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        數(shù)字PCR技術(shù)檢測感染者尿液中SARS-CoV-2的方法研究

        2022-08-03 07:10:50王志彬李寶林劉靳波
        關(guān)鍵詞:檢測

        王志彬,羅 慶,李寶林,唐 敏,張 章,劉靳波

        西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗部(瀘州 646000)

        2019 年12 月武漢爆發(fā)由新型冠狀病毒引發(fā)的肺炎,并迅速在全國蔓延[1],其傳播速度超過2003年爆發(fā)的“非典”[2]。2020 年1 月10 日,世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)將該病原體命名為2019-nCoV(2019 novel coronavirus),2 月11 日,國際病毒分類委員會(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)正式宣布該病毒為嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)。

        SARS-CoV-2 為正義鏈、單鏈線狀RNA 冠狀病毒[3],該病毒典型特征之一為無癥狀傳播[4],傳染者和被傳染者在感染初期可能無癥狀[5],使得防控難度加大。疫情發(fā)生以來,中國政府及時采取強(qiáng)有力、高效能的措施使得疫情得到初步控制,但截至目前,SARS-CoV-2在許多國家和地區(qū)仍在快速傳播和蔓延。感染者的及時確診是疫情防控的關(guān)鍵一環(huán),目前臨床診斷主要基于臨床病史、胸部CT和病毒核酸檢測[6-7]。相較于臨床癥狀的出現(xiàn),核酸檢測結(jié)果在促進(jìn)感染者隔離、治療、出院以及評估感染活動中起重要作用。根據(jù)WHO 診療指南,目前診斷SARS-CoV-2 感染的金標(biāo)準(zhǔn)是基于實時熒光定量PCR(RT-qPCR)技術(shù)的檢測結(jié)果,但由于RT-qPCR 技術(shù)本身的靈敏性較低,加之標(biāo)本取材差異大等,許多低拷貝病毒核酸感染者不能在一次核酸檢測中檢出,給疫情防控帶來巨大挑戰(zhàn)[8]。

        微滴式數(shù)字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的工作原理是由微滴發(fā)生器將20 μL RT-qPCR反應(yīng)體系分割成約20 000 個油包水的液滴單獨進(jìn)行PCR 反應(yīng),再通過微滴分析儀對每個油滴進(jìn)行熒光信號采集,采用泊松分布概率函數(shù)計算起始模板的拷貝數(shù)[9]。與RTqPCR相比,ddPCR不需要繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線即可實現(xiàn)絕對定量,對低拷貝核酸檢出具有優(yōu)勢[10]。咽拭子等取樣工作給醫(yī)護(hù)人員帶來暴露風(fēng)險,尤其當(dāng)防疫物資緊缺時。如果能通過尿液等標(biāo)本代替咽拭子等進(jìn)行核酸檢測,將大大降低醫(yī)護(hù)人員的暴露風(fēng)險。研究報告指出,陽性病人尿液中含有SARS-CoV-2 核酸[11]。本研究針對5 例咽拭子陽性標(biāo)本,同時進(jìn)行ddPCR 和RT-qPCR實驗,比較了兩種技術(shù)在準(zhǔn)確性和靈敏度上的差別,建立了最佳ddPCR 反應(yīng)體系和反應(yīng)程序;同時為了開發(fā)定量標(biāo)本的采集方法進(jìn)而應(yīng)用于臨床檢驗系統(tǒng),使用ddPCR 技術(shù)檢測了另外12 例陽性病人的尿液標(biāo)本,評價了以尿液作為檢驗樣本的可行性。

        1 材料與方法

        1.1 標(biāo)本采取

        2019 年12 月25 日至2020 年3 月4 日期間在西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院發(fā)熱門診就診病人和有武漢接觸史的人群進(jìn)行了SARS-CoV-2 病毒檢測,共收集到陽性標(biāo)本17份(均屬不同病人),其中包括咽拭子標(biāo)本5份,尿液標(biāo)本(隨機(jī)尿)12 份。病人納入標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)》[12]中病原學(xué)檢測標(biāo)準(zhǔn):標(biāo)本收集之前病人尚未接受藥物治療以及其他治療,標(biāo)本收集后RT-PCR檢測結(jié)果陽性。

        1.2 儀器與試劑

        儀器:EX3600 核酸自動提取儀(上海之江生物科技股份有限公司)、Bio-Rad CFX96 實時熒光定量PCR儀(美國Bio-rad 公司)、Bio-Rad QX200 微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)(美國Bio-rad公司)。

        試劑:Bio-Rad Droplet Generation Oil(美國Bio-rad公司)、Bio-Rad Droplet Reader Oil(美國Bio-rad公司)、Bio-Rad 2×ddPCR supermix for probes(美國Bio-rad 公司)、引物(中國生工)、探針(中國生工)、新型冠狀病毒2019-nCoV 核酸檢測試劑盒(上海之江生物科技股份有限公司)。

        1.3 方法

        本文的方法學(xué)研究主要參照康鳳鳳等[13]和黃斐等[14]的報道,并參考2012 年6 月美國臨床和實驗室標(biāo)準(zhǔn)研究院頒布的EP17-A2文件[15]。

        1.3.1 核酸提取 咽拭子SARS-CoV-2 RNA的提?。喝? 倍于咽拭子體積的4%NaOH 溶液,加入咽拭子采集管中液化30 min,液化過程中每10 min振蕩一次,直至樣本無拉絲。取1 mL 液化后樣本于13 000 rpm 離心10 min,棄上清后用生理鹽水洗滌,13 000 rpm 離心10 min,留取300 μL 上清,棄除多余的上清后將剩余的300 μL上清與沉淀混勻,將混合物吸入到EX3600核酸自動提取儀配套的核酸提取預(yù)裝板A 孔中(一次性可以提取36個標(biāo)本),將預(yù)裝版置于設(shè)備固定位置,啟動核酸提取程序提取核酸。

        尿液SARS-CoV-2 RNA 的提取:取尿液1.5 mL,8 000 rpm 離心5 min,棄上清1.2 mL,剩余混勻后進(jìn)行核酸提取,具體步驟同上。

        1.3.2 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒制備與稀釋 CDC-陽性質(zhì)粒V2,全長2 983 bp,載體pUC57,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒起始濃度為7.84×1010copies/μL。用ddH2O 將標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒做10 倍系列稀釋,共7 個濃度(7.84×107copies/μL~7.84×101copies/μL)。

        1.3.3 引物和探針 引物序列采用國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心(National Microbiology Data Center,NMDC)公布的信息,目的序列為新冠肺炎SARS-CoV-2 病毒核殼蛋白(nucleoprotein,N)基因,序列信息見表1。

        表1 SARS-CoV-2病毒核殼蛋白基因引物信息Table 1 Primer information of SARS-CoV-2 virus nucleocapsid protein gene

        1.3.4 ddPCR 反應(yīng)體系和條件優(yōu)化 進(jìn)行ddPCR 之前,通過溫度梯度PCR,設(shè)置51 ℃~62 ℃之間不同的溫度對退火溫度進(jìn)行優(yōu)化。使用Bio-Rad QX200微滴式數(shù)字PCR 系統(tǒng)進(jìn)行實驗,具體操作步驟參照實驗儀器及試劑說明書,略有改動,主要包括PCR反應(yīng)體系制備(見表2)、微滴發(fā)生、PCR 反應(yīng)程序設(shè)定和微滴信號檢測等。

        表2 ddPCR反應(yīng)體系Table 2 ddPCR reaction system

        將上述反應(yīng)體系混勻后加入微滴發(fā)生卡中間一排,在微滴發(fā)生卡Oil標(biāo)志列加入70 μL微滴生成油,及時蓋好專用膠墊后將微滴發(fā)生卡水平放置在微滴發(fā)生器的槽中制備油滴,待指示燈亮后取出微滴發(fā)生卡,將droplet 列微滴(約45 μL)全部轉(zhuǎn)入96 孔板,封鋁膜后置于PCR 儀中進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增程序為:95 ℃10 min,94 ℃30 s,60 ℃1 min,溫度變化設(shè)置為2 ℃,共40個循環(huán);擴(kuò)增結(jié)束后98 ℃酶失活10 min。每個模板設(shè)置2個技術(shù)重復(fù)。擴(kuò)增結(jié)束后,將96孔板放入微滴讀取儀中檢測探針信號,并使用QuantaSoft 軟件(Bio-Rad,USA)分析數(shù)據(jù)。

        1.3.5 假病毒樣本的ddPCR 擴(kuò)增 假病毒、陽性對照和陰性對照均來自新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(上海之江生物科技股份有限公司)。假病毒標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度為108copies/mL,分別稀釋為105copies/μL、104copies/μL、103copies/μL、102copies/μL、10 copies/μL和1 copies/μL,共6個濃度進(jìn)行重復(fù)性實驗。假病毒核酸稀釋后,在最佳反應(yīng)條件下進(jìn)行ddPCR擴(kuò)增。每次反應(yīng)中設(shè)置一個陰性對照和一個空白對照。將反應(yīng)體系離心混勻,放入微滴發(fā)生卡中,通過微滴發(fā)生器產(chǎn)生微滴,之后將制備好的微滴(水、油分層)緩慢加入96孔板,進(jìn)行PCR反應(yīng)。反應(yīng)程序同上,每個假病毒標(biāo)本均做3個相同模板的平行反應(yīng)。

        1.3.6 空白限評估 空白限評估(limit of blank,LOB):參照黃斐等[14]的研究方法,檢測8份(3次重復(fù))不同濃度陰性樣本核酸中SARS-CoV-2 的拷貝數(shù),計算應(yīng)用該檢測平臺可能出現(xiàn)的假陽性微滴數(shù)及概率大小。

        1.3.7 統(tǒng)計學(xué)分析 本研究采用SPSS17.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,實驗所得數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,采用兩組獨立實驗的t檢驗方法比較兩組間差異性。

        2 結(jié)果

        2.1 陽性質(zhì)控制備與引物特異性驗證

        通過溫度梯度PCR,退火溫度設(shè)為51℃~62 ℃,確定引物的最佳退火溫度為60 ℃。以稀釋后的7個不同濃度質(zhì)粒為模板,以核殼蛋白基因序列為目的基因,驗證引物特異性并確定陽性質(zhì)控的最佳濃度。RT-qPCR結(jié)果顯示見圖1,每兩個相鄰濃度模板之間擴(kuò)增曲線相差約3.3個循環(huán),除模板濃度(編號g)(7.84×101copies/μL)的Ct 值大于30 之外,其余各濃度模板擴(kuò)增曲線擴(kuò)增效率良好。陰性對照無擴(kuò)增,表明該體系無污染。

        圖1 不同濃度CDC-陽性質(zhì)粒V2模板擴(kuò)增曲線Figure 1 Amplification curve of CDC-positive plasmid V2 template at different concentrations

        不同濃度質(zhì)粒模板經(jīng)40個循環(huán)擴(kuò)增后,溶解曲線為單峰見圖2,無引物二聚體及其它非特異性擴(kuò)增,表明引物特異性良好,能用于SARS-CoV-2的檢驗。

        圖2 不同濃度CDC-陽性質(zhì)粒V2模板溶解曲線Figure 2 Template dissolution curves of CDC-positive plasmid V2 at different concentrations

        2.2 ddPCR反應(yīng)檢測結(jié)果的精密度評價

        以上述7 個不同濃度的陽性質(zhì)粒為模板進(jìn)行ddPCR 反應(yīng)。結(jié)果顯示,以陽性質(zhì)粒為模板(3.92 ×104copies/μL)進(jìn)行ddPCR 擴(kuò)增,微滴發(fā)生器生成的微滴數(shù)大于10 000,見圖3。在陰性對照中,無陽性液滴生成,表明反應(yīng)體系和微滴發(fā)生程序正常,能滿足基本擴(kuò)增和檢測。

        圖3 ddPCR方法擴(kuò)增CDC-陽性質(zhì)粒V2模板一維散點圖Figure 3 One dimensional scatter diagram of CDC-positive plasmid V2 template amplified by ddPCR

        ddPCR 可靠性檢測結(jié)果顯示:所有反應(yīng)中油滴總數(shù)均超過10 000,最低數(shù)量為11 343,最高數(shù)量為15 136,表明該數(shù)字PCR 平臺運(yùn)轉(zhuǎn)良好,微滴生成數(shù)量能夠滿足泊松分布函數(shù)。與質(zhì)粒模板的理論濃度相比,ddPCR檢測結(jié)果較理論值偏低,見表3。兩個機(jī)械重復(fù)之間相比較,ddPCR 結(jié)果重復(fù)性較好。ddPCR 檢測結(jié)果的變異系數(shù)CV值介于0.04~12.09,表明ddPCR檢測結(jié)果的準(zhǔn)確度較好。

        表3 核殼蛋白基因的ddPCR精密度檢驗Table 3 ddPCR precision test of nucleoprotein gene

        以ddPCR檢出結(jié)果和質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)濃度之間做相關(guān)性分析,結(jié)果顯示兩者之間具有極強(qiáng)的相關(guān)性,兩者之間的線性關(guān)系見圖4,ddPCR 檢出結(jié)果與理論值呈極度正相關(guān),ddPCR 結(jié)果正確可靠。當(dāng)模板濃度超過7.84×105copies/μL 時,微滴分析儀讀取不到陰性微滴,全部體系均為陽性微滴,超過機(jī)器檢出限,導(dǎo)致讀取結(jié)果錯誤,ddPCR檢測上限應(yīng)低于7.84×105copies/μL。

        圖4 ddPCR方法與RT-qPCR之間的線性相關(guān)性Figure 4 Linear correlation between ddPCR and RT-qPCR

        2.3 ddPCR反應(yīng)與RT-qPCR反應(yīng)組間重復(fù)

        將標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的7 個濃度稀釋液作為模板,以核殼蛋白(nucleoprotein,N)基因為為目的序列設(shè)計引物,進(jìn)行RT-qPCR 反應(yīng),構(gòu)建的標(biāo)準(zhǔn)曲線為:y=-3.317lgx+39.831,線性相關(guān)系數(shù)為R2=0.999,y為Ct值,x為濃度(copies/μL)。根據(jù)此標(biāo)準(zhǔn)曲線,通過對未知樣本測定的Ct 值便可得出樣本中SARS-CoV-2 的起始拷貝數(shù),見表4。

        表4 ddPCR與RT-qPCR之間的組間重復(fù)Table 4 Intergroup duplication between ddPCR and RT-qPCR

        2.4 ddPCR反應(yīng)重復(fù)性和可報告范圍

        在重復(fù)性分析實驗中,ddPCR 定量檢測中CV最小值為2.31%,最大值為38.35%,結(jié)果表明,ddPCR 方法具有較好的重復(fù)性。不同濃度假病毒方法間重復(fù)實驗結(jié)果表明,該平臺系統(tǒng)偏差為-17.33%~-3.80%,見表5。在重復(fù)性實驗中,使用ddPCR檢測到的所有結(jié)果均未超出假病毒標(biāo)準(zhǔn)品的理論濃度,表現(xiàn)出較高的一致性。

        表5 不同濃度假病毒樣本ddPCR方法組間重復(fù)Table 5 The ddPCR method of pseudovirus samples with different concentrations were repeated between groups

        2.5 空白限評估

        ddPCR 檢測陰性標(biāo)本核酸中SARS-CoV-2 拷貝數(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同濃度(隨機(jī))樣本產(chǎn)生的微滴數(shù)在11 101~14 805之間,陽性微滴數(shù)>1即判斷為假陽性,在本實驗中該平臺假陽性出現(xiàn)概率為1/24。LOB最大估計值為0.09 copies/μL。

        2.6 尿液標(biāo)本中SARS-CoV-2拷貝數(shù)檢測

        為了能使標(biāo)本量化檢測,同時避免咽拭子等取樣工作帶來的暴露風(fēng)險,本研究嘗試用尿液檢測SARSCoV-2。12份尿液標(biāo)本全部來自確診病人。臨床上使用某公司生產(chǎn)的核酸檢測試劑盒檢測病人痰液SARS-CoV-2陽性,而檢測尿液結(jié)果全部為陰性,表明尿液中該病毒核酸為低拷貝。

        使用ddPCR 檢測這12 份尿液樣本,其靈敏度增加,共9例檢出,3例未檢出,檢出率為75%。所檢出濃度范圍為5.4 copies/μL~30 copies/μL。

        從圖5、圖6 可以看出,陰性對照均無陽性微滴檢出,陽性對照分別檢出陽性微滴數(shù)2 226和2 561,分別對應(yīng)檢出濃度為4 520 copies/μL和5 500 copies/μL。

        圖5 尿液標(biāo)本1~6號檢測結(jié)果Figure 5 Detection results of urine samples 1~6

        圖6 尿液標(biāo)本7~12號檢測結(jié)果Figure 6 Detection results of urine samples 7~12

        尿液標(biāo)本同時使用RT-qPCR 和ddPCR進(jìn)行檢測,結(jié)果12 份尿液標(biāo)本使用ddPCR 技術(shù)檢出9 份,使用RT-qPCR 檢出0 份,表明ddPCR 方法在低拷貝核酸定量檢測中具有明顯優(yōu)勢。

        3 討論

        SARS-CoV-2 爆發(fā)以來,中國政府及時采取強(qiáng)有力的防控措施,使得疫情得到初步控制。但是,SARSCoV-2在許多國家和地區(qū)還有蔓延趨勢。研究報告表明,關(guān)于該病毒的致病性、遺傳特征等方面的認(rèn)知相對缺乏[15],因此很難在短時間內(nèi)制定一套有效的治療方案,而快速診斷疑似病人并采取隔離防控措施,成為疫情防控的關(guān)鍵。

        SARS-CoV-2 傳播能力強(qiáng)而且存在無癥狀感染的特性。相比于CT(computed tomography)或抗體檢測,核酸檢測克服了滯后性,同時也是目前臨床上感染者確診和出院的主要依據(jù)[16]。但核酸檢測易出現(xiàn)假陰性,標(biāo)本采集部位、方法以及RNA 提取等過程均是SARS-CoV-2 病毒核酸檢測出現(xiàn)假陰性的原因[8]。另外,RT-qPCR由于其檢出限的限制,在臨床上的應(yīng)用弊端日漸突出,加之不同公司生產(chǎn)的試劑盒質(zhì)量差別很大,致使許多疑似病例甚至陽性感染者無法在第一時間檢出陽性結(jié)果,從而導(dǎo)致診斷延遲,給疫情防控帶來巨大挑戰(zhàn)。

        ddPCR 技術(shù)優(yōu)勢明顯,是繼常規(guī)PCR 技術(shù)發(fā)展起來的一項精密檢測技術(shù),最初ddPCR 技術(shù)被用來分離單基因[17-18],在臨床檢驗中使用較少。有報道指出,當(dāng)ddPCR 應(yīng)用于檢測系統(tǒng)時,能夠檢測到低至0.001%的突變基因,相比于RT-qPCR,靈敏性提高1 000 倍[19]。趙欣[20]的研究結(jié)果顯示,ddPCR 在臨床樣本定量檢測時其檢出率高于RT-qPCR,這與本研究得出結(jié)果相同。本研究中,RT-qPCR 可檢出4 號咽拭子中1.41 copies/μL的SARS-CoV-2,卻無法檢出尿液中5.4~30 copies/μL(ddPCR檢出值)的SARS-CoV-2。假設(shè)上述兩種方法檢出值都在真值范圍內(nèi),這一現(xiàn)象無法僅僅以“尿液中該病毒核酸為低拷貝”作出解釋?;氐絉T-qPCR 檢測,在臨床上針對新冠病毒的“判陽”是依據(jù)Ct值大小,如第九版新冠肺炎診療方案中明確規(guī)定連續(xù)兩次新冠核酸檢測Ct 值≥35 即可解除隔離或出院。在本研究中,4 號咽拭子中核酸濃度1.41 copies/μL 對應(yīng)的Ct 值為36.03,通過常規(guī)PCR 技術(shù)檢測應(yīng)該判定為陰性,而ddPCR 與之相對應(yīng)的檢測結(jié)果為37.00 copies/μL。由此可見,ddPCR 檢測可以補(bǔ)充RT-qPCR 檢測結(jié)果,而RT-qPCR 不能補(bǔ)充ddPCR 的檢測結(jié)果。因此,當(dāng)ddPCR 檢測結(jié)果為5.4~30 copies/μL 時,RT-qPCR 無法檢出就得到了很好的解釋。RT-qPCR檢出濃度是根據(jù)Ct value帶入標(biāo)準(zhǔn)曲線計算所得,為理論值,4號咽拭子Ct 值兩次重復(fù)均超過35,隨著Ct 值增大,結(jié)果準(zhǔn)確性降低,國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心指南(https://nmdc.cn/nCoV)表明當(dāng)RT-qPCR 結(jié)果大于37,為不準(zhǔn)確。ddPCR將含有核酸分子的反應(yīng)體系分隔成“油包水”的小液滴,在模板量適當(dāng)?shù)那疤嵯?,確保每個小液滴最多包含一條核酸分子,經(jīng)PCR擴(kuò)增后,利用微滴檢測儀對每個微滴進(jìn)行逐個掃描檢測,有熒光信號的微滴判讀為“1”,沒有熒光信號的微滴判讀為“0”,最后根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個數(shù),分析軟件即可給出靶分子的絕對起始拷貝數(shù)及濃度,這個濃度的準(zhǔn)確性有待進(jìn)一步探討,趙欣在其碩士論文中也表示,RT-qPCR的定量值始終比ddPCR高10倍,推測其原因可能是標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒濃度被高估所致[20]。

        臨床上核酸檢測SARS-CoV-2的取樣主要包括鼻咽拭子、口咽拭子、痰液等,當(dāng)感染者病毒載量低時不能取到陽性標(biāo)本,加之醫(yī)護(hù)人員取樣操作帶來的差異,導(dǎo)致所取樣本無法量化,也是核酸檢測假陰性的原因之一。同時,咽拭子取樣操作使得醫(yī)護(hù)人員暴露風(fēng)險增加,在防護(hù)物資緊缺時增加醫(yī)護(hù)人員的感染風(fēng)險。有研究表明新型冠狀病毒還會導(dǎo)致不同程度的心理抑郁[21],因此快速、準(zhǔn)確檢出病毒,是疫情防控關(guān)鍵的一環(huán)。本研究開發(fā)新的取樣方法和標(biāo)本內(nèi)容,以尿液為實驗材料,定量至1.5 mL進(jìn)行實驗,以期在保證陽性檢出率的同時,更加安全的進(jìn)行傳染性疾病的取樣工作,更完整地鑒定感染病例并避免交叉感染。

        在低拷貝核酸樣本的檢測中,ddPCR 技術(shù)與RTqPCR相比具有顯著的優(yōu)勢[22-24]。臨床上根據(jù)檢測結(jié)果進(jìn)行的確診,不同試劑盒廠家建議只需滿足在同一份標(biāo)本中SARS-CoV-2 的ORF1ab基因及核殼蛋白基因至少1 個靶標(biāo)特異性RT-PCR 檢測結(jié)果為陽性即可,并且有研究報告指出,在檢測SARS 冠狀病毒時,ORF1b基因和核殼蛋白基因具有相似的準(zhǔn)確性[25],因此本研究主要以核殼蛋白基因為靶序列。雖然本研究證實,單拷貝核酸通過ddPCR 技術(shù)檢測具有優(yōu)越的靈敏性,但本研究依然存在局限性。①由于瀘州本地陽性病例較少,使得本研究樣本量不夠大,重復(fù)性不好;②ddPCR 儀器操作要求較高,很容易在不同的加樣孔之間造成污染;③ddPCR 檢測成本較RT-qPCR 技術(shù)高,普及困難。本研究的結(jié)果顯示,12例痰液檢測為陽性的感染者尿液標(biāo)本,RT-qPCR檢出0例,表明尿液中病毒載量低。ddPCR 技術(shù)檢出9 例,表明ddPCR 技術(shù)在低載量病毒核酸檢測過程中具明顯優(yōu)勢,這也為其他重大傳染性疾病的檢出提供新的思路與方法,其自動化程度是值得繼續(xù)研究與開發(fā)的方向。

        4 結(jié)論

        在低拷貝核酸樣本的檢測中,ddPCR 技術(shù)與RTqPCR相比,ddPCR技術(shù)在低載量病毒核酸檢測過程中具有明顯優(yōu)勢。這一結(jié)果也為其他類似的重大傳染性疾病的檢出提供了新的思路與方法。

        (利益沖突:無)

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