張栩晟,徐秋月 綜述,段 勇 審校
昆明醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院醫(yī)學檢驗科/云南省檢驗醫(yī)學重點實驗室/云南省醫(yī)學檢驗臨床醫(yī)學研究中心,云南昆明 6500322
肺癌是發(fā)病率和病死率增長極快,對人類生命和健康威脅極大的惡性腫瘤之一,據(jù)來自世界衛(wèi)生組織(WHO)國際癌癥研究機構(gòu)(IARC)的GLOBOCAN項目統(tǒng)計,2020年全球有220萬肺癌新發(fā)病例和180萬肺癌死亡病例[1]。目前,肺癌的病因尚未完全闡明,有觀點認為肺癌是肺細胞中基因突變的連續(xù)累積引發(fā)的。長鏈非編碼RNA(lncRNA)參與DNA轉(zhuǎn)錄,mRNA剪接和翻譯、染色體劑量補償、表觀遺傳調(diào)控,以及細胞核與細胞質(zhì)運輸?shù)然蛘{(diào)控過程[2],通過參與細胞生長、凋亡、侵襲和轉(zhuǎn)移等病理生理活動,在肺癌的發(fā)展和演進中起關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用[3]。目前,肺癌的臨床診斷主要依靠病理學活檢、影像學檢查、臨床癥狀和腫瘤標志物檢測,lncRNA作為包括肺癌在內(nèi)的多種惡性腫瘤的腫瘤標志物,能夠反映腫瘤的存在和生長,且其表達水平改變往往早于臨床影像學表現(xiàn),檢測過程具有無創(chuàng)、快速、可動態(tài)監(jiān)測等優(yōu)勢,適合應用于大規(guī)模人群篩查及肺癌診治全程。
lncRNA一般由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄而來,結(jié)構(gòu)與信使RNA相似,具有多聚A尾巴、5′-帽結(jié)構(gòu)和啟動子結(jié)構(gòu),缺少開放閱讀框[4]。lncRNA參與基因表達調(diào)控、細胞周期控制、細胞凋亡、細胞身份決定、染色質(zhì)重塑和表觀遺傳修飾等生理過程的調(diào)節(jié)[5]。lncRNA功能包括:(1)招募染色質(zhì)重構(gòu)和修飾復合體到特定位點,改變DNA/RNA甲基化狀態(tài)、染色體結(jié)構(gòu)和修飾狀態(tài),進而控制相關(guān)基因表達;(2)與mRNA結(jié)合,調(diào)控mRNA翻譯;(3)與某些轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合成復合體,影響mRNA轉(zhuǎn)錄;(4)作為競爭性內(nèi)源RNA(ceRNA),競爭結(jié)合miRNA的目標mRNA。
lncRNA參與基因組印跡、染色質(zhì)建模和轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)等生物過程,表達失調(diào)會破壞肺細胞的正常生理活動并影響肺癌的發(fā)生、發(fā)展[6]。
2.1lncRNA和肺癌細胞增殖 lncRNA在肺癌細胞增殖過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。PAN等[7]研究表明,lncRNA JPX能充當miR-33a-5p的“海綿”,上調(diào)轉(zhuǎn)錄因子Twist1,促進肺癌細胞的增殖。lncRNA SNHG20可直接靶向沉默miR-197,下調(diào)Wnt/β-actin信號通路的關(guān)鍵分子TCF和LEF1的表達,促進非小細胞肺癌(NSCLC)細胞增殖并抑制凋亡[8]。lncRNA HOTAIR在NSCLC組織中異常高表達,可作為miR-149-5p的ceRNA,上調(diào)HNRNPA1的表達,促進NSCLC細胞的增殖和遷移[9]。Hippo信號通路主要調(diào)控細胞的增殖和凋亡,有研究表明,LINC00968在肺腺癌(LUAD)組織中表達下調(diào),通過miR-21-5p/SMAD7軸抑制Hippo信號通路,從而抑制LUAD細胞的增殖和轉(zhuǎn)移[10]。
2.2lncRNA和肺癌轉(zhuǎn)移、侵襲 腫瘤轉(zhuǎn)移始于上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),上皮細胞呈現(xiàn)間質(zhì)特征并獲得遷移和侵襲能力,lncRNA可調(diào)節(jié)與EMT相關(guān)的基因和通路參與肺癌的侵襲轉(zhuǎn)移。lncRNA UCC可作為miR-143-3p的“海綿”,與miR-143-3p結(jié)合上調(diào)SRY盒轉(zhuǎn)錄因子5(SOX5)表達,進而促進EMT的發(fā)生,誘導NSCLC細胞轉(zhuǎn)移[11]。ZHANG等[12]研究表明,ncRNA LINC01006作為miR-129-2-3p的“海綿”上調(diào)癌基因CTNNB1表達,激活Wnt/β-catenin通路,促進LUAD細胞增殖、轉(zhuǎn)移和EMT。ncRNA LINC02323作為一種ceRNA,通過“海綿”化miR-1343-3p上調(diào)轉(zhuǎn)化生長因子-β受體1(TGFBR1)表達,促進LUAD中的EMT、侵襲和轉(zhuǎn)移[13]。
2.3lncRNA和肺癌細胞凋亡 凋亡對于控制細胞增殖,維持組織穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要,細胞凋亡的生理機制改變可能會引發(fā)腫瘤。lncRNA NNT-AS1在肺癌組織中表達上升,可作為miR-3666的“海綿”,上調(diào)E2F轉(zhuǎn)錄因子2(E2F2)表達,抑制肺癌細胞凋亡[14]。LI等[15]研究表明,NSCLC中表達上調(diào)的lncRNA SNHG1可直接與miR-361-3p結(jié)合并下調(diào)其水平,消除miR-361-3p對FRAT1的表達抑制,促進NSCLC細胞增殖,抑制凋亡。lncRNA FER14被認為是子宮內(nèi)膜癌、卵巢癌、肝細胞癌、食管鱗狀細胞癌中的腫瘤抑制因子,過表達的FER14能夠激活張力蛋白同源物基因(PTEN)并抑制蛋白激酶B的磷酸化,上調(diào)p53,抑制肺癌細胞的增殖并促進凋亡[16]。
lncRNA在外周血、外泌體及腫瘤“教育”血小板中含量較高,易于富集和檢測,在肺癌診斷中有較大潛力。研究顯示,lncRNA TUG1在NSCLC患者血漿中表達下調(diào),而lncRNA UCA1上調(diào),二者診斷NSCLC時,受試者工作特征(ROC)曲線的曲線下面積(AUC)分別為0.72和0.69,二者聯(lián)合診斷的AUC為0.82,靈敏度為78.33%,特異度為70.00%,診斷效能較好,有望成為NSCLC的潛在分子標志物[17]。外泌體SOX2-OT在肺鱗狀細胞癌(LSCC)患者血漿中表達上調(diào),AUC為0.815,靈敏度為76.00%,特異度為73.17%,且外泌體SOX2-OT水平與腫瘤大小、TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),LSCC患者術(shù)后血漿外泌體SOX2-OT水平明顯降低,提示SOX2-OT可以作為檢測LSCC的潛在標志物[18]。在YANG等[19]的研究中,NSCLC患者血清lncRNA LINC00173表達水平高于健康人和良性肺疾病(BPD)患者,血清LINC00173診斷NSCLC、BPD和SCLC的AUC分別為0.809、0.670、0.730,癌胚抗原和細胞角蛋白片段19抗原21-1(CYFRA21-1)聯(lián)合檢測NSCLC患者時AUC為0.917,靈敏度為90.74%,特異度為68.13%,表明其具有良好的診斷效能。
lncRNA參與肺癌發(fā)生相關(guān)通路的抑制、腫瘤細胞生理活動的阻滯和耐藥的克服,在肺癌治療中扮演重要角色,為臨床提供治療新思路。lncRNA PCAT1和ATP結(jié)合盒亞家族B成員1(ABCB1)在NSCLC患者體內(nèi)表達增加,且增加其對順鉑的耐藥性,將PACT1敲低后,抑制耐順鉑肺癌細胞的生存能力,同時顯著增加順鉑存在時的肺癌細胞凋亡率[20]。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA MALAT1在肺癌組織及細胞系中表達水平上升,而敲低MALAT1表達可通過miR-491-5p/UBE2C軸抑制肺癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力,表明MALAT1可能是肺癌治療和預后的分子靶點[21]。LINC01006在LUAD中表達上調(diào),通過充當miR-129-2-3p的“海綿”上調(diào)CTNNB1,激活Wnt/β-catenin通路促進LUAD的進展。ZHANG等[12]在敲低LINC01006后關(guān)閉了Wnt/β-catenin通路,肺癌細胞的增殖、遷移和EMT明顯受到抑制,表明LINC01006是一種有前景的LUAD治療生物靶點。
腫瘤特異性耐藥與藥物誘導的基因功能非突變修飾、隨機突變事件和核型改變有關(guān)。厄洛替尼可抑制細胞內(nèi)表皮生長因子受體(EGFR)相關(guān)的酪氨酸激酶磷酸化。耐厄洛替尼的NSCLC細胞中l(wèi)ncRNA H19呈低表達,lncRNA H19作用于EGFR/蛋白激酶B(AKT)通路,消除泛素介導的M2型丙酮酸激酶(PKM2)降解,上調(diào)PKM2表達,獲得對厄洛替尼的耐藥性[22]。順鉑通過轉(zhuǎn)運蛋白進入肺癌細胞后被水化激活,與DNA結(jié)合并形成鏈內(nèi)和鏈-鏈交聯(lián),阻斷DNA復制和轉(zhuǎn)錄,最終導致細胞凋亡[23]。lncRNA ZXF1在耐順鉑肺癌組織中高表達,ZXF1能激活MAPK途徑,使ERK、JNK和p38磷酸化水平上升,促進肺癌進展和順鉑耐藥[24]。吉非替尼是一種EGFR和人表皮生長因子受體2(HER-2)的強效選擇性ATP競爭抑制劑[25]。吉非替尼耐藥NSCLC細胞中l(wèi)ncRNA CASC9表達上調(diào),CASC9通過招募組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶EZH2抑制腫瘤抑制因子DUSP1,增加對吉非替尼的耐藥性[26]。
lncRNA能夠有效預測肺癌TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和腫瘤組織惡性程度等。lncRNA CCAT2是多種癌癥的潛在預后標志物,CCAT2高表達的小細胞肺癌(SCLC)患者總生存期(OS)明顯低于CCAT2低表達組(P<0.001),多因素分析顯示,CCAT2過表達是SCLC患者生存不良的獨立預后因素(P=0.007)[27]。NSCLC組織中LINC00691表達異常升高與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P=0.025)和晚期TNM分期(P=0.002)相關(guān),LINC00691高表達的NSCLC患者OS短于低表達患者(P=0.0042),多因素分析表明,LINC00691表達增加是NSCLC患者較差的獨立預后因素(HR=3.016,95%CI:1.217~3.889,P=0.006)[28]。lncRNA UPLA1在LUAD中高表達可促進細胞遷移、侵襲和增殖,生存曲線分析顯示UPLA1表達水平與OS呈負相關(guān)(P<0.05),單因素Cox回歸分析表明,OS與UPLA1表達和TNM分期相關(guān)。因此,UPLA1的表達可以作為LUAD患者的獨立預后因素[29]。lncRNA NBAT1在NSCLC組織中的表達低于正常肺組織,生存曲線分析顯示,NBAT1高表達的患者OS明顯高于NBAT1低表達患者(P=0.008),單因素分析顯示,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TMN分期、NBAT1表達是影響NSCLC患者總生存的危險因素(P<0.05),多因素分析顯示,NBAT1表達是NSCLC患者的獨立預后因素(HR=2.947,95%CI:1.184~4.369,P=0.014),表明NBAT1是NSCLC患者潛在的預后調(diào)節(jié)因子[30]。
lncRNA在肺癌的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用,具有成為治療關(guān)鍵靶點和預后標志物的潛力。肺癌耐藥機制闡明是一個重大臨床研究課題,lncRNA的結(jié)構(gòu)決定了生物學功能,對不同結(jié)構(gòu)層次進行研究是闡明lncRNA生物學功能的一種思路。利用lncRNA能夠減弱甚至消除肺癌患者的耐藥能幫助臨床提升治療效果,但是這類藥物還有特異性不足和利用率不足的缺點,一些藥物吸收和生物分布的問題還需要解決,lncRNA靶向抗癌藥物的批準和商業(yè)化仍有很長的路要走。lncRNA的作用靶點眾多,調(diào)控網(wǎng)絡復雜,目前大多數(shù)lncRNA研究還是獨立且分散的,以lncRNA作為肺癌特異性靶點的診治方案還有特異性不足的問題亟待解決。多中心臨床大數(shù)據(jù)平臺建設及數(shù)據(jù)挖掘可加速lncRNA與肺癌診治的深入機制研究與臨床性能評估。相信隨著對lncRNA和肺癌相關(guān)性的深入研究,這些問題都能得到更好地解決。