唐 樂(lè), 李 宏, 何麗麗, 牛海文, 羅 琴
新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院呼吸神經(jīng)內(nèi)科,烏魯木齊 830011
流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),中國(guó)肺癌的死亡率較以往30年增加了約464.84%[1]。盡管在肺癌研究及診療方面取得了許多進(jìn)展,但仍有較多患者確診時(shí)已處于臨床終末期。大約80%~85%肺癌患者的病理類型為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)[2],研究NSCLC能明顯改善肺癌患者群體臨床預(yù)后。microRNA(miRNA)是一類能與目標(biāo)基因靶點(diǎn)序列相互結(jié)合,作用類似于siRNA的內(nèi)源性小分子非編碼RNA,其可抑制目標(biāo)靶基因的表達(dá)[3]。miRNA由高等真核生物基因組編碼,可靶向約60%的基因組基因。研究miRNA對(duì)NSCLC有重要臨床意義[4]。既往研究發(fā)現(xiàn),miR-19b-3p與包括NSCLC在內(nèi)的多種癌癥相關(guān),可通過(guò)多種信號(hào)途徑發(fā)揮抑癌或促癌作用,但其在惡性腫瘤中的表達(dá)趨勢(shì)及作用不一,分子機(jī)制存在爭(zhēng)議[5-6]。
競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA),是一種能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合RNA的作用元件。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)可競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA并且充當(dāng)ceRNA調(diào)控mRNA的表達(dá)[7]。轉(zhuǎn)移相關(guān)性肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(MALAT1)是NSCLC中研究最為廣泛的一種癌類lncRNA,其在包括NSCLC在內(nèi)的多種惡性腫瘤中表達(dá)明顯增高[8]。例如,MALAT1在缺氧條件下表達(dá)增高并促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖、分化及血管形成,此效應(yīng)主要由缺氧誘導(dǎo)因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)和血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)介導(dǎo)[9]。最近有研究表明,缺氧誘導(dǎo)下的血管內(nèi)皮細(xì)胞中miR-19b-3p和HIF-1α之間存在靶向關(guān)系,MALAT1可海綿吸附miR-19b-3p,且使HIF-1α呈缺氧時(shí)間依賴性升高[10]。本課題組對(duì)比NSCLC癌組織與癌旁組織發(fā)現(xiàn),MALAT1在患者癌組織中高表達(dá),而miR-19b-3p低表達(dá)。然而目前在對(duì)NSCLC的研究中,尚未明確MALAT1/miR-19b-3p/HIF-1α三者之間是否存在ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。本文旨在研究MALAT1是否與miR-19b-3p之間存在海綿吸附作用并調(diào)控HIF-1α/VEGF分子軸參與NSCLC發(fā)病機(jī)制。
選取2019年1月~2019年12月期間新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院呼吸神經(jīng)內(nèi)科收治的經(jīng)手術(shù)病理確診為NSCLC的肺癌組織及對(duì)應(yīng)癌旁組織標(biāo)本各15例。其中男性9例、女性6例,年齡55~73歲,平均年齡(63.27±5.65)歲;鱗癌4例、腺癌11例;臨床分期Ⅰ期2例、Ⅱ期4例、Ⅲ期7例、Ⅳ期2例(以上臨床標(biāo)本使用均獲知情同意)。人正常支氣管上皮細(xì)胞系16HBE及人非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系NCI-H1299、NCI-H1650、SPC-A1、A549細(xì)胞來(lái)源于普諾賽生物公司;MALAT1、HIF-1α、VEGF引物,miR-19b-3p模擬物(mimic)及其陰性對(duì)照(NC mimic),MALAT1 siRNA(si-MALAT1)以及陰性對(duì)照(si-NC)由吉瑪基因公司構(gòu)建;Anti-HIF-1α抗體由Abcam公司提供,Anti-VEGF抗體由博奧森公司提供,二抗山羊抗兔IgG H&L(HRP)和山羊抗小鼠IgG H&L(HRP)購(gòu)自Abcam公司;CCK-8細(xì)胞增殖試劑盒由全式金生物公司、Transwell小室由Corning公司、凋亡試劑盒由BD公司提供。
細(xì)胞在完全F-12K培養(yǎng)液,37℃、飽和濕度、5%CO2條件下培養(yǎng)。根據(jù)轉(zhuǎn)染說(shuō)明書(shū)進(jìn)行轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)。分別設(shè)miR-19b-3p mimic組、NC mimic組、si-MALAT1組、si-NC組、空白對(duì)照組,轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)細(xì)胞48 h。
采用Trizol從組織或細(xì)胞中提取總RNA,用5X All-In-One RT MasterMix進(jìn)行RNA逆轉(zhuǎn)錄,用miRNA熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行miRNA逆轉(zhuǎn)錄,以cDNA為模板在熒光定量PCR儀(ABI 7500 FAST)上進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng)。MALAT1、HIF-1α、及VEGF使用GAPDH為內(nèi)參,miR-19b-3p使用U6為內(nèi)參。采用2-ΔΔCt法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量。引物序列詳見(jiàn)表1。
表1 引物序列表Table 1 List of primer sequences
按1.2項(xiàng)轉(zhuǎn)染分組,按Western blot法將細(xì)胞提取的總蛋白凝膠電泳分離后轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上。一抗兔抗HIF-1α抗體、兔抗VEGF抗體孵育過(guò)夜,二抗山羊抗兔IgG H&L(HRP)室溫孵育1 h,ELC化學(xué)發(fā)光顯影。β-actin作為內(nèi)參對(duì)照。Image J軟件分析蛋白條帶灰度值。
按1.2項(xiàng)轉(zhuǎn)染分組后,按CCK-8方法測(cè)定細(xì)胞的增殖,各組重復(fù)5孔。每孔加入100 μL 10% CCK-8試劑,1 h后用Bio-Rad xMarkTM酶標(biāo)儀測(cè)定450 nm處的吸光度(A)值。
按1.2項(xiàng)轉(zhuǎn)染分組后,重懸細(xì)胞過(guò)200目篩網(wǎng)制成單細(xì)胞懸液。4℃避光孵育30 min。用流式細(xì)胞儀檢測(cè)紅色熒光及光散射(激發(fā)波長(zhǎng)488 nm)。
按1.2項(xiàng)轉(zhuǎn)染分組后,吸出細(xì)胞瓶?jī)?nèi)培養(yǎng)液及2次PBS洗滌液至離心管內(nèi)(內(nèi)含凋亡或壞死細(xì)胞),胰酶消化、離心、重懸、過(guò)篩,制備單細(xì)胞懸液。加入5 μL Annexin Ⅴ-PE試劑和10 μL 7-AAD試劑,在4℃條件下使處理后的單細(xì)胞懸液避光10 min。采用LSRFortessa流式細(xì)胞儀在30 min內(nèi)盡快檢測(cè)細(xì)胞凋亡比率。
按1.2項(xiàng)轉(zhuǎn)染分組后,重懸并調(diào)整細(xì)胞懸液至5×105mL;將基質(zhì)膠包埋在Transwell小室底部中央;取100 μL細(xì)胞懸液接種至無(wú)基質(zhì)膠的Transwell小室(遷移實(shí)驗(yàn))及含有基質(zhì)膠的Transwell小室(侵襲實(shí)驗(yàn))中;在下室加入600 μL完全培養(yǎng)液,各組3個(gè)重復(fù)孔,48 h后棄小室內(nèi)上清并拭去小室上層內(nèi)的細(xì)胞及基質(zhì)膠,甲醛固定小室下層穿膜細(xì)胞,用Giemsa染液染色,取3個(gè)顯微鏡隨機(jī)視野計(jì)數(shù)遷移和侵襲細(xì)胞數(shù)。
利用生物信息學(xué)在線網(wǎng)站lncRNASNP2(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP/)及targetscan(https://www.targetscan.org/)預(yù)測(cè)了miR-19b-3p與MALAT1及HIF-1α之間均有互補(bǔ)結(jié)合位點(diǎn)。如圖1。
圖1 miR-19b-3p與MALAT1、HIF-1α靶向結(jié)合預(yù)測(cè)位點(diǎn)Fig.1 Predicted targeted binding sites between MALAT1,HIF-1α and miR-19b-3p
qRT-PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn),MALAT1在15例NSCLC癌組織中平均相對(duì)表達(dá)量為(2.649±0.724),對(duì)應(yīng)鄰近癌旁組織中平均相對(duì)表達(dá)量為(1.006±0.484)(P<0.05,圖2A)。miR-19b-3p在15例NSCLC癌組織中平均相對(duì)表達(dá)量為(0.400±0.113),而在鄰近癌旁組織中平均相對(duì)表達(dá)量為(1.028±0.164)(P<0.05,圖2B)。Pearson相關(guān)性分析顯示MALAT1與miR-19b-3p表達(dá)呈負(fù)相關(guān),r=-0.8969(P<0.01,圖2C)。
A:MALAT1的相對(duì)表達(dá)量;B:miR-19b-3p的相對(duì)表達(dá)量;C:MALAT1和miR-19b-3p的相關(guān)性分析圖2 MALAT1和miR-19b-3p在非小細(xì)胞肺癌組織及癌旁組織中的相對(duì)表達(dá)量Fig.2 The relative expression levels of MALAT1 and miR-19b-3p in NSCLC tissue and paracancerous tissue
qRT-PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn),與人正常支氣管上皮細(xì)胞系16HBE相比,MALAT1在人NSCLC細(xì)胞系NCI-H1299、NCI-H1650、SPC-A1、A549中相對(duì)表達(dá)增加,其中A549平均相對(duì)表達(dá)量較高為(6.815±1.031)(P<0.05,圖3A),而miR-19b-3p在人NSCLC細(xì)胞系NCI-H1299、NCI-H1650、SPC-A1、A549中相對(duì)表達(dá)減少,其中A549平均相對(duì)表達(dá)量較低為(0.359±0.076)(P<0.05,圖3B)。綜上,MALAT1、miR-19b-3p在NSCLC細(xì)胞系A(chǔ)549中表達(dá)差異顯著。
A:MALAT1的相對(duì)表達(dá)量;B:miR-19b-3p的相對(duì)表達(dá)量;與16HBE細(xì)胞比較,*P<0.05圖3 MALAT1和miR-19b-3p在NSCLC細(xì)胞系及16HBE細(xì)胞系內(nèi)的相對(duì)表達(dá)量Fig.3 The relative expression levels of MALAT1 and miR-19b-3p in NSCLC and 16HBE cell lines
qRT-PCR結(jié)果顯示,NC mimic組、si-NC組與Control組之間miR-19b-3p、MALAT1、HIF-1α、VEGF基因的RNA表達(dá)差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。miR-19b-3p mimic組細(xì)胞中miR-19b-3p表達(dá)升高,表明轉(zhuǎn)染有效,同時(shí)轉(zhuǎn)染后A549細(xì)胞內(nèi)MALAT1、HIF-1α、VEGF的RNA水平顯著下降(均P<0.05)。si-MALAT1組細(xì)胞中MALAT1表達(dá)降低,同時(shí)轉(zhuǎn)染后A549細(xì)胞中的miR-19b-3p水平顯著上升,HIF-1α、VEGF基因的RNA水平均顯著下降(均P<0.05)。Western blot檢測(cè)結(jié)果顯示,NC mimic組、si-NC組與Control組之間HIF-1α、VEGF蛋白表達(dá)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而miR-19b-3p mimic組、si-MALAT1組相對(duì)于其他對(duì)照組中HIF-1α、VEGF水平均顯著下降(均P<0.05)。見(jiàn)圖4。
1:Control;2:NC mimic;3;miR-19b-3p mimic;4;si-NC;5:si-MALAT1;A:轉(zhuǎn)染后miR-19b-3p的RNA相對(duì)表達(dá)量;B:轉(zhuǎn)染后MALAT1的RNA相對(duì)表達(dá)量;C:轉(zhuǎn)染后HIF-1α的RNA相對(duì)表達(dá)量;D:轉(zhuǎn)染后VEGF的RNA相對(duì)表達(dá)量;E:轉(zhuǎn)染后HIF-1α的蛋白相對(duì)表達(dá)量;F:轉(zhuǎn)染后VEGF的蛋白相對(duì)表達(dá)量;G:HIF-1α、VEGF的Western blot圖;*P<0.05圖4 轉(zhuǎn)染miR-19b-3p mimic及si-MALAT1對(duì)A549細(xì)胞miR-19b-3p、MALAT1、HIF-1α、VEGF基因相對(duì)表達(dá)水平的影響Fig.4 Effect of transfection of miR-19b-3p mimic and si-MALAT1 on the relative expression levels of miR-19b-3p,MALAT1,HIF-1α and VEGF gene in A549 cells
如圖5所示,轉(zhuǎn)染miR-19b-3p mimic后,NC mimic組與Control組之間增殖水平、細(xì)胞周期分布、細(xì)胞凋亡率及細(xì)胞遷移侵襲水平差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。而miR-19b-3p mimic組中,轉(zhuǎn)染后的A549細(xì)胞的增殖活性下降;G2/M期細(xì)胞比例下降及G0/G1期細(xì)胞比例有所上升;細(xì)胞凋亡率增加;細(xì)胞遷移及侵襲細(xì)胞數(shù)水平明顯下降(均P<0.05)。
1:Control;2:NC mimic;3;miR-19b-3p mimic;A:轉(zhuǎn)染對(duì)細(xì)胞增殖的影響;B:轉(zhuǎn)染對(duì)細(xì)胞周期的影響;C:轉(zhuǎn)染對(duì)細(xì)胞凋亡的影響;D:轉(zhuǎn)染后細(xì)胞遷移及侵襲細(xì)胞計(jì)數(shù)變化柱狀圖;E:細(xì)胞遷移及侵襲實(shí)驗(yàn)鏡下圖(標(biāo)尺=50 μm);*P<0.05圖5 過(guò)表達(dá)miR-19b-3p后A549細(xì)胞的增殖、細(xì)胞周期、凋亡、遷移、侵襲水平變化Fig.5 Changes in A549 cells proliferation,cell cycle,apoptosis,migration and invasion after overexpression of miR-19b-3p
MALAT1最早發(fā)現(xiàn)于對(duì)NSCLC的研究,在其細(xì)胞及組織中高度表達(dá),被視為NSCLC預(yù)后標(biāo)志物[11]?,F(xiàn)有研究證實(shí)MALAT1與肺、乳腺、結(jié)腸、膀胱、肝臟和胰腺等多種實(shí)體惡性腫瘤顯著相關(guān),被認(rèn)為是促癌類的lncRNA[12-13]。既往有研究發(fā)現(xiàn)MALAT1與缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)通路似乎密切相關(guān)[14-15]。然而MALAT1參與NSCLC的具體分子機(jī)制卻不明確。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是不具備編碼蛋白質(zhì)功能的長(zhǎng)核糖核苷酸鏈(>200 nt)RNA,但其通過(guò)不同機(jī)制對(duì)細(xì)胞內(nèi)生物活動(dòng)起到多重調(diào)節(jié)作用[16]。lncRNA的重要調(diào)節(jié)機(jī)制之一是充當(dāng)內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性RNA(ceRNA)通過(guò)海綿吸附miRNA來(lái)調(diào)節(jié)后者生物學(xué)功能[17]。在一項(xiàng)關(guān)于乳腺癌的研究中發(fā)現(xiàn)[18],MALAT1可以被HIF-1α和HIF-2α轉(zhuǎn)錄激活,并與miR-3064-5p相互靶向結(jié)合促進(jìn)乳腺癌MCF-7和MDA-MB-231細(xì)胞的增殖和遷移。在另外一項(xiàng)缺氧處理的人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞研究中,敲低MALAT1可提高細(xì)胞中miR-19b-3p水平,并抑制HIF-1α的表達(dá)以及細(xì)胞的凋亡、自噬和炎癥反應(yīng),HIF-1α的過(guò)表達(dá)可逆轉(zhuǎn)MALAT1敲低的影響[10],這與本研究結(jié)果一致。本研究在NSCLC患者外周血高通量測(cè)序及NSCLC患者癌組織及NSCLC細(xì)胞系中發(fā)現(xiàn)MALAT1表達(dá)量升高,而miR-19b-3p表達(dá)量顯著減少;生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)MALAT1與miR-19b-3p存在靶向結(jié)合位點(diǎn),以上提示MALAT1或許充當(dāng)miR-19b-3p的ceRNA影響后者的生物學(xué)效應(yīng);本研究通過(guò)在A549細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-19b-3p及敲除MALAT1亦驗(yàn)證了此海綿機(jī)制的可能性。同時(shí),轉(zhuǎn)染miR-19b-3p mimic后的A549細(xì)胞內(nèi)MALAT1、HIF1α、VEGF下調(diào)顯著,并且A549細(xì)胞的增殖能力、分裂能力、遷移及侵襲能力均有所下降,凋亡率增加。本研究結(jié)果提示MALAT1可通過(guò)海綿吸附miR-19b-3p,調(diào)節(jié)下游HIF-1α/VEGF分子軸來(lái)影響NSCLC細(xì)胞的生物學(xué)功能。
miRNA調(diào)節(jié)內(nèi)源靶基因轉(zhuǎn)錄后表達(dá)水平,與真核細(xì)胞分化、增殖、凋亡、轉(zhuǎn)移等多種生物學(xué)行為密切相關(guān)。已發(fā)現(xiàn)多個(gè)miRNA作為腫瘤抑制因子或癌基因在NSCLC中異常表達(dá)[19]。miR-19b-3p是從miR-19b前體的3′端臂加工而成,其表達(dá)異常參與多種疾病病理生理過(guò)程。Zhao等[20]發(fā)現(xiàn)miR-19b-3p可靶向PTEN抑制人髓核細(xì)胞凋亡緩解椎間盤(pán)的退行性變。Su等[21]通過(guò)RNA測(cè)序篩選和qRT-PCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)miR-19b-3p可作為急性心力衰竭的新型預(yù)后生物標(biāo)志物。另外,miR-19b-3p表達(dá)異常參與多種惡性腫瘤疾病,例如食管癌[22]、胃癌、肺癌[23]、乳腺癌和淋巴瘤[24]等。在一項(xiàng)乳腺癌的研究中,miR-19b-3p通過(guò)調(diào)節(jié)PI3K/Akt途徑抑制乳腺癌細(xì)胞增殖并可逆轉(zhuǎn)塞卡替尼耐藥性[6]。Zhang等[25]采用高通量miR測(cè)序方法和qRT-PCR證實(shí)miR-19b-3p在3種胃癌細(xì)胞中表達(dá)顯著下調(diào)。Wei等[5]發(fā)現(xiàn),miR-19b-3p負(fù)調(diào)節(jié)NRP1抑制胃癌細(xì)胞生長(zhǎng)、遷移和侵襲,過(guò)表達(dá)NRP1可逆轉(zhuǎn)miR-19b-3p的負(fù)向調(diào)控作用。本研究生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè),miR-19b-3p可通過(guò)靶向HIF-1α其3′-UTR下調(diào)HIF-1α的表達(dá);細(xì)胞功能研究表明,miR-19b-3p通過(guò)負(fù)調(diào)節(jié)HIF-1α、VEGF抑制A549細(xì)胞的生長(zhǎng)、分裂、遷移和侵襲并促進(jìn)凋亡。然而在一項(xiàng)既往肺腺癌細(xì)胞的研究中[26],miR-19b-3p靶向GNG7在肺腺癌細(xì)胞中的表達(dá)升高,促進(jìn)了肺腺癌的進(jìn)展。這項(xiàng)研究與本研究結(jié)果不完全一致,miR-19b-3p在NSCLC中是否具有雙重作用,是否存在臨床組織樣本及細(xì)胞異質(zhì)性,其具體機(jī)制仍需要更多的基礎(chǔ)研究進(jìn)一步證實(shí)。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)miR-19b-3p在NSCLC中表達(dá)下調(diào),MALAT1作為ceRNA,可競(jìng)爭(zhēng)性抑制miR-19b-3p表達(dá),從而促進(jìn)A549細(xì)胞內(nèi)HIF-1α/VEGF分子軸表達(dá)。過(guò)表達(dá)miR-19b-3p可抑制A549細(xì)胞增殖、分裂、遷移、侵襲能力,促進(jìn)凋亡。因病例組織標(biāo)本數(shù)量相對(duì)較少,體外轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)細(xì)胞種類單一,本研究仍存在不足。因此,對(duì)miR-19b-3p參與NSCLC疾病的具體分子機(jī)制尚需未來(lái)進(jìn)一步研究。