徐曉晴,周 倩,孫建華,孫麗霞,馮學(xué)珍, 2,徐永芳,童張法,廖丹葵*
1. 廣西石油資源加工及過程加強(qiáng)化技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,廣西 南寧 530000 2. 廣西科技大學(xué)醫(yī)學(xué)部,廣西 柳州 545006
高血壓作為最常見的慢性病,對人類健康產(chǎn)生嚴(yán)重威脅,已成為全球重要的公共衛(wèi)生問題[1]。 血管緊張素轉(zhuǎn)化酶活性過高會使血壓升高,通過抑制血管緊張素轉(zhuǎn)化酶(angiotensin-Ⅰ converting enzyme,ACE)的活性降低血壓已證明是治療高血壓的有效方法之一,ACE抑制劑類藥物如卡托普利等具有較好的降壓效果,但會引起咳嗽、 皮疹等副作用[2]。 近年來,從食源性蛋白中分離出多種ACE抑制肽,與化學(xué)合成的降血壓藥物相比,具有副作用小、 吸收好等優(yōu)點(diǎn)[3],可在一定范圍內(nèi)有效改善調(diào)節(jié)血壓。
以往研究多集中在ACE抑制肽的提取與鑒定,關(guān)于ACE與抑制肽在分子水平上相互作用的研究還處于起步階段,而兩者的作用機(jī)制研究是研發(fā)新藥的基礎(chǔ)。 Yan等[4]通過3D-QSRA、 分子對接和分子動(dòng)力學(xué)研究了C-末端為色氨酸的ACE抑制肽VKW與GTW和ACE相互作用,結(jié)果表明ACE-VKW復(fù)合物比ACE-GTW復(fù)合物更穩(wěn)定,因此VKW與ACE具有更高的親和力和活性。 Lan等[5]利用光譜法、 等溫滴定量熱及分子對接模擬研究了GF-6與ACE的相互作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)GF-6主要通過氫鍵作用結(jié)合在ACE非活性部位。 迄今為止,仍有大量ACE抑制肽與ACE的作用機(jī)制缺乏研究。
熒光光譜、 紫外-可見吸收光譜可以分析蛋白質(zhì)大分子與小分子作用類型,分析蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變,是研究分子間相互作用的重要方法[6]。 圓二色譜可以表征蛋白質(zhì)分子與小分子結(jié)合前后二級結(jié)構(gòu)的改變。 等溫滴定量熱法(isothermal titration calorimetry,ITC)可根據(jù)焓變與熵變的不同推測結(jié)合驅(qū)動(dòng)力等信息,更加深入了解大分子與小分子結(jié)合的作用機(jī)制。 分子對接可以有效分析蛋白質(zhì)大分子與小分子的相互作用[7]。 本工作采用多光譜法、 等溫滴定量熱以及分子對接研究分析ACE與LKP相互作用機(jī)理,為ACE抑制肽的應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
試劑: 豬肺ACE由本實(shí)驗(yàn)室自提(1.23 U·mg-1),用pH 7.0 HEPES緩沖溶液(含0.3 mol·L-1NaCl)配制成2.0×10-6mol·L-1的儲備液,LKP(純度>98%,經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證IC500.32 μmol·L-1由上海拜爾迪公司合成),用上述緩沖液配制成0.01 mol·L-1的儲備液。 HEPES(上海麥克林公司),NaCl(四川成都科隆有限公司)。
儀器: Nano等溫滴定量熱儀(美國TA公司); UV-2501PC紫外可見分光光度計(jì)(日本島津公司); MOS-450圓二色譜儀(法國Biologi公司); SF QY-9000熒光分光光度計(jì)(北京卓立漢光儀器公司)。
1.2.1 熒光及紫外光譜分析
ACE的濃度為1.0×10-6mol·L-1,加入不同濃度的LKP,以相應(yīng)濃度的LKP溶液為參比,設(shè)置激發(fā)波長為280 nm,激發(fā)與發(fā)射狹縫均為5 nm,在不同溫度(288,293和298 K)下,掃描反應(yīng)體系300~500 nm的發(fā)射光譜,研究LKP對ACE的猝滅機(jī)制。
以相應(yīng)濃度的LKP溶液為參比,掃描200~350 nm的紫外吸收光譜,研究在不同溫度(288,293和298 K)下,ACE-LKP體系光譜變化規(guī)律。
1.2.2 圓二色譜
ACE的濃度為1.0×10-6mol·L-1,用HEPES緩沖液進(jìn)行背景測試,用0.1 cm比色皿測定190~260 nm的CD譜。 研究LKP對ACE二級結(jié)構(gòu)的影響。
1.2.3 等溫滴定量熱
將250 μL ACE(0.4×10-6mol·L-1)溶液注入樣品池,LKP(2.8×10-3mol·L-1)裝入注射器,待溫度(288,293和298 K)穩(wěn)定后,開始向樣品池中連續(xù)滴加20滴LKP溶液,每滴2.5 μL,研究ACE與LKP的相互作用。
1.2.4 分子對接
使用軟件Auto Dock Vina進(jìn)行分子對接模擬。 LKP的結(jié)構(gòu)使用Chemdraw生成并優(yōu)化。 ACE的晶體結(jié)構(gòu)在 Protein Data Bank (http://www.rcsb.org/pdb)下載。 對接運(yùn)行后獲得具有最低結(jié)合能的構(gòu)象。 對接結(jié)果及相互作用力分析使用PyMOL(De Lano Scientific LLC, USA)軟件,研究LKP與ACE結(jié)合機(jī)制。
ACE的熒光主要是由色氨酸、 酪氨酸以及苯丙氨酸殘基發(fā)出,在不同溫度下,不同濃度LKP與ACE作用的熒光光譜如圖1(a—c)所示。
圖1 不同溫度下ACE與LKP結(jié)合的熒光發(fā)射光譜(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)= 1.0×10-6 mol·L-1Fig.1 Fluorescence emission spectra of ACEwith LKP at different temperatures(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)= 1.0×10-6 mol·L-1
由圖1結(jié)果可知,隨著LKP濃度的增加,ACE的熒光強(qiáng)度不斷降低,表明LKP能引起ACE的熒光猝滅,熒光猝滅過程分為靜態(tài)猝滅與動(dòng)態(tài)猝滅[8]。 做不同溫度下F0/F對[Q]的Stern-Volmer曲線[9](F0: 未加猝滅劑;F: 加猝滅劑熒光強(qiáng)度),結(jié)果如圖2。
由表1可知,隨溫度升高猝滅常數(shù)Ksv減小,且Kq均遠(yuǎn)大于2.0×1010L·s-1·mol-1(Kq: 猝滅過程速率常數(shù))由此判斷LKP對ACE的猝滅機(jī)制為靜態(tài)猝滅。 此外,隨LKP濃度的增加,ACE最大發(fā)射峰位置先紅移后藍(lán)移,說明ACE熒光生色基團(tuán)所處的微環(huán)境發(fā)生改變。 為進(jìn)一步研究LKP對ACE蛋白空間構(gòu)象的影響,采用紫外-可見吸收光譜和圓二色譜進(jìn)行分析。
圖2 ACE與LKP結(jié)合的Stern-Volmer圖Fig.2 The Stern-Volmer plots of ACE with LKP
表1 不同溫度下ACE與LKP結(jié)合的猝滅常數(shù)Table 1 Quenching constants of ACE withLKP at different temperatures
2.2.1 紫外可見吸收光譜
不同溫度下,ACE與LKP結(jié)合的紫外可見吸收光譜如圖3(a—c)所示。
由圖3可知,ACE的吸收光譜具有兩個(gè)吸收峰,221 nm處的強(qiáng)吸收峰為肽主鏈的特征峰,280 nm處的弱吸收峰為芳香族氨基酸的特征峰[10]。 隨著LKP濃度的升高,ACE的吸收光譜發(fā)生減色效應(yīng),221 nm吸收峰紅移,溫度越高移動(dòng)越明顯,分析認(rèn)為LKP的π*空軌道與ACE分子上氨基酸殘基的π電子軌道之間發(fā)生偶合,導(dǎo)致能級下降[11],以及芳香族氨基酸殘基所處的微環(huán)境發(fā)生改變[12]。 由此說明ACE與LKP結(jié)合生成復(fù)合物,使ACE的構(gòu)象改變。
2.2.2 圓二色譜
不同的二級結(jié)構(gòu)產(chǎn)生的圓二色譜CD譜帶的位置以及吸收強(qiáng)弱都是不同的[13]。 為進(jìn)一步了解LKP對ACE蛋白構(gòu)象的影響,測量LKP與ACE結(jié)合的CD光譜,結(jié)果如圖4所示。
采用CDpro軟件對CD數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,ACE的二級結(jié)構(gòu)含量由大到小依次是: 無規(guī)則卷曲,β-折疊,β-轉(zhuǎn)角,α-螺旋。 其中α-螺旋含量由10.8%降至0.1%后上升至10.2%; β-折疊由22.9%升至38.8%后降到34.8%; β-轉(zhuǎn)角由13.8%降至9.5%后升到11%; 無規(guī)則卷曲由49.4%升至50.8%后降至41.5%。 說明當(dāng)LKP含量較少時(shí),ACE的二級結(jié)構(gòu)是由α-螺旋逐漸向β-折疊與無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變,說明ACE肽鏈結(jié)構(gòu)逐漸舒展,結(jié)構(gòu)變得松散; LKP逐漸增加后,肽鏈結(jié)構(gòu)又進(jìn)行了折疊收縮,結(jié)構(gòu)變得緊密,最終ACE的空間結(jié)構(gòu)比未加入LKP時(shí)松散,表明LKP能夠使ACE的二級結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著變化,原因可能為LKP與ACE結(jié)合使蛋白質(zhì)原有的氫鍵網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,引起肽鏈的重排,從而導(dǎo)致空間構(gòu)象的改變。
圖3 不同溫度下ACE與LKP結(jié)合的紫外吸收光譜(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)=1.0×10-6 mol·L-1,c(LKP)(0—4): 0,0.28,1.4,2.8,4.2×10-3 mol·L-1Fig.3 UV absorption spectra of ACE withLKP at different temperatures(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)=1.0×10-6 mol·L-1,c(LKP)(0—4): 0,0.28,1.4,2.8,4.2×10-3 mol·L-1
LKP與ACE作用的等溫滴定量熱曲線圖如圖5(a—c),采用NanoAnalyze軟件分析得到的熱力學(xué)參數(shù)列于表2。
由公式ΔG=ΔH-TΔS可知,吉布斯自由能的變化ΔG包括兩個(gè)部分,即焓變項(xiàng)(ΔH)和熵變項(xiàng)(-TΔS)。 由表2結(jié)果可知,ΔG<0證明反應(yīng)具有自發(fā)性,ΔH>0說明LKP與ACE的結(jié)合過程是吸熱的。 ΔS值大說明有較大的疏水作用,因此結(jié)合力主要表現(xiàn)為疏水作用力。 三個(gè)溫度下,|-TΔS|>|ΔH|,說明LKP與ACE的結(jié)合主要以熵驅(qū)動(dòng)為主,ΔCp為較大的負(fù)值,說明LKP與ACE結(jié)合屬于非剛性結(jié)合,結(jié)合過程中ACE表面的疏水基團(tuán)被親水基團(tuán)包埋,蛋白質(zhì)產(chǎn)生的空間構(gòu)象變化使得表面的結(jié)合位點(diǎn)不能再和抑制肽結(jié)合。 288 K時(shí),LKP與ACE的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)為0.131,與另外兩個(gè)溫度的結(jié)果差異較大是因?yàn)闇囟容^低導(dǎo)致ACE失活嚴(yán)重,因此與LKP的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)較小。 隨著溫度的升高,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)逐漸增大,溫度升高會使ACE的空間構(gòu)象發(fā)生變化,ACE的肽鏈伸展,使氨基酸殘基暴露出來,更有利于與LKP的結(jié)合。
圖4 ACE與LKP結(jié)合的圓二色譜圖298 K, c(ACE)= 1.0×10-6 mol·L-1Fig.4 CD spectra of ACE with LKP298 K, c(ACE)= 1.0×10-6 mol·L-1
圖5 不同溫度下LKP滴定ACE的熱流曲線圖(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)=0.4 μmol·L-1,c(LKP)=2.8 mmol·L-1Fig.5 The heat flow of binding LKP to ACE(a)—(c): 288,293,298 K,c(ACE)=0.4 μmol·L-1,c(LKP)=2.8 mmol·L-1
表2 LKP與ACE結(jié)合的熱力學(xué)參數(shù)Table 2 Thermodynamics parameter of binding of LKP and ACE
實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,LKP與ACE的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)約為1,與ACE的抑制劑卡托普利、 依那普利等的結(jié)合位點(diǎn)數(shù)相近,但LKP與ACE的結(jié)合常數(shù)都遠(yuǎn)小于卡托普利、 依那普利等抑制劑與ACE的結(jié)合常數(shù)[14]。 卡托普利、 依那普利等藥物的分子結(jié)構(gòu)中的官能團(tuán)能夠和鋅離子結(jié)合形成穩(wěn)定的多面體結(jié)構(gòu),這個(gè)作用過程對親和力的影響非常大[15]。 說明LKP是與活性中心的結(jié)合口袋發(fā)生作用,沒有和鋅離子結(jié)合。 綜上所述,LKP與ACE的活性中心結(jié)合作用,反應(yīng)為自發(fā)進(jìn)行的吸熱過程,主要驅(qū)動(dòng)力為熵驅(qū)動(dòng),結(jié)合作用力為疏水作用力。
選擇tACE作為蛋白質(zhì)大分子,以鋅離子為中心設(shè)置結(jié)合口袋中心,調(diào)整結(jié)合口袋體積,對接盒子范圍為(40 ?×40 ?×40 ?)。 LKP與ACE的對接結(jié)果如圖6(a,b)所示,結(jié)構(gòu)能量為-7.5 kcal·m-1。
圖6 LKP與ACE的分子對接(a): LKP與ACE的對接模型;(b): LKP與ACE分子上氨基酸殘基的相互作用Fig.6 The docking simulation of LKP binding to ACE(a): The docking simulation of LKP binding to ACE;(b): The interaction between LKP and the residues of ACE is shown
通過多光譜法結(jié)合等溫滴定量熱實(shí)驗(yàn)、 分子對接等方法研究LKP與ACE相互作用。 熒光光譜表明LKP通過靜態(tài)猝滅機(jī)制有效猝滅ACE的內(nèi)源熒光。 紫外可見吸收光譜、 圓二色譜實(shí)驗(yàn)表明,在抑制肽LKP的作用下,ACE二級結(jié)構(gòu)比未加入LKP時(shí)疏松,LKP對ACE的空間構(gòu)象具有顯著影響。 ITC實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,LKP與ACE為非剛性結(jié)合,是由熵驅(qū)動(dòng)的自發(fā)吸熱反應(yīng),主要作用力為疏水作用。 分子對接模擬表明LKP通過疏水作用與ACE在活性中心S1口袋進(jìn)行結(jié)合。 本研究有助于了解ACE與其抑制肽相互作用機(jī)理,為開發(fā)新的治療高血壓藥物提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。