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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛的作用機(jī)制

        2022-09-03 10:05:02劉若雅唐耀平熊海風(fēng)王恒生韋夏薇
        關(guān)鍵詞:冠心病分析

        劉若雅,唐耀平,熊海風(fēng),王恒生,韋夏薇

        近年來,我國防治心血管病初有成效,但患病率與死亡率處于上升趨勢,居于首位,占我國居民疾病死亡的40%以上,居死因首位,已成為重大的公共衛(wèi)生問題,故防治心血管病刻不容緩[1]。冠心病是由冠狀動(dòng)脈粥樣硬化導(dǎo)致心肌缺血、缺氧或壞死,引發(fā)的心臟病[2],心絞痛是冠心病常見的臨床類型之一,主要臨床表現(xiàn)為冠狀動(dòng)脈供血不足,心肌急劇缺血、缺氧,導(dǎo)致胸骨后疼痛,有放射痛,兼見胸悶、氣短、汗出,活動(dòng)后癥狀加劇,心絞痛作為常見的慢性病,嚴(yán)重影響人們的生活質(zhì)量。目前我國關(guān)于冠心病的防治策略主要包括冠心病一級、二級預(yù)防和心臟康復(fù)等[3],現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的主要治療方法包括:藥物、介入及外科手術(shù);冠心病主要治療藥物包括抗凝藥、擴(kuò)血管藥、抗血小板藥及調(diào)脂藥[4],雖然效果可控而穩(wěn)定,仍存在許多不足之處。

        冠心病心絞痛在中醫(yī)學(xué)屬于“胸痹”范疇。胸痹之名最早見于《黃帝內(nèi)經(jīng)》[5],張仲景在《金匱要略·胸痹心痛短氣病脈證治》中首次將胸痹作為獨(dú)立疾病提出。中醫(yī)學(xué)認(rèn)為,胸痹病機(jī)多為本虛標(biāo)實(shí),心陰虛與心陽虛為本,痰濁與血瘀等病理產(chǎn)物為標(biāo),病程日久,易引起寒凝、氣滯、血瘀,從而導(dǎo)致胸痹發(fā)作,治療應(yīng)分清標(biāo)本主次,辨證施治,急性期治其標(biāo),緩解期治其本[6]。相關(guān)研究表明,中西醫(yī)結(jié)合治療冠心病心絞痛取得較好療效,可有效降低發(fā)作頻率,縮短發(fā)作時(shí)間[7-9],具有標(biāo)本兼治、不良反應(yīng)少的特點(diǎn)[10]。瓜蔞-薤白藥對古今廣泛運(yùn)用于治療胸痹,具有溫陽寬胸的功效,臨床常用的方劑包括瓜蔞薤白白酒湯、瓜蔞薤白半夏湯、枳實(shí)薤白桂枝湯等。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛的主要活性成分、作用靶點(diǎn)、通路進(jìn)行分析,進(jìn)而預(yù)測該藥對治療冠心病心絞痛的作用機(jī)制,以期為中醫(yī)藥治療冠心病心絞痛提供新思路。

        1 資料與方法

        1.1 瓜蔞、薤白有效化學(xué)成分與作用靶點(diǎn)篩選 通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫分析平臺(TCMSP,https://tcmspw.com/news.php)對瓜蔞、薤白進(jìn)行檢索,檢索出2味中藥的化學(xué)成分,通過定義篩選條件:口服生物利用度(OB)≥30%,類藥性(DL)≥0.18,篩選出所需的化學(xué)成分,之后將得到的化學(xué)成分通過DrugBank數(shù)據(jù)庫(https://www.drugbank.ca/)進(jìn)行靶點(diǎn)預(yù)測,刪除無法預(yù)測到作用靶點(diǎn)的化學(xué)成分,留下有效化學(xué)成分及靶點(diǎn)。從UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)中通過人類(human)及已驗(yàn)證的(reviewed)為篩選條件,獲取靶點(diǎn)對應(yīng)的基因名稱文件,最后通過perl軟件(https://www.perl.org/)將預(yù)測靶點(diǎn)與基因名稱建立聯(lián)系。

        1.2 瓜蔞、薤白有效化學(xué)成分-藥物靶點(diǎn)基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 將篩選出的有效化學(xué)成分以拼音首字母和數(shù)字為組合進(jìn)行編號,將有效化學(xué)成分編號與藥物靶點(diǎn)基因?qū)隒ytoscape軟件(http://www.cytoscape.org/)中,構(gòu)建有效化學(xué)成分-靶點(diǎn)基因網(wǎng)絡(luò),使用網(wǎng)絡(luò)中Network、Analyzer工具進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析,通過設(shè)置節(jié)點(diǎn)度值(Degree)與節(jié)點(diǎn)圖形呈正相關(guān),體現(xiàn)節(jié)點(diǎn)在網(wǎng)絡(luò)中的重要程度。

        1.3 冠心病心絞痛疾病相關(guān)靶點(diǎn)預(yù)測 在GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)中檢索“angina pectoris”,收集與心絞痛相關(guān)的疾病靶點(diǎn)基因,將relevance score作為篩選條件,去除冗雜,篩選出相關(guān)度較高的靶點(diǎn)基因。

        1.4 藥物-疾病共同靶點(diǎn)的確定及蛋白-蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 通過R語言(https://www.r-project.org/)將瓜蔞-薤白作用靶點(diǎn)基因與心絞痛疾病靶點(diǎn)基因取交集并構(gòu)建韋恩(Venn)圖,其中交集靶點(diǎn)基因可能是瓜蔞-薤白治療心絞痛的關(guān)鍵靶點(diǎn)基因。將交集靶點(diǎn)基因?qū)隒ytoscape軟件構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),并篩選出核心網(wǎng)絡(luò)。

        1.5 基因本體(GO)功能富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析 運(yùn)用R語言及DAVID數(shù)據(jù)平臺(https://david.ncifcrf.gov/)將獲得的交集靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,進(jìn)一步說明瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛的潛在作用機(jī)制。

        2 結(jié) 果

        2.1 瓜蔞-薤白化學(xué)成分與對應(yīng)靶點(diǎn)篩選信息 通過TCMSP數(shù)據(jù)庫,按照篩選條件檢索出瓜蔞-薤白化學(xué)成分共22個(gè),其中瓜蔞11個(gè)、薤白11個(gè),采用DrugBank數(shù)據(jù)庫將所得化學(xué)成分進(jìn)行靶點(diǎn)預(yù)測,共獲得205個(gè)相關(guān)靶點(diǎn),其中2項(xiàng)未找到相關(guān)靶點(diǎn)及基因,故去除。得到20個(gè)有效化學(xué)成分,其中瓜蔞9個(gè)、薤白11個(gè)。詳見表1。運(yùn)用1.1方法,找到靶點(diǎn)對應(yīng)的基因名稱并建立聯(lián)系。

        (續(xù)表)

        2.2 瓜蔞-薤白化合物-藥物靶點(diǎn)基因網(wǎng)絡(luò)圖分析 瓜蔞-薤白20個(gè)化學(xué)成分中,共183個(gè)靶點(diǎn)基因,將化學(xué)成分進(jìn)行匯總。其中化學(xué)成分Degree值與關(guān)聯(lián)的靶點(diǎn)基因數(shù)量呈正相關(guān)。運(yùn)用Cytoscape軟件將已編號的化學(xué)成分與靶點(diǎn)基因構(gòu)建成網(wǎng)絡(luò),并運(yùn)用Network Analyzer工具進(jìn)行拓?fù)浞治?,設(shè)定Degree大小與節(jié)點(diǎn)圖形大小呈正相關(guān),體現(xiàn)節(jié)點(diǎn)的重要程度,詳見圖1。通過Cytoscape軟件分析可知,該網(wǎng)絡(luò)共205個(gè)節(jié)點(diǎn)、289個(gè)相互關(guān)系,其中居前5位的化合物分別是槲皮素(quercetin)、柚皮素(naringenin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、香葉木素(diosmetin)、反式香豆酰酪胺(coumaroyltyramine)等。

        圖1 瓜蔞-薤白化合物-藥物靶點(diǎn)基因網(wǎng)絡(luò)圖(兩側(cè)菱形代表有效成分;中間圓形代表靶點(diǎn)基因;Degree值與節(jié)點(diǎn)大小呈正相關(guān))

        2.3 冠心病心絞痛相關(guān)靶點(diǎn)預(yù)測及共同靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將GeneCards數(shù)據(jù)庫中檢索到的冠心病心絞痛相關(guān)靶點(diǎn)基因進(jìn)行篩選后,共獲得1 890個(gè)疾病靶點(diǎn)基因。將1 890個(gè)疾病靶點(diǎn)基因與瓜蔞-薤白藥對作用靶點(diǎn)基因使用R語言取交集,并繪制Venn圖,詳見圖2。共獲得132個(gè)交集基因,其中交集的靶點(diǎn)基因可能是瓜蔞-薤白治療冠心病心絞痛的關(guān)鍵靶點(diǎn)基因,將其導(dǎo)入Cytoscape軟件中構(gòu)建共同靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò),并運(yùn)用CytoNCA軟件篩選出核心網(wǎng)絡(luò),詳見圖3。其中,靶點(diǎn)基因Degree值較高的有:人體生長因子(EGFR)、熱休克蛋白90AA1(HSP90AA1)、雌激素受體1(ESR1)、MYC基因(MYC)等。

        圖2 瓜蔞-薤白藥對與冠心病心絞痛靶點(diǎn)基因Venn圖

        圖3 交集基因PPI及核心網(wǎng)絡(luò)圖

        2.4 交集靶點(diǎn)基因GO功能富集分析 將獲得的交集靶點(diǎn)基因采用DAVID數(shù)據(jù)平臺及R語言進(jìn)行GO功能富集分析,根據(jù)富集的基因數(shù)量及P值大小進(jìn)行升序排列,并進(jìn)行可視化處理,獲得GO功能富集分析氣泡圖,詳見圖4。結(jié)果顯示:生物過程共1 987個(gè)條目,主要富集在對營養(yǎng)水平的反應(yīng)(response to nutrient levels)、對脂多糖的反應(yīng)(response to lipopolysaccharide)、對金屬離子的反應(yīng)(response to metal ion)、對抗生素的反應(yīng)(response to antibiotic)、對細(xì)菌源分子的反應(yīng)(response to molecule of bacterial origin)。說明瓜蔞-薤白可能是通過上述生物過程發(fā)揮治療冠心病心絞痛的作用。

        圖4 GO功能富集分析氣泡圖(富集在GO上基因數(shù)量與圓圈大小呈正相關(guān),GO上基因富集顯著度與紅色程度呈正相關(guān);Y軸顯示GO名稱,X軸顯示關(guān)聯(lián)基因數(shù)量占GO全部基因總數(shù)的比例)

        2.5 交集靶點(diǎn)KEGG通路富集分析 將獲得的交集靶點(diǎn)基因采用DAVID數(shù)據(jù)平臺及R語言進(jìn)行KEGG通路富集分析,根據(jù)富集的基因數(shù)量及顯著性進(jìn)行升序排列,并進(jìn)行可視化處理,獲得KEGG通路富集分析氣泡圖,詳見圖5。結(jié)果顯示:共獲得158條通路,主要富集在糖尿病并發(fā)癥中的晚期糖基化產(chǎn)物(AGE)-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(RAGE)信號通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、腫瘤壞死因子信號通路(TNF signaling pathway)、缺氧誘導(dǎo)因子1(HIF-1)信號通路(HIF-1 signaling pathway)等。

        圖5 KEGG通路富集分析圖(富集在KEGG上基因數(shù)量與圓圈大小呈正相關(guān),KEGG上基因富集顯著度與紅色程度呈正相關(guān);Y軸顯示KEGG名稱,X軸顯示關(guān)聯(lián)基因數(shù)量占KEGG全部基因總數(shù)的比例)

        3 討 論

        瓜蔞、薤白類方是張仲景治療胸痹的經(jīng)典方劑,瓜蔞-薤白作為治療胸痹心痛典型藥對,現(xiàn)代醫(yī)家應(yīng)用廣泛,有研究表明,瓜蔞-薤白藥理作用主要包括降低血液黏度,提高組織缺氧耐受能力,抗血小板聚集,降低血小板活化因子含量,提高血漿一氧化氮水平及對缺血心肌的保護(hù)作用[11]。中藥復(fù)方化學(xué)成分復(fù)雜,關(guān)于瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛的相關(guān)作用機(jī)制研究較少。

        本研究結(jié)果顯示,瓜蔞-薤白藥對有效化學(xué)成分中Degree居前5位的是槲皮素、柚皮素、β-谷甾醇、香葉木素、反式香豆酰酪胺等。其中槲皮素具有調(diào)節(jié)脂肪的分解和合成代謝,達(dá)到降脂目的[12-13],且槲皮素具有影響糖代謝,保護(hù)胰島β細(xì)胞,提高胰島素敏感性等作用,從而顯著降低心血管疾病發(fā)生率[14-16]。柚皮素是一種二氫黃酮類化合物,通過抑制肝臟分泌的載脂蛋白B,降低血液總膽固醇及三酰甘油濃度,達(dá)到降低血脂目的,有效抑制動(dòng)脈粥樣硬化形成[17],柚皮素還可抑制炎癥通路,增強(qiáng)抗氧化,具有抗腫瘤、抗癌等作用[18-19]。β-谷甾醇通過參與氧化應(yīng)激、細(xì)胞凋亡及炎癥反應(yīng)等抑制心肌缺血再灌注損傷[20],還具有降血脂、降膽固醇、抗氧化、抗炎癥、抗腫瘤等作用[21-22]。香葉木素屬于天然黃酮類化合物,既可清除自由基,抑制體內(nèi)活性氧及細(xì)胞丙二醛生成,發(fā)揮抗氧化的作用,同時(shí)具有抗炎、抑菌、抗腫瘤等作用[23]。關(guān)于反式香豆酰酪胺的文獻(xiàn)報(bào)道較少。故瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛可能是槲皮素、柚皮素、β-谷甾醇、香葉木素等化學(xué)成分發(fā)揮重要作用。

        本研究構(gòu)建交集靶點(diǎn)基因PPI網(wǎng)絡(luò)后,對其進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其中Degree值較高的有:EGFR、HSP90AA1、ESR1、MYC等。EGFR是一種受體型酪氨酸激酶,廣泛存在于心臟和血管正常組織,通過活化介導(dǎo)血管緊張素Ⅱ(AngⅡ),誘導(dǎo)AngⅡ進(jìn)行有絲分裂,促進(jìn)心肌增長,EGFR對胚胎期心臟發(fā)育及成熟心臟功能的維持發(fā)揮著重要作用[24-25]。HSP90AA1屬于熱休克蛋白90(HSP90)家族的一員,有研究表明,通過調(diào)節(jié)HSP90與內(nèi)皮型一氧化氮合酶(eNOS)結(jié)合,影響一氧化氮生成,一氧化氮在心血管系統(tǒng)中具有調(diào)節(jié)局部血流、血管緊張程度、血小板聚集的重要作用,HSP90通過影響一氧化氮生成,發(fā)揮治療冠心病心絞痛的作用[26]。ESR1作為雌激素受體(ER)中的一種,通過促進(jìn)eNOS表達(dá),增加血管內(nèi)一氧化氮合成,發(fā)揮舒張血管的作用[27]。MYC基因是一組癌基因,包括C-myc、N-myc、L-myc,其中C-myc在心血管增殖性疾病發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮著重要作用,C-myc通過誘導(dǎo)HIF-1α表達(dá),促進(jìn)血管生成,下調(diào)C-myc及HIF-1α可抑制血管形成,降低心血管增殖性疾病的可能性[28]。

        將交集靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO功能富集分析后,發(fā)現(xiàn)生物過程主要富集在對營養(yǎng)水平的反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)、對金屬離子的響應(yīng)、對抗生素的反應(yīng)、對細(xì)菌源分子的反應(yīng)。內(nèi)皮細(xì)胞障礙是動(dòng)脈粥樣硬化的始動(dòng)因素,脂多糖作為強(qiáng)烈的誘導(dǎo)劑,內(nèi)皮細(xì)胞被危險(xiǎn)因素侵犯時(shí),可激活核因子-κB(NF-κB)信號通路,誘導(dǎo)白細(xì)胞介素(IL)-1β、IL-6、TNF-α等炎性因子產(chǎn)生,這些炎性因子又作用于內(nèi)皮細(xì)胞,造成細(xì)胞損害[29]。根據(jù)上述結(jié)果推測,瓜蔞-薤白藥對可能通過調(diào)控EGFR、HSP90AA1、ESR1、MYC等靶點(diǎn)基因參與對營養(yǎng)水平的反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)、對金屬離子的響應(yīng)、對抗生素的反應(yīng)、對細(xì)菌源分子的反應(yīng)等生物過程,達(dá)到治療冠心病心絞痛的目的。

        本研究結(jié)果顯示,瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛涉及的KEGG通路主要包括糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、TNF信號通路、HIF-1信號通路等。心絞痛是在冠狀動(dòng)脈粥樣硬化基礎(chǔ)上發(fā)生的,與AGE-RAGE結(jié)合在冠狀動(dòng)脈粥樣硬化形成過程中發(fā)揮著重要作用,AGE-RAGE相互結(jié)合可激活二級信使通路,增加血管壁炎性因子及促纖維化生長因子生成,如轉(zhuǎn)化生長因子(TGF)-B、結(jié)締組織生長因子(CTGF)、血小板衍生生長因子(PDGF)、TNF-α、IL-1和IL-6等,從而促進(jìn)動(dòng)脈粥樣硬化形成[30]。增生的血管平滑肌細(xì)胞是冠狀動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的主要組成成分,血管平滑肌細(xì)胞增殖且遷移進(jìn)血管內(nèi)膜是冠狀動(dòng)脈粥樣硬化形成的重要原因。有研究報(bào)道,通過阻斷AGE-RAGE通路可發(fā)揮抑制血管平滑肌細(xì)胞遷移的作用[31]。TNF信號通路具有促進(jìn)細(xì)胞生長、分化、凋亡等生物學(xué)作用,有研究表明,TNF家族的TNF-α可誘導(dǎo)代謝紊亂,從而導(dǎo)致動(dòng)脈粥樣硬化[32]。HIF-1是由HIF-1α和HIF-1β組成,廣泛參與血管生成、組織重塑、血氧利用等過程,保持細(xì)胞在缺氧環(huán)境中的穩(wěn)定,因此,在缺血性心臟病、心力衰竭等疾病中發(fā)揮著重要作用,其亞型HIF-1α通過調(diào)控血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)、血紅素加氧酶(HO-1)等下游基因,達(dá)到保護(hù)心肌、改善心肌缺氧、促進(jìn)血管新生的目的[33]。因此,推測瓜蔞-薤白藥對可能是通過調(diào)節(jié)上述通路起到治療冠心病心絞痛的作用。

        綜上所述,本研究是基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,分析瓜蔞-薤白藥對治療冠心病心絞痛主要是通過槲皮素、柚皮素、β-谷甾醇、香葉木素等多種化合成分,作用于EGFR、HSP90AA1、ESR1、MYC等多種靶點(diǎn)基因,參與對營養(yǎng)水平的反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)、對金屬離子的響應(yīng)、對抗生素的反應(yīng)、對細(xì)菌源分子的反應(yīng)等生物過程,通過調(diào)節(jié)糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路、TNF信號通路、HIF-1信號通路等,產(chǎn)生抗動(dòng)脈粥樣硬化,控制代謝紊亂,保護(hù)心肌,改善細(xì)胞缺氧等功能,達(dá)到治療目的。受限于數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)不完善,本研究結(jié)果有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

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