戴婧婷,林麗玲,范銘豐,張華峰,劉希華
(1.福建省資源環(huán)境監(jiān)測與可持續(xù)經(jīng)營利用重點實驗室,福建三明 365004;2.三明學院海峽理工學院,福建三明 365004;3.三明市土肥站,福建三明 365000;4.廈門市森林病蟲害防治技術(shù)站,福建廈門 361004;5.三明學院資源與化工學院,福建三明 365004)
根據(jù)聯(lián)合國教科文組織和糧農(nóng)組織的不完全統(tǒng)計,我國的鹽堿地面積為9 913萬hm2,鹽堿地占中國總耕地面積的10%[1]。為了緩解鹽堿脅迫對植物生長和產(chǎn)量的負面影響,人們已經(jīng)采用多種方法來培育耐鹽的農(nóng)作物。傳統(tǒng)雜交育種周期長,見效慢,基因工程育種存在著不可預見的缺點[2],而內(nèi)生細菌與植物的互作提高了作物的自身耐鹽能力,并克服了上述2種方法的缺點[3],因而分離出能與植物互作且能提高作物自身耐鹽能力的內(nèi)生菌在耐鹽農(nóng)作物的培育中有著重要的作用。紅樹林區(qū)土壤及其植株體內(nèi)外含有大量微生物[4],但研究多集中在植物病原菌抗菌方面[5-7],而紅樹林內(nèi)生細菌在促生抗逆等方面的研究鮮有報道。木欖(Bruguiera gymnorhiza)是紅樹林的主要組成種類,該研究從木欖根莖葉中分離篩選鑒定耐鹽堿菌株,為培育耐鹽農(nóng)作物奠定基礎。
1.1.1 試驗材料。木欖采自福建省廈門市南湖公園(24°26′N,118°04′E),采樣時整株植物連根拔起,低溫保存運輸,運回實驗室后,馬上分離內(nèi)生細菌。
1.1.2 試驗試劑?;九囵B(yǎng)基為LB培養(yǎng)基,NaCl濃度設置為10(對照)、50、100、150、200 g/L。
1.2.1 內(nèi)生細菌的分離和純化。木欖內(nèi)生細菌的分離方法參照小飛蓬耐鉛內(nèi)生細菌的分離方法[8]。
1.2.2 生理生化分析。對分離純化的菌株進行革蘭氏染色、接觸酶反應、檸檬酸鹽反應、吲哚試驗和甲基紅試驗檢驗[8]。
1.2.3 分子鑒定。菌株基因組DNA用3S柱離心式環(huán)境樣品DNA回收試劑盒(天根)進行提取,以通用引物8f(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’)和1492r(5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’)(上海華大基因)進行PCR擴增。退火溫度為52℃。選用HinfⅠ、HaeⅢ、MspⅠ和TaqⅠ4種限制性內(nèi)切酶消化16S rDNA擴增產(chǎn)物,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,分析酶切結(jié)果。選取酶切不同類型的代表菌株送往杭州有康生物科技有限公司進行16S rDNA測序[8]。
測序后的序列在NCBI核酸數(shù)據(jù)庫,進行BLAST比對分析,用Clustal X 1.83對同源性超過95%序列進行分析,用軟件MEGA(7.0)利用Neighbor-Joining(NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)進化發(fā)育樹[9]。
從表1可以看出,只有在木欖的葉部分離到耐鹽的內(nèi)生細菌,而且隨著鹽濃度的增加,所分離到的內(nèi)生細菌數(shù)量也隨之減少。
表1 木欖分離菌株情況
對所分離的24株(50 g/L和100 g/L濃度中分離的)內(nèi)生細菌生理生化分析結(jié)果表明,所有的菌革蘭氏染色后是紫色的,為陽性菌;過氧化氫試驗均產(chǎn)生氣泡,為陽性菌;吲哚試驗全部為玫紅色,為陽性菌;甲基紅(M-R)試驗均為紅色,為陽性菌;淀粉水解試驗除了1個50 g/L的為深藍色,為陰性菌,其余菌株為紫色、紫紅色或無色,為陽性。
49株供試菌株通用引物8 f和1492 r擴增出1 600 bp左右的單一條帶,經(jīng)過4種限制性內(nèi)切酶消化分別產(chǎn)生1~4種圖譜類型(圖1),酶切圖譜比對、組合分析后共獲得5種遺傳型(表2)。選取不同組合類型的代表菌株進行16S rDNA序列測定,測序結(jié)果上傳到NCBI數(shù)據(jù)庫,收集同源性高的序列。
圖1 供試菌株16S rDNA PCR產(chǎn)物酶切圖譜類型
表2 供試菌株16S rDNA PCR-RFLP圖譜類型
利用MEGA(7.0)將秋茄和木欖內(nèi)生細菌菌株與其同源性較高的菌株16S rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)進化發(fā)育樹(圖2)。結(jié)合各菌株的遺傳距離(圖2)和菌株16S rDNA序列的Blast同源性(表3)進行比較分析,初步推斷出L1為越南芽孢桿菌(Bacillus vietnamensis),L2為芽孢桿菌(Bacillus cereus),L4為白翎芽孢桿菌(Bacillus baekryun-gensis),L5為巴氏葡萄球菌(Staphylococcus pasteuri)。
圖2 基于16S rDNA基因序列構(gòu)建內(nèi)生細菌系統(tǒng)發(fā)育樹
表3 菌株16S rDNA序列的Blast同源性分析
該文通過不同鹽濃度的LB培養(yǎng)基對木欖根莖葉耐鹽內(nèi)生細菌的分離篩選,共分離到24株耐鹽內(nèi)生細菌,結(jié)合生理生化分析、16S rDNA分子鑒定等技術(shù),推斷出所分離到內(nèi)生細菌分別為越南芽孢桿菌、蠟樣芽孢桿菌、白翎芽孢桿菌和巴氏葡萄球菌。
一些研究人員觀察到,用內(nèi)生細菌接種植物可以在鹽堿地環(huán)境下促進植物生長和發(fā)育[10]。內(nèi)生細菌或通過合成大量甘氨酸甜菜堿等化合物,或通過誘導滲透保護劑和抗氧化蛋白的合成[11],或通過合成低乙烯產(chǎn)生和抗氧化防御機制的快速激活來增強植物在鹽堿地的生長[12]。有研究通過分離龍葵等耐鉛植物的內(nèi)生細菌并轉(zhuǎn)接馬尾松上,促進了鉛脅迫下馬尾松的生長[13]。因此研究從紅樹林分離耐鹽的內(nèi)生細菌,轉(zhuǎn)接到其他植物上以增強其在鹽堿地生長,是可行的,也具有實際應用價值。