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        耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌感染的臨床特征及耐藥機制研究

        2022-08-21 14:41:14陳宗耀王登朝
        現(xiàn)代檢驗醫(yī)學雜志 2022年4期
        關鍵詞:頭孢他啶巴坦阿維

        鄭 茂,陳宗耀,王登朝,鄒 玉

        (德陽市人民醫(yī)院a. 檢驗科;b. 輸血科,四川德陽 618000)

        肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)是一種臨床常見的條件致病菌,可定植于人體皮膚、黏膜、腸道等部位,常引起肺部感染、尿路感染、血流感染等多種疾病,嚴重者可危及生命[1]。碳青霉烯類抗生素抗菌譜廣、抗菌活性強,是目前臨床治療產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended spectrum β-lactamase,ESBLs)、頭孢菌素酶(cephalosporinase)等多重耐藥菌引起嚴重感染的一線用藥,由于抗生素選擇壓力,耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistantKlebsiella pneumoniae,CR-KP) 檢出率呈逐年上升態(tài)勢,給臨床抗感染治療帶來巨大挑戰(zhàn)[2]。近年來,匯聚高毒力和高耐藥的“超級細菌”-耐碳青霉烯類高毒力肺炎克雷伯菌(carbpenem-resistant hypervirulentKlebsiella pneumoniae,CR-hvKP)的出現(xiàn),并導致多次嚴重醫(yī)院內(nèi)感染事件,更是引起全球公共衛(wèi)生的高度關注[3-4]。全國細菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)的數(shù)據(jù)顯示[5],肺炎克雷伯菌對亞胺培南、美羅培南的耐藥率從2014年的4.8%,4.5%,快速上升至2019年的10.5%,10.9%,耐藥形勢十分嚴峻。本研究旨在分析CR-KP 感染的臨床特征及耐藥機制,以期為臨床合理使用抗生素提供參考,更好地防治CR-KP 感染。

        1 材料與方法

        1.1 研究對象 收集2016年1月~2020年12月從德陽市人民醫(yī)院住院患者各類臨床標本中分離的CR-KP。菌株入選標準:①符合美國臨床和實驗室標準化協(xié)會(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)M100-S30 關于CR-KP 的判定標準,即肺炎克雷伯菌對亞胺培南、美羅培南或厄他培南任何一種抗生素耐藥;②同一患者首次分離株。排除標準:①患者臨床資料缺失;②同一患者重復分離株;③菌株未能妥善保存。CR-KP 感染患者男性61 例,女性28 例,中位年齡60 歲(26 天~93 歲),回顧性調(diào)查患者的臨床資料,包括住院號、姓名、性別、年齡、科室、標本類型、基礎疾病、侵入性操作、菌株檢出前2 周抗生素使用情況、是否并發(fā)其他細菌感染等。本研究經(jīng)過醫(yī)院倫理委員會批準(批件號2020-04-016)。

        1.2 儀器與試劑 基質輔助激光解析電離飛行時間(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)質譜儀(德國布魯克公司),VITEK2 Compact 微生物鑒定系統(tǒng)(法國生物梅里埃公司),ABI7500 實時熒光定量PCR 儀(美國ABI 公司)。細菌藥敏測試卡、E-test藥敏紙條(法國生物梅里埃公司),瓊脂平板(鄭州安圖生物公司),細菌基因組DNA 提取試劑盒、Talent qPCR PreMix(北京天根公司)。藥敏試驗質控菌株為大腸埃希菌ATCC25922,肺炎克雷伯菌ATCC700603(衛(wèi)生部臨床檢驗中心)。

        1.3 方法

        1.3.1 細菌分離及藥敏試驗:按照《全國臨床檢驗操作規(guī)程(第4 版)》要求進行細菌分離培養(yǎng),使用MALDI-TOF-MS 進行菌株鑒定、VITEK2 Compact 進行藥敏試驗,頭孢他啶-阿維巴坦采用紙片擴散法(Kirby-Bauer,K-B)作為補充藥敏試驗,依據(jù)CLSI M100-S30 標準判定藥敏結果。所有CR-KP 均采用E-test 法對亞胺培南、美羅培南的最小抑菌濃度(minimum inhibitory concentration,MIC)進行復核,確認藥敏為碳青霉烯類耐藥。

        1.3.2 碳青霉烯酶基因及毒力基因檢測:復蘇菌株接種于血瓊脂平板,37℃培養(yǎng)16 ~20 h,次日分離出單個菌落,按照試劑盒說明書提取CR-KP 基因組DNA,參照文獻[6]設計引物,由上海生工公司合成,引物序列見表1。使用SYBR Green 染料法進行實時熒光定量PCR(real-time PCR)檢測常見碳青霉烯酶基因(blaKPC,blaNDM,blaIMP,blaVIM,blaOXA-48)和毒力基因(aerobaction)。PCR 反應體系:Talent qPCR PreMix 10 μl,正反向引物(10 μmol/L)各0.6 μl,cDNA 2 μl,RNase-free ddH2O 6.8 μl。反應條件:95℃預變性3 min;95℃變性5 s,60℃退火10 s,72℃延伸32 s,40 個循環(huán)。待PCR擴增反應結束后,調(diào)整反應基線至適宜處,以Ct<35判定基因為陽性表達。

        1.3.3 CR-KP 高黏性表型判斷:將CR-KP 接種于血瓊脂平板,37℃培養(yǎng)16 ~20 h,用接種環(huán)輕柔向上挑起單個菌落,重復2 次,若挑起的黏液絲長度≥5 mm,即拉絲試驗陽性,稱菌株為高黏性表型。1.3.4 CR-KP 高毒力株篩選:參照文獻[7-8]將毒力基因(aerobactin)和拉絲試驗同時陽性,作為判斷高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulentKlebsiella pneumoniae,hvKP)的標志,從CR-KP 中篩選出高毒力株,即CR-hvKP。

        表1 real-time PCR 引物序列表

        1.4 統(tǒng)計學分析 采用SPSS22.0 軟件進行數(shù)據(jù)分析、WHONTE5.6 軟件進行藥敏分析。計數(shù)資料以例數(shù)或構成比表示,組間比較采用χ2檢驗或Fisher確切概率法,危險因素采用logistic 回歸分析。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 CR-KP 檢出變化趨勢 2016 ~2020年總計分離出2 562 株肺炎克雷伯菌,其中89 株CR-KP 占比3.47%。歷年檢出的CR-KP 株數(shù)分別為7,13,22,17 和30,在肺炎克雷伯菌中占比分別為1.59%,2.64%,3.58%,3.78%和4.87%,總體上呈逐年上升趨勢。

        2.2 CR-KP 來源科室及標本類型分布 見表2。CRKP 主要來源于ICU(17.98%,16/89)、感染科(14.61%,13/89)、腫瘤科(14.61%,13/89);標本類型主要為痰液(50.56%,45/89)、尿液(15.73%,14/89)、膿液(12.36%,11/89)。

        表2 CR-KP 來源科室及標本類型分布(n=89)

        2.3 CR-KP 對常用抗生素的藥敏情況 見表3。CR-KP 對青霉素類、頭孢菌素類、喹諾酮類、單環(huán)類等抗生素普遍耐藥,耐藥率均>70%。CR-KP 對氨基糖苷類阿米卡星、慶大霉素耐藥率相對較低,分別為28.54%,39.33%。CR-KP 對新型β 內(nèi)酰胺類復合制劑頭孢他啶-阿維巴坦和脂肽類黏菌素耐藥率低,分別為14.61%,7.87%。

        2.4 CR-KP 碳青霉烯酶基因攜帶情況 總計有70株CR-KP 檢出碳青霉烯酶基因陽性表達,檢出率為78.65%(70/89),包括56 株攜帶blaKPC,10 株攜帶blaNDM,3 株攜帶blaIMP和2 株攜帶blaVIM,其中1 株同時攜帶blaKPC和blaNDM。本研究未檢出blaOXA-48陽性表達。

        表3 CR-KP 對常用抗生素的藥敏情況 [n (%)]

        2.5 CR-KP 中高毒力株檢出情況及感染危險因素比較 見表4。從CR-KP 中篩選出16 株CR-hvKP(17.98%,16/89),將CR-KP 感染患者分為高毒力株感染組(CR-hvKP 組)和非高毒力株感染組(CR-cKP 組)。單因素分析表明,年齡≥60歲、糖尿病、肝膽疾病、機械通氣、留置導管、入住ICU 等共6 個因素,在CR-hvKP 組和CRcKP 組之間的差異均有統(tǒng)計學意義(χ2或Fisher=4.973 ~19.377,均P<0.05)。

        表4 CR-hvKP 組和CR-cKP 組的危險因素比較 [n (%)]

        2.6 CR-hvKP 感染的多因素logistic 回歸分析 見表5。將2.5 中差異有統(tǒng)計學意義的6 個變量進一步納入多因素logistic 回歸分析,結果顯示在CRKP 感染患者中,糖尿?。∣R=10.947,95%CI:1.751 ~68.424,P=0.010)、入住ICU(OR=16.012,95%CI:2.589 ~99.036,P=0.003)是CR-hvKP 感染的獨立危險因素。

        表5 CR-hvKP 感染的多因素logistic 回歸分析

        3 討論

        肺炎克雷伯菌是中國臨床分離率常居第二位的革蘭陰性菌,也是醫(yī)院內(nèi)感染的重要病原菌,其耐藥日益嚴重,尤其是CR-KP 感染不斷涌現(xiàn),使得臨床治療面臨巨大困境[9]。研究顯示患者感染CR-KP后通常造成治療失敗、住院時間延長、死亡率升高等,特別是與血流感染、入住ICU 或接受器官移植相關的死亡率明顯升高[10]。因此,CR-KP 長期以來都是醫(yī)院內(nèi)細菌耐藥監(jiān)測的重點。

        本研究中CR-KP 在肺炎克雷伯菌中占比呈逐年上升趨勢,2020年達到4.87%,縱然該數(shù)據(jù)尚低于全國水平(10.9%),但仍明顯高于許多省份,如山西、廣西、海南等[9],故需高度警惕肺炎克雷伯菌的泛耐藥傳播。CR-KP 首要來源于ICU,這與諸多因素有關。ICU 患者常具有多種基礎疾病、免疫力低下、住院時間長,加之大量廣譜抗生素的使用,更是增加了CR-KP 感染的機會。LI 等[11]報道的一項長達4年追蹤研究證實,通過綜合的感染預防及控制措施,可以使ICU 獲得性CR-KP 定植或感染顯著減少。因此,加強對重癥患者的病原微生物送檢,能盡早發(fā)現(xiàn)CR-KP 感染并進行相應治療,降低并發(fā)癥發(fā)生。另外,兒科檢出的CR-KP 占比高達13.48%,且在新生兒中更常見,但嬰幼兒生長發(fā)育尚不完善,藥物使用禁忌多,造成可選的抗生素種類極少。鄧文喻等[12]報道2015 ~2018年廣東省某婦幼保健院嬰幼兒呼吸道感染分離的肺炎克雷伯菌,對亞胺培南的耐藥率從4.35%上升至19.15%,增長趨勢十分明顯,這說明減少兒科患者的廣譜抗生素使用率已十分必要,或有助于降低其分離的肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類的耐藥性。

        本研究發(fā)現(xiàn)CR-KP 對氨基糖苷類耐藥率相對較低,對頭孢他啶-阿維巴坦、黏菌素耐藥率則更低。臨床治療CR-KP 感染時,可經(jīng)驗性優(yōu)選慶大霉素、阿米卡星、頭孢他啶-阿維巴坦等藥物,或根據(jù)藥敏結果合理選用抗生素。SHIELDS 等[13]報道對于CR-KP 引起的菌血癥,氨基糖苷類尤其是慶大霉素,具有不錯的抗菌效果。然而,由于氨基糖苷類具有較明顯的耳毒性、腎毒性等不良反應,兒科患者應用受限。盡管CR-KP 對黏菌素耐藥率低,但臨床和PK-PD 數(shù)據(jù)證實黏菌素臨床療效有限,其應與一個或多個其他抗生素聯(lián)合使用。食品藥品監(jiān)督管理局(food and drug administration, FDA)于2015年批準頭孢他啶-阿維巴坦用于治療泌尿系統(tǒng)和腹腔感染革蘭陰性桿菌的患者,CLSI M100 亦給出其參考折點,這為多重耐藥菌感染提供了治療依據(jù)。體外研究證實頭孢他啶-阿維巴坦對攜帶blaKPC的碳青霉烯類耐藥腸桿菌科細菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, CRE)具有較強抗菌活性,對攜帶blaNDM,blaIMP的CRE 抗菌活性較弱[14]。另外,對頭孢他啶、美羅培南和黏菌素耐藥,以及對多種藥物聯(lián)合應用也耐藥的腸桿菌,頭孢他啶-阿維巴坦仍然具有高度的抗菌活性[15]。周琴等[16]對120株CR-KP 進行抗菌分析證實頭孢他啶-阿維巴坦的耐藥率僅為16.67%,與本研究結果接近。由此可見,頭孢他啶-阿維巴坦有望成為將來治療CR-KP 感染的一線用藥。

        碳青霉烯酶按照Ambler 分類法則,可分為A,B,D 三類。A 類為絲氨酸碳青霉烯酶,編碼基因包括blaKPC,blaSME等,以blaKPC流行最常見、分布最廣泛;B 類為金屬β-內(nèi)酰胺酶,編碼基因包括blaNDM,blaIMP,blaVIM等,其中blaNDM自2009年印度首次發(fā)現(xiàn)后,現(xiàn)已在全球廣泛播散;D 類為苯唑西林酶,對碳青霉烯酶水解活性較低,編碼基因主要有blaOXA-48[17]。本研究中超過3/4 的CR-KP 檢出碳青霉烯酶基因陽性,主要為blaKPC,blaNDM,表明KPC 酶、NDM 酶是該院CR-KP 所流行的主要碳青霉烯酶,這與ZHANG 等[18-19]報道的全國調(diào)查數(shù)據(jù)一致。雖然KPC 酶是CR-KP 最常見的碳青霉烯酶,所幸該類酶仍然可以被多種新型復合制劑所抑制,包括亞胺培南-瑞來巴坦、美羅培南-維博巴坦和頭孢他啶-阿維巴坦等[20]。

        hvKP 是肺炎克雷伯菌的新變種,攜帶多種毒力基因,致病力強,能引起肝膿腫、眼內(nèi)炎、腦膜炎等侵襲性感染,其在平板上生長菌落常呈高黏液性,可通過拉絲試驗驗證,但目前仍缺乏有效的表型確證試驗[21]。鐵載體是細菌在宿主體內(nèi)生長繁殖不可或缺的條件,RUSSO 等[22-23]報道aerobaction是hvKP 最重要的鐵載體,也是介導毒力的關鍵因子。既往研究常將攜帶aerobaction 基因的肺炎克雷伯菌定義為hvKP[7,24],故本研究以aerobactin 基因和拉絲試驗同時陽性,從CR-KP 中篩選出CRhvKP。以往多重耐藥菌幾乎都不是高毒力,但CRhvKP 兼具高毒力和高耐藥表型,儼然是一種“超級細菌”,對于重癥患者而言很可能是致命的。研究顯示CR-hvKP 感染臨床治愈率低,傳播性強,明確相關危險因素是做好預防控制措施的關鍵[25]。本研究發(fā)現(xiàn)在CR-KP 感染患者中,糖尿病、入住ICU 是CR-hvKP 感染的重要危險因素。中性粒細胞胞外捕獲網(wǎng)(NETs)能夠以非共價形式結合多種抗菌成分,捕獲和殺滅病原微生物,是hvKP 主要的抗菌防御機制。JIN 等[26]報道糖尿病患者的NETs 結構表面存在損傷,而這種NETs 殺菌缺陷很可能是導致糖尿病患者易感CR-hvKP 的機制。ICU患者大都病情較重,接受侵入性操作多,這無疑增加了感染的機會,故CR-hvKP 引起的嚴重院內(nèi)感染也常集中發(fā)生在ICU[3-4,27]。CR-hvKP 感染并非無藥可用,YU 等[28]報道頭孢他啶-阿維巴坦對其依然具有較強抗菌活性(MIC90 ≤1 μg/ml),這可能是治療CR-hvKP 感染的理想選擇。

        綜上所述,細菌耐藥已成為威脅公共衛(wèi)生的世界性難題,尤以CR-KP 呈全球流行趨勢頗為嚴峻。當前形勢下,多模式、多學科的感染控制策略,規(guī)范化抗感染治療,嚴格的抗菌藥物管理,對遏制CR-KP 的傳播至關重要。

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