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        寧夏地區(qū)犢牛腹瀉型產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌的篩選及相關(guān)基因型分析

        2022-07-31 09:05:54高?;?/span>扈寧霞王培柱吳學(xué)青康曉冬
        動物醫(yī)學(xué)進展 2022年7期
        關(guān)鍵詞:耐藥

        高海慧,汪 潔,扈寧霞,王培柱,吳學(xué)青,康曉冬*

        (1.寧夏農(nóng)林科學(xué)院動物科學(xué)研究所,寧夏銀川 750002;2.陜西榆林市綏德縣名州區(qū)農(nóng)牧業(yè)綜合服務(wù)站,陜西綏德 718000;3.寧夏吳忠市利通區(qū)扁擔(dān)溝鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)工作站,寧夏吳忠 751100)

        犢牛大腸埃希氏菌性腹瀉是危害犢牛生長的重要疾病,嚴(yán)重者可導(dǎo)致死亡。在規(guī)?;膛龊腿馀?,抗菌藥物是治療該病的首選藥物,寧夏地區(qū)牛只對阿米卡星敏感性最高[1]。由于長期用各種抗菌藥物治療,加之濫用嚴(yán)重,形成了大腸埃希氏菌耐藥性日趨嚴(yán)重的狀況。β-內(nèi)酰胺酶是一種細(xì)菌產(chǎn)生的能水解β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物的滅活酶,是細(xì)菌對β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥性的主要機制。超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)主要存在于臨床分離的革蘭氏陰性桿菌,大腸埃希氏菌是產(chǎn)β-內(nèi)酰胺的代表菌株,耐藥基因可以通過轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合等形式在細(xì)菌中傳播擴散[2]。β-內(nèi)酰胺類抗生素是使用廣泛的治療藥物,導(dǎo)致大量β-內(nèi)酰胺失活和β-內(nèi)酰胺酶出現(xiàn)[3]。國際上研究認(rèn)為,ESBLs和頭孢菌素酶(Amp C)是較為活躍的2類β-內(nèi)酰胺酶,尤其是在腸桿菌科細(xì)菌中起到較為重要的作用[4]。不同國家或地區(qū)獸醫(yī)用藥習(xí)慣、劑量不同,使得不同地區(qū)菌株的基因型和基因亞型存在差異,其所攜帶的某些耐藥基因可能會通過水平轉(zhuǎn)移的方式轉(zhuǎn)移到人類,給臨床治療帶來壓力。ESBLs相關(guān)基因中主要流行的是TEM型,CTX-M型[3,5]。奶牛和肉牛是我區(qū)畜牧業(yè)重要的支柱產(chǎn)業(yè),肉牛又是南部山區(qū)脫貧攻堅的主力軍,本研究開展寧夏地區(qū)犢牛腹瀉型產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌篩選、耐藥性調(diào)查與優(yōu)勢基因型分析,為犢牛腹瀉型產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌在寧夏地區(qū)的感染和流行情況提供資料,為明確大腸埃希氏菌ESBLs耐藥基因的傳播趨勢,有效監(jiān)控細(xì)菌耐藥性,指導(dǎo)犢牛大腸桿菌病用藥提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣本 寧夏農(nóng)林科學(xué)院動物科學(xué)研究所動物疫病防治實驗室于2019年10月-2021年9月采集寧夏地區(qū)規(guī)?;鰻倥8篂a型肛門拭子180份,離心管收集,冰袋運輸。

        1.1.2 試劑與材料 伊紅美藍培養(yǎng)基EMB(批號:161119)、麥康凱培養(yǎng)基MAC(批號:161119)、MH 瓊脂(批號:161021),青島海博生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;4.5 mg/mL NaCl溶液,法國梅里埃公司產(chǎn)品;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒、DNA標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000、DNA標(biāo)準(zhǔn)DL 1 200、2×TaqPCR MasterMix,天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品;blaTEM、blaCTX-M-1、blaCTX-M-9、blaCTX-M、blaOXA、blaSHV基因擴增引物,生工生物工程(上海)技術(shù)服務(wù)有限公司合成;ESBLs測定盒(頭孢他定(CAZ)、頭孢噻肟(CTX)、頭孢他定/克拉維酸(CAZ/clav))、頭孢噻肟/克拉維酸(CTX/clav),杭州天和微生物試劑有限公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        1.2.1 大腸埃希氏菌的分離 將肛拭子于營養(yǎng)肉湯中37 ℃培養(yǎng)16 h~24 h,培養(yǎng)物接種于EMB、MAC,培養(yǎng)16 h~24 h,疑似菌鏡檢純化,用于菌株的鑒定。

        1.2.2 疑似菌的16S rRNA鑒定 將純培養(yǎng)的大腸埃希氏菌,用滅菌生理鹽水洗脫,吸取1.5 mL,用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取DNA,分裝后,置-20 ℃保存?zhèn)溆?。參?6S rRNA通用引物序列[7],PCR擴增反應(yīng)體系為2×TaqPCR Master Mix 25 μL,DNA模板2.0 μL,上、下游引物各1 μL(10 μmol/L),ddH2O補足至50 μL。擴增條件為:95 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 10 min,共循環(huán)30次;72 ℃ 10 min。陽性樣品送公司測序,測得序列進行Blast比對。

        1.2.3 大腸埃希氏菌ESBLs篩選 復(fù)壯保存的大腸埃希氏菌后,用麥?zhǔn)媳葷醿x調(diào)整為0.5麥?zhǔn)蠁挝?,接種于MH平板上,均勻涂布,采用雙紙片協(xié)同法,將ESBLs測定盒中的CTX(30 μg)、CTX/CLA(30 μg/10 μg),CAZ(30 μg)、CAZ/CAL(30 μg/10 μg)兩組,37 ℃過夜培養(yǎng),比較加入克拉維酸與不加克拉維酸的抑菌直徑≥5 mm者判定為產(chǎn)ESBLs菌株。

        1.2.4 ESBLs引物的合成 參考文獻[6-9]設(shè)計基因的特異性引物,由生工生物工程(上海)技術(shù)服務(wù)有限公司合成,序列見表1。

        1.2.5 PCR檢測blaCTX、blaCTX-M-9基因的PCR條件為:40 μL體系:2×TaqPCR Master Mix 10 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板1 μL,ddH2O 17 μL;blaCTX-M-1、blaTEM、blaOXA、blaSHV基因的PCR條件為40 μL體系:2×TaqPCR Master Mix 10 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板0.5 μL,ddH2O 17.5 μL。PCR條件為95 ℃ 5 min,95 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共29個循環(huán);72℃ 10min,退火溫度見表1。

        表1 基因檢測引物序列及大小

        2 結(jié)果

        2.1 大腸埃希氏菌的16S rRNA鑒定

        分離株在MAC上呈圓形、突起光滑、邊緣整齊的粉色菌落,在EMB上呈具有金屬光澤菌落,革蘭氏染色可見紅色、兩端鈍圓的桿菌。以疑似為E.coli的純培養(yǎng)物DNA為模板,擴增分離株16 S rRNA基因,目的條帶為370 bp,與預(yù)期條帶一致(圖1)。產(chǎn)物送測序,經(jīng)Blast比對確定為大腸埃希氏菌。

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 1 500;1~5.分離菌株;6.陰性對照

        2.2 ESBLs檢測結(jié)果

        測量抑菌圈直徑分析顯示,腹瀉源性74株E.coli有51株為產(chǎn)ESBLs菌株,陽性率為68.92%。

        2.3 相關(guān)基因檢測結(jié)果

        結(jié)果見表2和圖2~圖7。51株產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌中,bla-TEM基因陽性率為100%(51/51),bla-CTX基因陽性率為100%(51/51),其中bla-CTX-M-1基因亞型株62.75%(32/51)、bla-CTX-M-9基因亞型株100%(51/51),bla-OXA基因陽性率為50.98%(26/51),bla-SHV基因陽性率為23.53%(12/51)。攜帶CTX+CTX-M-1+CTX-M-9+TEM基因的菌株占比最高,為21.57%。

        表2 腹瀉源產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌β-內(nèi)酰胺酶耐藥基因型分布

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000;1~9.分離菌株

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 1 200;1~14.分離菌株

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 1 200;1~10.分離菌株

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 1 200;1~10.分離菌株

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 1 200;1~11.分離菌株

        M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 600;1~13.分離菌株

        3 討論

        大腸埃希氏菌腸道正常菌群,數(shù)量大,是維護腸道健康的重要菌群,這無疑加速了細(xì)菌耐藥基因的產(chǎn)生、累積和轉(zhuǎn)移[10],隨著人醫(yī)和獸醫(yī)在治療臨床疾病中廣泛使用第三代頭孢菌素、單環(huán)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物,使得ESBLs菌株出現(xiàn)耐藥及傳播,通過環(huán)境污染,食用畜產(chǎn)品等途徑威脅著人類健康。ESBLs主要由腸桿菌科產(chǎn)生,ESBLs使大腸埃希氏菌對新型廣譜β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥性增加,ESBLs陽性株的出現(xiàn)會導(dǎo)致臨床的高病死率及高比率持續(xù)性定殖,給臨床治療相關(guān)疾病帶來挑戰(zhàn)。

        ESBLs基因型主要有blaTEM、blaSHV、blaCTX和blaOXA[11],本研究中51株產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌中,優(yōu)勢基因型為bla-TEM、bla-CTX、bla-CTX-M-1、bla-CTX-M-9。bla-CTX型酶是近年來研究較多且流行較廣泛的,分為CTX-M-1、CTX-M-9和KLUC等6組,每組又存在亞型,總數(shù)有150多種[11]。本研究中發(fā)現(xiàn)blaCTX-M-1基因亞型陽性率為62.75%,blaCTX-M-9基因亞型陽性率為100%。blaTEM來源于TEM-1和TEM-2基因序列發(fā)生突變造成1個~5個氨基酸改變而形成的一系列酶,本研究中bla-TEM基因陽性率為100%,TEM-1基因是目前革蘭氏陰性菌中流行范圍最廣、檢出率最高的TEM基因亞型。OXA型ESBLs國內(nèi)外文獻報道主要存在于銅綠假單胞菌和鮑曼不動桿菌中[12],而在腸桿菌科細(xì)菌中所占比例較少,本研究中blaOXA基因檢出率為50.98%,與報道有一定差異。SHV型是較早發(fā)現(xiàn)的酶型之一,且產(chǎn)SHV型ESBLs的菌株日益增多,對第三代頭孢菌素等呈現(xiàn)多重耐藥現(xiàn)象,給臨床抗感染治療帶來很大的困難,已引起世界各地高度重視[13],本研究中bla-SHV基因陽性率為23.53%,相對其他基因型檢出率最低。據(jù)有關(guān)報道,blaCTX型和TEM型或SHV型的同源性較低,僅為40%[14-15]。本研究中腹瀉源產(chǎn)ESBLs大腸埃希氏菌攜帶CTX+CTX-M-1+CTX-M-9+TEM基因型的菌株占比最高(21.57%)。

        寧夏地區(qū)犢牛腹瀉型產(chǎn)ESBLs菌株檢出率高,提示我區(qū)牛場中產(chǎn)ESBLs菌株流行普遍。牛源ESBLs大腸埃希氏菌攜帶的某些耐藥基因,可能會通過復(fù)制、變異、水平轉(zhuǎn)移等方式傳遞到人類的致病菌中,有重要公共衛(wèi)生意義,應(yīng)定期開展ESBLs監(jiān)測,平時生產(chǎn)實踐中減少抗菌藥物的使用。

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