采用免疫檢查點(diǎn)阻斷的癌癥治療(ICB),通常會(huì)誘發(fā)免疫相關(guān)的不良事件(irAEs)。研究人員假設(shè)在腫瘤和正常細(xì)胞中共表達(dá)的蛋白可能是irAEs中的抗原靶點(diǎn),并在此描述了用于鑒定它們的DITAS(腫瘤相關(guān)自身抗原的發(fā)現(xiàn))?;趩螛颖净蚣患治?,DITAS計(jì)算了肺腫瘤和健康肺組織之間的轉(zhuǎn)錄相似性。
本研究鑒定了10個(gè)在肺腫瘤中高度表達(dá)的肺組織特異性基因。將計(jì)算分析與功能性T細(xì)胞分析和抗原特異性T細(xì)胞的單細(xì)胞RNA測(cè)序相結(jié)合,以驗(yàn)證肺腫瘤自身抗原。在接受ICB治療的非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者中,napsin A是一種自身抗原,可引發(fā)強(qiáng)烈的CD8+T細(xì)胞應(yīng)答,與無(wú)應(yīng)答者相比,ICB應(yīng)答者攜帶這些CD8+T細(xì)胞的頻率更高。源于napsin A的人白細(xì)胞抗原(HLA)I類配體存在于人肺腫瘤和非腫瘤肺組織中,napsin A四聚體證實(shí)了非小細(xì)胞肺癌患者血液和腫瘤中存在napsin A特異性CD8+T細(xì)胞。Napsin A特異性T細(xì)胞克隆型在肺腫瘤和ICB誘導(dǎo)的炎癥性肺損傷中富集,并且可以離體殺死永生化的與HLA匹配的NSCLC細(xì)胞。單細(xì)胞RNA測(cè)序顯示這些T細(xì)胞克隆型表達(dá)促炎細(xì)胞因子和細(xì)胞毒性標(biāo)志物。
因此,DITAS成功鑒定了自身抗原,包括napsin A,它們可能在NSCLC中介導(dǎo)有效的抗腫瘤T細(xì)胞反應(yīng),并可能同時(shí)支持肺irAEs。