王玉文 周雅琪 宋宗義 趙永麗
甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是甲狀腺惡性腫瘤中最常見的組織類型,其發(fā)生率在過去幾十年中一直在穩(wěn)步上升[1,2]。盡管大多數(shù)病例具有良好的預(yù)后和治療反應(yīng),但高達(dá)30%的患者在10年內(nèi)出現(xiàn)局部復(fù)發(fā)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移[3]。微小RNA(microRNA,miRNA)是一組具有18~25個序列,沒有編碼能力的單鏈RNA,可以通過與目標(biāo)mRNA的3′非翻譯區(qū)(untranslated region,UTR)結(jié)合,參與轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)[4]。miRNA調(diào)節(jié)細(xì)胞周期及多種基本生理過程,包括細(xì)胞凋亡、增殖、遷移、侵襲和分化,并且miRNA表達(dá)或功能在各種惡性腫瘤(包括PTC在內(nèi)的)中失調(diào)[5,6]。miR-204-5p通過靶向HMGB1抑制甲狀腺乳頭狀癌K1細(xì)胞增殖、侵襲和遷移[7]。最近的基因芯片的測序結(jié)果顯示miR-204-5p在PTC中下調(diào)[8]。然而,miR-204-5p在PTC中的生物學(xué)功能和潛在機(jī)制未知。
白細(xì)胞介素11(interleukin 11,IL-11)是一種屬于多功能IL-6細(xì)胞因子家族的造血細(xì)胞因子,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移中起重要作用[9,10]。IL-11的高表達(dá)對乳腺癌、胃癌和細(xì)胞性腎細(xì)胞癌等惡性腫瘤細(xì)胞的增殖和侵襲具有促進(jìn)作用[11~13]。本研究旨在探討miR-204-5p在PTC中抗癌角色和生物學(xué)功能。
1.主要試劑和儀器:DMEM培養(yǎng)基購自美國Thermo Scientific公司;psiCHECK-2熒光素酶載體購自美國Promega公司;miR-204-5p模擬物(miR-204-5p)、miR-204-5p陰性對照(miR-neg)、miR-204-5p抑制劑(anti-miR-204-5p)和抑制劑對照(anti-miR-neg)購自南京凱基生物科技發(fā)展有限公司;Lipofectamine 3000購自美國Invitrogen公司;聚凝胺購自美國Sigma公司;miRNeasy Mini試劑盒購自德國Qiagen公司;SuperScript Ⅲ反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自美國Invitrogen公司;ABI 7900HT熒光定量PCR儀購自美國Applied Biosystems公司;SYBR Premix Ex Taq Ⅱ購自中國大連TaKaRa公司;MTT試劑盒購自美國Invitrogen公司;IX81倒置顯微鏡購自日本Olympus公司;FACScan流式細(xì)胞儀購自美國BD Biosciences公司;Annexin V-FITC/PI細(xì)胞凋亡檢測試劑盒購自美國BD Biosciences公司;雙熒光素酶報告系統(tǒng)購自美國Promega公司;BCA試劑盒購自北京索萊寶生物工程有限公司;白細(xì)胞介素11(interleukin 11,IL-11)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)購自英國Abcam公司;辣根過氧化物酶偶聯(lián)的山羊抗兔IgG購自美國Santa Cruz Biotechnology公司;ECL發(fā)光系統(tǒng)購自美國Amersham Biosciences公司。
2.細(xì)胞培養(yǎng):人PTC細(xì)胞系(TCP-1和BCPAP)、人甲狀腺正常細(xì)胞NTHY-ORI 3-1和HEK293T購自美國ATCC細(xì)胞庫,在含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基中于37℃和5% CO2中培養(yǎng)。
3.載體構(gòu)建:miR-204-5p、miR-neg、anti-miR-204-5p和anti-miR-neg從商業(yè)公司獲得,并通過測序驗證結(jié)果。根據(jù)說明書,Lipofectamine 3000用于轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染序列如下:miR-204-5p: 5′-UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU-3′; anti-miR-204-5p: 5′-AGGCAUAGGAUGACAAAGGGAA-3′。
4.慢病毒轉(zhuǎn)染:將含有pre-miR-204-5p的450bp片段克隆到pWPXL載體中以生成pWPXL-miR-204。使用Lipofectamine 3000將pWPXL或pWPXL-miR-204-5p構(gòu)建體與所對應(yīng)的包裝質(zhì)粒psPAX2或pMD2G共轉(zhuǎn)染到HEK293T細(xì)胞中,48h后收集病毒顆粒。TPC-1細(xì)胞用含有8mg/ml聚凝胺的重組慢病毒轉(zhuǎn)染。通過qRT-PCR檢測穩(wěn)定的轉(zhuǎn)染基因表達(dá)。
5.qRT-PCR:根據(jù)制造商的說明,使用miRNeasy Mini試劑盒提取總RNA和miRNA。SuperScript Ⅲ反轉(zhuǎn)錄試劑盒用于將RNA轉(zhuǎn)錄成cDNA,并在ABI 7900HT熒光定量PCR儀上使用SYBR Premix Ex Taq Ⅱ進(jìn)行qRT-PCR。將靶基因表達(dá)水平標(biāo)準(zhǔn)化為內(nèi)部對照(U6或GAPDH)的水平,并由2-△△CT計算比較差異。引物序列如下:miR-204-5p 上游引物:5′-ACAATTGAACGTCCCTTTGCC-3′,下游引物:5′-CTCAACTGGTGTCGTGGA-3′;IL-11上游引物:5′-GGGAATTTGTCCCTCTGGCA-3′,下游引物:5′-CTGGGACTTAAGACCTCCAGC-3′;GAPDH 上游引物::5′-GCAACTAGGATGGTGTGGCT-3′,下游引物:5′-TCCCATTCCCCAGCTCTCATA-3′;U6上游引物:5′-CTAGATAATGGTGCTGATAGATGGA-3′,下游引物:5′-CGGTATAGCTGGACGCTCTG-3′。
6.細(xì)胞增殖和平板克隆試驗:使用MTT法測定法評估細(xì)胞活力,具體參照文獻(xiàn)所述[14]。簡而言之,將2×103個細(xì)胞培養(yǎng)在96孔板中,并在24、48、72和96h用20ml MTT(0.5mg/ml)染色4h。棄上清液,每孔加入200ml DMSO溶解沉淀。在490nm處測量吸光度。對于平板克隆試驗,將細(xì)胞以2×102個/孔接種在6孔板中并生長2周。形成的菌落用PBS洗滌,甲醇固定,0.5%結(jié)晶紫染色。在IX81倒置顯微鏡下計數(shù)菌落數(shù)。
7.細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡分析:對于細(xì)胞周期分析,收集2×105個轉(zhuǎn)染細(xì)胞,用70%乙醇固定并在4℃下孵育過夜。洗滌后,細(xì)胞用RNase A(100mg/ml)處理30min,然后用PI(50mg/ml)在暗室中染色30min。使用FACScan流式細(xì)胞儀分析細(xì)胞周期分布。使用Annexin V-FITC/PI細(xì)胞凋亡檢測試劑盒評估細(xì)胞凋亡。
8.雙熒光素酶報告基因分析:HEK293T細(xì)胞在96孔板中培養(yǎng),并用50ng野生型(WT)或突變(MUT)IL-11 3′-UTR構(gòu)建體或50mmol/L miR-neg或miR-204-5p mimic共轉(zhuǎn)染。48h后收集細(xì)胞,并用雙熒光素酶報告系統(tǒng)測量海腎熒光素酶活性。
9.Western blot法檢測:裂解細(xì)胞并使用BCA法測量蛋白質(zhì)濃度。變性蛋白30mg通過12% SDS-PAGE分離并轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用5% 脫脂牛奶在Tris緩沖鹽水中室溫封閉1h,并與一抗孵育IL-11和GAPDH在4℃過夜,然后在常溫下孵育二抗辣根過氧化物酶偶聯(lián)的山羊抗兔IgG。通過化學(xué)ECL發(fā)光顯影蛋白質(zhì)條帶。
1.miR-204-5p在TPC-1和BCPAP細(xì)胞中表達(dá)下調(diào):筆者評估了正常人甲狀腺細(xì)胞NTHY-ORI 3-1和兩種PTC細(xì)胞中miR-204-5p的表達(dá)水平。qRT-PCR的結(jié)果顯示,與正常細(xì)胞比較,TPC-1和BCPAP細(xì)胞系中的miR-204-5p水平顯著降低(P<0.05,圖1)。這些數(shù)據(jù)表明miR-204-5p在PTC細(xì)胞中顯著下調(diào)。
圖1 miR-204-5p在TPC-1和BCPAP細(xì)胞中表達(dá)下調(diào)
2.miR-204-5p抑制TPC-1細(xì)胞增殖:由于miR-204-5p在TPC-1的表達(dá)水平更低,因此筆者選擇TPC-1進(jìn)行后續(xù)試驗。隨后筆者探索了miR-204-5p在TPC-1細(xì)胞中的生物學(xué)功能。TPC-1細(xì)胞用表達(dá)帶有miR-204-5p或者miR-neg的慢病毒感染,qRT-PCR驗證顯示,miR-204-5p在轉(zhuǎn)染細(xì)胞中的表達(dá)顯著增加(P<0.05,圖2)。MTT結(jié)果顯示,與轉(zhuǎn)染miR-neg細(xì)胞比較,細(xì)胞存活率明顯降低(P<0.05,圖3A),并且在平板克隆試驗中也顯示了轉(zhuǎn)染miR-204-5p可以降低細(xì)胞增殖率(P<0.05,圖3B)。
圖2 TPC-1細(xì)胞過表達(dá)處理后miR-204-5p表達(dá)水平
圖3 miR-204-5p抑制TPC-1細(xì)胞增殖
3.miR-204-5p促進(jìn)TPC-1細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯:流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示與miR-neg轉(zhuǎn)染細(xì)胞比較,轉(zhuǎn)染miR-204-5p增加了TPC-1的細(xì)胞凋亡率(P<0.05,圖4A)。并上調(diào)G0/G1的比值(P<0.05)和降低了S期細(xì)胞的比例(P<0.05,圖4B),表明miR-204-5p促進(jìn)了TPC-1在S2期的細(xì)胞阻滯。
圖4 miR-204-5p促進(jìn)TPC-1細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯
4.miR-204-5p通過靶向結(jié)合3′-UTR抑制IL -11表達(dá):TargetScanHuman 7.1預(yù)測了IL-11 3′-UTR與miR-204-5p存在高度保守的結(jié)合位點(圖5A)。雙熒光素酶報告分析結(jié)果顯示,miR-204-5p的轉(zhuǎn)染降低了野生型IL-11 3′-UTR的HEK293T細(xì)胞中的相對熒光素酶活性(P<0.05),但在轉(zhuǎn)染了3′-UTR且miR-204-5p突變結(jié)合位點的細(xì)胞中,該活性基本未改變(圖5B)。
圖5 miR-204-5p與IL-11 3′-UTR存在靶向關(guān)系
5.miR-204-5p與IL-11存在負(fù)性調(diào)節(jié)關(guān)系:qRT-PCR的結(jié)果顯示過表達(dá)miR-204-5p會降低IL-11 mRNA的水平(P<0.05),而敲減miR-204-5p則顯示出相反的結(jié)果(P<0.05,圖6),與mRNA的結(jié)果一致,蛋白表達(dá)也觀察到了類似的結(jié)果。
圖6 miR-204-5p與IL-11存在負(fù)性調(diào)節(jié)關(guān)系
miRNA通過調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)在癌癥的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用,它們可以在功能上區(qū)分為促癌因子和抑癌因子[15,16]。作為一種腫瘤抑制因子,miR-204-5p在結(jié)直腸癌中下調(diào)并與不良預(yù)后相關(guān),過表達(dá)miR-204-5p可抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲并誘導(dǎo)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化[17]。miR-204-5p可抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞的克隆生長、遷移和侵襲以及移植瘤體的生長[18]。本研究中miR-204-5p在PTC細(xì)胞中顯著降低。生物學(xué)功能分析表明,miR-204-5p可以抑制細(xì)胞活力和增殖能力,阻斷細(xì)胞周期進(jìn)程,增強(qiáng)細(xì)胞凋亡。
Wang等[19]研究發(fā)現(xiàn),IL-11通過NF-κB/microRNA-204/血小板生成素調(diào)節(jié)軸促進(jìn)了造血干細(xì)胞移植療法在再生障礙性貧血小鼠模型中的治療效果。miR-204-5p可以影響食管癌細(xì)胞和小鼠模型中的增殖、侵襲、凋亡和細(xì)胞周期[20]。既往研究顯示,IL-11與miR-204-5p存在負(fù)性調(diào)節(jié)關(guān)系。Tang等[20]研究表明,miR-204-5p與IL-11的表達(dá)呈負(fù)相關(guān),而IL-11的過表達(dá)逆轉(zhuǎn)了miR-204-5p在細(xì)胞系中的癌癥抑制作用。Liang等[21]研究顯示,IL-11是miR-204-5p的下游靶標(biāo),lncRNA脫氧鳥苷激酶反義RNA1(lncRNA deoxyguanosine kinase antisense RNA1,DGUOK-AS1)可以保護(hù)IL-11免受miR-204-5p介導(dǎo)的降解,從而起到促進(jìn)乳腺癌的發(fā)展進(jìn)程。在本研究中,筆者通過生物信息學(xué)預(yù)測和熒光素酶活性測定證實IL-11是miR-204-5p的靶標(biāo)。發(fā)現(xiàn)通過過表達(dá)或敲減miR-204-5p的表達(dá)分別可以引起IL-11的下調(diào)或者上調(diào),這表明了二者之前存在負(fù)性調(diào)節(jié)關(guān)系。在隨后的研究中筆者還會在其他類型的PTC細(xì)胞上進(jìn)行評估m(xù)iR-204-5p的生物學(xué)功能并進(jìn)行在體荷瘤實驗。
綜上所述,miR-204-5p作為腫瘤抑制因子,可能通過調(diào)控下游靶基因IL-11的表達(dá)來調(diào)控PTC細(xì)胞的生物學(xué)行為。結(jié)果表明,miR-204-5p可能是一種有用的診斷標(biāo)志物和潛在的治療分子。