黃艷云 雷 茗 譚 曇 劉純宏 王 艷 韋葉生 (百色市人民醫(yī)院檢驗科,百色 533000)
缺血性腦卒中(ischemic stroke,IS)是一種嚴重威脅人類健康的常見腦血管疾病。其缺乏有效的早期診斷或者早期預警方法、治療時間窗短、預后差等問題,給臨床診療帶來了重大難題。尋找一種特異性強、敏感性高和穩(wěn)定性好的血清標志物用于IS 的早期診斷、預后評估及療效監(jiān)測,成為全世界腦血管疾病領域研究的熱點[1]。miR-107 即是目前備受關注的熱點之一。近幾年的研究發(fā)現(xiàn),miR-107 作為轉(zhuǎn)錄后基因沉默的重要調(diào)節(jié)因子,在IS 患者的血漿或動物模型腦組織中異常表達,并通過多種作用機制參與IS 的發(fā)生、發(fā)展及預后,有望成為IS 早期診斷、預后判斷的潛在性生物標記物和治療靶標[2-5]。然而,miR-107 在 IS 這一疾病中異常表達的分子機制尚不清楚。大量研究已證實,miRNA 單核苷酸多態(tài)性與人類許多疾病的遺傳易感性相關,并影響miRNA 在疾病中的表達[6-7]。已有多項研究顯示,多種miRNA 單核苷酸多態(tài)性與IS 易感性相關,并影響自身在IS 中的表達[8-9]。有研究報道,miR-107 基因rs2296616 位點多態(tài)性與中國漢族人群胃腺癌的易感性和預后相關,并影響miR-107 在胃腺癌組織中的表達[10]。然而,截至目前,國內(nèi)外尚未查閱到有關miR-107 基因rs2296616 位點多態(tài)性與IS遺傳易感性方面的文獻報道,rs2296616位點多態(tài)性是否影響miR-107在IS中的表達調(diào)控也尚不清楚。因此,本課題組選擇miR-107 基因中具有多態(tài)性且已經(jīng)被報道與疾病相關的rs2296616 位點進行研究。本研究將在廣西人群中探討miR-107基因rs2296616 位點多態(tài)性與IS 的遺傳易感性,并分析rs2296616 位點多態(tài)性與miR-107 表達的相關性,以期為廣西人群篩選出IS 的遺傳易感基因及其基因型,從而對高危人群進行早期預防和早期干預,降低廣西人群IS的發(fā)病率。
1.1 資料 收集 2017 年 10 月至 2018 年 11 月右江民族醫(yī)學院附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科住院確診的IS 患者349 例。IS 診斷標準依據(jù)中華醫(yī)學會神經(jīng)病學分會制訂的《中國急性缺血性腦卒中診治指南2014》。經(jīng)臨床、實驗室及射影像學等檢查綜合確立IS 診斷。將同期在右江民族醫(yī)學院附屬醫(yī)院體檢中心按性別、年齡匹配原則收集的372 例健康體檢者作為對照組,均體健且無心腦血管疾病史。所納入的研究對象均已排除腦出血、顱內(nèi)感染、各系統(tǒng)惡性腫瘤、血液病、自身免疫性疾病、感染性疾病以及嚴重的肝臟、腎臟、心臟等疾病。所有研究對象均為無血緣關系的廣西人群。本研究方案是在右江民族醫(yī)學院附屬醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準下實施,研究對象均已簽署知情同意書。
1.2 方法
1.2.1 標本采集 采集所有受試者清晨空腹靜脈血 3~5 ml,以 EDTA-K2抗凝,用于基因組 DNA 抽提和單個核細胞的分離。另抽取3~5 ml 靜脈血,離心分離血清,用于血脂檢測。所有樣本保存于?70 ℃冰箱備用。
1.2.2 基因組DNA 提取和分析 統(tǒng)一使用深圳亞能生物技術(shù)有限公司提供的全血DNA 快速提取試劑盒從白細胞中提取基因組DNA(嚴格按照說明書操作)。采用1%瓊脂糖對提取完成后的DNA 樣本(1 μl)進行電泳,以檢測其質(zhì)量和估計其濃度。根據(jù)估計濃度將DNA樣本稀釋到工作濃度5~10 ng/μl,沒有明顯DNA條帶的樣本則不稀釋。
1.2.3 引物的設計與合成 通過NCBI 查找包含rs2296616 位點的適宜長度DNA 片段,將查找到的DNA 序列輸入Prime 3.0 軟件進行引物設計,得到的引物序列委托上海天昊生物科技有限公司合成。rs2296616 位點正向引物序列為5'-ACACAGCTTTCACCGGGTTGAG-3';反向引物序列為5'-TGCCTGAGGACGATTTTGAACA-3',延伸引物序列為5'-TTTTTTTTTTTGGCTCCATTGCTCGGATGTG-3'。
1.2.4 多重SNa Pshot 技術(shù)檢測rs2296616 位點多態(tài)性 PCR 擴增反應體系為正反向引物各1.0 μl,1×GC-Ⅰ緩沖液(TaKaRa)2.0 μl,dNTPs 2 μl,1 U TaqDNA 聚合酶 1 μl,DNA 模板 1 μl,加雙蒸水至總體積 20 μl。PCR 產(chǎn)物采用 2 U 的核酸外切酶Ⅰ(EXOⅠ,Epicentre)和5 U 蝦堿基磷酸酶(SAP,Pro?mega)純化后使用 SNaPshotMultiplex Kit(ABI)進行延伸反應。延伸產(chǎn)物用1 U SAP 純化后使用ABI3730X測序儀進行測序,以保證實驗結(jié)果的準確性。使用Gene-Mapper 4.1(Applied Biosystems Co.Ltd.,USA)分析原始測序數(shù)據(jù)。
1.2.5 外周血單個核細胞中miR-107 表達水平的檢測 采用Trizol 法提取外周血單個核細胞的總RNA,提取產(chǎn)物置紫外分光光度計260 nm 和280 nm處檢測吸光度值(OD),計算OD260/OD280以評估RNA樣品的純度,若比值為1.8~2.0 則RNA 樣品純度符合實驗要求。采用寶生物工程(大連)有限公司生產(chǎn)的試劑盒進行基因mRNA 表達量的檢測。通過反轉(zhuǎn)錄試劑盒(miR-X miRNA First-Strand Synthesis Kit,TaKaRa)將 RNA 合成為 cDNA,最后按照 cDNA 2 μl、SYBR Advantage Premix 12.5 μl、正向和反向引物各0.5 μl、ROX Dye 0.5 μl、去離子水9 μl 的體系進行PCR 反應。根據(jù)相對定量分析——2?ΔΔCt法,比較IS組和對照組外周血單個核細胞中miR-107的表達差異,并分析rs2296616 位點多態(tài)性對基因表達的影響。
1.3 統(tǒng)計學分析 采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計分析。在IS 組和對照組中采用χ2檢驗分析rs2296616 的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。計數(shù)資料應用χ2檢驗,計量資料需先進行正態(tài)性檢驗,服從正態(tài)分布則應用t檢驗或方差分析,不服從正態(tài)分布則應用秩和檢驗,并以表示。病例組和對照組間基因型、等位基因以及遺傳模型的比較采用二元Logistic 回歸分析,以優(yōu)勢比(OR)和 95% 可 信 區(qū) 間(CI)評 估 miR-107 基 因rs2296616 位點多態(tài)性與IS 易感性的相關性,以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學意義。
2.1 兩組研究對象相關臨床資料的比較 本研究共納入研究對象721例,其中IS組349例,男224例,女 125 例,年齡(61.5±12.2)歲,對照組 372 例,男240例,女132例,年齡(59.9±13.4)歲。兩組研究對象的平均年齡和性別構(gòu)成比較差異無統(tǒng)計學意義(分別為P=0.098 和P=0.926)。IS 組患者的血清總膽固醇(TCH)、高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)、極低密度脂蛋白膽固醇(VLDL-C)以及甘油三酯(TG)水平與對照組比較,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.001),見表1。
表1 研究對象的一般情況和臨床生化指標的比較Tab.1 Comparison of general conditions and clinical bio?chemical indexes of study subjects
2.2 miR-107 基因rs2296616 多態(tài)性的分型結(jié)果rs2296616 在病例組中存在 AA、AG 和 GG 三種基因型,在對照組中存在AA 和AG 兩種基因型,DNA 測序法的檢測結(jié)果進一步驗證了SNaPshot SNP 分型檢測的結(jié)果,測序結(jié)果如圖1所示。
圖1 miR-107基因rs2296616位點測序圖Fig.1 Sequencing map of miR-107 gene rs2296616
2.3 miR-107 基因rs2296616 多態(tài)性在兩組中的遺傳平衡評估 在IS組和對照組中,rs2296616位點的基因型分布均符合Hardy-Weinberg 平衡定律(P>0.05),說明所選研究樣本來自同一孟德爾群體,能夠反映rs2296616 在目標人群中的分布情況,適合進行遺傳學統(tǒng)計分析。結(jié)果見表2。
表2 rs2296616 多態(tài)性在兩組中的Hardy-Weinberg 遺傳平衡檢驗Tab.2 Hardy-Weinberg genetic balance test of rs2296616 polymorphism in two groups
2.4 miR-107 基因rs2296616 多態(tài)性在兩組不同性別間的比較 結(jié)果如表3 所示,rs2296616 位點的基因型和等位基因頻率分布在IS 組和對照組男、女不同性別間的比較,差異均無統(tǒng)計學意義。
表3 rs2296616多態(tài)性在IS組和對照組性別間的比較[例(%)]Tab.3 Comparison of rs2296616 polymorphisms between genders in IS group and control group[n(%)]
2.5 miR-107 基因 rs2296616 多態(tài)性與 IS 的遺傳易感性分析 以AA 基因型為參照,rs2296616 位點的AG 和GG 基因型在IS 組和對照組中的分布差異均無統(tǒng)計學意義;以A 等位基因為參照,G 等位基因在兩組中的分布差異也無統(tǒng)計學意義;在顯性模型、隱性模型和超顯性模型中也均未發(fā)現(xiàn)rs2296616 位點的基因型頻率在兩組間的分布差異有統(tǒng)計學意義。納入IS 的常見風險因素如年齡、性別、高血壓、糖尿病、TCH、HDL-C、LDL-C、VLDL-C 及TG 進行二元Logistic 回歸校正計算后,rs2296616 位點基因型和遺傳模型的頻率在IS 組和對照組中的分布差異仍無統(tǒng)計學意義,見表4。
表4 miR-107基因rs2296616多態(tài)性與IS的遺傳易感性分析Tab.4 Genetic susceptibility analysis between miR-107 gene rs2296616 polymorphism and IS
2.6 miR-107 表達水平與rs2296616 多態(tài)性的相關性分析 基因表達檢測結(jié)果顯示,miR-107 在IS 組患者外周血單個核細胞中的表達水平是對照組的(2.03±1.14)倍,顯著高于對照組,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.001),如圖 2A 所示。但在 IS 組中,rs2296616 位點AA 基因型與AG/GG 基因型之間miR-107 表達水平的比較,差異無統(tǒng)計學意義,如圖2B所示。
圖2 miR-107 在IS 組和對照組中的表達及其與rs2296616多態(tài)性的關系Fig.2 Expression of miR-107 in IS group and control group and its relationship with rs2296616 polymor?phism
IS 是一種發(fā)病機制非常復雜的多發(fā)性腦血管疾病。盡管人類對IS 發(fā)病機制的探索從未停止,但其病因?qū)W至今始終未被完全闡明?,F(xiàn)階段的觀點普遍認為傳統(tǒng)風險因素(如高血壓、糖尿病、動脈粥樣硬化、吸煙和飲酒等)是IS 的外因,遺傳因素是IS的內(nèi)因[11]。外因影響內(nèi)因,內(nèi)因通過外因起作用。單獨或者雙重暴露于傳統(tǒng)風險因素和遺傳因素下的高危人群發(fā)生IS 的風險要明顯高于普通人群。當前,針對傳統(tǒng)風險因素的預防和早期干預使得IS的防治工作取得了一定的成效。但對遺傳因素在IS 中作用機制的了解還只是冰山一角,限制了遺傳因素在IS 防治工作中的應用。因此,開展基因與IS的相關性研究對推動IS的防治工作具有重要意義。
眾所周知,動脈粥樣硬化是IS 發(fā)生的高危風險因素,而高脂血癥是動脈粥樣硬化的重要誘發(fā)因素。高脂血癥一般以成人空腹12~14 h 血清TG 超過1.70 mmol/L、TCH超過5.72 mmol/L為診斷標準。大量流行病學調(diào)查證明,高TG 是動脈粥樣硬化的獨立危險因素[12-13];膽固醇升高,尤其是血漿LDL、VLDL 水平持續(xù)升高與動脈粥樣硬化的發(fā)病率呈正相關[14-15]。相反,HDL 可通過膽固醇逆向轉(zhuǎn)運機制清除動脈壁的膽固醇,將其轉(zhuǎn)運至肝代謝并排出體外[16]。此外,HDL 有抗氧化作用,防止LDL 氧化,并可通過競爭性抑制阻抑LDL 與內(nèi)皮細胞的受體結(jié)合而減少其攝取,因此,HDL 有抗動脈粥樣硬化作用[17]。由此可見,血脂水平與IS 的發(fā)生息息相關。本研究也觀察到,IS 組患者的血清TCH、TG、LDL-C和VLDL-C 水平顯著高于對照組,HDL-C 水平顯著低于對照組,提示血脂水平與IS 的風險相關,與IS的許多既往研究結(jié)果是一致的[11,18]。因此,檢測并比較病例對照組的血脂水平,將有助于在分析基因多態(tài)性與IS 易感性的相關性時校正其對統(tǒng)計結(jié)果的影響。
越來越多的證據(jù)表明,基因多態(tài)性與IS 的易感性相關,并已有項目應用于臨床中,例如,亞甲基四氫葉酸還原酶基因多態(tài)性用于IS 易感性的預測[19-20]。早期關于基因多態(tài)性與IS的相關性研究主要集中在編碼蛋白的基因上。隨著對非編碼miRNA的發(fā)現(xiàn)以及人們對其結(jié)構(gòu)和功能的深入認識,人們發(fā)現(xiàn)miRNA 單核苷酸多態(tài)性影響成熟miRNA 的表達,并影響自身結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定性,進而對靶mRNA 的轉(zhuǎn)錄和翻譯產(chǎn)生全局性影響,導致人類許多疾病的發(fā)生[6-7]。miRNA 單核苷酸多態(tài)性與 IS 的相關性研究逐漸受到重視,成為IS 新的診療方向。目前,已有多種miRNA 單核苷酸多態(tài)性被檢測出與地域性IS的遺傳易感性有關[9,21-22]。在不同地區(qū)、種族人群中探討同一miRNA 基因多態(tài)性與IS 易感性的關系或許能為我們解答為何IS 的發(fā)病率呈現(xiàn)地域性、種族性差異的原因[23],或許還能發(fā)現(xiàn)miRNAs在IS 中異常表達的分子機制。本課題組前期的研究結(jié)果顯示,miR-107 基因rs2296616 位點多態(tài)性在不同種族、地區(qū)人群間存在明顯的差異[24]。本研究分析了廣西人群miR-107 基因rs2296616 位點多態(tài)性與IS 發(fā)病的相關性,發(fā)現(xiàn)無論是否校正混雜因素的影響,這個多態(tài)性位點的基因型、等位基因、顯性模型(GG+AGvsAA)、隱性模型(GGvsAA+AG)和超顯性模型(GG+AAvsAG)在病例對照組中的分布差異無統(tǒng)計學意義,提示廣西人群miR-107 基因rs2296616位點多態(tài)性與IS發(fā)病可能不存在相關性。
已有多項研究顯示,miR-107 有望成為IS 早期診斷、預后判斷的潛在性新型生物學標志物和治療靶點。有研究報道,與健康對照組相比,IS 組患者血漿中的miR-107 水平顯著提高了2.78 倍,并與卒中嚴重程度呈正相關,提示循環(huán)中的miR-107 可作為潛在的新型非侵入性生物標記物用于IS 的診斷[2];另有研究報道,miR-107 水平在局灶性腦缺血/再灌注損傷大鼠的腦組織和血漿中升高,并通過抑制谷氨酸轉(zhuǎn)運體-1 表達而增加缺血性中風后谷氨酸的累積,其血漿水平可作為監(jiān)測IS 患者興奮性毒性的新型生物標志物[4];LI 等[5]發(fā)現(xiàn),miR-107 在大鼠永久性中腦動脈閉塞后的缺血邊界區(qū)中強烈表達,并通過下調(diào)Dicer-1 促進中風后的血管生成,提示miR-107可作為中風的治療靶標。本次研究結(jié)果也顯示,IS 組患者外周血單個核細胞中miR-107 表達水平是對照組的(2.03±1.14)倍,顯著高于對照組,差異具有統(tǒng)計學意義。本研究結(jié)果與前述報道的研究結(jié)果一致,進一步支持miR-107 作為IS 診斷的潛在性新型生物標志物。然而,在分析rs2296616多態(tài)性與miR-107 表達水平之間的相關性時發(fā)現(xiàn),rs2296616 多態(tài)性與IS 患者外周血單個核細胞中miR-107 的表達水平不存在相關性,提示rs2296616多態(tài)性對miR-107 的表達可能不具有調(diào)節(jié)作用,miR-107 在IS 中異常表達可能是其他發(fā)病機制所引起。
綜上所述,本研究結(jié)果進一步證實miR-107 的表達水平在IS 患者外周血單個核細胞中呈升高狀態(tài),支持miR-107 作為IS 診斷的潛在性新型生物學標志物。但是,miR-107 基因rs2296616 位點多態(tài)性與IS 的發(fā)生可能不存在關聯(lián)性,且對miR-107 的表達也可能不具有調(diào)節(jié)作用。當然,由于樣本量相對較小、研究對象來源單一(選擇偏倚不可避免)、未對IS 患者進行亞型分組以及缺乏基因與傳統(tǒng)風險因素交互作用的研究等,使本研究存在一定的局限性。此外,由于基因多態(tài)性在不同種族和地理人群間存在差異性[25],本研究對象僅局限于中國廣西地區(qū)人群,該結(jié)果可能不適用于其他種族人群,而且目前國內(nèi)外尚未發(fā)現(xiàn)其他地區(qū)人群miR-107基因多態(tài)性與IS 遺傳易感性研究的文獻報道,缺乏多地區(qū)人群的數(shù)據(jù)比對,miR-107 基因多態(tài)性是否與IS 的發(fā)病存在相關性仍需要更多地區(qū)、更大數(shù)據(jù)和更多方面的進一步研究來求證。