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        基于隨機(jī)森林的洞庭湖苔草葉綠素含量估測研究

        2022-06-29 04:04:00
        林業(yè)科技情報(bào) 2022年2期
        關(guān)鍵詞:苔草葉綠素植被

        陳 斌

        (廣東生態(tài)工程設(shè)計(jì)研究院有限公司,廣州 510630)

        葉綠素是植被進(jìn)行光合代謝的重要載體,其含量與植被光能轉(zhuǎn)化、生理固碳等功能有著密切的聯(lián)系,是監(jiān)測植被生長狀況重要的生化參數(shù)之一,準(zhǔn)確快速地對葉綠素含量進(jìn)行定量估測對植被生境具有重要意義。高光譜遙感技術(shù)為估測植被葉綠素含量提供了極大的便利,當(dāng)前常用的方法主要可歸納為2種經(jīng)驗(yàn)?zāi)P秃臀锢砟P?。前者主要是基于植被光譜指數(shù)與葉綠素含量的經(jīng)驗(yàn)或半經(jīng)驗(yàn)關(guān)系,從而建立起有效的估算模型,該方法的主要優(yōu)點(diǎn)是建模方便,但模型的普適性較差。相比而言,物理模型具有較為清晰的機(jī)理,且模型通常具有一定的普適性,但該模型對調(diào)參的依賴高,尤其在缺參的條件下極大影響精度。總而言之,在植被葉綠素含量遙感估測研究方面,在方法上仍有進(jìn)一步改進(jìn)的空間。

        隨機(jī)森林(random forest, RF)可以很好地預(yù)測上千個解釋變量的貢獻(xiàn),不需過多調(diào)參,具有抗噪能力強(qiáng)、多元共線性不敏感等優(yōu)點(diǎn)。隨機(jī)森林算法已經(jīng)被廣泛應(yīng)用到各方面的研究[1-2]。當(dāng)前RF模型應(yīng)用于濕地植被葉綠素含量估測的相關(guān)研究還鮮有報(bào)道。該文以洞庭湖濕地最大的建群種植物—苔草為研究對象,以6種植被光譜指數(shù)為輸入變量,在R軟件平臺上建立葉綠素含量隨機(jī)森林估測模型,以期為植被葉綠素定量估測提供新的方法和思路。

        1 數(shù)據(jù)及方法

        1.1 數(shù)據(jù)采集

        利用FieldSpec 4便攜式地物光譜儀,于2018年11月1到3號對洞庭湖濕地最大的建群種—苔草(Carexcinerascens)的光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行采集。同時利用 SPAD-502葉綠素儀測定苔草葉綠素SPAD值。后續(xù)的實(shí)驗(yàn)中,劃分31組葉綠素SPAD值數(shù)據(jù)為訓(xùn)練樣本用以建模,另取30組數(shù)據(jù)用于檢驗(yàn)?zāi)P偷墓罍y效果[1-3]。

        1.2 植被光譜指數(shù)

        該文采用多種植被光譜指數(shù)作為RF模型的輸入變量,通過優(yōu)化模型的參數(shù),從而提高模型的預(yù)測精度。6種光譜指數(shù)具體表達(dá)及與SPAD值的相關(guān)系數(shù)如表1中所示。

        表1 植被光譜指數(shù)選取

        1.3 隨機(jī)森林的實(shí)現(xiàn)

        該研究基于R軟件平臺,運(yùn)行(1)中的命令以建立隨機(jī)森林模型,運(yùn)行(2)中的命令利用檢驗(yàn)樣本對模型估測效果進(jìn)行檢驗(yàn)。

        rf=randomForest(S1~.,data,ntree=1000,mtry=3)

        (1)

        predict(rf, new.data,type=”response”)

        (2)

        其中S1表示輸出變量,在該文中為葉綠素SPAD值;data表示輸入路徑;ntree表示隨機(jī)森林模型中單棵樹性能的樹節(jié)點(diǎn)預(yù)選變量個數(shù),一般ntree值應(yīng)不小于100;mtry表示分類樹每個節(jié)點(diǎn)用以二分?jǐn)?shù)據(jù)的自變量個數(shù),mtry值等于解釋變量數(shù)目的平方根。在該文中先采用mtry=3、ntree=1 000進(jìn)行建立模型。predict為預(yù)測分類函數(shù),其中rf為基于預(yù)測樣本的隨機(jī)森林建模結(jié)果,new.data在本文中表示輸入的檢驗(yàn)樣本,type表示對輸入樣本進(jìn)行預(yù)測[4-6]。

        1.4 模型性能評價方法

        該文根據(jù)三項(xiàng)指標(biāo)對模型結(jié)果做出評價,分別為平均絕對誤差(MAE)、平均誤差平方和(MSE)和相對誤差平方和(NMSE),指標(biāo)數(shù)值越小表示模型的預(yù)測值與真實(shí)值間的差異越小,隨機(jī)森林對葉綠素預(yù)測能力越強(qiáng)。三項(xiàng)指標(biāo)公式表示如(3)~(5)所示。

        (3)

        (4)

        (5)

        2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        圖1為基于隨機(jī)森林模型的葉綠素SPAD預(yù)測值和真實(shí)值間的相關(guān)圖。同時,將該模型效果與多元線性 (Multiple linear regression, MLR)和一元線性回歸模型(A linear regression, ALR)作為對比(圖2和表2)。結(jié)合圖表結(jié)果可見,RF模型對植被葉綠素SPAD預(yù)測效果優(yōu)于其它兩種模型。總而言之,RF模型表現(xiàn)出了優(yōu)越的預(yù)測性能[7-9]。

        圖1 基于RF的預(yù)測效果

        圖2 基于MLR的預(yù)測效果

        表2 光譜指數(shù)表現(xiàn)效果

        3 結(jié)論

        該文利用隨機(jī)森林模型對洞庭湖典型植被苔草的葉綠素進(jìn)行了估測。在該方法中,首先選取了6種植被光譜指數(shù)作為隨機(jī)森林模型的輸入變量,通過優(yōu)化模型參數(shù),進(jìn)而對植被葉綠素含量進(jìn)行估測,最后將該模型的估測效果與多元線性回歸模型進(jìn)行了比較分析[10-11]。研究表明,利用隨機(jī)森林模型可以很好地對植被葉綠素進(jìn)行估測,隨機(jī)森林模型構(gòu)建簡捷、數(shù)據(jù)處理能力強(qiáng)大。從模型預(yù)測的精度結(jié)果可以看出,相比較一元和多元線性回歸模型,隨機(jī)森林模型具有更優(yōu)的預(yù)測性能(R2=0.94)[12-13]。

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