近日，我國(guó)科研團(tuán)隊(duì)依托原創(chuàng)的臨床單細(xì)胞拉曼藥敏快檢系統(tǒng)（CAST-R）建立的單個(gè)細(xì)菌細(xì)胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的H.pylori 診療技術(shù)CAST-R-HP，具有快速病原鑒定、精確藥敏表型檢測(cè)、基于單細(xì)胞全基因組支撐耐藥機(jī)制研究與精準(zhǔn)溯源等優(yōu)勢(shì)，其特性可用來(lái)診療幽門(mén)螺桿菌感染。

幽門(mén)螺桿菌耐藥菌鑒定的臨床金標(biāo)準(zhǔn)是內(nèi)鏡檢查與細(xì)菌培養(yǎng)相結(jié)合的藥敏檢驗(yàn)。由于其生長(zhǎng)條件苛刻，分離和培養(yǎng)胃活檢標(biāo)本中的幽門(mén)螺桿菌通常需7～10天，且難以考察臨床樣品中“原位”的病原多樣性。目前臨床醫(yī)生主要依賴(lài)經(jīng)驗(yàn)用藥而非藥敏結(jié)果指導(dǎo)下的精準(zhǔn)治療，隨著幽門(mén)螺桿菌耐藥性的不斷增加，經(jīng)驗(yàn)治療的根除失敗率日益提高。

針對(duì)以上瓶頸問(wèn)題，科研團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了15種臨床常見(jiàn)胃部共生菌的單細(xì)胞拉曼光譜（SCRS）參考數(shù)據(jù)庫(kù)，進(jìn)而利用端到端的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（DCNN），將拉曼光譜特征提取與分類(lèi)模型訓(xùn)練過(guò)程相融合，有效提升了基于SCRS 的病原鑒定準(zhǔn)確率。直接從臨床胃黏膜樣品出發(fā)，對(duì)幽門(mén)螺桿菌細(xì)胞進(jìn)行識(shí)別和鑒定，準(zhǔn)確率達(dá)98.5±0.27%。

下一步，研究人員將基于“微生物藥敏單細(xì)胞技術(shù)臨床示范網(wǎng)絡(luò)”，進(jìn)一步開(kāi)發(fā)CAST-R-HP 系統(tǒng)，拓展其應(yīng)用，從而為建立單細(xì)胞精度的幽門(mén)螺桿菌診療與疾控體系奠定技術(shù)和裝備基礎(chǔ)。