劉書(shū)涵,韓海偉,韓成坤,周 青
(1.廈門(mén)大學(xué)附屬第一醫(yī)院放射科,福建 廈門(mén) 361003;2.武漢大學(xué)人民醫(yī)院超聲科,湖北 武漢 430060)
膠質(zhì)瘤起源于神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞,是成人最常見(jiàn)的原發(fā)性腦腫瘤,約占顱內(nèi)腫瘤的75%[1]。研究表明,近年來(lái)發(fā)達(dá)國(guó)家的膠質(zhì)瘤發(fā)病率在全球范圍內(nèi)有顯著上升的趨勢(shì)[2]。膠質(zhì)瘤具有高度異質(zhì)性、侵襲性和復(fù)發(fā)性,目前尚無(wú)有效的根治措施。因此,早期精確診斷尤其重要。近年來(lái),在眾多的診斷方法中,MRI 影像組學(xué)不僅具有高空間分辨力和多參數(shù)成像的優(yōu)勢(shì),還可對(duì)靶區(qū)進(jìn)行影像學(xué)特征的高通量提取,篩選出有利于診斷的組學(xué)特征,并予以驗(yàn)證、建立模型[3-4]。盡管如此,影像組學(xué)也面臨著巨大挑戰(zhàn),包括但不限于ROI 提取的差異性、定量成像的重復(fù)性、重建參數(shù)的敏感性,以及構(gòu)建模型的可解釋性等[5],其中,影像組學(xué)對(duì)ROI 的精準(zhǔn)分割是后續(xù)工作的首要保障。目前,醫(yī)學(xué)圖像ROI 的分割主要是利用3D-Slicer(https://www.slicer.org/)或ITK-SNAP(http://www.itksnap.org/)軟件進(jìn)行全自動(dòng)、半自動(dòng)和手動(dòng)分割,而被學(xué)術(shù)界一致認(rèn)為金標(biāo)準(zhǔn)的手動(dòng)分割[6],卻存在著不可忽視的完整性和穩(wěn)定性差異。因此,本研究以較低級(jí)別膠質(zhì)瘤為例,探討腫瘤MRI 影像組學(xué)研究中手動(dòng)分割ROI 特征提取的一致性和可重復(fù)性。
1.1 一般資料 回顧性分析廈門(mén)大學(xué)附屬第一醫(yī)院2017 年12 月至2020 年12 月收治的78 例經(jīng)病理確診為較低級(jí)別膠質(zhì)瘤患者的臨床及影像資料,其中男43 例(55.13%),女35 例(44.87%);年齡16~70 歲,平均(41.4±13.6)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):①經(jīng)病理確診為較低級(jí)別膠質(zhì)瘤(WHO 2~3 級(jí));②患者圖像資料完整,同時(shí)具備T2WI、動(dòng)態(tài)增強(qiáng)T1WI(CE-T1WI)序列;③圖像質(zhì)量較好,不存在大于所勾畫(huà)層面15%的偽影。排除標(biāo)準(zhǔn):①排除確診為WHO 1、4 級(jí)的膠質(zhì)瘤患者;②圖像質(zhì)量不佳,無(wú)法勾畫(huà)ROI 者;③缺少CE-T1WI 序列和/或無(wú)病理結(jié)果的患者。本研究獲得醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
1.2 儀器與方法 使用Philips Achieva 1.5 T MRI掃描儀。掃描序列與參數(shù):T2WI,TR/TE 4 000 ms/120 ms,視野240 mm×240 mm,矩陣480×480,層厚5 mm,層距1 mm,激勵(lì)次數(shù)1 次;CE-T1WI,TR/TE 800 ms/20 ms,視野240 mm×240 mm,矩陣384×224,層厚5 mm,層距1.5 mm,翻轉(zhuǎn)角90°,激勵(lì)次數(shù)1 次。增強(qiáng)掃描經(jīng)靜脈高壓注射對(duì)比劑釓噴酸葡胺注射液(馬根維顯,德國(guó)BAYER 公司),劑量0.1 mg/kg 體質(zhì)量。
1.3 腫瘤ROI 分割與特征提取 由2 名醫(yī)師(醫(yī)師A:具有11 年工作經(jīng)驗(yàn)的放射科主治醫(yī)師;醫(yī)師B:具有7 年工作經(jīng)驗(yàn)的放射科住院醫(yī)師)采用盲法分別獨(dú)立完成78 例膠質(zhì)瘤的分割任務(wù)。2 名醫(yī)師均采用3D-Slicer 軟件(4.11 版本)進(jìn)行手動(dòng)分割(ROI分割前,分別評(píng)價(jià)被試圖像,自行調(diào)整窗寬窗位以便勾畫(huà)腫瘤;用Segment Editor 模塊中的“Draw”勾畫(huà)腫瘤邊界,用“Paint”對(duì)腫瘤實(shí)質(zhì)進(jìn)行填充),1 個(gè)月后醫(yī)師B 重復(fù)該任務(wù),以最大程度地減少記憶偏差對(duì)其分割結(jié)果的影響。由于較低級(jí)別膠質(zhì)瘤形態(tài)不規(guī)則,部分病灶缺乏腫塊特征(即非腫塊樣病灶),因此無(wú)需避開(kāi)鈣化、囊變、壞死及出血區(qū),需在T2WI 上勾畫(huà)腫瘤的整體范圍,并配準(zhǔn)至CE-T1WI 序列圖像上,從而提取影像組學(xué)特征(圖1,2)。
圖1 男,41 歲,少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤(WHO 3 級(jí))。T2WI(圖1a)及動(dòng)態(tài)增強(qiáng)T1WI(CE-T1WI)(圖1c)示腫塊位于右側(cè)顳葉-基底節(jié)區(qū),邊界清晰,2 名醫(yī)師均給出較好的分割方案(圖1b,1d)圖2 女,51 歲,彌漫性星形細(xì)胞瘤(WHO 2 級(jí))。T2WI(圖2a)及CE-T1WI 示腫塊位于左側(cè)額下回-島葉皮質(zhì)區(qū),呈非腫塊樣,邊界不清,且CE-T1WI 示該腫塊無(wú)明顯強(qiáng)化(圖2c)。分割時(shí)在T2WI 上確定腫塊范圍(圖2b),再配準(zhǔn)至CE-T1WI 圖像上(圖2d)
應(yīng)用3D-Slicer 軟件的Radiomics 插件對(duì)每個(gè)腫瘤各提取851 個(gè)特征,主要特征分類(lèi)見(jiàn)表1。由于獲取特征數(shù)量龐大,故本研究?jī)H對(duì)既往文獻(xiàn)中常用的腫瘤特征參數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)研究[7-9],包括一階特征:能量、熵、峰度、偏度、最大值、最小值、平均值、均勻性;形狀特征:主軸長(zhǎng)度、短軸長(zhǎng)度、平整度、表面積體積比、球形度;灰度共生矩陣特征:對(duì)比、相關(guān)性。
表1 使用Radiomics 提取的膠質(zhì)瘤的影像組學(xué)主要特征分類(lèi)
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 26.0 和SSPSAU(https://spssau.com/)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。采用組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(intraclass correlation coefficient,ICC)分析2 名醫(yī)師手動(dòng)分割ROI 所提取影像組學(xué)特征參數(shù)的一致性。通過(guò)使用雙向混合效應(yīng)模型,獲得2 名醫(yī)師間的一致性;使用單因素隨機(jī)效應(yīng)模型獲得醫(yī)師B 2 次不同時(shí)間的一致性。ICC<0.5 為一致性較差,0.5~0.75 為一致性中等,0.75~0.9 為一致性良好,>0.9 為一致性優(yōu)秀[10]。使用Bland-Altman 方法,對(duì)一致性評(píng)價(jià)進(jìn)行直觀展示。使用Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)評(píng)價(jià)各參數(shù)的可重復(fù)性差異。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 一致性分析結(jié)果 2 名醫(yī)師間的ICC 均>0.75(良好3/15,優(yōu)秀12/15),平均為0.937±0.068。其中,納入研究特征中的能量和對(duì)比一致性表現(xiàn)最佳(均ICC=0.998)。醫(yī)師B 2 次測(cè)量勾畫(huà)特征參數(shù)的ICC均>0.9(優(yōu)秀15/15),平均為0.978±0.022(表2)。觀察者內(nèi)與觀察者間的ICC 均>0.75,說(shuō)明2 名醫(yī)師對(duì)ROI 的勾畫(huà)一致性良好。其中,納入研究特征中平均值和對(duì)比的一致性表現(xiàn)最佳(均ICC=1.000)。
表2 觀察者間及觀察者內(nèi)的一致性分析
2.2 可重復(fù)性評(píng)價(jià)結(jié)果 選取3 個(gè)特征(熵、球形度、相關(guān)性)繪制Bland-Altman 圖(圖3),可直觀展示觀察者間的一致性和觀察者內(nèi)的可重復(fù)性。本研究特征的散點(diǎn)絕大多數(shù)在95%CI 范圍內(nèi),說(shuō)明特征參數(shù)具有良好的一致性和重復(fù)性。醫(yī)師B 2 次測(cè)量結(jié)果,經(jīng)Bland-Altman 獲取描述統(tǒng)計(jì)量CR 值(重復(fù)性系數(shù))及Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)所得P值顯示,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),說(shuō)明再次測(cè)量具有較高的可重復(fù)性(表3)。
圖3 Bland-Altman 圖 圖3a 醫(yī)師A 與醫(yī)師B 獲得的熵的Bland-Altman 圖 圖3b 醫(yī)師B 先后2 次獲得的熵的Bland-Altman 圖 圖3c醫(yī)師A 與醫(yī)師B 獲得的球形度的Bland-Altman 圖 圖3d 醫(yī)師B 先后2 次獲得的球形度的Bland-Altman 圖 圖3e 醫(yī)師A 與醫(yī)師B 獲得的相關(guān)性的Bland-Altman 圖 圖3f 醫(yī)師B 先后2 次獲得的相關(guān)性的Bland-Altman 圖
表3 醫(yī)師B 分割腫瘤參數(shù)的可重復(fù)性評(píng)價(jià)()
表3 醫(yī)師B 分割腫瘤參數(shù)的可重復(fù)性評(píng)價(jià)()
注:CR 表示低于該值的2 個(gè)測(cè)量值之間的絕對(duì)差異,概率為0.95。
較低級(jí)別膠質(zhì)瘤為WHO 2~3 級(jí),通常為彌漫性星形細(xì)胞瘤或少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤(或混合型),是具有高度異質(zhì)性的腦內(nèi)原發(fā)性腫瘤,具有復(fù)雜、重疊和多樣的生物行為[11]。由于WHO 2 級(jí)膠質(zhì)瘤在常規(guī)MRI 上表現(xiàn)無(wú)特異性(通常邊界不清,占位效應(yīng)不顯著,注射釓劑后無(wú)對(duì)比增強(qiáng)),且易發(fā)生間變繼而發(fā)展為WHO 3 級(jí)膠質(zhì)瘤,直接影響預(yù)后判斷。因此,在臨床中對(duì)較低級(jí)別膠質(zhì)瘤的診斷和鑒別一直存在著較大困難[12]。2012 年Lambin 教授提出的影像組學(xué)[3],很好地彌補(bǔ)了這一缺陷,其結(jié)合MRI 序列可反映腦腫瘤的空間和時(shí)間異質(zhì)性。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,影像組學(xué)在預(yù)測(cè)腦腫瘤的分子特征[13-14]和腫瘤分級(jí)方面[15]均顯示出很大潛力,但影像組學(xué)的應(yīng)用和評(píng)價(jià)也同樣面臨著巨大挑戰(zhàn),如觀察者對(duì)ROI 勾畫(huà)分割的一致性和可重復(fù)性評(píng)價(jià)。只有最大限度減少觀察者間或觀察者內(nèi)存在的顯著差異,才可對(duì)后期模型建立的準(zhǔn)確性提供有效保障。目前,一些臨床研究忽略了或模糊了這一評(píng)價(jià),其建立的影像組學(xué)模型投放到多中心的考驗(yàn)中是否得到與模型相同的泛化能力,還有待商榷。因此,本研究排除WHO 1 級(jí)(預(yù)后良好)和WHO 4 級(jí)(預(yù)后極差)的膠質(zhì)瘤,對(duì)生物學(xué)行為相近的較低級(jí)別膠質(zhì)瘤進(jìn)行影像組學(xué)一致性和可重復(fù)性研究,具有良好的臨床價(jià)值和實(shí)踐意義。
研究表明,半自動(dòng)分割配合手動(dòng)勾畫(huà)ROI 可取得與單一手動(dòng)分割相近的效果,且組合分割耗時(shí)少,觀察者不易視覺(jué)疲勞,可大大減少其在勾畫(huà)中所產(chǎn)生的系統(tǒng)誤差[16-17]。但由于本研究?jī)H78 例,故仍選用被視為金標(biāo)準(zhǔn)的手動(dòng)分割。
本研究觀察者間和觀察者內(nèi)一致性均很好,平均ICC 分別為0.937±0.068、0.978±0.022,優(yōu)于既往文獻(xiàn)[18-20],原因可能為:①2 名醫(yī)師屬一家醫(yī)療機(jī)構(gòu)同一部門(mén),且職業(yè)背景和工作經(jīng)驗(yàn)相近;②2 名醫(yī)師勾畫(huà)腫瘤前,對(duì)其規(guī)定了勾畫(huà)規(guī)則,即對(duì)浸潤(rùn)彌漫生長(zhǎng)的膠質(zhì)瘤先在T2WI 圖像勾畫(huà)腫瘤實(shí)性區(qū)域,再配準(zhǔn)至CE-T1WI 圖像進(jìn)行特征提取。
ICC 和Bland-Altman 圖在展示觀察者一致性上具有相同的效果,前者量化為數(shù)值表示,后者可視化地展示出結(jié)果。在某種程度上,良好的一致性可間接反映為具有較好的重復(fù)性,兩者呈正相關(guān)。本研究中,醫(yī)師B 的2 次測(cè)量顯示出很高的可重復(fù)性,其中一階參數(shù)中的平均值和對(duì)比度具有較高的穩(wěn)定性,與Jang 等[21]的研究有所不同,這可能由于研究對(duì)象和特征提取序列不同而產(chǎn)生的重復(fù)性差異。
本研究的不足之處:①樣本量較小,應(yīng)進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量,納入更多的影像組學(xué)特征進(jìn)行全面分析,包括基于小波的特征研究。②特征提取序列單一,僅對(duì)CE-T1WI 序列進(jìn)行特征提取,如用多模態(tài)MRI 影像組學(xué)的研究模式可納入更多序列的不同特征參數(shù),提高一致性和重復(fù)性評(píng)價(jià)。③僅采用同一醫(yī)院經(jīng)病理診斷為較低級(jí)別膠質(zhì)瘤(WHO 2~3 級(jí))的患者資料,為單中心數(shù)據(jù),如采用多中心影像資料、多中心觀察者進(jìn)行研究,可大大提高結(jié)論的可靠性。
綜上所述,基于ROI 手動(dòng)分割對(duì)較低級(jí)別膠質(zhì)瘤進(jìn)行MRI 影像組學(xué)特征的提取,在觀察者間和觀察者內(nèi)均具有良好的一致性,且在觀察者內(nèi)具有較高的可重復(fù)性,這為今后其他學(xué)者構(gòu)建較低級(jí)別膠質(zhì)瘤的MRI 影像組學(xué)模型提供了一定保障。