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        柿單寧酶PsnTanA 異源表達(dá)及酶學(xué)特性表征

        2022-06-23 02:07:02盧海強(qiáng)田洪濤谷新晰谷子林

        盧海強(qiáng),陳 偉,田洪濤,谷新晰,谷子林

        (1.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 食品科技學(xué)院,河北 保定 071000;2.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 動物科技學(xué)院,河北 保定 071000)

        單寧酶(EC 3.1.1.20)是一類能夠水解單寧酯鍵和縮酚酸鍵酶的總稱[1],廣泛分布在植物,動物和微生物中[2-3]。目前,單寧酶已表現(xiàn)出了巨大應(yīng)用價(jià)值,如茶經(jīng)單寧酶處理后,可有效控制“茶乳”的形成,增強(qiáng)茶的口感和風(fēng)味[3-4]。單寧酶可以提升果汁的澄清度,降低果汁的苦澀及增強(qiáng)果汁的生物活性等效果[6]。除此之外,單寧酶在飼料和廢水處理也有著巨大應(yīng)用[7-8]。目前商品化的單寧酶主要來自曲霉,如黑曲霉[9]和米曲霉[10]等。然而,這些單寧酶也存在一些不足,如較差的縮合單寧降解效率及較高的溫度敏感性,這些因素限制了單寧酶的應(yīng)用領(lǐng)域。

        隨著基因工程技術(shù)的發(fā)展,目前重組菌構(gòu)建越來越受到關(guān)注,單寧酶重組菌也越來越多,如Kanpiengjai 等人從乳酸菌中克隆了堿性單寧酶基因并在大腸桿菌BL21(DE3)中重組表達(dá)[11];Kumar等人從肺炎克雷伯菌中克隆了單寧酶基因并在大腸桿菌BL21(DE3)中重組表達(dá)[12]。然而,目前只有少數(shù)單寧酶得到了詳細(xì)的表征和商業(yè)化應(yīng)用,遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足單寧酶相關(guān)研究和應(yīng)用的需要。2020 年Dai等人首次從植物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了單寧酶[13],豐富了現(xiàn)有單寧酶資源,而該單寧酶的相關(guān)性質(zhì)尚未見報(bào)道。

        本研究擬依據(jù)大腸桿菌密碼子偏好性,優(yōu)化并合成柿樹單寧酶基因;在大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行單寧酶生產(chǎn),利用Ni-NTA 親和層析對產(chǎn)物進(jìn)行分離純化,并對重組單寧酶PsnTanA 進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)表征,為柿樹單寧酶PsnTanA 的理論和應(yīng)用研究提供一定的指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        大腸桿菌(Escherichia coli)BL21(DE3) 由本課題組保存;PCR 反應(yīng)試劑購自大連寶生物有限公司,硫酸卡那霉素(Kan),瓊脂糖凝膠回收試劑盒,質(zhì)粒提取試劑盒購自北京索萊寶科技有限公司;蛋白標(biāo)準(zhǔn)分子量Marker 購自河北瑞帕特生物科技有限公司;羅丹寧,沒食子酸正丙酯購自上海源葉生物科技有限公司;Ni-NTA 購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司,其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 儀器與設(shè)備

        酶標(biāo)儀 Bio-RAD;SDS-PAGE 電泳設(shè)備 北京君意東方電泳設(shè)備有限公司。立式高速低溫離心機(jī)HITACHI 公司;JY88-IIN 超聲波細(xì)胞粉碎機(jī) 寧波新芝生物科技股份有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 柿樹單寧酶密碼子優(yōu)化及基因合成 使用GenSmart? Codon Optimization 工具(https://www.genscript.com/)對柿樹單寧酶基因(MK381274.1)進(jìn)行稀有密碼子分析及優(yōu)化,由南京金斯瑞生物科技有限公司合成并連接至pET30a 表達(dá)載體。

        1.3.2 生物信息分析 采用SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy.org/interactive)軟件對單寧酶PsnTanA 進(jìn)行同源建模,并利用Pymol 軟件進(jìn)行可視化分析。使用 Vector NTI 11.0 軟件計(jì)算單寧酶PsnTanA 的基本參數(shù)。

        1.3.3 重組菌的構(gòu)建與誘導(dǎo)表達(dá) 表達(dá)質(zhì)粒經(jīng)熱激轉(zhuǎn)化至E. coilBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,隨后挑取單菌落接種于LB 液體培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng),當(dāng)發(fā)酵菌液OD600達(dá)到0.6 左右時(shí)添加IPTG 試劑的進(jìn)行誘導(dǎo)。誘導(dǎo)培養(yǎng)結(jié)束后,取培養(yǎng)液,8 000 r/min 條件下離心10 min,收集細(xì)胞沉淀,并用PB 緩沖液(0.2 mol/L,pH 7.0)重懸后超聲破碎,超聲條件為:超聲5 s,間歇6 s,超聲功率0.3 kW,20 次。細(xì)胞破碎液離心后收集上清,即為粗酶液樣品。

        1.3.4 重組單寧酶的純化及SDS-PAGE 分析 采用Ni-NTA親和層析方法進(jìn)行重組酶PsnTanA的純化。將粗酶液注入平衡好的Ni 柱,用9 mL PB 緩沖液分3 次加入洗滌雜蛋白,分別用3 mL 含20,40,80,100,200 和300 mmol/L 咪唑的洗脫液進(jìn)行洗脫處理,收集各部分洗脫液,測定單寧酶酶活性。利用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDSPAGE)檢測各組分的純化效果。采用Bradford 方法測定蛋白質(zhì)濃度。

        1.3.5 單寧酶酶活力的測定 參考Sharma 等[14]的方法進(jìn)行單寧酶活性的測定:取適當(dāng)稀釋酶液(100 μL)與沒食子酸丙酯溶液(400 μL,1.25 mmol/L,pH 6.0) 混 勻,30 ℃反 應(yīng)10 min 后 加 入300 μL羅丹寧甲醇溶液(50 mmol/L)終止反應(yīng),加入溶液KOH(200 μL,0.5 mol/L)進(jìn)行顯色,隨后在520 nm 波長處測定吸光度。定義每分鐘生成1 μmol沒食子酸所需的酶量為1 個(gè)酶活力單位(U)。

        1.3.6 溫度和pH 對重組單寧酶活性的影響 以沒食子酸正丙酯為底物,在0 ~80 ℃的溫度的條件下測定重組酶PsnTanA 活性變化規(guī)律;在40 ℃或50℃條件下處理0、5、10、20、30 和60 min 后,測定重組單寧酶活性變化規(guī)律;將重組酶PsnTanA 在pH 2.0 ~12.0 條件下測定重組酶PsnTanA 活性變化規(guī)律;在不同pH 2.0 ~12.0 緩沖液中,0 ℃保溫1 h 后測定重組酶PsnTanA 活性變化規(guī)律。

        1.3.7 金屬離子及化學(xué)試劑對重組單寧酶活性的影響 在酶反應(yīng)體系中分別加入不同金屬離子或不同化學(xué)試劑,使其濃度分別為1 mmol/L 和5 mmol/L(或體積濃度1%和5%)進(jìn)行反應(yīng),進(jìn)行活性的測定。

        1.3.8 重組單寧酶底物特異性及動力學(xué)常數(shù)的測定 參考上述活性測定方法,分析重組酶PsnTanA 對沒食子酸甲酯(MG)、沒食子酸乙酯(EG)、沒食子酸正丙酯(PG)和表沒食子兒茶素沒食子酸酯(EGCG)的底物的水解能力。稱取1.0 g 茶(紅茶、綠茶)或谷物(高粱、綠豆)研磨成粉末狀,料水比(w/v)為1∶50,煮沸,冷卻至適當(dāng)溫度,加入單寧酶(以U 為單位添加),在單寧酶的最適反應(yīng)溫度下反應(yīng)1 h,煮沸5 min 滅酶活,測定沒食子酸。在最適條件下,以PG(0.25 ~5 mmol/L)為反應(yīng)底物,基于Lineweaver-Burk 方法計(jì)算重組單寧酶PsnTanA 的Km 和Vmax 值。

        1.3.9 數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計(jì) 上述試驗(yàn)均重復(fù)3 次,并利用GraphPad Prism 8.0 軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)結(jié)果采用平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤差表示。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 單寧酶PsnTanA 的生物信息學(xué)分析

        柿樹單寧酶PsnTanA 的基因全長912 bp,編碼303 個(gè)氨基酸和1 個(gè)終止密碼子。經(jīng)分析野生型柿樹單寧酶基因中含有30 個(gè)大腸桿菌稀有密碼子和5處連續(xù)稀有密碼子(CCC CCC、GGA CCC、GGG AGG、ACG GGG 和AGA GGG)。優(yōu)化后,該基因共有21 個(gè)稀有密碼子進(jìn)行了同義密碼子的替換,并消除了連續(xù)稀有密碼子。CAI(Codon Adaptation Index)值和GC 含量由此前的0.62 和60.20%分別改變?yōu)?.76 和57.11%,基因序列優(yōu)化前后的一致性為78.3%。

        經(jīng)三維結(jié)構(gòu)模擬分析可知(見圖1),單寧酶PsnTanA 由2 個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,分別是α/β 水解酶折疊域和Lid 結(jié)構(gòu)域。α/β 水解酶折疊核心域或由8 個(gè)β 折疊片和5 個(gè)α 螺旋組成,其中2 個(gè)α螺旋位于8 個(gè)β 折疊的凹側(cè)(α2 和α17),3 個(gè)位于凸面(α3、α4 和α12)。Lid 結(jié)構(gòu)域則由2 個(gè)平行的β 折疊和1 個(gè)反平行的β 折疊組成。單寧酶PsnTanA 催化三聯(lián)體殘基為S164、D245 和H278,具有保守活性位點(diǎn)基序“G-X-S-X-G”,而與微生物來源單寧酶中普遍存在的“CS-D-HC”保守基序存在差異[15]。Dai 等人構(gòu)建了柿樹單寧酶G76A和G77A 突變體,發(fā)現(xiàn)突變體不再具有單寧酶活性,證明了Gly-Gly 氧陰離子洞在催化水解過程具有關(guān)鍵的作用[13]。Ser164 位于底物口袋底部特征性的“親核肘”位置,處于β8-α4 的loop 結(jié)構(gòu)頂部,這允許親核氨基酸殘基有效地呈遞給底物,并將酶-底物中間體定位在氧陰離子洞的氫鍵距離內(nèi),從而使過渡態(tài)的穩(wěn)定。

        圖1 柿單寧酶PsnTanA 的 三維結(jié)構(gòu)模擬Fig. 1 The overall structure of tannase PsnTanA from persimmon

        2.2 重組酶PsnTanA 的純化及SDS-PAGE 分析

        發(fā)酵液菌體經(jīng)超聲波破碎處理后,采用鎳柱親和層析方法進(jìn)行重組蛋白的純化。經(jīng)測定,當(dāng)洗脫液為40 mmol/L 咪唑時(shí),收集到的單寧酶活性最高。經(jīng)SDS-PAGE 分析(見圖2),泳道1 為細(xì)胞破碎液上清,泳道2 為純化的重組蛋白,表觀分子量約為39 kD,其比酶活力為1.08 U/mg。本研究中,重組酶PsnTanA 采用融合表達(dá)His 標(biāo)簽策略進(jìn)行異源表達(dá),繼而增大了酶蛋白分子量,類似的現(xiàn)象也有報(bào)道[16]。

        圖2 重組單寧酶PsnTanA 的SDS-PAGE 分析Fig. 2 The SDS-PAGE analysis of purified recombinant tannase PsnTanA

        2.3 單寧酶PsnTanA 的酶學(xué)性質(zhì)分析

        2.3.1 溫度和pH 對重酶活力的影響 如圖3A 所示,單寧酶PsnTanA 在0 ~70 ℃范圍內(nèi)均表現(xiàn)出一定的活性,50 ℃時(shí)活性最高,在40 ~50 ℃的溫度范圍酶活力維持在76.9%,隨著反應(yīng)溫度的增加,重組單寧酶活性急劇下降,70 ℃僅殘留10%左右的酶活力。重組酶PsnTanA 在40 ℃溫度條件下處理60 min 后,酶活力仍保持80.0%以上,該酶表現(xiàn)出較好的溫度穩(wěn)定性;隨著處理溫度的提升,酶的溫度耐受性隨之減弱,如在50 ℃溫度條件下處理60 min后,酶活力保持在10.0%左右(圖3D)。

        由 圖3B 可 知, 重 組 酶PsnTanA 在pH2.0 ~12.0 范圍內(nèi)均表現(xiàn)出活性,pH 7.0 反應(yīng)條件下,PsnTanA 的酶活力最大,而pH8.0 條件下,PsnTanA的酶活力降至20.3%。經(jīng)重組酶PsnTanA 的pH 穩(wěn)定性測定結(jié)果(圖3C)可知,該酶在pH6 ~12 之間具有較好的穩(wěn)定性,殘余酶活力大于60%,在酸性條件下,重組酶的穩(wěn)定性較差。

        圖3 重組單寧酶PsnTanA 的酶學(xué)特性Fig. 3 Enzymatic properties of the recombinant tannase PsnTanA

        2.3.2 金屬離子和化學(xué)試劑對酶活力的影響 經(jīng)測定低濃度(1 mmol/L)的Ca2+對PsnTanA 無抑制作用,Na+、K+、Li+及Mg2+在1 和5 mmol/L 的濃度下,對PsnTanA 酶活力有輕度抑制作用,殘余酶活力保持在70% 以上。Al3+對PsnTanA 酶活力有中度抑制作用,重金屬離子Ag+、Mn2+、Zn2+、Cu2+和Fe3+對PsnTanA 酶活力有重度抑制作用。在5 mmol/L 的濃度下Ag+、Zn2+、Cu2+和Fe3+可使PsnTanA 酶活力喪失90%以上,其中Cu2+幾乎完全抑制PsnTanA 的酶活力(見表1)。

        表1 金屬離子和化學(xué)試劑對單寧酶PsnTanA 的影響Table 1 Effect of metal ions and chemical reagents on the activity of tannase PsnTanA

        化學(xué)試劑對重組酶PsnTanA 均表現(xiàn)出不同程度的抑制作用,并且多數(shù)試劑添加量越大抑制作用越強(qiáng),只有尿素在高濃度下抑制作用反而減弱。螯合劑EDTA 抑制了PsnTanA 約35% 的酶活力;表面活性劑SDS、吐溫80 和CTAB 的抑制作用最強(qiáng),幾乎完全抑制了PsnTanA 的酶活力;5%的甲醇、乙醇、異丙醇及丙酮可抑制90%以上的酶活力。

        2.4 單寧酶PsnTanA 的底物譜和動力學(xué)參數(shù)

        經(jīng)測定,單寧酶PsnTanA 隨著底物酯鏈的增加而活性降低,且該酶對合成底物(MG、EG 和PG)表現(xiàn)出比天然底物(EGCG)更高的活性。以PG 為底物,重組酶PsnTanA 的Km 值和Vmax 值分別為1.71 mmol/L 和2.56 mmol/(L·min)。本研究進(jìn)一步測定了該酶在綠茶、紅茶、高粱及綠豆中的降解能力(圖4)。重組酶PsnTanA 可有效降解綠茶中的單寧物質(zhì),使得單寧酸的含量提高了40%左右(綠茶含7.5 μg/mL),然而類似的現(xiàn)象并未在紅茶的酶解中發(fā)現(xiàn)。除此之外,該酶對高粱中的單寧有表現(xiàn)出了高效的降解,使得沒食子酸含量增加了42.2 μg/mL。同樣,重組酶對綠豆中的單寧也顯示出了較好的降解能力。

        圖4 重組單寧酶PsnTanA 的底物特異性Fig. 4 The substrate specificity of the recombinant tannase PsnTanA

        3 結(jié)論與討論

        柿樹與大腸桿菌的遺傳密碼子使用頻率存在較大差異,因此,參照大腸桿菌的密碼子偏好性優(yōu)化PsnTanA 的野生型基因,替換了21 個(gè)大腸桿菌稀有密碼子,改善了密碼子偏性狀況,CAI 值由0.62 提高至0.76,更接近于理想值1.0[17],這為該酶的成功表達(dá)提供了保障。

        重組酶PsnTanA 最適反應(yīng)溫度為50 ℃,在40 ~55 ℃反應(yīng)時(shí),該酶可表現(xiàn)出約80 % 以上的酶活力,當(dāng)溫度大于60 ℃后,酶活力急劇下降。Kanpiengai 等人報(bào)道的戊糖乳桿菌單寧酶LpTanBA-7 的最適反應(yīng)溫度同樣為50 ℃,LpTanBA-7 在50 ℃下酶活力半衰期為30 min。重組酶PsnTanA 在50 ℃溫條件下處理10 min 后,酶活力保持在49.0%,在40 ℃溫度條件下處理60 min后,仍保持80.0%的酶活力。pH 值影響活性位點(diǎn)氨基酸殘基的質(zhì)子化和去質(zhì)子化,而影響酶的催化效率和穩(wěn)定性[18]。多數(shù)真菌單寧酶在酸性環(huán)境中有較高酶活力,最適pH 值在pH 4.5 ~6.0 的范圍內(nèi)[19];而大多數(shù)細(xì)菌來源的單寧酶則在pH 值7.0 ~8.0 的范圍內(nèi)具有較高酶活力[20]。魯頓葡萄球菌單寧酶pH 值為7.0,同重組單寧酶PsnTanA 一樣在酸性環(huán)境中酶活力較低,但經(jīng)過固定化后魯頓葡萄球菌單寧酶酶活力提高了35%[21]。酶經(jīng)固定化材料包埋后,固定化酶在液體環(huán)境中的暴露減小,溶液中pH的變化對固定化酶活性的影響較小。因此,單寧酶PsnTanA 的固定化應(yīng)是提高該酶特性的策略之一。

        金屬離子和化學(xué)試劑對重組酶PsnTanA 的酶活力均表現(xiàn)出不同程度的抑制,其中金屬離子的抑制作用尤為顯著,如Cu2+和Fe3+幾乎完全使PsnTanA活性喪失。類似的現(xiàn)象在黃蕾等[22]、Kanpiengjai等等人研究中均有發(fā)現(xiàn)[11]。推測這很可能是由于金屬離子與酶活性部位的巰基、色氨酸殘基和或羧基相結(jié)合,繼而阻礙了酶與底物結(jié)合而生成產(chǎn)物。

        本研究實(shí)現(xiàn)了柿樹單寧酶PsnTanA 在大腸桿菌中的異源表達(dá),重組酶 PsnTanA 最適反應(yīng)溫度和最適pH 分別為50 ℃和7.0 ,該酶對高粱中的單寧有較好的降解效果,本研究有利于柿樹單寧酶PsnTanA 理論和應(yīng)用研究的進(jìn)一步開展。

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