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        HIV-1原發(fā)性耐藥國內(nèi)外研究進(jìn)展*

        2023-01-04 06:26:08曹旭健綜述余維維曾紫微彭勇權(quán)審校
        現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2022年24期
        關(guān)鍵詞:毒株抗病毒測(cè)序

        曹旭健 綜述,曹 靜,祁 慧,余維維,曾紫微,彭勇權(quán),王 敏△ 審校

        (1.南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院/長(zhǎng)沙市第一醫(yī)院研究生協(xié)作培養(yǎng)基地,湖南 衡陽 421001; 2.長(zhǎng)沙市第一醫(yī)院艾滋病研究所,湖南 長(zhǎng)沙 410000)

        獲得性免疫缺陷綜合征(AIDS)是由人類免疫缺陷病毒(HIV)感染引起的一種慢性傳染性疾病。HIV通過攻擊人體免疫系統(tǒng)CD4+T淋巴細(xì)胞,導(dǎo)致其數(shù)量減少和功能缺陷,使機(jī)體逐漸喪失免疫功能,引起各種機(jī)會(huì)性感染及惡性腫瘤。截至2020年底全球共存活3 770萬HIV感染者/AIDS患者(HIV/AIDS),其中2 750萬人正在接受聯(lián)合抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(cART)[1]。cART可最大限度地抑制病毒復(fù)制,重建患者免疫功能,從而延緩病程進(jìn)展,提高患者生活質(zhì)量,大幅降低了患者病死率[2]。

        自從2006年“四免一關(guān)懷”政策在我國實(shí)行以來,越來越多的HIV/AIDS接受了正規(guī)檢測(cè)與治療,cART覆蓋范圍逐漸擴(kuò)大。該政策極大地降低了我國AIDS患者病死率,對(duì)我國AIDS防治工作帶來巨大幫助。然而,隨著抗病毒治療不斷推廣應(yīng)用,原發(fā)性耐藥(PDR)也不斷增加?,F(xiàn)將HIV-1 PDR產(chǎn)生機(jī)制、檢測(cè)技術(shù)、現(xiàn)況、對(duì)治療結(jié)局的影響、患者管理策略等研究進(jìn)展綜述如下。

        1 HIV-1 PDR產(chǎn)生機(jī)制

        HIV包括HIV-1和HIV-2,二者均屬于HIV組,在進(jìn)入細(xì)胞后的復(fù)制機(jī)制、傳播方式、臨床結(jié)局(最終發(fā)展成為AIDS)等基本相同[3]。然而HIV-1毒株在世界廣泛傳播,而HIV-2的流行主要局限于西非及某些歐洲國家(葡萄牙、法國)[4]。因此,學(xué)者主要針對(duì)HIV-1 PDR情況進(jìn)行了研究。

        HIV-1耐藥性是在病毒自身因素及抗病毒藥物選擇壓力作用產(chǎn)生的[5]。HIV-1作為RNA病毒具有高度遺傳變異性,進(jìn)入細(xì)胞后需要在逆轉(zhuǎn)錄酶作用下將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,而參與HIV-1復(fù)制的逆轉(zhuǎn)錄僅具有DNA聚合酶的合成功能,缺少校正功能,因此,HIV-1復(fù)制具有易錯(cuò)傾向,平均每輪復(fù)制每個(gè)基因組約產(chǎn)生0.2個(gè)堿基變異[6-7],并且HIV-1具有高復(fù)制率,每天能產(chǎn)生1010~1012個(gè)新病毒[8],導(dǎo)致產(chǎn)生的堿基變異快速累積和放大。另一方面,隨著cART的普及,在藥物的選擇壓力作用下野生毒株與耐藥毒株失去平衡,耐藥毒株成為優(yōu)勢(shì)毒株,最終對(duì)抗病毒藥物產(chǎn)生耐藥。病毒復(fù)制程度及抗病毒藥物的選擇壓力均可導(dǎo)致耐藥突變(DRM)的產(chǎn)生和累積[9],發(fā)生耐藥的HIV-1毒株可在人群中傳播,導(dǎo)致新確診的HIV-1感染者在進(jìn)行抗病毒治療前就存在了耐藥毒株感染,即PDR,又稱為傳播性耐藥。而獲得性耐藥(ADR)是指在患者治療過程中藥物選擇壓力作用下病毒基因突變導(dǎo)致的耐藥。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,PDR可導(dǎo)致抗病毒治療失敗,加重治療負(fù)擔(dān)[10-11]。PDR的發(fā)生會(huì)降低抗病毒藥物療效并限制cART方案的選擇;對(duì)患者而言,一旦出現(xiàn)PDR,所負(fù)擔(dān)的治療費(fèi)用及病死率均將增加;對(duì)社會(huì)而言,PDR毒株的傳播不利于HIV/AIDS疫情防控。因此,《中國艾滋病診療指南(2021年版)》[12]及《Guidelines for the Use of Antiretroviral Agents in Adults and Adolescents with HIV》[13]均推薦在抗病毒治療前為患者進(jìn)行基因型耐藥檢測(cè)(GDRAs),以指導(dǎo)抗病毒方案的選擇。

        2 HIV-1 PDR檢測(cè)技術(shù)

        HIV耐藥檢測(cè)技術(shù)包括表型耐藥檢測(cè)(PDRAs)和GDRAs,二者均存在一定優(yōu)勢(shì)及技術(shù)限制,GDRAs技術(shù)簡(jiǎn)單、成本更低,因此,目前針對(duì)新診斷HIV-1感染者治療前耐藥檢測(cè)通常采用GDRAs。

        2.1PDRAs技術(shù) PDRAs的原理是基于體外培養(yǎng)技術(shù),通過檢測(cè)待檢樣本中抑制病毒生長(zhǎng)所需的抗病毒藥物濃度,與敏感參考株進(jìn)行比較,得到病毒株的耐藥情況[14]。其方法之一是運(yùn)用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增患者的基因片段(蛋白酶、整合酶及逆轉(zhuǎn)錄酶等),并將其植入野毒株內(nèi)以獲得重組病毒,通過重組病毒進(jìn)行耐藥檢測(cè)[15]。一個(gè)關(guān)于PDRAs的關(guān)鍵指標(biāo)是抑制50%病毒復(fù)制需要的抗病毒藥物濃度(IC50)。若將患者感染病毒株的IC50與藥物敏感參考毒株的IC50進(jìn)行比較即可得出倍數(shù)變化值。由于PDRAs技術(shù)需要更高的成本和更長(zhǎng)的檢測(cè)時(shí)間,目前僅用于藥物開發(fā)、耐藥相關(guān)研究及多次抗病毒治療失敗的臨床病例中[16]。

        2.2GDRAs技術(shù) GDRAs是對(duì)患者所感染的HIV-1基因組序列進(jìn)行分析并與已知的針對(duì)抗逆轉(zhuǎn)錄病毒耐藥的病毒序列譜進(jìn)行比較[14]。實(shí)際方法是提取HIV-1感染者血漿中的病毒RNA,采用逆轉(zhuǎn)錄-PCR方法擴(kuò)增與耐藥性密切相關(guān)的基因片段并且進(jìn)行序列測(cè)定后根據(jù)已建立的耐藥性突變位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(如斯坦福大學(xué)HIV耐藥數(shù)據(jù)庫https://hivdb.stanford.edu)進(jìn)行耐藥位點(diǎn)分析。該方法的優(yōu)點(diǎn)是簡(jiǎn)單、快速及價(jià)格較低。但也存在數(shù)據(jù)庫信息不足、耐藥程度難以評(píng)價(jià)及無法對(duì)新型抗病毒藥物耐藥進(jìn)行評(píng)價(jià)等問題[17]。GDRAs依賴于高質(zhì)量、標(biāo)準(zhǔn)化的手段檢測(cè)出患者的DRM,目前,GDRAs最主要的方法是Sanger測(cè)序,Sanger測(cè)序操作簡(jiǎn)單,是HIV-1耐藥檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”[18-19]。另外一種二代測(cè)序方法(NGS)的檢測(cè)結(jié)果與Sanger測(cè)序的結(jié)果具有高度一致性,但當(dāng)突變株比例小于20%時(shí)NGS具有更高的靈敏度[20]。HIV/AIDS應(yīng)該在抗病毒治療前、治療失敗后及病毒載量下降不理想時(shí)進(jìn)行耐藥檢測(cè)。這種檢測(cè)在發(fā)達(dá)國家是常規(guī)進(jìn)行的,而在發(fā)展中國家由于成本等因素耐藥檢測(cè)難以推廣應(yīng)用,一項(xiàng)使用羅氏454焦磷酸測(cè)序系統(tǒng)進(jìn)行的GDRAs調(diào)查結(jié)果顯示,相較于Sanger測(cè)序,該方法靈敏度高4倍,并且在一次運(yùn)行期間可檢測(cè)至少48例患者樣本(比Sanger測(cè)序多4倍),該方法可降低3~5倍成本,有望在發(fā)展中國家廣泛使用[21]。NGS進(jìn)行HIV耐藥檢測(cè)的步驟:(1)對(duì)樣本進(jìn)行核酸提?。?2)對(duì)目標(biāo)HIV基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增;(3)文庫構(gòu)建;(4)測(cè)序;(5)結(jié)果分析。由于NGS易受外界影響、測(cè)序結(jié)果的分析處理系統(tǒng)不完善及對(duì)技術(shù)人員操作水平要求更高,因此,在其廣泛用于臨床耐藥檢測(cè)前仍需進(jìn)行優(yōu)化改進(jìn)[22]。

        3 PDR現(xiàn)況

        3.1世界各地PDR現(xiàn)況 在歐美一些發(fā)達(dá)國家PDR率呈下降趨勢(shì)[23],與其日益更新的強(qiáng)效抗病毒藥物有關(guān)。來自法國的一項(xiàng)關(guān)于PDR的研究結(jié)果顯示,法國PDR率為10.8%,其中多數(shù)是(4.0%)對(duì)非核苷酸類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs)產(chǎn)生的耐藥,存在PDR的患者最常見的病毒亞型為B亞型,但同時(shí)重組亞型(如毒性更強(qiáng)的CRF02_AG毒株)也在增加,提示HIV-1在不斷進(jìn)化重組[24]。而在美國,PDR率高達(dá)18%,其發(fā)現(xiàn)PDR在男性、20~29歲、男男性行為人群、CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)大于或等于200個(gè)/μL者中更為常見[25]。在巴西一項(xiàng)針對(duì)596例HIV/AIDS進(jìn)行的調(diào)查結(jié)果顯示,PDR率為10.9%,并且發(fā)現(xiàn)根據(jù)GDRAs檢測(cè)結(jié)果調(diào)整cART方案能獲得更高的病毒學(xué)抑制率[26]。疫情最嚴(yán)重的撒哈拉以南非洲地區(qū)生活著全球70%以上的HIV/AIDS及近90%的兒童HIV/AIDS,有研究表明,該地區(qū)PDR率為5.6%,并且在該地推行抗病毒治療時(shí)間越長(zhǎng)的國家PDR率越高[27]。一項(xiàng)關(guān)于我國PDR現(xiàn)況的meta分析結(jié)果顯示,我國PDR率為3.6%[28]。抗病毒制劑——蛋白酶抑制劑、核苷酸類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTIs)、NNRTIs耐藥率分別為1.1%、1.3%、1.6%,但未統(tǒng)計(jì)關(guān)于整合酶抑制劑(INSTIs)耐藥情況。目前,我國PDR仍是針對(duì)NRTIs及NNRTIs耐藥,原因在于這兩類藥物基因屏障低、抗病毒治療推行時(shí)間長(zhǎng),然而我國指南仍推薦2種NRTI及1種NNRTI作為成人及青少年初治方案之一,因此,完善治療前耐藥檢測(cè)有助于為患者制定個(gè)性化抗病毒方案?!禘ACS Guidelines》[29]建議,如需要在沒有GDRAs檢測(cè)結(jié)果的情況下啟動(dòng)cART,含INSTIs的方案可迅速降低病毒載量。同時(shí),INSTIs也具有耐藥屏障高的優(yōu)點(diǎn),但鄧雪媚等[30]于2015—2016年云南省進(jìn)行的治療前耐藥檢測(cè)的513例有效基因序列中仍發(fā)現(xiàn)9例(1.7%)對(duì)INSTIs PDR。提示盡管INSTIs具有較高的基因屏障,其可能仍然并非是一種完全活性的抗病毒藥物,也需要注意對(duì)該類抗病毒藥物的耐藥情況進(jìn)行監(jiān)控。

        3.2國內(nèi)各地PDR現(xiàn)況 盡管我國PDR率處于世界衛(wèi)生組織(WHO)報(bào)告的低水平耐藥流行預(yù)警行列(<5%),但我國各地區(qū)PDR率仍存在一定差異。廣西壯族自治區(qū)PDR率為7.21%[31]。寧夏回族自治區(qū)PDR率為12.1%,高于我國浙江省(11.1%)、黑龍江省(8.3%)、北京市(3.4%)和上海市(2.7%)[32-36]。江蘇省PDR率為2.8%,盡管該省PDR率暫時(shí)處于WHO報(bào)告的低水平耐藥流行預(yù)警行列,但亞型分析結(jié)果顯示,該省CRFs和URFs大量出現(xiàn),導(dǎo)致該省亞型結(jié)構(gòu)明顯改變,亞型結(jié)構(gòu)改變提示HIV-1感染者人口特征變化,以及病毒不斷突變、重組等,因此,需進(jìn)一步加大對(duì)HIV/AIDS疫情的防控[37]。我國各地PDR率分布見圖1。

        圖1 我國各地PDR率分布

        4 PDR對(duì)治療結(jié)局的影響

        在治療前完善GDRAs只能提示患者體內(nèi)病毒可能有PDR,判斷PDR還需根據(jù)患者臨床表現(xiàn)、病毒學(xué)指標(biāo)及免疫學(xué)指標(biāo)。一旦出現(xiàn)PDR,患者治療結(jié)局:(1)病毒學(xué)抑制,規(guī)律cART 24周以上HIV RNA≤20或50 copy/mL;(2)病毒學(xué)失敗,通常指持續(xù)cART 24周后血漿病毒載量持續(xù)大于或等于200 copy/mL或出現(xiàn)病毒學(xué)反彈,即在達(dá)到病毒完全抑制后又出現(xiàn)病毒載量大于或等于200 copy/mL[12]。而PDR對(duì)病毒學(xué)失敗是否存在影響仍存在爭(zhēng)議。

        2007—2009年P(guān)harmacess非洲耐藥監(jiān)測(cè)研究隊(duì)列選取了2 733例HIV/AIDS進(jìn)行相關(guān)研究,結(jié)果顯示,與不存在PDR患者比較,存在PDR并接受部分活性cART患者第12個(gè)月病毒抑制率顯著下降,病毒學(xué)失敗風(fēng)險(xiǎn)顯著增高,ADR風(fēng)險(xiǎn)顯著增高,但存在PDR并接受完全活性cART患者無上述差異,并且存在PDR患者在隨訪期間CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)上升更少[38]。同樣來自非洲的一項(xiàng)對(duì)82例兒童的隊(duì)列研究結(jié)果顯示,在為期24個(gè)月的抗病毒治療期間58.3%存在PDR的兒童出現(xiàn)了治療失敗,而在無PDR的兒童中僅24.6%存在治療失敗,表明PDR使治療失敗的概率增加了7.5倍[39]。而一項(xiàng)來自非洲6個(gè)國家的隊(duì)列研究結(jié)果顯示,對(duì)成人HIV/AIDS在使用一線cART方案的12個(gè)月內(nèi)PDR同樣與治療失敗有關(guān)[40]。相較于成人,母嬰傳播的兒童具有更高的PDR率及基線病毒載量,并且兒童二線抗病毒藥物選擇較成人更少,需要更加注意對(duì)兒童進(jìn)行治療前耐藥檢測(cè)。這與某些研究結(jié)果相悖,國外的一項(xiàng)隊(duì)列研究結(jié)果顯示,119例HIV/AIDS患者的PDR率為17.5%,使用一線cART方案隨訪12個(gè)月后未發(fā)現(xiàn)PDR與治療失敗及更高的病死率有關(guān)[41]。

        上述研究結(jié)果的不同可能與研究地區(qū)差異(如當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)水平、耐藥情況及cART方案選擇等)、個(gè)體化差異(如基線病毒載量、基線CD4細(xì)胞計(jì)數(shù)及服藥依從性等)有關(guān);另外,cART過程中出現(xiàn)ADR也是造成治療失敗的重要原因。由于隨訪難度大、治療前難以完善耐藥檢測(cè),目前,我國已發(fā)表的關(guān)于PDR的報(bào)告主要展示各地區(qū)HIV-1感染者PDR情況,關(guān)于PDR與治療結(jié)局的研究甚少見,二者關(guān)系尚需進(jìn)一步探究。

        5 PDR管理策略

        PDR在臨床工作中常被忽視,其管理需要患者、管理者積極參與及合理的cART方案的制定。在抗病毒藥物管理方面用藥應(yīng)考慮cART方案的效能及抗病毒藥物的基因屏障。此外也需注意抗病毒藥物的藥代動(dòng)力學(xué)特點(diǎn),如藥物生物利用度、半衰期及針對(duì)單藥發(fā)生DRM時(shí)對(duì)方案其他抗病毒藥物的影響。另外,一旦發(fā)生耐藥需更換2種以上有活性的抗病毒藥物,最好是3種[12]。由于個(gè)體的服藥依從性及個(gè)體基因組的差異可影響藥物血藥濃度導(dǎo)致耐藥,如依非韋倫血藥濃度與CYP2B6、CYP2A6、UGT2B7、ABCB1/MDR1等編碼其主要代謝酶或轉(zhuǎn)運(yùn)受體的基因密切相關(guān)[42],因此,應(yīng)該對(duì)患者進(jìn)行個(gè)體化用藥,監(jiān)測(cè)血藥濃度,必要時(shí)調(diào)整抗病毒藥物用量。若患者同時(shí)服用其他藥物,還應(yīng)該考慮不同藥物的相互作用,也需注意患者合并其他感染(乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒)的情況。管理者應(yīng)盡量要求患者完善治療前耐藥檢測(cè),了解當(dāng)?shù)馗鞣N抗病毒藥物PDR現(xiàn)況,以優(yōu)化cART方案。

        綜上所述,隨著抗病毒治療的普及,HIV-1在藥物選擇壓力作用下不斷變異,PDR不斷增多。Sanger測(cè)序目前仍是GDRAs的“金標(biāo)準(zhǔn)”,而NGS作為一種靈敏度更高的檢測(cè)手段在用于臨床之前仍需優(yōu)化改進(jìn)。國內(nèi)外目前PDR現(xiàn)況及趨勢(shì)有所不同,由于推行抗病毒治療時(shí)間更長(zhǎng),當(dāng)前國外PDR率更高,但隨著強(qiáng)效抗病毒藥物的日益更新,其趨勢(shì)逐漸下降,我國目前尚處于WHO低水平耐藥預(yù)警行列,但各地PDR率存在一定差異,且多是針對(duì)NNRTIs耐藥,而目前我國指南仍推薦NNRTIs為一線抗病毒藥物,因此,對(duì)HIV/AIDS應(yīng)提倡完善治療前耐藥檢測(cè)。管理者應(yīng)該根據(jù)耐藥檢測(cè)結(jié)果選擇合理的cART方案,使患者獲得更好的抗病毒療效及遠(yuǎn)期預(yù)后,阻斷耐藥毒株在人群中的傳播。

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