薛靜,瞿晶田,韓真真,孫瑜,孫精通
(1.天津中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院藥學(xué)部,天津 300381;2.天津中醫(yī)藥大學(xué)附屬??滇t(yī)院藥劑科,天津 300381)
室性早搏(VPB),又稱為室性期前收縮,屬于一種比較常見的心律失常。目前西醫(yī)對于VPB的治療,多采用鉀通道阻滯劑、鈉通道阻滯劑、β受體拮抗劑、鈣通道阻滯劑等4類常用的抗心律失常藥物,還可采取射頻消融手術(shù)治療[1]。中醫(yī)將VPB歸屬為“心悸”的范疇,認(rèn)為病位主要在心,總結(jié)的病機(jī)特點(diǎn)主要為本虛標(biāo)實(shí)。通過對古代醫(yī)籍文獻(xiàn)的研究和臨床實(shí)踐,不同醫(yī)家提出了許多治療方法,比如從心氣不足,心陽不振論治,也可從脾血不統(tǒng),心陰不足之心脾論治,也有從痰濁水飲,血絡(luò)瘀阻論治等等[2-6]。VPB的中醫(yī)證型有多種,加之中醫(yī)注重個(gè)體化治療,這就導(dǎo)致臨床用藥繁雜多樣。因此,利用數(shù)據(jù)分析技術(shù)對中醫(yī)臨床治療VPB的用藥規(guī)律的提取整理十分必要,通過數(shù)據(jù)挖掘出有效的藥物配伍,以期更好的服務(wù)指導(dǎo)臨床實(shí)踐。
1.1 數(shù)據(jù)來源 進(jìn)入中國知網(wǎng)(CNKI)的高級檢索界面,以主題關(guān)鍵詞為“室性早搏+中醫(yī)+臨床”,全文關(guān)鍵詞為“中藥”并且篇名中不含“進(jìn)展”。時(shí)間選擇為1979年1月1日—2020年3月1日。共檢索到273篇文獻(xiàn)。
1.2 納入及排除標(biāo)準(zhǔn) 納入臨床病例文獻(xiàn),排除實(shí)驗(yàn)研究類,綜述類等文獻(xiàn);納入病例中應(yīng)有明確診斷為“室性早搏”并有“心悸”等中醫(yī)病名表述;納入有具體中藥的組方,排除加減方和重復(fù)處方;納入文獻(xiàn)明確表明中藥的臨床效果較好,排除中藥為輔的臨床治療。
1.3 數(shù)據(jù)處理 參照中國藥典2015年版[7]和中藥學(xué)[8]標(biāo)準(zhǔn),將數(shù)據(jù)庫中的110味中藥的名稱、功效、性味歸經(jīng)等規(guī)范化處理,對于中藥有別稱或簡稱的,進(jìn)行統(tǒng)一名稱,如“云苓”統(tǒng)稱為“茯苓”,“焦三仙”規(guī)范錄入“焦山楂,焦神曲,焦麥芽”。有些中藥炮制后性味歸經(jīng)有所改變,如“生甘草,炙甘草”則分別統(tǒng)計(jì)。
1.4 統(tǒng)計(jì)方法 將上述所有中藥統(tǒng)一錄入Excel 2010,建立數(shù)據(jù)庫。對納入的所有中藥品種進(jìn)行分類排序分析,采用SPSSClementine12、SPSSS tatistics20數(shù)據(jù)處理軟件對中藥數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則、因子分析等統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。
1.5 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析 使用BATMAN-TCM系統(tǒng)預(yù)測關(guān)鍵中藥所含化學(xué)成分,并獲取對應(yīng)靶點(diǎn);把這些靶點(diǎn)與Genecard數(shù)據(jù)庫中檢索到的室性早搏相關(guān)靶點(diǎn)相映射并取交集,將其作為治療室性早搏的潛在作用靶點(diǎn);將上述靶點(diǎn)上傳至DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫進(jìn)行KEGG通路和GO生物過程富集分析,利用 Cytoscape 3.2.1 構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-通路等多層次網(wǎng)絡(luò)圖,分析預(yù)測關(guān)鍵藥物發(fā)揮藥理作用主要成分、靶點(diǎn)以及重要的信號通路。
2.1 單味中藥使用情況 最終從篩選的273篇文獻(xiàn)資料中,納入符合數(shù)據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)102篇,共102首中藥組方,含中藥110味,累積頻率965次,前20味中藥,累計(jì)頻次562次,占總頻率的53.20%。使用頻次最高的前3位中藥品種分別是炙甘草(49 次,48.04%)、酸棗仁(43次,42.16%)、丹參(42 次,41.18%)結(jié)果見表1。
表1 高頻中藥(頻次前20)統(tǒng)計(jì)分析Tab.1 Statistical analysis of high frequency traditional Chinese medicine(top 20 frequencies)
2.2 高頻中藥性味統(tǒng)計(jì) 參照《中國藥典》2015年版和《中藥學(xué)》標(biāo)準(zhǔn)分類,將20味高頻中藥的性味進(jìn)行規(guī)范的分類統(tǒng)計(jì)。高頻中藥的藥性統(tǒng)計(jì)最高者為溫(6次,30.00%);五味統(tǒng)計(jì)最高者為甘(13次,43.33%)。結(jié)果見圖1。
圖1 高頻中藥性味統(tǒng)計(jì)分析Fig.1 Statistical analysis of high frequency Chinese medicine flavor
2.3 高頻中藥歸經(jīng)統(tǒng)計(jì) 依據(jù)《中國藥典》2015年版標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行性味歸經(jīng)的統(tǒng)計(jì)校對,累計(jì)統(tǒng)計(jì)頻率為64次。高頻中藥歸經(jīng)統(tǒng)計(jì)最高者為心經(jīng)(14次,22.88%)結(jié)果見圖2。
圖2 高頻中藥歸經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析Fig.2 Statistical analysis of meridian attribution of high frequency traditional Chinese medicine
2.4 高頻中藥功效統(tǒng)計(jì) 以《中藥學(xué)》為標(biāo)準(zhǔn),對高頻中藥的功效進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,共有9類:使用最多的為補(bǔ)虛藥(7次,35%),結(jié)果見圖3。
圖3 高頻中藥功效統(tǒng)計(jì)分析Fig.3 Statistical analysis of efficacy of high frequency traditional Chinese medicine
2.5 高頻中藥關(guān)聯(lián)規(guī)則分析 使用SPSSClementine 12數(shù)據(jù)挖掘軟件對所選擇的高頻中藥(頻次前20)進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則分析,使用Apriori建模進(jìn)一步統(tǒng)計(jì)分析不同的中藥之間關(guān)聯(lián)配伍關(guān)系[9-10]。將支持度設(shè)置為15%,置信度設(shè)置為80%,最大前項(xiàng)數(shù)設(shè)置為5,提升≥1等條件,挖掘高頻中藥中的潛在藥物組合,通過分析,共獲得核心藥物組合6組。具體結(jié)果見表2。高頻中藥之間的關(guān)聯(lián)性分析的網(wǎng)絡(luò)化展示見圖4。
表2 高頻中藥關(guān)聯(lián)規(guī)則統(tǒng)計(jì)分析Tab.2 Statistical analysis of association rules of high frequency traditional Chinese medicine
圖4 高頻中藥關(guān)聯(lián)規(guī)則的網(wǎng)絡(luò)化展示Fig.4 Network display of high frequency association rules of traditional Chinese medicine
數(shù)據(jù)里中藥之間關(guān)聯(lián)規(guī)則的支持度和置信度越高,說明這兩種或幾種藥物的聯(lián)系越大越緊密,這種藥物聯(lián)系的核心組合,能直接反映出中藥治療VPB的核心對藥,這對分析方劑配伍規(guī)律是十分有幫助的[11-12]。筆者提取了支持度大于15%的6組組合藥物,從結(jié)果可以看出,1組和4組提取出的核心藥對配伍是“當(dāng)歸-黃芪-酸棗仁-炙甘草”,當(dāng)歸甘溫質(zhì)潤,長于補(bǔ)血,為補(bǔ)血圣藥,黃芪甘溫,為補(bǔ)氣要藥,兩者合用,氣血雙補(bǔ),酸棗仁養(yǎng)心陰,益肝血而安神,配合補(bǔ)益心脾的炙甘草,4味藥組成藥對,主要針對氣血虧虛之驚悸不安有很好的治療作用;2組和3組提取出的核心藥對是“麥冬-生地黃”和“生地黃-炙甘草”,生地黃清熱滋陰涼血 有清有補(bǔ),治陰虛血熱之心神煩亂,麥冬養(yǎng)陰生津,潤肺清心,炙甘草藥性微溫,增強(qiáng)了補(bǔ)益心脾的作用,“生地黃-麥冬-炙甘草”3藥形成藥對滋心陰,清心火,益心脾,這也是“炙甘草湯”中的核心藥物;5組提取出的是核心藥對“生龍骨-生牡蠣”,龍骨牡蠣重鎮(zhèn)安神,平肝鎮(zhèn)驚,是治療心神不寧等疾病的常用藥對;6組提取出的核心藥對為“酸棗仁-遠(yuǎn)志-炙甘草”酸棗仁入心肝經(jīng),能養(yǎng)心陰,益肝血而安神,遠(yuǎn)志性善宣泄通達(dá),既能開心氣而寧心安神,又能通腎氣而強(qiáng)志不忘,為交通心腎,安神定志之佳品,加之補(bǔ)益心脾,調(diào)和藥性的炙甘草。3藥組成藥對,主要針對心悸怔忡,失眠多夢等癥狀而治療。
2.6 高頻中藥因子分析 藥物之間的關(guān)聯(lián)規(guī)則分析解釋的主要是藥物之間的聯(lián)系疏密程度歸類與展示,一定程度上能代表用藥組合的使用規(guī)律,但是并不能展示整體數(shù)據(jù)中貢獻(xiàn)最大的藥物組成[13-14]。因此,筆者利用SPSS Statistics 20統(tǒng)計(jì)軟件的因子分析工具,通過提取共性因子,將具有相同本質(zhì)的變量歸入一個(gè)因子,并對各變量之間的關(guān)系進(jìn)行分類,找出貢獻(xiàn)率最大的因子。在統(tǒng)計(jì)前完成KMO和Bartlett的球形度檢驗(yàn),KMO 值為 0.584>0.5,Bartlett的球形度檢驗(yàn)的近似卡方值為532.548,顯著性檢驗(yàn) 0.000,P<0.001 符合要求,可以進(jìn)行因子分析。通過旋轉(zhuǎn)成分矩陣分析,參考碎石圖,提取了貢獻(xiàn)率排名前6的因子,累積方差貢獻(xiàn)率58.816%,對照6個(gè)因子中,貢獻(xiàn)率較大的中藥成分進(jìn)行提取分析。高頻中藥旋轉(zhuǎn)成分矩陣中貢獻(xiàn)率較大的中藥組成及因子方差百分比見表3,高頻中藥旋轉(zhuǎn)空間成分分析見圖5。
表3 因子中高度相關(guān)的中藥組成Tab.3 Highly correlated traditional Chinese medicine composition among factors
圖5 高頻中藥旋轉(zhuǎn)空間成分圖Fig.5 Rotational spatial component map of high frequency traditional Chinese medicine
通過成分旋轉(zhuǎn)矩陣,發(fā)現(xiàn)因子1高度相關(guān)的中藥組成為“酸棗仁、當(dāng)歸、甘松、黃芪”,該組成包含了關(guān)聯(lián)規(guī)則分析提取的編號1的中藥組合的全部品種,并加入了甘松,甘松味辛、甘,性溫,具有理氣止痛、開郁醒脾的作用。因子方差百分比可知,因子1貢獻(xiàn)率最高,可知該藥物組分為整體方劑數(shù)據(jù)中采用的最廣泛的治療思路,總結(jié)為氣血雙補(bǔ),兼養(yǎng)心陰,益肝血而安神,同時(shí)加入理氣醒脾之甘松,使補(bǔ)而不滯;因子2高度相關(guān)的中藥組成為“炙甘草、桂枝、生地黃”,桂枝能溫經(jīng)通陽,化氣行水,炙甘草溫陽益氣養(yǎng)心,加入了清熱滋陰涼血的生地黃,從因子2的用藥組成來看,總結(jié)治療思路為溫經(jīng)通陽、益氣的同時(shí),滋陰涼血也同樣重要;因子3高度相關(guān)的中藥組成為“生龍骨、生牡蠣”,龍骨牡蠣重鎮(zhèn)安神,平肝鎮(zhèn)驚,是治療心神不寧等疾病的常用藥對,其治療思路為鎮(zhèn)驚安神;因子4高度相關(guān)的中藥組成為“麥冬、五味子”,麥冬養(yǎng)陰生津,潤肺清心,五味子益氣生津,補(bǔ)腎寧心,該因子治療思路著重于滋陰,補(bǔ)腎寧心;因子5高度相關(guān)的中藥組成為“川芎、白芍”,川芎辛溫,功能活血行氣,可補(bǔ)肝之氣,為血中之氣藥,可疏通臟腑經(jīng)絡(luò)之氣,調(diào)節(jié)氣血運(yùn)行,白芍養(yǎng)肝血,斂肝陰,養(yǎng)肝之本,因此該因子治療思路主要為補(bǔ)肝氣,養(yǎng)肝血,疏肝氣,肝為心之母,此為子病求母之思路;因子6高度相關(guān)的中藥組成為“人參”,人參,甘,微溫,有健脾養(yǎng)心,安神益智,另有大補(bǔ)元?dú)庵?。綜合6個(gè)因子的高度相關(guān)中藥組成分析,治療VPB的最普遍的中醫(yī)思路主要為氣血雙補(bǔ),兼養(yǎng)心陰,同時(shí)注重溫經(jīng)通陽益氣,適當(dāng)佐以補(bǔ)肝疏肝活血之品,同時(shí)兼入理氣醒脾之藥,使之補(bǔ)而不滯。
2.7 關(guān)鍵藥物酸棗仁靶點(diǎn)預(yù)測和室性早搏相關(guān)靶點(diǎn)檢索 數(shù)據(jù)挖掘顯示,使用頻次最高的前3味中藥為“炙甘草、酸棗仁、丹參”,關(guān)聯(lián)分析中支持度最高的藥物為“當(dāng)歸、黃芪、酸棗仁”,因子分析中貢獻(xiàn)度最高的藥物為“酸棗仁、當(dāng)歸、甘松、黃芪”,通過以上數(shù)據(jù)綜合分析,提取出關(guān)鍵藥物“酸棗仁”進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析,在BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)中以“suan zao ren ”為關(guān)鍵詞,“Score cutoff”設(shè)置為 30,“Ad-justed P-value”設(shè)置為0.05,檢索出酸棗仁主要化合物21種,分別編號S1-S21,包括BetulinicAcid,Acetyljujuboside B,Sylvestrene,Jujuboside A1,Betulin 等,同時(shí)獲取這些化合物對應(yīng)靶點(diǎn)131個(gè)[15]。以“ventricular premature beats”為關(guān)鍵詞,在Genecard數(shù)據(jù)庫(http://www.genecards.org/)中檢索室性早搏的相關(guān)靶點(diǎn),與BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫獲得的成分預(yù)測靶點(diǎn)相對比并取交集,共獲得酸棗仁治療室性早搏的共同靶點(diǎn)59個(gè)[16]。
2.8 GO功能富集和KEGG信號通路分析 采用DAVID 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/)進(jìn)行基因本體(GO)的生物過程富集分析,以 P<0.01 對相關(guān)靶基因進(jìn)行篩選,納入前20個(gè)最重要的條目,其中包擴(kuò)11個(gè)與生物過程(GOTERM_BP_DIRECT)相關(guān)條目,主要涉及腺苷酸環(huán)化酶激活腎上腺素能受體信號通路,正性血管收縮調(diào)節(jié),心臟傳導(dǎo)調(diào)節(jié)心率等方面;4個(gè)與細(xì)胞組分(GOTERM_CC_DIRECT)相關(guān)條目,主要涉及質(zhì)膜,控鉀通道復(fù)合體等;4個(gè)與分子功能(GOTERM_MF_DIRECT)相關(guān)條目,主要涉及降低鉀通道活性,類固醇物質(zhì)結(jié)合等條目。將數(shù)據(jù)通過 http://www.bioinformatics.com.cn/平臺進(jìn)行可視化處理,結(jié)果見圖6。圖中圓點(diǎn)越大,表明通路富集到的基因數(shù)目越多,圓點(diǎn)的顏色越紅,表明P值越小。
圖6 GO功能富集分析Fig.6 GO function enrichment analysis
通過 DAVID 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/)進(jìn)行京都基因和基因組百科全書(KEGG)的信號通路的富集分析,以P<0.01對相關(guān)靶基因通路進(jìn)行篩選,得到11條重要通路,包括神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,鈣信號通路,cGMP-PKG信號通路,心肌細(xì)胞腎上腺素能信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路等。將數(shù)據(jù)通過http://www.bioinformatics.com.cn/平臺對通路富集分析的結(jié)果進(jìn)行可視化處理[17]。結(jié)果見圖7,圖中圓點(diǎn)越大,表明通路富集到的基因數(shù)目越多,圓點(diǎn)的顏色越紅,表明P值越小。
圖7 KEGG富集分析Fig.7 Enrichment analysis of KEGG
2.9 “成分-靶點(diǎn)-關(guān)鍵通路”可視化網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建和分析 通過Cytoscape3.2.1軟件,將“酸棗仁所含活性成分(S1-S21)”“酸棗仁治療室性早搏的59個(gè)共同靶點(diǎn)”“KEGG富集分析的11條關(guān)鍵通路(P1-P11)”進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-關(guān)鍵通路結(jié)合的多層次網(wǎng)絡(luò)圖。采用Cytoscape中的NetworkAnalyzer功能對所有的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)拓?fù)鋵W(xué)特征進(jìn)行分析,分析的特征值包括自由度、介數(shù)中心性及平均最短路徑長度等數(shù)據(jù)。以度值作為主要的評價(jià)指標(biāo)[18],度值越大,該節(jié)點(diǎn)的面積就越大,結(jié)果見圖8。
圖8 成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)(圓形-活性成分,菱形-靶點(diǎn),正方形-通路)Fig.8 Network of traditional Chinese medicine-components-targets-pathways(circular-active component,diamond-target,square-pathway)
從網(wǎng)絡(luò)圖中發(fā)現(xiàn),酸棗仁中對于治療室性早搏重要的活性成分為Betulin、BetulinicAcid、Dauricine等,重要的基因靶點(diǎn)包括ATPA1,PTGS2,PTGS1,TYR,CYP3A4等。重要的信號通路為:神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,鈣信號通路,cGMP-PKG信號通路,cAMP信號通路。表明酸棗仁可能主要通過這些通路來發(fā)揮治療室性早搏的作用。
VPB可見于伴有心臟器質(zhì)性病變的患者,也可見于正常人[19]。中醫(yī)藥治療VPB時(shí)注重辨證論治,從人體整體角度進(jìn)行調(diào)節(jié),探索了多種途徑對該病進(jìn)行治療。VPB中醫(yī)歸于心悸的范疇,通過分析,其病機(jī)多錯(cuò)綜復(fù)雜,歷史上各個(gè)醫(yī)家對VPB的認(rèn)識也各有不同。通過對中醫(yī)治療VPB的文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,初步篩選探討了其臨床用藥規(guī)律,以進(jìn)一步挖掘潛在的治療VPB有效的中藥、藥對或組方。結(jié)果表明,中醫(yī)對于VPB的臨床治療以補(bǔ)虛藥、安神藥、清熱藥較為常用,多選擇藥性偏溫、平、微寒,藥味偏甘,歸心、肝、脾經(jīng)的中藥。臨床用藥時(shí)可著重參考當(dāng)歸、甘松、黃芪、酸棗仁、炙甘草、桂枝、生地黃、生龍骨、生牡蠣、麥冬、五味子、川芎、白芍、人參等中藥進(jìn)行配伍使用。通過數(shù)據(jù)挖掘分析,提取了關(guān)鍵中藥“酸棗仁”并通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析酸棗仁治療VPB的潛在作用機(jī)制,結(jié)果發(fā)現(xiàn)酸棗仁治療VPB涉及多通路、多靶點(diǎn)。涉及到的重要通路有神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,鈣信號通路,cGMP-PKG信號通路cAMP信號通路。重要的基因靶點(diǎn)包括 ATPA1,PTGS2,PTGS1,TYR,CYP3A4 等。已知的研究證實(shí),早搏大鼠的L型鈣通道(LCCs)mRNA水平和Ca2+-ATP酶基因的表達(dá)水平下降,說明早搏的發(fā)生與鈣信號通路和Ca2+-ATP酶的表達(dá)關(guān)系密切[20]。此外,有研究顯示酸棗仁皂苷A具有明顯的鈣通道阻滯作用。鄧偉等[21]結(jié)果顯示,酸棗仁皂苷A對L型鈣通道電流(Ica-L),有明顯影響,且呈現(xiàn)濃度依賴關(guān)系,通過抑制L型鈣通道,降低心率失常的發(fā)生,緩解心率失常等心血管系統(tǒng)類疾病。Coben等[22]研究發(fā)現(xiàn),有些抗生素是強(qiáng)力CYP3A4、CYP2C9抑制劑,可對心律產(chǎn)生明顯的影響,這與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測的關(guān)鍵靶點(diǎn)也相吻合。
綜上所述,本研究采用數(shù)據(jù)挖掘結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的相關(guān)方法對中藥治療VPB的用藥規(guī)律及關(guān)鍵藥物酸棗仁治療VPB的潛在作用機(jī)制進(jìn)行了多角度的探析,預(yù)測的通路和靶點(diǎn)與已知文獻(xiàn)報(bào)道的酸棗仁治療VPB的作用基本吻合,體現(xiàn)了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測分析的準(zhǔn)確性,同時(shí)揭示了酸棗仁多成分、多靶點(diǎn)、多途徑作用的特點(diǎn)。由于數(shù)據(jù)庫的局限和信息收集的不完善以及化合物之間的相互作用的復(fù)雜性,故研究預(yù)測的結(jié)果具有一定的局限性,需要構(gòu)建復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。