李潔,劉光耀,樊鳳仙,胡萬均,白玉萍,張靜*
作者單位:1.蘭州大學(xué)第二醫(yī)院核磁共振科,蘭州 730030;2.蘭州大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院,蘭州 730030;3.甘肅省功能及分子影像臨床醫(yī)學(xué)研究中心,蘭州 730030
腦膠質(zhì)瘤是中樞神經(jīng)系統(tǒng)最常見的原發(fā)性腫瘤,跨越兒童到老人各個(gè)年齡段。在全身腫瘤中,膠質(zhì)瘤五年病死率排第三,尤其是膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(glioblastoma,GBM)的中位總生存期僅約為12~15 個(gè)月[1-2]。由于低級(jí)別彌漫性膠質(zhì)瘤具有向高級(jí)別轉(zhuǎn)變的特征,無法達(dá)到完全治愈,使腦膠質(zhì)瘤成為最具破壞性的癌癥代表之一,患者術(shù)后神經(jīng)功能障礙、精神障礙,生活質(zhì)量下降以及巨大的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)都會(huì)影響患者生活質(zhì)量,因此膠質(zhì)瘤的早期診斷及分級(jí)、基因突變狀態(tài)、規(guī)范治療、療效評(píng)估對(duì)優(yōu)化患者術(shù)后護(hù)理、提高術(shù)后生活質(zhì)量至關(guān)重要。人工智能的快速發(fā)展,為精準(zhǔn)醫(yī)療帶來曙光[3],尤其在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的發(fā)展最可觀[4]。影像組學(xué)能挖掘常規(guī)影像所不能顯示的內(nèi)部特征,反映膠質(zhì)瘤復(fù)雜的異質(zhì)性信息。如何應(yīng)用人工智能技術(shù)和影像組學(xué)方法提高腦膠質(zhì)瘤術(shù)前診斷能力并應(yīng)用于治療決策是目前研究的熱點(diǎn)。筆者針對(duì)基于MRI 的深度學(xué)習(xí)(deep learning,DL)和影像組學(xué)在腦膠質(zhì)瘤鑒別診斷、分級(jí)、基因分型及預(yù)后等方面的研究現(xiàn)狀進(jìn)行綜述,并探討以后的發(fā)展方向。
人工智能是計(jì)算機(jī)科學(xué)的一個(gè)分支,能夠分析復(fù)雜的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù),其快速發(fā)展為未來精準(zhǔn)、個(gè)體化醫(yī)療帶來曙光,可用于許多疾病的診斷、治療和預(yù)測(cè)結(jié)果,其實(shí)現(xiàn)主要依靠機(jī)器學(xué)習(xí)和DL。DL[5]是一門源于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的研究,本質(zhì)是一個(gè)高度復(fù)雜的非線性回歸方法,運(yùn)算程序較復(fù)雜。DL 屬于機(jī)器學(xué)習(xí)方法的一個(gè)分支,傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)算法如決策樹、隨機(jī)森林、支持向量機(jī)(support vector machine,SVM)等需要預(yù)先進(jìn)行人工分割并提取特征,而DL 可以準(zhǔn)確高效地自動(dòng)提取數(shù)據(jù)特征,避免了手工分割的煩瑣性及誤差性,大大節(jié)約了人力、時(shí)間和財(cái)力。DL 模型較多,目前常用的是卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolution neural network,CNN)模型。
影像組學(xué)是一種圖像分析方法,是荷蘭學(xué)者Lambin 等[6]于2012 年提出,將其定義為“采用高通量技術(shù)從影像圖像中提取成像特征,創(chuàng)建可利用的數(shù)據(jù)庫”。影像組學(xué)方法的具體步驟包括獲取圖像、病變ROI 勾畫及分割、提取影像學(xué)特征、特征篩選、建立預(yù)測(cè)模型并驗(yàn)證等[7]。影像組學(xué)主要有兩種類型:基于特征的影像組學(xué)(即經(jīng)典影像組學(xué))和基于DL 的影像組學(xué)(deep learning-based radiomics,DLR),前者不需要大型數(shù)據(jù)集,而后者需要更大的數(shù)據(jù)集[8]。DLR 通過對(duì)圖像進(jìn)行歸一化、直接從深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來獲得影像組學(xué)特征,與經(jīng)典的影像組學(xué)方法不同,不涉及額外的特征提取操作,因此不會(huì)因?yàn)樘卣饔?jì)算而引入額外的錯(cuò)誤[9]。影像組學(xué)具有非侵入性、客觀性、準(zhǔn)確性及可重復(fù)性較高的特點(diǎn),在腫瘤性病變中發(fā)展最快,目前已廣泛應(yīng)用于膠質(zhì)瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌等腫瘤的診斷、分期或分級(jí)、基因預(yù)測(cè)、治療效果評(píng)價(jià)以及預(yù)后判斷等方面。
腦膠質(zhì)瘤屬于腦內(nèi)最常見的原發(fā)性腫瘤,隨著WHO 中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類方法的更新,膠質(zhì)瘤的分級(jí)、基因分型越來越詳細(xì)[10]。膠質(zhì)瘤的治療以手術(shù)切除為主,切除范圍、放化療方法、療效以及生存期與腫瘤級(jí)別及基因分型有密切關(guān)系。膠質(zhì)瘤病理組織學(xué)檢查是一種傳統(tǒng)且可靠的診斷方法,但它通常需要很長(zhǎng)時(shí)間、復(fù)雜的程序才能獲得病理結(jié)果[11]。術(shù)前穿刺活檢也可以作為標(biāo)準(zhǔn),但屬于有創(chuàng)性操作,且活檢不能獲得完整腫瘤的組織,無法提供腫瘤真實(shí)的信息。因此膠質(zhì)瘤的術(shù)前MRI成為膠質(zhì)瘤診斷、治療決策、預(yù)后評(píng)估等方面的重要支柱[12]。目前常規(guī)序列包括T1 加權(quán)成像(T1 weighted imaging,T1WI)、T2加權(quán)成像(T2 weighted imaging,T2WI)、液體衰減反轉(zhuǎn)恢復(fù)(fluid attenuated inversion recovery,F(xiàn)LAIR)序列、T1WI對(duì)比增強(qiáng)序列(T1 contrast enhancement weighted imaging,T1CE);功能序列包括擴(kuò)散加權(quán)成像(diffusion weighted imaging,DWI)、擴(kuò)散張量成像(diffusion tensor imaging,DTI)、灌注加權(quán)成像(perfusion weighted imaging,PWI)等。基于常規(guī)和功能MRI的DL和影像組學(xué)已廣泛用于腦膠質(zhì)瘤術(shù)前鑒別診斷、分級(jí)、基因分型及預(yù)后等方面研究[13-14]。
腦膠質(zhì)瘤的MRI 表現(xiàn)與其他腫瘤、非腫瘤性病變會(huì)有重疊相似之處,例如低級(jí)別膠質(zhì)瘤與腦炎、高級(jí)別膠質(zhì)瘤與脫髓鞘病變、GBM 與原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)淋巴瘤(primary central nervous system lymphoma,PCNSL)和轉(zhuǎn)移瘤等,因此準(zhǔn)確鑒別腦膠質(zhì)瘤與其他疾病是影像診斷的第一步。
Zhang等[15]應(yīng)用DL方法鑒別GBM、PCNSL和脫髓鞘病變,AUC達(dá)到了0.954~1.000,Nakagawa 等[16]應(yīng)用多序列MRI 構(gòu)建影像組學(xué)模型區(qū)分GBM與PCNSL,取得了0.98的高AUC值,結(jié)果證明DL 和影像組學(xué)在腦膠質(zhì)鑒別診斷方面具有較高的效能。但是,關(guān)于二者能否為影像醫(yī)生節(jié)省更多的時(shí)間,多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)對(duì)此進(jìn)行了研究。Wu 等[17]分別構(gòu)建Alexnet、ResNet-50 和Inception-v3 三個(gè)卷積網(wǎng)絡(luò)模型以區(qū)分彌漫性膠質(zhì)瘤與腦炎,結(jié)果顯示三個(gè)模型的AUC 值均超過了0.9,而兩名神經(jīng)放射科醫(yī)生評(píng)估的AUC 分別為0.891、0.770。Han 等[18]分別建立基于T2WI的單參數(shù)影像組學(xué)模型和基于T2WI、T1WI的多參數(shù)影像組學(xué)模型以區(qū)分腦炎與Ⅱ級(jí)膠質(zhì)瘤,AUC 為0.980、0.988,明顯高于兩位影像醫(yī)師評(píng)估的AUC (0.661、0.722)。但以上研究樣本量較小,其結(jié)果還需慎重解釋。
總體而言,DL 和影像組學(xué)在膠質(zhì)瘤鑒別方面具有良好的性能,可能相當(dāng)于、甚至略高于影像醫(yī)生的診斷水平。但是以上研究均是針對(duì)單發(fā)病灶,而實(shí)際工作中多發(fā)性病灶鑒別更加困難;而且DL 和影像組學(xué)對(duì)于體積較小病灶無法判斷,可能與二者自身局限性有關(guān);未來尚需進(jìn)一步優(yōu)化計(jì)算機(jī)算法提高其性能。
依據(jù)2007年WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類將腦膠質(zhì)瘤由低到高分為Ⅰ~Ⅳ級(jí),級(jí)別不同,侵襲、浸潤(rùn)特征不同,治療方案與預(yù)后也存在差異,術(shù)前分級(jí)是制訂治療計(jì)劃的首要問題[19]。既往影像醫(yī)生根據(jù)腫瘤部位、形態(tài)、邊緣、內(nèi)部信號(hào)及強(qiáng)化特征進(jìn)行主觀判斷分級(jí),導(dǎo)致術(shù)前分級(jí)欠準(zhǔn)確。影像組學(xué)最早應(yīng)用于膠質(zhì)瘤是預(yù)測(cè)術(shù)前分級(jí)。穆建華等[20]基于T2WI、T1CE圖像,結(jié)合三種機(jī)器學(xué)習(xí)方法建立了六種單序列影像組學(xué)模型以區(qū)分高級(jí)別(Ⅲ級(jí)和Ⅳ級(jí))與低級(jí)別膠質(zhì)瘤(Ⅰ級(jí)和Ⅱ級(jí)),AUC 值均在0.8 以上。Tian 等[21]從常規(guī)MRI、DWI和動(dòng)脈自旋標(biāo)記(arterial spin labeling,ASL)圖像中提取特征,使用SVM分類器構(gòu)建影像組學(xué)模型,區(qū)分Ⅱ級(jí)與Ⅲ級(jí)和Ⅳ級(jí)的AUC 為0.987,準(zhǔn)確率為96.8%,區(qū)分級(jí)Ⅲ級(jí)與Ⅳ級(jí)的AUC為0.992,準(zhǔn)確率為98.1%。諸多研究證明,影像組學(xué)已成為一種有前途的非侵入性膠質(zhì)瘤分級(jí)方法,多參數(shù)模型較單序列模型效能較好,而且將功能MRI 納入模型后,效能亦得到提升。但并不是序列越多越好[22],尋找最佳組合序列是以后研究的探索方向。
與影像組學(xué)方法相比,DL 在術(shù)前神經(jīng)膠質(zhì)瘤分級(jí)中的應(yīng)用性能更高[23]。Li 等[24]分別開發(fā)了影像組學(xué)和CNN 模型預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤分級(jí),CNN 模型的準(zhǔn)確率、AUC 都優(yōu)于影像組學(xué)模型。Gutta 等[25]使用CNN 方法對(duì)237 名膠質(zhì)瘤患者進(jìn)行級(jí)別分類,與傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)相比,CNN 模型的準(zhǔn)確率提高了23%。常用的CNN 模型有2D CNN、3D CNN。Zhuge 等[26]對(duì)同一組數(shù)據(jù)分別應(yīng)用2D-Mask R-CNN 和3D-ConvNet 進(jìn)行Ⅱ級(jí)膠質(zhì)瘤與Ⅲ級(jí)、Ⅳ級(jí)分類,準(zhǔn)確率分別為96.3%、97.1%,顯示3D CNN 稍優(yōu)于2D CNN DL 網(wǎng)絡(luò),這與Mzoughi 等[27]的研究結(jié)果一致。其原因在于3D CNN 是將整個(gè)腫瘤體積傳送到學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)中,利用了整個(gè)腫瘤空間信息。也有研究提出將DL 與影像組學(xué)結(jié)合探索其性能。Zhang 等[28]基于DTI 衍生的圖像提取了深度特征、紋理特征和形狀特征,采用SVM 構(gòu)建分類模型,實(shí)現(xiàn)了98%的最高準(zhǔn)確率,AUC 達(dá)到了0.99,與其他研究相比,模型性能確有提高,但是二者結(jié)合的研究較少,未來還需進(jìn)一步探索其在膠質(zhì)瘤分級(jí)以及其他應(yīng)用方面的能力。
以上研究均是依據(jù)2007版WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類進(jìn)行的。2021 年《Neuro-Oncology》發(fā)布了第五版WHO 中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類,提出首先需要明確膠質(zhì)瘤基因分型,才能進(jìn)一步對(duì)進(jìn)行腫瘤分級(jí)[29]。以后膠質(zhì)瘤的分級(jí)研究應(yīng)按照最新版本進(jìn)行,但DL與影像組學(xué)的方法依舊適用。
2016年WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類增加了基因分型,認(rèn)為結(jié)合細(xì)胞形態(tài)和基因分型,能更準(zhǔn)確地指導(dǎo)臨床制訂輔助放療、化療等方案。最新版分類亦強(qiáng)調(diào)了基因分型在膠質(zhì)瘤分類、分級(jí)中作用。其中,異檸檬酸脫氫酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)基因突變與術(shù)后制訂化療方案有關(guān),1p/19q共缺失狀態(tài)在膠質(zhì)瘤分類、分級(jí)中揮著核心作用,O6-甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)啟動(dòng)子的甲基化與高級(jí)別膠質(zhì)瘤術(shù)后治療的有效性相關(guān)[30-31]。由于術(shù)后經(jīng)病理組織檢測(cè)基因分型需要的時(shí)間較長(zhǎng),延誤了膠質(zhì)瘤患者的治療,因此,急需在術(shù)前基于MRI特征預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤基因分型以滿足臨床治療需要。目前以預(yù)測(cè)IDH突變狀態(tài)的研究較廣泛、成熟。
無論是基于常規(guī)MRI、還是功能MRI,影像組學(xué)和DL 在預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤基因分型同樣具有較大的潛能[32-33]。Chang 等[34]應(yīng)用2D CNN 學(xué)習(xí)分析259 名膠質(zhì)瘤患者的常規(guī)MRI 圖像(T2WI、T1WI、FLAIR、T1CE)的特征,對(duì)IDH-1 突變狀態(tài)、1p/19q 共缺失狀態(tài)和MGMT啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)進(jìn)行分類,準(zhǔn)確率分別為94%、92%、83%。Choi等[35]開發(fā)了一種基于動(dòng)態(tài)磁敏感對(duì)比灌注MRI圖像的DL 網(wǎng)絡(luò)模型,對(duì)463 名膠質(zhì)瘤患者的IDH 基因型進(jìn)行分類,驗(yàn)證集、測(cè)試集的準(zhǔn)確率分別為92.8%、91.7%,AUC 分別達(dá)到了0.98、0.95。最新的MRI 技術(shù)如酰胺質(zhì)子轉(zhuǎn)移成像(amide proton transfer,APT)也被證明是預(yù)測(cè)腦膠質(zhì)瘤基因分型的重要序列[31]。
雖然多序列MRI 模型在腫瘤分級(jí)方面的診斷性能較高,但在預(yù)測(cè)IDH 基因型時(shí),與單序列模型診斷性能相當(dāng)[36]。Bangalore 等[37]使用3D Dense-UNets訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò),分別創(chuàng)建了基于T2WI圖像的單序列模型,和基于T2WI、FLAIR、T1CE圖像的多序列模型,結(jié)果顯示兩種模型在預(yù)測(cè)IDH基因突變狀態(tài)方面的準(zhǔn)確率分別為97.14%、97.12%,AUC 分別為0.98、0.99,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,Kim等[36]基于功能磁共振圖像的研究結(jié)果與其一致。但是薛彩強(qiáng)[38]等研究認(rèn)為應(yīng)用T2WI 和T1CE 的聯(lián)合序列模型預(yù)測(cè)MGMT 啟動(dòng)子甲基化效能優(yōu)于單一序列。綜上所述,預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤基因分型的最佳組合序列還有待進(jìn)一步研究。
3.4.1 腦膠質(zhì)瘤術(shù)后放療后真、假性進(jìn)展的鑒別
膠質(zhì)瘤尤其是高級(jí)別膠質(zhì)瘤術(shù)后需要常規(guī)進(jìn)行放射治療,但放療會(huì)引起鄰近腦組織放射性壞死,早期MRI 表現(xiàn)與腫瘤復(fù)發(fā)浸潤(rùn)難以鑒別,這將會(huì)潛在性延誤復(fù)發(fā)患者的治療時(shí)機(jī)。因此區(qū)分真、假性進(jìn)展對(duì)腦膠質(zhì)瘤的進(jìn)一步治療決策至關(guān)重要,是膠質(zhì)瘤術(shù)后隨訪的重大挑戰(zhàn)。已經(jīng)證明多參數(shù)MRI組學(xué)、DL為二者鑒別提供了有力工具,診斷性能明顯優(yōu)于神經(jīng)影像醫(yī)生[39]。多項(xiàng)研究[40-41]證明在鑒別膠質(zhì)瘤放療后真、假性進(jìn)展時(shí),多序列MRI模型性能優(yōu)于單個(gè)序列,影像組學(xué)與DL結(jié)合的模型性能較優(yōu)。
Kim等[42]將DWI、PWI納入鑒別GBM真假性進(jìn)展的多序列影像組學(xué)模型,AUC 值高于基于常規(guī)MRI、DWI、PWI 等單序列模型,明顯提高了診斷性能。Metz 等[43]發(fā)現(xiàn)DTI 的衍生圖,尤其是各向異性分?jǐn)?shù)圖,在預(yù)測(cè)GBM 復(fù)發(fā)方面亦具有較大潛力。盡管功能MRI 能夠提供一些定量指標(biāo)來量化膠質(zhì)瘤術(shù)后殘腔周圍的異常信號(hào),基于功能MRI 的影像組學(xué)和DL 在鑒別膠質(zhì)瘤術(shù)后真假性進(jìn)展方面優(yōu)于常規(guī)MRI,但是功能成像操作復(fù)雜度高、檢查時(shí)間過長(zhǎng),且費(fèi)用較高,可重復(fù)性不強(qiáng),實(shí)際效果并不理想。
3.4.2 腦膠質(zhì)瘤術(shù)后生存預(yù)測(cè)
隨著醫(yī)療技術(shù)逐漸發(fā)展,腦膠質(zhì)瘤治療取得了較大的進(jìn)展,但高級(jí)別膠質(zhì)瘤的患者存活率仍然很低,尤其GBM 中位總生存期僅約為12~15 個(gè)月,五年生存率不到10%,能否利用人工智能早期預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤無進(jìn)展生存期和總生存期是患者及家屬、研究者關(guān)注的問題。已有研究證明在不需要考慮膠質(zhì)瘤級(jí)別的情況下,基于MRI 的影像組學(xué)可用于預(yù)測(cè)膠質(zhì)瘤的生存情況[44-45]。但是手動(dòng)分割的影像組學(xué)特征在觀察者內(nèi)和觀察者間的變異性很敏感,DL的自動(dòng)工作流程可以避免這種差異。Feng 等[46]基于3D U-Net DL 網(wǎng)絡(luò)開發(fā)了一種分割、提取影像組學(xué)特征的線性模型來預(yù)測(cè)患者的總體存活率,在低級(jí)別膠質(zhì)瘤、GBM中均具有較高的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率,并取得2018年BraTS挑戰(zhàn)賽冠軍的佳績(jī),為膠質(zhì)瘤生存期預(yù)測(cè)研究提供了基石。Han等[47]的研究證明結(jié)合了深度特征和影像組學(xué)特征的模型可以有效將高級(jí)別膠質(zhì)瘤患者分為長(zhǎng)期和短期生存者。
除了腫瘤本身級(jí)別、異質(zhì)性及基因分型與預(yù)后相關(guān)外,患者的年齡、體能狀態(tài)、切除范圍等臨床因素也影響預(yù)后。影像組學(xué)與DL 通過挖掘腫瘤內(nèi)部影像特征,與臨床因素結(jié)合,提高了預(yù)測(cè)術(shù)后生存期的能力。Zhang 等[48]利用從多參數(shù)MRI中提取特征和臨床風(fēng)險(xiǎn)因素相結(jié)合構(gòu)建了用于評(píng)估GBM 患者生存期的影像組學(xué)列線圖,訓(xùn)練集、驗(yàn)證集的一致性指數(shù)分別是0.971和0.974。Huang等[49]將降維后的MRI特征與年齡、腫瘤分級(jí)等臨床特征結(jié)合到隨機(jī)森林回歸模型中進(jìn)行生存預(yù)測(cè),亦顯示了較好的優(yōu)勢(shì)。
以上對(duì)于膠質(zhì)瘤術(shù)后生存預(yù)測(cè)的研究多為回顧性研究,納入的患者術(shù)后治療方案不統(tǒng)一,而且影響患者生存期的因素除了研究中所提到的年齡、體能狀態(tài)、手術(shù)及影像特征之外,還有患者心理因素、術(shù)后營(yíng)養(yǎng)狀況等難以評(píng)估的因素,因此在未來的研究中,應(yīng)前瞻性納入統(tǒng)一治療方案的患者,還可以與基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等信息相結(jié)合,增強(qiáng)對(duì)腫瘤內(nèi)部信息的辨別能力,提高生存預(yù)測(cè)能力。
DL 和影像組學(xué)以非侵入性方式提高了腦膠質(zhì)瘤術(shù)前診斷、分級(jí)的準(zhǔn)確性,預(yù)測(cè)基因分型方面性能良好,且與臨床因素結(jié)合能評(píng)估術(shù)后生存期。但目前研究的樣本量較小,且數(shù)據(jù)單一,可靠的預(yù)測(cè)模型需要大量數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練,建立多中心的數(shù)據(jù)庫十分必要,未來挑戰(zhàn)在于創(chuàng)建適用于多中心數(shù)據(jù)的更穩(wěn)定的方法。利用DL 和影像組學(xué)方法幫助診斷以及治療腦膠質(zhì)瘤勢(shì)必成為未來發(fā)展的主流方向。
作者利益沖突聲明:全體作者均聲明無利益沖突。