趙敏華,劉 吉,葛晨輝,徐晨曦,蔡曉鋒,王小麗
(上海師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海 200234)
菠菜(Spinacia oleraceaL.)屬于莧科藜亞科菠菜屬植物[1],是世界性重要葉用蔬菜,具有很高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值.菠菜的生長(zhǎng)需要充足的氮素供應(yīng),尤其是硝態(tài)氮,但過(guò)量硝態(tài)氮會(huì)導(dǎo)致菠菜硝酸鹽積累,影響品質(zhì).生產(chǎn)上通常適當(dāng)配施銨態(tài)氮以提高品質(zhì)和產(chǎn)量,如SCHORTEMEYER等[2]發(fā)現(xiàn),氮肥組合中銨態(tài)氮肥比例的增加,可顯著降低硝酸鹽和亞硝酸鹽在菠菜體內(nèi)的累積,提高菠菜莖葉中的氨基酸總量,同時(shí)獲取最大的生物量.因此研究菠菜對(duì)銨態(tài)氮的吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)及利用的機(jī)制,對(duì)于合理配施銨態(tài)氮肥,提高菠菜生產(chǎn)效能和品質(zhì)有重要指導(dǎo)意義.
植物對(duì)銨態(tài)氮的吸收及體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)都依賴(lài)銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(AMT).植物銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族屬于AMT/MEP/Rh家族,主要由兩個(gè)亞家族AMT1和AMT2構(gòu)成[3].為適應(yīng)土壤中銨態(tài)氮供應(yīng)濃度的變化,植物進(jìn)化發(fā)展出低親和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(LATS)和高親和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(HATS),以充分吸收利用環(huán)境中的高、低銨態(tài)氮營(yíng)養(yǎng)[4-6].由于土壤中銨態(tài)氮含量較硝態(tài)氮低,植物銨態(tài)氮的吸收主要是由HATS構(gòu)成.目前已經(jīng)從擬南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、番茄(Solanum lycopersicum)等植物中鑒定到不同數(shù)目的AMT蛋白(表1),并對(duì)部分AMT功能開(kāi)展了研究.此外,AMT不僅參與根部銨態(tài)氮的吸收運(yùn)轉(zhuǎn),還參與地上部分銨態(tài)氮的運(yùn)輸和再分配、種子銨態(tài)氮的儲(chǔ)存,以及銨態(tài)氮由共生菌向宿主植物的運(yùn)輸和根部發(fā)育等生理過(guò)程[7].菠菜AMT研究尚未見(jiàn)系統(tǒng)報(bào)道.本文作者通過(guò)生物信息學(xué)方法篩選鑒定菠菜AMT編碼基因,并研究其對(duì)不同氮素形態(tài)配比的響應(yīng)模式,初步解析菠菜AMT基因家族在氮素響應(yīng)中的功能.
表1 部分植物AMT1和AMT2家族成員數(shù)目表
選取飽滿一致的Sp75菠菜種子,經(jīng)75%(體積分?jǐn)?shù))酒精消毒后,播種于吸滿蒸餾水的工字孔育苗海綿中,待長(zhǎng)出2片子葉后,選取長(zhǎng)勢(shì)一致的幼苗定植于10 L水培箱中.水培營(yíng)養(yǎng)液采用1/2 Hoagland-Arnon配方.水培至兩葉一心期開(kāi)始氮處理實(shí)驗(yàn).共設(shè)置7個(gè)氮處理,包括:①缺氮(不含氮);②硝銨比7.0∶0.5(7.0 mmol·L-1NO3--N+0.5 mmol·L-1NH4+-N);③硝銨比7.5∶0(7.5 mmol·L-1NO3--N);④硝銨比0∶0.5(0.5 mmol·L-1NH4+-N);⑤硝銨比0∶7.5(7.5 mmol·L-1NH4+-N);⑥硝銨比0.25∶0(0.25 mmol·L-1NO3--N);⑦正常1/2 Hoagland-Arnon配方處理,硝銨比為7.0∶0.5.處理②~⑦前,均先缺氮預(yù)處理2 d.每個(gè)處理均設(shè)置3次重復(fù).采用CaCl2,K2SO4,KH2PO4調(diào)節(jié)不同處理中Ca,K,P的濃度,使它們保持一致,其余營(yíng)養(yǎng)由MgSO4·7H2O,NaFeEDTA,及Amon微量元素配方提供.調(diào)節(jié)水培營(yíng)養(yǎng)液pH值為6.0±0.2.處理全程在人工氣候室中完成,溫度為20℃/18℃(光照/黑暗),光周期為10 h/14 h(光照/黑暗),濕度控制在68%左右.分別于氮素處理0,0.5,2,24,48 h后取樣,-80℃保存,用于氮素響應(yīng)表達(dá)譜分析.同時(shí)采集正常供氮(1/2 Hoagland-Arnon)培養(yǎng)1周的幼苗葉片、葉柄及根樣品,-80℃保存,用于組織表達(dá)譜分析.
將擬南芥AMT蛋白序列在菠菜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(www.spinachbase.org)中進(jìn)行同源比對(duì)搜索,并根據(jù)菠菜基因組注釋結(jié)果,剔除重復(fù)序列后獲得菠菜AMT候選序列.利用NCBI CDD在線工具(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd)預(yù)測(cè)AMT結(jié)構(gòu)域,存在完整AMT結(jié)構(gòu)域的,則認(rèn)定為菠菜AMT家族候選蛋白.利用ExPaSy(http://web.expasy.org/protparam)預(yù)測(cè)候選蛋白各項(xiàng)理化性質(zhì),包括氨基酸數(shù)量、相對(duì)分子質(zhì)量、等電點(diǎn)、脂溶系數(shù)等.利用WoLF PSORT(http://wolfpsort.hgc.jp/)和TMHMM Server 2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)分別對(duì)候選蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位和跨膜結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè).
基因結(jié)構(gòu)使用TBtools工具進(jìn)行分析,并進(jìn)行可視化操作[23].利用MEME Suite(http://meme.sdsc.edu/meme/memeintro.html/)進(jìn)行蛋白質(zhì)保守基序(motif)分析,最大保守序列鑒定數(shù)目設(shè)置為10,TBtools工具進(jìn)行基序模式可視化.利用MEGA-X軟件,采用鄰接(NJ)法構(gòu)建菠菜AMT基因家族進(jìn)化樹(shù)及其與多物種之間的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),校驗(yàn)參數(shù)bootstrap設(shè)置為1 000,其余均為默認(rèn)參數(shù).同時(shí)選取基因家族起始密碼子上游2 000 bp啟動(dòng)子片段,利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)進(jìn)行順式作用元件分析,用TBtools工具可視化.
采用Trizol法提取菠菜總核糖核酸(RNA),通過(guò)PrimeScript?RT reagent Kit with gDNA Eraser(Takara)試劑盒將提取的總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA(complementary DNA).使用Primer Premier 5進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)引物設(shè)計(jì)(表2),Tm值控制在57~61℃.最后使用TaKaRa TB Green TM Premix Ex Taq TM(Tli RNaseH Plus)試劑盒在Applied Biosystems 7500 Real Time PCR儀器上進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng).采用18s rRNA作為內(nèi)參,以2-ΔΔCT法計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量,用Sigma Plot 7.0對(duì)結(jié)果進(jìn)行作圖.采用TBtools工具繪制基因表達(dá)量熱圖,數(shù)據(jù)作log2轉(zhuǎn)換后以行為單位均一化,采用Euclidean法聚類(lèi).
表2 實(shí)驗(yàn)所用引物設(shè)計(jì)
在菠菜Sp75基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(2018),Monoe-Viroflay基因組庫(kù)(2021)中共獲得同源性較高的候選蛋白序列6條,其中5個(gè)候選蛋白在兩個(gè)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中完全相同,只有SoAMT1A(Spo21031)僅在Sp75基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(2018)中被鑒定到(表3).使用在線網(wǎng)站NCBI CCD-search進(jìn)行逐條驗(yàn)證,結(jié)果顯示:5個(gè)候選蛋白包含amt保守結(jié)構(gòu)域,1個(gè)候選蛋白包含AmtB結(jié)構(gòu)域.序列分析表明,6個(gè)SoAMT基因分布在4條染色體上(第1,4,5,6條染色體),編碼區(qū)(CDS)長(zhǎng)度在1 443~1 506 bp之間,編碼的6個(gè)AMT蛋白氨基酸數(shù)目為462~501個(gè),其中SoAMT1B、SoAMT1D包含501個(gè)氨基酸;而SoAMT2氨基酸數(shù)目最少(480個(gè)).候選蛋白的分子質(zhì)量和等電點(diǎn)范圍分別為377.829~632.678 ku和5.59~7.64.SoAMT1A預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)最低(5.59),SoAMT1B預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)最高(7.64);6個(gè)SoAMT蛋白的平均親水系數(shù)均為正值,表明它們均為疏水性蛋白.SoAMT蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果均顯示定位于質(zhì)膜上,且含有9~11個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域.
表3 菠菜SoAMTs基因家族基因數(shù)據(jù)庫(kù)信息
對(duì)擬南芥(6個(gè))、黃瓜(5個(gè))、大豆(9個(gè))、苜蓿(7個(gè))、水稻(3個(gè))、玉米(8個(gè))、百脈根(5個(gè))及菠菜(6個(gè))共49個(gè)AMT蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,結(jié)果如圖1所示.49個(gè)AMT蛋白聚成兩類(lèi):AMT1亞家族和AMT2亞家族.菠菜SoAMT2(Spo20483)與擬南芥、苜蓿、百脈根等分組到AMT2亞家族的分支上,其余5個(gè)菠菜AMT與其他物種均屬于AMT1亞家族分支.
圖1 菠菜與其他植物AMT進(jìn)化樹(shù)分析.
菠菜AMT家族基因編碼蛋白的序列分析表明,除SoAMT2(Spo20483)外,菠菜AMT基因具有類(lèi)似的編碼區(qū)和核苷酸長(zhǎng)度,如圖2(a)所示,但不同基因間,內(nèi)含子數(shù)差異較大,SoAMT1C(Spo24676),SoAMT1B(Spo24677)不含有內(nèi)含子,SoAMT2(Spo20483)含有2個(gè)內(nèi)含子,其余3個(gè)菠菜AMT基因含有1個(gè)內(nèi)含子.SoAMT2與其余5個(gè)SoAMT1蛋白保守基序有較大差異,在SoAMT1結(jié)構(gòu)域內(nèi)鑒定到10個(gè)Motif,而SoAMT2只 有4個(gè)Motif,如 圖2(b)所示.6個(gè)SoAMT蛋白均具有共同的Motif 6,如圖2(c)所 示,尤其是Motif 6中 的DFAGSGVVHLVGGIAGLWGSIIEGPR(SoAMT1亞家族)和DYSGGYVIHV SSGIAGFTAAYWVGPR(SoAMT2亞家族),與已報(bào)道的AMT保守基序D-[FYWS]-[AS]-G-[GSC]-x(2)-[IV]-x(3)-[SAG](2)-x(2)-[SAG]-[LIVMF]-x(3)-[LIVMFYWA](2)-x-[GK]-x-R[24],以及D204FAGSGMVHMVGGIAGLWGAFIESPR229[25]一致.
圖2 菠菜SoAMT家族的(a)基因結(jié)構(gòu)、(b)保守基序、(c)Motif
SoAMT啟動(dòng)子區(qū)順式調(diào)控元件分析發(fā)現(xiàn),除了典型的核心啟動(dòng)子TATA-Box外,這些序列還具有光響應(yīng)、無(wú)氧響應(yīng)以及脅迫相關(guān)的順式元件,包括缺氧脅迫元件(ARE)、ABA響應(yīng)元件(ABA,ABRE)、生長(zhǎng)素響應(yīng)元件(Auxin,TGA-element/AuxRE)、干旱誘導(dǎo)元件(Drought,MBS)、茉莉酸甲酯響應(yīng)元件(MeJA,CGTCA-motif)、水楊酸響應(yīng)元件(SA,TCA-element)以及赤霉素響應(yīng)元件(GA,TATC-box)等(圖3).不同成員順式作用元件數(shù)目和種類(lèi)存在差異,SoAMT1A(Spo21031)含有較多ABA響應(yīng)元件,SoAMT1B(Spo24677)不含有茉莉酸甲酯響應(yīng)元件,而其余成員均有該元件.SoAMT2(Spo20483)含有的ARE響應(yīng)元件數(shù)量明顯多于SoAMT1亞家族成員.
圖3 SoAMTs順式作用元件分析
SoAMT基因在菠菜不同組織部位中的表達(dá)有差異,如圖4所示:SoAMT1A(Spo21031),SoAMT1B(Spo24677),SoAMT1D(Spo05791)在地上部分的表達(dá)量明顯高于根的,而SoAMT1C(Spo24676)在根中表達(dá)量較高,SoAMT1E(Spo16971)在葉柄中表達(dá)量明顯低于葉片和根.SoAMT2(Spo20483)在根和柄中的表達(dá)量明顯高于葉片的.供試6個(gè)SoAMT基因中,SoAMT1C在葉片、柄及根中的表達(dá)量均顯著高于其他AMT基因.
圖4 SoAMT基因組織表達(dá)量分析.注:柱頭不同小寫(xiě)字母表示同一基因組織間差異顯著,下同
缺氮處理對(duì)不同SoAMT基因表達(dá)量影響不同(圖5).除SoAMT1D(Spo05791)表達(dá)量受缺氮處理影響不顯著外,隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),其余4個(gè)SoAMT1表達(dá)模式基本呈上調(diào)趨勢(shì).SoAMT1E(Spo16971),SoAMT1C(Spo24676)及SoAMT1B(Spo24677)表達(dá)量變化趨勢(shì)相似,隨處理時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)量增加,缺氮處理48 h時(shí)表達(dá)量最大,分別為對(duì)照的12.76,8.36,15.04倍,受長(zhǎng)期缺氮處理的誘導(dǎo)影響顯著.SoAMT1A(Spo21031)表達(dá)量在處理0.5 h時(shí)無(wú)顯著變化,處理2,24,48 h時(shí)顯著上調(diào),平均為對(duì)照的4.46倍.
圖5 缺氮處理下SoAMT基因表達(dá)譜
與SoAMT1表達(dá)模式不同,隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),SoAMT2(Spo20483)表達(dá)量先增加后下降,處理24 h 時(shí)與對(duì)照組(7.5 mmol·L-1NO3--N+0.5 mmol·L-1NH4+-N)差異不大,48 h時(shí)甚至低于正常供氮對(duì)照組.
以缺氮處理為對(duì)照,考察SoAMT基因?qū)Σ煌@態(tài)氮濃度的響應(yīng),結(jié)果如圖6~7所示,單獨(dú)供應(yīng)銨態(tài)氮時(shí),5個(gè)SoAMT1表達(dá)量均在處理0.5~24 h后無(wú)顯著變化,48 h后表達(dá)量上調(diào);其中SoAMT1A(Spo21031)和SoAMT1B(Spo24677)表達(dá)量在高濃度銨態(tài)氮(7.5 mmol·L-1)與低濃度銨態(tài)氮(0.5 mmol·L-1)處理下無(wú)顯著差異.不同的是,SoAMT1D(Spo05791)和SoAMT1C(Spo24676)表達(dá)量顯著受低銨態(tài)氮誘導(dǎo),而SoAMT1E(Spo16971)表達(dá)量顯著受高銨態(tài)氮誘導(dǎo).單獨(dú)銨態(tài)氮供應(yīng)下,SoAMT2表達(dá)量變化趨勢(shì)與SoAMT1正好相反,其表達(dá)量受銨態(tài)氮抑制,供試時(shí)間內(nèi)表達(dá)量均低于缺氮對(duì)照組.
圖6 不同銨態(tài)氮濃度處理下菠菜根SoAMT基因表達(dá)譜.
實(shí)驗(yàn)同時(shí)比較了不同硝態(tài)氮濃度及銨硝配比對(duì)SoAMT基因表達(dá)量的影響(圖7~8),結(jié)果發(fā)現(xiàn),單獨(dú)供應(yīng)硝態(tài)氮也能不同程度地誘導(dǎo)SoAMT1基因的表達(dá),SoAMT1A(Spo21031)對(duì)高低硝態(tài)氮濃度響應(yīng)差異不顯著,處理48 h時(shí)表達(dá)量達(dá)到峰值;SoAMT1D(Spo05791)和SoAMT1B(Spo24677)表達(dá)量分別在低硝態(tài)氮處理0.5 h和高硝態(tài)氮處理48 h時(shí)顯著上調(diào),其余處理時(shí)間下變化不大.SoAMT1C(Spo24676)和SoAMT1E(Spo16971)在低硝態(tài)氮處理0.5,2,48 h后的表達(dá)量均顯著高于缺氮對(duì)照,且在48 h時(shí)表達(dá)量達(dá)到最高.硝銨物質(zhì)的量濃度配比為7.0∶0.5時(shí),不同SoAMT1基因表達(dá)模式不同,如SoAMT1B基因在硝銨混合處理48 h時(shí),表達(dá)量達(dá)到最大值,與其在高硝處理下的表達(dá)譜更相似;硝銨混合處理下的SoAMT1D的表達(dá)譜與低銨態(tài)氮處理相似,48 h達(dá)到峰值,而SoAMT1E的硝銨混合氮響應(yīng)表達(dá)譜與其在低硝態(tài)氮處理更相似,均在2 h和48 h有明顯的上調(diào).SoAMT2氮響應(yīng)表達(dá)模式與SoAMT1不同,除高硝態(tài)氮處理48 h后,其表達(dá)量顯著上調(diào)外,其余氮處理均抑制了SoAMT2的表達(dá).硝銨混合處理下,SoAMT2表達(dá)同樣受到抑制,低于缺氮對(duì)照組.
圖7 不同氮處理?xiàng)l件下SoAMT基因表達(dá)譜比較.
綜上,缺氮(除SoAMT1D外)、銨態(tài)氮及硝態(tài)氮供應(yīng)均能不同程度地提高5個(gè)SoAMT1基因的表達(dá)量,大部分基因在48 h時(shí)表達(dá)量達(dá)到峰值;銨態(tài)氮或硝態(tài)氮供應(yīng)對(duì)SoAMT1A(Spo21031)的表達(dá)的作用不受供氮濃度的影響;低氮(銨態(tài)氮或硝態(tài)氮)顯著誘導(dǎo)SoAMT1C(Spo24676)和SoAMT1D(Spo05791)的表達(dá),而SoAMT1E(Spo16971)僅受高銨和低硝顯著誘導(dǎo);高濃度硝態(tài)氮誘導(dǎo)SoAMT1B(Spo24677)表達(dá),而銨態(tài)氮濃度對(duì)其影響差異不大.與SoAMT1相反,SoAMT2基因表達(dá)量?jī)H受短期缺氮和長(zhǎng)期高濃度硝態(tài)氮誘導(dǎo),在銨態(tài)氮存在或低硝態(tài)氮濃度處理下,其表達(dá)量受抑制.
圖8 不同硝銨濃度處理下菠菜根SoAMT基因表達(dá)譜.
本文作者在菠菜基因組數(shù)據(jù)中共鑒定得到6個(gè)AMT家族基因,其數(shù)量與已報(bào)道的作物,如擬南芥(6個(gè))、番茄(4個(gè))、菜苔(5個(gè)),黃瓜(6個(gè))等植物AMT數(shù)目大致相近,說(shuō)明菠菜AMT家族基因不存在明顯的基因重復(fù)和縮減現(xiàn)象,AMT家族數(shù)目保守性較高.同源系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,SoAMT分屬AMT1和AMT2兩個(gè)亞家族,且AMT2成員只有1個(gè).與水稻、楊樹(shù)、大豆等作物具有較多AMT2成員相比,菠菜AMT2成員數(shù)量明顯少于AMT1,不同植物中AMT1和AMT2成員數(shù)目的不同可能與其氮素吸收偏好、真菌共生及生長(zhǎng)環(huán)境有關(guān),喜銨(水稻、楊樹(shù))、固氮(大豆)等作物通常具有更多的AMT2[22,26].
與其他物種(如玉米、擬南芥、水稻等)AMT蛋白相比,SoAMT蛋白在結(jié)構(gòu)上與其高度相似,具有與擬南芥、番茄等類(lèi)似的編碼區(qū)和核苷酸長(zhǎng)度,含有AMT蛋白典型的保守結(jié)構(gòu)和保守基序,外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)也與其他許多植物物種的分析結(jié)果相類(lèi)似[4],證明了AMT蛋白結(jié)構(gòu)和基因組成的保守性.順式作用元件分析顯示,SoAMT可能參與多個(gè)激素及逆境途徑的調(diào)控,其生物學(xué)功能可能不僅局限于銨態(tài)氮的吸收與運(yùn)轉(zhuǎn),還參與逆境脅迫的響應(yīng)途徑等.
擬南芥AMT1亞家族主要存在于根部,而AMT2亞家族則廣泛分布于植物主要器官中[6].菠菜SoAMT基因的組織表達(dá)譜具有特異性,除SoAMT1D在根中表達(dá)量很低外,其余在根和地上部分中均有較高表達(dá),與其他植物的組織表達(dá)譜存在差異,可能與其獨(dú)特的生物學(xué)功能相關(guān).
已有研究表明,AMT轉(zhuǎn)錄水平受植物氮濃度及氮素形式的影響,在缺氮條件下大多數(shù)AMT基因的表達(dá)會(huì)受到缺氮誘導(dǎo)而大幅提高[9],這與本實(shí)驗(yàn)中SoAMT基因受缺氮脅迫誘導(dǎo)后表達(dá)上調(diào)結(jié)果一致.缺氮一周后恢復(fù)供氮,不同濃度的銨態(tài)氮、硝態(tài)氮處理?xiàng)l件下各基因表達(dá)譜有差異.SoAMT1A在根、葉、柄中均有較高表達(dá)量,其根部表達(dá)量受缺氮誘導(dǎo),但對(duì)銨態(tài)氮、硝態(tài)氮濃度的變化響應(yīng)差異不明顯,與擬南芥、水稻等模式植物的AMT基因同源性較小,推測(cè)SoAMT1A可能是一個(gè)組成型銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,或者不參與氮素的轉(zhuǎn)運(yùn),具體結(jié)論還有待進(jìn)一步研究證實(shí).
SoAMT1B和SoAMT1C序列同源性較高,均在根、葉、柄中具有較高的表達(dá)量,根中表達(dá)量均受缺氮和高濃度硝態(tài)氮的誘導(dǎo).不同的是,SoAMT1B對(duì)銨態(tài)氮濃度不敏感,在長(zhǎng)期高濃度和低濃度的銨態(tài)氮作用下均被誘導(dǎo)上調(diào);而SoAMT1C受低濃度的銨態(tài)氮誘導(dǎo),在煙草NtAMT1.3中也發(fā)現(xiàn)類(lèi)似氮響應(yīng)表達(dá)譜,氮饑餓和供應(yīng)NH4+、硝酸鹽的條件下,NtAMT1.3表達(dá)顯著上調(diào),且NtAMT1.3過(guò)表達(dá)促進(jìn)了植株根對(duì)NH4+的吸收,及葉片氮素的積累,本文作者推測(cè)NtAMT1.3在煙草NH4+的獲取和利用中發(fā)揮著重要作用[27].因此,SoAMT1B和SoAMT1C可能也具有類(lèi)似的銨態(tài)氮吸收運(yùn)轉(zhuǎn)功能,結(jié)合菠菜組織表達(dá)譜,SoAMT1B更可能參與菠菜地上部分銨態(tài)氮的轉(zhuǎn)運(yùn),尤其是在硝態(tài)氮供應(yīng)充足條件下(其表達(dá)水平受高硝誘導(dǎo)),負(fù)責(zé)地上部分硝態(tài)氮還原產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)和分配;SoAMT1C在根組織中表達(dá)水平最高,更可能是一個(gè)根部的銨態(tài)氮吸收轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,根據(jù)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果,SoAMT1C與AtAMT1.2也具有較高的同源性.已知AtAMT1.2轉(zhuǎn)錄水平也受缺氮誘導(dǎo),是一個(gè)高親和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,負(fù)責(zé)根質(zhì)外體中銨態(tài)氮向內(nèi)皮層細(xì)胞的轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程[9],推測(cè)SoAMT1C可能在菠菜根部銨態(tài)氮高親和吸收中發(fā)揮重要作用.更重要的是,供應(yīng)不同濃度的硝態(tài)氮以及硝銨比7.0∶0.5混施處理,也能上調(diào)SoAMT1C的表達(dá)量,但表達(dá)水平不如低銨態(tài)氮處理下高,進(jìn)一步說(shuō)明SoAMT1C可能在高親和銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)中發(fā)揮功能,并在一定程度上受硝態(tài)氮供應(yīng)的影響.SoAMT1C在硝銨互作中的功能值得進(jìn)一步深入研究.
與大部分SoAMT表達(dá)受缺氮誘導(dǎo)不同,SoAMT1D不受缺氮誘導(dǎo),且根中表達(dá)量為6個(gè)SoAMT中最低的.盡管在進(jìn)化樹(shù)上看,SoAMT1D與AtAMT1.1,AtAMT1.3具有較高的同源性,但AtAMT1.1和AtAMT1.3均受缺氮誘導(dǎo),是擬南芥高親和銨態(tài)氮吸收的主要貢獻(xiàn)者[9,28].表達(dá)譜的差異說(shuō)明SoAMT1D與AtAMT1.1,AtAMT1.3在功能上差異很大,考慮到SoAMT1D可被低濃度銨態(tài)氮誘導(dǎo),且在地上部分具有較高的表達(dá)水平,推測(cè)其負(fù)責(zé)地上部分銨態(tài)氮的高親和轉(zhuǎn)運(yùn).
SoAMT1E表達(dá)受缺氮和高濃度銨態(tài)氮誘導(dǎo),這與水稻OsAMT1.1相似,OsAMT1.1受缺氮、供氮均誘導(dǎo),高銨條件下表達(dá)量大于缺氮處理.已知OsAMT1.1是一個(gè)雙親和銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,負(fù)責(zé)銨態(tài)氮由根向地上部分的轉(zhuǎn)運(yùn),過(guò)表達(dá)OsAMT1.1能提高地上部分銨態(tài)氮含量,和籽粒產(chǎn)量的增加[21,29-30].同源進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示,SoAMT1E與AtAMT1.4也具有較高的同源性.AtAMT1.4是擬南芥花粉中特異表達(dá)的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白[31],在根、葉等組織器官中未見(jiàn)表達(dá),SoAMT1E與AtAMT1.4的組織表達(dá)譜差異較大,不太可能具有類(lèi)似的生物學(xué)功能,更可能與OsAMT1.1相似.
SoAMT2是供試6個(gè)SoAMT中唯一受高濃度和低濃度銨態(tài)氮抑制的AMT成員,其表達(dá)譜與棉花GhAMT1.3和AtAMT2.1相似,均受缺氮誘導(dǎo)和較高銨態(tài)氮濃度(>1 mmol·L-1NH4+)抑制[8,32].功能實(shí)驗(yàn)證明,GhAMT1.3是一個(gè)高親和銨態(tài)氮吸收轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,在棉花銨態(tài)氮吸收和利用中起重要作用,而AtAMT2.1受較高銨態(tài)氮(1 mmol·L-1或10 mmol·L-1)抑制,卻是一個(gè)低親和銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白.本研究中,SoAMT2的轉(zhuǎn)錄水平受低濃度(0.5 mmol·L-1)和高濃度(7.5 mmol·L-1)銨態(tài)氮的抑制,其在銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)中的功能未知,或許是一個(gè)雙親和蛋白,參與調(diào)節(jié)植物體內(nèi)銨態(tài)氮的動(dòng)態(tài)平衡.
由上可知,SoAMT基因表達(dá)水平不僅受外源銨態(tài)氮濃度的影響,部分SoAMT表達(dá)譜還受硝態(tài)氮濃度的影響,如SoAMT1C,SoAMT1D,SoAMT1E顯著受單一低硝態(tài)氮濃度的誘導(dǎo),而SoAMT2表達(dá)量在長(zhǎng)期單一高濃度硝態(tài)氮處理下表現(xiàn)上調(diào).有關(guān)SoAMT受外源硝態(tài)氮濃度的影響,可能的解釋有:一方面,硝態(tài)氮不僅是植物氮素來(lái)源,還作為信號(hào)分子,調(diào)控植物氮響應(yīng)途徑,從而參與銨態(tài)氮轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的轉(zhuǎn)錄調(diào)控;另一方面,銨態(tài)氮是植物體內(nèi)硝態(tài)氮的還原產(chǎn)物,外源硝態(tài)氮的供應(yīng)必然影響植物體內(nèi)銨態(tài)氮庫(kù)的大?。?7,33],從而影響相關(guān)基因的表達(dá).SoAMT的表達(dá)譜還與兩種氮素形式是否混合供氮有關(guān),如SoAMT1D在低濃度銨態(tài)氮下的表達(dá)譜與硝銨混合處理相似,說(shuō)明低濃度銨態(tài)氮對(duì)SoAMT1D的誘導(dǎo)作用不受高濃度硝態(tài)氮的影響,高濃度硝態(tài)氮對(duì)SoAMT1B(Spo24677)表達(dá)量的誘導(dǎo)又與營(yíng)養(yǎng)液中是否添加銨態(tài)氮無(wú)關(guān),相反,硝銨混合處理下SoAMT1C的表達(dá)譜與單一硝態(tài)氮或銨態(tài)氮差異很大,說(shuō)明SoAMT成員間在菠菜硝銨互作中的作用不同,值得更一步深入研究.
本文作者從菠菜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中共鑒定到6個(gè)SoAMT基因家族蛋白,包括5個(gè)AMT1亞家族成員和1個(gè)AMT2亞家族成員.菠菜SoAMT與其他植物AMT蛋白結(jié)構(gòu)相似,高度保守,但在組織表達(dá)譜和氮響應(yīng)表達(dá)譜上與其他物種同源基因差異較大.根據(jù)其不同的氮響應(yīng)模式,初步推測(cè)了其在銨態(tài)氮吸收轉(zhuǎn)運(yùn)中的功能,可為后續(xù)進(jìn)一步深入研究奠定基礎(chǔ).