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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的六味地黃湯治療糖尿病的機(jī)制研究*

        2022-11-15 04:23:14張艷軍劉曉琴
        中醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2022年9期
        關(guān)鍵詞:六味地黃靶點(diǎn)批號(hào)

        張艷軍,劉曉琴

        (1.晉城市中醫(yī)醫(yī)院,山西 晉城 048000;2.山西中醫(yī)藥大學(xué),山西 晉中 030619)

        糖尿病是因糖代謝異常及胰島素缺乏而引起人體組織功能發(fā)生障礙的一種代謝性疾病,常伴有許多的并發(fā)癥,以高血糖為主要標(biāo)志[1]。長(zhǎng)期存在的高血糖會(huì)導(dǎo)致眼、腎臟、心臟、血管等的慢性損害、功能障礙[2]。據(jù)最新報(bào)道,目前全球成人糖尿病患病率為9.3%[3];據(jù)估計(jì),到2045年成人糖尿病患病率將達(dá)9.9%[4]。據(jù)國際糖尿病聯(lián)盟(International Diabetes Federation,IDF)報(bào)道,到2030年將會(huì)有5.78億成人患糖尿病[5]。糖尿病已成為當(dāng)前威脅人類生命健康的非傳染性疾病之一,然而,糖尿病的發(fā)病機(jī)制尚未被完全闡明?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)治療糖尿病需要長(zhǎng)期服用藥物,而降糖藥物有許多不良反應(yīng)及副作用,且很難根治。

        中醫(yī)學(xué)認(rèn)為糖尿病屬“消渴”范疇,且認(rèn)為其發(fā)生與陰虛燥熱有緊密關(guān)系,糖尿病治法在于補(bǔ)腎養(yǎng)陰。陰虛型消渴的代表方藥是六味地黃湯,其具有安全性高、毒副作用小、治療效果較理想等優(yōu)勢(shì)[6]。六味地黃湯處方中包括熟地黃、牡丹皮、山茱萸、澤瀉、山藥、茯苓6味中藥,其中熟地黃是君藥,具有補(bǔ)髓滋陰補(bǔ)腎的功效;山茱萸具有補(bǔ)益肝腎的功效;山藥具有降血糖、補(bǔ)腎、健脾等功效;牡丹皮、澤瀉、茯苓三味藥具有清熱、涼血、利水等功效[7]。有研究[8]表明六味地黃湯可以改善2型糖尿病模型大鼠的胰島素抵抗,可以改善糖尿病發(fā)病過程中存在的葡萄糖代謝異常情況、調(diào)節(jié)血脂[9],可用于糖尿病、腎炎、神經(jīng)衰弱等患者的治療,廣泛應(yīng)用于臨床,且有良好的治療效果[10]。

        隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、基因組學(xué)等學(xué)科的發(fā)展,藥物對(duì)疾病治療的研究已進(jìn)入到了細(xì)胞和基因水平。目前對(duì)六味地黃湯治療糖尿病及其并發(fā)癥的臨床研究報(bào)道較多,但對(duì)其活性成分、藥理作用及治療機(jī)制的研究報(bào)道較少;傳統(tǒng)的理論因缺少化學(xué)及生物學(xué)的表征,難以和現(xiàn)代科學(xué)融合[11]。因此,本研究著重探討六味地黃湯治療糖尿病的機(jī)制,找出其活性成分,并研究其藥理作用及機(jī)制。

        1 材料

        1.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究工具 數(shù)據(jù)庫和軟件:基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(GEO,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/);中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(TCMSP,http://tcmspw.com/);京都基因和基因組百科全書(KEGG,https://www.genome.jp/kegg/pathway.html);Strawberry Perl 5.30.2(Perl,http://Strawberryperl.com/);R語言3.6.3(Lucent Technologies,http://www.r-project.org);Cytoscape 3.7.2(The Cytoscape Consoritum,http://cytoscape.org)。

        1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 7周齡SPF級(jí)雄性C57BL/6小鼠40只,體質(zhì)量18~22 g,由斯貝福(北京)生物技術(shù)有限公司提供。動(dòng)物生產(chǎn)許可證號(hào):SCXK(京)2019-0010。動(dòng)物房溫度(23±2)℃,相對(duì)濕度(50±10)%,12 h光照/12 h黑暗循環(huán),自由攝食飲水,所用小鼠實(shí)驗(yàn)前均適應(yīng)性飼養(yǎng)1周。本研究動(dòng)物處置符合“3R”原則。倫理批準(zhǔn)編號(hào):JCPH.No20220713001。

        1.3 藥物與試劑 六味地黃湯,方藥組成:熟地黃24 g,山藥12 g,山茱萸12 g,牡丹皮9 g,茯苓9 g,澤瀉9 g。以上中藥材均購自山西和仁堂中藥飲片有限責(zé)任公司,且經(jīng)杜晨暉教授鑒定為正品。上述藥材煎煮兩次,濃縮為含生藥1 g/mL的藥液,于4 ℃保存?zhèn)溆?。高脂飼料購自小黍有泰(北京)生物科技有限公司;鏈脲佐菌素(STZ)(批號(hào):WXBD4971V)購自美國Sigma公司;磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)抗體(批號(hào):CN89330)、p-PI3K抗體(批號(hào):CN89330)、蛋白激酶B(Akt)抗體(批號(hào):AA44161)、p-Akt抗體(批號(hào):AA44161)、β-肌動(dòng)蛋白(β-actin)抗體(批號(hào):AA64132)均購自Bioworld公司;HRP-羊抗兔IgG(批號(hào):BST16G15B16H55)、SDS-PAGE凝膠制備試劑盒(批號(hào):16F02A12)、廣譜磷酸酶抑制劑混合物(×100)(批號(hào):16L21C83)、增強(qiáng)型RIPA裂解液(批號(hào):16D16B02)均購自博士德生物工程有限公司;Tris-HCl緩沖鹽溶液(TBST)(批號(hào):20210311)購自北京索萊寶科技有限公司。

        1.4 主要儀器 TGL-20B高速離心機(jī)(上海安亭科學(xué)儀器廠);Image J軟件(美國國立衛(wèi)生研究院);GeneGnome成像系統(tǒng)(基因有限公司)。

        2 方法

        2.1 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究

        2.1.1 糖尿病差異(關(guān)鍵)基因的獲取 利用GEO數(shù)據(jù)庫查找、下載有關(guān)糖尿病的矩陣文件和平臺(tái)文件[12],獲得正常組樣品22個(gè)(GSM610904~GSM610925)和實(shí)驗(yàn)組樣品18個(gè)(GSM6 10886~GSM610903),利用Perl對(duì)其進(jìn)行整理;使用軟件R對(duì)所得樣本進(jìn)行篩選,繪制糖尿病GEO數(shù)據(jù)庫差異熱圖和火山圖。

        2.1.2 六味地黃湯中藥有效成分的獲取 利用TCMSP數(shù)據(jù)庫查找熟地黃、山藥、茯苓、牡丹皮、山萸肉、澤瀉的有效成分,篩選條件為生物口服利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18[13]。

        2.1.3 六味地黃湯候選靶標(biāo)的獲取 在TCMSP數(shù)據(jù)庫下載六味地黃湯中6味中藥的藥物靶點(diǎn)并進(jìn)行整理,再用Strawberry Perl 5.30.2軟件進(jìn)行藥物靶點(diǎn)ID轉(zhuǎn)換。

        2.1.4 中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 Strawberry Perl 5.30.2軟件處理藥物靶點(diǎn)ID轉(zhuǎn)換后的表格和差異基因表格,得到network.txt和node.txt兩個(gè)準(zhǔn)備文件,Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建六味地黃湯與糖尿病的“有效成分-靶點(diǎn)-疾病”中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

        2.1.5 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)和網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治龅臉?gòu)建 PPI網(wǎng)絡(luò)來源于以下幾個(gè)數(shù)據(jù)庫:DTP、BIOGRID、HPRD、INTACT、MINT、BIND數(shù)據(jù)庫。運(yùn)用Cytoscape3.7.2對(duì)中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò)里的所有基因進(jìn)行PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)制作,構(gòu)建之前定義相關(guān)參數(shù)。PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)龐大的網(wǎng)絡(luò),直接觀察看不出里面的基因或者蛋白,需要進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?。再運(yùn)用Cytoscape 3.7.2中的CytoNCA包進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?,以?jié)點(diǎn)度值(Degree Centrality,DC)>61、介數(shù)中心度(Betweenness Centrality,BC)>100為篩選標(biāo)準(zhǔn),創(chuàng)建子網(wǎng)絡(luò)后,最終得到核心網(wǎng)絡(luò)。

        2.1.6 GO富集分析、KEGG富集分析 通過R語言,選擇生物過程(biological process)、細(xì)胞組分(cellular component)和分子功能(molecular function)3個(gè)模塊對(duì)六味地黃湯中的靶點(diǎn)和糖尿病基因進(jìn)行GO富集分析、KEGG富集分析;利用Perl語言將六味地黃湯干預(yù)糖尿病的關(guān)鍵靶標(biāo)名稱轉(zhuǎn)換為Entrez ID后,以P<0.05為篩選條件,運(yùn)用Cytoscape構(gòu)建KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò),并將信號(hào)通路富集結(jié)果可視化。

        2.2 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)

        2.2.1 造模與分組 適應(yīng)性飼養(yǎng)1周后,將小鼠按隨機(jī)數(shù)字表法分為正常組8只和造模組32只。正常組小鼠喂食普通飼料,造模組小鼠喂食高脂飼料。飼養(yǎng)10周后,禁食過夜,造模組小鼠按100 mg/kg劑量腹腔注射STZ造模,正常組小鼠腹腔注射同等劑量的檸檬酸緩沖液,1次/d,連續(xù)3 d。注射后測(cè)空腹血糖值,以血糖值≥11.1 mmol/L為造模成功條件。將32只造模成功小鼠按隨機(jī)數(shù)字表法分為模型組、六味地黃湯低劑量組、六味地黃湯高劑量組、二甲雙胍組,每組8只。

        2.2.2 實(shí)驗(yàn)給藥 六味地黃湯低、高劑量組小鼠分別灌胃給予六味地黃湯,7.5、15 g/kg;二甲雙胍組小鼠灌胃給予二甲雙胍溶液,250 mg/kg;模型組與正常組小鼠灌胃給予等體積純凈水,1次/d,連續(xù)4周。末次給藥后12 h,10%水合氯醛麻醉小鼠,取腎臟,備用。

        2.2.3 Western blotting 法檢測(cè)小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt蛋白的表達(dá)水平 取小鼠腎臟,使用T-PER組織蛋白提取試劑提取蛋白,Bradford法測(cè)定蛋白含量,SDS-PAGE法分離30 μg蛋白,并轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,于5%脫脂奶粉中孵育30 min,室溫封閉1 h后,與抗體p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt、β-actin(1∶500)在4 ℃孵化過夜;TBST洗膜后,與HRP標(biāo)記兔二抗(1∶2 000)室溫孵育1.5 h。GeneGnome成像系統(tǒng)曝光,Image J軟件分析,所得灰度值即為蛋白相對(duì)表達(dá)量。

        2.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 運(yùn)用Graphpad Prism 6.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,計(jì)量資料以“均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差”(±s)表示,各組實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)經(jīng)方差齊性檢驗(yàn),多組比較采用單因素方差分析,兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        3 結(jié)果

        3.1 糖尿病差異(關(guān)鍵)基因 以lgFC≥1、P<0.05為條件對(duì)糖尿病矩陣文件和平臺(tái)文件進(jìn)行處理得到糖尿病的差異基因2 255個(gè),其中上調(diào)基因1 004個(gè),下調(diào)基因1 251個(gè);繪制糖尿病GEO數(shù)據(jù)庫差異熱圖(見圖1A)和GEO數(shù)據(jù)庫差異火山圖(見圖1B)[14]。熱圖中橫坐標(biāo)為組別(C.正常組;T.實(shí)驗(yàn)組),縱坐標(biāo)為基因名稱,其中,紅色、黑色和綠色分別代表高表達(dá)、中表達(dá)和低表達(dá)?;鹕綀D中,lgFC<0為綠色,表示在實(shí)驗(yàn)組為下調(diào)基因;lgFC=0為黑色,表示正常組與實(shí)驗(yàn)組無差異基因;lgFC>0為紅色,表示在實(shí)驗(yàn)組為上調(diào)基因;顏色越亮表示基因表達(dá)越顯著。差異基因RPS4Y2和RPS4Y1在正常組高表達(dá),在實(shí)驗(yàn)組低表達(dá);差異基因XIST在實(shí)驗(yàn)組高表達(dá),在正常組低表達(dá)。(見圖1)

        圖1 糖尿病GEO 數(shù)據(jù)庫差異熱圖(A)與火山圖(B)

        3.2 六味地黃湯中主要有效成分 在TCMSP數(shù)據(jù)庫中共找到有效成分74個(gè),其中,熟地黃2個(gè)、山茱萸20個(gè)、山藥16個(gè)、牡丹皮11個(gè)、茯苓15個(gè)、澤瀉10個(gè)[15]。(見表1)

        表1 六味地黃湯各種中藥有效成分

        3.3 六味地黃湯靶標(biāo) 從TCMSP數(shù)據(jù)庫搜索處方中各個(gè)中藥的藥物靶點(diǎn),并進(jìn)行中藥復(fù)方靶點(diǎn)整理后,得到584個(gè)有效成分和靶點(diǎn),其中熟地黃34個(gè)、山茱萸130個(gè)、山藥144個(gè)、茯苓30個(gè)、澤瀉9個(gè)、牡丹皮237個(gè)。進(jìn)行藥物靶點(diǎn)ID轉(zhuǎn)換,得到506個(gè)有用結(jié)果,即熟地黃30個(gè)、山茱萸108個(gè)、山藥122個(gè)、茯苓23個(gè)、澤瀉9個(gè)、牡丹皮214個(gè)。

        3.4 中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò)共有24個(gè)有效成分,30個(gè)基因,其中來源于山藥的有效成分最多(9個(gè));網(wǎng)絡(luò)圖共有53個(gè)節(jié)點(diǎn),其中藥物分子24個(gè)、靶點(diǎn)基因29個(gè),共有82條連線;藥物分子中槲皮素(Degree=23)、山奈酚(Degree=12)、β-谷甾醇(Degree=5)度值較大,作用的靶點(diǎn)較多,說明其在治療糖尿病的治療過程中發(fā)揮主要作用。(見圖2、表2~3)

        圖2 中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

        表2 六味地黃湯有效成分藥物分子及其度值

        表3 六味地黃湯治療糖尿病相關(guān)靶點(diǎn)基因及其度值

        3.5 PPI 蛋白相互作網(wǎng)絡(luò)和網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?利用度值(Degree Centralities,DC)分析之后得到1 402個(gè)凝接節(jié)點(diǎn)(見圖3A),以DC(406-61)進(jìn)行過濾得到170個(gè)節(jié)點(diǎn)(見圖3B),創(chuàng)建子網(wǎng)絡(luò),再進(jìn)行介度中心數(shù)(Betweenness Centralities,BC)分析,以BC(840-150)進(jìn)行再次過濾處理,創(chuàng)建一個(gè)新的子網(wǎng)絡(luò)后,最終核心網(wǎng)絡(luò)存在43個(gè)節(jié)點(diǎn)。(見圖3C)

        圖3 六味地黃湯治療糖尿病相關(guān)靶點(diǎn)的PPI 網(wǎng)絡(luò)(A)與拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)(B、C)

        3.6 GO富集分析 研究六味地黃湯對(duì)糖尿病的治療作用,以P<0.05為過濾條件,對(duì)藥物和疾病的靶點(diǎn)基因采取GO富集分析,得到結(jié)果有282個(gè)條目,包括生物學(xué)過程相關(guān)條目243個(gè)、細(xì)胞組分相關(guān)條目20個(gè)、分子功能相關(guān)條目19個(gè)。GO富集分析生物學(xué)過程相關(guān)條目主要有上皮細(xì)胞增殖(epithelial cell proliferation)、調(diào)控上皮細(xì)胞增殖(regulation of epithelial cell proliferation)、類固醇激素反應(yīng)(response to steroid hormone)等;細(xì)胞組分相關(guān)條目主要有頂端等離子體膜(apical plasma membrane)、細(xì)胞的頂端部分(apical part of cell)、橫向等離子體膜(lateral plasma membrane)等;分子功能相關(guān)條目主要有蛋白激酶調(diào)節(jié)活性(protein kinase regulator activity)、激酶調(diào)節(jié)活性(kinase regulator activity)、核受體活性(nuclear receptor activity)等。篩選出P<0.05生物學(xué)過程的前20個(gè)條目、細(xì)胞組分的20個(gè)條目、分子功能的19個(gè)條目制作GO富集分析柱狀圖。(見圖4)

        圖4 六味地黃湯相關(guān)靶點(diǎn)的GO 富集分析圖

        3.7 KEGG富集分析 KEGG富集分析得到37條通路,篩選前20條作出氣泡圖(見圖5A);KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò)中共有20條通路、17個(gè)基因;結(jié)果表明基因顯著富集在神經(jīng)活性配體受體相互作用信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、Ca2+信號(hào)通路和AMPK信號(hào)通路等通路上(見圖5B)。

        圖5 KEGG 富集分析氣泡圖(A)與KEGG 關(guān)系網(wǎng)絡(luò)(B)

        3.8 各組小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt蛋白相對(duì)表達(dá)量比較 與正常組比較,模型組小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt表達(dá)水平明顯降低(P<0.05或P<0.01);與模型組比較,六味地黃湯高劑量組、二甲雙胍組小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt表達(dá)水平均明顯升高(P<0.05或P<0.01),六味地黃湯低劑量組小鼠腎臟中p-Akt/Akt表達(dá)水平明顯升高(P<0.05)。(見圖6~7)

        圖6 各組小鼠腎臟中p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt 蛋白表達(dá)Western blotting 圖

        圖7 各組小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt 蛋白相對(duì)表達(dá)量比較 (±s,n=8)

        4 討論

        本研究通過對(duì)六味地黃湯治療糖尿病的靶點(diǎn)進(jìn)行PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)和網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析,得到六味地黃湯治療糖尿病的關(guān)鍵靶點(diǎn),包括雌激素受體α基因(ESR1)、雄激素受體(AR)、絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、內(nèi)表皮生長(zhǎng)因子(EGF)、β2腎上腺素受體(ADRB2)、蛋白激酶B(AKT1)等;通過GO富集分析得到六味地黃湯治療糖尿病關(guān)鍵靶點(diǎn)的相關(guān)功能,主要包括上皮細(xì)胞增殖、調(diào)控上皮細(xì)胞增殖、類固醇激素反應(yīng)、蛋白激酶調(diào)節(jié)活性、激酶調(diào)節(jié)活性等方面;通過KEGG富集分析得到六味地黃湯治療糖尿病的基因顯著富集在神經(jīng)活性配體受體相互作用信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、Ca2+信號(hào)通路和AMPK信號(hào)通路等通路上,初步探討了六味地黃湯治療糖尿病的藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和治療機(jī)制;通過小鼠體內(nèi)實(shí)驗(yàn),采用六味地黃湯對(duì)糖尿病模型小鼠進(jìn)行治療,對(duì)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)所得結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果表明,六味地黃湯可升高小鼠腎臟中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt的表達(dá)水平,為其進(jìn)一步研究應(yīng)用提供參考和方向。

        2型糖尿病患者會(huì)伴隨嚴(yán)重的脂代謝異常,雌激素和ESR1結(jié)合之后可調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對(duì)絕經(jīng)后婦女糖尿病人群進(jìn)行雌激素替代治療,發(fā)現(xiàn)其糖耐量升高、胰島素抵抗降低[16-17]。據(jù)報(bào)道,腫瘤抑制因子P53(TP53)與肥胖癥有關(guān)[18]。ADRB2可以特異性地與內(nèi)源性配體結(jié)合并被激活,產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng),在脂質(zhì)代謝和能量消耗中發(fā)揮重要作用[19]。AKT1是一種絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,存在于PI3K/AKT信號(hào)通路的核心部位,在調(diào)節(jié)胰島素細(xì)胞的刺激反應(yīng)、增進(jìn)細(xì)胞的生存能力和生長(zhǎng)發(fā)育中發(fā)揮著不可替代的作用[20];研究表明AKT1可在能量代謝通路中發(fā)揮作用[21]。胰島素是機(jī)體內(nèi)唯一可降低血糖的激素,同時(shí)能促進(jìn)糖原、脂肪、蛋白質(zhì)合成;PI3KAkt作為胰島素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要通路,具有調(diào)節(jié)控制機(jī)體中的葡萄糖吸收、糖原降解和合成的作用[22];增強(qiáng)PI3K/Akt信號(hào)通路的表達(dá)可減輕胰島素抵抗[23]。

        六味地黃湯中起主要治療效果的中藥是山茱萸和山藥,而六味地黃湯的君藥是熟地黃,二者結(jié)論不統(tǒng)一,出現(xiàn)這種情況的具體原因有待進(jìn)一步探究。目前網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中藥復(fù)方中的應(yīng)用處在初期階段,只是對(duì)藥物治療疾病的靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),具體的治療效果需要在臨床應(yīng)用中方可得到體現(xiàn)。這進(jìn)一步說明網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥中的應(yīng)用有很大的發(fā)展空間。

        六味地黃湯治療糖尿病的作用機(jī)制可能與調(diào)節(jié)PI3K-Akt信號(hào)通路有關(guān),可為其進(jìn)一步研究應(yīng)用提供參考,但更深層次的原理還需繼續(xù)探索。

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