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        lncRNA在心臟肥大中的作用研究進展

        2022-11-26 03:42:34鄧勇志
        關(guān)鍵詞:研究

        晏 陽,鄧勇志

        心臟肥大(cardiac hypertrophy,CH)是指在心臟前負荷或后負荷增加的情況下,為了維持外周器官的灌注量,以滿足其正?;驊?yīng)激條件下的需求而導(dǎo)致的心肌細胞數(shù)量不變但心臟體積增加[1],主要有兩種類型:生理性肥厚及病理性肥厚。生理性肥厚及病理性肥厚都涉及單個心肌細胞的肥大,都是作為心臟應(yīng)激(例如高血壓、瓣膜病、心肌梗死以及長期體育鍛煉)的適應(yīng)性反應(yīng)引起的,但是其潛在的分子機制、心臟表型及預(yù)后事件則完全不同。主要原因是生理性肥厚及病理性肥厚伴隨著基因表達的變化,從而導(dǎo)致心肌細胞新陳代謝、收縮力及存活的變化[2]。研究表明,長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)與微小型RNA(microRNAs,miRNA)均與心臟肥大高度相關(guān)[3],但與miRNA受到的廣泛研究不同,lncRNA在心臟肥大的作用研究卻是剛剛開始[4]。

        1 lncRNA的分類及功能

        人類基因組的大部分均具有轉(zhuǎn)錄活性,但是只要極少部分能夠被翻譯成蛋白質(zhì),其余都轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA(non-coding RNAs,ncRNA),非編碼RNA覆蓋人類基因組的98%以上[5]。lncRNA是指從基因組產(chǎn)生的長度大于200個核苷酸的轉(zhuǎn)錄本,編碼潛力有限。lncRNA的命名標準基于雨果基因命名委員會的命名指導(dǎo)指南,lncRNA的現(xiàn)有分類則取決于其描述性和獨特性[6]。隨著對RNA測序技術(shù)的深入了解,在不同的人體組織中已經(jīng)鑒定出5萬多個lncRNA,分別來源于內(nèi)含子、外顯子及基因間隔區(qū)[7]。lncRNA的功能主要通過其定位、序列或二級結(jié)構(gòu)來確定,其功能還可能通過與DNA、RNA和蛋白質(zhì)的相互作用來完成。因此基于lncRNA的基因組位置,可以將其分為5個類別:反義、雙向、內(nèi)含子和基因間,基因間和增強子lncRNAs包含其自身的啟動子,與蛋白質(zhì)編碼基因不同。雙向lncRNA共享一個啟動子,并從蛋白質(zhì)編碼基因的反義鏈轉(zhuǎn)錄,而內(nèi)含子lncRNA在蛋白質(zhì)編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域內(nèi)轉(zhuǎn)錄[8]。雖然不能基于lncRNA分類來確定lncRNA功能,但是分類有時候可以幫助了解其作用機制。還可以按其分子功能對lncRNA進行分類。①信號lncRNA:可作為分子信號以整合發(fā)育線索或?qū)Ω鞣N刺激做出反應(yīng),還可以作為重要的生物學事件標記;②誘餌RNA:可以從染色質(zhì)上結(jié)合RNA結(jié)合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)或滴定靶標miRNA來調(diào)控轉(zhuǎn)錄;③導(dǎo)游lncRNA:通過募集染色質(zhì)修飾酶來修飾靶向基因位點;④支架RNA:組裝多種蛋白質(zhì)以形成核糖核蛋白復(fù)合物(ribonucleoprotein complex,RNP)影響組蛋白修飾;⑤增強劑lncRNA:通過充當增強子來實現(xiàn)改變基因的表達[9]。

        lncRNA調(diào)控可以分為3個部分來闡述:①在主動轉(zhuǎn)錄過程中l(wèi)ncRNA可以進行差異剪接或在刺激后利用新的轉(zhuǎn)錄起始位點;②轉(zhuǎn)錄完成后RNA修飾可以根據(jù)細胞的炎癥狀態(tài)添加或刪除修飾來改變lncRNA的分子結(jié)構(gòu),或被加工成成熟的miRNA,或lncRNA具有小的開放閱讀框(small open reading frame,smORF);③lncRNA在細胞核和細胞質(zhì)中的調(diào)節(jié)功能,lncRNA可以是轉(zhuǎn)錄因子增強激活的支架,也可以是關(guān)閉染色質(zhì)的支架,可以影響穩(wěn)定性、改變剪接活性、修飾編輯甚至通過給成熟mRNA加帽來調(diào)控mRNA的轉(zhuǎn)錄。lncRNA還可以充當miRNA海綿,間接地抑制miRNA靶向mRNA的表達,或在翻譯過程中與核糖體或mRNA轉(zhuǎn)錄物結(jié)合來調(diào)節(jié)mRNA的翻譯[10]。

        2 lncRNA與心臟肥大的關(guān)系

        lncRNA構(gòu)成了人類轉(zhuǎn)錄基因組的大部分,多項研究表明,最大的RNA轉(zhuǎn)錄類別在許多細胞過程包括細胞分化、組織器官發(fā)育到癌癥的發(fā)生中都發(fā)揮著重要的作用。目前,lncRNA的研究主要集中在癌癥領(lǐng)域[11]。隨著高通量RNA測序技術(shù)的進步,越來越多的證據(jù)表明lncRNA在心臟肥大的過程中發(fā)揮著重要作用,包括Chaer、Chast、Mhrt、CHRF、ROR、H19、ZEB2-AS1、Gm15834和MIAT在內(nèi)的lncRNA與心臟肥大密切相關(guān)。

        2.1 lncRNA對心臟肥大的正向調(diào)控作用 表觀遺傳重編程是心臟肥大過程中基因誘導(dǎo)的關(guān)鍵過程,心臟肥大相關(guān)表觀遺傳調(diào)節(jié)物Chaer是在心臟肥大中富含的一種lncRNA,是介導(dǎo)心臟肥大過程的關(guān)鍵基因。實驗發(fā)現(xiàn),Chaer在應(yīng)激刺激下在雷帕霉素(mTOR)信號傳導(dǎo)途徑上通過與多梳抑制物復(fù)合體(polycomb repressor complex 2,PRC2)催化亞基直接相互作用,抑制肥大基因組蛋白H3賴氨酸27甲基化,誘導(dǎo)心肌肥大的發(fā)生[12]。另一種心臟肥大相關(guān)轉(zhuǎn)錄物Chast在橫斷主動脈縮窄(transverse aortic constriction,TAC)操作的小鼠體內(nèi)和主動脈瓣狹窄病人的心臟中都發(fā)現(xiàn)明顯上調(diào)。Viereck等[13]研究發(fā)現(xiàn),Chast負調(diào)節(jié)Chast反義鏈上的含Pleckstrin同源結(jié)構(gòu)域的蛋白家族M成員1(pleckstrin homology domain-containing protein family M member 1,Plekhm1)阻止心肌細胞自噬以此驅(qū)動心肌肥大。而Cheng等[14]在探索lncRNA ZEB2-AS1與磷酸酶和張力蛋白同源物(phosphatase and tensin homolog,PTEN)對細胞表面積的調(diào)控作用時,發(fā)現(xiàn)lncRNA ZEB2-AS1可以通過下調(diào)PTEN來刺激心臟肥大。除上述幾種方式以外,lncRNA Gm15834的強表達可增強心肌細胞的自噬活性促進心肌肥大的發(fā)生,而沉默lncRNA Gm15834則減弱了自噬誘導(dǎo)的心肌肥厚。Gm15834還可以作為microRNA(miR)-30b-3p的內(nèi)源性海綿RNA,抑制miR-30b-3p增強了心肌的自噬活性并加劇了心肌肥大[15]。Wang等[16]發(fā)現(xiàn),lncRNA-自噬促進因子(autophagy promoting factor,APF)可以通過調(diào)節(jié)miR-188-3p從而提高自噬相關(guān)蛋白7(autophagy associated protein,ATG7)翻譯的表達,導(dǎo)致心肌缺血增加。Jiang等[17]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA ROR通過充當miR-133的海綿可以促進心臟肥大反應(yīng)。相關(guān)研究還證明了lncRNA心肌梗死相關(guān)轉(zhuǎn)錄本(myocardial infarction related transcript,MIAT)對心肌肥大的其他調(diào)節(jié)作用。Zhu等[18]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA-MIAT增加了miR-150的表達,增強了心肌細胞的病理發(fā)育,從而促進了心肌肥大的發(fā)展。還有研究指出,lncRNA UCA1在經(jīng)橫向主動脈縮窄處理的小鼠心肌細胞中高表達,而miR-184是UCA1心臟肥大的靶標,UCA1可以通過與miR-184競爭性結(jié)合來改善HOXA9 mRNA的表達,介導(dǎo)心肌肥大的發(fā)展[19]。lncRNA PEG10也可以通過調(diào)節(jié)HOXA9加重心肌肥大[20]。

        2.2 lncRNA對心臟肥大的負向調(diào)控作用 與上述lncRNA對于心臟肥大的正向調(diào)控作用不同,越來越多的研究證明lncRNA與心臟肥大的負向調(diào)節(jié)也具有明顯的相關(guān)性。H19 lncRNA是一種在進化上高度保守的基因,其與許多重要的生物過程與疾病相關(guān)。Liu等[21]通過RNA測序法檢測了正常和患病病人心臟中H19及其編碼的miR-675的表達,發(fā)現(xiàn)其在病理性心臟肥大中上調(diào),并在細胞實驗中發(fā)現(xiàn)敲低H19可誘導(dǎo)心肌肥大,為了進一步驗證H19在心臟肥大中的作用,研究者在新生小鼠心肌細胞中施用了用于小鼠H19的siRNA,用siRNA-H19轉(zhuǎn)染心肌細胞可顯著降低內(nèi)源性H19和miR-675的表達,并顯著增加細胞肥大,由此證明H19的過表達可以抑制心肌細胞的肥大生長。促肥大因子Ca/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶Ⅱδ(Ca/calmodulin-dependent protein kinase Ⅱδ,CaMKⅡδ)是miR-675的直接靶標,進一步研究證明揭示了靶向CaMKIIδ的H19-miR-675軸作為心臟肥大的負調(diào)節(jié)劑的新功能[21]。進一步研究表明,H19可以與PRC2發(fā)生相互作用抑制抗肥大性Tescalcin基因座的H3K27三甲基化從而抑制活化T細胞的表達和活性,進一步逆轉(zhuǎn)病理性心肌肥大[22]。另有研究發(fā)現(xiàn),之前未注釋過的lncRNA,稱之為抗肥厚性相關(guān)轉(zhuǎn)錄本(antihypertrophic interrelated transcript,Ahit)在橫斷主動脈縮窄的小鼠心臟中表達上調(diào),并在隨后的體內(nèi)與體外實驗發(fā)現(xiàn)Ahit可以將肌細胞增強因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)的啟動子與核心PRC2蛋白zeste 12蛋白同源物的抑制劑(suppressor of zeste 12 protein homolog,SUZ12)結(jié)合并募集到MEF2A的啟動子上觸發(fā)其在H3賴氨酸27殘基上的三甲基化(H3K27me3)并介導(dǎo)MEF2A的下調(diào),從而防止心臟肥大。其中MEF2A是參與心肌肥大的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,Ahit介導(dǎo)的心肌肥大的抑制都與MEF2的表達有關(guān),SUZ12是zeste 12蛋白同源物的抑制劑(suppressor of zeste 12 protein homolog,SUZ12)[23]。在本研究中提到lncRNA和miRNA之間在調(diào)節(jié)心臟肥大功能方面有重要聯(lián)系,并發(fā)現(xiàn)lncRNA Gm15834抑制miR-30b-3p增強了心肌的自噬活性并加劇了心肌肥大,但在后續(xù)研究中可以發(fā)現(xiàn)miR-30b-3p的過表達通過靶向調(diào)控unc-51-like激酶1(unc-51-like kinase 1,ULK1)的下游自噬因子反而抑制了自噬誘導(dǎo)的心肌肥大[15]。所以lncRNA與miRNA之間的相互作用及其在心臟肥大中的進一步調(diào)節(jié)將是接下來研究的重點內(nèi)容。將心臟肥大相關(guān)調(diào)節(jié)劑(cardiac hypertrophy related regulator,CHRF)作為抗肥大性lncRNA,發(fā)現(xiàn)其在血管緊張素Ⅱ(angiotensin Ⅱ,Ang Ⅱ)誘導(dǎo)的TAC小鼠模型體內(nèi)和心肌肥大細胞模型中均被上調(diào),Wang等[24]研究發(fā)現(xiàn),CHRF是通過下調(diào)miR-489的表達水平來發(fā)揮抗心肌肥大作用。進一步研究證明,miR-20b通過抑制PTEN的表達并間接加重蛋白激酶AKT的活性來誘導(dǎo)心臟肥大,AKT是PTEN的下游效應(yīng)子并參與心臟肥大的調(diào)節(jié),而CHAR的過度表達可能下調(diào)miR-20b的水平,此研究表明,lncRNA CHAR通過海綿樣作用吸收miR-20b,調(diào)節(jié)miR-20b-PTEN-AKT信號傳導(dǎo)途徑減輕心肌肥大反應(yīng)[25]。

        3 小結(jié)與展望

        近年來,隨著RNA測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的研究表明lncRNA參與調(diào)節(jié)心臟重塑的多個病理過程,包括心肌肥大、自噬、壞死、凋亡、纖維化以及血管細胞的凋亡和增殖。因此,通過抑制疾病上調(diào)的lncRNA或增加疾病下調(diào)的lncRNA來操縱lncRNA表達水平代表了心臟重塑的新治療策略,但總的來說對于lncRNA與miRNA的認知及研究仍處于初級階段,所以lncRNA在心臟肥大中的作用仍是現(xiàn)在及未來的熱點[26]。

        lncRNA可以與不同的蛋白質(zhì)如PCR2、PTEN等結(jié)合介導(dǎo)心臟肥大的發(fā)生或減輕心肌肥大反應(yīng);不同的lncRNA-miRNA也可以通過靶向不同的mRNA介導(dǎo)不同的生物學過程,例如:ROR與miR-133的組合可以促進充當miR-133的海綿以促進心臟肥大反應(yīng);MIAT通過增強miR-150的表達,促進心肌肥大;而H19和miR-675的組合可以抑制CaMKIId和USP10的表達來調(diào)節(jié)心臟肥大;CHRF也可以下調(diào)的miR-489的表達水平來發(fā)揮抗心肌肥大作用等。這些研究證明了lncRNA有望成為指導(dǎo)個體化治療心臟肥大的新工具,但仍需要開展大規(guī)模的前瞻性臨床研究及進一步的試驗以確保其臨床效果[27]。

        綜上所述,lncRNA在調(diào)節(jié)心臟肥大的生物過程中發(fā)揮著重要作用,通過在心肌細胞中的特異表達或與miRNA的組合,正向或負向的調(diào)控心肌肥大的發(fā)展,影響心臟肥大的進展。迄今為止,針對lncRNA在動物模型中的作用已經(jīng)成功地進行了各種研究,但是由于lncRNA的先天免疫應(yīng)答及不可預(yù)測的毒性和lncRNA表現(xiàn)出來的物種特異性高和保守性差,所以即使在動物模型中取得了成功,也并未進行臨床臨床試驗,對于這些發(fā)現(xiàn)能否可以轉(zhuǎn)移到人類上仍是一個未知數(shù)。因此,將lncRNA的治療靶向從動物模型轉(zhuǎn)移至人類疾病尤為重要,通過對心臟肥大相關(guān)的lncRNA進行更深入的研究,可以在生物學上獲得新的分子遺傳學見解,從而有可能創(chuàng)造出獨特的藥理和治療靶點機會。

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