田茂強 束曉梅 李 娟 雷文婷 陳 靜 余小華 彭龍英
遵義醫(yī)科大學附屬醫(yī)院小兒內科(貴州遵義 563003)
神經(jīng)發(fā)育障礙(neurodevelopmental disorders,NDDs)是一組表現(xiàn)為運動、智力、語言、社交及興趣異常的神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育障礙譜系病,包括自閉癥譜系障礙(autism spectrum disorder,ASD)[1]。此組疾病臨床異質性強,雖多數(shù)患者與遺傳相關,但其基因型-表型關系復雜[2]。目前報道NDDs相關基因變異多數(shù)因涉及突觸轉錄調控、影響突觸傳遞功能而致病[3-5]。SHANK2基因(OMIM* 603290)編碼SH3和多個錨蛋白重復結構蛋白2(SHANK 2),是一種興奮性突觸后支架蛋白,參與神經(jīng)興奮的傳導過程,研究發(fā)現(xiàn)SHANK2與NDDs 相關[1,5-6]。SHANK2相關NDDs臨床表型差異較大,其基因型-表型關系及遺傳模式復雜,發(fā)病率及病例數(shù)不詳,亟待進一步研究明確。本研究對父母分別攜帶SHANK2單位點變異、而下一代攜帶雙等位變異的家系患者的臨床表型及遺傳學進行分析,以提高臨床醫(yī)師對SHANK 2相關譜系病基因型-表型關系的認識。
先證者(II.3)為2歲患兒,女,因發(fā)育落后就診。表現(xiàn)為全面發(fā)育落后,1歲6個月可抬頭,2歲仍不會獨坐,不會講話,可認識親人。圍生期無異常,父母非近親結婚。家系中共4 例患者表現(xiàn)為不同程度的智力、運動及社會功能障礙。系譜圖及相應的臨床表型見圖1。父親(I.1)表現(xiàn)為輕度智力障礙,伴社交功能障礙,但生活自理能力正常,能完成日常農活;母親(I.2)表現(xiàn)為中度智力障礙,伴嚴重語言及社交障礙,但可完成日常家務活動;大姐(II.1)智力運動發(fā)育正常;二姐(II.2)4.5歲就診,表現(xiàn)為自幼嚴重的智力運動發(fā)育障礙,隨訪到5歲,僅可認識親人,不會走路,不會說話。體格檢查(先證者2歲時):身長 83 cm,體重 11 kg,無特殊外觀,反應遲鈍,追聲、物好,無語言表達,心肺腹部無異常,四肢肌張力高,病理征陰性。輔助檢查:血常規(guī)、血生化、血氨、乳酸、丙酮酸正常,葉酸、維生素B12均正常;血、尿串聯(lián)質譜篩查無異常。II.2及II.3Gessel發(fā)育量表評估均提示重度全面發(fā)育落后。2 例患兒頭顱磁共振成像(MRI)無異常。因經(jīng)濟原因父母未進行發(fā)育量表及頭顱MRI 檢查。因家系中有多例類似患者,考慮遺傳性病因可能性大。經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準、患兒監(jiān)護人簽署知情同意書后,采集家系先證者及父母外周血送至北京貝瑞和康醫(yī)學檢驗實驗室有限公司進行全外顯子測序(WES)。WES檢測到SHANK 2基因2 種變異。①SHANK 2剪切位點變異(NM_012309.4,c.2309-2A>C),經(jīng)Sanger驗證顯示母親(I.2)、二姐(II.2)及先證者(II.3)均攜帶該變異,父親及大姐該位點為野生型(圖2A),該變異在數(shù)據(jù)庫中均未被收錄;根據(jù)ACMG 評級[7],該位點變異為致病變異(PVS1+PM2+PP1)。②檢測到父親及先證者SHANK2基因11-16號外顯子雜合缺失(圖3A),經(jīng)qPCR驗證顯示父親(I.1)、二姐(II.2)及先證者(II.3)均攜帶該缺失,見圖3 B 及表1。該家系診斷為SHANK2相關NDDs,診治時間軸見圖4。2例患兒不規(guī)則康復治療中,智力及運動功能緩慢進步中。
圖1 家系系譜圖及患者基因型-表型示意圖
表1 3例患者qPCR檢測結果
圖2 家系成員一代測序峰圖、SHANK2 結構及其基因型-表型關系示意圖
圖3 SHANK2 缺失及qPCR 驗證圖
圖4 家系患者診治時間軸
在個體生命發(fā)育過程中,神經(jīng)元突觸的密度、大小、形狀等在相應基因的調控下處于動態(tài)變化中[8-9]。編碼這些突觸蛋白的基因如SHANK1~3變異均可導致突觸功能異常而引起NDDs。SHANK 2包含SH 3、PDZ 結合域及SAM 結構域(圖2)[9]。SHANK2(NM_012309.4)含25個外顯子、1 849個氨基酸,是SHANK突觸蛋白家族(SHANK1~3)成員之一,在興奮性后突觸密度中起到分子支架的作用[10]。SHANK2在腦中高表達,出生前(胎兒期)及成人期高表達,基因敲除小鼠顯示產后致死、樹突形態(tài)異常及興奮性突觸后電位異常(https://gdap.org.cn/unigene.html?entrez=22941),提示SHANK2對維持中樞神經(jīng)系統(tǒng)的正常發(fā)育及功能起至關重要的作用。
SHANK 2基因型-表型關系復雜。在鼠的研究中發(fā)現(xiàn),編碼SHANK家族蛋白(SHANK1~3)基因的變異導致與人類NDDs 相似表型,包括重復刻板運動、社會行為改變及焦慮癥狀[11]。臨床研究發(fā)現(xiàn),SHANK2與神經(jīng)發(fā)育障礙相關,包括ASD易感17型(OMIM# 613436),遺傳模式為常染色體顯性遺傳伴不完全外顯[5]。SHANK 2復雜的基因型-表型關系可能與單基因的變異類型、修飾基因或多基因遺傳相關。本研究家系中,未攜帶SHANK 2變異的姐姐表型正常,攜帶缺失變異的父親表現(xiàn)為輕度社交障礙,攜帶內含變異的母親表現(xiàn)為中度智力障礙及社交障礙,而攜帶雙等位基因變異的2 個女兒均表現(xiàn)為嚴重的運動、認知發(fā)育障礙,提示SHANK 2不同變異導致SHANK 2 蛋白劑量的變化可能是該家系患者表型差異的主要原因,也提示SHANK 2譜系病臨床異質性可能與變異導致SHANK 2 劑量變化相關。
Zhang等[12]在關于先天性脊柱側彎2家系研究發(fā)現(xiàn)父親及2個兒子均攜帶TBX6缺失變異,但僅其中一個兒子表現(xiàn)為脊柱側彎,即攜帶變異的個體呈現(xiàn)不完全外顯現(xiàn)象。進一步研究發(fā)現(xiàn),發(fā)病者還攜帶來自母親TBX6的多態(tài)性位點(T-C-A)。該研究認為TBX 6缺失變異和多態(tài)性位點共同導致先天性脊柱側彎,呈非典型隱性遺傳模式[12]。該現(xiàn)象在RBM8A相關血小板減少癥的研究也曾被報道[13]。SHANK2是ASD的易感基因,大量研究發(fā)現(xiàn)某些攜帶變異者也表現(xiàn)為不完全外顯的現(xiàn)象[5],提示可能個體對于該基因劑量依賴較低。當變異導致SHANK2輕微下降時則不出現(xiàn)表型或出現(xiàn)較輕微表型,而嚴重變異或雙等位基因變異則導致SHANK2蛋白顯著下降而出現(xiàn)較重表型。推測本研究患者中差異性表型出現(xiàn)的原因可能為:①父親攜帶雜合外顯子缺失變異導致SHANK2截短,機體存在截短的SHANK2及50%功能正常的SHANK2,患者為輕表型(圖2);②母親攜帶內含子變異(c.2309-2A>C),該變異導致可變剪切,可能導致外顯跳躍(缺失)、外顯子延長及或外顯子部分缺失等,與缺失相比,母親剪切位點變異可能導致體內存在大量無功能的變異型蛋白,由于顯性負效應機制,大量變異型蛋白可能與野生型蛋白SHANK2競爭性的結合靶蛋白,影響殘存正常蛋白功能,從而導致比父親較重的表型(圖2);③2個女兒均攜帶雙等位基因變異,則體內僅存在變異型SHANK 2,患兒則表現(xiàn)為重型NDDs(圖2)。本研究家系可能為進一步關于SHANK2致病機制研究提供參考,但仍需在今后通過直接的功能實驗或積累更多類似病例進行證實。
ASD 是一類以廣泛的社交、言語交流障礙、刻板行為及興趣狹隘為核心癥狀的綜合征[14-15]。通過患病的一致率研究發(fā)現(xiàn)同卵雙生子為30%~99%,異卵雙生子為0~65%,說明ASD病因與遺傳因素高度相關[2]。近來發(fā)表在Cell雜志的研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了三類變異與ASD 相關,即在多基因變異的基礎上,罕見變異及新生變異是ASD 發(fā)生的主要因素[14]。Caumes 等[16]2020 年報道2 例ASD 患者,并總結了已報道的9 例SHANK 2基因變異的患兒,11 例患者均為De novo變異,其中10 例患者伴典型ASD 癥狀,提示De novo變異多見于對于SHANK2劑量影響較大的變異,常導致ASD,而遺傳性變異可能對SHANK2蛋白劑量影響相對較小而導致不同程度智力障礙。本研究中SHANK 2單等位基因和/或雙等位基因變異出現(xiàn)的表型異質性現(xiàn)象可能為ASD或智力障礙的研究提供依據(jù),對于表型差異較大的家系患者,除考慮表觀遺傳或多基因變異影響外,還應該考慮雙等位基因特殊變異(拷貝數(shù)變異,多態(tài)性等)導致不典型隱性遺傳可能。
總之,SHANK 2相關NDDs 嚴重程度可能與SHANK 2 量依賴相關,此種量依賴現(xiàn)象也為理解SHANK 2相關NDDs 基因型-表型關系提供幫助。對于臨床表現(xiàn)差異大、不完全外顯的家族患者,需進一步分析患者中可能存在該基因的其他類型變異。