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        GeneXpert MTB/RIF檢測技術(shù)在肺結(jié)核診斷及利福平耐藥分析中的應(yīng)用研究

        2022-11-07 10:09:06胡曉蓉宋江勤
        傳染病信息 2022年5期
        關(guān)鍵詞:利福平涂片靈敏度

        胡曉蓉,宋江勤

        全球結(jié)核病患病率高,社會(huì)負(fù)擔(dān)重,我國是位列全球第二的結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國家。WHO全球結(jié)核病報(bào)告顯示,2020年全球病原學(xué)陽性證據(jù)率為58%,我國為55%,低于全球水平,誤診和漏診率較高[1]。傳統(tǒng)的痰涂片、痰培養(yǎng)、傳統(tǒng)核酸擴(kuò)增等方法周期較長。目前綜合醫(yī)院逐漸將快速分子生物學(xué)方法如GeneXpert MTB/RIF檢測法作為涂片的替代方法用于結(jié)核病及耐藥結(jié)核病病原學(xué)檢查的首選方法,而且也作為診斷結(jié)核病的金標(biāo)準(zhǔn)之一[1]。本研究分析了GeneXpert MTB/RIF檢測技術(shù)在肺結(jié)核診斷中的應(yīng)用,現(xiàn)報(bào)告如下。

        1 對象與方法

        1.1 對象 本研究為回顧性分析,收集2020年7月—2021年6月在天門市第一人民醫(yī)院就診疑似肺結(jié)核患者120例作為研究對象,其中男性患者59例,女性患者61例,年齡在29~59歲,平均年齡為(44.29±2.67)歲,體質(zhì)量指數(shù)平均為(24.58±2.06)kg/m2。所有患者均簽署知情同意書,并經(jīng)我院倫理委員會(huì)論證通過?;颊呷脒x標(biāo)準(zhǔn):①所有研究對象均診疑似肺結(jié)核進(jìn)我院治療;②所有患者均知情同意。排除標(biāo)準(zhǔn):①合并自身免疫性疾??;②合并腫瘤疾?。虎酆喜⒕癞惓;颊?。

        1.2 方法 所有患者均留取呼吸道痰標(biāo)本,進(jìn)行痰涂片、痰培養(yǎng)、GeneXpert MTB/RIF檢測及比例法藥物敏感試驗(yàn)(藥敏試驗(yàn))。GeneXpert MTB/RIF試劑盒購自美國Cepheid公司。

        痰涂片:參照《中國結(jié)核病防治規(guī)劃痰涂片鏡檢標(biāo)準(zhǔn)化操作及質(zhì)量保證手冊》[2]萋-尼抗酸染色要求操作,并按照文獻(xiàn)規(guī)定的光學(xué)顯微鏡報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行報(bào)告。

        痰培養(yǎng):羅氏固體培養(yǎng)法按照《結(jié)核病診斷細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程》[3]對痰標(biāo)本進(jìn)行前期處理、固體培養(yǎng)操作。將患者的痰液接種到羅氏培養(yǎng)基,置于37 ℃培養(yǎng)箱中孵育。每周觀察結(jié)果并報(bào)告陽性結(jié)果,若滿8周仍未有菌落生長,則報(bào)告培養(yǎng)陰性。

        GeneXpert MTB/RIF檢測:按照GeneXpert MTB/RIF試劑盒操作手冊進(jìn)行操作。取患者的痰液標(biāo)本1 ml,向其中加入2 ml的樣本處理液,劇烈振蕩20次,或渦旋振蕩10 s,室溫孵育10 min,再重復(fù)振蕩10 s,室溫孵育5 min,使用新的移液管,將2 ml經(jīng)過處理的樣本加入GeneXpert MTB/RIF反應(yīng)盒中進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)時(shí)間為2 h,觀察結(jié)果。

        比例法藥敏試驗(yàn):用接種環(huán)取培養(yǎng)基或痰涂片上的菌落,研磨后與標(biāo)準(zhǔn)麥?zhǔn)瞎鼙葘?,制? mg/ml菌懸液,接種到含利福平的羅氏固體培養(yǎng)基和空白對照管培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)4周后觀察結(jié)果。

        1.3 觀察指標(biāo) 計(jì)算Xpert MTB/RIF檢測MTB的診斷效能。靈敏度=真陽性病例數(shù)/(真陽性病例數(shù)+假陰性病例數(shù))×100%;特異度=真陰性病例數(shù)/(真陰性病例數(shù)+假陽性病例數(shù))×100%;一致率=(真陽性病例數(shù)+真陰性病例數(shù))/總病例數(shù)。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 數(shù)據(jù)分析采用SPSS 22.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)算GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度和特異度;并計(jì)算GeneXpert MTB/RIF檢測與固體培養(yǎng)法、比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果的一致率。

        2 結(jié) 果

        2.1 一般情況 120例疑似肺結(jié)核患者經(jīng)檢測,痰涂片陽性42例(35.00%),痰涂片陰性78例(65.00%);痰涂片陰性患者中最后確診為肺部腫瘤、肺炎、支氣管擴(kuò)張者7例。42例痰涂片陽性患者中,3例GeneXpert MTB/RIF檢測MTB結(jié)果為無效,無效率為7.14%。78例痰涂片陰性患者中,7例GeneXpert MTB/RIF檢測MTB結(jié)果為無效。最終可進(jìn)行GeneXpert MTB/RIF檢測者110例;其中痰涂片陰性患者中3例GeneXpert MTB/RIF檢測利福平耐藥結(jié)果無法判斷,即最終可進(jìn)行對比分析者107例。

        2.2 GeneXpert MTB/RIF診斷肺結(jié)核的效能 107例疑似肺結(jié)核患者中,痰培養(yǎng)MTB陽性48例,其中GeneXpert MTB/RIF檢測MTB陽性41例;痰培養(yǎng)MTB陰性59例,其中GeneXpert MTB/RIF檢測MTB陰性52例。以痰培養(yǎng)結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度為85.42%(41/48),特異度為88.14%(52/59)。GeneXpert MTB/RIF與痰培養(yǎng)診斷一致率為86.92%(93/107)。見表1。

        表1 痰培養(yǎng)與GeneXpert MTB/RIF檢測MTB結(jié)果(例)Table 1 Results of sputum culture MTB and GeneXpert MTB/RIF detection MTB (cases)

        進(jìn)行GeneXpert MTB/RIF檢測107例疑似肺結(jié)核患者中,痰涂片陽性39例(36.45%),痰涂片陰性68例(63.55%)。以痰培養(yǎng)結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),痰涂片陽性患者中,GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度為97.22%(35/36),特異度為33.33%(1/3)(表2);痰涂片陰性患者中,GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度為50.00%(6/12),特異度為91.07%(51/56)(表3)。

        表2 痰涂片陽性患者痰培養(yǎng)與GeneXpert MTB/RIF檢測MTB結(jié)果(例)Table 2 Results of sputum culture and GeneXpert MTB/RIF detection in sputum smear positive patients (cases)

        表3 痰涂片陰性患者痰培養(yǎng)與GeneXpert MTB/RIF檢測MTB結(jié)果(例)Table 3 Results of sputum culture and GeneXpert MTB/RIF detection in sputum smear negative patients (cases)

        2.3 GeneXpert MTB/RIF藥敏試驗(yàn)檢測效能 比例法藥敏試驗(yàn)確認(rèn)痰培養(yǎng)陽性36例患者中利福平耐藥者有4例(11.11%),敏感者有32例(88.89%)。以比例法藥敏結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),GeneXpert MTB/RIF檢測痰培養(yǎng)陽性患者利福平耐藥的靈敏度為75.00%(3/4),特異度為93.75%(30/32)。同時(shí),對GeneXpert MTB/RIF與比例法藥敏試驗(yàn)進(jìn)行一致性檢驗(yàn),一致率為91.67%(33/36),2者具有較好的一致性。見表4。

        表4 GeneXpert MTB/RIF藥敏試驗(yàn)與比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果(例)Table 4 Results of GeneXpert MTB/RIF drug sensitivity test and proportional drug sensitivity test (cases)

        3 討 論

        GeneXpert MTB/RIF系統(tǒng)是一種能夠快速診斷結(jié)核病并檢測結(jié)核桿菌耐藥性的全新系統(tǒng),該系統(tǒng)主要針對MTB的位于RpoB基因81 bp區(qū)域(密碼子426—452)的利福平耐藥突變區(qū)(該區(qū)域被稱為利福平耐藥決定區(qū))設(shè)定引物、探針并進(jìn)行擴(kuò)增檢測,并根據(jù)其是否發(fā)生基因突變而確定被檢測樣本中是否含有MTB,而且也能檢測其是否對利福平耐藥[4]。該系統(tǒng)能夠?qū)颖具M(jìn)行全自動(dòng)的核酸提取、純化及濃縮,而且2 h便可出結(jié)果,是全自動(dòng)的半定量巢式實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng),具有更高的靈敏度和特異度,而且該系統(tǒng)的檢測過程是在完全封閉的檢測盒中進(jìn)行的,因此該方法不僅具有操作簡單、高度全自動(dòng)化的優(yōu)點(diǎn),而且還有很好的生物安全性。該技術(shù)已被WHO和我國推薦作為用于快速診斷成人和兒童肺結(jié)核和肺外結(jié)核以及利福平耐藥,具有確診的作用[1]。

        本研究結(jié)果顯示,以痰培養(yǎng)結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),GeneXpert MTB/RIF檢測TBM的靈敏度為85.42%,特異度為88.14%,GeneXpert MTB/RIF與痰培養(yǎng)診斷一致率為86.92%。這與國內(nèi)其他同行研究結(jié)果一致[1,4]。因此GeneXpert MTB/RIF檢測技術(shù)可有效的篩檢出肺結(jié)核陽性患者,且具備快速便捷的特征,彌補(bǔ)痰培養(yǎng)周期長的缺陷。值得注意的是,本研究所納入的107例患者為疑似肺結(jié)核病例,患者標(biāo)本的低質(zhì)量或者弱陽性均會(huì)使得GeneXpert MTB/RIF檢測技術(shù)出現(xiàn)弱信號,從而得出錯(cuò)誤的結(jié)論。同時(shí),本研究對2種方法分析結(jié)果不一的病例進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)多數(shù)病例存在臨床特征不明顯、采集樣本較少的現(xiàn)象,這可能導(dǎo)致了GeneXpert檢測技術(shù)結(jié)果的誤判。

        本研究進(jìn)一步分析了GeneXpert MTB/RIF檢測技術(shù)分別在痰涂片陽性和陰性患者中對肺結(jié)核的診斷價(jià)值,結(jié)果顯示,痰涂片陽性患者中,GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度為97.22%,特異度為33.33%;痰涂片陰性患者中,GeneXpert MTB/RIF檢測MTB的靈敏度為50.00%,特異度為91.07%。這說明了人群發(fā)病率或病原體感染率的高低對某一診斷技術(shù)靈敏度和特異度的影響,即人群發(fā)病率越高,該診斷技術(shù)靈敏度越高,特異度越低,反之則靈敏度越低,特異度越高[5]。

        在對患者的GeneXpert MTB/RIF檢查中,主要是將標(biāo)本的處理、DNA提取以及核酸擴(kuò)增等工作集于一體,在對患者進(jìn)行病原微生物檢測過程中,及時(shí)有效對患者的耐藥基因進(jìn)行檢測,在實(shí)際的檢測過程中,通過多通道的檢測,一般可在2 h之內(nèi)即可得到結(jié)果。在整個(gè)檢測過程中,其較高的封閉性以及自動(dòng)化,在臨床檢測中的外部影響較小,降低手動(dòng)操作中可能的誤差,提升檢測的準(zhǔn)確性[6]。

        本研究顯示,以比例法藥敏結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),GeneXpert MTB/RIF檢測痰培養(yǎng)陽性患者利福平耐藥的靈敏度為75.00%,特異度為93.75%,對GeneXpert MTB/RIF與比例法藥敏試驗(yàn)進(jìn)行一致性檢驗(yàn),一致率為91.67%(33/36),2者具有較好的一致性。這與國內(nèi)研究結(jié)果一致[1]。RpoB基因中的81bp耐藥基因的突變是造成肺結(jié)核患者利福平耐藥的重要原因。本研究將GeneXpert MTB/RIF中加入利福平耐藥的基因片段檢測試劑,將RpoB基因作為利福平耐藥檢測的靶基因,在檢測中,使用引物探針對RpoB基因中的81bp片段進(jìn)行選擇性覆蓋,通過其檢測的陽性與否,進(jìn)一步對患者的耐藥情況進(jìn)行分析[7-8]。

        綜上,本研究發(fā)現(xiàn)GeneXpert MTB/RIF檢測MTB有較高的靈敏度和特異度,對于利福平耐藥的檢測與比例法藥敏試驗(yàn)有較高的一致性,可以作為結(jié)核病診斷和利福平耐藥檢測的金標(biāo)準(zhǔn)。但是本研究還存在一定的局限性,由于納入的樣本量較少,研究數(shù)據(jù)需要大樣本量進(jìn)一步支持。

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