周凡萍,黃墩兵,黃賽娥
(1.福建生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院,福建 福州 350000;2.浙江醫(yī)院,浙江 杭州 310013;3. 福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬康復(fù)醫(yī)院,福建 福州 350000)
腦卒中后認(rèn)知功能障礙(post-stroke cognitive impairment,PSCI)是一種常見并且嚴(yán)重的腦卒中后遺癥,常導(dǎo)致患者注意功能、計(jì)算能力和執(zhí)行功能等腦高級(jí)功能障礙[1-3],影響患者康復(fù)進(jìn)程和效果。當(dāng)前康復(fù)鄰域評(píng)定患者認(rèn)知功能的方式停留在各種量表的使用,但是對(duì)于意識(shí)不清、言語(yǔ)障礙、情感障礙、雙側(cè)手運(yùn)動(dòng)不能的患者,量表有其局限性。臨床上目前也沒辦法完全克服量表多次使用后失效的問題。所以,如果能夠?qū)颊哐暹M(jìn)行生物標(biāo)志物的檢測(cè),快速、簡(jiǎn)單、無(wú)創(chuàng)地利用患者血清生物標(biāo)志物對(duì)對(duì)患者進(jìn)行認(rèn)知功能的評(píng)估,對(duì)PSCI的早期診斷、早期治療意義重大,也有利于PSCI的臨床管理。miRNAs是人體內(nèi)源性非編碼單鏈小分子RNA,長(zhǎng)度約22個(gè)核苷酸。miRNAs在血液中的表達(dá)量不是穩(wěn)定不變的,會(huì)隨著機(jī)體生理病理的改變而改變[4]。本團(tuán)隊(duì)前期工作中已對(duì)單個(gè)miRNAs與PSCI的關(guān)系進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)血清miR-132的表達(dá)量與PSCI密切相關(guān),患者血清miR-132的高表達(dá)預(yù)示著PSCI的程度越嚴(yán)重[5]。本次實(shí)驗(yàn)意在進(jìn)一步通過(guò)Solexa高通量測(cè)序獲得PSCI患者血清miRNAs的表達(dá)譜,從中篩選出差異表達(dá)的miRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,并做相關(guān)分析,尋找臨床診斷PSCI的潛在新分子標(biāo)志物。
1.1 研究設(shè)計(jì)及對(duì)象來(lái)源
本次研究方法屬于病例-對(duì)照,所有受試人員都招募于福建省康復(fù)醫(yī)院,對(duì)所有就診人員進(jìn)行公開招募,時(shí)間跨度為2017年1月至2019年9月。按照表1-1、表1-2、表1-3中納排條件將受試人員分為三個(gè)組,分別為PSCI組、PSCN組、AMC組。三組間年齡、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間卒中類型、病灶、病程、腦卒中損傷程度相匹配。
1.2 研究對(duì)象納排標(biāo)準(zhǔn)
基于本項(xiàng)研究的不同之處,本團(tuán)隊(duì)充分研究了將既往有關(guān)腦卒中后認(rèn)知功能障礙的隨機(jī)對(duì)照研究的納排條件之后,決定將《Trials》雜志里的一項(xiàng)有關(guān)PSCI的隨機(jī)對(duì)照研究中的納排要求進(jìn)行了刪減,確定了下表納排標(biāo)準(zhǔn),詳見表1、2、3。
表1 腦卒中后認(rèn)知功能障礙組(PSCI)
表2 腦卒中后認(rèn)知功能正常組(PSCN)
表3 年齡匹配對(duì)照組(AMC)
1.3 標(biāo)本采集采取受試人員空腹血5mL,隨即在低速離心機(jī)中離心,速度設(shè)置為3000 rpm,時(shí)間為5min,經(jīng)初步離心后取最上層的血清,轉(zhuǎn)移至對(duì)應(yīng)編號(hào)的1.5mL無(wú)Rnase EP管中。然后將EP管放入低溫高速離心機(jī)中離心5min,速度為于12000 rpm,溫度為4 ℃,完全清除標(biāo)本中殘余的血細(xì)胞。將標(biāo)本取出按序號(hào)分組放入凍存盒,凍存盒上標(biāo)注組名,置于-80℃冰箱保存,用于下一步實(shí)驗(yàn)。
1.4 Solexa測(cè)序
從三組血清標(biāo)本中各挑選5個(gè)樣本,三組間性別、年齡、文化程度、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、發(fā)病部位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標(biāo)本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限公司進(jìn)行高通量的Solexa測(cè)序。
1.5 血清RNA提取和逆轉(zhuǎn)錄
本研究采用miRNA純化試劑盒(北京艾德萊公司,RN4601),嚴(yán)格遵照配套使用說(shuō)明書進(jìn)行操做分離提取miRNA。分離提取后的樣本都需行濃度和純度的檢測(cè),檢測(cè)使用的是德國(guó)Thermo公司NanoDrop 2000c分光光度計(jì)。通過(guò)檢驗(yàn)之后篩選出A260/A280比值在1.80-2.12之間的、濃度在20 ng/μL以上的miRNAs樣品進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。然后使用南京諾唯贊生物科技有限公司的試劑盒(MQ101-02)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),選擇miR-16作為內(nèi)參進(jìn)行校正[7],其序列為:TAG CAG CAC GTA AAT ATT GGC GT。
1.6 RT-qPCR檢測(cè)
使用南京諾唯贊生物科技有限公司提供的ChamQTMSYBR qPCR Master Mix (MR101-02)試劑盒進(jìn)行miRNAs檢測(cè),嚴(yán)格按照說(shuō)明書步驟操作。得到的miRNAs的Ct值與miR-16的Ct值相減得到差值-ΔCt,2-ΔCt則表示miRNAs相對(duì)表達(dá)量,然后經(jīng)由對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換,即log102-ΔCt,最終得到正?;腃t值。
1.7 統(tǒng)計(jì)分析
本研究通過(guò)IBM SPSS 20.0對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示。三組組間比較,符合正態(tài)分布使用單因素方差分析,不符合則使用Kruskal-Wallis H(K)檢驗(yàn)。兩組組間比較,符合正態(tài)分布使用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),不符合則使用Mann-Whitney U檢驗(yàn)。若數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布使用Pearson相關(guān)進(jìn)行分析,不符合則使用Spearman相關(guān)分析。最后,通過(guò)ROC曲線和曲線下面積(area under curve,AUC)來(lái)評(píng)估m(xù)iRNAs的診斷能力。
2.1 各組一般資料的分布三組受試者性別、年齡、受教育水平等一般資料差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見表4。
表4 三組間一般資料的分布(±s, n)
表4 三組間一般資料的分布(±s, n)
特征 PSCI(n=60) PSCN(n=60) AMC(n=60) P 年齡(歲) 61.08±10.3160.65±9.9658.97±9.100.295 教育程度(年) 7.50±3.038.10±2.777.45±2.770.429 MoCA評(píng)分 9.32±6.1526.75±0.8927.45±1.25 <0.001 性別(男/女) 42/1839/2131/290.101 腦梗死/腦出血 33/2723/37 - 0.067 左側(cè)/右側(cè)/雙側(cè) 27/29/422/36/2 - 0.381 高血壓史 28/3223/3724/360.619 糖尿病史 20/4027/3321/390.362 高血脂癥史 26/3435/2532/280.246 心臟病史 17/4316/4420/400.706 吸煙史 19/4119/4115/450.652
2.2 Solexa測(cè)序結(jié)果
根據(jù)此前研究,我們將log2_FC(PSCI/PSCN)≥3和P value<0.05的miRNAs作為顯著差異表達(dá)的miRNAs。本研究中,我們共篩選出10個(gè)差異表達(dá)miRNAs。見表5。
表5 顯著差異表達(dá)miRNAs
2.3 第二階段RT-qPCR驗(yàn)證
小樣本驗(yàn)證階段發(fā)現(xiàn)PSCI組與PSCN組相比 較,miR-20a-5p,miR-20b-5p,miR-191-5p, miR-93-5p,miR-5991-y和miR-30d-5p顯著上調(diào)。miR-193b-5p,miR-134,miR-132-5p和 miR-214-y顯著下調(diào)。見圖2-1a。在大樣本驗(yàn)證階段,我們發(fā)現(xiàn)miR-5991-y, miR-30d-5p,miR-132-5p和miR-214-y表達(dá)量無(wú)顯著性差異,其余6個(gè)miNRAs表達(dá)情況與小樣本量階段一致。其中,miR-20a-5p, miR-20b-5p, miR-191-5p和miR-93-5p顯著上調(diào),miR-193b-5p和miR-134顯著下調(diào)。見圖1。
圖1 a 小樣本量階段PSCI組與PSCN組miRNAs表達(dá)量。b大樣本量階段PSCI組與PSCN組miRNAs表達(dá)量(*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001)
此外,我們檢測(cè)60例AMC患者血清中miR-20a-5p, miR-20b-5p, miR-191-5p,miR-93-5p,miR-193b-5p和miR-134表達(dá)量。結(jié)果顯示,miR-20a-5p,miR-20b-5p,miR-191-5p和miR-93-5p在PSCN和AMC患者之間存在顯著差異,miR-20a-5p,miR-93-5p,miR-193b-5p和miR-134在PSCI和AMC患者中存在顯著差異,相較于AMC患者,miR-20a-5p和miR-93-5p在PSCI中顯著上調(diào),而miR-193b-5p和miR-134顯著下調(diào)。見圖2。
圖2 PSCI、PSCN和AMC患者中miRNAs相對(duì)表達(dá)量
2.4 ROC分析
采用ROC曲線分析6種血清miRNA對(duì)PSCI的 診 斷 價(jià) 值,6種 血 清miRNA(miR-20a-5p, miR-20b-5p, miR-191-5p,miR-93-5p,miR-193b-5p和miR-134)的ROC曲線下面積分別為0.862(95%CI:0.806,0.918)、0.726(95%CI:0.652,0.799)、0.781(95%CI:0.710,0.852)、0.897(95%CI:0.852,0.943)、0.762(95%CI:0.830,0.694)、0.877(95%CI:0.926,0.829)、0.998(95%CI:0.995,1)。ROC曲線分析結(jié)果顯示miR-93-5p診斷效能最高,miR-134次之。
我們進(jìn)一步采用多元Logistic回歸方法計(jì)算6個(gè)血清miRNAs組合診斷PSCI的ROC曲線,構(gòu)建了回歸方程:Logit(p)=0.204-19.042×(miR-20a-5p)-7.669×(miR-20b-5p)-18.586×(miR-191-5p)-31.898×(miR-93-5p)+10.181×(miR-193b-5p)+21.03×(miR-134)。ROC曲線分析6個(gè)血清miRNAs組合診斷PSCI的靈敏度100%,特異度99.2%,比單個(gè)血清miRNAs診斷PSCI的敏感度和特異性高,AUC為0.998,具有良好的診斷效能。見表6和圖3。
圖3 6個(gè)miRNAs的ROC曲線圖
表6 6個(gè)miRNAs的ROC曲線分析
我國(guó)腦卒中發(fā)病率逐年升高,一半以上的腦卒中患者出現(xiàn)PSCI[8]。PSCI患者無(wú)法與周圍人群進(jìn)行正常交流,積極主動(dòng)性差。此外,PSCI患者因交流的障礙不能聽從指令配合康復(fù)訓(xùn)練,康復(fù)進(jìn)程慢,效果差,日常生活嚴(yán)重依賴。認(rèn)知障礙的評(píng)估常用評(píng)定量表[9],存在局限性。研究表明,miRNAs能穩(wěn)定存在血清中[10],且血清提取方便快捷,成本低廉。因此,血清miRNAs有望作為PSCI的預(yù)測(cè)、診斷及評(píng)估的方便快捷指標(biāo)。
本研究結(jié)果顯示6個(gè)miRNAs(miR-20a-5p, miR-20b-5p, miR-191-5p,miR-93-5p,miR-193b-5p和miR-134)的相對(duì)表達(dá)量在PSCI、PSCN和AMC患者之間存在顯著性差異(P<0.01)。上述6個(gè)miRNAs在多個(gè)研究報(bào)道中提及,闡明了miRNAs與突觸可塑性、認(rèn)知相關(guān)疾病、記憶等關(guān)系。Kart Varendi等[11]的研究表明腦源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(BDNF)的表達(dá)與血清miR-191水平相關(guān),實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)低濃度的miR-191會(huì)促進(jìn)BDNF的表達(dá),miR-191的高表達(dá)反而不利于BDNF的信使RNA的翻譯,而多項(xiàng)研究已經(jīng)證實(shí)BDNF有助于神經(jīng)元的生長(zhǎng),在突觸可塑性方面有著積極作用[12-13]。Myrrhe van Spronsen等[14]對(duì)各個(gè)發(fā)育時(shí)期的海馬神經(jīng)元微小RNAs表達(dá)譜進(jìn)行研究,他們研究數(shù)據(jù)顯示miR-191與海馬NMDA受體依賴的可塑性相關(guān)。Hui Dong等[15]的研究中同樣利用Solexa技術(shù)獲得了阿爾茨海默?。ˋD)患者與非癡呆人群血清微小RNAs的表達(dá)譜,對(duì)比表達(dá)譜發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的微小RNAs,發(fā)現(xiàn)了miR-191、miR-93在兩組人群中存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。Subodh Kumar等[16]亦研究了miRNAs與AD的關(guān)系,其中就包括miR-191-5p,所有相關(guān)微小RNA中,miR-191-5p曲線下面積最大,相關(guān)性最強(qiáng)。亦有研究表明,miR-20a-5p在AD患者DE 血清中明顯上調(diào)[17]。Pete Heinzelman等[18]及Liu等[19]的研究不僅表明miR-193b減少與AD的發(fā)病機(jī)制有關(guān),對(duì)miR-193b的調(diào)節(jié)還有望成為治療AD的一種手段。胡雅坤等[20]的研究發(fā)現(xiàn)miR-134的存在可下調(diào)BDNF 表達(dá),從而促進(jìn)海馬神經(jīng)細(xì)胞的凋亡。
進(jìn)一步行ROC曲線獨(dú)立分析結(jié)果提示單一miRNA對(duì)診斷PSCI有一定的指導(dǎo)意義。我們采用多元邏輯回歸方法計(jì)算6個(gè)miRNAs組合的ROC曲線。Logistic回歸模型方法計(jì)算6個(gè)血清miRNAs組合的AUC為0.998,說(shuō)明6個(gè)miRNAs具有較高的診斷PSCI的效能。這些結(jié)果說(shuō)明6個(gè)miRNAs組合物作為診斷PSCI的生物標(biāo)志物存在潛在價(jià)值。