強;低溫保存2、4、6、8個月的反應(yīng)體系擴增陽性質(zhì)粒的Ct 值和峰值幾乎一致,說明穩(wěn)定性良好。

        綜上所述,本研究建立的炭疽桿菌雙重?zé)晒釶CR 檢測方法特異性強、靈敏度高、穩(wěn)定性好,可滿足國境口岸對動物源性產(chǎn)品和國際郵件樣品中炭疽桿菌檢疫排查的需求。

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