馬艷平,郝 樂(lè),馮國(guó)清,梁志凌,馬江耀,柯 浩,劉振興
廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物衛(wèi)生研究所/廣東省畜禽疫病防治研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸用藥物與診斷技術(shù)廣東科學(xué)觀測(cè)實(shí)驗(yàn)站,廣東 廣州 510640
無(wú)乳鏈球菌 (Streptococcus agalactiae) 屬于 B 族鏈球菌 (GBS),宿主范圍廣泛,能感染人類、哺乳動(dòng)物、爬行動(dòng)物和魚類等,對(duì)全球公共衛(wèi)生和人體健康造成了嚴(yán)重的安全隱患[1-2]。中國(guó)是羅非魚(Oreochromissp.) 養(yǎng)殖大國(guó),也是鏈球菌病高流行地區(qū),其發(fā)病率和死亡率居高不下,居羅非魚傳染病之首,因抗生素濫用或過(guò)量添加,造成耐藥率也越來(lái)越高[3-5]。
近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),在放線桿菌門和厚壁菌門等革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌中存在一種新型分泌系統(tǒng),即VII型分泌系統(tǒng) (Type 7 secretion system, T7SS)[6-8]。VII型分泌系統(tǒng)由多種組分構(gòu)成,分泌早期分泌性抗原靶 6 (Early secretory antigenic target 6, ESAT6)和培養(yǎng)濾液蛋白 10 (Culture filtrate protein 10,CFP10)兩種免疫原性胞外蛋白。VII型分泌系統(tǒng)具有改變細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、促進(jìn)細(xì)菌從巨噬細(xì)胞吞噬體逃逸、抑制吞噬體溶酶體融合、影響細(xì)胞凋亡及裂解細(xì)胞等生物學(xué)功能,與致病性密切相關(guān)[9-10]。分枝桿菌VII型分泌系統(tǒng)與菌株毒力密切相關(guān),正是由于ESAT6蛋白的缺失,才使得牛型結(jié)核菌毒力缺失,成為卡介苗。目前為止,眾多研究聚焦結(jié)核分枝桿菌 (Mycobacterium tuberculosis) VII型分泌系統(tǒng),ESAT-6基因的缺失會(huì)導(dǎo)致結(jié)核分枝桿菌喪失分泌其他ESX-1分泌蛋白的能力,甚至喪失結(jié)核分枝桿菌致病性[9]。金黃色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus)缺失ESAT6和CFP-10編碼基因,造成金黃色葡萄球菌毒力下降,影響了該菌的持續(xù)感染[11]。
無(wú)乳鏈球菌研究顯示,ESAT6蛋白以同源二聚體形式發(fā)揮作用[12-13]。VII型分泌系統(tǒng)單個(gè)基因各自編碼具有特定功能的蛋白質(zhì),決定著ESAT6/CFP10及其毒力蛋白分泌轉(zhuǎn)運(yùn),并與細(xì)菌的毒力和致病機(jī)制存在重要聯(lián)系[8,14-17],因此對(duì)VII型分泌系統(tǒng)的研究有助于了解無(wú)乳鏈球菌毒力蛋白分泌機(jī)制,有助于闡明無(wú)乳鏈球菌的生存、增殖和擴(kuò)散的分子基礎(chǔ),更可為尋找抗無(wú)乳鏈球菌基因蛋白藥物的作用靶點(diǎn)提供關(guān)鍵性線索,進(jìn)而為從根本上控制無(wú)乳鏈球菌病提供可能性。前期研究對(duì)無(wú)乳鏈球菌的基因組檢索發(fā)現(xiàn)了與VII型/ESAT-6分泌系統(tǒng)同源性較高的基因簇,由11個(gè)基因組成的基因簇構(gòu)成 (esaABCDEF、essABC、esxAB)[18-20]。分子生物學(xué)顯示essA、essB、essC基因編碼膜蛋白,但是其功能研究還未見(jiàn)文獻(xiàn)報(bào)道。
筆者課題組前期擴(kuò)增到了羅非魚無(wú)乳鏈球菌essA、essB、essC全長(zhǎng)基因,生物信息學(xué)分析顯示essA、essB基因編碼膜蛋白,essC基因編碼蛋白含有典型的FtsL-Spo III E結(jié)構(gòu),前期研究重組表達(dá)了essA、essB、essC蛋白,免疫羅非魚后,對(duì)無(wú)乳鏈球菌的相對(duì)免疫保護(hù)率分別為82.57%、85.29%、91.60%,是良好的免疫原性蛋白[21]。在此基礎(chǔ)上,本研究以羅非魚源無(wú)乳鏈球菌致病株GDZX1為研究對(duì)象,利用熱敏性自殺載體pSET4S構(gòu)建基因缺失突變株ΔessA、ΔessB、ΔessC,并對(duì)其生物學(xué)特性進(jìn)行分析, 以揭示無(wú)乳鏈球菌essA、essB、essC對(duì)ESAT6蛋白mRNA表達(dá)水平、對(duì)菌株致病性的影響,以期為無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)編碼基因功能研究提供理論數(shù)據(jù)。
野生型無(wú)乳鏈球菌強(qiáng)毒力菌株GDZX1 (Wild type,Serotype Ia),由廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物衛(wèi)生研究所水產(chǎn)病害研究室分離并保存。溫敏型自殺質(zhì)粒pSET4S和pSET5S由日本國(guó)立動(dòng)物衛(wèi)生研究所Daisuke Takamatsu博士惠贈(zèng)。試驗(yàn)用羅非魚購(gòu)自廣東省羅非魚良種場(chǎng),體質(zhì)量約為10 g,實(shí)驗(yàn)前在室內(nèi)玻璃缸暫養(yǎng)2周,隨機(jī)抽檢5尾,做病原分離試驗(yàn),確保試驗(yàn)用魚不攜帶無(wú)乳鏈球菌病原。隨機(jī)分為13組 (12個(gè)攻毒組和1個(gè)對(duì)照組)。保持溶解氧>5.0 mg·L?1,每天換水,保持水質(zhì)良好。試驗(yàn)前每天飽飼2次。
運(yùn)用 Oligo 7.0 和 Primer 6.0 軟件設(shè)計(jì)引物,試驗(yàn)用引物序列見(jiàn)表1,由北京擎科生物科技有限公司合成。
表1 試驗(yàn)用引物Table 1 Primers in this study
1.3.1essA基因敲除重組載體的構(gòu)建
以提取的無(wú)乳鏈球菌GDZX1基因組DNA為模板,essAup-FBamHI/essAup-R引物對(duì)擴(kuò)增essA基因上游同源臂,essAdown-F/essAdown-REcoRI引物對(duì)擴(kuò)增essA基因下游同源臂,反應(yīng)程序?yàn)?8 ℃預(yù)變性 5 min;98 ℃ 10 s,58 ℃ 10 s,72 ℃ 15 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min。以pSET5S質(zhì)粒為模板,Cat(essA)-F/Cat-R引物對(duì)擴(kuò)增氯霉素表達(dá)框(Cat),反應(yīng)程序?yàn)椋?8 ℃ 預(yù)變性 5 min;98 ℃10 s,56 ℃ 10 s,72 ℃ 30 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 延伸 5 min。
PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,將擴(kuò)增的片段切膠純化,等體積 (8 μL) 混合,進(jìn)行第 1輪融合PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)椋?8 ℃預(yù)變性5 min;98℃ 15 s,62 ℃ 15 s,72 ℃ 90 s,16 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min。然后以第1輪融合后的PCR產(chǎn)物為模板,以essAup-FBamHI/essAdown-REcoRI為正、反向引物,進(jìn)行第2輪融合PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?8 ℃ 預(yù)變性 5 min;98 ℃ 15 s,62 ℃ 15 s,72 ℃90 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 延伸 5 min,PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析。
符合預(yù)期的片段切膠純化,BamHI和EcoRI雙酶切,與同樣雙酶切后的線性化載體pSET4s連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,然后將培養(yǎng)物涂布在含有氯霉素 (25 μg·mL?1) 和壯觀霉素 (50 μg·mL?1) 的 LB 固體平板上,37 ℃ 倒置培養(yǎng)過(guò)夜,挑取單克隆,利用essAup-FBamHI/essAdown-REcoRI引物對(duì)進(jìn)行PCR鑒定,反應(yīng)程序?yàn)?98 ℃ 預(yù)變性 5 min;98 ℃ 15 s,60 ℃ 15 s,72 ℃90 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 延伸 5 min,PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析,鑒定后的陽(yáng)性質(zhì)粒送北京擎科生物科技有限公司測(cè)序。
1.3.2essB基因敲除重組載體的構(gòu)建
以提取的無(wú)乳鏈球菌GDZX1基因組DNA為模板,essBup-FBamHI/essBup-R引物對(duì)擴(kuò)增essB基因上游同源臂,essBdown-F/essBdown-REcoRI引物對(duì)擴(kuò)增essB基因下游同源臂,反應(yīng)程序?yàn)椋?8 ℃預(yù)變性 5 min;98 ℃ 10 s,58 ℃ 10 s,72 ℃ 15 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 5 min。按 1.3.1Cat擴(kuò)增程序,Cat(essB)-F/Cat-R擴(kuò)增Cat表達(dá)框。按1.3.1融合PCR程序,進(jìn)行第1輪融合PCR擴(kuò)增,以essBup-FBamHI/essBdown-REcoRI為正、反向引物,進(jìn)行第2輪融合PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析。并按1.3.1重組載體構(gòu)建步驟,構(gòu)建并鑒定重組質(zhì)粒。
1.3.3essC基因敲除重組載體的構(gòu)建
以提取的無(wú)乳鏈球菌GDZX1基因組DNA為模板,essCup-FSalI/essCup-R引物對(duì)擴(kuò)增essC基因上游同源臂,essCdown-F/essCdown-REcoRI引物對(duì)擴(kuò)增essC基因下游同源臂,反應(yīng)程序?yàn)?8 ℃預(yù)變性 5 min;98 ℃ 10 s,56 ℃ 10 s,72 ℃ 30 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 5 min。按 1.3.1Cat擴(kuò)增程序,Cat(essC)-F/Cat-R擴(kuò)增Cat表達(dá)框。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,將擴(kuò)增的片段切膠純化,等體積 (8 μL) 混合,進(jìn)行第1輪融合PCR擴(kuò)增。反應(yīng)程序?yàn)?8 ℃預(yù)變性 5 min;98 ℃ 15 s,48 ℃ 15 s,72 ℃ 90 s,16個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min。然后以第1輪融合PCR產(chǎn)物為模板,以essCup-FSalI/essCdown-REcoRI為正、反向引物,進(jìn)行第2輪融合PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?98 ℃ 預(yù)變性 5 min;98 ℃ 15 s,60 ℃ 15 s,72 ℃ 90 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 延伸 5 min,PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析。并按1.3.1重組載體構(gòu)建步驟,構(gòu)建并鑒定重組質(zhì)粒。
參照Takamatsu等[22]的方法,制備GDZX1株電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞。分別取 5 μL pSET4S-ΔessA、pSET4S-ΔessB、pSET4S-ΔessC陽(yáng)性質(zhì)粒分別加入到100 μL GDZX1電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞中,輕微混勻后將混合物加入0.2 cm電轉(zhuǎn)杯內(nèi),冰浴10 min,在 2.25 kV·cm?1,200 Ω、25 μF 電轉(zhuǎn)參數(shù)下電擊,迅速加入 1 mL SOC 培養(yǎng)基,30 ℃,160 rpm 振蕩搖動(dòng) 3~4 h;隨后將 300 μL 菌液涂布于 THB Spc+Cm+平板,在30 ℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)48 h。挑取小菌落至 Cm+THB 培養(yǎng)基上,30 ℃ 培養(yǎng) 6~7 h,轉(zhuǎn) 37 ℃培養(yǎng)24 h。轉(zhuǎn)移菌落分別至Cm+抗性和Spc+抗性的THB培養(yǎng)基中,繼續(xù)培養(yǎng)。其中在Cm+抗性培養(yǎng)基能生長(zhǎng)、但在Spc+抗性培養(yǎng)基不能生長(zhǎng)的為疑似陽(yáng)性菌落,繼續(xù)穩(wěn)定傳代,PCR鑒定并測(cè)序,菌株保種至?80 ℃冰箱。
1.5.1 生長(zhǎng)曲線分析
劃線接種 ?80 ℃凍存的無(wú)乳鏈球菌野生株(WT)、ΔessA、ΔessB、ΔessC株至THB固體培養(yǎng)基,30 ℃ 培養(yǎng) 24 h。挑取單菌落至 5 mL THB 液體培養(yǎng)基,30 ℃ 振搖 24 h。測(cè)定各菌株光密度 (OD600),調(diào)整各菌株OD600均為1.80,然后以體積比1∶100 接種至 100 mL THB 液體培養(yǎng)基,30 ℃ 振搖,每隔 2 h取樣 2 mL,測(cè)定 OD600,SPSS 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。
1.5.2 基因缺失對(duì) ESAT6 蛋白表達(dá)量的研究
1)ESAT6基因qPCR檢測(cè)方法的建立:利用Primer 6.0軟件,設(shè)計(jì) ESAT6 qPCR 檢測(cè)引物,引物序列見(jiàn)表1。依實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的ESAT6-pMD18T載體為模板,測(cè)定質(zhì)粒濃度,10倍梯度稀釋 7 個(gè)梯度。分別以原液、10?1、10?2、10?3、10?4、10?5、10?6稀釋質(zhì)粒為模板,利用 Vazyme AceQ qPCR SYBR Green Master Mix 試劑盒,配制20 μL qPCR 反應(yīng)體系,其中 2 × AceQ qPCR SYBR Green Master Mix 10 μL,上游引物 (10 μmol·L?1)1 μL,下游引物 (10 μmol·L?1) 1 μL,模板 2 μL,ddH2O 6 μL。按 95 ℃ 5 min;95 ℃ 10 s,55 ℃10 s,72 ℃ 20 s,40 個(gè)循環(huán)進(jìn)行 qPCR 反應(yīng);95 ℃15 s,60 ℃ 60 s,95 ℃ 15 s進(jìn)行熔解曲線采集。
2) ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除對(duì) ESAT6蛋白mRNA表達(dá)水平影響分析:劃線接種無(wú)乳鏈球菌WT株、ΔessA株、ΔessB株、ΔessC株至THB固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)24 h。挑取單菌落至5 mL THB培養(yǎng)基,30 ℃振搖24 h,調(diào)整OD600=1.80后,按 1∶100 接種至 100 mL THB 液體培養(yǎng)基,30 ℃振搖,分別于 4 、8 、12 和 24 h 取樣 5 mL,利用OMEGA RNA提取試劑盒,提取細(xì)菌RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,稀釋10倍,以無(wú)乳鏈球菌16Sr-RNA 基因?yàn)閮?nèi)參基因[23],按 95 ℃ 5 min;95 ℃ 10 s,55 ℃ 10 s,72 ℃ 20 s采集熒光,40 個(gè)循環(huán)進(jìn)行qPCR 反應(yīng);95 ℃ 15 s,60 ℃ 60 s,95 ℃ 15 s進(jìn)行熔解曲線的采集。以WT株為對(duì)照,2?ΔΔCT方法計(jì)算敲除株ESAT6 mRNA相對(duì)表達(dá)量,并利用SPSS軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。
1.5.3 毒力試驗(yàn)
取?80 ℃凍存的無(wú)乳鏈球菌WT株、ΔessA、ΔessB、ΔessC菌株,劃線接種THB固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)24 h,挑取單菌落,接種THB液體培養(yǎng)基,30 ℃ 培養(yǎng) 24 h 后,適度稀釋,取 100 μL 涂布在THB平板上,30 ℃培養(yǎng)24 h,計(jì)數(shù)。4株菌株均稀釋至 5×108、5×107、5×106CFU·mL?13 個(gè)劑量,0.1 mL·尾?1腹腔注射健康羅非魚各20尾,對(duì)照組設(shè)置20尾,注射等量PBS溶液。試驗(yàn)魚放置于 40 cm×30 cm×40 cm 的水族箱,連續(xù)充氣,水溫維持在27~30 ℃,每天觀察死亡情況并記錄,死亡羅非魚剖解,重新劃線接種分離病原菌。利用GraphPad Prism軟件繪制生存率曲線,并進(jìn)行顯著性分析。
以野生型菌株GDZX1基因組DNA為模板,采用表1引物序列,獲得essA基因上游435 bp同源臂序列,下游502 bp同源臂序列;獲得essB基因上游508 bp同源臂序列,下游508 bp同源臂序列;獲得essC基因上游632 bp同源臂序列,下游571 bp同源臂序列。以pSET5S質(zhì)粒為模板,采用表1引物序列,獲得氯霉素表達(dá)框1 056 bp片段。essAup片段、cat(essA)、essAdown片段,經(jīng)融合PCR,獲得 1 993 bp 的融合片段 (圖1-a);essBup片段、cat(essB)、essBdown片段,經(jīng)融合PCR,獲得 2 072 bp 的融合片段 (圖1-b);essCup片段、cat(essC)、essCdown片段,經(jīng)融合 PCR,獲得 2 259 bp的融合片段 (圖1-c)。
圖1 essA、essB、essC同源臂融合PCR結(jié)果Fig. 1 Overlap extension PCR results of essA, essB, essC homologous arms
以此為基礎(chǔ),將目的片段與酶切后的pSET4S質(zhì)粒連接,轉(zhuǎn)化E.coliDH5α 菌株,37 ℃ 培養(yǎng)過(guò)夜,挑取單克隆菌株,進(jìn)行PCR鑒定,并測(cè)序驗(yàn)證,獲得基因敲除載體,分別命名為pSET4S-ΔessA質(zhì)粒、pSET4S-ΔessB質(zhì)粒、pSET4S-ΔessC質(zhì)粒。
將2.1獲得的pSET4S-ΔessA質(zhì)粒、pSET4SΔessB質(zhì)粒、pSET4S-ΔessC質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化入野生型無(wú)乳鏈球菌電轉(zhuǎn)化感受態(tài)中,30 ℃培養(yǎng)48 h,使質(zhì)粒與野生型菌株發(fā)生同源重組,挑取對(duì)氯霉素具有抗性的單克隆菌株至cm+THB液體培養(yǎng)基中,30 ℃培養(yǎng) 6 h,轉(zhuǎn)至37 ℃繼續(xù)培養(yǎng) 12 h,以此傳代培養(yǎng),對(duì)第9代菌株篩選到的對(duì)氯霉素具抗性的菌株,提取細(xì)菌基因組DNA,分別利用essA驗(yàn)證引物、essB驗(yàn)證引物、essC驗(yàn)證引物進(jìn)行PCR鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖2。利用essA驗(yàn)證引物,WT株擴(kuò)增到479 bp的目的片段,而疑似essA敲除株擴(kuò)增到 1 311 bp的目的片段,符合預(yù)期,對(duì)所獲目的片段進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證,essA基因插入了cat基因序列,證明敲除成功,敲除株命名無(wú)乳鏈球菌ΔessA(圖2-a);利用essB驗(yàn)證引物,WT株擴(kuò)增到740 bp的目的片段,而疑似essB敲除株擴(kuò)增到1 702 bp的目的片段,符合預(yù)期,對(duì)所獲目的片段進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證,essB基因插入了cat基因序列,證明敲除成功,敲除株命名為無(wú)乳鏈球菌ΔessB(圖2-b);利用essC驗(yàn)證引物,WT株擴(kuò)增到1 263 bp的目的片段,而疑似essC敲除株擴(kuò)增到2 077 bp的目的片段,符合預(yù)期,對(duì)所獲目的片段進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證,essC基因插入了cat基因序列,證明敲除成功,敲除株命名為無(wú)乳鏈球菌ΔessC(圖2-c)。
圖2 敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC DNA水平PCR鑒定結(jié)果Fig. 2 PCR identification results of ΔessA, ΔessB, ΔessC knockout strains at DNA level
在此基礎(chǔ)上,對(duì)第9代菌株篩選到的對(duì)氯霉素具抗性的菌株,提取菌體RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用RT-PCR技術(shù)在RNA水平上驗(yàn)證基因缺失突變株ΔessA、ΔessB、ΔessC。利用essAF/essA-R引物對(duì)對(duì)ΔessA敲除菌株進(jìn)行mRNA水平驗(yàn)證,利用essB-F/essB-R引物對(duì)對(duì)ΔessB敲除菌株進(jìn)行mRNA水平驗(yàn)證,利用essC-F/essC-R引物對(duì)對(duì)ΔessC敲除菌株進(jìn)行mRNA水平驗(yàn)證,結(jié)果均未擴(kuò)增到目的條帶,證明缺失菌株構(gòu)建成功 (圖3)。
圖3 敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC RNA水平PCR鑒定結(jié)果Fig. 3 PCR identification of ΔessA, ΔessB and ΔessC knockout strains at RNA level
通過(guò)測(cè)定不同時(shí)間菌液OD600,比較ΔessA、ΔessB、ΔessC與WT株的生長(zhǎng)速度差異,結(jié)果見(jiàn)圖4。與WT株生長(zhǎng)速率相比,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株前期生長(zhǎng)速率明顯減慢,WT株在第8 小時(shí)OD600達(dá)到1.282,在第18 小時(shí)OD600達(dá)到1.878;而ΔessA、ΔessB在第8小時(shí)OD600僅為0.2,在第18小時(shí)OD600才達(dá)到1.4,生長(zhǎng)速率明顯減慢,經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,與WT株相比,0~18 h OD600具有顯著性差異 (P<0.01);而ΔessC株與WT株相比,OD600無(wú)顯著性差異。
圖4 敲除菌株ΔessA、ΔessB、ΔessC 生長(zhǎng)曲線測(cè)定結(jié)果Fig. 4 Growth curve of ΔessA, ΔessB and ΔessC knockout strains
2.4.1ESAT6 基因 qPCR 檢測(cè)方法的建立
以構(gòu)建的ESAT6-pMD18T質(zhì)粒為模板,經(jīng)10 倍梯度稀釋,分別以原液、10?1、10?2、10?3、10?4、10?5、10?67 個(gè)劑量質(zhì)粒為模板,配制 q-PCR反應(yīng)體系,經(jīng)三步法qPCR擴(kuò)增,得到ESAT6基因qPCR擴(kuò)增曲線,擴(kuò)增效率為95.1%,符合要求 (圖5);熔解曲線分析得出在75 ℃左右出現(xiàn)單峰,證明擴(kuò)增產(chǎn)物單一;擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果得到88 bp的特異性條帶。
圖5 ESAT6 qPCR檢測(cè)方法的建立注:a. 擴(kuò)增效率分析結(jié)果;b. 熔解曲線分析結(jié)果; c. 擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠檢測(cè)結(jié)果。Fig. 5 qPCR detection method of ESAT6 geneNote:a. Amplification efficiency analysis result; b. Melt curve analysis result; c. Amplification product detection result based on agarose gel.
2.4.2 敲除株對(duì) ESAT6 蛋白 mRNA 表達(dá)水平的影響結(jié)果
以無(wú)乳鏈球菌16S rRNA基因?yàn)閮?nèi)參基因,在第 4 、第8 、第12和第 24小時(shí),比較 ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株與WT株ESAT6 mRNA表達(dá)水平差異,結(jié)果見(jiàn)圖6。第4 、第8 、第12 小時(shí)時(shí),相較于WT株,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株ESAT6 mRNA 表達(dá)水平均顯著降低 (P<0.01),但在第24小時(shí),ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株ESAT6表達(dá)量與WT株無(wú)顯著性差異。說(shuō)明essA、essB、essC基因缺失在生長(zhǎng)早期影響了ESAT6表達(dá),導(dǎo)致ESAT6 mRNA表達(dá)水平顯著性降低。
圖6 敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC 與野生株對(duì)底物蛋白ESAT6表達(dá)量的影響結(jié)果注:**. 差異顯著 (P<0.01)。Fig. 6 Effect of substrate protein ESAT6 expression by knockout strains ΔessA, ΔessB, ΔessC and WT strainNote:**. Significant difference (P<0.01).
ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株與WT株分別稀釋至 5×108、5×107、5×106CFU·mL?13 個(gè)劑量,分別對(duì)羅非魚進(jìn)行毒力試驗(yàn),比較敲除株與WT株毒力差異 (圖7)。各組以 5×108CFU·mL?1劑量0.1 mL·尾?1注射攻毒,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率分別為90%、90%、70%,而WT株累計(jì)死亡率為 100%;各組以 5×107CFU·mL?1劑量 0.1 mL·尾?1注射攻毒,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率分別為60%、90%、60%,而WT 株累計(jì)死亡率為 100%;各組以 5×106CFU·mL?1劑量 0.1 mL·尾?1注射攻毒,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率分別為50%、50%、30%,而WT株累計(jì)死亡率為100%,經(jīng)成活率曲線分析,5×106CFU·mL?1劑量攻毒時(shí),ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率均與WT株存在明顯差異(P<0.01)。死亡羅非魚剖解,可見(jiàn)魚體肝臟充血、腹水、眼球突出等無(wú)乳鏈球菌感染典型癥狀 (圖8),且從腦、肝、脾、腎組織取樣,劃線接種血瓊脂平板,得到呈β溶血、針尖大小的灰白色小菌落,經(jīng)革蘭氏染色和PCR鑒定,為無(wú)乳鏈球菌。PBS組在攻毒試驗(yàn)期內(nèi)未發(fā)現(xiàn)死亡。隨后又對(duì)回接到各個(gè)菌株,以 5×108CFU·mL?1劑量,重復(fù)攻毒,結(jié)果顯示,WT、ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率分別為100%、90%、80%、70%,證明回歸試驗(yàn)成功。
圖7 敲除菌株ΔessA、ΔessB、ΔessC 與野生株毒力試驗(yàn)結(jié)果Fig. 7 Virulence test of ΔessA, ΔessB, ΔessC knockout strains and WT strain
圖8 攻毒死亡魚解剖及其菌株鑒定結(jié)果注:a. 攻毒死亡魚解剖癥狀;b. 攻毒分離菌株革蘭氏染色結(jié)果;c. 攻毒分離菌株 PCR 鑒定結(jié)果。Fig. 8 Anatomical symptom result and identification of strains of infected dead tilapiaNote:a. Anatomical symptom result of infected dead tilapia; b. Gram staining result of isolated strain after infection;c. PCR identification of isolated strain after infection.
VII型分泌系統(tǒng)由多個(gè)膜蛋白、胞質(zhì)蛋白及外分泌蛋白組成,其分泌蛋白的穩(wěn)定釋放依賴于VII型分泌系統(tǒng)不同蛋白的共同作用[18,24]。對(duì)于VII型分泌系統(tǒng)的研究,結(jié)核分枝桿菌研究最為清楚地顯示出膜蛋白R(shí)v3871識(shí)別分泌蛋白ESAT-6/CFP-10復(fù)合物,與CFP-10的C端結(jié)合,并與Rv3870在細(xì)胞內(nèi)膜上相互作用形成有活性的ATP酶,形成一個(gè)具有中央空洞的六環(huán)結(jié)構(gòu),分泌蛋白通過(guò)六環(huán)分泌通道分泌出胞外??缒さ鞍卓赡苄纬闪宿D(zhuǎn)位通道,促進(jìn)分泌蛋白的分泌[25]。
無(wú)乳鏈球菌感染是危害羅非魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)最為嚴(yán)重的細(xì)菌性傳染病,前期筆者課題組從患病羅非魚中分離鑒定到一株高毒力菌株GDZX1[26],對(duì)其毒力特征和致病機(jī)制的研究亟待開(kāi)展。前期研究對(duì)無(wú)乳鏈球菌的基因組檢索發(fā)現(xiàn)了與VII型/ESAT-6分泌系統(tǒng)同源性較高的基因簇[11-12],由11個(gè)基因組成的基因簇構(gòu)成 (esaABCDEF、essABC、esxAB)。essA、essB蛋白均為跨膜蛋白,可能對(duì)VII型分泌系統(tǒng)正常功能的發(fā)揮起著重要作用。essC蛋白含有典型FstK/SpoEIII結(jié)構(gòu)域 (FSD),分泌蛋白的分泌需要essC調(diào)控的ATP水解作用提供能量[14]。本研究利用同源重組技術(shù),構(gòu)建了羅非魚無(wú)乳鏈球菌essA、essB、essC缺失突變株,通過(guò)DNA水平和RNA水平鑒定,均證明缺失突變成功。并對(duì)敲除菌株的VII型分泌系統(tǒng)可能的編碼基因進(jìn)行了測(cè)序分析,均未造成VII型分泌系統(tǒng)其他基因的缺失或突變。對(duì)野生株和各基因敲除株進(jìn)行了生長(zhǎng)特性表型分析,證明essA、essB基因缺失明顯影響了細(xì)菌的生長(zhǎng),證明essA和essB蛋白與細(xì)菌生長(zhǎng)有關(guān)。隨后對(duì)分泌蛋白ESAT6表達(dá)量的研究發(fā)現(xiàn),essA、essB、essC基因缺失均導(dǎo)致了分泌蛋白ESAT6 mRNA表達(dá)水平明顯下降,說(shuō)明essA、essB、essC蛋白可以影響ESAT6 mRNA表達(dá)水平,對(duì)于維持無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)的完整性起著重要作用。眾多研究表明,VII型分泌系統(tǒng)單個(gè)基因各自編碼具有特定功能的蛋白質(zhì),而這些基因以單個(gè)或多個(gè)形式相互作用,使得由它們獨(dú)立編碼的多個(gè)蛋白質(zhì)協(xié)同作用,組成一個(gè)完整的毒力蛋白分泌系統(tǒng)。該分泌系統(tǒng)決定著ESAT6/CFP10及其毒力蛋白的分泌轉(zhuǎn)運(yùn),結(jié)核分枝桿菌其組分很有可能形成一個(gè)類似于細(xì)菌I型-VI型分泌系統(tǒng)的多重跨膜結(jié)構(gòu),酵母雙雜交試驗(yàn)揭示,膜蛋白R(shí)v3871識(shí)別分泌蛋白ESAT-6/CFP-10復(fù)合物,與CFP-10的C端結(jié)合,并與Rv3870在細(xì)胞內(nèi)膜上相互作用形成有活性的ATP酶。分子伴侶Rv3868與Rv3870和Rv3871相互作用促進(jìn)ESAT-6和CFP-10蛋白的分泌。Rv3870/Rv3871復(fù)合物形成具有活性的ATP酶,形成一個(gè)具有中央空洞的六環(huán)結(jié)構(gòu),底物分泌蛋白通過(guò)六環(huán)分泌通道分泌出胞外。膜蛋白R(shí)v3877含有11個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,可能形成了位于內(nèi)膜上的轉(zhuǎn)位通道[23]。本研究挖掘到無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)重要的組成蛋白essA、essB、essC,其缺失均造成了ESAT6蛋白分泌障礙,對(duì)無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)其他組成蛋白的挖掘,以及組成蛋白的相互協(xié)同關(guān)系,仍有待進(jìn)一步研究。
本研究對(duì)ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株和WT株,選擇3個(gè)梯度對(duì)羅非魚進(jìn)行攻毒試驗(yàn),essA、essB、essC基因缺失導(dǎo)致了無(wú)乳鏈球菌毒力明顯下降,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株累計(jì)死亡率均與WT株存在明顯差異 (P<0.01),影響了菌株毒力,可能與essA、essB、essC基因缺失造成的ESAT6分泌蛋白表達(dá)量降低有關(guān)。這與金黃色葡萄球菌的報(bào)道一致,金黃色葡萄球菌VII型/ESAT6分泌系統(tǒng)分泌蛋白需要essA、essB和essC蛋白的協(xié)同作用[11],essB蛋白全缺失導(dǎo)致ESS系統(tǒng)不能分泌底物蛋白[27],部分缺失導(dǎo)致ESS系統(tǒng)分泌底物蛋白表達(dá)量明顯降低[28-29],證明essB是金黃色葡萄球菌ESS分泌系統(tǒng)的核心組件,繼而通過(guò)十二烷基麥芽糖苷萃取技術(shù)提取了金黃色葡萄球菌essB蛋白,研究發(fā)現(xiàn)essB蛋白與esaA、essA、essD和esxA蛋白形成聚合體,同時(shí)essC蛋白可為ATP水解作用提供能量,才能使金黃色葡萄球菌ESS分泌功能正常發(fā)揮[15,30],而esxA/ESAT6蛋白是金黃色葡萄球菌ESS分泌系統(tǒng)的分泌蛋白,與金黃色葡萄球菌毒力與膿腫形成密切相關(guān)[27]。蟾蜍分枝桿菌 (Mycobacterium xenopi) 研究也發(fā)現(xiàn)相似的膜蛋白,組成ESX-5 T7SS分泌系統(tǒng),與毒力密切相關(guān)[31]。
本研究證明無(wú)乳鏈球菌essA、essB、essC蛋白對(duì)ESAT6分泌蛋白的分泌至關(guān)重要,維持無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)的完整性,可能是無(wú)乳鏈球菌VII型分泌系統(tǒng)的關(guān)鍵膜蛋白,其缺失不僅影響了ESAT6蛋白的表達(dá),而且直接影響了菌株毒力,是潛在的無(wú)乳鏈球菌毒力因子。但是這些膜蛋白是如何控制分泌蛋白分泌的,是否存在蛋白之間的相互作用,膜蛋白僅控制分泌蛋白分泌還是可以自身參與入侵宿主過(guò)程,這些問(wèn)題有待進(jìn)一步探索研究。