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        肺炎支原體SAT 檢測的室內(nèi)質(zhì)量控制與室間質(zhì)量評(píng)價(jià)

        2023-01-15 06:08:02許佳音李亞迪劉子晗韓欣洋魏光燦郝軍榮董明綱劉心星
        神經(jīng)藥理學(xué)報(bào) 2022年2期
        關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)室檢測

        王 冰 許佳音 李亞迪 劉子晗 韓欣洋 魏光燦 郝軍榮,2 李 雙 董明綱 劉心星

        1.河北北方學(xué)院藥學(xué)院,張家口,075000,中國

        2.河北省神經(jīng)藥理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,張家口,075000,中國

        3.張家口健垣精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)有限公司,張家口,075000,中國

        4.河北北方學(xué)院學(xué)報(bào)編輯部,張家口,075000,中國

        支原體肺炎(mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)是一種主要的非典型肺炎,在流行病期間,肺炎支原體(mycoplasma pneumoniae,MP)在普通人群中引起20% 至40% 的社區(qū)獲得性肺炎(communityacquired pneumonia,CAP),在封閉人群中高達(dá)70%[1]。而且MPP 好發(fā)于兒童或青少年,在門診患兒中約20%~40%感染MP,而住院CAP 患兒中感染率約為10%~20%[2-3],發(fā)病無明顯季節(jié)性[4]。并且MPP 有一定的傳染性,有臨床統(tǒng)計(jì)顯示,自二十世紀(jì)九十年代以后支原體肺炎有大流行趨勢[5]。其發(fā)病機(jī)制主要是肺炎支原體直接與間接損傷,導(dǎo)致支原體吸附在呼吸道黏膜上皮細(xì)胞引起氧化應(yīng)激反應(yīng)或者引起呼吸系統(tǒng)以外的反應(yīng)及免疫功能抑制或紊亂等[6]。支原體肺炎臨床上以發(fā)熱、無痰或者少痰的持續(xù)性咳嗽為主要表現(xiàn),也有厭食、胸骨下疼痛等特征,從癥狀上很難與其他肺炎相區(qū)別。對(duì)MP 進(jìn)行早期快速診斷不僅可以降低并發(fā)癥的發(fā)生率,也可遏制其繼續(xù)傳播,減輕患者及家人的痛苦。RNA 實(shí)時(shí)熒光恒溫?cái)U(kuò)增檢測技術(shù)(simultaneous amplification and testing,SAT)可以用于MP 感染早期診斷。

        SAT 是以rRNA 為靶標(biāo),與帶有T7 啟動(dòng)子的引物結(jié)合,開始逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;在M-MLV RT 酶的R Nase H 活性下,靶標(biāo)RNA 鏈降解,形成單鏈cDNA;之后反向引物與cDNA 結(jié)合,在M-MLV RT 酶的聚合酶活性作用下,產(chǎn)生靶標(biāo)核酸(RNA)的一個(gè)雙鏈DNA 拷貝,且該雙鏈帶有T7 啟動(dòng)子,在T7 RNA 聚合酶的作用下,一條DNA 雙鏈上產(chǎn)生多個(gè)(100~1 000 個(gè))RNA 拷貝;每一個(gè)RNA 拷貝再從反轉(zhuǎn)錄開始下一個(gè)擴(kuò)增循環(huán);同時(shí),帶有熒光標(biāo)記的探針和拷貝的RNA 特異結(jié)合,產(chǎn)生熒光。檢驗(yàn)結(jié)果根據(jù)實(shí)時(shí)熒光信號(hào)的出現(xiàn)時(shí)間和強(qiáng)度,對(duì)檢驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行判定。

        與傳統(tǒng)的PCR 檢測DNA 技術(shù)相比SAT 技術(shù)具有更高的準(zhǔn)確性。并且MP-DNA 提取采用煮沸裂解法,而MP-SAT 的提取采用磁珠提取法,相關(guān)研究證實(shí),磁珠法的提取效率是煮沸裂解法的10 倍[7],大大縮短了檢驗(yàn)所需時(shí)間,可以達(dá)到快速診斷的要求。且通過林苗苗[8]等研究可知,MP-SAT 檢測對(duì)MP 感染的診斷敏感度、特異度及準(zhǔn)確率均高于MP-DNA,可以明顯縮短窗口期,對(duì)支原體肺炎的早期快速診斷具有重要意義。

        本研究在張家口健垣醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室采用SAT 檢測方法對(duì)MP 進(jìn)行檢測,結(jié)合質(zhì)控品、陽性對(duì)照、陰性對(duì)照以及內(nèi)標(biāo)信號(hào)檢測結(jié)果的比較驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)方法的精密度和準(zhǔn)確性以完成室內(nèi)質(zhì)量控制(internal quality control,IQC),并將對(duì)質(zhì)控品的檢測結(jié)果與天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供的MP 標(biāo)本檢測結(jié)果進(jìn)行比較進(jìn)行室間質(zhì)量評(píng)價(jià)(external quality assessment,EQA)。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        1.1.1 試劑

        MP 核酸檢測試劑盒,批號(hào):2018.01.01,上海仁度生物科技有限公司提供;試劑盒A:裂解液、核酸提取液、洗滌液;試劑盒B:反應(yīng)液、酶液、檢測液、陽性對(duì)照、內(nèi)標(biāo)、陰性對(duì)照;0.9%生理鹽水。

        1.1.2 儀器

        TL-998 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀,西安天隆科技;HWS-24 電熱恒溫水浴鍋,上海一恒科技;Mini-6k 微型離心機(jī),常州梅香儀器;QL-901 漩渦混勻器,上海雙旭科技;BHC-1300IIB2 生物安全柜,上海一恒科技;移液器,大龍科技;TU-100C 干式恒溫儀,上海一恒科技;5~120 μL 連續(xù)加樣槍,大龍醫(yī)療。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 標(biāo)本處理

        將天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供MP 的9例樣本與適量的生理鹽水混勻,將此混合液和裂解液按照1∶1 比例(各取500 μL)混勻備用,即為待測樣品。

        1.2.2 試劑準(zhǔn)備

        將試劑盒A 和B 置于室溫下溶解,充分混勻。并將試劑盒B 內(nèi)各試劑充分溶解后離心,放到桌面靜置備用。其中檢測液要避光保存,且所有試劑應(yīng)避免反復(fù)凍融。

        擴(kuò)增檢測液的準(zhǔn)備:以每個(gè)樣品40 μL 反應(yīng)液和25 μL 檢測液的比例,配制所需擴(kuò)增檢測液,混勻,3 000~4 000 rpm 離心10 秒備用。

        稀釋內(nèi)標(biāo):取90 μL 裂解液于EP 管內(nèi),再加入10 μL內(nèi)標(biāo),進(jìn)行10 倍稀釋,混勻備用。

        質(zhì)控品稀釋:取質(zhì)控品10 μL,加入90 μL 的裂解液混勻,作為陽性對(duì)照。取上述陽性對(duì)照40 μL,再加入360 μL 的裂解液進(jìn)行10 倍稀釋;在稀釋10 倍質(zhì)控品的基礎(chǔ)上再稀釋10 倍,進(jìn)行100 倍稀釋。同理再進(jìn)行1 000 倍稀釋,其中100 和1 000 倍稀釋分別準(zhǔn)備四管。

        1.3 操作流程

        將MP 質(zhì)控品進(jìn)行10 倍稀釋后作為陽性對(duì)照,并在陽性對(duì)照的基礎(chǔ)上進(jìn)行10 倍、100 倍和1 000 倍的稀釋,其中100 倍和1 000 倍稀釋重復(fù)進(jìn)行四次,與陰性對(duì)照和陽性對(duì)照在相同條件下,采用SAT 法對(duì)進(jìn)行檢驗(yàn),觀察曲線,檢測靈敏度和精密度。并將天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供MP 的多例樣本,進(jìn)行檢測。

        1.3.1 質(zhì)控樣品準(zhǔn)備

        首先準(zhǔn)備11 個(gè)1.5 mL EP 管,以陰性對(duì)照、稀釋后的質(zhì)控品和陽性對(duì)照的順序依次標(biāo)記為陰性對(duì)照、質(zhì)控品10 倍、100 倍A、100 倍B、100 倍C、100 倍D、1 000 倍A、1 000 倍B、1 000 倍C、1 000 倍D 和陽性對(duì)照。再準(zhǔn)備11 個(gè)1.5 mL EP 管,依次標(biāo)記為陰性對(duì)照、MP①、MP②、MP③、MP④、MP⑤、MP⑥、MP⑦、MP⑧、MP⑨和陽性對(duì)照。

        每管分別加入混勻的100 μL 核酸提取液和10 μL步驟1.2.2 中稀釋好的內(nèi)標(biāo)。

        陰性對(duì)照、陽性對(duì)照和質(zhì)控品稀釋管中各加入200 μL 的生理鹽水和200 μL 的裂解液。

        陰性對(duì)照管中加入10 μL 的陰性對(duì)照,混勻。樣本管中加入待測樣品400 μL,混勻。陽性對(duì)照和質(zhì)控品稀釋管中各加入10 μL相應(yīng)的陽性對(duì)照和稀釋的質(zhì)控品,混勻。

        將所有充分混勻的EP 管,置于60℃電熱恒溫水浴鍋中保溫5 min,然后再室溫放置10 min。

        1.3.2 樣品RNA 手工提取

        將所有EP 管置于磁珠分離裝置上,靜置5 min,待磁珠清晰地吸附于管壁內(nèi)側(cè)后,用移液器吸干凈管蓋和管里的氣泡和液體,保留磁珠吸凈后應(yīng)清晰可見磁珠。每管加入1 mL 洗滌液,盡量將磁珠沖洗下來,渦旋混勻。洗滌步驟進(jìn)行兩次。將EP 管移出,每管分別加入40 μL 擴(kuò)增檢測液,渦旋混勻,取30 μL 混懸液于新的微量反應(yīng)管中待測。

        1.3.3 核酸擴(kuò)增檢測

        打開熒光檢測儀器并完成預(yù)熱:設(shè)定反應(yīng)條件:溫度為42℃,40 個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)1 min,熒光素通道設(shè)定為F1 和F2,熒光信號(hào)每分鐘收集一次,反應(yīng)體系30 μL。

        將上述準(zhǔn)備好的微量反應(yīng)管置于已設(shè)置好的干式恒溫儀中,其中60℃保持10 min,42℃保持5 min,同時(shí)將酶也預(yù)熱到42℃。用連續(xù)加樣器向每個(gè)微量反應(yīng)管中分別加入10 μL 已預(yù)熱的酶液,立即蓋上管蓋,渦旋混勻。微量反應(yīng)管迅速轉(zhuǎn)至熒光檢測儀器,立即啟動(dòng)反應(yīng)程序,期間不要隨意退出界面。

        1.4 觀察指標(biāo)

        1.4.1 室內(nèi)質(zhì)量控制

        靈敏度檢測:通過觀察10 倍稀釋、100 倍稀釋和1 000 倍稀釋質(zhì)控品的曲線,看稀釋曲線是否為較完美的“S”形曲線,是否顯示陽性,且隨著濃度的減小,觀察擬合熒光數(shù)據(jù),從而觀察檢測方法的靈敏度。

        精密度檢測:觀察100 倍稀釋的4 條曲線和1 000倍稀釋的4 條曲線,通過比較曲線的重復(fù)性觀察檢測方法的精密度。

        1.4.2 室間質(zhì)量評(píng)價(jià)

        將天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供的9 例MP 標(biāo)本,用SAT 檢測方法進(jìn)行盲測,并將本實(shí)驗(yàn)室的檢測結(jié)果與天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供的結(jié)果進(jìn)行對(duì)比,進(jìn)行EQA。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 室內(nèi)質(zhì)量控制

        2.1.1 靈敏度檢測

        對(duì)比質(zhì)控品10 倍、100 倍和1 000 倍稀釋的曲線,發(fā)現(xiàn)1 000 倍稀釋的質(zhì)控品能夠檢出陽性結(jié)果,近似為“S”型曲線,CT 值小于30 循環(huán)數(shù),且隨著濃度的減小,擬合熒光數(shù)據(jù)也減小(Fig.1),表明在1 000 倍稀釋的情況下,能夠檢測出具有應(yīng)用價(jià)值的結(jié)果,即靈敏度高。

        Fig.1 The curves of quality control products diluted at 10、100 and 1 000 are compared

        2.1.2 精密度檢測結(jié)果

        對(duì)比100 倍稀釋的四條曲線(Fig.2);對(duì)比1 000 倍稀釋的四條曲線(Fig.3),均為“S”形曲線,重復(fù)性良好,即精密度高。

        Fig.2 Comparison of curves diluted by 100A,100B,100C and 100D

        Fig.3 Comparison of curves diluted by 1 000A,1 000B,1 000C and 1 000D

        2.2 室間質(zhì)量評(píng)價(jià)

        以陰性看內(nèi)標(biāo)、陽性看靶標(biāo)的標(biāo)準(zhǔn)觀察,發(fā)現(xiàn)只有第一個(gè)標(biāo)本為陽性,其余均為陰性(Fig.4、Fig.5),張家口健垣醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室檢測結(jié)果與天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供的結(jié)果一致(Tab.1),準(zhǔn)確度極高,符合EQA 的要求,表明這次室間比對(duì)實(shí)驗(yàn)通過。

        Tab.1 MP-RNA test

        Fig.4 Comparison of positive control,MP①,MP②,MP ③,MP④ and negative controls

        Fig.5 Comparison of negative control,MP⑤,MP⑥,MP⑦,MP⑧,MP⑨ and negative controls

        3 討論與結(jié)論

        當(dāng)前用于診斷MP 感染引起的肺炎的方法主要有血清學(xué)診斷、分離培養(yǎng)和分子生物學(xué)的診斷。MP 分離培養(yǎng)是診斷MP 感染的金標(biāo)準(zhǔn)[9]。然而它的成功培養(yǎng)不僅需要特殊的培養(yǎng)基、嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生環(huán)境,還需要耗費(fèi)長時(shí)間進(jìn)行培養(yǎng),樣本來源的途徑等因素對(duì)MP感染的診斷也具有重要的影響。并且有結(jié)果顯示利用分離培養(yǎng)的方法靈敏度僅為60%[10],對(duì)于我們要達(dá)到早期快速臨床診斷的要求相距較遠(yuǎn)。在我國常通過檢測血清學(xué)中MP 特異性抗體來判斷是否是MP 感染,然而隨著試劑盒商品化,患者年齡和標(biāo)本采集時(shí)間等對(duì)MP感染的診斷產(chǎn)生影響,Beersma 等[11]以實(shí)時(shí)定量PCR 為金標(biāo)準(zhǔn),比較12 種商品試劑盒的靈敏度和特異性的實(shí)驗(yàn)中得到證實(shí)??贵w檢測是目前國內(nèi)MP 檢測的主要診斷手段。然而,單一的血清學(xué)檢測,無論樣本中抗體滴度是否高,對(duì)MPP 的早期診斷價(jià)值有限[10]。

        支原體肺炎缺乏特異的臨床和影像學(xué)表現(xiàn),早期不易做出診斷[12],我們急需一種新方法來打破這個(gè)僵局。SAT 可在2~3 h 內(nèi)完成,非常適合MP 的快速檢測[13]。它比傳統(tǒng)的細(xì)菌培養(yǎng)和血清學(xué)分析更快,而且重現(xiàn)性良好。所以SAT 作為新型的分子診斷技術(shù),直接以存在活菌體內(nèi)的MP 病原體的RNA 片段為靶標(biāo)進(jìn)行擴(kuò)增從而達(dá)到快速診斷脫穎而出。且無創(chuàng)傷、操作簡便、靈敏度高以及能明顯縮短窗口期。更值得注意的是,SAT 技術(shù)屬于活菌檢測,不僅可以精確的檢測患者體內(nèi)有無病菌,更可以準(zhǔn)確反應(yīng)病原微生物在體內(nèi)是否存活與繁殖,便于患者的療效觀察和臨床指導(dǎo)用藥等優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于呼吸系統(tǒng)感染的檢測中。并有研究表明,MP-SAT 的檢測結(jié)果與相關(guān)研究結(jié)果相符[14-16]。在兒童MP 感染時(shí),此方法尤受推崇。

        IQC 和EQA 是實(shí)驗(yàn)室全面質(zhì)量管理體系的兩個(gè)非常重要的環(huán)節(jié)。其中,IQC 可以監(jiān)測和控制實(shí)驗(yàn)測定系統(tǒng)的精密度,有效的IQC 是保證實(shí)驗(yàn)室檢測結(jié)果可靠的關(guān)鍵因素。IQC 為檢驗(yàn)人員按照一定的頻度連續(xù)測定穩(wěn)定樣品中的特定組分,并采用一系列方法進(jìn)行分析,按照統(tǒng)計(jì)學(xué)規(guī)律推斷和評(píng)價(jià)本批次測量結(jié)果的可靠程度,以此判斷檢驗(yàn)報(bào)告是否可發(fā)出,及時(shí)發(fā)現(xiàn)并排除質(zhì)量環(huán)節(jié)中的不滿意因素[17]。將IQC 的數(shù)據(jù)同實(shí)驗(yàn)室間進(jìn)行對(duì)比,能同時(shí)提供正確度和精密度的信息,可用于評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)室的檢測的質(zhì)量。

        本研究依據(jù)2012 版《醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力認(rèn)可準(zhǔn)則》和2012 版《醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力認(rèn)證準(zhǔn)則》對(duì)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室檢測系統(tǒng)性能評(píng)價(jià)的相關(guān)要求,對(duì)SAT 定性檢測項(xiàng)目的分析性能進(jìn)行評(píng)價(jià)。通過實(shí)驗(yàn)室內(nèi)用SAT檢測MP 的方法靈敏度、精密度都好,說明實(shí)驗(yàn)方法符合驗(yàn)證要求。將用SAT 對(duì)MP 的檢測結(jié)果與天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行EQA,結(jié)果顯示,在目前的實(shí)驗(yàn)條件和方法下,本實(shí)驗(yàn)室用SAT 方法檢測MP 的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠。要想達(dá)到這樣結(jié)果,需要對(duì)實(shí)驗(yàn)室的實(shí)驗(yàn)人員進(jìn)行嚴(yán)格培訓(xùn),并對(duì)正確的樣本采集、留取、操作和保存以及對(duì)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的溫度、濕度、壓力等進(jìn)行嚴(yán)格控制,而且需要保證實(shí)驗(yàn)使用的設(shè)備與試劑均符合要求。

        本研究結(jié)果顯示:IQC 的驗(yàn)證是通過觀察靈敏度、精密度和準(zhǔn)確度來進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示良好,符合對(duì)IQC 的要求,表明本實(shí)驗(yàn)室對(duì)SAT 定性檢測MP 的分析符合;通過與天津兒童醫(yī)院兒研所分子實(shí)驗(yàn)室提供的結(jié)果進(jìn)行EQA,顯示結(jié)果一致,表明本實(shí)驗(yàn)室對(duì)SAT技術(shù)檢測MP 的EQA 通過驗(yàn)證,該SAT 技術(shù)檢驗(yàn)MP能夠在本實(shí)驗(yàn)室投入使用。

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