趙 遠(yuǎn),賈慧建,宋順佳,李 琦,邵學(xué)超,艾金霞,孫麗媛
(北華大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院分子生物學(xué)教研室,吉林 吉林 132013)
熊膽粉為脊索動(dòng)物門哺乳綱熊科動(dòng)物黑熊(Selenarctos thibetanus G.Cuvier)或棕熊(Ursus arctos Linnaeus)經(jīng)膽囊術(shù)引流膽汁后干燥而得[1],其中含其他中藥、動(dòng)物膽汁和人工合成品不能替代的獨(dú)有成分熊去氧膽酸[2]。研究[3-5]顯示:熊膽粉對(duì)治療中樞神經(jīng)、肝膽、眼和肛腸等部位疾病有較好療效。國家食品藥品監(jiān)督管理局審批的含熊膽粉成分的中藥制劑有243種,中醫(yī)的經(jīng)典處方中有396方包含熊膽,以熊膽為原料的單味制劑熊膽膠囊收錄于《中國藥典》[6]。
熊膽入藥歷史長達(dá)百年,應(yīng)用廣泛需求量大,因來源稀缺和市場(chǎng)價(jià)格昂貴,故有不法商家借機(jī)將廉價(jià)易得的豬、牛膽汁加工成粉后,混入或冒充熊膽粉出售,以期謀取暴利。紹興“4.18”非法生產(chǎn)銷售“熊膽粉”假藥案,總涉案金額高達(dá)1億多元,不僅侵犯了消費(fèi)者權(quán)益,也極大地影響了臨床療效。既往對(duì)于熊膽粉的鑒別,傳統(tǒng)法主要采取口嘗、手搓、火燒和水試等方法[7],受鑒別人員技術(shù)能力和經(jīng)驗(yàn)影響較大,難以實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化;之后又以熊去氧膽酸作為檢測(cè)指標(biāo),采用紅外光譜測(cè)定法[8]、薄 層 色譜 鑒 別 法[9]和高 效 液 相色 譜 法[10-11]等技術(shù)鑒別,但此類方法檢測(cè)指標(biāo)單一且需大型精密儀器,檢測(cè)成本高、耗時(shí)長。隨著分子生物學(xué)方法的進(jìn)步,位點(diǎn)特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)鑒別[12]、DNA條形碼分子鑒定[13]、PCR-限制性內(nèi)切酶酶切長度多態(tài)性[14]和熒光PCR[15-16]等分子生物學(xué)鑒別方法陸續(xù)應(yīng)用于膽類藥材鑒別,但均難以一次實(shí)驗(yàn)實(shí)現(xiàn)多種膽類同時(shí)檢測(cè)。故亟需建立一種針對(duì)性鑒別熊膽粉摻偽的準(zhǔn)確、快速且便捷的檢測(cè)體系。
本研究根據(jù)豬、牛和熊線粒體細(xì)胞色素b基因設(shè)計(jì)物種特異性引物,根據(jù)不同長度的擴(kuò)增片段進(jìn)行鑒定;在物種屬特異性PCR體系基礎(chǔ)上建立并優(yōu)化多重PCR體系,達(dá)到不同物種混合樣品核酸片段同時(shí)擴(kuò)增鑒定的目的。本課題組建立的多重PCR方法可同時(shí)檢測(cè)多種DNA,具有高效、經(jīng)濟(jì)和簡便等優(yōu)點(diǎn),便于基層實(shí)施快速檢測(cè),適用于常見的熊膽粉摻偽豬膽粉及牛膽粉的鑒別,為我國膽類藥材市場(chǎng)監(jiān)管提供了技術(shù)支持。
熊膽粉購于國家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)資源平臺(tái),樣品編號(hào)為D027550,豬膽粉和牛膽粉均由吉林省長春市食品藥品檢驗(yàn)研究所提供,均已采用液相色譜法鑒定為正品。9份混合膽類藥材由標(biāo)準(zhǔn)品膽樣按比例混合而成。2×Taq PCR Master Mix、100 bp DNA Ladder、普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、pGM-T連接試劑盒、DH 5α感受態(tài)細(xì)胞和質(zhì)粒小提試劑盒均購自北京天根生物科技有限公司,三羥甲基氨基甲 烷[tris(hydroxymethyl)methyl aminomethane,Tris] 和乙二胺四乙酸 (ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)購自美國Genview公司,十二烷基磺酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)購自美國Biosharp公司,無水乙醇(分析純)、NaAc結(jié)晶和異丙醇購自天津市永大化學(xué)試劑有限公司,GelRed核酸染料購自美國Biotium公司,瓊脂糖購自西班牙Biowest公司。HH-S精密恒溫水浴鍋購自江蘇金壇市醫(yī)療儀器廠,NanoDrop One微量核酸蛋白測(cè)定儀購自美國Thermo公司,TC9600-G多功能梯度PCR儀購自美國Labnet公司,JY 300E通用型電泳儀購自北京君意東方電泳設(shè)備有限公司,UV WHITE-2020D紫外凝膠成像分析儀購自美國Biorad公司。
取膽粉樣品0.1 g,置于1.5 mL Ep管中,加入P1(NaCl、EDTA、Tris、10%SDS、PK酶和dd H2O)溶液500μL,P2(10%SDS)溶液30μL,P3(PK酶)溶液15μL,56℃水浴1 h。加入P4(飽和NaAc)溶液500μL,10 000 g離心10 min。取上清加入等體積P5(異丙醇)溶液,-20℃靜置1 h。取出10 000 g離心5 min,棄去上清液。留沉淀加入P6溶液(70%冰凍乙醇溶液)500μL,11 000 g離心5 min,棄上清,并重復(fù)操作1次。沉淀室溫晾干,雙蒸水100μL溶解,作為供試品DNA溶液。采用微量核酸蛋白測(cè)定儀檢測(cè)各方法所得微生物基因組DNA的濃度和純度,濃度為機(jī)器直接讀取數(shù)據(jù);純度計(jì)算方法:波長為260和280 nm處吸光度(A)值的比值,即A(260)/A(280),每份基因組DNA原液重復(fù)測(cè)量3次。
在GenBank數(shù)據(jù)庫中選取各動(dòng)物線粒體細(xì)胞色素B基因:豬(AY830188.1)、牛(KU291093.1)和熊(EU573176.1),采用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)物種特異性引物,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。特異性引物序列見表1。
表1 特異性引物序列Tab.1 Sequences of specific primers
物種特異性PCR體系:反應(yīng)總體積為20μL,其中2×Taq PCR Master Mix 10μL,上游引物和下游引物(10 mg·L-1)各1.5μL,DNA模板(10 mg·L-1)1.5μL,無 菌ddH2O 5.5μL。PCR參數(shù):94℃預(yù)變性5 min,94℃、30 s,60℃、30 s,72℃、30 s,循環(huán)35次,延伸72℃、10 min,4℃保存。
三重PCR體系:反應(yīng)總體積為20μL,其中2×Taq PCR Master Mix 10μL;不同物種上下游引物(10 mg·L-1)各0.5μL,共計(jì)3μL;每一物種DNA模板(10 mg·L-1)0.5μL,共計(jì)1.5μL;無菌ddH2O 5.5μL。PCR參數(shù):94℃預(yù)變性5 min,94℃、30 s,60℃、30 s,72℃、30 s,循環(huán)35次,延伸72℃、10 min,4℃保存。
PCR產(chǎn)物檢測(cè):5μL產(chǎn)物點(diǎn)樣于1.5%瓊脂糖凝膠,電壓85 V、85 min。采用紫外凝膠成像儀觀察檢測(cè)結(jié)果。
紫外凝膠成像儀下取不同物種特異性DNA擴(kuò)增片段進(jìn)行凝膠回收,測(cè)定其DNA濃度。將目的基因與pGM-T載體連接為重組DNA,轉(zhuǎn)化至DH 5α感受態(tài)細(xì)胞中,涂于LB培養(yǎng)基上,37℃過夜培養(yǎng)。次日挑取白色陽性重組菌落置于LB液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)過夜。提取質(zhì)粒DNA,擴(kuò)增后瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
質(zhì)粒DNA濃度測(cè)定:選取濃度超過100 mg·L-1的樣本,送至上海生物工程股份有限公司測(cè)序,并對(duì)測(cè)序結(jié)果與靶基因比對(duì)分析。序列結(jié)果經(jīng)NCBI-Nucleotide BLAST分析。
1.6.1 引物的特異性評(píng)價(jià) 將豬、牛和熊膽粉提取的DNA分別以豬、牛及熊進(jìn)行物種特異性引物擴(kuò)增,參照“1.4”中物種特異性PCR體系及條件擴(kuò)增,對(duì)引物的特異性進(jìn)行檢測(cè)。PCR過程中均以dd H2O作為空白對(duì)照。依據(jù)電泳結(jié)果評(píng)價(jià)引物的特異性。
1.6.2 多重PCR反應(yīng)體系的特異性評(píng)價(jià) 以1為遞減數(shù)量依次減少體系中模板DNA物種數(shù),按“1.4”步驟中三重PCR體系及參數(shù)進(jìn)行擴(kuò)增,檢測(cè)多重PCR體系的特異性。PCR過程中均以ddH2O作為空白對(duì)照。依據(jù)電泳結(jié)果評(píng)價(jià)多重PCR體系的特異性。
1.6.3 多重PCR體系的靈敏度評(píng)價(jià) 將提取的熊膽粉、豬膽粉和牛膽粉DNA模板檢測(cè)濃度后稀釋至102mg·L-1,采用ddH2O 10倍梯度稀釋直至10-5mg·L-1,作 為PCR體 系DNA模 板。參照“1.4”步驟中三重PCR體系及參數(shù),同時(shí)保持其中2種模板濃度始終不變,剩余物種模板濃度依次為102~10-5mg·L-1。依據(jù)電泳結(jié)果評(píng)價(jià)多重PCR體系的靈敏度。
1.6.4 混合膽樣檢測(cè)評(píng)價(jià)重復(fù)性 模擬摻假可能性,制備混合膽樣,每種模擬混合方式制備3份,共計(jì)27份樣品。參照“1.2”步驟中方法提取DNA,參照“1.4”步驟進(jìn)行電泳,電泳后采用紫外凝膠成像分析儀觀察結(jié)果。隨機(jī)抽取其中5份混合膽樣DNA,對(duì)檢測(cè)體系進(jìn)行重復(fù)性評(píng)價(jià)。見表2。
表2 樣品模擬混合方式及其構(gòu)成比Tab.2 Simulation mixing modes of samples and their component ratios
將膽粉樣DNA經(jīng)微量核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定濃度和純度,重復(fù)3次。A(260)/A(280)處于1.70~2.00,質(zhì)量濃度均高于100 mg·L-1,該方法提取獲得的DNA樣品基本無蛋白質(zhì)污染且純度高,證明本研究建立的膽類藥材DNA提取方法可有效提取膽類藥材DNA。見表3。
表3 膽類藥材基因組DNA檢測(cè)結(jié)果Tab.3 Genomic DNA test results of biliary herbs
克隆鑒定結(jié)果與預(yù)期目的條帶位置一致,瓊脂糖凝膠電泳圖譜分別于267、157和218 bp處出現(xiàn)單一特異性條帶。見圖1。
圖1 豬、牛和熊膽粉克隆質(zhì)粒的DNA PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Electropherogram of DNA PCR amplification products of suis fellis pulvis,pulvis billis bovis,and bear bile powder clone vectors
測(cè)序結(jié)果在NCBI-Nucleotide上采用相似性搜索算法(basic local alignment search tool,BLAST),與GenBank中已登記的豬(AY 830188.1)、牛(KU 291093.1)和熊(EU 573176.1)序列同源性達(dá)99%以上,證明多重PCR檢測(cè)體系特異性試驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性及PCR擴(kuò)增的特異性基因片段序列的正確性,同時(shí)也表明克隆的DNA片段分別為豬、牛和熊目的基因片段。見圖2。
圖2 豬(A)、牛(B)和熊(C)目的基因測(cè)序圖譜及序列比對(duì)分析Fig.2 Sequencing maps and sequence alignment analysis on target genes of pig(A),bovine(B),and bear(C)
各物種引物特異性試驗(yàn)中分別僅于豬、牛和熊目的條帶處見單一特異條帶,其余泳道皆無條帶,表明本研究所設(shè)計(jì)引物特異性良好。1~7號(hào)泳道依次見:豬、牛、熊、豬/牛、豬/熊、牛/熊和豬/牛/熊特異性條帶。初步表明本研究所建立三重PCR引物之間互不干擾,體系特異性良好。見圖3。
圖3 引物特異性檢測(cè)電泳圖Fig.3 Electrophoregrams of specific test of primers
豬膽粉、牛膽粉和熊膽粉最低檢測(cè)限均可達(dá)到1 mg·L-1,其他2種特異條帶亮度不受影響。表明本研究所建立多重PCR檢測(cè)體系結(jié)果穩(wěn)定,當(dāng)任意一種DNA減少至1 mg·L-1時(shí),仍可準(zhǔn)確檢測(cè),且無交叉干擾。見圖4。
圖4 多重PCR體系的靈敏度檢測(cè)電泳圖Fig.4 Electropherograms of sensitivity detection of multiplex PCR system
模擬混合樣品經(jīng)DNA提取和多重PCR檢測(cè)體系擴(kuò)增后,未加入DNA模板的陰性對(duì)照泳道無條帶,其余各泳道條帶有無及明暗情況與各樣品原模擬混合方式大致相符。表明該多重PCR檢測(cè)體系特異性良好,3種特異性檢測(cè)成分的構(gòu)成比變化不影響檢測(cè)的準(zhǔn)確性,可基本滿足熊膽粉中實(shí)際動(dòng)物源性摻偽情況檢測(cè)。見圖5。
圖5 混合熊膽樣品瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.5 Agargel electrophoregram of mixed bear bile samples
熊膽粉是傳統(tǒng)的名貴中藥材,被譽(yù)為四大動(dòng)物藥材之首,已有上千年藥用歷史[17]。膽粉類藥材形態(tài)相似,肉眼不易直觀分辨[18],為確保熊膽粉產(chǎn)品的用藥功效,避免對(duì)患者帶來生命財(cái)產(chǎn)的嚴(yán)重?fù)p失,弘揚(yáng)中醫(yī)藥文化,有必要建立鑒別熊膽粉摻偽檢測(cè)的方法。
對(duì)于熊膽粉內(nèi)化學(xué)成分鑒定,王一博等[19]建立了對(duì)5種膽汁酸應(yīng)用高效液相色譜-電霧式檢測(cè)器實(shí)現(xiàn)同時(shí)測(cè)定的檢測(cè)方法;石巖等[20]建立了測(cè)定熊膽粉主要膽汁酸類成分的HPLC-ELSD方法;李曉瓊等[21]采用一測(cè)多評(píng)法同步測(cè)定了熊膽粉中3種膽酸類成分含量,以熊去氧膽酸為內(nèi)參物,實(shí)現(xiàn)定量分析。上述方法彌補(bǔ)了檢測(cè)指標(biāo)單一、紫外基線漂移和靈敏度差等問題,可較為全面反映熊膽粉中膽汁酸成分含量。但熊膽粉的藥理作用機(jī)制尚未清楚,有關(guān)針對(duì)非膽汁酸類成分研究較少,其可能也在熊膽粉中發(fā)揮作用。已有研究[2]表明:可人工合成熊去氧膽酸,以其為指標(biāo)鑒別熊膽粉真?zhèn)我桩a(chǎn)生假陽性結(jié)果。
許亞春等[22]基于DNA條形碼技術(shù)對(duì)名貴中藥材熊膽粉及混偽品構(gòu)建鄰接樹,該方法雖具有很強(qiáng)物種特異性,但只能檢測(cè)出是否存在特定物種,只能對(duì)純正品或純偽品提供鑒定。本研究采用改良SDS-蛋白酶K裂解法(SDS proteinase K cleavage,SDS-PK)法提取含有膽汁酸類樣品DNA,其濃度高、純度好,為多重PCR檢測(cè)體系鑒別熊膽粉摻偽提供了良好的先決條件。基于多重PCR原理,根據(jù)豬、牛和熊線粒體細(xì)胞色素b基因設(shè)計(jì)出物種特異性引物,建立針對(duì)豬膽粉、牛膽粉和熊膽粉的多重PCR檢測(cè)體系,依據(jù)不同長度的擴(kuò)增片段進(jìn)行鑒定。具有特異性強(qiáng)、靈敏度高和重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),最低檢測(cè)限可達(dá)到1 mg·L-1,且模擬實(shí)際摻假情況下,DNA含量低至檢測(cè)樣品總DNA含量10%時(shí),仍可準(zhǔn)確檢測(cè)。與其他檢測(cè)技術(shù)比較,其對(duì)混合品鑒別時(shí)具有高效性的特點(diǎn),可實(shí)現(xiàn)熊膽粉偽品一次檢測(cè),即同時(shí)檢出多種動(dòng)物源性成分摻假,大大縮短了檢測(cè)周期。
田娜等[23]基于STR分型原理建立用于膽粉類藥材及其摻雜樣品的通用DNA指紋圖譜鑒別方法,但該法分型結(jié)果對(duì)儀器分辨率、片段大小準(zhǔn)確性和操作人員等要求高,使其應(yīng)用受到限制。本研究采用的檢測(cè)方法無需昂貴的檢測(cè)儀器,經(jīng)濟(jì)便捷,具有應(yīng)用價(jià)值,適用于膽類藥材市場(chǎng)質(zhì)控監(jiān)測(cè)。為方便后續(xù)商品化試劑盒組裝應(yīng)用,本課題組將豬、牛和熊物種特異性條帶克隆作為陽性對(duì)照,解決實(shí)際應(yīng)用中標(biāo)準(zhǔn)品難以獲取的問題。后續(xù)可將本研究成果通過熒光定量PCR技術(shù),建立多重?zé)晒舛繖z測(cè)體系,進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)對(duì)待測(cè)樣品中膽類藥材DNA含量的精確檢測(cè)。
吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)2022年3期