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        EXO1蛋白在DNA損傷中研究進展

        2022-12-29 07:49:05吳珊邱俊陳俊宇陳瑩瑩王月婷王楠劉淑香趙淑華
        中國老年學(xué)雜志 2022年5期
        關(guān)鍵詞:外切端粒染色體

        吳珊 邱俊 陳俊宇 陳瑩瑩 王月婷 王楠 劉淑香 趙淑華

        (1吉林大學(xué)第二醫(yī)院,吉林 長春 130041;2空軍航空大學(xué)門診部;3吉林大學(xué)護理學(xué)院;4浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院)

        核酸外切酶(EXO)1兼有5'端-3'端外切酶及5'端結(jié)構(gòu)特異性內(nèi)切酶活性〔1〕,屬于皮瓣結(jié)構(gòu)特異性內(nèi)切酶(Rad)2/著色性干皮病(XP)G組蛋白家族的成員。EXO1蛋白具有EXO1a及EXO1b兩種異構(gòu)體,其中EXO1b的C端額外具有48個氨基酸,因而活性明顯優(yōu)于EXO1a〔1〕,但兩者的功能并無區(qū)別。

        EXO1不僅參與DNA損傷細胞的周期調(diào)控和細胞凋亡的調(diào)節(jié),還在DNA錯配修復(fù)(MMR)、DNA雙鏈斷裂修復(fù)(DSBR)、DNA損傷應(yīng)答(DDR)、DNA末端剪切及細胞分裂的重組修復(fù)中發(fā)揮重要作用。研究表明,EXO1基因缺陷可能增加乳腺癌、卵巢癌及肺癌等多種惡性腫瘤的易感性及化療耐藥性。此外,EXO1的多態(tài)性可預(yù)測胰腺癌、頭頸部鱗狀細胞癌、上皮性卵巢癌及非小細胞肺癌的預(yù)后〔2〕。本文就EXO1蛋白在DNA損傷中研究進展予以綜述。

        1 EXO1參與細胞周期調(diào)控

        真核細胞發(fā)生DNA損傷時,調(diào)控DNA修復(fù)及細胞周期進程的信號通路激活,從而保持基因組的完整性〔3〕,EXO1可與多種細胞周期調(diào)節(jié)蛋白相互作用。在細胞增殖的S期,增殖細胞核抗原(PCNA)與EXO1表達共定位,通過與EXO1中的PCNA相互作用蛋白盒(PIP-box)結(jié)合,激活EXO1對雙鏈DNA(dsDNA)的外切酶活性〔4〕。DNA損傷檢測點Cdc25磷酸化可介導(dǎo)細胞G1/S期轉(zhuǎn)化,并為14-3-3蛋白提供結(jié)合位點〔5〕。14-3-3蛋白具有多種異構(gòu)體,在細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡及細胞分裂中發(fā)揮重要作用,其中,14-3-3η及σ可激活人EXO1蛋白。研究發(fā)現(xiàn),結(jié)直腸癌細胞中14-3-3σ過表達可誘導(dǎo)G2期阻滯,在dsDNA末端剪切過程中14-3-3σ可抑制PCNA依賴的EXO1蛋白激活途徑,DNA損傷時EXO1蛋白還可作為半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(caspase)-3的上游分子,參與細胞凋亡〔6〕。

        2 EXO1參與DNA MMR

        MMR是一種高度保守的DNA修復(fù)途徑,通過更正DNA復(fù)制、修復(fù)及重組過程中出現(xiàn)的DNA堿基錯配、插入和缺失環(huán)(IDLs),維持基因組穩(wěn)定性〔7〕。MMR分為兩種途徑,一方面,減數(shù)分裂重組蛋白(MRE)11、DNA交聯(lián)修復(fù)蛋白(DCLRE)1C及FAN1 (FANCD2/FANCI-Associated Nuclease 1)不依賴EXO1直接參與MMR〔8〕。另一方面,EXO1蛋白的N端和C端分別與錯配修復(fù)蛋白Muts同源體(MSH)3、MLH1 和MSH2相互作用,從而完成MMR〔9〕。MSH2和MSH6形成異二聚體MutSα,識別堿基錯配和最多3 nt的IDL;MSH2和MSH3形成異二聚體MutSβ,識別13 nt大小的IDL,從而啟動MMR〔10〕。之后,MutL同源體(MLH)1和MLH4形成具有內(nèi)切酶活性的異二聚體MutLα,后者與PCNA及復(fù)制因子(RF)C一同聚集至錯配位點,繼而招募EXO1與MutSα(或β)及MutLα相互作用,對含有錯配堿基的DNA鏈進行剪切。在此過程中,復(fù)制蛋白(RP)A通過調(diào)節(jié)EXO1蛋白對DNA的親和力,確保剪切的安全性〔11〕。研究發(fā)現(xiàn),EXO1敲除的細胞微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)增加,EXO1基因缺陷小鼠的腫瘤易感性增加〔12〕。

        3 EXO1參與DDR

        DDR是一種復(fù)雜的DNA損傷修復(fù)機制,通過多種蛋白的參與,恢復(fù)DNA的完整性及保真性,維持其遺傳穩(wěn)定性。其中,F(xiàn)ANA、B、C、E、F、G、L和M可啟動DNA鏈間交聯(lián)(ICL)修復(fù),MSH2、MSH3、MSH6、MLH1和MLH4可啟動MMR修復(fù),XPC組、損傷特異性DNA結(jié)合蛋白(DDB)2和可卡因綜合征蛋白(CS)A可啟動核苷酸切除(NER)修復(fù),Ku蛋白及MRE11-RAD50-NBS1(MRN)復(fù)合物可分別啟動非同源末端連接(NHEJ)修復(fù)及同源重組(HR)修復(fù),多腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)可啟動DNA單鏈斷裂(SSB)修復(fù)。研究發(fā)現(xiàn),EXO1敲除小鼠發(fā)生染色體斷裂及堿基錯配的概率升高,淋巴瘤易感性增加;EXO1null/null細胞的染色體不穩(wěn)定,對電離輻射的敏感性高〔13〕。在DNA損傷修復(fù)的過程中,RPA與DNA損傷反應(yīng)蛋白激酶ATM及ATR結(jié)合并發(fā)生磷酸化,從而參與DNA修復(fù)過程。有證據(jù)表明EXO1參與RPA的招募,通過HR修復(fù)維持基因組穩(wěn)定性〔14〕。此外,PARP1合成的PAR不僅參與EXO1向DNA損傷位點的快速募集,也參與調(diào)節(jié)EXO1的外切酶活性〔15〕。同時,PARP1可與EXO1相互作用并激活EXO1的5'端剪切活性〔16〕。

        4 EXO1與DNA末端剪切

        在所有DNA損傷中,DNA雙鏈斷裂(DSB)對細胞的危害作用最強,如不及時修復(fù),可阻斷DNA復(fù)制、引起染色體缺失,進而導(dǎo)致細胞死亡或腫瘤轉(zhuǎn)化。DSBR過程包括相互競爭的兩種作用,一是Ku蛋白依賴的NHEJ途徑,另一種是MRN復(fù)合物依賴的HR途徑〔17〕。Ku70和Ku80異構(gòu)體是構(gòu)成NHEJ的重要成分,與雙鏈DNA末端緊密結(jié)合,從而阻礙EXO1介導(dǎo)的DNA末端剪切,并防止核酸酶發(fā)生過度酶切〔17〕。而MRE11和SAE2〔人羧基末端結(jié)合蛋白反應(yīng)蛋白(CtIP)的同源基因〕可阻止Ku70/80參與DSBR,從而促進EXO1的剪切〔18〕。此外,CtIP可直接與EXO1相互作用從而抑制后者的外切酶活性〔19〕。

        DNA末端剪切是HR途徑的重要步驟,主要通過兩種途徑進行,一種是RPA介導(dǎo)的DNA末端剪切途徑,另一種是由EXO1介導(dǎo),通過激活BLM、MRN及RPA而發(fā)揮作用。Bloom綜合征解旋酶(BLM)可增加EXO1對DNA末端的親和力,MRN則負責(zé)招募EXO1并增強其作用〔20〕。研究發(fā)現(xiàn),MRE11、RAD50或奈梅亨斷裂綜合征蛋白(NBS)1基因缺陷具有致死性,而EXO1基因缺陷雖然對小鼠的存活幾乎無影響〔13〕,但小鼠表現(xiàn)為嚴重的發(fā)育障礙、胚胎死亡及染色體不穩(wěn)定,在細胞表型上表現(xiàn)為DNA復(fù)制、DNA修復(fù)、檢測點信號及DDR方面的功能缺陷〔21〕。EXO1外切酶活性可被人RecQ解旋酶RECQL1、BLM及Werner綜合征解旋酶(WRN)所激活〔22,23〕。然而,DNA末端被EXO1剪切的程度可能受到WRN、RPA、Ku70/80和(或)CtIP的限制〔24,25〕。此外,EXO1還通過微同源序列介導(dǎo)的末端連接,參與DNA剪切〔26〕。

        5 EXO1與減數(shù)分裂重組修復(fù)

        研究發(fā)現(xiàn),小鼠需要 EXO1的酶切活性完成減數(shù)分裂Ⅱ期。EXO1null/null小鼠與野生型小鼠雜交后出現(xiàn)生育障礙〔12〕。相同大小或體重的EXO1null/null雄性小鼠的睪丸小于野生型小鼠。由于減數(shù)分裂Ⅱ期進展障礙,EXO1null/null雄性小鼠的精子發(fā)生存在缺陷〔13〕,但EXO1在減數(shù)分裂中維持基因穩(wěn)定性的機制尚未明確。

        6 EXO1與端粒維持

        端粒位于染色體末端,通過端粒結(jié)合蛋白作用,防止DNA末端發(fā)生降解和DNA復(fù)制相關(guān)的損耗。端粒的末端攜帶t-loop結(jié)構(gòu)〔27〕,通過與端粒特異性結(jié)合蛋白復(fù)合物shelterin如TFR1和TFR2、POT1、RAP1、TIN2、TPP1、MRE11、Ku70/80、BLM、WRN及RECQL4等緊密結(jié)合發(fā)揮作用〔28〕。缺乏功能性shelterin的細胞表現(xiàn)為染色體不穩(wěn)定、端端染色體融合及端??s短。實驗表明,端粒功能障礙是導(dǎo)致細胞周期阻滯的重要機制,可干擾細胞分裂,從而影響腫瘤形成〔29〕。然而研究發(fā)現(xiàn),端粒功能失調(diào)的小鼠,EXO1缺失有助于維持器官穩(wěn)定性并延長小鼠壽命,且不增加染色體不穩(wěn)定性及腫瘤形成,表明EXO1缺失可能在端粒功能失調(diào)中具有延長生存期的作用〔30〕。

        7 EXO1與年齡及惡性腫瘤的關(guān)系

        EXO1缺失可影響基因組穩(wěn)定性,并降低神經(jīng)干細胞(NSCs)的增殖能力〔31〕,如EXO1null/nullNSCs表現(xiàn)出分化受損、嗅覺神經(jīng)減少、微衛(wèi)星和基因不穩(wěn)定性增加等現(xiàn)象〔31〕,但EXO1并不直接與年齡增長或年齡相關(guān)疾病有關(guān)。

        一些研究發(fā)現(xiàn)EXO1基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與人類細胞中MSI及癌癥易感性相關(guān)〔32〕。EXO1蛋白在正常組織中多呈低表達,且不隨細胞周期及細胞增殖狀態(tài)的改變而變化〔33〕。但其表達呈組織特異性,如在小鼠模型中,EXO1蛋白在睪丸及脾臟中高表達,而在甲狀腺、淋巴結(jié)及骨髓組織中呈適度表達。在人類組織中,EXO1蛋白在甲狀腺、結(jié)腸及胎盤組織均有表達,但在睪丸中表達度最高〔11〕。EXO1蛋白在一些腫瘤細胞中呈過表達〔34〕,是乳腺癌、卵巢癌、肺癌及胃腸道腫瘤的易感基因〔35〕,且可能與腫瘤的化療耐藥有關(guān)〔36〕。

        8 總結(jié)與展望

        EXO1蛋白同時具有內(nèi)切酶及外切酶活性,不僅參與DNA損傷細胞的周期調(diào)控,調(diào)節(jié)細胞的凋亡,還通過與多種蛋白相互作用,參與MMR、DSBR、DDR、DNA末端切除與減數(shù)分裂和有絲分裂的重組修復(fù)等多種損傷修復(fù),從而維持DNA的完整性及基因組的穩(wěn)定性。EXO1基因缺陷與肺癌、乳腺癌及卵巢癌等多種惡性腫瘤的易感性密切相關(guān),可作為腫瘤標志物用于高危人群篩查。此外,EXO1蛋白可能參與惡性腫瘤的化療耐藥,因此有望作為藥物研發(fā)的靶點,提高耐藥患者的化療敏感性。但EXO1蛋白在端粒維持中的作用仍需深入探索,且EXO1蛋白在DNA損傷修復(fù)機制中的具體信號通路及在惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用仍需進一步研究。

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