李 霞 劉 婭 王 聰 李振江
1.山東省菏澤市立醫(yī)院,山東菏澤 274000;2.山東省腫瘤醫(yī)院 山東省腫瘤防治研究院,山東濟南 250012
磁共振影像(magnetic resonance images,MRI)已成為宮頸癌ⅠB1 期及以上期別的標準診療方法,在影像診斷和腫瘤邊界鑒別方面有獨特優(yōu)勢[1-2],并可提供治療評估及預后信息[3-4]。研究表明,基于MRI 確定的靶區(qū),其體積要明顯小于以常規(guī)電子計算機斷層掃描(computed tomography,CT)確定的靶區(qū)[5-6]。應用MRI 圖像勾畫宮頸癌靶區(qū),定義腫瘤靶區(qū)并進行局部加量,可將3 年生存率提高10%~20%,同時顯著降低胃腸道和尿道的毒性反應[7]。同時,由于治療過程中腫瘤消退、器官位置變化,對實時快速精確的臨床靶區(qū)(clinical target volume,CTV)和危及器官(organs at risk,OARs)勾畫的要求越來越高。應用深度學習算法較基于圖譜集自動勾畫方法準確性高、適應性廣,并提高輪廓生成速度[8]?;诰矸e神經(jīng)網(wǎng)絡提出的U-Net 體系結(jié)構(gòu)[9-10],專門為醫(yī)學圖像設計,需要的網(wǎng)絡參數(shù)較少,訓練過程快。目前應用MRI 使用深度學習算法實現(xiàn)CTV 和OARs 勾畫,在宮頸癌放療中仍處于研究階段。本研究使用U-net 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡算法架構(gòu),以MRI 為基礎,建立宮頸癌感興趣區(qū)(region of interest,ROI)自動分割算法,并比較手動勾畫與自動勾畫的差異,擬為MRI 引導適應性放射治療提供自動勾畫技術支持。
選取2019 年4 月至2020 年12 月山東省腫瘤醫(yī)院根治性放療宮頸癌患者43 例。患者年齡20~65 歲,平均(48.6±9.6)歲;鱗癌34 例,腺癌9 例;國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(Federation of Gynecology and Obstetrics,F(xiàn)IGO)[4]分期為ⅡB 期13 例,Ⅲ期28 例,ⅣA 期2 例。納入標準:ⅡB~ⅣA 期的宮頸癌根治性同步放化療患者,放療前進行大孔徑MR 定位,定位圖像質(zhì)量高,膀胱憋尿量為200~600 ml。排除標準:不能正?;顒?;具有MR 掃描禁忌證;既往盆腔手術或放療史;合并盆腔其他良惡性疾病或畸形。本研究已獲機構(gòu)審查委員會批準(SDTHEC 201904001)。
患者取仰臥位并使用負壓袋固定,治療前行大孔徑MR 定位。定位前充盈膀胱,排空直腸,掃描層厚3 mm。MR T2 序列分辨率352×352。每例患者獲得80~120 張盆腔MR T2 壓脂序列采集圖像,圖像覆蓋整個盆腔放療野。
采用計算機進行簡單隨機抽樣,將43 例患者分為訓練集35 例,驗證集4 例,測試集4 例。由1 名有經(jīng)驗的婦科放療醫(yī)師根據(jù)美國放射腫瘤學會[10]的宮頸癌靶區(qū)推薦及放射治療腫瘤組正常組織輪廓放射治療指南[11]進行人工勾畫ROI,包括CTV 和4 個OARs(膀胱、直腸、左股骨頭、右股骨頭),1 名有經(jīng)驗的婦科放療醫(yī)師復核。
本研究網(wǎng)絡輸入為單層MRI 和勾畫數(shù)據(jù),輸出為所對應的勾畫數(shù)據(jù),使用同一個模型進行訓練。訓練集中的數(shù)據(jù)用于訓練模型,驗證預測數(shù)據(jù)與實際數(shù)據(jù)的差異,評價模型訓練的結(jié)果。測試集不參與訓練和驗證過程,作為獨立的驗證手段,用于驗證模型的適用性和魯棒性。
1.4.1 圖像取樣 訓練集圖片3 655 張,驗證集圖片340 張,將所有的數(shù)據(jù)重復取樣到(1.0,1.0,None)的體素后每次在單層數(shù)據(jù)中截取320×320 大小的圖像輸入網(wǎng)絡中。為獲得更多的數(shù)據(jù)量,避免模型過擬合,在輸入數(shù)據(jù)前對圖像數(shù)據(jù)進行圖像灰度浮動及圖像縮放形變兩種干擾[8]。在灰度浮動途徑中,將圖像上所有點的灰度值乘0.9~1.0 的隨機數(shù),后疊加1 個-0.1~0 的隨機數(shù)??s放形變途徑是將每一層的MRI圖像和勾畫進行仿射變換,所使用變換矩陣中任意兩個點之間的坐標值之差均在-0.2~0 的一個固定值,其中橫縱坐標分別為不同大小的值。
1.4.2 網(wǎng)絡構(gòu)建 采用帶有殘差塊的U-net 網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)(圖1),包括編碼器和解碼器兩部分,且均由兩個卷積層的殘差塊堆疊而成,編碼器和解碼器之間使用特征圖躍層連接,融合高層語義信息和低層的邊緣細節(jié)信息。在訓練期間,在線進行縮放、旋轉(zhuǎn)、對比度亮度增強、高斯噪聲等增強手段,并采用標簽平衡方法對輸入樣本進行窗口采樣。訓練所使用的損失函數(shù)為Dice Loss,優(yōu)化器為Adam,學習率為3e-4。
圖1 殘差U-Net 網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)示意圖
在測試數(shù)據(jù)集中分別計算Dice 相似性系數(shù)(Dice similarity coefficient,DSC)和勾畫時間,并對自動勾畫和人工勾畫的相似性進行比較。DSC 定義為DSC(A,B)=2A∩B/(A+B),其可對兩個感興趣區(qū)勾畫的相似度進行測量[9]。DSC 值為0~1,其中1 為完全重疊,0 為無重疊;DSC≥0.7 時被認為是輪廓之間具有較好的一致性[9,12]。
采用SPSS 26.0 軟件進行數(shù)據(jù)分析。計量資料用均數(shù)±標準差(±s)表示,組間比較采用t 檢驗;計數(shù)資料用例數(shù)表示。以P <0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。
模型訓練的Loss 曲線和驗證DSC 曲線如圖2 所示。訓練前期Loss 曲線下降明顯,800 次迭代時Loss值<0.1,之后緩慢下降。DSC 值前期提升明顯,迭代到達800 次之后開始震蕩上升,在3 600 次時達到了最優(yōu)值。
圖2 訓練過程中模型的Loss 曲線和DSC 曲線
如圖3 所示,在訓練前期,膀胱已經(jīng)有較好的效果,但CTV、股骨頭的分割效果還有待改進,直腸在不同的切片上表現(xiàn)不一。隨著訓練的進行,這些ROI的輪廓完整性、平滑度及勾畫精準度都有不同程度的提升。
圖3 模型訓練過程中預測輸出變化
患者平均自動勾畫耗時為(44.5±0.6)s,短于平均人工勾畫的(2 280.0±356.7)s,差異有統(tǒng)計學意義(P <0.05)。自動勾畫與人工勾畫的DSC 值:直腸為(0.752±0.049);CTV 為(0.831±0.038);膀胱為(0.943±0.016);左股骨頭為(0.894±0.009);右股骨頭為(0.896±0.004)。
放射治療的目標是動態(tài)跟蹤腫瘤的變化,但僅依賴放療前CT 來捕捉這種變化在治療過程中是不全面的[13]。MR 引導放射治療允許在治療過程中進行運動監(jiān)測,通過實時解剖成像來提高放療精度。MR 軟組織對比度較CT 更優(yōu),精度更高[14-15]。人工勾畫每例患者的中位時間要超過1 h[16],隨著自動勾畫出現(xiàn)及發(fā)展使更頻繁的計劃調(diào)整得以實施[17-18]。自動勾畫在提高臨床醫(yī)生效率,減少勾畫不確定性等方面均有優(yōu)勢[19-22]。
研究顯示,基于深度學習算法對OARs 自動勾畫準確度優(yōu)于基于患者圖譜庫的方法[23-24];U-net 在性能和速度方面優(yōu)于以往的其他分割方法[25-27]。本研究基于U-net 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡算法,以MRI 圖像為基礎,構(gòu)建宮頸癌自動勾畫模型,并與人工勾畫結(jié)果進行比較。本研究結(jié)果顯示,自動勾畫與人工勾畫DSC 值最小為直腸(0.752±0.049),該結(jié)果與Wang 等[25]研究結(jié)果相似??赡苁且驗橹蹦c是個體差異最大的器官,故DSC 值較低。同時本研究中CTV 勾畫也得到了比較理想的結(jié)果,應用構(gòu)建模型自動勾畫ROI 后對CTV及直腸勾畫進行適度修改,膀胱、股骨頭勾畫較少修改后即可應用于MR 自適應放射治療過程,提高工作效率。在精準勾畫ROI 的同時降低患者長時間等待勾畫過程中的出現(xiàn)器官運動導致靶區(qū)變動。有助于個體化精確放療,在提高靶區(qū)照射劑量的同時降低OARs 受量。
本研究存在不足:患者入組樣本量少,且多為局部晚期患者;治療范圍內(nèi)影像學表現(xiàn)有差異,導致ROI勾畫有個體差異。在之后的研究中將在增加入組量的前提下縮小入組期別差異,以期得到更精確的適用模型,針對性應用提高靶區(qū)勾畫效率。研究入組圖像為定位MRI,圖像質(zhì)量及后續(xù)數(shù)據(jù)處理也有待進一步提高。
綜上所述,基于U-net 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的MRI 圖像深度學習算法,自動勾畫效率高,與人工勾畫的差異較小,有助于提高工作效率,協(xié)助MR 引導在線適應性放射治療實施具有較高的臨床應用價值。