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        用“基因”,重新定義疾病

        2022-11-23 03:10:13王仲昀
        新民周刊 2022年43期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        王仲昀

        第二屆“NGS(新一代基因測(cè)序)行業(yè)峰會(huì)”上,生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)<?、臨床醫(yī)學(xué)專家、基因檢測(cè)頭部企業(yè)代表等各領(lǐng)域?qū)I(yè)人士,圍繞著如何通過(guò)基因技術(shù)實(shí)現(xiàn)“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”的目標(biāo)展開(kāi)了討論。

        疾病對(duì)人類社會(huì)到底有多大的影響?身處全球新冠疫情中的我們,深有體會(huì)。

        人類自誕生就在與疾病做抗?fàn)?,不斷摔倒又爬起?lái)。分子生物學(xué)誕生后,我們的“武器”變得精良,當(dāng)分子生物學(xué)與信息技術(shù)、大數(shù)據(jù)、人工智能等結(jié)合后,“武器”再次升級(jí)。

        近十年基因組學(xué)與基因測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展,更讓人類擁有更多了解疾病、戰(zhàn)勝疾病的底氣。在中國(guó),《“十四五”生物經(jīng)濟(jì)發(fā)展規(guī)劃》中提出推動(dòng)基因檢測(cè)、生物遺傳等先進(jìn)技術(shù)與疾病預(yù)防深度融合,開(kāi)展重大疾病早期篩查,為個(gè)體化治療提供精準(zhǔn)解決方案和決策支持。借助最新科技建設(shè)健康中國(guó)已經(jīng)成為國(guó)家策略。

        從現(xiàn)今人們熟悉的新冠病毒測(cè)序到腫瘤溯源早檢,基因測(cè)序技術(shù)正在讓“精準(zhǔn)醫(yī)療”走進(jìn)現(xiàn)實(shí)。

        2022年11月9日,全球基因測(cè)序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者因美納主辦的第二屆“NGS(新一代基因測(cè)序)行業(yè)峰會(huì)”在上海舉行。峰會(huì)上,生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)<?、臨床醫(yī)學(xué)專家、基因檢測(cè)頭部企業(yè)代表等各領(lǐng)域?qū)I(yè)人士,圍繞著如何通過(guò)基因技術(shù)實(shí)現(xiàn)“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”的目標(biāo)展開(kāi)了討論。

        作為對(duì)人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一,肺癌在中國(guó)的發(fā)病率和死亡率常年高居惡性腫瘤之首,且逐年呈上升趨勢(shì)。20年前,很多剛?cè)胄械姆伟┽t(yī)生接觸這個(gè)專業(yè),學(xué)習(xí)的內(nèi)容大多圍繞著化療。20年后的今天,肺癌的治療方式已經(jīng)包括手術(shù)、放療、化療、靶向以及免疫治療等。其中,靶向治療成為精準(zhǔn)治療的奠基石。

        進(jìn)一步看,得益于新一代測(cè)序技術(shù)(Next Generation Sequencing,以下簡(jiǎn)稱NGS)的快速發(fā)展,越來(lái)越多的靶點(diǎn)被檢測(cè)出來(lái),一些靶點(diǎn)已經(jīng)“被認(rèn)識(shí)”、“被研究”、“被研制成藥”。 《新民周刊》記者不久前采訪過(guò)福建省腫瘤醫(yī)院胸部腫瘤內(nèi)科主任醫(yī)師林根,他向記者分享了一個(gè)NGS技術(shù)如何推動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)療的故事。

        林根介紹,曾有一位女性肺癌患者,在外院初次就診即診斷為晚期非小細(xì)胞肺癌。在做過(guò)8個(gè)常見(jiàn)靶點(diǎn)的一代基因檢測(cè)后,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)基因突變,被認(rèn)為是無(wú)靶向藥物可用,隨后采取了化療和免疫治療。但患者的病情毫無(wú)起色,持續(xù)惡化。

        “她來(lái)到我院就診后,經(jīng)過(guò)專家團(tuán)隊(duì)的研究和與她充分的溝通,安排她再次進(jìn)行了更為精細(xì)的新一代基因測(cè)序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)她是一個(gè)發(fā)生率小于1%——罕見(jiàn)ROS1重排的患者。我們立即為其制定了針對(duì)性的藥物治療方案,患者在口服藥物后腫瘤直徑消失90%以上,并維持至今。如果沒(méi)有檢出這個(gè)基因突變,她可能早已不在人世。”林根說(shuō)道。

        不難看出,基因組學(xué)的進(jìn)步與測(cè)序技術(shù)的飛速提升,成為加速實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療的關(guān)鍵,使得科學(xué)家、研究人員能夠在分子層面上探究最根本的發(fā)病機(jī)制,讓臨床醫(yī)生能夠設(shè)計(jì)出治療方案,著力攻克曾經(jīng)過(guò)去無(wú)法被攻克的疾病。精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)為越來(lái)越多病患帶去生存的希望。

        第五屆進(jìn)博會(huì)上,序禎達(dá)生物簽下因美納最新產(chǎn)品NovaSeq? X Plus的第一單。序禎達(dá)生物創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官孫樂(lè)樂(lè)說(shuō),一個(gè)月前她在因美納IGF論壇上見(jiàn)證了NovaSeq?? X Plus的全球首發(fā),“我一直以來(lái)都是因美納產(chǎn)品的忠實(shí)粉絲,也很高興能繼續(xù)與因美納合作,用這款高質(zhì)量的測(cè)序儀,推動(dòng)中國(guó)乃至全球的基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)發(fā)展。”上海序禎達(dá)生物科技有限公司是中國(guó)領(lǐng)先的多組學(xué)服務(wù)商,服務(wù)的客戶主要有制藥企業(yè)和科研機(jī)構(gòu),而基因測(cè)序儀器是序禎達(dá)開(kāi)發(fā)各種應(yīng)用的基礎(chǔ)。

        燃石醫(yī)學(xué)創(chuàng)始人兼CEO漢雨生。

        “早在2014年,我們就判斷精準(zhǔn)醫(yī)療將會(huì)成為腫瘤臨床治療的大趨勢(shì),基于NGS的多基因的檢測(cè)將成為‘剛需’?!比际t(yī)學(xué)創(chuàng)始人、CEO漢雨生接受《新民周刊》采訪時(shí)說(shuō)。漢雨生畢業(yè)于北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院細(xì)胞生物學(xué)專業(yè),曾在北極光創(chuàng)投擔(dān)任過(guò)醫(yī)療投資經(jīng)理。在看準(zhǔn)“精準(zhǔn)醫(yī)療”發(fā)展方向后,他創(chuàng)辦了燃石醫(yī)學(xué)。

        作為一個(gè)高速發(fā)展的賽道,過(guò)去幾年,NGS行業(yè)經(jīng)歷了從最初的“無(wú)人問(wèn)津”到“蜂擁而至”,從無(wú)序再到如今逐漸形成了一些共識(shí)、有了頭部企業(yè)并走出了各自特色的發(fā)展路徑。

        “我們可以看到,基因測(cè)序在用藥指導(dǎo)、微小病灶殘留、遺傳易感、復(fù)發(fā)監(jiān)控以及全程管理等方面都發(fā)揮著重要的作用。目前燃石醫(yī)學(xué)的業(yè)務(wù)布局涉及癌癥患病人群精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢測(cè)、全球抗腫瘤藥企的生物標(biāo)志物和伴隨診斷合作,以及多癌種早檢三個(gè)方向?!睗h雨生告訴記者。

        燃石醫(yī)學(xué)從應(yīng)用場(chǎng)景的獲益人群基數(shù)、衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)角度出發(fā),選擇布局基于液體活檢的多癌種早檢技術(shù),也就是通過(guò)抽取一管血就可實(shí)現(xiàn)多個(gè)癌種的早期檢測(cè),包括肺癌、腸癌、肝癌、卵巢癌、胰腺癌、食管癌等癌種。

        序禎達(dá)生物簽下因美納最新產(chǎn)品NovaSeq? X Plus的第一單。

        燃石醫(yī)學(xué)早檢中心。

        目前我國(guó)有2000多萬(wàn)存量的癌癥病人。隨著治療手段的越來(lái)越多,以及越來(lái)越廣泛的早篩,會(huì)有更多的病人存活下來(lái)。

        “從2016年開(kāi)始,我們就不遺余力地投入多癌種早檢業(yè)務(wù)。目前無(wú)論是技術(shù)水平,還是臨床驗(yàn)證研究的開(kāi)展和推進(jìn)等方面,燃石醫(yī)學(xué)都位于行業(yè)前列。我們的多癌種早檢技術(shù)ELSA-seq也已經(jīng)多次發(fā)表于國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)雜志與會(huì)議,在多個(gè)癌種中得到了良好的性能驗(yàn)證?!睗h雨生說(shuō)道。

        漢雨生向記者介紹,燃石醫(yī)學(xué)最新的一管血多癌種早期檢測(cè)產(chǎn)品不光能甄別出受試者是否有腫瘤,還可以提供組織溯源性,告訴受試者檢測(cè)出的腫瘤信號(hào)有可能來(lái)源于哪個(gè)器官。在此基礎(chǔ)上,臨床可以通過(guò)影像腔鏡及病理檢測(cè)等方法進(jìn)一步檢查和確診。

        基因測(cè)序給醫(yī)療帶來(lái)了革命性的改變。具體在癌癥診療領(lǐng)域, NGS技術(shù)更貫穿了癌癥診療全周期。在診療領(lǐng)域,基因檢測(cè)的出現(xiàn),為患者帶來(lái)了更多、更精準(zhǔn)的治療選擇。

        如今中國(guó)NGS市場(chǎng)愈發(fā)壯大,其中有一家企業(yè)——“泛生子”,在基因科技上不斷創(chuàng)新,對(duì)抗“癌癥全周期”。

        “基因組學(xué)及分子診斷技術(shù),是癌癥精準(zhǔn)醫(yī)療的基礎(chǔ)和入口,幫助醫(yī)生獲得目標(biāo)獵物的具體信息并鎖定位置。理論上看,在癌癥發(fā)生、發(fā)展不同時(shí)期都有可能阻斷或打敗癌癥。所以泛生子希望積極利用基因組學(xué)技術(shù)到人們管理癌癥整個(gè)周期?!狈荷勇?lián)合創(chuàng)始人、董事長(zhǎng)兼CEO王思振對(duì)《新民周刊》說(shuō)道。

        基于這樣的理念,泛生子將業(yè)務(wù)板塊分為早篩、診斷及監(jiān)測(cè)、藥物研發(fā)服務(wù)三大領(lǐng)域。王思振對(duì)此表示,“對(duì)于那些還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)或確診癌癥的人,我們希望在早期能夠把他們篩出來(lái),以此大幅提高生存率,及時(shí)阻止癌癥發(fā)展?!?/p>

        癌癥早篩的社會(huì)意義巨大。2018年,全國(guó)肺癌新增患者約80萬(wàn)人,其中80%發(fā)現(xiàn)癌癥時(shí)已是晚期。若癌癥在早期時(shí)就被發(fā)現(xiàn),總共可降低約480億元的醫(yī)療支出,大約27萬(wàn)人的生存周期可以得到延長(zhǎng)。

        泛生子的第二大業(yè)務(wù)板塊是癌癥診斷與監(jiān)測(cè),即通過(guò)分子檢測(cè)幫助腫瘤患者找到更適合的治療手段。這些監(jiān)測(cè)技術(shù)在當(dāng)下?lián)碛辛烁嗟氖褂脠?chǎng)景?!澳壳拔覈?guó)有2000多萬(wàn)存量的癌癥病人。隨著治療手段的越來(lái)越多,以及越來(lái)越廣泛的早篩,會(huì)有更多的病人存活下來(lái)。無(wú)論是‘帶癌生存’,抑或這些病人的腫瘤在他身上已經(jīng)變成了一個(gè)慢性病,他們都可以存活更久。”王思振告訴記者。

        “對(duì)于這部分患者而言,他們面臨一個(gè)很重要的需求,需要了解什么時(shí)候可能復(fù)發(fā),復(fù)發(fā)了以后又該怎么辦?”王思振表示,這便是NGS在現(xiàn)實(shí)中另一個(gè)重要的應(yīng)用場(chǎng)景。“通過(guò)高精度的測(cè)序,我們可以通過(guò)對(duì)患者血液當(dāng)中的生物標(biāo)志物和物質(zhì)突變的監(jiān)測(cè)來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)發(fā)的預(yù)測(cè)。因此,圍繞該方向,泛生子正在著力打造一系列產(chǎn)品?!?/p>

        泛生子聯(lián)合創(chuàng)始人、董事長(zhǎng)兼CEO 王思振。

        去年 11 月及今年 2 月,泛生子高通量測(cè)序儀GENETRON S5及肺癌8基因試劑盒分別獲批,形成了“測(cè)序儀 + 試劑盒”的完整解決方案。

        王思振介紹道,泛生子專利技術(shù)如 “一步法”、“Mutation Capsule”等,能讓原本操作復(fù)雜、需要花費(fèi)更多時(shí)間、消耗更多樣本才能完成的分子檢測(cè)實(shí)驗(yàn)變得簡(jiǎn)單快速且精準(zhǔn)。近期上海、杭州陸續(xù)推出LDT試點(diǎn)政策。腫瘤基因檢測(cè)項(xiàng)目有望納入醫(yī)保和集采?;谡咄苿?dòng),這類技術(shù)有望在公立醫(yī)院大規(guī)模推廣。

        NGS技術(shù)同樣能夠?yàn)樗幬镅邪l(fā)服務(wù)。近年來(lái),中國(guó)新藥研發(fā)進(jìn)入高速發(fā)展期,尤其是腫瘤創(chuàng)新藥領(lǐng)域內(nèi),出現(xiàn)了一大批具備自主研發(fā)能力的藥企。在新藥研發(fā)的過(guò)程當(dāng)中,也需要從事基因組學(xué)分析的公司參與其中。據(jù)王思振介紹,從新藥研發(fā)到 I 期、II 期、III 期臨床,再到上市,泛生子有能力為藥企提供療效標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、檢測(cè)技術(shù)及試劑盒開(kāi)發(fā)、注冊(cè)報(bào)證等全面配套服務(wù),而泛生子所研發(fā)的伴隨診斷產(chǎn)品也將與新藥深度綁定。

        當(dāng)然,基因測(cè)序涉及的這三大業(yè)務(wù),目前在國(guó)內(nèi)仍處在早期階段。王思振也在采訪中多次提到“可及性”。“NGS可以和醫(yī)院結(jié)合,可以在體檢中心用到,也可以配合政府的民生工程。但無(wú)論如何,只有價(jià)格足夠低,老百姓用得起,才具備真正的可及性?!?/p>

        11月9日,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院院長(zhǎng)毛穎在因美納第二屆“NGS行業(yè)峰會(huì)”上表示,“精準(zhǔn)醫(yī)療的實(shí)現(xiàn),最重要的一點(diǎn)就是患者是否能負(fù)擔(dān)得起。這要求每一個(gè)參與精準(zhǔn)醫(yī)療過(guò)程的相關(guān)方,都把降低成本、造?;颊咦鳛樽约旱哪繕?biāo)。希望通過(guò)醫(yī)院與產(chǎn)業(yè)上下游全鏈條、全周期的合作,為患者提供最普惠、簡(jiǎn)潔的診斷和治療方案?!?/p>

        國(guó)內(nèi)目前諸多測(cè)序服務(wù)提供商,按主要服務(wù)的客戶分為兩大類,一是臨床、醫(yī)療類的基因檢測(cè)服務(wù)提供商,二是面向基礎(chǔ)研究的基因測(cè)序服務(wù)提供商。后者主要客戶為大學(xué)、科研機(jī)構(gòu)、研究型醫(yī)院、生物醫(yī)藥公司等,提供基礎(chǔ)科研、新藥研發(fā)過(guò)程中所需要的基因測(cè)序服務(wù)。創(chuàng)立于2011年的諾禾致源就是這樣一家以科技服務(wù)為核心的企業(yè)。

        “和專注于某一個(gè)或多個(gè)細(xì)分臨床基因檢測(cè)的企業(yè)有所不同,諾禾致源目前主營(yíng)科技服務(wù),而服務(wù)的客戶是全球研究型大學(xué)、科研院所、醫(yī)院、醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)、農(nóng)業(yè)企業(yè)等?!敝Z禾致源創(chuàng)始人、董事長(zhǎng)李瑞強(qiáng)告訴《新民周刊》。

        在諾禾致源服務(wù)的客戶中,相當(dāng)一部分為農(nóng)業(yè)科學(xué)家。如今“糧食安全”“種業(yè)振興”的重要性不言而喻,想要“讓中國(guó)百姓餐桌更豐富”,包括種子、糧食作物、畜牧業(yè)肉類產(chǎn)品的改良就至關(guān)重要,種業(yè)更是農(nóng)業(yè)的“芯片”,而育種的基礎(chǔ)工具之一就是基因測(cè)序。

        諾禾致源柔性智能交付系統(tǒng) Falcon。

        以棉花為例,最近發(fā)表在《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》PNAS上的研究成果是諾禾致源與中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所科學(xué)家合力應(yīng)用組學(xué)技術(shù)助力分子設(shè)計(jì)育種的典型案例。研究員劉方老師分享:“如果我們能解析出除栽培種之外的其余野生種的基因圖譜,并進(jìn)行分析對(duì)比,就能進(jìn)一步了解在野生到栽培的演化過(guò)程中究竟保留了哪些基因、丟掉了哪些基因?這樣整個(gè)演化歷史就會(huì)更加清晰”。該研究補(bǔ)全了異源四倍體棉花的演化拼圖,填補(bǔ)廣泛種質(zhì)的陸地棉的馴化歷史空白,強(qiáng)調(diào)了野生品種的有利基因滲入栽培棉花適應(yīng)氣候變化的潛力,為棉花育種良種提供了基因組背景。

        在采訪中,李瑞強(qiáng)提到了一幅畫(huà)。畫(huà)上是一棵基因產(chǎn)業(yè)樹(shù),樹(shù)枝上掛著腫瘤診斷治療及早篩、生物制藥、健康管理等“果實(shí)”,“科學(xué)研究”則是最關(guān)鍵、扎實(shí)的樹(shù)干,樹(shù)根扎向地面,沿著生物技術(shù)和計(jì)算技術(shù)兩條脈絡(luò)往科學(xué)研究注入源源動(dòng)力。

        “科技突破積累到一定水平,才足以開(kāi)發(fā)創(chuàng)新產(chǎn)品去支撐基因科技在農(nóng)業(yè)育種、生物進(jìn)化、疾病早診早篩、藥物開(kāi)發(fā)等廣泛場(chǎng)景中的應(yīng)用領(lǐng)域?!被谶@樣的判斷,李瑞強(qiáng)創(chuàng)辦諾禾致源,以科技服務(wù)為主導(dǎo),專注賦能生命科學(xué)研究研發(fā)與應(yīng)用全場(chǎng)景。

        在創(chuàng)立之初,諾禾致源是一家“生物信息公司”,通過(guò)高通量、高性能的計(jì)算平臺(tái)和數(shù)據(jù)中心,許多棘手的基因組數(shù)據(jù)分析難題都可以在諾禾致源找到答案。

        但是很快李瑞強(qiáng)就意識(shí)到,生物信息分析只是基因服務(wù)鏈條中的一環(huán),假如前置的測(cè)序環(huán)節(jié)不能高效地輸出高品質(zhì)的數(shù)據(jù),生物信息分析中能做的工作十分有限。從保證研究質(zhì)量及周期可控的角度出發(fā),諾禾致源開(kāi)辟了自己的建庫(kù)測(cè)序業(yè)務(wù)。

        隨著行業(yè)發(fā)展,基因測(cè)序使用者對(duì)生產(chǎn)周期、測(cè)序質(zhì)量提出了更高要求。近幾年,諾禾致源不斷推進(jìn)基因測(cè)序智能化。2020年,柔性智能交付系統(tǒng)Falcon正式上線運(yùn)行。這個(gè)全球領(lǐng)先的智能系統(tǒng)壓縮了基因測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出的工作量,實(shí)現(xiàn)全流程自動(dòng)化;2022年,在Falcon基礎(chǔ)上,諾禾致源又推出了多產(chǎn)品并行的Falcon II,該系統(tǒng)更小更便捷,同時(shí)實(shí)現(xiàn)了全程智能、高效生產(chǎn)、穩(wěn)定交付。

        “基因這個(gè)領(lǐng)域,永遠(yuǎn)沒(méi)有終點(diǎn)”,如李瑞強(qiáng)所言,基因測(cè)序技術(shù)重新定義了疾病等領(lǐng)域,未來(lái)基因還能改變哪些已有的認(rèn)知?我們拭目以待。

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