魯 萍,于龍政
1.延邊大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科,吉林延吉 133002;2. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林延吉 133002;3.東北寒區(qū)肉??萍紕?chuàng)新教育部工程研究中心,吉林延吉 133002
隨著抗生素的廣泛應(yīng)用,出現(xiàn)藥物殘留、機(jī)體耐藥性的產(chǎn)生等諸多問(wèn)題。因此,目前積極開(kāi)展替代抗生素的微生態(tài)制劑的研究。微生態(tài)制劑是從自然界中分離得到的有益微生物,通過(guò)微生物工程工藝制作成含有活菌或其代謝物的活菌劑。微生態(tài)制劑可以平衡宿主腸道內(nèi)的微生物菌群,調(diào)節(jié)免疫力,其代謝物可以抑制病原菌,具有安全、無(wú)藥物殘留、有利于動(dòng)物的生長(zhǎng)繁殖等優(yōu)點(diǎn),被廣泛重視和應(yīng)用。解淀粉類芽孢桿菌是廣泛存在于自然界中的桿菌,解淀粉類芽孢桿菌的分離鑒定報(bào)道較多,但多數(shù)是從植物中分離。反芻動(dòng)物的瘤胃中棲息著多種微生物群,本試驗(yàn)旨在從羊瘤胃內(nèi)分離菌源,對(duì)其進(jìn)行菌種鑒定、生長(zhǎng)情況、耐酸、耐膽鹽、抑菌作用等研究,以期為微生態(tài)制劑的開(kāi)發(fā)提供參考。
教學(xué)牧場(chǎng)的羊瘤胃內(nèi)容物,RCM培養(yǎng)基、藥敏紙片購(gòu)自青島海博生物技術(shù)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自天根生物有限公司,大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、沙門(mén)氏菌為實(shí)驗(yàn)室從腹瀉病例分離菌株。
1.2.1 菌株的分離純化
從教學(xué)牧場(chǎng)的羊瘤胃瘺管處采集羊瘤胃內(nèi)容物物,用無(wú)菌PBS稀釋后80 ℃水浴加熱10 min。熱處理后的內(nèi)容物涂布在RCM固體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)24 h。挑取菌落,反復(fù)純化分離3次,得到純培養(yǎng)物。對(duì)純培養(yǎng)物進(jìn)行革蘭氏染色鏡檢。
1.2.2 分子生物學(xué)鑒定
對(duì)分離純化的菌進(jìn)行16S rRNA鑒定分析。用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取菌株DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物為細(xì)菌16S rRNA基因通用引物,上游引物 27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGTCAGAACGAACG CT-3',下游引物1492R:5'-TACGGCTACCTTGTTACGA CTTCACCCC-3'。PCR擴(kuò)增采用20 μL反應(yīng)體系,其中:2×Taq Mix 10 μL,10 nM引物各1 μL,菌液DNA 2 μL,ddH2O 6 μL。PCR擴(kuò)增的反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 1 min,56 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);最后在72 ℃延伸10 min。將PCR產(chǎn)物送至吉林省庫(kù)美生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中的BLAST工具對(duì)序列進(jìn)行比對(duì),應(yīng)用軟件Clustalx和MEGA建立系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
1.2.3 生長(zhǎng)曲線測(cè)定
挑取分離純化的單個(gè)菌落接種到液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),制成菌懸液。菌液按照2%的接種量接種到新的RCM液體培養(yǎng)基中,并每隔2 h取樣品,測(cè)定其菌液的OD值,38 h后繪制出該菌的生長(zhǎng)曲線。
1.2.4 耐酸和耐膽鹽能力測(cè)定
耐酸試驗(yàn):pH為7.0的PBS用0.1 mol/L的鹽酸分別調(diào)節(jié)pH至4.0、3.0、2.0,高壓滅菌。取菌懸液0.1 mL,分別加入到裝有9.9 mL上述pH的PBS試管中(3次平行試驗(yàn)),制成菌懸液,并在37 ℃搖床培養(yǎng)3 h。做3個(gè)稀釋度,各取100 μL培養(yǎng)液涂在普通瓊脂培養(yǎng)基平板上,37 ℃培養(yǎng)24 h,平板菌落計(jì)數(shù)。以原菌液作為對(duì)照,計(jì)算菌株的存活率。
耐膽鹽試驗(yàn):分別稱取豬膽鹽,加入PBS溶解,使其濃度分別為0.1%、0.2%和0.3%,高壓滅菌后備用。取菌懸液0.1 mL,加入到裝有9.9 mL上述濃度的豬膽鹽溶液的試管中(3次平行試驗(yàn)),充分混勻,在37℃搖床培養(yǎng)3 h。做3個(gè)稀釋度,取100 μL培養(yǎng)液涂布在普通瓊脂培養(yǎng)基平板上,37 ℃培養(yǎng)24 h,平板菌落計(jì)數(shù)。以原菌液作為對(duì)照,計(jì)算菌株的存活率。
1.2.5 抑菌試驗(yàn)
將大腸桿菌、沙門(mén)氏菌和金黃色葡萄球菌為指示菌,測(cè)試分離菌的抑菌特性。將分離菌株在平皿上點(diǎn)種,培養(yǎng)過(guò)夜,按照每7 mL的0.7%軟瓊脂接種300 μL指示菌為比例,接種指示菌,37 ℃培養(yǎng)24 h,測(cè)量抑菌圈直徑。
羊瘤胃中分離純化的菌株Y1在RCM培養(yǎng)上菌落呈現(xiàn)圓形、邊緣不整、淡黃色、不透明、大菌落。革蘭氏染色后菌株Y1呈紫色、短桿狀,為革蘭氏陽(yáng)性菌。
提取菌液DNA,經(jīng)27 F和1 492 R引物PCR擴(kuò)增,得到1.5 kb左右的PCR產(chǎn)物。PCR產(chǎn)物純化后測(cè)序。將菌株Y1的16S rRNA序列在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),應(yīng)用Lasergene軟件進(jìn)行同源性分析,菌株Y1與解淀粉類芽孢桿菌(GenBank No.MK618627, KC355293)同源性最高,為99.7%。應(yīng)用軟件Clustalx構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹(shù),應(yīng)用MEGA軟件繪制遺傳進(jìn)化樹(shù)(圖1)。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn),菌株Y1與解淀粉類芽孢桿菌遺傳距離最近,處于同一進(jìn)化分支上;與解淀粉芽孢桿菌(GenBank No.KY357304)和枯草芽孢桿菌(GenBank No.X60646)不在同一分支上。
圖1 菌株Y1的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
菌液經(jīng)過(guò)培養(yǎng),每隔2 h取樣品,測(cè)定其菌液的OD值,繪制生長(zhǎng)曲線。由Y1生長(zhǎng)曲線可知,經(jīng)過(guò)4 h生長(zhǎng)遲緩期,進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期。在14 h進(jìn)入穩(wěn)定生長(zhǎng)期,34 h后進(jìn)入衰落期。
經(jīng)過(guò)不同pH的PBS處理,在37 ℃培養(yǎng)3 h之后,在pH 2.0、3.0、4.0的存活率分別為0、0.15%、51.23%。該菌在pH 3.0條件下可存活,但存活率低。在pH 4.0條件下存活率可達(dá)50%以上。
經(jīng)過(guò)不同濃度的豬膽鹽在37 ℃培養(yǎng)3 h之后,在0.1%(w/v)豬膽鹽條件下細(xì)菌存活率83.4%,0.2%豬膽鹽條件下細(xì)菌存活率為75.3%,0.3%豬膽鹽條件下細(xì)菌存活率為66.5%,隨著膽鹽濃度的增加,存活率下降,但仍保持在60%以上,具備耐膽鹽特性。
以大腸桿菌、沙門(mén)氏菌和金黃色葡萄球菌為指示菌,檢測(cè)該菌的抑菌效果。結(jié)果沒(méi)有抑菌圈出現(xiàn),表明分離到的菌對(duì)大腸桿菌、沙門(mén)氏菌和金黃色葡萄球菌沒(méi)有抑菌作用。
本研究從羊瘤胃內(nèi)容物中分離到一菌株,經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)觀察和16S rRNA鑒定,該菌株與解淀粉類芽孢桿菌形態(tài)相同,革蘭氏陽(yáng)性菌,同源性高達(dá)99.7%、遺傳距離最近,鑒定為解淀粉類芽孢桿菌。
解淀粉類芽孢桿菌培養(yǎng)2 h后進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,在培養(yǎng)14 h后進(jìn)入穩(wěn)定期;在pH 4.0條件下存活率可達(dá)50%以上,在0.3%豬膽鹽條件下細(xì)菌存活率為60%以上,表明該菌的生長(zhǎng)規(guī)律適合腸道內(nèi)繁殖。為進(jìn)一步幫助機(jī)體消化吸收提供基礎(chǔ)。
大腸桿菌、沙門(mén)氏菌和金黃色葡萄球菌是腸道主要致病菌。本試驗(yàn)分離純化的解淀粉類芽孢桿菌對(duì)大腸桿菌、沙門(mén)氏菌和金黃色葡萄球菌均無(wú)抑制作用。這結(jié)果與王政露等人報(bào)道的解淀粉芽孢桿菌的結(jié)果一致,然而也有報(bào)道解淀粉芽孢桿菌對(duì)大腸桿菌和沙門(mén)氏菌均有抑制作用。這可能與菌株差異有關(guān),因此在開(kāi)發(fā)益生菌劑時(shí)應(yīng)選擇對(duì)腸道病原菌具有良好抑制作用的菌株。