杜紅飛,袁鴻玲,龐雪利,鄧蘭,陽燕,唐寧,許穎
610500 成都,成都醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院 檢驗科
前列腺癌是男性泌尿系統(tǒng)最為常見的惡性腫瘤之一。據(jù)2021年全球最新癌癥數(shù)據(jù)顯示,前列腺癌的新增病例數(shù)為248 530例,占26%,居男性癌癥的第1位[1];2022年我國癌癥中心的數(shù)據(jù)顯示,前列腺癌的發(fā)病率居我國第7位,死亡率居第10位[2]。目前大約10%的前列腺癌患者就診時已處于疾病晚期,且有5%患者已發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移[3],嚴(yán)重影響人類的健康。因此,迫切需要探究前列腺癌發(fā)病的病理分子機制,尋找有效的生物學(xué)標(biāo)志物及治療靶點。
CBX4(chrombox homolog 4,CBX4)為 多 梳 基因蛋白家族(the Polycomb group of protein,PcG)成員之一,是一種SUMO E3鏈接酶[4]。近年來的研究證實CBX4參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展,為重要的分子靶點,然而CBX4在前列腺癌中的研究仍處于空白。鐵死亡是2012年新發(fā)現(xiàn)的一種細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)過氧化物和活性氧過量積累導(dǎo)致的鐵依賴性程序性細(xì)胞死亡[5],不同于細(xì)胞凋亡、壞死及自噬,鐵死亡在形態(tài)學(xué)上表現(xiàn)為線粒體皺縮、線粒體嵴減少、線粒體膜密度增加和細(xì)胞核正常[6]。目前的研究表明,鐵死亡主要包含兩個途徑,一是外源性(轉(zhuǎn)運蛋白依賴)途徑,即胱氨酸/谷氨酸反向轉(zhuǎn)運體,其中SLC7A11為鐵死亡的重要上游調(diào)控蛋白;另一途徑為內(nèi)源性(酶調(diào)控)途徑,脂質(zhì)過氧化物積累是鐵死亡的標(biāo)志。2021年Ghoochani等[7]最新的研究發(fā)現(xiàn),SLC7A11高表達(dá)于去勢抵抗性前列腺癌,參與前列腺癌鐵死亡的調(diào)控。為此,本研究將通過生物信息數(shù)據(jù)庫和細(xì)胞水平實驗揭示CBX4在前列腺癌的表達(dá),臨床意義及CBX4對前列腺癌鐵死亡的影響,以期為前列腺癌的臨床治療和診斷提供有效的分子靶點。
轉(zhuǎn)移性激素敏感型前列腺癌細(xì)胞系LNCap和22RV1、轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性前列腺癌細(xì)胞系PC3和DU145以及前列腺增生細(xì)胞BPH-1為課題組前期保存于液氮;組織芯片從上海芯超生物購買獲得,包括100例前列腺癌組織,50例前列腺癌旁組織,相關(guān)病理參數(shù)見表1(剔除6例信息不全的病例)。CBX4干擾慢病毒載體(LV-shCBX4)購買于上海吉凱基因,保存于-80℃。CBX4抗體購于正能生物有限公司。
1.2.1 Oncomine數(shù)據(jù)庫分析CBX4基因表達(dá) Onc- omine(www.oncomine.org)為一個在線分析DNA或RNA序列的腫瘤微陣列數(shù)據(jù)庫,可用于基因表達(dá)分析的研究。本文利用Oncomine進行CBX4數(shù)據(jù)集收集,篩選條件為“gene: CBX4; analysis type: cancer vs normal analysis; data type: all; cancer type: prostate cancer; gene summary: P < 0.05,fold change > 2,gene rank = top 10%; order by: over-expression”。對獲取的部分?jǐn)?shù)據(jù)進行Meta分析,結(jié)果用散點圖表示。
1.2.2 UALCAN數(shù)據(jù)庫進行病理參數(shù)和生存期分析 UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu)數(shù) 據(jù) 庫是一個基于TCGA數(shù)據(jù)集中31種癌癥類型的臨床數(shù)據(jù)進行在線分析和挖掘的網(wǎng)站工具,可以對相關(guān)基因進行表達(dá)譜、臨床病理參數(shù)等進行分析。在UALCAN數(shù)據(jù)庫中的TCGA數(shù)據(jù)集的gene symbol(s)檢索“CBX4”,TCGA Dataset選擇“prostate adenocarcinoma”。分別對CBX4在前列腺癌和前列腺正常組織的表達(dá)、CBX4的表達(dá)與前列腺癌患者臨床病理特征(淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、Gleason 分?jǐn)?shù)等)及生存期進行分析。
1.2.3 HPA數(shù)據(jù)庫分析CBX4蛋白表達(dá)水平 HPA在線數(shù)據(jù)庫(https://www.proteinatlas.org):該數(shù)據(jù)庫包含大約20 種常見的腫瘤基因表達(dá)數(shù)據(jù)。本項目通過利用該數(shù)據(jù)庫在線評估正常潛前列腺正常組織和前列腺癌中CBX4蛋白表達(dá)水平。
1.2.4 String數(shù)據(jù)庫平臺構(gòu)建CBX4蛋白互作網(wǎng)絡(luò) String(https://cn.string-db.org/)是一個在線搜索已知蛋白,以及預(yù)測蛋白質(zhì)互作關(guān)系(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)庫。本研究運用該數(shù)據(jù)庫分析可能與CBX4基因相互作用的蛋白網(wǎng)絡(luò)。
1.2.5 免疫組織化學(xué) 免疫組化參照課題組前期已發(fā)表論文所述方法[8-9]。CBX4抗體按照1∶200的比例稀釋用于前列腺癌組織免疫組化檢測。將組織芯片進行常規(guī)脫蠟,水化,抗原修復(fù),一抗,二抗及三抗孵育等步驟處理后,在光學(xué)顯微鏡下觀察并采集圖像。CBX4免疫組化染色結(jié)果通過半定量計分的方法進行蛋白表達(dá)的評價,染色強度評分原則如下:陰性(0分)、弱陽性(1分)、中陽性(2分)、強陽性(3分);陽性染色的百分比評分如下: < 5%(0分)、5% ~ 25%(1分)、26% ~ 50%(2分)、51% ~ 75%(3分)、 > 75%(4分)。CBX4的最終免疫組化染色得分(0 ~ 12分)為組織標(biāo)本的染色強度評分乘以相對應(yīng)的陽性染色的百分比評分。
1.2.6 細(xì)胞培養(yǎng) 前列腺癌細(xì)胞PC3、22RV1、DU145 和LNCap,前列腺增生細(xì)胞BPH-1購自中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所細(xì)胞培養(yǎng)基為含10%胎牛血清,100 μg/mL鏈霉素,100 U/mL青霉素的1640,于37℃、5% CO2條件下靜置培養(yǎng)。
1.2.7 實時熒光定量PCR 參照課題組前期已發(fā)表論文所述方法[8-9],采用Triol法提取細(xì)胞總RNA,經(jīng)NanoDrop 2000進行定量后,取200 ng總RNA經(jīng)Bio-Rad逆轉(zhuǎn)錄試劑逆轉(zhuǎn)錄,后將產(chǎn)物進行qPCR檢 測,CBX4的 引物序列為:Forward: 5’-AGTGGAGTATCTGGTGAAATGGA-3;Reverse:5’-TCCTGCCTTTCCCTGTTCTG-3’。每個樣本以β-actin為內(nèi)參。
1.2.8 CBX4干擾慢病毒載體感染 LV-shCBX4和LV-control(LV-ctrl)慢病毒從上海吉凱基因購買。CBX4干擾序列為:GATGAAGATAGTCAAGAACAA;對照序列為:TTCTCCGAACGTGTCACGT。常規(guī)培養(yǎng)前列腺癌細(xì)胞,待細(xì)胞融合度達(dá)60% ~ 80%。感染細(xì)胞LV-shCBX4和LV-ctrl,并使用嘌呤霉素穩(wěn)定篩選CBX4沉默細(xì)胞,提取細(xì)胞總蛋白和總RNA,在蛋白和mRNA水平上驗證CBX4干擾效果。
1.2.9 免疫印跡(Western blot) 參照課題組前期已發(fā)表論文所述方法[8-9]。采用細(xì)胞裂解法提取細(xì)胞總蛋白,即加入細(xì)胞RIPA裂解液,經(jīng)勻漿、裂解、離心后,獲得總蛋白,后通過Bradford方法檢測總蛋白濃度,利用 SDS-PAGE行蛋白電泳,經(jīng)恒流電轉(zhuǎn)將蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,后將PVDF膜放入含5%脫脂奶粉的TBST封閉液中封閉,加入CBX4一抗4℃孵育過夜,洗膜,加入二抗,37℃孵育1 h,洗膜后加入發(fā)光液,顯影,拍照。最后,采用ImageJ分析系統(tǒng)軟件測定蛋白條帶的光密度值,以GAPDH蛋白條帶作為內(nèi)參對照。
1.2.10 透射電鏡 常規(guī)培養(yǎng)細(xì)胞,經(jīng)LV-shCBX4和LV-ctrl慢病毒感染細(xì)胞48 h后,將細(xì)胞消化制成細(xì)胞懸液,分別兩次離心后,吸除細(xì)胞上清,緩慢加入戊二醛固定液,將固定好的細(xì)胞送成都里來生物科技有限公司完成透射電鏡細(xì)胞鐵死亡觀察,即通過固定-脫水-滲透與包埋-超薄切片-雙染色法-圖像采集(6 000倍觀察)。
本研究涉及的所有數(shù)據(jù)采用SPSS 26.0統(tǒng)計分析軟件。計量資料數(shù)據(jù)用均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,運用t檢驗分析組間差異。CBX4的表達(dá)和臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系采用χ2檢驗分析。P < 0.05被認(rèn)為具有統(tǒng)計學(xué)意義。
在Oncomine數(shù)據(jù)庫中,有327項研究分析了CBX4在癌組織和正常組織的表達(dá)差異,結(jié)果顯示:58項研究提示表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義,49項為高表達(dá),9項為低表達(dá)。其中,有5項研究分析了前列腺癌中CBX4的表達(dá)情況,均提示CBX4呈異常高表達(dá)(圖1A)。對5項研究的數(shù)據(jù)進行Meta分析,結(jié)果提示,與對照組比較,CBX4在所有差異表達(dá)基因的中位數(shù)值排名為576(P < 0.001),表明CBX4在前列腺癌中高表達(dá)(圖1B)。
然后,選取Wallace和Grasso等2項前列腺癌芯片的表達(dá)研究,對其表達(dá)進行了散點圖分析。結(jié)果顯示,CBX4均高表達(dá)于前列腺癌組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P < 0.05;圖1C、D)。最后,利用不同來源的UALCAN和HPA數(shù)據(jù)庫驗證,發(fā)現(xiàn)CBX4明顯高表達(dá)于前列腺癌(圖1E、F)。
圖1 CBX4在前列腺癌中的表達(dá)差異Figure 1.Differential Expression of CBX4 in Prostate Cancer
運用UALCAN數(shù)據(jù)庫分析CBX4 mRNA表達(dá)水平與前列腺癌患者臨床病理特征關(guān)系,包括Gleason分?jǐn)?shù)、TP53突變、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等,數(shù)據(jù)結(jié)果表明CBX4的表達(dá)與前列腺癌的Gleason分?jǐn)?shù)及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān),與TP53突變和種族有明顯相關(guān)性(圖2A~D)。同時,對CBX4高、低表達(dá)組進行了生存期的分析,揭示前列腺癌患者的不良預(yù)后與CBX4的高表達(dá)相關(guān)(圖2E)。
進一步在臨床樣本組織芯片中利用免疫組織化學(xué)分析CBX4蛋白在前列腺癌表達(dá)及其與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系。結(jié)果提示,CBX4蛋白表達(dá)水平明顯升高(圖2F、G),且與臨床Gleason分?jǐn)?shù)相關(guān)(P < 0.05),而與前列腺癌患者的年齡、病理分級、TNM分期無關(guān)(P > 0.05;表1、2)。
表1 前列腺癌患者的臨床參數(shù)及CBX4在前列腺癌組織中的表達(dá)Table 1.Clinical Characteristics of Prostate Cancer Patients and CBX4 Expression in Prostate Cancer Tissue
圖2 CBX4的表達(dá)與前列腺癌病理參數(shù)的關(guān)系Figure 2.Association between CBX4 Expression and Clinical Characteristics of Prostate Cancer
通過String平臺構(gòu)建CBX4蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(圖3)發(fā)現(xiàn),與CBX4相互作用的蛋白有E3泛素蛋白連接酶RING2和RING1、多梳復(fù)核蛋白BMI-1、多梳樣蛋白PHC1/PHC2/PHC3、DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT3A等。
圖3 CBX4基因與上下游基因的關(guān)系Figure 3.Relationship between CBX4 and Upstream or Downstream Genes
提取前列腺增生細(xì)胞與癌細(xì)胞的總RNA,進行RT-PCR。結(jié)果顯示,與前列腺增生細(xì)胞BPH-1比較,CBX4在前列腺癌細(xì)胞22Rv1和LNcap細(xì)胞中的mRNA表達(dá)水平顯著升高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P < 0.05;圖4)。由于22Rv1和LNcap為轉(zhuǎn)移性雄激素敏感型前列腺癌細(xì)胞,表明CBX4的高表達(dá)可能與雄激素敏感有關(guān)系。
圖4 CBX4前列腺增生細(xì)胞和癌細(xì)胞系的mRNA表達(dá) 水平Figure 4.Levels of CBX4 mRNA in Prostate Hyperplasia Cells and Cancer Cell Lines
表2 CBX4的表達(dá)與前列腺癌臨床病理參數(shù)的關(guān)系Table 2.Correlation between CBX4 Expression and Clinicopathologic Characteristics of Prostate Cancer Patients
基于CBX4在前列腺癌細(xì)胞的表達(dá)結(jié)果,選擇22RV1細(xì)胞作為細(xì)胞水平功能實驗的細(xì)胞,分別感染CBX4慢病毒載體LV-shCBX4和LV-ctrl,RT-qPCR和Western blot 檢測CBX4的干擾效果。如圖5A和5B所示,LV-shCBX4能夠明顯降低22RV1細(xì)胞中CBX4的表達(dá)水平。透射電鏡下的線粒體的變化顯示,與LV-ctrl組比較,LV-shCBX4的線粒體皺縮,膜密度增加(圖5C)。以上結(jié)果表明下調(diào)CBX4的表達(dá)加劇線粒體的皺縮,揭示CBX4負(fù)性調(diào)控鐵死亡。
圖5 干擾CBX4表達(dá)對前列腺癌細(xì)胞鐵死亡的影響Figure 5. Effect of CBX4 Interference on Ferroptosis of Prostate Cells
由于胱氨酸轉(zhuǎn)運蛋白SLC7A11是鐵死亡的關(guān)鍵負(fù)性調(diào)控蛋白,抑制其表達(dá)能夠誘發(fā)腫瘤細(xì)胞發(fā)生鐵死亡[10]。因此,下調(diào)CBX4的表達(dá)后,實時熒光定量PCR檢測SLC7A11的表達(dá)變化。如圖6所示,與正常組及LV-ctrl組比較,LV-shCBX4組的SLC7A11表達(dá)明顯下調(diào),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P < 0.01)。
圖6 干擾CBX4的表達(dá)對SLC7A11表達(dá)的影響Figure 6.Effect of CBX4 Interference on the Level of SLC7A11 mRNA Expression
前列腺癌是危害男性健康的常見腫瘤之一,早期臨床癥狀不典型,確診時多數(shù)患者已是中晚期[11]。目前臨床對于前列腺癌的治療方法為手術(shù)切除結(jié)合內(nèi)分泌治療、放療、化療等,能夠延長部分患者的生存期,但部分患者會因為腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移而導(dǎo)致臨床結(jié)局不理想。因此,深入探究前列腺癌的分子發(fā)病機制,對臨床的早期診斷和治療具有關(guān)鍵的臨床意義。
CBX4具有重要的SUMO泛素連接酶活性。研究表明CBX4參與促進實體腫瘤發(fā)生發(fā)展[12-13],且在多種腫瘤中表達(dá)異常,如骨肉瘤[14]、肝癌[15]、結(jié)直腸癌[16]及食管鱗狀細(xì)胞癌[17]等。另外,CBX4通過泛素化調(diào)節(jié)低氧誘導(dǎo)因子1a的轉(zhuǎn)錄活性進而調(diào)控腫瘤血管生成[18];CBX4可與HDAC3的相互作用來抑制轉(zhuǎn)錄因子Runx2的表達(dá),進而調(diào)控結(jié)直腸癌的遷移和侵襲能力[16];CBX4的異常高表達(dá)促使肝癌患者易發(fā)生多柔比星耐藥[19]。然而,CBX4在前列腺癌中發(fā)揮的生物學(xué)功能未見報道,有待深入探究。
本研究首先利用Oncomine數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),有5項研究顯示CBX4在前列腺癌中顯著高表達(dá);進一步對這部分研究進行Meta及散點圖分析,得到的結(jié)果一致。然后,我們運用TCGA來源數(shù)據(jù)庫UALCAN證實,CBX4在前列腺癌的表達(dá)明顯高于正常前列腺組織,且通過HPA數(shù)據(jù)庫從蛋白水平證實了這一結(jié)論。為增加生物信息數(shù)據(jù)庫結(jié)論的準(zhǔn)確性,我們再次利用免疫組織化學(xué)方法檢測臨床患者組織芯片中CBX4在前列腺癌及前列腺癌旁組織的表達(dá)情況,并通過實時熒光定量PCR檢測前列腺癌細(xì)胞及增生細(xì)胞CBX的mRNA水平。結(jié)果顯示,前列腺癌組織中的CBX4表達(dá)高于癌旁組織,并且CBX4高表達(dá)于轉(zhuǎn)移性激素敏感型前列腺癌細(xì)胞系LNCap和22RV1,而在轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性前列腺癌細(xì)胞PC3和DU145中呈低表達(dá),表明CBX4的表達(dá)可能與前列腺癌雄激素治療敏感性有關(guān),提示CBX4可能為參與前列腺癌發(fā)生和發(fā)展的重要分子,為后期的進一步實驗奠定了基礎(chǔ)。為分析CBX4在前列腺癌中可能涉及的臨床意義,我們通過UALCAN數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),CBX4的表達(dá)與前列腺癌的Gleason分?jǐn)?shù)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān),且CBX4的表達(dá)與前列腺癌的生存期呈負(fù)相關(guān);臨床樣本組化結(jié)果顯示,CBX4的表達(dá)與前列腺癌的Gleason分?jǐn)?shù)具有密切相關(guān)性。以上研究結(jié)果表明CBX4可能為前列腺癌診療的關(guān)鍵生物學(xué)標(biāo)志物。
近年來的研究證實,鐵死亡與多種疾病,如腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、缺血再灌注損傷、腎臟損傷、血液病等多種疾病的病理過程密切相關(guān)。熱休克蛋白β-1過度表達(dá)可抑制erastin誘導(dǎo)的前列腺腫瘤細(xì)胞的鐵死亡[20];前列腺癌中,ZNF217的高表達(dá)能導(dǎo)致細(xì)胞中轉(zhuǎn)鐵蛋白的含量降低,結(jié)果是細(xì)胞內(nèi)鐵含量增加,促進了前列腺腫瘤細(xì)胞的生長[21]。以上研究揭示鐵死亡為臨床前列腺癌潛在治療靶點,因此研究鐵死亡的調(diào)控機制具有重要的臨床意義。本研究確定CBX4高表達(dá)于前列腺癌細(xì)胞后,利用慢病毒干擾技術(shù)下調(diào)CBX4的表達(dá),運用透射電鏡形態(tài)學(xué)觀察線粒體的改變,發(fā)現(xiàn)線粒體皺縮,膜密度增加,揭示CBX4調(diào)控前列腺癌的鐵死亡;進一步檢測CBX4調(diào)控的鐵死亡分子發(fā)現(xiàn),CBX4干擾組的SLC7A11表達(dá)明顯被抑制。但具體的分子機制待后期進一步探究。以上結(jié)果提示CBX4可能通過對外源性胱氨酸/谷氨酸反向轉(zhuǎn)運體的關(guān)鍵蛋白SLC7A11的調(diào)控進而抑制前列腺癌的鐵死亡。
綜上所述,本研究通過生物信息數(shù)據(jù)庫分析和細(xì)胞水平實驗證實,CBX4在前列腺癌中的表達(dá)上調(diào),與前列腺癌的臨床病理參數(shù)Gleason評分、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),且影響前列腺癌患者的預(yù)后,與生存期呈負(fù)相關(guān)關(guān)系;進一步發(fā)現(xiàn)前列腺癌中可能存在CBX4/SLC7A11信號軸調(diào)控鐵死亡。以上研究或可為前列腺癌患者的早期診斷和靶向治療提供更為精準(zhǔn)的分子標(biāo)志物和靶點。
作者聲明:本文全部作者對于研究和撰寫的論文出現(xiàn)的不端行為承擔(dān)相應(yīng)責(zé)任;并承諾論文中涉及的原始圖片、數(shù)據(jù)資料等已按照有關(guān)規(guī)定保存,可接受核查。
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