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        近紅外光譜技術(shù)在閩楠葉片氮含量測定中的應用

        2023-01-18 09:07:40涂白連伍艷芳劉新亮鄭永杰張月婷徐海寧
        林業(yè)資源管理 2022年6期
        關(guān)鍵詞:方法模型

        涂白連,伍艷芳,,劉新亮,鄭永杰,張月婷,徐海寧

        (1.江西農(nóng)業(yè)大學 林學院,南昌 330045;2.江西省林業(yè)科學院 國家林業(yè)草原樟樹工程技術(shù)研究中心,南昌330032)

        閩楠(Phoebebournei(Hemsl.)Yang),樟科楠屬常綠大喬木,中國特有,被列為國家二級珍稀瀕危種,同時也是江西省重要鄉(xiāng)土珍貴闊葉用材樹種[1-3]。江西省的閩楠資源豐富,楠木種植面積2萬hm2(30萬畝)以上,但在楠木人工林的營建過程中,有50%以上的人工林需根據(jù)營養(yǎng)診斷結(jié)果進行肥力提升或低產(chǎn)低效林改造,因此,亟需提升閩楠的營養(yǎng)診斷技術(shù),改善林地肥力結(jié)構(gòu),實施森林質(zhì)量精準提升。氮素(N)是閩楠生長過程中所必需的主要營養(yǎng)元素之一,同時也是限制閩楠生長和產(chǎn)量形成的重要因素,恰當?shù)氖┯玫什坏軌蛴行Т龠M閩楠生長,還能提升其產(chǎn)量[4-7]。實現(xiàn)實時、快速的檢測閩楠氮素營養(yǎng)水平,對楠木營養(yǎng)診斷技術(shù)的提升具有重大意義。傳統(tǒng)的植物氮素檢測方法主要有形態(tài)診斷、組織全氮含量診斷、硝酸鹽快速診斷和土壤化學診斷等[8],但這些方法均存在一定的弊端,難以實現(xiàn)大面積的推廣使用;現(xiàn)代的檢測方法主要有葉綠素儀診斷[9]、葉綠素熒光法[10]、遙感技術(shù)診斷[11]、可見近紅外光譜技術(shù)(NIRs)等[12]。近年來,隨著科學技術(shù)的快速發(fā)展,近紅外光譜技術(shù)也得到相當程度的發(fā)展和完善,應用近紅外光譜技術(shù)無損、快速地測定多種植物生化組分含量已經(jīng)能夠很好實現(xiàn)[13-14]。吳靜珠等[15]通過比較競爭自適應重加權(quán)采樣法(CARS)、蒙特卡羅無信息變量消除法(MCUVE)、向后間隔偏最小二乘法(BiPLS)、組合間隔偏最小二乘法(SiPLS)等4種特征譜區(qū)篩選方法,優(yōu)選出BiPLS為最適合建立番茄葉片氮含量模型的方法,并建立了最優(yōu)定量分析模型;張玉森等[16]應用近紅外光譜技術(shù)結(jié)合偏最小二乘法(PLS),經(jīng)光譜預處理和建模譜區(qū)選擇,建立了水稻鮮葉和粉末氮含量預測模型;胡永光等[17]以茶樹活體鮮葉為研究對象,利用便攜式光譜儀于田間收集了86個茶鮮葉樣品的漫反射光譜信息,通過選擇建模波段、預處理方法、建模方法等步驟,建立了茶鮮葉全氮含量近紅外光譜預測模型。

        截至目前,尚無將NIRs技術(shù)與閩楠營養(yǎng)成分檢測和應用相結(jié)合的研究報道。因此,本文將近紅外光譜分析技術(shù)與閩楠葉片氮含量預測相結(jié)合,以期得到一種快速便捷的閩楠葉片氮含量檢測方法。以江西省永豐縣官山林場國家楠木良種基地采集到的高產(chǎn)組和低產(chǎn)組共64份閩楠葉片樣品為材料,其中54份用于模型建立,余下10份用于模型的外部驗證。通過常規(guī)的組織全氮含量診斷法獲得閩楠葉片的全氮含量作為實測值,應用近紅外光譜儀采集閩楠干葉粉末樣品的近紅外光譜信息,通過化學計量學方法結(jié)合軟件分析,選擇最佳建模方法、建模波段、預處理方法,最終得到預測效果最優(yōu)的模型。用10份未知樣品對模型進行外部檢驗,結(jié)合配對樣本T檢驗評價模型,以期為閩楠營養(yǎng)水平實時測評技術(shù)的提升提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料與儀器設(shè)備

        2021年5月下旬,于江西省永豐縣官山林場楠木種子園,隨機選擇高產(chǎn)組和低產(chǎn)組各32棵單株,每單株為1個樣本,采集中部功能葉片,不帶小枝,共得到64份閩楠葉片樣品。

        所用近紅外光譜采集儀器為瑞士BUCHI公司生產(chǎn)的傅里葉變換近紅外光譜儀NIRFlex N-500,及其配套的Operator光譜采集軟件和NIRCal分析軟件,儀器光譜范圍為1 000~2 500nm,分辨率為13.38nm。

        1.2 實驗方法

        1.2.1樣品前處理

        閩楠葉片經(jīng)實驗室純水洗凈晾干,于電熱恒溫鼓風干燥箱中105℃殺青10~30min,在調(diào)至80℃烘干至恒重,經(jīng)粉碎機粉碎成粉末狀,最終得到閩楠干葉粉末樣品,裝入聚四氟乙烯封口袋中,避光干燥保存待用。其中54份作為建模集參與建模,另隨機選取10份作為外部驗證集用于檢驗模型。

        1.2.2近紅外光譜采集

        將葉片粉末裝入Petri培養(yǎng)皿中,裝樣厚度15mm,反射蓋壓實,置于近紅外光譜儀器上進行光譜測定。使用Management軟件設(shè)置光譜掃描參數(shù):掃描范圍1 000~2 500nm,掃描次數(shù)32次,分辨率13.38 nm,環(huán)境溫度保持恒定24~25℃。采取單個樣品重復裝樣3次、掃描3次,得到3張光譜,取其平均光譜作為該樣品的表征光譜。

        1.2.3氮含量測定

        參考鮑士旦[18]的方法進行閩楠養(yǎng)分含量測定,氮、磷、鉀含量分別采用凱氏定氮法、鉬銻抗比色法和火焰光度計法測定。

        1.2.4模型建立

        利用儀器配套的Operator軟件采集樣品近紅外光譜,將所測得的樣品實測值賦值于所采集得到的近紅外光譜,導入配套的化學計量學軟件NIRCal進行相關(guān)分析,依次通過選擇合適的建模方法、最佳建模波段、預處理方法建立定量分析模型。選用內(nèi)部交叉驗證的方法檢驗模型[19],外部驗證的方法評價模型的預測效果。以校正集相關(guān)系數(shù)Rc(Related coefficient of calibration)、校正集均方根誤差RMSEC(Root Mean Square Error of Calibration)、交互驗證集相關(guān)系數(shù)Rv(Related coefficient of validation)、交互驗證均方根誤差RMSEV(Root Mean Square Error of Validation)、殘差(BIAS)等5個值對模型進行評價,以確定最優(yōu)模型。

        1) 建模方法選擇。近紅外光譜分析中,主要的建模方法有偏最小二乘法(PLS)、主成分回歸(PCR)、多元線性回歸(MLR)等線性校正方法和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)、支持向量機(SVN)等非線性校正方法[20-22]。本研究主要選擇PLS和PCR這2種方法對模型進行構(gòu)建,并比較其效果。

        2) 建模波段選擇。在全光譜段上不是所有的光譜信息都是對總提取物含量的預測有用,無效的光譜信息會影響所建模型的精度[16]。因此,選擇特定有效的光譜區(qū)域參與建模能夠在一定程度上優(yōu)化模型,提高模型的預測效果。

        3) 預處理方法選擇。近紅外光譜的實測光譜為樣品的表觀光譜(Apparent spectrum),表觀光譜由能夠表征樣品的真實光譜(Real spectum)和不確定的背景(Background)組成。樣品的真實光譜包含了大部分物理、化學和生物等確定信息,其中有需要用到的確定信息,也有不需要的信息[23]。此外,光譜基線偏移、高頻噪音、斜坡背景等偏差也會影響建模的準確性,增加近紅外光譜分析的難度[24-25]。因此,在建立近紅外光譜模型時,需要對近紅外光譜進行預處理,以消除這些干擾信息對模型精度造成的影響。

        1.2.5模型的評價及外部驗證

        近紅外光譜校正模型效果的評價,可以從模型自身相關(guān)性和外部預測能力2個方面進行[26]。評價參數(shù)方面,較高的Rc和Rv,較低的RMSEC和RMSEV是一個好的預測模型應該具備的條件,其中Rv和RMSEV又更為重要。這主要是因為雖然模型具有較高的Rc和較低的RMSEC,表示其預測建模樣品的能力更強,但這也可能造成模型過擬合;而Rv和RMSEV代表模型在預測外部樣本時的準確性,更高的Rv和更低的RMSEV就表明模型預測外部樣本時更準確,同時RMSEC和RMSEV越接近越好[20,24,27-28]。模型的外部驗證方面,通過將10份未參與建模樣品的近紅外光譜圖導入模型進行預測,比對模型預測值和實測值,對模型的預測能力進行檢驗和評價。在利用SPSS 25.0軟件進行配對樣本T檢驗,驗證該方法的可靠性[28]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 閩楠葉片氮含量的實測值

        測定得到的樣品全氮含量結(jié)果如表1所示。所測64份閩楠葉片樣品的氮含量最大值為19.15g/kg,最小值為9.29g/kg,平均氮含量為13.28g/kg。樣品含量涵蓋范圍較廣,具有一定的代表性,可用于近紅外光譜技術(shù)分析。

        表1 閩楠樣品氮含量實測值描述性統(tǒng)計表Tab.1 Descriptive statistics table of the measured value of nitrogen content in P.bournei. samples

        2.2 譜圖分析和建模方法的選擇

        由圖1可看出,在整個光譜波段內(nèi),閩楠干葉粉末的近紅外光譜總體變化趨勢基本一致,這可能是由于閩楠葉片的物質(zhì)組成基本相同;但不同樣品在同一波長下反射率方面有一定的差異,并非完全相同,說明葉片的內(nèi)部組成存在一定的差異。這表明近紅外光譜分析技術(shù)可用于閩楠全氮含量的定量分析。

        圖1 所有樣品的近紅外光譜圖Fig.1 Near-infrared spectra of all samples

        本研究選用偏最小二乘法(PLS)和主成分回歸(PCR)2種方法分別建立定量模型,從中選擇出最恰當?shù)慕7椒?結(jié)果如表2所示。2種方法所建模型的Rc值均高于0.9,但PCR方法所建模型的Rv值更高,RMSEV也更低,且RMSEC和RMSEV值更為接近,所以可得出PCR方法建立的模型效果更好。

        表2 不同建模方法氮含量預測模型表現(xiàn)比較Tab.2 Comparison of model performance of nitrogen content prediction by different modeling approaches

        2.3 特征波段的選擇

        應用PCR方法,選擇不同的光譜區(qū)域建模,結(jié)果如表3所示。雖然在3個波段內(nèi)建立的模型Rc值均高于0.9,但觀察表中數(shù)據(jù)會發(fā)現(xiàn)在1 000~1 350nm,1 400~2 000 nm范圍內(nèi)建立的模型具有更高的Rv值和更低的RMSEV值,且其RMSEC值和RMSEV值最為接近。由此表明,選擇1 000~1 350nm,1 400~2 000 nm波段建立的模型效果更好。

        表3 不同光譜波段范圍氮含量預測模型表現(xiàn)比較Tab.3 Comparison of the performance of nitrogen content prediction models in different spectral band ranges

        2.4 預處理方法的選擇

        選擇1 000~1 350,1 400~2 000nm建模波段,使用標準化(Normalization)、導數(shù)(Derivatives)、平滑(Smoothing)等方法對光譜進行預處理,其結(jié)果如表4所示。經(jīng)一階導數(shù)(db1)、二階導數(shù)(db2)、SG(savitzky-golay filter)平滑、結(jié)合單位長度歸一化(nle)、乘法散射校正MSC和SNV標準化等預處理方法所建立的模型,各參數(shù)較為接近,但仔細比較后發(fā)現(xiàn),經(jīng)“一階導數(shù)(db1)、平滑SG(savitzky-golay filter)和結(jié)合單位長度歸一化(nle)”預處理方法所建立的模型具有更高的Rv值和更低的RMSEV,效果最佳。圖2為經(jīng)預處理后所有樣本的光譜圖。

        表4 不同光譜預處理方法氮含量預測模型表現(xiàn)比較Tab.4 Comparison of the performance of nitrogen content prediction models with different spectral pretreatment methods

        2.5 模型的建立

        選擇1 000~1 350nm,1 400~2 000nm組合波段,經(jīng)一階導數(shù)、平滑SG和結(jié)合單位長度歸一化預處理,利用PCR方法建立閩楠葉片氮元素含量模型,模型的各參數(shù)如表5所示。圖3是模型內(nèi)部交叉驗證預測值和實測值之間的關(guān)系圖,由圖可知,模型的預測值和樣品實測值間沒有顯著差異,且偏差較小。

        圖2 光譜預處理效果圖Fig.2 Effect diagram of spectral pre-treatment

        表5 近紅外模型建立結(jié)果參數(shù)Tab.5 Parameters of near-infrared model establishment result

        圖3 預測值與實測值關(guān)系圖Fig.3 Relationship between predicted values and measured values

        2.6 模型的驗證

        將10個未知樣品的近紅外光譜圖導入模型檢驗所建模型的預測能力,結(jié)果如表6所示。預測值和實測值的相對偏差在0.070%~0.705%范圍內(nèi),預測值與實測值接近,表明模型的預測值和實測值具有較高的相關(guān)性。

        采用統(tǒng)計學分析方法,結(jié)合SPSS分析軟件,對閩楠樣品氮含量的預測值和實測值進行配對樣本T檢驗,結(jié)果如表7所示。P值為0.116,大于0.05,沒有顯著差異,說明NIR結(jié)合PCR對閩楠葉片粉末樣品的氮元素含量進行快速分析是可行的。

        表6 閩楠葉片氮含量外部驗證結(jié)果Tab.6 The results of external verification of nitrogen content in leaves of P.bournei

        表7 外部驗證預測值與實測值T檢驗結(jié)果Tab.7 T-test results of predicted and measured values of external verification

        3 討論與結(jié)論

        研究結(jié)果表明,借助近紅外光譜儀,采集閩楠干葉粉末的光譜數(shù)據(jù),結(jié)合其傳統(tǒng)分析方法測得的理化值,經(jīng)化學計量學分析方法處理可建立閩楠葉片氮含量預測模型。所建模型經(jīng)外部檢驗,結(jié)果也無顯著差異,這說明應用近紅外光譜分析技術(shù)建立閩楠葉片氮含量預測模型可行,該方法具備一定的創(chuàng)新性,可為閩楠營養(yǎng)成分檢測技術(shù)的改善提供參考。

        相比于傳統(tǒng)的化學分析方法,近紅外光譜技術(shù)有著分析快速、無損,可實施大批量樣品快速檢測和實時在線分析的特點[29],已逐漸替代傳統(tǒng)分析方法,在工農(nóng)業(yè)分析領(lǐng)域得到了廣泛的運用[30]。在植物氮含量檢測方面,近紅外光譜分析技術(shù)相關(guān)的研究現(xiàn)階段主要集中在農(nóng)業(yè)經(jīng)濟作物:小麥[31-32]、蘋果[27,33-35]、茶[17,36]等方面,對于林業(yè)經(jīng)濟樹種方面的研究較少[37]。本研究針對閩楠葉片建立近紅外光譜氮含量檢測模型,與前人的研究相比:建模方法方面,凌智剛等[38]利用偏最小二乘回歸方法建立的煙葉的總氮含量檢測模型,得到了較高精確度的模型,本研究采用的建模方法為主成分回歸,對比使用偏最小二乘法所建立的預測效果更好。樣品光譜采集方式方面,本研究參與建模的樣品為閩楠干葉粉末,這在一定程度上規(guī)避了閩楠葉片水分對葉片光譜造成的影響,但制作葉片粉末樣品的過程較繁瑣。以往有大量的學者直接應用植物鮮葉構(gòu)建相關(guān)的營養(yǎng)成分檢測模型[16-17,33,39],因此下一步可對閩楠鮮葉光譜進行研究,利用閩楠鮮葉直接構(gòu)建閩楠葉片氮含量近紅外光譜預測模型。植物葉片有機成分含量檢測方面,集中在氮含量檢測方面的研究較多,但也有學者運用近紅外光譜技術(shù)對葉片其他有機成分的檢測進行了研究,石吉勇等[40]應用近紅外光譜技術(shù)結(jié)合人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(BP-ANN)算法建立了黃瓜葉片磷元素虧缺快速診斷模型,模型識別率達到100%。前人的研究結(jié)果表明,應用近紅外光譜技術(shù)檢測植物葉片的磷、鉀等營養(yǎng)成分是可行的,因此,后期可嘗試對閩楠其他營養(yǎng)成分(如P,K等)的近紅外預測模型進行相關(guān)研究,可為閩楠營養(yǎng)成分的快速、實時檢測提供新的技術(shù)途徑。

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