熊煒,孫思揚,韓偉,李深偉,薛蓓蕾,田楨干
(1.上海海關(guān)動植物與食品檢驗檢疫技術(shù)中心,上海 200135;2.南昌海關(guān)技術(shù)中心,江西南昌 330038;3.上海國際旅行衛(wèi)生保健中心,上海 200335)
由炭疽桿菌(Bacillus anthracis)引起的炭疽(anthrax)是嚴(yán)重危害人類和家畜健康的一種古老疫病,以急性、熱性、敗血性感染為主要特征。炭疽在世界各國均有發(fā)生,呈地方性流行或散發(fā),各種家畜、野生動物和人類都有不同程度的易感性[1]。炭疽芽胞有很強的抵抗力,在干燥的土壤中可存活數(shù)十年之久。依據(jù)侵染途徑不同,炭疽可分為3 種類型:皮膚性炭疽、吸入性炭疽和胃腸道炭疽[2]。近年來,我國不時有炭疽感染的報道。2017—2019年,我國共報道951 例炭疽病例,其中938 例是皮膚炭疽,占98.63%[3];2010—2019年,云南省共報告94 例人間炭疽病例[4];寧夏是我國炭疽的高發(fā)地區(qū),2019—2022年分離的毒株均為強毒株[5];2021年山東出現(xiàn)人間炭疽病例[6];2022年陜西省延長縣發(fā)生22 頭豬感染炭疽桿菌死亡事件[7]。
炭疽致死的主要原因是炭疽桿菌在血液中大量增殖并產(chǎn)生毒素。炭疽毒素由3 種毒力因子組成,分別為保護性抗原(protective antigen,PA)、致死因子(lethal factor,LF)和水腫因子(edema factor,EF),均由pOX1 質(zhì)粒所編碼。這些毒力因子相互協(xié)同入侵機體,引起嚴(yán)重的病理性損害[8-9]。pOX2 質(zhì)粒負(fù)責(zé)編碼莢膜蛋白,可抵御炭疽桿菌繁殖體被機體吞噬。pOX1 和pOX2 質(zhì)粒任缺其一,都將大大降低炭疽桿菌的致病力[10]。
炭疽桿菌常用的檢測方法有細菌培養(yǎng)、Ascoli沉淀試驗、莢膜免疫熒光檢測、抗體ELISA 檢測、PCR、熒光量子點免疫標(biāo)記法、RPA 等溫擴增、上轉(zhuǎn)磷光免疫層析技術(shù)等[11-15]。其中,熒光PCR 方法具有特異性強、靈敏度高、準(zhǔn)確性好等優(yōu)點。為了提高我國出入境口岸對不明粉未快件樣品的查驗效率,防范郵遞樣品的炭疽攻擊,本研究使用TaqMan 探針技術(shù),建立了針對炭疽桿菌兩種毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的雙重?zé)晒釶CR 檢測方法,并對該方法的特異性、靈敏性和穩(wěn)定性進行了試驗,以期為炭疽的精準(zhǔn)防控提供技術(shù)支撐。
細菌DNA 提取試劑盒(HiPure Bacterial DNA kit),購自廣州美基生物科技有限公司;熒光PCR 通用試劑(Premix ExTaq),購自寶生物工程(大連)有限公司。熒光PCR 儀(QuantStudio 7 Flex),購自美國ABI 公司。
含炭疽桿菌pOX1 和pOX2 保守序列的質(zhì)粒,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、嗜肺巴斯德桿菌、銅綠假單胞菌、螺桿菌、沙門氏菌、志賀氏菌、大腸桿菌、化膿棒狀桿菌、肺炎克雷伯菌、支氣管鮑特桿菌、無乳鏈球菌、蠟樣芽孢桿菌、副溶血弧菌、單增李斯特菌,由上海海關(guān)動植物與食品檢驗檢疫技術(shù)中心微生物室保存;產(chǎn)氣莢膜梭菌、布魯氏菌、豬丹毒桿菌、副豬噬血桿菌,由南昌海關(guān)技術(shù)中心提供。
取500 μL 細菌培養(yǎng)液,按照細菌DNA 提取試劑盒要求進行核酸抽提,最后將DNA 用50 μL水溶解作為模板,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
使用Vector NTI Suite 軟件分析GenBank 上公布的炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的基因序列,選擇保守區(qū)域,使用Primer Express 軟件設(shè)計引物和TaqMan 探針(表1)。
表1 引物和探針序列
雙重?zé)晒釶CR 檢測體系:2×Premix ExTaq緩沖液10.0 μL、pOX1 和pOX2 質(zhì)粒正反向引物(30 μmol/L)各0.4 μL、pOX1 和pOX2 質(zhì)粒探針(30 μmol/L)各0.3 μL、待檢核酸模板3.0 μL,加水補足總體積至20.0 μL。單重?zé)晒釶CR 檢測體系:2×Premix ExTaq緩沖液10.0 μL、pOX1 或pOX2 質(zhì)粒正反向引物(15 μmol/L)各0.8 μL、pOX1 或pOX2 質(zhì)粒探針(15 μmol/L)0.6 μL、待檢核酸模板3.0 μL,加水補足總體積至20.0 μL。雙重和單重?zé)晒釶CR 反應(yīng)條件均為95℃ 3 min;95℃ 10 s、60℃ 30 s(收集熒光信號),共45 個循環(huán)。
采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法分別檢測炭疽桿菌pOX1 和pOX2 質(zhì)粒以及金黃色葡萄球菌等19 種對照病原菌,驗證該方法的特異性。
將炭疽桿菌pOX1 和pOX2 質(zhì)粒依次10倍比稀釋至拷貝數(shù)濃度為1×104、1×103、1×102、1×101、1×100copies/μL,采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法和單重?zé)晒釶CR 方法同時進行檢測,以水為陰性對照,驗證該方法的靈敏性。
配制雙重?zé)晒釶CR 反應(yīng)體系,均分為4 份后凍存。每間隔2 個月取出1 份,用于pOX1 和pOX2 質(zhì)粒及48 份陰性組織樣本檢測,驗證該方法的穩(wěn)定性。
采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法分別對口岸入境的200 份豬肉樣本、200 份牛肉樣本和200 份羊肉樣本進行炭疽桿菌核酸檢測。
采用建立的雙重?zé)晒釶CR 方法,同時用于炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 和其他對照病原菌的檢測。結(jié)果(圖1)顯示,僅pOX1 和pOX2 質(zhì)粒出現(xiàn)陽性擴增曲線,其余對照菌均未出現(xiàn)擴增曲線。
圖1 特異性試驗結(jié)果
將炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 分別進行10 倍比稀釋,同時用建立的雙重?zé)晒釶CR和單重?zé)晒釶CR 方法進行檢測。結(jié)果(圖2)顯示,雙重?zé)晒釶CR 和單重?zé)晒釶CR 方法對pOX1 和pOX2 質(zhì)粒的最低檢測限均為1×101copies/μL。
圖2 靈敏性試驗結(jié)果
結(jié)果顯示,4 個保存反應(yīng)體系擴增陽性質(zhì)粒的Ct 值和峰值幾乎一致,而所有陰性樣品均未出現(xiàn)擴增曲線。
結(jié)果顯示,僅陽性對照出現(xiàn)典型“S”形擴增曲線,600 份豬牛羊肉組織樣本中均未檢出炭疽桿菌陽性核酸。
炭疽桿菌可以形成抵抗力強且長期存活的芽孢,因而被芽孢污染的溪谷、灘地、凹地和草場等環(huán)境可能會成為炭疽的自然疫源地。炭疽的流行有明顯的季節(jié)性,常流行于夏季,特別是在大降雨之后,雨水容易將環(huán)境中的炭疽芽孢沖刷出來,使得放牧牲畜接觸炭疽芽胞的概率增加,從而造成炭疽暴發(fā)或流行。炭疽桿菌是嚴(yán)重威脅公眾健康的致病菌之一,因此建立一種快速準(zhǔn)確的檢測方法,是迅速發(fā)現(xiàn)并控制病原擴散的有效手段。針對我國出入境郵件包裹中不明來源的粉未開展炭疽桿菌快速檢測,既保證了正常郵件快速通關(guān),又可防范通過郵件引發(fā)的惡意恐怖事件。
基于此,本研究建立了針對炭疽桿菌毒力質(zhì)粒pOX1 和pOX2 的雙重?zé)晒釶CR 檢測方法。同時檢測2 種炭疽桿菌靶基因,既保證了檢測結(jié)果的可靠性,又能對炭疽桿菌的毒力進行預(yù)判,為后繼的處置提供更多參考。雙重?zé)晒釶CR 方法可能存在2 套檢測體系在同一反應(yīng)管內(nèi)相互干擾的情況,本研究分別比較了雙重和單重體系檢測同一份樣品的靈敏性,發(fā)現(xiàn)雙重檢測體系與單重檢測體系的最低檢測限一致。另外,如果檢測過程中出現(xiàn)單一通道陽性的情況,那么首先應(yīng)當(dāng)考慮復(fù)檢。復(fù)檢時應(yīng)重新提取核酸,并盡可能增加樣本提取量及模板添加量(減少水的補充),以確認(rèn)疑似樣品是否為單一質(zhì)粒陽性。如果確認(rèn)為單一質(zhì)粒陽性,可以初步判定為低致病性炭疽桿菌[10]。為了保證檢測結(jié)果的可靠性,本研究還驗證了該方法的特異性和穩(wěn)定性。結(jié)果顯示:19 種對照病原菌均未出現(xiàn)擴增曲線,說明特異性較強;低溫保存2、4、6、8個月的反應(yīng)體系擴增陽性質(zhì)粒的Ct 值和峰值幾乎一致,說明穩(wěn)定性良好。
綜上所述,本研究建立的炭疽桿菌雙重?zé)晒釶CR 檢測方法特異性強、靈敏度高、穩(wěn)定性好,可滿足國境口岸對動物源性產(chǎn)品和國際郵件樣品中炭疽桿菌檢疫排查的需求。